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GrainGenes Sequence Report: AE036207

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Sequence
AE036207
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE036207
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGGAGAGAGGTGTGAAGAGCGTTTGTGCTTCTCAAACTCGAGCCCCCGCA
GACCCCACCAAATCACACACCATTCCCGCATCCCCTTGTCTAATACTACT
ACTCCCCAGCGCGCCTCTAATCTCGCCGGCGTCCTTCCTTCTCGCCGGCG
TCCCCGTCGTTGGTCACCATCCGTCCGAAAGGTGAGCACGCCCCCAAACC
GTCTCGAAGCCCCCTCCCCCCTCATCGGCTTCGATTTTGCGTCGTCGTAA
CAGGCGGGGGGTGATTCGTTTTTTTTTCTTTTGGTTCGAAACAGAGTGGG
GATCGTTGCAGGTGCGTGAGTCGATCGATCGGCGGAACTGACTTCGGCGA
GGCGATGTTCCACTTCCACGCCGCGCGGCCACCGAGGCCGACGGCCGTCC
CCGCGAACCGCGCCTTGCCACGCCTCTTCGGACGCACGGCCGCGCTTGCT
CGCCCTTTCCCGTCGCCTCCTCCTCACCCACTCGCTGCGGGCGGGAGCAT
CGTGCGGGCGCGCGGCGAGGTGGAAACGGTCCGTGGTCGAAGCCAAGCCG
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GGGGACAGCGCAGAGGGGGGTGCCGGCTTGTTGGAGGAGAGGGGAAGCAG
AGGCGGTGAACTGGACAGGAAAAGGGGGTTGGCTTTCGCCGCGTTTCCGC
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CGTCTGTTTCTCGCCCTGCCGGTACCGCTGGCTTGCCGCTGGAAGATGCG
CCTTCCAATGCGGGTTTTGGTGTGCCGGAGAAGGTGACGGCTGCAGATGT
TGGCGGTGCTCCACTGTCGGATGGGTGCCATCATGGTCTAGAGGCTGCAT
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AAGCTGCGCCTGCCAGTGCTGGTTTGGGTGGTGTGCCGGAGAAGGTGATG
ACTGCAGATGGTGGTGGAGCTCCAGTGTCAGATGGGTATCATCATGCTCC
AGAGGCTGCATTGGTGAGATCTTCAGATGGAGCAATAGGAGTTGCTGGTT
TGGTGGTGAAACACATGGTAACAACACCTGGGAGTGCTGAACTGGGGATG
AAGGAGTTGACGCCGATCACGCGGCCGCTACCGAATCGGAGGATGGTTTC
TGCCAATCGCCGCTTCCCTCCTGGCTGCGGAAGGGACGTCGTGGTTCCAC
TTCCTAGCAGAGGAAGCAGTCAGGTTCGTTTGCGGCTGGAAACCCTGCCT
GCTGATCGTGGTGGTTTGGGTGCATTGGTGGAGGCAGTTGTGACAAACCG
TGGTCGTTCCGATGTGTGTGCCATGGACACTATGGAAGCTGTGAGCAAGA
ATGCTTTGGATGGAATAGCAGAGGTACAAGAACAGGAGGATGGTGAGATT
CCTACAGAAGATTATGTTGAGATTCCTACAGAAACTGACCATGTCCTCCC
CCAAGAGTCTCATGTTACTCTCAACAATGGCTTGCATGATCTTAGAGCTG
GTACACATGAGTCTGCTGTTCCACTAATCGTAGCTGTGAAACCATCTATA
CGACATTTTTCTAATGAGCACATCCATGGGAACCTACTGCAGGGCAAGGG
AAAGACTGTATCATGGGCAGTTGCTGAAGATGTCAAGGTGATGAACAAAT
GTGAAGGCAGCTCACCCAGGGTTGCCACTAAACCTTCTGCTCAAGGTCCT
CCAAAAGAGTTTCAAGTTAAAGCTGATAGACACGAGCGTGCTGTTCCTTC
GGTTGTTGCTGTGGAACCTTTTATGGGGCAGTTTTCTAATGAGAAGATCC
ATGGGAACATGCTGCAGAGCAAGGGAAATACTGTATCACGGGAAGTTGCT
