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GrainGenes Sequence Report: AE021480

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Sequence
AE021480
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE021480
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATTTTCCATGCTCTTAGACCCTCCTCTTCTTATCCCGCTCCGTTCCACCT
GCGCCCCACATACTACACACTCGTCTTCCCCAATTCCAGCGTCCGACCAC
TAATCTCTTGCTCGCCGTCGCCAAACTCTTCATCCCCTCGCCGCCCTCCA
TACCATCCACCACAGGCCGGGGCAGCGCTCATCCGATCCGACGTCTCTAC
GCTCTACGCGGCGGCAGTCCGCTTGGCTCACCACCCAGGCGTGAAGAACA
CATACGTCTAATGGCCCCGCAGCTCCTGGGCTACTACTGGGTCTCCTCCT
GGCCCCGGCTCCCGCAAGTTCCCCCGTGGCCCTGCTCCTCCCACTTCCAG
CGTCGCAGAGTGCTGCGCCTCGCGCCGCCCCTCCGCCGTGCCGGCGCGGT
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GGGCGGTGGAGATCCAGTTCCCAACGGAGGAGGAGGGCGCTGCGGGTAAC
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AATTTCCTATCGGTAATTTATGTGGAAATCTTTGACTAAAATCGAAAAGA
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ATACTTCAATAGGATGAATCTATACACTAAATATGTCTAGATACGTATGA
ATCTAGACAAATCTAAGTCACTTATTTCCGGACGGAGGGAGTATAATAAA
TGGCCTAGGCATAGTTGCATATGGAAACAACAATGGCTTATTGAATTTAT
GTGCAGAGACACTCCAGCGGATTCGTGAGAAGACAAGGCTTGCCATGCAG
GATCCCAAGGTGAAGTCATGTAAGAACTATCGTTGTTATTTATATCAGGT
GTCATATCAATGTCATTACTCTCTTGGTATTTGCATAACCTTACTTGAGC
TAACAGCTTCATAATGATGGATTGTGGATAACTAATTGAGTAAACTAGTC
CTGAACACGTGCATTCACATGGGCTAGTTTTAGAATATCATCTAACTACA
TATAATGATCATATACTGATATGTGATGTGGACAACTACTTGGGATGTGT
GTCCAAGCATATAGGTCTAGAGACTCAGGGATTGTTAGGAAATATATGCA
GGTAAGACAGCTGAAATCATCACAAATAATGCTACCGAACTTATATATTT
TGTAATAATTCTGGGTTGTGGAGCATTTTAGTTTTCTTTTACCCCAAATA
TTCTGTTATATGTATGCTAATATATCTTGAAAGATATATGCTAACGCAGT
TTTGTGGCTCGGAATGTAGAATAGTAGCATTTTGTTTAGCATCTGGTCAT
AAATCGATGGTGCCCTCCTATAAAGGATGCTGACAAACTTCTCTAATTTT
GCTATATTCATATATAGAAACATATTCTAATTGTTTTAGTGATAACACTA
TCATAGAACATTCATGGACAAGAGTTTCACTATCATAAGGTATAATGTTT
TATTAACATTTTTTAATGAAAATTCAGTCTCAAAATAAAACGTTCTTGAC
TGACTACATCCAGAACGTCTTAAATTTATGAATCGGAAGGGGAATCGACT
TGTGAATAAATTTCTTGTTTAGTACATAAAAGACGATCTTTATTTCATAC
CCTGATAACTAATTATGCTTTGTTGATCTTGTCCTAATATGTAAGTATAA
