Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE023396

[Submit comment/correction]

Sequence	AE023396
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE023396
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGGCTGTTGGTTAGGGCCTGATGAAATTGGACACGCACCGCCCCTCCC CTTTCTCCCCATCCCTTCGCCGGTCGCACTCGTGCTGCTGCTCCCCGCAT CCTGCTCTCTCCCGTCTCCCGTCTCCGCCGCGACGCCTCGACGCGGGGGA TCCGCGCGCGGGGCCTCGCCGCCGTTAGTCCCTCAGGTTCGTCTCTCTCC CTCTCTAGAGCTTGATGCTAGTAGAACCTTCTCTACCCCCCGCCCCTCGT GCGTAGGACGACGAGTGCCGCCGCCGTGCGCGGGGCTGCTTGCTTCTGGA TCCGTGGCATTCGGTCTCGCGGTCCGCTGTAGGTTTCGTTGGGGTGGAGT GGTCTTCGGATTCCACTCGCCTTGGGTTTAGATTCGATTTTGGAGGTGGC GCTTTTTGTAGATTGCAAGTGGCGCTGATTGGGTGTTGGGACGAACCTGC GTGAATTGGGGCCTGGGGAGAAAGATAGTGTACGACGGTGCTAGGGTATG CTTGCGATTGCTTTGATCGGCAGTAAGTAGGTTTTCTTAGCTGTTTGGGG GCGGCAGCTGTTATGGGTAGCTTTGAGCTTTACTTAACTTCAGCTCGAGC CCAGCAAATGAGCTTGGTATGCACTGTCCTGTTCCCGTTGCCGTCACAGC TCTTCTAGTCTGGGCCTTTTGTCGGTCGGAGCATCATAATCCCACTGTTG TCTTCTGCTCCGAAGCACATAGCTAGAAAACATGTGTGAGAATGACTTGC CAGCGTTTCTGCTGTCAATGTATAACCTAACTGGTCACCAGCATTTTGTC GTCTGTTTTTGTATTACTGTAACCATGAGTACAGCAGAGTTAGCTTCAGA GTTTAGGGCACGATACAATACAGTGCTCCTATAGGTCTAGCTCCAACTTT CCGATAATTGTGCAGAGATATTTTTTAACTTGTACAAGGAGATAATAAGA TTGACAGCAAACTAGACAAATCATTTGATGCTCCTATTTCTACTAAGATT TTCTTCCTTATATATTTCAAATGTTGCATTATTATATCTCATCGTAGAAA TACGCCACAGCTAGAAAAATATACACAGGTCTTATTCTCTAAAGGTGTCT CTGTTTTAACATGTTTTTTACTTCTTTAAAAAACCCTTATAGCCTTATGA AACTTAGAACATATATTTGGAATTCAATATAAGAATATATTTTATATTGT TTCCTTTGTATTTCCTGATTATTATGACATTATATATCTTGTATGTTGTC AATCAGGATAATTTTTAGGCTAGTAAACAAGCGTGAAGCCTACATGCAAG TATTTTCAATTACAATTAAACCTATCAAAATTGATATTCTTGTGGAGGAT GGAACTGGCACTGAACTAATCAATATAGAAAGCATTTACCCCACTGTTCT TTATGCAGCTCAATCAGTTGAAACATAGGATAACCATAGTGATTTGAGAT TGCCTATGACTTTACAAAATTGTGACCTGATAGAAAATTGGCATGGCTTC ATTTCTAATAACATGCATAGTTTGGGTAATGTGTCTAATGATGACCAGAG GGAAGGAAGATGAGTGTGTTCAACATGATGTGTTGTGATTGTACAGGCAG GCCCCATCATTGGAAGTTCAGATTAATGTGGAAATCCTTAGGTCTTTTCC ATTTTTCGCATTTGATATTGTGAAATTTACCACCTCTATGATTAATGTGA GTCCTCCAATCACATCTAACGTTGTCAAATACAAGAACCAAACCCTTAAT TGAAGAGGCCTGCTTGCTAGCCTGTTGAGGTCCCCTGGAAAATTTTCCTT GTTTTGTTCTCGGAAATCTATTTTAGGAAGTAGGCACCAGAAGCCTGCAT CTCATGCTAAACCAAAACATTGATATTGATTCAAGGTTTTTGGCTTGCCA AGTCGAGCCGAGTCGTCATGCAATCATCTAGGGATTAGCCAGGACTATTC