GAAGATGTCGAGGTGATGAACAAATGTGAAGGCAGCTCACCCAAGGTTGC
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TGTCTGAAAGCTCTAGCATGAAAATGACATCCCCTCCTGTGGCAGCAGGG
GGGCAAGGCCAAGTTATAATGAGAAGTAAGGTGAAATTCACGGCTAGAAA
ATCAGTTCGGTTACCTGTTGAAGAAAATCATAATCCCAGGTCGGTTAATC
TGGATAGACCCTATTCTACAGGCAAGGAGATGGAGTCTGTCACTGTTACC
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AACTCAAAGCAAACATCTTCCCATGAATGTTGCCCCTACATCTGCATTGC
ATAGCAAGGTGAAATTGAAGGATAAAGAGGCCTCCCTTCTGGATGGTGAT
GATGAAATTTGGAACGCAGTAGCTGGTAATGAAGGAACGCTTAAGATGTA
CCTCAATAATCCCTCGTGTGTTCCATCAGTTTGGCGTCACATGCAGCATG
GTGGCCAGAATGCTGATGCTCGGAGCAAAGTCAAGATGATTTGCCGAAAG
TTTCAGCTCATATGCCGGACACTTGTGCAAGCTGTGGAACAGCGTTCTCT
GAAGAGTACTAGAATTGATCTTGCAGCTGATAAAATAATCAGAAAATTAC
CGGGCTTTACCAAACACGGACCTATTCTGGGTAAAGCCCCTGGTGTTGAA
GTTGGTGACGAATTTCTATACAGAGTGGAGTTGGCCATTGTTGGTCTCCA
CCGCCCATACCAAGGAGGCATCGACACCATGAAGGATATTAATGATACAC
TTATTGCCATAAGCATTGTTGCTTCTGGAGGTTACCCTGACGAGTTGTCA
AGCTCAGGTGAAGTAATATACACTGGCTCCGGAGGAAAGCCTGCTGGCAA
GAAGGAGAATGAGGATCAAAAGCTTGTGCGCGGGAACCTGGCCCTAAAGA
ATTGCATCAAAACAAAGACGGCTGTCCGGGTAATTCATGGCTTTAAAGGT
CCAAATAGAGAGGAAGGCAGTCATTCGAAGGCCAAAGAAGTCTCAACATT
TACTTATGATGGGCTCTATCATGTGGTGGATTGCTGGCAAGAAGGTCTGC
CAGGTTCAAGGGTCTTCAAATACAGGTTACAAAGGATTCCTGGACAACCA
GAATTACCTCTGCATGTTGCTAAAGGGTTGAAAAAGTCTGTAGTGCGTCC
AGGCCTCTGCATAGCTGATGTATCACAAGGAAAGGAGAAGACTCCCATCT
GTGTGATCAATGATATTGACAATGCACGTCCAGCATCTTTCAAATACATC
ACTAGAAATAGAGGTCCATCCTTGACTGCAAAAAGAAGTCAGGGTTGTGA
CTGCACCGATGGCTGCTCAGATTCTGCTAACTGCACTTGTATTGTGAAGA
ATGGAGGAGAAATCCCATTTAACTTCAACGGTGCAGTTGTTCATGCAAAG
CCTCTCATATTTGAGTGCGGTCCATCCTGTAGGTGTCCTCCTTCGTGCCA
CAACAGGGTCAGTCAGCTTGGCATGAAAATACCACTGGAAGTATTCAGGA
CAACCAAGACAGGTTGGGGTGTAAGATCCCTAAGGTCAATCTCTGCTGGA
AGCTTTATATGCGAGTATGTTGGTGAGCTTTTGCATGGCCAGGAAGCCAA
CCAGAGAAGTAATGACGAATACTTGTTTGATATAGGACAGAACTACGATA
TATGGAAGGAGATGCCATCAGCTATTCCAGTTACGAATTCTTCTGGCGCT
CGCTCTCTGACCGATGAAGAAGATGAGGGCTTCACAATAGATGCAGCTGA
GTATGGAAATATTGGAAGATTCATCAACCATAGCTGTTCACCTAACCTCT
ACGCACAGAACGTTCTCTGGGACCATGATGACAAAAGAGTGCCCCATATC
ATGCTCTTTGCCGTGGAGAACATTTCACCACTACAGGAGCTGACTTATGA
CTATAACTACGAGATAGATCATGTCCATGATCTGAATGGCAGAGTAAAAG
TTAAATATTGTCATTGTGGTTGTGCACAGTGCCGCGGCAGGCTTTATTAA
GGAAAGGATGGCTGCTGGTGCTAGGAGTTTTAAATCCTTTTGAATGTTGT
TGTTTCATATTTTACCTCCTTTTCATTGGAATCCTAGTAAGTAATATGTA
