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GrainGenes Sequence Report: AE034061

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Sequence
AE034061
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE034061
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGCAGCTGTAGCACAAGCACGAGGCAGGTGGCGACGGTGAAAGAGGTGTG
TCCCGCGAGGAGAACAGGTGATGACGGTGGGCGAGTCGAGGTGAAGCAGG
TGAAGCAAACTGTAGTCATTCCTCAGCTGGCTGTTTCAGATTCTGAAATA
CACGCAGAGGTCACCAAGATCGAACAAGGTCAGGAGCTTTGTCCATCCAT
TATCCTTTTCTTCTGTAGTTTCTGTGGTATCATCGTTTACTTAATTGTAA
ATCTAGTTCTTGCTAGTTTTGTTTCCATACTACTATAGATACAAGTACCA
ACCTAATCAGTCAAGTAGCATTAGGGATTTTTACTCGTTTCATAGTCAGA
CCTGATGTTGATTTATATGATTATTTGTAAATCTAGTGTTTGGTAGTTGA
TTTATATGATTATATCTGATAGAACACCACAAATGAATCAGAGACACCAC
CTGACCGTAGATGTCATTAGCTCAATTGTTTGGGGATTAGTTTGCACCCT
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GTTGCTACAATGGATATAGTAATCTGATTTTGAAGGGAGCAATCAACTTG
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TACTCCCAAAATGAGATGTCAACTCGTAACTCGTAAGAGAGACGTCCAAA
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CAAAAACTTCATCTTCCTTGGGGTCTCCTCTGCTGCTCTTCGCCCTCTCA
GCCTCTCTGTCCTACTACTCAATAAGAGAAAAAAAGACGACACCACCACC
TCCGAATTCACCACAGCAATGGGCGTATCTCGCCGTCGGTCGCTGGAAAT
CGAACCCCAATTCCACCCGATTTTTTTTACCATATTGGGGCTGTTTTTTC
AGTCCACACCCATGTTGTGGATGGTCTCAGTAAGCCCTAGGCCGACTCGC
CTATGAGTTGCAGCTTCTCTCTTGTTGGTGTTCCCTCTTTGTTCTCTCTT
CTCATGTTGTGGATGGTCTCGGTAAGCCCTAGGCCGACTCAGCCTATGAG
TTGCAGCTTCTCTCTTGTTGGTGTTCCCTCTTTGTTCTCTCTTCTCTCTG
TTCTCTCTTTTGAGTAAAAGCAGAAAATGAGGGACTAGCACTACAGATGA
GAACACACAGAAGTTTCAGGCAACCGATGCTACACTACTCAGCAACAAAT
GCCTATTGAACTTAGCAACCCATGCTTACACACATATGACACACATACAT
ATGTGCTTCAGCCTGACACACATGCTATCTACTACATCTTGGATTGCAAC
TTATGCTAGCCCACAACAACCTATGCTTGGACCTATTTATACTTGTACAT
GACCCTTCAGATTGTTGCCATGTGGCACAATCTAAACCCTACACCATACT
TCTAGAATACTCTACAAACTTGAAGACATTGGATACTACTAAATATCTTA
CTCTAGAACATTCCTAATTCTAGAGTTCTCCCTACATACCCTGGATACTT
CATGACCTAGCTAGCTCCTTCTACTAGCCAACTACATTGACAAGATTACT
