Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE047200

[Submit comment/correction]

Sequence	AE047200
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE047200
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAGGGACGTGGCGCCGGCCATCGAGAAGTTGCACTCGTCCATCCCGGC CTACATGGACGCCGCCGCCGCGCAAGCCGCCGTGAGGGCAGAGCAGGCCA CCAAGTTGGAGGAGATCAGCGCGACAAGGTGGGCGTCGGTCATCGAGCGG TAAAACATCAAGCTCGGCCTCATTAAGGCCAATGTGGAGGCAAAGAAGAG GAGGAAGGACCTGGCGATCTTGATGGTCGACATGAAGGACATGGACGACA AGGTGAAGGCGTGGTGTGTTGATCATCACGCCTTGATCCTCTCCGAGTGC CGAGCGGCCGCCAACCAGGCTAGCACCCCGACACCGGCGGCTGGGACTGC GACCCGAGAAAATTGCACATAACACCAATGTTTGGTACTCCCTCCTATCT ATATTACTTGTCGCAGAAATAGATATATCTAGGCACATTTTAGTGCTAGA TACATCCAATCCAATGACAATTAATATGGATCGGAGGGAGTAGCAATGTT GCATAGAACACAGAATCAAAACATTTTTTGCAGCTAATCCCAGTTTTTGG TGTAATACGTTGCACCTAGCCAAATAGATGTTTTAGAACCCTTAATAGTG GAATTAACACATGAGACCAAGTTTTTATACCGTATTCCACAATATTTTTA TACCATATTTCACAATTATATGATTTCGAAAAATAGTATACCGCAATACT AGAATGCTAGTGCATTGTGTTTGGTATGTCAAGAAACGAATAATAAATAT ATCTATTGTTTTACATGTTTATACTGAAAAATGAAGTAAATTTAAAGCAA ACATTAATGTTATTCAAGATTTGGTGCCACTTAATTACGTGAGTCCCTAA TTAAACGTAAGCCTATATTATCATTCTACAGTGTAGGTAATTTATATGAC ACAGGTTAACGTGGTGTCTATGGAAACACATGTTTTGCCACGCTCATAAG TTTTCATGTCTCGTAAGTTTTTTCCACACTTACACATGTATAATTGTGGT ATATGTATAAAAAATATGGGTTTACATGTCAGATACAATATTAATGGTCT TAAAACATTTATTTGGGCTTGCTACAACGTATTACACTAAAAGTTGGGGT CAGCTGCAAACTGTTTTATTTTCGTGTTTTGTGCAACTATGTTACCAAAC ATTGGTATTGTGTACAATTTTCTCCTGCGACCTTGACCCCGGTCGGCACC CGGATCAGCACCACCGTTCCGCCAGCGGCAACCCCGGAGGTGCCTCCTAC CGCGACGGATAATCTTCCCCTGTTTGATTTTCGTGTTTCTCGCATGTTTA TTTTGACCGATGCACTTGTATTTTGGTGATTTACGGTGATTGCATCACCT GAACTATGATATGCCCGGTGCTGGCAAAACTATGTTTAATTTCTGGCGAC CTTTTGAATGTTTAAATTTGCAATTGCGAGGGGGGGCTGTTTGGGGGTGG CGGCTGGGAGGCGGTGACCCCCCGATAGGAGGTACCTGCGCCTCGCCCCC ATAAGGCCAACCGACGGACCCCGTATGGGAAGGGGACGAGTGGAGATGCT CTTAGCCTCTAAACATATTTTGTTCATCAGAATAACGTCCTCTCCACTTT ATCCTCCTCCGGTGATGCGCCCTAGTATCGACGGGACATGCGTGGAGTCG TGTGTTTGACCGAATCCTCGATCGTTTTTCATATTTGTTGCTATGGTTTG AGATAAGTCTCTTCCGATCTATTCCCTCCGTTTTAAAATATAAGATGTTT TAGCTTTGTGAAAAGAGTGTATCTAGACATCTTTTAGCGTGTAGATTTAT CTAGGTTTGGAATGAACCTAGACCCTAAAAATAGTCTAGATACACTTTAT TCACAAACCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGGGTACATCTTTAGGCA TGGTTGTTACTCCTGTGCGCTGATATTTTGCCAAAAAAAAATTATCTCTG AGAAAAGCTTCGAGTGGTCAAGTCAAGTGGCAAATTTGAAAATTCGAACC TTTTTCTTCCAGGCTTGTATTTGGAGAAAACTCTGGGTACCGCGAGTCCG GCCGGTCGCCTGCCAGAAACGACTCGCGGATTGGCTCGATGCCATGTCTG CCCAACCTGTCAGCGACTGAACATCACTGCCTTCCAGACCAGCAACAACG CGCGTGGTTTGCAGGAAGCCCACGGCAGCATACCAGAGCAGTAGCAGACT TCCCTCCTCGCACCACGACCTCGTCTCGCACGACCCCCCTCTTGATTCGG AGCACATCCCGCGCGGCGCAGATGCCGGCGATCGCCTGCGGCGCCTGCGC GTCTGCCTTCCCCTCCTCCCGCCACGCTCGCAGCCATCCGTCGTCTTCCG GGAGCTTCGGGAACCTCGTTCCGGTCACTCCCAGGCGGCTAGGGCTCCTT CTCCCCGCTCCCATGGCCTCTACCGTCGACTCGCCAGGGAGCTCCAACGA CTTCGCCAAGCGCATGGACCGCGCCTGGCTCATCTCCAAGGTCCGCGCTC GAATCGCCGCCCAAATTTTCTCTTCGCTTTTATGCTTGCTTATTATCGAT GTCTAACTGAAATTGGGCAACTGTGGGGAATTTCTCGCCTGAATATACTC AATTAGGTAGACCTATTGGAAACTTAGGTACTTAGGAATTCCTATAAATT CTGTTGGCGCATGAGACCAGCAATCATATACTATTTTTGTTGATAGTGGG TTACTTGTGAACTCTCTAATTCGAATAATTGGTCGAATGAGCTTGCTGCA ACTCTGCAAGAATTAAACACGGCAGTGGTAAGTGCAACGAGACGTACTTA TAGTAAGGTTGGTTCTATTGGAGAGCTTAGTTGGGTATTCCGATAAATTA TGTTGTTGCACGAGACCAGGAATCGTATACTTTGTTGATGGTGGTGATCC GTGAACTCCCTAATTGGAATCACTGCTCCAACTGAGCTTGCTGCAACTCT GCAACAACTTAATGATGCAGTAAATAAGTGTTGTAAGAAGTGTGGTGCCT GTTTACTTTTATGCACCTGATGAGGAAGTTCTCAGATACTGAACTGCTTC AGAACTGTTGGATGGGATCCTTGTTAGTTCTGTTAAGGTGAATGAAGTGA ATAAGGACACTGTTGACCCTAAAGCTCTCAGCATTTTGGAGTGGATGTAT GAGTCTTAATGGAGATTCTGGCAATGACCAGGCTGTTCCACACACTCACT GAACGTGTATGTTCGATGTAGTATGTAGTTTATGGACTTTATGTGAGCTT TGGACATGTTGGTTCCACAGGAGCAGTTTTCCATATCGTAACTAAAGATG TCCTAATTACTAAACAGTATAAATTTACAGAGGGTAGTAGTGTAGTGATA GGCTTATTGCCTTATCGTGACCATCTTGATTCATGAACTCTCAAAGGAAA CACTCTCAAATAAAAGTCAGTTTGATGTGCCAGGAGTACAACTATATTAC TTGATTAGTACACCATTTGTATCATCATGTACGCAGCATAAAAAATAGTG TTCAGTATTTTACTTGCAAAAACATGCCCTGTGATTTTGTTAATATAACT ATGTAGTTTTGAAATGATGTAATGGGAAATGGGAATGCCACTTCTTTGGT TTTTTCACATCTAGTTCTCCAAACTTCTAACTAAGGAGCATGGCATAATG TAGGATGCACATTGCTTTAGGATGTCTTTGGGAGAGCTCTACTCAACCTT CACCTGACTCCATCTCCTAACTCCACTCCACCTACTAAGTTGTATCAAAG TGTTTGGCTAGCACATTACCTCCAACTTTAGTTCATTGGAAATTTGTCAG GAAAAGTCAAGACTACCCTTTTCTTTCTTTTCTTTTTTCTCCACCTGCTA ATTCGTTGTACAAAAGGAGAATTTGGACTGATTCACCTGCTTCACCAGTG AATCTGTGGTGTGGAGCTGTCCAGAACACACGATTAATATGATTTAGAAG TTGGAATTTATGGTTCTTTACTTGTATTTATATGCATAAAAGGCATTCTC AGAAATGTTATGGTTTCATCATCTGATTCTAGTAGAGGGAAGCAAAGTCA AATTCTATATTTAGCAGGCACACATAGATATCTGTCATGCTTATAGAATT