CTACTACGTAGGTAACATGAAATGTTCATACGGGTAAAAAGGTAGTGATT
CTGTTGTCAACTACTCCAGTGCATCTTATTATGCTCACTCTGATTTGTAA
ATATATAATATTGGCGATCTGCGAGGCTGTGACACACTCTGTTTTGAACT
TTGGCTGAGCGAGAGAATCGAGTAGAGGGAAGAGAGAGGAGAGGAAGAAG
GAAGGTAATTGCAATGACATGTGGGCGCAGGTGATATGGCAGTCCACGAT
TGCAAAAAGGCATGTTAGCATGCCATACCACCCTGCAAAACAACTTGAGG
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CCTCATTTATTGCTAAAAGCATGTTTGGTTTAGGGTATTGGGCTAATTTA
TTCCCATTTTCCCCACTTTTTCCTAAATTATAGTATATTCTTCCCAATAT
CCAATACACCACCCCTACCTATTTGATTGGGGATTGGGGTTTTATGAGGA
TTAGAGTGGTTCGGGTGAATGTAGGGGTTTCACCTAATTCCTACAGTTTT
GCGAAGGTTAGGAGAGTTTTTGGTCTTGACCCCTCTGAAAACCCCAAAAC
ATTGTTGATCAAATTTATGCATTGTTCAATTCAAGGCTGCTAGCTATGGT
CATAGATGCATGCTGTTCTTTTGATTGTTTTGCTTCCTCTAGATTCTTGC
ACTTGAACTTATAGTTGCATAACCATTCAAGTTAGAATGTAATTATCAAA
TGTTTAACTGTTGGAGGCCATAACTTTTTACTAGATAATTGGTGGCCATA
AATTAGGAAGAGGCCTGTTTGGGGACCTTGGGAGCCGTCCGACTCAAAGG
TGTGCTGTCCCGGCCGTCGACGCCGCCGATCCCGGCGGTGGTGGCAGCGC
CCGGCCGTCTAAGATGGGCGGGAGGAGAGGCGCTTCCCCGGTGGCCTGAC
CTACGCGCGGAGGGCGGCTGGTTTGGGGGCGCGGGGGCGACGTCATGTGC
GTGCGCTCGAGGCTGAGGAGGGAGCGAGGCGGCAGAGCCATGGCGGCGCT
GGCGGCTAGGCACGACATGGAGAGCCGGCGACGTCTAGGCGGGGCTTGGA
TCTGGATCCGTTCTGGGCTGGCCACGAGGCATGGTGGAGCTGGGCATCGG
GATCCCGGGGCAGCGCTCAGACCTCGCTACTGGCGGAGCCCTGGTGACGG
CGGTGCGATCGGGTCGTGCAGCTGCCTACCGATGATCTGCTCTATGTCTG
GCGGCCAGACGTTCGCTGTTTGGCTTTTGTTTGTTGAGCCTCCTCCTCGG
CTGCGGACCGGTGGCGTCGGGGCTACTGGTGCGCTTTTCAATAAAGGTGG
TTGTCCTAGGGTTCCTCTTGTGCGAAGATGGAGACCTTCCTGAGGCCGGT
CCTTCTTGATCTAGCGGGAGTGTTGAGTTCCGGAAGGCTCCGCCGACGAA
TGTAACAGTGCACATTATGCCTGGAGTTTGCTGGATCAGGTGGTATTCGC
TCGTGCGCACCCATGCTTTTATTCCGACCGTTTGGTTCTGGAGGGAGCGG
CGCGAAGCTCTGTTCTATGTTGCAAGCACATTCTGTTTAATGGTGAAATC
AGAGGTGGAGAATATCATAAAGGCTGGATTGGAGGACTAGCAATGGAGGT
TCGAGTCTCTGTGCTGTTGAGGGACTTGCTTGGTGTTCTGGTTTCGCAGC
AGCAGTATGATAGTGGGGGCGGCAGCACAGGTGAAGTTCAGAGTCTTACC
TTTCAGGGCGAAAATCCATGGTCTGGCCTTAATTGGTTGTGCCTGACAAT
GACCTTGTTGAAGGCATTGTTTTGAGAGTGTGAACTATCTTTAGGGTGAA
AACCTAAGATCTTTTGATCGGGCGACGATGGTGTTTGTGCACTATTACCT
TCTTGGAGGCGTCGCTTTTGGAGAGCCTGGAATTCAGGTGTTGTCTTGGT
GGTGGATGTATTGTTGCTGCTAGAGCTAGAATACCGTAGCGGGACTTTTA
TTTCATAGTTTTCTTTTTCTTTTTTTTGGCTGTGTGCATCAGTATTGCCA
TTAAGATATTGCGTTGTTGCAGAGGCTGGGTGTATCTCTCGATATTAATA
TATGCTCCTTTCCAAAAAAAAAAGAGGCATATTTTACAGTAGTACCTTTT
ACTAGTGCTAGGGAGGAGAGTAGTATGAATTGATCGGATGGTTAATAAGT