TCTAACAGAAAACACACAACCTATGTGTGCTCTACAGCCTGCACACTACC
TATGTGTGCAGATCACACCATGACAAGATTACATTCAGGCTAACATCTCT
CGCCCTGTCCTCCTTTCTTACACCTCCAGCAAAGCCGCCTTCAACAGCCG
GTCACCGGCGCCGACTGCTCTCCTAGCCCGCCGCTTGTCGAAGACAGAAT
TAATTTACCCTTAGGAAAATACGCACCAAACTGCTCTCCTCTCTCTGTCT
CTCTCGCTCGACCTGCCGCACCCTTTCTGTCGGTCCGACGCGCCGCCGCT
CTCGCTATTGCCCCGTCATGCTCGAGCCCCACGCACGGCCCTCCCCAGCG
GCCAGGACGAGCTCCGGCGATTTAGTCCACATCCGGCGGTGAGGTACGCG
CTGCCCCCATCCCATGCTCTTTCCAATTTTTCTGCCCTTGTTCTCTCTAT
TGACCCTACGGCGCGCCTGTACAGGGTAGGAGCGGGTTCCAGCAACCTAT
GTACTAGTATGCATGGCAAAAGTTTCAATCAAATTATGGCTAGAAGAAAT
GTCTCAAATTCTCTTGTCACAGTTAACTTTGACTTGGCATGCTGTTCAGA
AAAAAATGGTGGATCAGTAGCTGCTAACTTTGATATGTTTTGATTTTGAG
GTTCTTTAGTAGATGTCCAAGTTATTTTTTTTTTGAGAACATGCAAAGAG
GTGTTTGCGTTTCATTTCATTGCAAAGGTAGAGTTGAATTGAGCTATAAT
CTGGTTAGAAAACTTAGCAAACCAGCAGACCCACTGGATGCTTGCTGCTC
TAAAATTCGTCACGTAATTTTGAACTTTGGTTACTGGATATTAATCTATT
TGCAAACACTTTGCCCCTTTTTTGGTTAGCTTATTTGTTTGCTGTTGTAG
GACTTAACTTTCTGCATTTCATCTTCTTTTTTAAGATGGATGCCGCATCT
CTTCAATACGAGAACCAGAGGCTTGTGCAACAATTGGAGACGCAGAAGTC
TGAAATGCATATATTGGAAACCAAGTTCAAGGAGCTGAAGAATGAACAAT
TTTCTTACGACAATACTCTAATTTCTCTAAATAAGATTTGGAATCAGGTT
CTTTCCTCTGAGCCTCATCTAGCCTCTGTTTTATGCTTCTTTTCTGGCTT
GCCGTGTTTCTTATTAATAAATGTTAATTATAGCTGATTGATGATTTAGT
CCTGCTTGGAATTCGGGTTGGTGGGGGTTTGGACAATTTGCAAGCGCTTG
ACGATGAAGATTTATCAGAAGGTTGCTACCTAAGTTGTTTAATTGTTAAT
CTTGCTTTATGATGTTGCTTTTCTGTTCAACTAGCGATGTTGCCTTAGCT
GATTGTATGTTGTCTGTTGCTTGGATTCAGCTGAGTCGTGTCCTTCTGAG
GAGATGTTTCTCTTCATGCTCTTGAAGTTAAACAATTCTAGAAATAATGA
CGACAGTAGCCTGTTGAAATTTGTTAAAGAAGCTCTTCCTTTGCGGCATT
CGGCAACTGTTGCTCTGATGAGGTCCCTTCAAGAGGCTATTGCTGCACAA
CAGGCTAGAATTGAATCCCTGTCATTAGCTTTAAATGGAGAAAAGTCAAA
TGAAGGTAAAGACAAGTAATATCATGCCTTCCTTCCATTTTTCTTTGTAC
TACACTTTTAATAGTTGCTAATTACTCACCTCTTGAATTGAATTTAGATG
TTATTGTTGCCCTTCAAAACCATAATAATCACTTGAAAGAGGTAGTTGGC
AATGTCCGCCAAGCTATTTCTATTGTCAATGAGAAGCATAAAAGGTTTCT
GGATGAGATCGAGGCTTTCAAAAGAAACTACCCTGAAGAATTACAGGAAA
