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GrainGenes Sequence Report: AE017934

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Sequence
AE017934
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE017934
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCACTGACCACTGCTGCCTTTCCCGATACCACCAGCTGCCTCCCCTCC
TTCGGATCTCTGCCGCCGCATCCCCCTCCGCCACCGGATCCCCATTACCG
CCACTCGCCGCCTTCCCCTCCTTCCCGTCTCCACCTATCGCCGTCTCGTC
AGCAACCCCTCAACTTTTCCTGGATCTCCACCGCCGGCAAGCCCCCCACA
CTTCCACCGAAGCCTTTCGGTTAGTACGCGCCTCTTCTTTCTCCATTATG
CTGGTTGGTTTAACCATCAAAATCTAGAGCAAGTGGAGGGCTAGCTTTCG
TGTCTGCTTCTTTAGACAGGGATAATGCACCAACTGTAGGAGAAGATTTG
CAGCTCACTCATTTCTTATTTTCTTATGTAAACACTCGTGCTAAACATTT
TCATCCTCATGTCGCGTCATGTAGTTAACATTTGAGTTTTCCTCCGCAGG
TTCATTATGCTGCTGGCAAGCAATTGGTAGTACTTCCTCGGCATTTTTGT
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CTGCCATTTACCACAGATGTCAACTTTCAGTTGTAAACTAAGTTCACTAT
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CGTGATCGCCATGTCTTGCTCAACTACATCCTTTCTGGTAACTTGATCAA
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GGTTTTTTCTTGTATTCTACTTTTTTCTAAGAAATTTCCATTTGTCAAAG
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AGCTATATGCGTACTTCATATGTTTTGCACAACATGTTCAGAGCCATTAA
AATTCATTGCCTATTGAGTTATGGCATTCATATGCCTCAATCTTTTCTTT
TCTCAGGCTAACACAGGAGCTGTGGAAGAGTTCTTTTTACTTACAAAACC
CGAATATTCAGGATCAGCACCAGCAAGAGAACCACCCCCTGTTCCTGCCA
CTGCACCATCACCAGTTGTGATACCACCAGTTGTTGAACAACCGCAAATT
CCTGTGCCATTACCAGTTGCAAACCTGCCAAAATCACTATCATTGGACTC
TCCCACTGAGAAGGAATTAACCATAGATGACATTGAAGACTTTGAGGATG
AAGAAGATGAATTCGATAGCCGAAGGGCTTCTAGAAGGCATCAAACTGAT
GCCAACGATCTTTCATTGCGGTTACCATTATTCGAAACAGGTAATAGTTA
TTAATTAACAGCTATCAGTATTGCAGGTCTGATAATAGATTGAAGTTAAC
TAGCCATATCTTATGTTCCTTAAAATAATCGTCATGCTATTGCTACTAGA
GATGTTTCAATGATCTTCCATCTGTTCCTTCTCCCTTGAAGTGCATTTTG
TTGGTCCTCATAGCTTGCTAGTGCTGCACTAATGCTTTCTTGAGTTTCCT
ACTTTCCTTAATCACCTGAAGGCGTTCCCTTTAGTTTTGGAATAACTGTG
TTGTCATTGTGCACTTAAGTTACCTGTTCATTCGTGAGTCTGAACTATTG
GATAAAGAAAGAAAACAAAAGCATTTTTTTCTCGAACGCAAATCTAAATG
AGCGTCATTTGTATTAGAAGGAGAGCACCAAGATGGCGCAAAAACATTTT