GTGGGTATATTAGGCATTTCTGCATGAGAATTTTTCCCCGCTAAGATGGA
GATGAGGCCCAGCAGCCCGGTAGGCGTAACGCAAAATTCCGAAAAAAAGA
TAACTGAACAAATGTTCTAATCAAATATGTAACTTCAAATTTGAATTCCT
AATTGTGTGCAAATAAATAAGACAAATGGATATTATAAGTGTGGTGCTCT
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GATGCTGCTAGGTGAATTTTGGTTTGAGTTGACATGACATTAGTGTTATT
TTCTGGATGCATGTTGTGCTTCACACGGTCGTCCGGAGTTGCAATTGGTG
AACAAGAGAATGGGTTTTTTGTTATCACCCCTGCAAATCGCTACCCATCA
ATTGGTGAACTAGGCCTCCTCCAACGCACGCACGTGCTGATGTTGCAGCG
GCCAAGACGCCCGTGCCCATGGCTCGACCGCAGCTGCGTCCAGTGCACGA
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CTGATGAGACTAAGGTTAGTTTCTCCTCATCTTTCTTCCCCTCTTCCCTT
GGTCTCTGTCAAACAGATTTGGTTTTGTAGTATCTGTGCAGGCAGGGGGT
AATTGCATGGAGAAATCACAACTGCATGCTGCAAGTGAGATGTGATCAAT
TCAGACACTTTGTTCACCATTATCAGATTTCATCATATACTTCCAGTCAC
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TGGGTAGGTCACAAGTAGGCCTTGGACGTCTGCACCAGAGTGCAAGGGGA
GAAGATAATTTTTAGTTGAGCCTTGCTTCGGTACCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCGCTGTTCAAGGAAGCATTGGTGTGTTAGTTGCCGGACGGTTTGTGGG
TGGGTTTGGGCGGGCCGAAGTCAGATTGAGCTTCTCCTGTATTGGCCACT
TATGTAGTCGTGTGCTATCAGTTACCTTGGGTACATATGTAACCATGGGA
TTGACAAAGTCTAATTCCAATGGAACTTATGTGGTTGCTGGATCTGACTA
TTTCAGATAAAGTTCAGGTGGATGGGGAGCTTGCCCTTTGACTTCATATG
TGCATTTTTATTTTCCTCAGCAACTTGAAATATTTGGAAACTGATGCCTC
ATATAATTCAATAAGAAGCTCTTATTGATTTATTTCAGGCTCTGGTTCGC
ATAATGAATCTGTGACGATACAGCCGAAGCATCCGTCTCGTGCTTGCCTT
GAGCTACGAGGAGTACGGGGAGCCTGTCAAACAAGTCGAGAGTTTCATCG
TGGAACGTCTGGAGCAGAATGGGGGATCTCAGTGTGTTCTTATCAAAGTC
CTCAGCTGTGTTTCAAGGTACAAATTGGAGATTCGTTGATGGCCTATTTG
TGGCTGTGTGCATCGATAACGTGCCATGAGCTGCTGACAGTGTCATGGCA
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TTTTCTTCAAGCATTGGTGTGATTAGCTTGACTCGTGTGAGAATGCATGA
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GAGACCATCAAAAGGCTGATCTTTTAGCTTTGCTGCTCAATATGAGCGAT
AGCAGCTATTAAAATTGACATATATGTTACAAATATCAGGGTTATTTATT
TATTTCCCAGTCAGCAAAAGCACGTTCAGTAATTACGAGTGCAGCCCGAT
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CAGCGTCTACAAGGTGCTGCTGCCAAAACCATACTCGCCAACGTCTTCAT
TAAGGTGGTTCCACTTTGCTTCTCATCTTATAGGATTTTACTATGCTTCT
TCTCTTCTGTGCTCAGATGCATTCTTCCTCTCCTGTGCTCGTTCAGCTAC
ACCATGGTTTATATCTTTTATGTCCTTGCTGTGTCCATCTATAATTAGTG
CATCTTCTGTTCCATTGTTTAGTGCATCCGCCTGCCTCTTTTGCACTATA
TAAGATTGATTTCTATGGTTTTACCTCTTATCGCTCTGAACTTACAGACG