CGGTGACTAGTTATGACTAATCACGCCCAGTCACCCCATCTAGTCAGGAA GATTAATGGAGAGGATGAGAGGATGTTAAGGGCAGAGTCGCAGTTTTGAA AGAGCTTGAATAAGAAGTCAATGTGGCGTGAAGCACCTGGGCAAGGTCCG GCCGGCCGAAGCAGGGTGACGGTAGACTAGAAGGGCCGCGTTGCTTCAGT GGAGGAGGACGATAAGTCTAAGTTGGTAATGGTAGGGCATATCTCTGGCC CATGAAGGCCCATTTGAAAACCCTAGCTTTTTAGATATATCCATACCATC CATACCATCCATCAAGATGGTAACTGACACGAGGCCAGGACTTTCGTGCT TTACATAGCAGCCGCCAGGGCAGCTTCCTTCCCCCTTCCCACACCTTCTC TCTCCTACCACACACCAGCCGCGGGGTAGATCTATGGCTGGTGGCGTCAA GGAGATTGATTCCTCACGGAAGACCTTGTCGGCCGCCTAAACCATAAACC AGCAGACGAGACCTAAATCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCCCCCCCCCCCCCTGCCAGTGGATCTTACCAAAGCGAGCTGCGACGGCT GGGTGTTTCTAGTCGCTGTCTAGTCAGAGCAAGCCGTCTGCTGCCTGGCT CGTTGCAGGACTTGCTCTGCTAGTCGGGTCTCTGCTTTGGCTCGGCGATT ATCCGGTGACTAACTGGTGATTAATCGGCGACTCAAACCCTTGTTGATTT AGTAACGCATCGTTGTTTTCATGTCTAGCTTTGTTATAAAGGCTCATAGA TATAAATATGGGGGCCATCTGAAGCAGTGGAACACCAAAATGTATAATTT CGTGCTCTTCCGGTATGTTAGTCATAGCCTTCTTTTTGTTCAGTATTGGT GCTGTTCCTTTAATTCAGTACTTTGTCTAAATATCTTTTGAAATTTTGTA GAACTTTATGTTTCCTTTTAGATCTTAGCTAGTAGTTTTCTTGTAAGTGT AAACTTGGAAGTAAATCATGATTTATCCTGTGTATCAATCTGCCTACTTT TTTGCTTGTCAGTTTAGGTCTCAAAATGCTAGTCCTATGTTCTAAATATA CCAAGCTGGTCCTGGAAGTTACACACACCTTCATTTGTTTTTTAGATTGG TTCTCATGTTTTTCCTACCCTCTTTCTTGTGCCATCTTGCTCACAGTATT TTCTAAAGTTTTGCTATTTGATAGTTTGTCCTGCATGACTTCCTTTTTAG AATGTAACAATTAACATATATAGAATTCTAATGTCTTCTACCTAGTTAGT GTTTTAATCTAGCACAACTTTGGGTCATGTGTTGCGTGTAGCCATGCATT TCTTTCCATTTTTTTATAACTATCCTGCACTTGTGGAAGGACCTGGGATG TAAATTACTTACATATATATTATCTCTTCTTGTACTCCAGATTGGATTCA TTATCACTCAGTTGGTGGGATACTGGAATAGTATTTTGACTTCCTCTTGC ATTGTCACTCTTGCGGCATCATTACAATGTCAGGATCACTGAATGTATGA TATTATCCTTATTTACTTAATATATGGTTATGTATTTTCTCCTTTGCGTT CAGTAAATATGGCAACTTATTTAACTTGTCCTTTTTAGTCATGGTGTTAT TTTTATGTTATTTTACTCCCTGCCTAGTTCCTCTACCTCAAAGCATGGGC ATGCTGACTTTTTGTTGTGATCAAGGTTCATTGTCCACTTTTATGTACTG ATGACACTGGCCAGCTATGTTTTTGAAAAGGTCTTTGGTTTATTGTTATT ACTTTTTTCAGTCAAATATGAGTGGGGATTCAACAGGGAGGCCATTCACA TCAACCTTTTCTGGTCAGTCTGGATCATTTCCTGGTTTCCATCACTCTGG TTAGTAAATCTTACAGATTGGTTAGTCCAATAATTCATTTTACAAAGTAC TGTTTTTTCTCATAGAGCTAACTTATTTGAACTTCTTGGAAGGCTTGCAT AATATCCATGGAAATCTCAATCTTGCATCACTAGCACCAAGGAATGCTTC ACTGTCTGGTATTCCATCCCCAGGTGTTCAACAACCTGGCGGTAGTATTT CTGGTAACCGGTTTCCCTCAAATAACCTTCCAGCGTCCATGTCTCAGGTT