GGTCGATATATGACAATATTTCCTTTTGAGACATTTAAAATGTGCAGACG
TTTGAATTATAAAAAATAATACAGTAGTTAGTTCCAGAAATCGATATGGA
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TTGGTGAGAATTGATAAAATAGCAGCATATGAGACGTGCAGCAGCCAGGT
TGCCCTTTGCCGACAAACCTCCAGATAGCTGACAGGCTGATGACTCGAAT
GATTGAGGTCATTGGTGTTTGATGCTAATCACGATAGCTCATAAATTTGC
ATAGGAAGCATGCACAGAGTTGCATGAACTCACCGTATTTACGTCAGATT
ATAATCTTGTAAAGAGCGCTGCATGAAAATTCAGTCACTGGATGATCTTC
TGGGCATGGTACTCCACCATTGCTTGTCAGCACGACAACAGCCAAAGGGG
CCAAGGTTAGCCAGCCGCTAGGGAAGCTTGGTGCAGTCTAATCCCCAACA
AGTCCTATCTCAGCCATTATAACTCGGATGAACTGTTGGTGTTCTTTTCA
TTTTTTGTACGATTAAAATGTGATCTTCCAGGGTGTCTGTCATTGTGTAG
ATATAGATTTCATAAAAATATTGCTACGAGCCTACACACATGTAGGTTTA
ACTTATACCGCACCAGTCAAATGCCTAGGCTTTACCCCATTTGGCTAAAG
CATGGTCTCTACCTCTTAAGTTTGCATCATCTGAGGAGGTCAAATGTCTA
AAATTAGTAACAAACTAAATTGCAATGTTGTTTCTCAGACAAAAGAAACA
CTCATGTTTGGATCGTGTTTCACTTGTCGAACCATTATTTTGAAGATGTA
TACCCCTTTTGATCCCTATTTCCTTCATCCGACGATCCCCAACCCTCGAC
CCGATCGACCCGGAAACATGGTTACTATGATTTCATGGTGTGGCAAATTT
TCACGACTTGTGTGTAGCTGTTTGTTTTATGATGCAAAGCAATGATTAAA
AAGTTTGAGGGCAGCGAGTTGAATTATGCTTGAAGATTTCATTGTTTGGC
CATGGATACATACAAAGGCACAAACTTAGATATATGCAGTGGCGGACCTT
GACCACAATTATAGGAGGGGCCAAAAGAGATTAGATGGCAGTTGAGGGGG
CGAACATAAAATATTTTGTATTTTATATGGTAAAAAAAATGATAAATAGT
AAGCAGTACTATGCAAATTGTAGTTGAGTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
CATGGCCCTTTTGGCCTGCATTAAGGTCCGCCAGTGGATATATGTAATGC
TTGAAATGAACGATTTGTCTGACCACATCATATTTCGATACATTTTTGTA
ATTTATTGAATCATGTGCTGACCTAAAGCAGTTTAACTTAAAATGTTCAT
GCCATCATTTCAATTTGTGTTCTATTGGGTATGTTTGGAAGTGACCTTTG
TTGCATTTCAGTTTAACTTAAAATGTTCATGCCATCATTTCAATTTGTGT
TCTATTGGGTATGTTTGGAAGTGACCTTTGTTGCATTCTATTAATAAGTG
GTGCTACATTCAGGGCATCTAAATTTATTCAGCTCTCCATTATGTTTTGA
AGTATGTATAGAGATGTAGTTTGCCTTTTTTTTGCTATCACTCGTTAAAA
CTGAGATCTCTGGTAACATGAAACCTGCAATAATACATAGATATGTCCCA
TCATTGCTGGTACTGTATGATGTGTTTACAGATACTTCAACATATATACA
ACACAGATTTGCTGCCCATGGGCATAGCTATGAATAGGATGCCGCCTGTT
CGATCTAGAGTTGCATGTGCAACCCTCTCCCGCGATGCCAAACCTCAGGC
GCTAGCCGGCGTAAATGCCGTCTACCCAGCCGTCCGCGAATTGCGTGCTA