CCAAGCGTCTTTCAGGTTATTGTTCTGTCTTGTGTGCATTTCTGACATTA
ACAGTTATTGTACTTTCATCCTCATGTACATGTACTATACATGAATGCAT
TTTGCTTAATTTAAACATACCGTTTCTTTCTGTCAGCTGGATAATTAAAA
GCTGCTCCTTTTTTACAATAAACCCCGGCTTTGCATTGTCGACAATGCTT
GCCTTCCATCATACTTCCCATATTTCTTGCGGAAATAATACAATTTCTTC
TAAAACCTGTCAATAAAACTGGAAGAAATGAACTAGTATGTGTAAACAGA
TCCTTGCCAAATACACATAAAAAATACCGTGTCTTGGTCAACGCCACCAA
GTTTTGAGCTATAAAATTTGGTTCTAAAGCAAAGCAATCCATATGCATAG
TATACATTGCATTGCAGGTGAGCTAGAGGAAACCATGGCAGAGCTCGAGG
AAAGCCGACGGAAGTTAGTTATTCAACAGTTACAGAGGCATGGAGGTTCA
CTAGTGAACATATCTGGTTCAAATGGTGTGAATGGTTCTCTTTCAACTGA
TAAATCTTCAGACAGAAGCATGGGCTGGGGAGATCTCAAAGATGCTGTTG
ACGAGGCTAAGGTACTTTTCAGTAAACCAAAATCCATTATTCTGCATATG
TATGCTCTTTATATGCCTTATCTGCTCAGCCTTTATCTTATAGCTGCCAT
TTTGTCCAATGGAGGCCAGACTCTTGCAGCAAACCATCTGTTTGAACTCC
ATGAGACTCAAGAGGATAATCTAATACTCTCTAGGCAGTTAGAAGATCTT
CAGGTTGGCACCTTTTGTAATGGAGGGGGTTGACACATTTGTTGCAGCTT
TGAGTTGGATCCTGATTTTTTTATTCCTTTAATTTGCATCCTGGTGCTAC
TATGTGTGCAGGGTCAACTAAAAGATGAAAACTACATTTTCACATCAAAA
CCATATACAATTCTAAGCGATCAGTTGCACCATCTGAATGCTGAGATAGA
ACGATACAAGGGTTTGGTTGAAGTATTACAGGTACCACGTTTTCCTCTGT
TGTGCTCTTTTGCAATGCTATTGTTTCTTCATCAGCTTTTGCTTTCTTTG
ATTTTAGAATGACAAGAACCAGTTTTTACAAAGGGAGAAAGAAATGTGTG
CAAAAGGAGAATCTGTCGACAATATCAAACAATCCATTACCACTTATGAG
GCCAAAATTGAAGAACTGGAACATCAGATTCTGAAATTCATGTCTGAGAA
GAATGATCTTGAGGTCAAGGTTGAGGAATCCTTGCAAGATTCAGGTAATT
TGGTCTCTCTTGGTAGCTTGTTAAATCAGGATCTGTGGTTTACCTCTTCC
TCCAGAATGTAATATACTTTATTCTTAATTCCTCGGTATAGGTAAAAAAG
ACTTCAAGGATGAGATTCACATCATGGCTGCAGCACTCTCCAAAGAGATG
GAAATGATGGAGAATCAGTTGAATAGATCAAAGGATGCGGCTTCTGAAGC
ACTAGCATTACGTGAAGAAGCCAAATCCTTAAGAACCTTGTTAGCTAAGA
AGGTCTGCGTCATCCTCTTCTGGAGAAATTAGAAATAGCTAACCAAACCT
CTAGTACAAAAAGATCTGATTAAAGTATCTCCAACTTTCAGATCAATGAA
CAGAAGGAGATATCTGATAGATACAACACACAGCTCACTGAAATCAAGTC
CCTCAAAGCATTGGTATGGTATAATTAATATCTCTCCTGAGACATATTTG
CTTCTCTGTGAAAGTTTTATCCTTTTCCCTCCACCACTGTTCTCTTAGCT
AAGCGTGTAATTATCAACATGTTGCTACACGAGCTATTATATGTGATTTT
TCATCAGTGTGGATCCACCAAATAGCTGGATAAAAGAGCAACTGGAGAGC