TGTTCTTTCAAAGTCCGCACTGTTTCTATCCATGCTAAGTGATCAATCAC TTGACTTATTGGTTTGCCTCTTCTCTAGATTCCTCATGGACATTCTGGGA TCAGCAACAGAGGAGGTATGAATGTTGGGGGGAATCCTGTATTTAGTAGT AGCATGAATGCTATTGGTGGTTCAGGACAAGGTTTATCCTCAAGCTTGGC TAATGTTGGTAACCGAAATTCTGCTCCTGGGTTGACAGCTTCTTCAGTTT TGGGGAATTTAGGCCCACGGATAACAAATTCTGTGGGCAATATAGTGGGC GGCAGCAGTATTGGCAGAAGCATAAGCTCCGCAGGACTATCTATGCCTGG TATTACATCCCGTATCAGTTCAAGTGGCAACTCTGGAAGTGGGGCTCTTA ATATCCCAGGATCCAACCGAATGAGTAGTATGCATCAAGGTACATGGTTA AGTGAATTTTTATTTATTCTTTTGCACTTTTCATGCTTCTTTGGTGAACA GCTATCTTCAATTTATCTTTCTTGTGGGCTGAATAGTGGAGTGGAGTGGA GTGGCGTGGGTGTATTGTATGTCTTGTCTTTGGTCGTGGTCCTGTCTTGA GTGGTTGGATGTTTCAGTCTAGTCATAGGCTTGTAATTGTTTACTTTCTA GCAATGCATGGAGCTGCAAGCTTTGCATGTTCTCGACAAAAAATATGGAA GTAGTTTGTAAGGGTGGGTAAAAGAGTGGAAGTAGGAAAATGTGTAACTC TTTGAAATTTTATGGATTGAACTTCAATGTGGCTCGGTTTGATTTGAAAT TGACACATGGGGAACTAAAATTTTCACCCATTGTATTATAAAGCAGTGGC ACTGCCTTGAGGGTTGTCTGCCTTGGTTGCCCACACTTGATTATATGTAC ACCAATTGGAAGCAACTAAACTGTCTATAGAATTACTGGGTTTATTAAGA GTTTGGAATTTCTTCTTTGTGTAAGGGCTGTCGGTGAAAAATGACCTAGT GGATTTCTATTTTTGTAATTCTTTCTGAGTTTTTTTCTTCACCAGCATCG CCACAGTTCATGAACATTCTTGGGAACTCTTATCCATCACCCGGAGGGAT GCTATCTCAGAACCAAGTGCAGGCGGGAAACACTTCTTTTGGTTCTTCAG GAATGCTACATGACGGAAACCCCGGTGAAAATTCTCCGTTTGATATAAAT GATTTCCCCCAGTTAACGGGTCGTCCTAATTCTGCCGGAGGTGGTCAAGG GCAATATGGTAATGCTAAAACACAAACAAAATCTTCAATCCTCAGTGCTT AGATAATGTTAGGCTAACCAACTTTTTTTATTTTGTAATTTGAAGGGTCA CTGCGAAAGCAAGGAGTGAGTGTAAATGCCATTGTGCAACAAAACCAGGA GTTCAGCATTCAGAATGAAGATTTTCCAGCTTTACCAGGATATAAAGGTG TGTCTCCGCCATTGCTAGTCTCATTATGCACGCAGTGGACAACTCTATAA ATCTTGATGAGATTAACCATCTGTTTCTTGTTAGTTTTAGCCTTTTTCCT TGCATTTTTTCCTTGTTAATTTTGTCATCTGGACAAGATAAGTTCATGTT TTATCAACTCCTTCACTGTTTTCTTCTCTATTGACCACATATCATGGTTC TAATCCTTCCTCAGTTTTTCATCTGGCATTGTTTATCCTTTTCTCGCAAA TTGGGTTATTTAACTTTCGCCAGATTTATAACCAACTCATATGTATTGCA ATTTGTTCTGTAGAAATTATTTGGCTAAATTCAGAGCATGGGAGTTATTT CTACGATGTTTCTTTATGCTGATTATTTCTGCAACTCCCTTTCTTTCCTT TCTCGATATTACATTATGATATGTTTCTTTGGGATATAAGGTAGTTCGTC AGATTACGGTATGGATTTGCATCACAAGGACCAGCTTCATGAGAATGCAA ATGTTATGCAAGCACAACATTATCCTGTGAGTTCATATTGTTGTATCATT CCATCCAGATAAACTATACCTTCTCTTACTCTTAAATTTCCACATATGAT TCTGCAGATGGGTAGATCATCTGGCTTTAATTTGGGGGGTAGCTATCCAC CCCGCCAACAACAACAGCAGAGCACTACTCAGGTAAGCATTCTAGCAATC