CATTTTGTGGGCTGCACTGCAAAAATTTCGTGGGGTGGTTGTACCTAGCG
TGGGGAAACTTGCACCAAAAAATTTCTGAACCAGGCTGAAGGCGATCCTG
CAGCATTTTTCTTTTGCATGCAGTTTTCATGTACTCCCTCCGACCCATAT
TAGTTGACTTGGGTCGAAGGGAGTAGGAAAATTATCTCATACGCAGACTT
TTTGCATGCTATTTTTTGCATGCATCCATATCTAGACAAATCCAAGTCAA
CTAATATGGGTCGGAGGGAGTAGGAAAATTATCTCATACGCAGAATTTTT
GCATGCTATTTTTTGCATGGACAATGGAGCATGCTATTTTTGCACGGATG
GTTGCATGCCAGTCATTTTCAAAGAAACTCACACTGCTATGTCAATGTGA
AAAGAAATTTCTGCACCTAAAACCATCTCCACAAGGCGTAACCACCCACG
AAATTTCTGCACCCAAAACAGCATGCAGAACTGGCCAGCCCACCGTCCAT
GGGAAAGACAGCATGCAAAAACATTGTGCCCACGTGGATAGTTCCATACA
TGTAATGTGCAGCATGCAAAAAACAACATGCAAAAGATTGTGCTCTTGCT
ATGACGCCGTGTGCTCTCTATATCAGACTATCTGAATCAACGGTTAGATG
GACGCGCGCAGCTATGGGTAGCTGGCTATTTTTTCAACATATATAGTGGG
AAATGAAATATATGTTTTACTTTTTTTGCGGGGATATGTTTTACTTATTG
GTATAATTAGCTAATTATTTACAATGATTGTGTATTGGAGTAGCCAGCCA
GATGTGCCATAGCAGGCACAAAGGTAGTACCAATTGGTCCAACCACAAAG
GACCAGACCTTATGAGTTACAATTTCGGTGGAGTGTGTGGGTATGCTAGT
GTAAGGTACTAGGTGTGATCCCTGTCTAGTTCCCATCTCTGAGTTAAATC
ATCTGTTTGGCTCATTAAAACCATTTTGTGTCTATGCGTCTGTTTTGTTT
CAAGTTTTGTCTAAAGAGATTAATGTGCAGGTTAAAAAAAAGCTGATGAA
TCTTGGACATGCTCAGAGGTTGGTACCTACTTATTCTTAAGATTTATGTA
GCACATTTGCTTGTGTGAAAAAACACTTACTATTATCAGTATAAGAAGGT
ATTTTGTCTATTTTCTTATACAAATTCCTACTGAATCTTTAATATTCCGT
AATTATAACACCCTGATGTGCTTGGAAGTGGAAGGTTTAGTCCCACATGG
TTTAGTGTAAGATGTATTAGAGTTGTGAACCATATGAGCTGGATTGTAGT
GTTGTAGGCTGATATAAGGGCAGATGACTAAGTAGTACTGTAGGCTGGAC
ATACTTCTCGTGTTACAAGTCCGCTCTTTTTGACGTAATATTCACTGGTA
AATTTTTTTTCCGTCACAGTTGGATAGACTTGAAGCATGTAAATTATTAG
TCTTGAGATACTACCTCTGTCCCAAAAGGATGTCGCAAATTTGTCTAATT
TGAATGTATCTAGTCACTATTTGGTGTATAGATACATCCAAATTTAGACA
AATCTGCAACATCTTTTTTGGGACGGGAGGAGTACATGCTTGTGTTTATG
GAAAATAATATTTTACCGCGCAGAATGTATCCTCCTGTTCTGTCCCTGCT
CCCATTTTAGTGCAGATATGTTAGCAGTTTATGCTATTTGCTGACTCATA
ACAAAATTACTGATAAACATTGGTAATAAGAGGGTCAAAACACTTTTACA
TCGACACATCTAACTAAGCTGTAAGCCGGGAGAACCAGGAGCTCTGTGAG
GCTCCCTTTCGTTGTTGTGTCATTGTTGGGTAGCTGCCAGGTGGGGGCCT
CCGTAGTCGTAGTCGGTTTGTTTCCACGCCTGCAAACCCCATGTCTGCAC
TTTGCCCTCACTGTCCCCCCTCTCTCCCAACTCCCAAGCGGCAAGCGCCC