GCTCTTTGTTAGTTGAGTTGTATTCTCACATTCATGATGTGGTGATGTAC AGCAACCAAGACCGAGTTCTTGTTCATCTTGTCAATCCACTGGCGATGTG GAGTGCAAGTGGTGTGCAGGCACAGGCTTCTTTATCCTCGGCAACAATAT GCTGTGTGAAGTACCCTCAAAAAATACAAGATGTGTGATTTGCTCTGGGA AGGTAGTGTAATTATAACTTGTTCTCTTCCATTTATTTTCAAATCTTACC TGTGGAATTAAAATCCCATGACTACTTACATGTGAAAAAACAGTACTATG TTGATAATGATACAAATTCTGTTGGCATAACAACATGGTTGTTATTCTTC ATGTAACACACATTATATATTCATTTGATTTCAGGGTTTTGCAAGTTGTG TTGATTGCAAAGGTACTGGGTTTCGCGCCAAATGGCTTGAAGAACCTCCT GTAGACAAATGAACAGTCAAAGTCAACCATACTATAAAATTTACTGTATA ACAGTTAACTTGGCAACTGTATGTACCCCTGTCCAAATTCTCCTGTTTGT AAACGATGGTACATATATCATTTTGTCATTGCGTCTTCTCTCTTGACCAG TTGAAATTGTGTTTCTTTTAGCTCACACCCACCATACCCCTCCAACCAAA CACTACCTTTGTCTCAGAAGCAGAGGACAAATGACTCTAAACCTGGAAAT GAATAGTGGACTACAAATGTGTTTACACCAATCAGGGTTTTCACATATAT ATTTTGGGGTTCTTCAGATGTTGTGGCAACAGTTTTCGTTGTAATGGTTC AGTATTTTGGTACTCACAATCTTTTAGCCTCTCTGATTCGCAATATTCGA AAAAATGCAGGAAAGAAGACAAAAGTTGCCTTGCAAAGTCATTCCCATTT GAATCCTACAGGAGAGAATTGACACTAAAGTTCGTTTTGGTTGCACCACA TGAAAAAACAAACGATTGACACTAAAGTTCAGTCAATGGAAATTTTCCTC CGAAATCTAGCGTGTAATTTCTTAGAGAAAAAATCTTATAGGATACACTC CTAGTCCTACAAATCCAGCAACCTGCATAGAAAAAATTCTGAAGGAACCA AATCCTCTGAAAATCCTATAGAAGTCCTTACTTAATCCTCCTCTGGGTAG GTATCTCAGATTTTGTGCACTTTCACCAGGGTAGTAAACAGAATGTGAAA TAGCTGCATGATTTGTTCCCTTAATTTCTTTTTAGAAATAGATTTGTTGC AGATTTGTCCGTCGTTTCTTGAATCTTTGTTACCAAACTGTTACAACTTT AGTCTTAAGTGTTACATTGTTGTAACATAATGTTTTATTTAACCTTCTAA GTTCGTTGCATGTGGATGGGGATTTATGCAGGTCGACAAATCTAGTGTGG TTGTATTGAAGGAATTTGCGGCCAGCTTAGCTAAATCATTTCCCTCTTGT GATTTTTCCTTGGATGTTAGTTTGGTTATCTTACGAGATTCGTCTATTTC ATTCTTGATATTTACACACCAGGGACGGTTCTAGCATCCCTCCAGCCTAG GCTTGCCGACGGCAGAACGCTTTACTTTGTGTGATTTTCTATGCGATCGA AAATGGCAGGTTAAGCACTTCGACTTGTGGTTTGCCTAGGCTTTGAAAAG TTTGTAGGTCCTACACTGGTGCACCTTCGTGCTGTGTCCTACAATATCTG ACTGGATATTGGGGTTATTGTGCATAAGAAGGGAGTGTCAGAGTTTAACA GTATTAGAGAAGCCAAAATTCCTTCAGGGTAGAACTTTCGTAAGCCAAAA TCACTTCTAGATCACGGTATTTCCTAGGGAAGTTAAAGATAATTTTCTGT CGTCACTCATGGATTTACTTCCTTGACTAGTAAATCAAGTCCCTCATACA GCTGGTTGCTGACAGAATTATTAGTTGGCATTGGCTCTGGCTCTTAACCT GTGCATTAGAGCCAAGTAGGCAAAGCACAATGTTTCTATCAACCCTATGC TTGTTGTTTTCCTTCTGAAGGAAATGAAGCTATCCAAAGGACCTTAAGGG ATAGGATTTTGAAATATAAATCACCAAGTTTGCATATTGTTGTTTTGCTA TGGAGAAGTTAGTTTCTTGTCCACAGGTATTTTGGCCATTATCCTTAGGT