Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE041628

[Submit comment/correction]

Sequence	AE041628
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE041628
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGTTCCCTATGGTAACTGGGTTCATGAGTTATGGTCAACAAACAATACG TGCTACACGGTACATTGGTCAAAGTTTCATAACTACCTTATCCCACACAA ATCGTTTACCTATAACGATTCACTACCCTTACGAAAAATCAATTACACCG GAGCGTTTTCGGGGCCGAATCCACTTTGAATTTGATAAATGTATTGCTTG TGAAGTATGTGTTCGCGTATGTCCGATAGATCTACCCCTTGTGGATTGGA GATTTGAAAAGGATATTAAAAGGAAGCAATTGCTTAATTATAGTATTGAT TTCGGAGTTTGTATATTTTGTGGTAATTGTGTTGAGTACTGTCCGACAAG CTGTTTATCAATGACTGAAGAGTATGAACTTTCTACTTATGATCGTCATG AATTGAATTACAATCAAATTGCTTTAAGTCGATTACCGATCTCCATAATG GAAGATTACACAATTCAAACAATTAGAAATTCTACTAAAAGTAAAATAGA GGAAGATAAATCTTCGAATTCAAGAACGATTACTGATTACTAAATTCGTA TTTTTTTCTTTTCTTTTTGTTATAAAAAAAGAATAATCCTTTACTAACTA TAAAGAAAAACGAATAACTACATGCTTATTCGAAATTTTTTATTATTTTA AATAAGACTAGATTTTCGTGATATAATTTCTAACTATAACAGCTTATACC CCCAAAAAATATCCTAATCCCTTTTGCCTTCCTTGAATTCTTTAGTTTTA GTCAGTTCATGAAAAATTTTATACTATTAATTTCTTTTTATCCATAATGG ATTTACCTGGGCCAATACATGAGATTCTTATGCTATTTGGGGGATTTGTT CTTCTACTAGGGGGTCTAGGAGTAGTATTACTTAACAACCCCATTTATTC TGCCTTTTCGCTGGGATTAGTTCTTGTTTGTATATCCTTATTCTATTTTT TATTAAATTCCTACTTTGTAGCTGTGGCACAACTTCTTATTTATGTGGGA GCCATAAATGTCTTGATCATATTCGCTGTAATGTTCGTAAATGGCTCAGA ATGGTCTAAAGATAAGAATTATTGGACTATTGGAGATGGGTTCACTTCAC TAGTTTGTATAACTATTGTTTTTTCACTAATGACTACTATCCCAGATACG TCATGGTATGGAATTCTTTGGACTACAAGATCAAACCAAATAGTAGAACA GGGTCTCATAAATAATGTTCAACAAATTGGGATTCATTTAGCAACAGATT TTTATCTTCCGTTTGAACTCATTTCCATAATTCTTCTAGTTTCTTTAATA GGTGCAATTACTATGGCTCGGCAATAAGAAAACTTTAAAATAGTAAAAAT TCTAAGAATTGCAAATCTAAAATAAATAACTAAAGAATCAAAATTTTGAT TTAGTAAAACCGATCTACTGCCAACAAATACCTTCTTTCTTTTCTCTTTT GTTGTGTAATTGTTCTATTGTAATTAATTGAATCGATTCAATTCTTGTCC TCATATTGAAATGAATCAAGATTTATAAGGAGTTAATTAATGATGTTTGA GCATGTACTTTTTTTGAGTGTCTATTTATTTTCGATTGGTATCTATGGAT TGATCACAAGTCGAAACATGGTTAGAGCTCTAATATGTCTTGAACTTATA CTGAATTCAATTAATCTAAATCTCGTAACATTTTCTGATCTATTTGATAG TCGCCAATTAAAAGGAGACATTTTTGCAATTTTTGTTATAGCCCTTGCGG CTGCTGAGGCCGCTATTGGACTATCCATTCTTTCTTCCATCCATCGTAAT