CTGCGTCCTAGTTGTCTATATTCTTGAATATCTTCCTGCATGACCATCAC
ACATACTAAACTAAGCAGAATATATCTAGTGGCAGTGGAGAACCAAGCGC
TGGCTTGGTGGCAAGGCTTGCGAGTGCGCAGCCAGTCCACCCGGGTTCGA
GTCCCCATGGGGACCGAATTAAACGGGGTGTTACCCAAGCGCGTATAATC
CGCTGCTGGAGAGGTCTCATCTACCTAACAACGTACAGCCCGCGAGGGAT
CATTCCCCGTGGGTCAACGTTTTATATATCTAGTGGCAGTGTGGTATGAA
AGCCTAGGTAGAAGTTGAAGTTGATGCCTTTTTGGACAAAGCACATGAGT
TGGTCCTTGTTTGCATCATTGCATGTACTGATTCTTGGTCAACTTGTCCT
TGAACATAGGGCCGTTCAAATAACTTGAGCTTGACAAGTTACTCAACCTT
GGCTCAGTCCGGGTTTGATTAAAGTTCTGCTTAAATCAAGGCACAATGCC
TATACTATAGCTCACGTGCTTTAGTGAACCGATCTCAAATAGCTCCTTTA
GTCTTGAGTTTGTTTGCAATTCTTCCACATACCACTTCATACTTTTGCTC
GGCCGTATCAGAACTTGCAACTTTGCTGCAACCCACAAGTCTGAACTCTG
AAGTCACCAAGAACCCATGGCCAACCTAACACCAAACCACAGCTCTAGCC
TTAGCCATAATGATCGTTGCCTTATCCCCCATCCATCAAACTCCCATCAT
ATAGTTTAAAACCCAGATTGAATTGATGTTCTAAAAATATGTCAACAGAG
TTGTATCTATTGTGGTATATGTCTTGTCTCATTTGGACAAACACACGGGA
GATAAGTACCACAAACCAACTGGCTCAGTTAGTTGGTATCAGAGGCTATG
TTAGCTGATTTTTTTGTTGACTACTAAGAATTATGTTTCAATTAATTTTA
TTGGCCTAGATATATTTTTAGTGAACCGATCTCAAATAGCTCCTTTAGTC
TTGAGTTTGTTTGCAATTCTTCCACATACCACTTCATACTTTTGCTCGGC
CGTATCAGAACTTGCAACTTTGCTGCAACCCACAAGTCTGAACTCTGAAG
TCACCAAGAACCCATGGCCAACCTAACACCAAACCACAGCTCTAGCCTTA
GCCATAATGATCGTTGCCTTATCCCCCATCCTTCAAACTCCCATCATATA
GTTTAAAACCCAGATTGAATTGATGTTCTAAAAATATGTCAACAGAGTTG
TATCTATTGTGGTATATGTCTTGTCTCATTTGGACAAACACACGGGAGAT
AAGTACCACAAACCAACTGGCTCAGTTAGTTGGTATCAGAGGCTATGTTA
GCTGATTTATTGGCCTAGTTGGTATCAGGTCCACTGGTCTAGATATATTT
TTGAGTTAAATACATGGATGGTCACCGAACTCAACCCCCTTACCCACCTT
GGTCAACATAGAGATACGCAATTACGGTCATCAAATACGCCTAGTGCTTC
ATCGGAGGTCACTGGAGCATGTAGAGCAACATATTCGCTGATGTGGCACT
GAGTTGGCCAGTCTCTAGCACAGAGTTTTTTTCCGCAAAAGGACCCTCCT
CAATCCTGCTTTCCTATTCAACATTTCAACGCATGGGAACTAGCCGGTCA
CACTGACCGGCGGGGCCCATTGGTCAGGGTCACCCACACATCGTCTTCCT
CTGTCTCCCCACACGACGCATCGCTCCCAGATCCGGCGACTGGCGTCTGC
CCCTGGCTCCCCACGCTGGCGCTGCTAGGCCCTGTTTTCTCCGGCGACGC
AGTGCCTTCAGGCTGGCGGCGCTACCGCTGGTCGCAACCCCGAAGCAGTG
GTAATCGCTCCTTACATGGCACCTGGCAGCATGGCTCTAGCTCCTCCTGT
GAGGCAGTACTTGGCAGTCGGCGGCTCTTCACCTGGTCACAACCATGACG
GCGGTGTGGCCGCAGGTCCCCGCAAGGCACCTGGCGCCGTGGCTCTGTAC