CTTTACTTATTGGATAATCCTCGTTAAAAAAAATAGTTATTGGAATAACT
AGGTCCTTGTTGTTCTCTTCTTAATCTTTTTTTTAGAGAAAACGCAAAGA
AGCCTTTTGTGTTCCATTTTATTGGATAGAGAGAAGTTTGATTACAAACC
TCCTAGAAGGCAGTGGCCGATAAGCAAAAAAAAAAAAAAAACCAGACATC
AGTGCACATCCCAGTTGGATGGCAGCACAACCCTAAGGCCAGAAGTGTTC
TCTTCTTAAGCTTGATTGACTCTAAATTCTGAATTATCTGGCAAAGAAAG
TTATTGAAAAGCGATAACTATCGTATTTTTCCAGGTATCACAGATGATGA
TCTTCGTGAAACAGCATATGAAATCCTTGTTGCTGCTGCTGGTGCTTCAG
GGTAGGCCTGCGCAGTTCAATGTGACGAGCTATTATTTTAATTAGAAGAT
CAGGAGTATCATAGTACTAACCTATTTAAACTGCTTATAGGGGGCTTATA
GTTCCAAAGAAAGAAAAGAAGAAGGAGAAGAGACACAGATTAATGAGGAA
ACTTGGCCGTAGTAAGAGTGAAAGTGCTGAATCTCAAACTCAGCGGCAAC
CAGGTTTAGTTGGTTTACTTGAAATCTTGAGAGCACAACTTGAGGTGGGC
TGTCTTACCTATCTGTTCCTGATAAATAATTTAATAAACAAAATTCTACC
TTTGTGTTTTTTGTTCTTCTGTACTATATATTTATTTCACTCTGTTGAGC
TTATATTTGTACATTTGAACACTAGTAGCTTACATTTATAGTACAACTTC
TCAAAAAGAACCATATATAGAACAACTTATTGAGTTTAAGGTTACTGTTC
CGTTTCTTTATATGTTTGTGTGCAACCTGATTTCTTCATACTCAGCATGC
TAATGTGCTTACCTCCTTCACCCCTCTGCTTTTGAATAGATTACAGAGTC
CATGGATATTAGGACTAGACAAGGACTACTCAATGCTATGGTGGGTAAAG
TCGGAAAACGGATGGACAATCTATTGATTCCACTGGAACTATTGTGCTGT
ATATCTAGAGCTGAATTTTCTGACATGAAGGCATATCTTCGTTGGCAGAA
AAGACAGGTTAGCCATCCATTTGTGCTTTAATAATTTTGGACTAGTTACA
TGACTTAACAGTATATATTCCTTTTGTGTCTTTGGTTAGCTAAACATGCT
GGAGGAGGGCCTAATAAACCATCCTGTTGTTGGATTTGGAGAGTTAGGTC
GAAAAGTCAACGAGCTAAGAAACCTTTTCAGGAAGATTGAAGAATCTGAG
GTCTTATGCGTACCCCAGTCATTTCTTATGGTTGATTTATTAAACTAAAT
AAGCGCTGTATAGAATAGGCACTAAATGGAGGTTATTATGGTGTATTATT
TGCTAGTCTCTGCCACCATCTGCTGCAGAGGTTCAGCGTACAGAATGCCT
ACGATCACTGAGAGAAGTTGCCACATCTTTCTCTGAAAGGCCTGCTCGAG
GTGATCTTACTGGTGAGGTTTGTCATTGGGCTGATGGCTACCATCTGAAT
GCTGCCTTGTATGAAAAAATGCTCGGCAGTGTTTTTGACATCTTAGATGA
GGGAAAACTTACAGAGGCCAGTACTTAAAATCCTTGCCTGTCATTTTCCC
CTTTCCATCCCATCGGTTGCAACATTTTTCTTACATATTTGCTTTAATAT
GCCAGGAGGTGGAAGAAATCCTTGAGCTCCTAAAGTCAACTTGGCGGATA
CTAGGAATCACAGAGACAATTCATGATACATGCTATGCATGGGTGTTATT
TCGACAGGTAAAGCACTAATTGAGAAGTAATATACTATCCTTCTTGGATT
ATTTTGTGCTCGTGCTGTTGTTAGCCATGCTGTTGTTGGCCTTAAATATC
TCTACAATGGCAATCAAACGTGTTTCTGGATTCTGGCATCTTGTGTTTTT
TCTTCATAGCTCCGAATGTGCCAAAAGCAAGGGAGAAGCTCACCATCCTT