AAGTAGCTTGCAACTTAAGCCAACTAGATACAAGGAAAGATAGGATTAGT
TGCCTTAAGGTGAGATATGATCAAATATGGTCAGATCTATCAAGAATAGT
CTGTCAGGGGCTAAGAAAGACATGTCTCTAAAAAGAGACAGTTATATATT
CGCCAATCCAACAATGATAATAAACTAGATCTAACAGTCACAGTGTGGAT
ATCCTGCATTGTAAGGTTACAGAGCTTGATTGAGTAGCTCCAGTAGTTTC
GTGATGATCTTTAAAATTATTGCTTAGTGTAGCATTCAAACATATCCAGC
CTTAACTAGCTACCCGAAATTAATGTTATTTTCCAAGGGCCTGCACTGCC
ATATTTGGTCAATTTGTATGCAGAGTAAAATCAGGCCTGAACTGTATATT
TTGCTAGTCACATGGACTATCAACATATTAATATGTTTATATTTGGAAAT
TAAGGATATAATCATGTTTGCAGTGTTGGATGTAGGTTGACCATTACTAA
AAAATTTAAAATCTAGCTGTCGCTGAGGGAACAAAAAACTTGAGCAAGAT
TTGTTGGCAAACAAATTTTTGATAGTGAAGAGCTAACAGAGGTTACTGAT
TTGTAATATGTTTTCTCAATGAAATTTTTGACAGATTGATATGTCCGAAA
AAGAAAAGCAGAAGTTGGAATTTATTGTGGATATGTATGGGAAAGAATGT
TCTGAGTTGAGGTATTGTCTTCATTGTTATCATTATCAGTTATGTTGAAT
TTTAATGATTATGACTTATGCTTCTCTTAAATTATCCGTAATTGTATAGT
TGTCCTCTCCATCAGGTTTTTGAAATTCTCTATTGGAATTTTTTCTTCCT
ATAGTTGGGATTTACAGTTTACCATGCCCTGTGAACAATAGAACAAAGAG
GATAAATAATCCTGTCATGATTGTTAAAAGTTTATGATTTATGCATTATT
TTTCTGAACAAACATACTATGTTGTGCGCCCCTTTTTTAGCAAAGGAAGT
TCATTTTACTCCAGTTCTAAATTTTACTTTCAGTTGTGTGGCTAACTTAT
ACGGTAGGGCTCCCGATCGTCAGGTGTTGAAGGATAACTAGCCTAGCAAA
TCCAATGCAAACACCCCGCGGTCCGACGGTCTGACATCCCTTTCTATTTG
TCAAAGGCTGAGGGATGACTGATGCAAGAGGAGGTCAGACGGTCCAAGAT
TCGCTTCTGTTCCTCACATCTTCAGTGTATGTCTAACTTGGGCTCCTGGA
CTCGGACATGTCTTTGGCGCTAGACTTGGCATGCAACTTGTACGTGACTT
GGGAGTCCCTCCTCAAAATTAGACATCTCTTCTGGTCCTCCCTCATCATA
ACCTTAAATCCCCAAATCTATGTATACAACCAAAGCATGATGTAGCCTAC
CCTCGTTGAGACTATAAGATGGACACACACACACAAAGGAGAAGATTCAC
CTTTTTATGCTGTGTCTTGGCCATTTATAGTCCAATCCGCTTGCCGCTTG
AACTTGAAGTCCTTGCCATGGTGATGCTTGTTGATCTAATGGTTTAGCTG
TATAGAGTATGGACTGTTACAAAGTTTATGGTCAGGTCACATCTATCAAA
TTGTTACAACAAGTGATGACAATGTTGATTTCGATGTGCTAACACTAGCG
ACATATATGTTATATGAGAAAATATAAACGGCGAGGCAAAAAAAGAACCT
TAGATCATATAAGCCAAAATTTCAAAAAAGTAAAGTGTATGTCTGTTACC
TCTGCGGCTTCCTCCATTACCAAATGCTCATTAATTTCCCCTTTTAAAAT
GCTTCATGCTCCCTCCGTTCCAAGATATAATATGTTTTAGCCTTTTTCTG