TGACAGATCATTTGTTAGCATTTTTTATGGATTTTCCCAATTGTGTGGCA
AATCACAAGTGTCTTTCCGTTGAAATGTTTTAGTGGACAGACTGAAAATA
GATACAAGACGGAGCCAACTAGAGGTGGAGCTGGCAGTTTTTTCAGGGAT
CTTGAATTGAAAGAACATGCATTTTATAATGATGCAATTTTTCTTGGGAA
ATTGTCTGTTGTTCCAGCAGTCTGGCCACACATGAAGTAGTTGCAAAGAG
CCAAGAATCATTGGTGATAGATGGGACTGCTTATAACCGTACATATGATC
CATTGTAGAGAAAAGAGATATACTTGGAGAAGTTATAAATGCGTAGGTAC
TAGGGGCTGCTGAAACTTTGCCATAGCTTTTTCTTATGTTTGCAGTTTAC
TCCATGCAGGTGTGAGAATACAAAAACATAGTTATGTTAAGTAAATCGAC
ATGTTGCTTAATAAAATGATACATCCGAATCTAGAAAAATCCAAGTAAAT
TAATTTGGATCAGAGGGAGTAGTAACTCATCCGAATTCCAAACTACTAGG
TACATGTCATCCTTGCCATGGTGATGGTGGTTCTCGCCTGAAGCTCTGCA
ATTATTTTCTTCTGGTCCAGGTTCACACCTTATGGATTCCTTGATTAGTT
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AAAGCTGCAGCGAGCTGGTTGATATTGTTAATATACGATGTTGATGCGAG
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TGATGTAGATGTTGTGGAATGCTTTTTGCGTGCTGTTTTTTCCTTTTCTA
AATTTACAAGCTTTCTTTTGGTTTGTCAAGTCTACAACTAGAAGACACTA
GAGTATTTTAAATCTAACCCTCTGACATGAACTTACAACTTAATATTCTC
GGGTGGTTGCAAATTGAAATGAATTCATTATTACAGAGGGAATTCGTAGA
CTCCCTTCTGATTCAGGATAGATTTGTGCAATTGTGCTGCTACTTTTTAA
ATCAAGAGTAAGATGGGGACGTCGAGAGGATCTCTTCTCCACATTGAGTG
GATATTAAACCATCACCACTTCTGCTAGCATGTGCCACCGCAAAATAGCG
AGATTTCTCGGCGCCACTATAGTTCGGCAATAACATTTTAGCTGTTGTGT
TCTAATACATTAAATGCTACGTAAATTATTGCAATGAGTGGATTGTTTCC
AGCAACCTTTTCCTAATTGACAAATCAATGTTTAAACTTAACTTTTGCCT
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GATGTTTTATGATAAAATAAAATACAAAGTTATTTTTTGATAATGCGTTC
TTCTCCTCCGTGCTCTGACCTATGCTGCCCGGGTGGGAAGTCGGGTATGT
TCAGAAGTATGCAGCCTAGAGTGGCCACGGTCGAGGGATAGGGGAAAGAA
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TTGGAATTTCATGTTCATCCCGCAAGTGCCTGGTCAGGAGGTTATGGTGA
CCCGCACAAGTGTCGTCGCCTTTCCCCGTCATCCCCTCCAGTTCAGTTAG
CCACATGATGTGCCCCATTCCTTCTTCTCCGGGACCCTAATCAACAGTTC
TAATAAGGTGATAATTAGGGATTAAGGATGGTCTGCACATCTCTTGTCCT
CTTTGAGTAAGAAAACATCTGCCTCTTGCAGTTAGTTCCTCCACTGCTTT
TAATTCCACATAGAAGTATGATTGGCATATTGACTCATAATACAGTATCC
ATTATCTTACAGTTTTATTATGAAAGAAATTACCAGTATCCTTCCTCTTC
TAATCTTCCTATACTGTTATACTTAGTATTCAGTTTTTACTACTACTATC
TTTGGTCATAGCGTGTGCTAGAATTTACATGGCATTGTACTATCTATTTT
TTATGTAGATAGTGCTCACTTAGATGTATAGCTTACCACTATCCATAACA
TTTGCTAGGCATCTTCCAAAGTAAAATGTTTATCTCAAAGTATTATCTTA
ATTTGAGTGTCATTACAATTTATACCATGTTTTCCCTTATTACAGGTCTA
G

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.