ATCCATTTTTGAATGATGGCAGTTTAGCCTTTTCTCTTCGAAGTGTCAGA
AACAATTACCACCACAACAACAAAGCCTTTTGTCCCAAGCAAGTTGGGGT
AGGCTAGAAATGAAACCCAACAAAGACCTGTGGCAATCAAAGGAGGAGGG
TGTGATAGGCTTGGCGAGTCAACATAAAAACTAGCCATCCCTATGGATAT
GAAACCCAATAGTGTCAGAGACCATTATCTGGAAAAAAGTAACTGAGTTC
AAACTCCTGTTTTGCCTTCACGATTTTGTGGGAATGATTCTTTTACCTAA
TAGTGTAGTTCAATTTAAGTCTGTCACGATGTACGATTATCGTTTAAGTG
GTGATCATATCTAAAACCAGTAACCCCTTGGACTGGATCATTAGTTTATT
ATTTTATCAAAAGATGATCTTGCATACTGCACTAAATATAGTCCTGTTCA
GTAGCGTGCTACTGATTTATTAGCTCATGAATTAAGTCACCATCACAATA
GTATGACAATTAATGTAGGTTCCACAACACAGTTTGTTTTTACAGGTGAG
CAAGGACTCCTGAAAGTTGTGATTGCGCATTTAAGGAAAATACCCTTGAA
GGAACAGCGTGGTCCACAAGAACGATTACACTTGAAAAGTTTACGTAGTT
CTGTTGATGCTGATGATAGTTGTCAGGACTTCACGTTTTTTCAGTCTTTC
CTGTCTCCAGTTCAGAAATGGGTGGACAAGAAATTGAATGATTATCACCT
ACACTTTTCAGAGGTTTGTTTTTCTCTGTCCTGGTTTGCTCATGTGCGCC
CTAACATGCATGCCTACATTAAATTTGTCTTTACATCTGCAGGGTCCCAA
TATGTTGTCTGATATCGTAACAGTAGCAATGCTCACTAGGCGGATCCTTG
GTGAAGAAAATGACAAGGTGCTGAAACCTTAAATCCTTCATTTTTCATCC
CAAATACATTTTTTAATCTAAAAATTGGACCGTCTTTGTGTGCCTTGTGT
GCGTATAAACACCAACACATCCAGAAATTTCTCGAGCAAAAAGCGCTTGA
CAACAAACCAATCCAGTGGAGTTCCTCACAAAATGGTCTCTAATCCCCGC
AGTCCTCGCCTTCTAACTTGTGGCAGTATACAATAGCAACCTTATGTTAT
CAATAGCAAGCACTGCAGAATGTGGAAAACAAAACTTAGGTTACCGTTTG
CACTATAGAAAATCTTATTTTGCCCCATATTTGTTTTTGCTCGTCAGGCA
ATGGAGTCACCTGATCGAGACCAGATTGAACGTTACATTACATCTTCTGT
CAAAAGTGCTTTCGTGAAGGTGACCTTATTTGCAGCTTTATTCTTTTGGT
AGTATAGCTTAATATTGCTGATTTTCTTTATTTTCTCATATTGTTTTACT
TATTTTACCCATGGGATGGACATAAAAAGATCACTTACTCACCCATGTAT
GTTTATGTGAGACCTTGAATGTTGTTCGATCATAGTGTATATGTATATTA
GATTTGTTGTGTTGTATTTGATCACCTTGACTCATAGTCATAGAAACTGT
AATACCATTATTGCAACTGTTGGCAAGATTCTTTGCACTTAGGCCATGTA
CATTGCACGGGTGCTTGGGTAGACGCTTAAGCGTAAAAAAACAATAATTT
AATGGATAGCGTCTGTATAAGAGTCCCCGTCTCCAACGCCAACAGAAGTT
GTAGACGCTAAACTGCCCCTGGATATCTCTTCACGCGGGGGGAAAACGGC
AAAGCGCCCGGCGTCTTGTTTTACGGCGACGCTAGCCCAATTCCCAGGAT
CGCATGGGATTATCGCATAACGGTCAGGAATGTTCTCCTAGCGTCTGCTC
TTAGCGCCTCCATTGTACTTGCCCTTAGAGGTGTCGATCATGGATTTGTC
TTCTTTGTATATGCAAAATTGCGTTATGACCTTAGTTATGTTTATTAGGA