AGGAAATCAACTCGTGTCAATCAATCTAATTTATTGAATAATTAGACATA CAATCCTATAAACAAAGGCGCATATATAATAATATTGAATATTAAGATGA ATGGAAATCAATACTATACTATTTTCTTAGTATTATTTGAGAATATACAT TTTTTTTTTAATAGGTTATTGCATAGTATTCTTTTTCACTTAAATGAATT TTTGTAATTCATTGATATTGCAATTTTAATATTGCAATAATTTATATTGA AAAGACGATAGCCAATTTATTGGCTAATTCGAATTCGTATGTACAATTCG TATAATTCTGATTATTGAAGTCAAAAATTCAAGTCTCTTGGCTTTTTTCA CGCTTTCTCACAAACGGATTAAAAAAATATATATATATATTTTTTGAGGT TTGGATAAACCATTGCTTCGTCTGGTGTCTACAATACATATGACTCATGA TAGTACTAATTTCATTTTTACCAGATCGAAAAATTTTATGTTGAAAAGAA AAATTTATAGATCCAATGTCACATTCCGTAAAAATTTACGATACATGTAT AGGATGCACTCAATGTGTACGAGCTTGTCCAACAGATGTATTAGAAATGA TACCTTGGGATGGATGTAAAGCCAAGCAAATTGCTTCTGCGCCGAGAACT GAAGATTGTGTGGGTTGTAAAAGATGCGAATCCGCCTGCCCGACAGATTT TTTAAGTGTCCGCGTTTATTTAGGACCTGAAACAACCCGTAGCATGGCTC TATCTTATTGATACGTTACAAAAAACTGCATTCGAATCGTCTGATTCCTC TTTACCGAAGAAGCCTGTGCTTGAAATAATCAAGCACGGGCTTTTCTGGT CAAAACGTATCTTGTCTTTATCACTTTATCATGAGTTATTTTCCTTGGTT AACAATACTTGTTGTTTTGCCGATATTTGCAGGTTTATTAATTTTCTTTT TACCCCATAGGGGAAACAAAATCATTAGGTGGTATACTATATCCATTTGT TTATTAGAATTCCTTCTAATGACTTATGCATTCTGTTATCATTTCCAACT GGAGGATCCCTTAATCCAACTAAAGGAGGATTATAAATGGATAGATATCC TCGATTTTCACTGGAGATTGGGAATCGATGGACTTTCAGTAGGATCTATT TTATTGACAGGATTTATCACTACTTTAGCTACTTTAGCAGCTTGGCCAGT TACCCAGAATTCGCGATTATTCTATTTCCTGATGCTCGCAATGTATAGTG GTCAAATAGGATTATTTTCTTCGCGAGACCTTTTACTTTTTTTTATCATG TGGGAGTTAGAATTAATTCCTGTTTACTTACTTTTATCCATGTGGGGGGG AAAGAGGCGTTTATATTCAGCTACAAAATTTATTTTGTATACTGCAGGCG GTTCCATTTTTTTCTTAATCGGAGTTCTGGGTATGGGCTTATATGGTTCC AATGAACCAGGATTAGATTTGGAAAGATTAATTAATCAATCATACCCAGC AACCTTGGAAATACTTTTATATTTTGGCTTCCTTATTGCTTATGCTGTCA AATTGCCGATTATACCCCTACATACGTGGTTACCAGATACCCATGGGGAA GCTCATTATAGTACATGTATGCTTTTAGCGGGAATCTTATTAAAGATGGG AGCATATGGATTGATTCGTATCAACATGGAATTGTTACCTCATGCTCATT ATCTATTTTCGCCCTGGTTGGTAATAATAGGAGCTATCCAGATAATCTAT GCAGCTTCAACTTCTCTTGGTCAACGAAATTTCAAAAAAAGAATAGCCTA TTCCTCCGTATCTCATATGGGTTTCATAATTATAGGAATTGGTTCCATAA CCAACATTGGACTCAATGGAGCTATTTTACAAATATTATCCCATGGATTT ATCGGTGCTACACTTTTTTTCTTGGCAGGAACGGCTTCTGATAGAATGCG TCTTGTTTATCTCGAAGAACTTGGGGGAATATCTATCCCAATGCCGAAAA TTTTTACTATGTTTAGTAGCTTTTCAATGGCTTCTCTTGCCTTACCAGGA