GCATTGAGTATTTATTTTGCTTCATATTGTGCTGTGGCATAGTCATCAAA TTTATGTTTAGAAAACTTATGGTAGGCGATACGATGGGTGAATGATTGTT TTCCTCTTTTTATCTTTTCTGCTGGGTTTATTTGGCTATGCAGGAGCGAT GGATTCAGCACTTAAGACAATAGGTACGAAGGTTTGGACTCTTTTGAACC ATACAATGCAGATCCTCCAAGTGAAAATAACCAAAGCTATTGTTTTCTAG TCTTTGCAATTGATAGAACTTACAGTACAAAACAAAAGACAAATTGATTG GAGTTATATGACTTGATAGCGACTTGTATGGCGTATTTGGCGTTTTCCTA CCCTTATGTATGAGGCATTCTGCGTTAGCTATTTGGAGTTGATACAGTAC ACATGTGAAAGAATGATTTAACGTGTTTGATTTTTTTGTTAGTGGTAATT TGATCTCCGTGAAATGGTGTTGAAAACATTTTTTTGTCTCAAGAAGAAAC ATATTTTGTTATAGGACTACTTAGATGAATATATGAAATCATTGCTTCTG AATCTGCTGCAGTAAGATACACTCAACTTGATTATGAATGATCAAACACT GCCTTTTGACATCAGATGATTGGTTAGAACTTGCAAAAGAAAGCATGGAG GTGGAGAAAAGGAAGATAAAATATAATAATACTACATAGTGATTTGGAAG ATGGAGAAAAGGAAGAGCAAGGAAAATATCCCATATTGATTCCGAATCTT CCAACAAGAAGCTGGTGGTAATTTCGGAGCCCCTCCTTCCTCTACAACTA CATGTGTGTGTTCTTATCCATCCCAATTTGCTCAAGCAAATAGAAAGACT CAAAGTTATCACTGCTTTGTTTATGCCATTGCAATAGAGACTTGGATGAA AATGACGCCGACTTGGGGAGATTTGTCACACACCCAGTACACATTGGAAT GCTCCATTAGCTCAATACAGAGATGTACACGTGGGAACCAATTCAATTGC TTGCCAGACAGGAATCTTGAGATGTCGGAATCTCTGCTGGCATGCTGCAA ATAGTGATGCAGGATTGTATCTGCGCATGGCGTGGTTTGCTCTGTCCAAG TCAGCCATAGCATCACCAGTCCATGGGTGATAACAGATTAACAGTAGCTA GTGAACCCCACTATGGAATGATAGGACATTAGATGCACGAGGGGTGCCTA AAACTGCCATAGAAAAAGAAAGCTCTGCTGTGGAGTTGCATTTTACTTTC CACAATGAAGAGAGACCCGCCCAGCAGATGAATATAGGGGTAGCTCAAGC TCAACTGATTTCTTCTGCACCAGAAGTCATATCAATACGGAGAAAATGCT AGCAAGATTATCATTTTCCATTGAGTGCTTGTTCAGTTAGTAGCGGGCCC AAAACTCAAGTGTTGTTTTAGTCCTTGTGTCCATGGTCTTGAAGTTAACC CTGAACTTGGCAGTCAAAATATGCCTTATATTTCTGAAGGAAGTAAATAT GTTGTGAGCAAATCTTGAAGGTTCCACTCACAGTATCTTAATTGATGGCG GCCCTATGCTGAAGTACTTGGTATCAAGCTTGATCAGCTCACCCGTGACT TTTCCTTTTTTGTCAATCGTTTTCCCTCTTGTTTTTCAGTTGAGCAAAGT CATGGGCATGGTCCTGAATGAGCGTTTACTCGGTACAGGTTTTTGTCAAA TCAATTTAGGAGGCTGATTTGTAGCCGTCCAACAGGTTCAAGTTAAGTAC GCGGAGACAACATGCTTGCACTACACATGGCGTGCTGCAGAGTGTTCAGG ACTTTTTGGCGTCATTTTTTGATGGATACACAGCATCGGCATCACTGCAG ATATGAAGGACTGCGGTTGTGGCCTCATAACTGGGAAATGTACCGGTTTG AAGGTAGGGGCTAAAAATCATGACTCCTGGCGGTCGGAATTCGTTGGGAG TTGATGAATTCTGTCATAAATTATGCCCATATCCTCCACTGGAAAACGAT GGATCTATGGTGTCCATTGCCTAATAAATGGAGCACCATGCGAAGGGATT TGTTTTCTTTATCATGAGAATGTTATGTGTTTTTGTCTAATATGCTTAGA AATTATCTGTTCAGCCTTGCGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.