CCTCCTGCGAAGCGGTCCCTGGGCAGCGACAAGATGCTGCTCTTCCCCGC
GCATGTAGATCCTCCGCCGAGGACCATGGAAACGAGATGAGGGAGGAGGG
AATGGGGCAGCACCTCCGCATCCAAGCACCGGCGGCAGTTTGATGTCTCC
CAGCTCGCCTTAGGGAGGAGGAAGAACGCCAGGAGGAGCGCAGTCCGCCA
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GGCAGAAGCAGCTCGCTGGATCCCCGGCTTCACACCACGCCCGCCTCTGC
AGTACACGCCCCGTCACGCGGGAGGAAGAAGCCGAGGTGGGGATTTTTCT
TTTTCTTTTTTCTTGACAGTCGAGGAGGGACCTTTGTGTCTAAGGAAAAC
AAGTTTAGGATCTTTGTGCAAAGTAAAACATAGCTGGATCCTGACATGCG
GGGTTGACACGCTGCCACATAAGCAAAATACATAGCTCTAGATGCTCCAG
TGACCTCCGATGAAGCACTGAATGTATTTGATGACCGTAAATTGAGTATC
TCTATGTACGGTGGTCAAGGTGGAAAAGGAGGTTGAGTTCGGTGTCCATC
CATGTATTTAACTCTATATTTTGACATGCTGACTGTATTTTCAGGGCATA
TTGCAGGTTCCTCACAAAGTAAATAATAGCTATATTTCGTACTGTTTATT
GAATGTGTATGCTATTCATATTGTAGTTGTTCTCAGTACATCGTTTTTGT
TTGCTGACCAATTTGTACATGATGCTTAACTTAAACATCCTTTTATTTCT
TTCTGTCTAACGACATCAATTGTAGTCATAGATGCTTTCGTAGTAATTTC
TATTTCTTGTACTTAATACAGCGAAGAGACCAAAATAAAGATATCATTGG
GAGTTAGGCAAGGTTGGAGCTTGCGTCTACAGAAGCTAATGGTTCAGGAT
GGCTGCTTTGTGGAGTGGCGGGACATAATAGCAGATGCAGCTAGGAAGGG
CTTTGCTGGTGGAGTGCCCTTTCAATGGAATTCACATAAAATATTGACTG
AGCAACTGCGGCAGGAGTGGTTAGAGAAACTCCAGAAAAGAAGATCAATG
CCTAGGCCGACTGGTAATAGAAGAGCACCAAAAACTCCTGAGCAGAGGAG
AAAAATTGCAGAAGCCATTGCTGCGAAGTGGTTGGATCGAGTAAGAGCAT
AACAATGCCTGGCTGAACCTATTTCATGTTTTCCATCTTCTCATTCTAAT
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AACGTGTTTGCAGTGCAATTAACAGCTACCATGGAACATCTGCTGGATCT
AAAGTACCACGGAAACCAAGAACTCCTAGAGAACCGGGTGCAAAGAGTGA
AGCTGTGAAAAGGAAACCTTCTAAAAACAGAGCTGTCAGTTTGGAGAATT
CACACGTAAAAACTGCAACTATTAAGAGAAAGAAAAGTACAATTCCTTAT
AAAGATCCTATGGCAGGAGAGAAACTAGAGATGATAACGAAGATACGGGC
CCAAAGGACATCACTGGAAATAGAAAAGAAAGAGGCCATTAAAAGAGCCA
GGTATGTTTGCTTATTTATTGAAAGAGGCCAGATAAGGAAGATATGGACA
CCTGTACTTAAATTTTTTTGTTGCTGCATTTTGACACTTCATTCAACTGG
ACTTTTGACTAATCCCGAGTTCTGACAAACGTTAGGGAAATAACCTGGCA
ATGATGGCCAAGTTTCCTTGTATCACCTGAATGAATGCTCACTACTAAGG
GTACACTGCCGTTGTTTGTTACGTCATTCAAGATTAGTTTTAAGTTCATG
AACGTGACATAGGTCAATGATGAATGACAGAGGCATGTAGTCCAAATGAT
AAATTTCTTGGATAAAAATCAGAAGTCGAAACCACATACTCCCTCTGTTT