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GTTTTTGCCAGAAAAATTGTATACCTTTTGGCATTTTAGTATAGAATATT
TGTTTGGTCTTCCTGGCCACTATATTCCTTACAAGTCAGTATGACATGAG
GCCTTGTAGGCAATATTCATATTAGAAGATACTATGTAAGAGTGTAAGCA
CGTGGTAAACGGCAGGGCTGTCTTTCGTCTGCATATTAGAAGATACTGTA
TAAATGCTAGACTCTAAATCTTCATGTTCATACTAATAATTTTAATTATT
TGACCATTAGTTTTTTATTGTACTGGATCAAGAAGCCTTCTGCACCTGAA
GTGGACTTCGTCATCCATATCCATATAGTGCAATGTGTATTTGTATAGTA
TGTCATATACTTTCCTCGTTCCATTTGATATGTCAACATTAGGATAATTT
TTTGTTTTGTTTCAGATTGCACATTCTGTAGAGGTTAAAGCAGACACGGG
GCATGAGCATGTTTTAGCATCTCTGGCTGAGGAGACAAAGAAGCTTCTGA
AGAAAGATACAAACATTTTTGTGCCAGTTTTGTCAAGATGGCATCCACAG
GCTGCTGTTCTTTCTGCTTCCCTTCTCCATAAACTTTATGGGAACAAATT
GGTAAGTTATAGTTGACTGTTAAATCCATCATAACCTTCTGATACCGCAT
GCTCACATTAGGTTGTTGTGCCAGAGACCTTTTCTTGAGCATGCTGAGCA
TCTTACGGAGGACGTAGTTTCTGTATTCCCGGCAGCTGATTCTCTCGAGC
AGTACATAATGTCTGCGATGGCCTCTGTTGTGGGCGAAGATGGTTTGGAC
AGTATATGTAGACAAAAGCTAACTCCTTATCAGGTTAGATACCTCGATCA
TATTTTCCTCAACTACAAGCAACCCAACATTTTAAATTGCTTTAATGTCA
CCTTTGACATGCTATGTTCATGCCATTTTTTTTCTATCATCAATTATTAT
GTGCTGGGATTTCTTTGTTGTATTGTTCACCCTAATTCTCTGCTTTTGTT
TATCTCAGATTGAAAGTAAATCTGGCACGGTTGTTCTACGCTGGGTGAAT
GGGCAACTCGAGAGAATTGAAACTTGGGTTAAAAGGGCTGCTGAACAAGA
GGTTAACACATTAATTGCCTTTTTTTTTTTGGATATGACTGTTTGCGAGT
TTGTAGGCATCTTAGTGTGTATGATAGTGTATTTTGTTTTACTGCTTACA
AAGTTACAATATATTCTCTTCCTATGTGACCTGTCTTTGCATTCAAACAT
CACTTCGGTACTCATCGAGTGTTACGAATTTCTGCATTTTCTCCATGCTA
AATCTGTGCTTGACAGGCTTGGGATCCTATATCCCCTCAACAACGCCATG
GGGGTTCTATAGTAGAAGTCTACAGAATCATAGAAGAGGTGTTCCTCTTG
TCCTTCATTATCTCTTTAAATTTGTGTTAATTAATTTCTCTTTATAGGTT
AAACTTAAATGCTATTTCTCTTCTATGCCACAATATCTCGAAGTTATTTA
GCCTTGATGGTTTCAGATATGATTTGTGCCTGATAATCGAGCTGCCTCTG
CGAAAGTAATTTTTGTTACTTGCGAGCTATTGCAGACTGCAGATCAGTTT
TTTGCATTCAAGGTTCCCATGCGAATTGGCGAGCTAAATAGTCTCTGTCG
TGGTATCGATAAGGCATTTCAAATTTATACACAACTTGCTATTGGACCCA
TAGGTTTGCATCATCACCTTTATACTTCTCCTAAAGTATCTTTCTGTTAA
TCCTCTTGCTGCATGTTATTTATTTGTTCCTTCATCTTTATTTCCTATTA
TTGATTTGAAAGGAAAATATTCTCTTGCAGTAGAATACAAAGTACAAACT
CATGCTTTAGATAGATGGTCCCTGCTAAATAGTATATTTGAGGTAGTATC
TAGGATGGACAAAAGATACTTATGTTCTGTTTGTTTTTAACACTTGGGCT
TTGGTTGAACGCTATTTATTTTCTTTTCATTTTAAGAGAAAACAGTTTTC