AAACGCACGTATCTAGACGCCTTTTAGTGTTTAGGTTCACTCATTTTGCT
TCGAACCTACACACTATAAGGCGTCTAGATACATGTGTTTCAGAAAAAGG
CTAAAGCATCTTATATTTTGCAACGGATGGAGTAGAATGGTAGGAATTCA
CAGCTTTCATCTGTTTGATTCTTATTTTACACTAATGTGCATATAGGACA
ATTACAGAGATCAAGGAATCAGAAAACCGAGCTCAGAAGCAGGCTGAATA
TTTGAGAACTAGTCTAGAGGAGCATAGTTTTGAGCTTCGTGTAAAAGCAG
CAAATGAAACTGAAACTGCATGCCAGCGAAGGCTTTCAATTGCTGAAGCT
GAACTAGAAGAGTTAAGGACCTTGGTAGATGCATCTGAAAGGTTAGTTAT
CTGCTCTTGGAGACAATTTGATATGTGTACCACTGCTAGAAGCAATTGGT
GGCTGTTTCTTGTCACTCCCACCGCTAGAAATAGCTGTCCAGTTTACTGG
GAATGCTGTTCAAAATAGTTACCCATTAAGGTGATCAGGAATAGTTATTG
CAGTTGTTTCATCCTTGCCCCTACTATTAATGATGTAAAAGATGCTGAAT
GTGTTAAGTACATTATTTGGTACTACCTCTGTTCCATATTAACTGTTGCA
GATCTGTCTAGATTAGCATGTATCTACACTAAAACGCATCTAGATTCATG
TGCATTTAGAAAAATCTATGACAGTTAATATGGAACGGAGGGAGTAATGG
CTAACATAGTCCGTTATAGGCTCCAAAACCGCTCGTGTTGCCGCTCAATA
GCAATACACTCCCGTAAACCCCTGTATTTATCCCAACTTATTTCCAACTT
CCATTTATTAAATTCTGAAGTAAACTCAGACTCAAATGCCCAAACAAACT
GGTTTGTTTGTTGCAACTGGAAACCGTCCCAGGTGAAAGCCAGAACTGGC
AGGTTCCAGTTTAACTCCTGGGCTTCCTAAACTGTTATTAGTACTTAGAT
ATTTTGCCAACCTGTGTTGTGCATATGTTTGGCAAACTAGGTTAAAAAAT
GCGTTATATCTCAATAATCTTCATCTTGCTATTGAGTATTATCCAACTGG
TTCTTGTGATCAGTAGTTCAGACGAGCTGTATTATTTTCTTGCTGGATTA
TTTCTGACAACCAGCAGTATATGCTAATGATTGTCAATTGGTGGATAATA
TATTTTTCAATGAGTTGCTATTTTATATCCACTCTGCATTTTCATACTTT
TTATGATCTGTTTCGCCAGAGATGTTCTGGAACTCAATGAGGCAATAAAA
ATTAAAGAAGCTGAAGGGGATGCTTATATCTCTGAAATTGAGGTTAGCTC
ATTTTTAGTTTTCTTATTAGCAGCTTCTTGTTGTGTTTGTGTGCACGGGT
GTGAGAAAGCATATGATGCTGTCACTGCAGACAATTGGTCAAGCATATGA
AGACATGCATACACAAAATCAGCATCTTCATCAACAAGTTGCCGATAGAG
ATGATTTTAACATAAAGGTGCGTAGCATATTTCTTTTGATGCAGACACTT
TGCTGCTGGCTTTCTGGGCTTTGTCTCGTGGAATCCATGCTGCTGCTGTG
CTGGTGGCCGCCTATTGCTGGCGGCGCGGTGCTGCCATCAATAGCACACC
AAAAGGAACTTATTGCATGCTCCATCAAGCATCTGTGATAGCTGAGTGTT
GGGCTAAGGTCGCCTGGTGTATTTCTCCTTTCCCTGCCCCATCTGCAGTA
GCCAGACGCATCACCTTGACTTATCACCTTATTTGCCATGCACTTTGACC
ACATAATTTATACTCTACTGCATTGCCAGAAGATACCGTGTTTTCTTTTT