CAAATTACAAGATGTTTTAGCCTTTTTTCTGAAACACATGTGTCTAGACA
CCTTTCGGGCACCGTTCGGTTCACAGGATTTCTGGAGGATTTCCATAGGA
ATGTTGTTCCTCTGGAATTGTTTCCTCTGAGGGCGTTTGGAATGAGGCGG
GAAATGTGAACAGTGTTCCAGAGGAAAAGTTGCTCCGTCGTACTGATTCC
ATAGGATTGCAAAAATCCACCTGGAGCTCGTTTTTCGGGCGGAAGCCCAA
GGCAGACGCTCGCAGCCGTGCATGATGATGTGGTGTCCTGAATAAAAAAC
TCGATCAATGTGGGCTACATCAGGTGTAAGTACCGGAGCAAACACTGTGC
AGCCTAATAAGAAACTCTAACAATCTGCTCTTGGCTCATAAAATACTCTA
GCAGCCCCAGGAATTAGAAAAGTTTCCTGTATGTTTTGGAGGTCCATTCG
AACACTTCCTCCTACAGTTTTCTGTTCCTTAGTTTTACCTCTACCATCCT
TTCCCATTCCTATGTTCTCATCTGATCCTAAGGTTTTCGTCCCTGCATTC
TGAACGGGCCCTTGGTGTGTAGGTTCGGAGCAAAATGAGTGAACCTACAC
ACTGAAAGATGTATGGATACATGTGTTTCAGAAAAAGGCTAAAACATCTT
ATATTTTGGAACGGAGGGAGTATATGACAATCCTCTGGTAGAAAATAGTG
CATCTCTTTGTTTATGCAAGAATGTTTAGATTCAACTTTCCAGCTGTAAG
TTATATTCTTCTTCACTACCAGGTCACTCATTGTAGAAGCCGAAAAAGCT
GCAGATGCTCTTGAGACTGTCGCAGCAACAAATCCTTTTGCGCAAGCATC
ACTTATAGAAGCTAGAAAGCTTGTTACAGAGGCAAGAATATCGCTCCAGT
GTGTTGATGATGATGAAGGGCATGCTGAAAGTTCTTCTGATGGTACATCA
GATGAATCAGGCATATCAGAACTGCACGAGTACAACCTGGAGAAGGATAA
TGACTTGATTAAGCAAGAGAGTAAACCTGTAAATGGCATGAAGCTTCCTC
CAAGCAATGTTAATGGCATGGATTTCTATTTTGACGTGTCCGGACTCGGT
GAAACTGAACAACTCAGTGTTTACCAGAGAATAGAGAACTCCATGGAAAG
AGCTTATTTGCTCCCTTCAGCTTCTTCAACAGCTCAGGATGTGATCGGAA
AACTTGGAGCAAATGATCTATATGTCAGTCAATCATTGGCCAATAATGAC
CAGATCGACCAGATTGACCAGATTGCAGCAGAAACAACAGATGTTTATTC
TGCAGAGCCACTAGAAGATGTGTCCTCACCTGGGAGTAAGTCTAAAATGA
GATGGGTACGTGGAAGATTAGTTGAAGTAGAAGAATAAACTAGGAAGTCT
AAGCAGTCGAAGCCGTCTCCCAAGACATCATCATCTGCCAATTCAGCATC
TTGCTTGTTTCAGATTTGCTTCCATTTTGTAAGTTGGTTCTGTGTGCTGC
ATGGGAAATGCAATGTTTGCAAGGAGATGCTCGCTTTCATTCAACTGACT
TTTATGGGATGCGTTTATTTTGGTATATTTGATCCCAGGAGAAATGGATG
AGCATCTCAAGAAGCTGCCTTCTGAGGTGAGAGTTGTAATTAGTAGTTGG
GCTTTTAGATTTTGCCCACGGATGTTTAGTCAGCTTTAGGAAAAATCTAA
TCTGAAGTCATGATTTGGACAATGTATTTATATTGAATTAGAGTATTATG
TAGCCATCAATGACATTGTAGCTGCTGGCCTTAGTAATTTGATTAACTAG
ATAATTCCCCGTGCTTTGCTGCATGGTATTTAGATAAAATTCAAATTCTT
ATAGTAGAGATGTCCATATGGCCTGAATGTATGTAGACATACATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.