TTTGTTGCATCAACAGCAAATATTTGAGGTTGAGCACACCACTCTTATAG TTAGTATAAACACCTCATAATTTTAACCTTTTTTTATGGGGAGCTGTATG TAGAACCTGTTATTGAAAATTTAATATTTAGTATCTGCTAAACCTTTTGA ATGTAGATTGTTAACTACTCTCTCTTATTGTGCTAATTAGGTTCAAAATG GCCTTGATAGTATCGGGCTAAGGCTGATAAATTCTCCAAATCCGTCTTCT AATTCAGGGTCTTATGAGCAACTTATCCAGCAATACCATCAACCACAGAC TCAGAATTCACTTAGGTCGCAGACGTCTTCGGGCCCACAGTCATATAAGG ATCAGAGTCTAAAGTCTGTTCAGGGAACACAGACTGCTCCAGACCCATAT AGTTTACTTGCATTGTTGCATCTAATAAAAGCGAAAGAGCCTGGACCAAC AGCTCTTGCCTTAGGGCTTGATTTGACAACCCTAGGGTTGAATTTGAACT CTCAAGAAAGTCTTTACAAGACGTTTGGGTCTCCATGGTCAAATGAGCCA GCTAAAGGAGAACCTGATTTTCAGATTCCTGCTTGTTACTCTGCCGAGCA ACCTCCAGCACTGCAAGTAAGCTGTTTCCTATTTGGTTTACAGTAGCCTC TTGAACTCTGACATTTCAATTTTTTTCTCCATTTTCTCCATCTGCAGCCA TTCATTTTTCCGAAGTTTCAAACCATGACACTATTCTACATCTTCTACAG GTATATTTAATATAATGAACTGTGCGTTTGGTTTTACTAGCCTATGCATT ATTTCACTTTGCTCTTTGTGCAGTATGCCGAAGGATGTTGCTCAGTTGTA TGCTGCGAATGAACTGTAAGTACAAACCTGTACCCTTTTTGGTATCTCAG CAGAATATACTATTTTAGCGGACCTTCATTTGCTGCTGTTCACACACACA CACACACACACCCTATACGATTGTTAGCTGTTTTTGGTGTATGCTCTTCA ATTTATAGTCTAATATTAACAGTCTATAATCGTGCTTGGACCTATCTTAT ATGCAAAAATATTATTTGTCTACATCATTTTCTACTATTGAGTTTTTTCT CAATTATCCATTACTTTTAGTCCAAATGACAATGTCAGATGACTCAGATT TCTGATTCTCCTTTCCCAGATATAACAAAGGGTGGCTTTACCACAGAGAG TACCGTGTGTGGCTCACAAGAAATCCAAATGTGGCACCTCTTGTGAAAAA TTCACTTTATGAACGAGGGTCCTACCTTTTCTTTGATCCAAGCGTTTGGG AGACGATTCAAAAGGTTTAGTCATTAAAAACTGTGGAACTTTATAGCCTG ATGGAACATCAGGGAAAGTAATCTGAGCATTTGTTGATTGCAGGACAACT TTGTTCTCCAGTATGATTCTGTAGAGAAGAGACCTGCCCTCCCTTCGGCC AGCCAAAATGTTAGATTATAAGGTCAGCAGTAGGATTCTATCATTCCATT CGAGTGTGTTCCTATCCCGCAGTGTCATAATTCCCTCCATATGTATGTAG TGGCTTTTCTGACATGCAAATTTGCACTTGCATCAGCTATTGGACTTTCC TTCAGCATTTAGAGGATGTCGATTTTCTTCGGTCGGATCAGTACCTTCTA TTATCATCACAAGATGTAGGTGGCGTACATTTGTGCAAAATGATTCTGTA AGCACACCCAACAAAACTGTATTTACTTTTGTTGAGATTAATTTACTGTG CCGTTCTAAATTCCATTTCCTCTGAACAGGACATGTTAGCTGTTCCGAAC GGAGCTTCTGTAATCTGTATTGGCTGACAGCCCTGATGGTAGTTTTAGAG ATGTAGCTGAGGAAAGTGCGCCTCATAATTCGTTGGCTGTATCCAGTAGG GGTCGATTCGATATTTTCTTGCTGTAAATGACTTGGATTTCTAGCTTCTG TAACTTCAGACATGTGCTATCCTGTGCTCTTTAACTAGAAGTTTGTTACG ACACTCCGTTTTAGAATGTGCCCCTCGTTTTAATATTCTGGGAAGGGAAA TAGACATCAAAATAGATGGCTGTGATTTTCTCGTGATAAAGTGGCTTGCT CTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.