TGTGCTTGCAGTTGATAAAGAAGATTTAGTTCCACCTGTTCCTGCTCTTA
CTCGGTATAAAAAGGAGCTTGGAATCAAAGCTTTTGTAAAGAAGGAAATC
CCGGAAGTTAGAACAGTTGATGAGAGAAAAGCAAGTGAAATAGTTCAACT
TACGATGTCAAAGCTCTGTGTGCGGCTTAACAGCCTATATGTGAGTTTCT
TATTACAACTGATGCTGCTACGTTGCTTTTATCTAGAATGACATATCAAG
ATCCTGAGCAATTTCCAGTACACAAAGATGTAAATTAGAAGAAAAAAGCA
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TAGCTGTATCTTTCACTGTTCCTGGTTTGATGCTGTTCCCTTTTGAAAGT
AGCTATTGTTAAGTTGGTGCATTATTAGTAATAGTGATTTATCAGCAATT
ATAATTTTACAGCAAGTGCAGATGCTATTGATTATACTGATAGTTCTGGT
CTTGAAACAGTATTCTAGTATGAGGCAATAGCTGTTACTAGCTGTTGCCA
TGATTTACATCTACAGGACCATGACGTTTTTTTGATATTTGTCATTCTTC
CTATTTTATTGTTCATTTTTATTACCGTCACCAGTTTCTGAATATGAATA
TGCAAACAGTACGGTATAAGCCAGCTAGGCAAGTTGGAGGACAGCATAAG
TGAACGGTGGGCTAGAAGGAAAATTGGCAACATTGACATCAGTAAGTGTG
CATTTAAAATAGTAAACAGTTTATCTGTTGGATACTCTGATAGGATTGCC
AATTACTCTGTTTGGCATAGTCCATATAGATCAATCTAAATTCTTTTTTT
AATATTTAACTGTGTTAGGACGATCTACGAGCGGAAAATCAAAGAGCGTT
GTCTCCAATCAGAAGAATCAATTTGATGGCAGTAGAAAAGAAATCAATGC
TGCTATTGATCGGGTATGTGAATTTACAGGTAAGAAAATATGCATGGACT
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CTTTTCTTTCATAGGGTTAAAGGTCATATTCTGGGACCTGCAACAGCCAT
TCATCGATAATTTATACAAAAACAGTGTAGCCCAAGCTCGACTGGACACT
ATTGTGGAAGTGCTTGATATGGTACGTTCACAAGTTTGCATCATTTGATC
TGACAGCTGGCATGTCTAGTTGTCTACTTGGTTTTTTATCCATTAGCTTT
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CAGTTAATATTTTTGGACCGTAAGCATGCAAACCAATGTTTGACTGCAAA
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AATCCCAAGCAGGCGCTAATCCATGTCATGCAACTTTTTGTAGGATATTC
TGTTTTTACGAGAAAATATATGGATAGCTTTTATGTCAGAAATTCGGTGT
GGCCAAATGCTAAGCATATGCTGTTACCTCAAACTTTGGACACGCGCATA
TATATATATATATAGGAAAAATACTTCTTACTCCCGGGTGTAACTACACC
CACGTCTTATATACTGCCTTACGGAAGTATTTGTAATACTTTATCTGTTT
GAGTATGTCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA
TAGAAACCCTATTCAGCATCCTGGGTGCAGAATAGTTATTTTGCATCCCA
CATATTTTTATGTTCTCATATTTAGAAACTAATGTTTTGTATACTAATAA
TTATGTTCATATTCATCAGAAACACACAAAAATCGACATAAAAATACAAT
TTATGAGTCATTTAAGTGTAAAAAACATCAAAAATATGCATTTTATGTCG
TATTTTTATACGGCATGTAAACAATTTTTTTACGACATGTCTAAATTTTC