ATGAGTGGTTTTGTCGCAGAATTAGTAGTCTTTTTTGGACTAATTACTAG TCCAAAATTTCTGTTAATGCCAAAAATGCTAATTACTTTTGTAATGGCAA TTGGAATGATATTAACCCCTATTTATTTATTATCTATGTTACGCCAGATG TTCTATGGATACAAGCTATTTAATGTTCCAAACGCAAATTTTGTGGATTC TGGACCACGGGAACTTTTTATTTTAATCTGTATCTTTTTACCAGTAATAG GTATTGGTATTTATCCAGATTTAGTTCTCTCTCTATCCGTTGACAGGGTA GAGGCTCTCTTATCCAATTATTATCCTAAATAGGTTTTTTTAATTAGTTC GCTCTATTACTATTAATGCAGAAAAAAGTAAAAAAAAAGTCTAATTAGAT CTTTTTTGTTTTATTTGAGAACCCTTTGAGAGGGCGTTCAAAGGGTTCTC AAATAAAACAAAAAAGTAAAAACGTGCATTTCATGAAGGTTTCATTTTAT GTAATCATTTAGGTATTAATGTAAACGAACCATAACTATGTAAACCTATT CCTAATAGATTGATACCAAAATAACAGATCCAAATTATAAGAAATCCTAT CGAAGCTACAAGTGCCGAATTCGTACCCTTCCAATTTGGATTTGTTCTAC TATGTAAATAAATTGCAAATATGGTCCAAGTAATAAATGCCCAAGTTTCC TTAGGATCCCAATTCCAATAGGATCCCCACGCCTCATTAGCCCATACTGC TCCACAAAGAATACCTATGGTTAAAAGGGTAAATCCTAGACTAATGACAC GATAACTCCAAGAATCCAAACGCTCCGTTAATTGATATTTGTAATAATTT GGAAATGAAGGAATAGAGGTGCTTTTTAAAGCACTTCTTTTTGCATTAAA ATCACTAAAGAAAAATGTTTTATTTAAAACATTTTTTTTCTTTTTAGAAA AGAAATGGAAATTCTTTCGAAATCTAATGATTAGAATAGCGGCAGATAAT AAGGATCCGCACAAAAGAGTTGCATAGCTTAGTAACATCATACTGACATG CATCATTAACCACTGAGATTGTAGAGCAGGTACTAGTATTGTGGATTGAT GCATTTCAGTTAAAAGACCCGATGTGGCAAAGCCTTGCGTTAAAATAGTA CTTGGCGTAGTTATTGTGCTTAAATCATTTTTAGAGTTCTGTATCTTAGG AATGGTATGAAGAATATACAAAGCCCATGAAAGGAAGATCAATGACTCAT ATAAATTACTTAATGGAAAATGTCCCGAAGAAGCCCAACGAGAAACTAGG AATCCTGTTATAGAGAAAAAAGTAACTATCATTCCTTTTTCTGACGAATC ACGTAATCCCCCAAGTTCACGAACTAATAAGGTTATCAAATGAATCGTAA TCACAATAGAAATGGTTGAGAAAGAGATATGAGTTAGTATATGTTCTAAA GTTGCAAATAGCATAAGGGGAAGGTCTCATTACAAAATTGTAAATTTCGA ATTGAATCCATTTTCTAATCTATTGTATTTTTTTTCGAGAATGCCGCCAC TCGGATTCGAACCGAGATGCTTGAGCACTGCTTCCTAAGAGCAGCGTGTC TACCAATTTCACCATGGCGGCTAACTTCAAATAATGGGTAACTTAAAAGA ATAATAGCTATTATCTCGGGAATCGTCGAGATTGGGAAAGTCTATAAAAT TTAGGAACATTAGAGTCTTCATTAAAATAGACTTCGTTTGGTAGTATCGT TGCGATTTTTTTTACAATAAACTCTTGCTGTGCCTAATAGAAAGACTGCT TGAAAGAGTTGGAACTCCTTTTTTTCTAATTAGTTTCTCCCTTAAATTTT GAGAATTCTTTCAATAAAAGGAAAAATTTAGAGAATCAAACTTTATGCTC CTATTAATATTAATAGGATTTACTTTACTAACATTAAACCAATGATTTTG GAGAAAATGGAAGTCGTAAGTACTATTGCAAGAATACTCTACTTTTCATA ATAGAATTCTCATATTTTATTATGAGAATTCTATTATGAAAAATTCATGG