TGTCGGTCCCCGTTGGTAACTTGATTCTCATCTAACAGCTAGTATCAGAT
AGTGTGAAGACAAAGCAGGCCTCTGCTTCCCTTCTCTCCGAAAAGCATTT
GTTACAGAAGCAACTCCATCAAGTTAATAGTTCGCTGGAGTCATTTAAAC
AAAGAGTCGCCCGCGGTGAAGAGCAGGTAAACCTGAGTTATGTCCTATGT
GTTATTTAGTGGTATAAACTTGCTGCATGCCAATAGTATCTGAAAATCAC
GTCAAAGCAAATATCTATTAAAAGAAATAGATTTTTTTGTGTGATTCTGT
TTACCACTGAACTGGTTTTGAAGATTCTTGTTTAAATAATTCTCACAGAT
GAAAGCCTATGTTGCACAAGCTGTAAAAACTTCTTTGGAGAACAGGCATC
ATGTGATTAACCTTGAAAAGACTCTGATGGAGGTGTCTGACACAGAGAAG
GAGCTCAAGTGGCTTGGGTCCACTGTTGGATCATCTGAGAAAGAGTATGA
GGTAAATCAGAAAAAGATAGCTGAGCTTAGAATGGAGCTAGAGCACGAGA
GGTTAGTGTTACCTTTTGGTTCCAAATTTGTCTTGCTATGCTGTCACCAG
GGCTCGTTAGTCACTGCATTCTTTGCTATTTCAGAAGCGAGAAGAGAAAG
CTTGAGGAAGAATACGAAGAGGTGAAAAATGAAGTCATGGAGCTGACATC
TGAAAATGAAGAGGCTACTATTCAGAAGCTTCAGGATGAGATTAAAGATT
GCAAGGCTATTCTCAAGTGTGGTGTGTGTTTTGACCGACCAAAAGAGGTA
ACTAATTGTCCATTGAATTTGCACAGCTTATTTTTGAGTGATCTGGATTT
GTGCGTGACTCAAAATTAGTACTCTCTCTGTTCACAATCATAAGATGTTT
TAACTTTTTTCTGAATCGTGTGTATCTAGGTGTGTTTCAGTGTGTATGTT
CACTCATTTTGGTCTGTATATAATCCACATTGAAATATCTAAAACATCTT
ATAATTGTGAACAGAGGGAGTAGCTAAGATCTAACAACTATTCTTATTCC
CATGACACCGAAGTTCTGGCTTCTTTTTGTTAAGCTTTTAATGTTGAGAC
CACCTACGCTGATTAGCCTTTTGTTCCTCTCTTGTTGGTTGTTATCAGGT
TGTGATCACCAAATGCTTCCACCTATTCTGCTCACCATGTATCCAGAGAA
ACCTTGAGCTCCGCCACCGGAAATGCCCAGGCTGCGGCACACCGTTTGGG
CAAAACGATGTGCGAGAGGTCAAGATCTGATGTCCCAGCGAGGTTAGCCT
GAACGACTTGGTATTTGTATCTTGGATAGCATCAACATATTTTACATGCG
GGATCGTCTCTTGTAAATATATACTCCCTCTGTTTCAAAATATAAGATAT
TTTAGCTTTTGTGAAACAAATGTGTCTAGACATCTTTTAGTGTGTAGGTT
CGGAGTGAACCACTCCACTAAATAGCGCCTAGATACATTCATTTCACAAA
AATTAAAACATCTTATATTATGAAACGGAGGGAGTAGTTTCTGTTCTCTC
GTGGTGGTAGCTTCTGTGATGTCTGATTGTTCGATGATCTCCTTCGAGTG
AGTCGATTATTGTACGATATATCGCTTTACATGAGGCTACTTCTAATCTT
GTTTCAGTTGTGTTTGAAGTGACATAGGAGTAAACCAGAAATGAATTGAA
AGTTGAAGATTTCTTTTCTTCAAAAAGGTTCATACGCTAGGATGAACATA
GACTGCCTTTGTGTCTCTGTAATCTTAAGCTGGAATTGGTTCTTCGGAGC
TGCTCTTGCTCGAGTTCAGAAACTTTCATCTGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.