TTATGTTCTTGACTTTCGAGGTAAGAGAAAATTTACGTGTCGTAAAAATC
ATATACGGTTTGAAAGATAGAGGGTGGATGAAAAATAACTATTCTACACC
CTGGGTGGCAAATAGCGCCACTCTGTATATATAGGACACCCATATGGGAC
ACCATGGTGCCCGGGCACCATACCTATAATTTGTACATACCCAGGGTGTA
CGTACCTAAATTTTCGCTATAACTGGTGCACCTTGGTGCCCAGACACCAT
ACGTGATACGCGTATTTTCGCTATGAACCACACATACCTGAGGGTATACG
TACCTAAGTTATACATACCTAGGTATCACATACCTAAGATATGCATACCT
AAGTTATATATACCTAACATATTCCATACCTAAGTTATATATATATATAT
ATAATATATATATATATATACCACTTATTATAAGCTCTTAGTAAAGGTTC
TTCATTTGTCGTCCGGCCAGTAAGATTTTGTTGAACTTATTGGCATATAT
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CTGGTAATTTTGGCTGTCAAAATTAGTGAGATACTGTAACAAGTTCTCGA
TTATAATTTTAACATAAGTTCTTTTTCTCAGGATGGCTTACTTCGTATAA
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TTGGAGGAAGATCTTGAAATTCTGAAGGTATATTGGTGTCAGACATCTTG
GCCGCTTTTGCTTTATATACAAGGGACATCATGCATGCGGTAGTATTATT
CTATAACTGACATGCTTATCATACGTCTGGAATATATGTTAATCTCACTC
TGTATTTATTGTCTGACCAATAAACTGTTGTCTTAACTCGTGCTGACTAT
TTGTTTGCTTACCTAAAAGGAAACTTTTTGTGTGATATAGGAATTTTTCA
TATCTGGTGGAGATGGGCTCCCTCGTGGAACTGTTGAGAATTTGGTCTCA
CGTGTTCGTCCTGTAATAAATCTGATCAAGCAAGAGGTAAAATTTGGATT
AAATCTCCCATGGTTTTGGATCTGTTGAACTCTAGATTCTAGATTCTGGA
AGTGCACCATCCATAATTACCGTACCTAATCTCCAATTATTAGGTATAGT
CTGTACCTGCCCACTGGAGTGAACTTAGTTATTTCATTTTTCTTCAAACT
GGCCACAGTTGAACGGTAGCAACGATTCTGTAATTGCATCAAAGACAGCT
AAGCAGAGTGTTGGTACTAAAGGAAGCAGTGTGTCGAACTCTCAATTTAT
TACACGCCATTGACTTAATGATACTTGGGACTAGGGATTCTGTAGTTGCT
GTAATCATTTTTTTTTGCTGTAATCATATTTGTGAATGACTAGATGGCAT
TTCTTATGTGCTCTCTTTCCGCAGACCCGTGTGCTTATTGATGATCTGCG
AGAAGTTACTCAAGGAGGCAAAAGCAAATTGGGAGGTGACTCCAAAACCC
TGCTCAGGGTCCTGTGCCACAGAAATGATTCGGAGGCATCACATTATGTA
AAGAAGCATTTCAAGATACCCAGTTCGGCCCCTCCGAGCTCGTGATCAAA
TGCAAATGAAAAATCTGAAAATGTGTATATAGATGATGGAACAATGGCCG
GTATCTTGCTCGTACGTTCTTGTAATATTTGTGCATTATTAGTGGTGGGA
GCTAGGGAAGCATACACTAGTTCTGATACATGGGGCATTGTATTGATTGA
TCAGGAAGGACTTGGATGTTTTTTTTTGTATCTTTGGAGAACCTGTAGGT
GGATTTTGATGGTCTTATTTTAGGTGGATTTTGATGGCATTTTCGTCTGA
TGGGATTGGTGGGGACAGAACTGATGCTTGACAATTGGTTAGGTGATTTT
TCCTTGTGATACTAGCATGTGTACGATGTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.