ATCATTGATAGGAAAAGAATACTTAGCACATAGTATACCAAAACTTTTAT TCTATAATATCAGAGGAGTTTGTTCTAACAATATTGTACTGAGTAATTCA ACACATAAAAGTACATTAATTAATTAATCGAAATTATTCATATTTAAGTA ATTGGAATAATTTTTTGATAGGTCAATTCAGATTATTCCAAAACCGTATT ACTTATTATTTGTTTGTTGTTGCCCCGAAAAACCCTTTGGTTTTGGATGT TCATTCCCGCTGGAAAATGATCTTGATTTTGCTAAAGAATAAGAGTGTAC TATGGAAAAATAAGTTTTTTTCTTCCAAATATTTTTACGAATACGCTTTT TTGACAATGAAATACGTTTTTTTGGAACAGCCATTCAAAAAGGAAATTAT TTTTTTTTCTAGTTGTATGTGAAAGACATCTATTGTGGCAAATCAATCCT TCTTTCTTCTTTTTCTTAGTATTTATACTTAGATACTGAAAGATACTGAC ATTCTGAATTTTTTTCCGTATATATTTTATACTTTGTTTTAATAATATAG AATATATGGAAAGGTTTCCCCTTTAAATCTATTTATAGATATTTATATAT CCAGTATACTCCATATATAGATATACGGTATGGAAGCCTATCCCCTATAT AAGAATAAGATGGGTGGATAAAAAGAAGGGGGAATCCAAATAGTTAATTA AGTTCAGAATGGTACTCCATAATGGAATACCCATCAAAACAAAAAATACG GAGTCTCTTAAACAAGACATTCTTAAACTTAGTTAATTATAGTCATTAGG ATTTGATTTCTATATGAAGTAAGAACTCTTTTATAATTTTTTATAAACAT GGGTTTTCTTTTCATTGGAATTCAATCAATCAGTTACGAAATAAGAGAGC TGCTTCATCTTTGTTTTAATGTTTTAAAGAAATCTAAAAATGAATAGAAA GTAAAAAGATTCAACCTTTTTTTTTATTTTACTAAATATCCTTATTTAGG TAATTATTTAGGTAATAATTAGGTAACGAAGTTATTTGATTAACTTTTTG AATTTAACCAATTAAACCCATTTTGAATTTTAGATTATATCAATGAAATA AATTTTTGAAAAAATTAAGAATTCCAGTATTTTTTCTTATTCTTTTTATT TATTCCTTCAGAAAGAGATAAGAATTGGTTTGGTGAATCGGAAACCTTTT TATTTTATAGAAAAATTTTAAGTAAAATTTCAAGTAAAAATTGCAACTTC TTTTCTTATGGAACATATATATCAATATGCATGGGTAATTCCTCTTCTCC CACTTCCAGTTATTATGTCAATGGGATTTGGCCTTTTTTTTATTCCGACA GCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTGTTTTACTCTT AAGTATAGCTATGGTATTCTCAGTTCAACTGTCTATTCAACAAATAAATG GAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCGTCAATAATGATTTT TCTTTAGAATTTGGATACTTGATTGACCCGCTTACTTCTATTATGTTAAT ACTAATTACTACTGTAGGAATCCTGGTTCTTATTTACAGTGACGGTTATA TGTCTCACGATGAAGGGTATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTC AATACTTCCATGCTAGGATTGGTTACTAGCTCCAATTTGATACAAATTTA TTTTTTTTGGGAACTCGTAGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGTTTTT GGTTTACACGACCAATCGCAGCGAGTGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTAACT AATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTATTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTG GATAACAGGTAGTTTAGAGTTTAGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACT GGATTCCTAATAATGGAATTAATTCTTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTT TTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCGAAATCCGCACAATTCCCTCTTCACGT ATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCAGCTCTTATAC ACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGTATTTTTCTTCTAGCTCGACTTCTT CCTCTTTTCATATCTCTACCTTTGATAATGAGTTTAATTTCTTTAGTAGG TACAGTAACACTCTTCTTAGGAGCTACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATA TTAAAAGAAGTTTAGCTTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATG TTAGCTTTAGGTATAGGTTCTTATCAAGCTGCTTTATTTCATTTGATCAC TCATGCTTATTCAAAAGCTTTATTGTTCTTGGGATCCGGATCAATTATTC ATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATG GTTCTTATGGGCGGTTTAAGAAAATATATTCCAATTACAAGATCCACTTT TTTATGGGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCGCCTCTTGCTTGCTTTT GGTCCAAAGATGAGATCCTTAGTAATAGTTGGTTATATTCGCCCTTTTTT GGAATAATAGCTTCCTTTACTGCAGGATTAACTGCCTTTTATATGTTTCG GATATATTTACTTACATTTGATGGGTATTTGCGCGTTCATTTTCAAAATT ATAGTAGCACTAAAGAGGGCCCCTTGTATTCAATATCCTTGTGGGGAAAA AGGATACCCAAAGGAGTGAATAGGGGTTTCATTTTATCAACAACAAAGAA TGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACCAAAAATTCAAGGTAATACAA CAAATAGGATAGGATCCTTTAGTACGTCCTTTGGGGCTAAAAAAACTTTT GCCTATCCGCATGAAACGGAAAATACTATGTTATTTCCTCTTCTTATATT ACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATTCATAGGAATCTCTTTTGATAATG GAGCGACAGATAATGGAATAGGGGGGTTAACCATATTATCAAAGTGGTTA ACTCCCTCAATAAACTTTAGCCAGGAAAGTTCTAATTCTTCTATAAATTT ATATGAATTTTTTACTAATGCAATTTATTCTGTAAGTTTAGCTATCTTCG GTTTATTCATTGCATATATTTTCTATGGATCCTCTTATTCTTTTTTTCAG AATTTGGATTTACAAAATTCCTTTTACAAGGAAAGTCCTTTTTCGTACTT TTTTGATAAAGTAAAAAAAAATATATACAGTTGGTCATATAATCGCGGTT ATATAGATATTTTCTATACTAGGGTCTTTACCTTCGGTATAAGAGCATTA ACCGAACTAACGGAATTTTTTGATAAAGGTGTCATTGATGGAATTACCAA TGGAGTGGGTCTTGCTAGTTTTTGTATAGGAGAAGAAATTAAATATGTAG GAGGAGGGCGAATTTCGTCTTATTTATTCTTTTTTTTATGCTATGTATCC GTATTTTTATTCTTTTTTCTTTCTTAACTTAAGGAATTTACAATATCTTC CCCTTTCCTATCCCCTTCTACCATCTCTCTATCTCCCTCATCTCTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.