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GrainGenes Sequence Report: AE004594

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Sequence
AE004594
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE004594
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCCATTGTCCACCCCCTCAACCTCTCGAGAAAAACCCTTCTCAACCTCG
CCCACCCAGCCGCCTCCTACTCCCTCCTCCCACCGGCGCCGCCTCGCCTC
TGCCGCCGCCGTCCTTATCCCACCTCACCTCTGCTCGCATATCCCATCGC
CGAGGCGTCCATCCATGACTGAGCCAAACCCCAAATCGAAGTCCGCCAAG
AAAGCGAGGAAGCCTGCCGCCGGTGGCGAGGAGCAGAGCATGGACGAGCT
CAAGTCCGACGCAGGCCCCAAACAGAAGTCCACCAAGAAATCGAAGAAGC
CGGCTGCTGAAGGCGAGGAGGAGGGCGTGGATGCGGTCACGCTCGACGTA
AATCCCAAGCCCAAGTCCGCCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGTCGCCGC
CAGTGGGGAGGAGGGTGACATTGACGCGATCAAGTCCGACGTCGCCTCGT
TCGCCTCCTCCCTGGGACTTCTCCCCGGCACTGGTAACTCCTCCGGCTTC
GACGATTCCGACTTCCGCAAGTCCGGCCCCATAAACGCCCCCAAACCGCC
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ACCGCCGCCACTACTAGTGCCCCCACCAATTACCCGCTGGTAAAAGCGGG
TGCTCTCTCTGGGCAGTGGTACGCGGATGCTGATGAGCTGGAGACCAAGG
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TTCACATGTCTTGTTGAGGACAATCCAATAGCAAACATGAGAGCTCTTGA
CTCTCTCCTTGGTGAGTACTACTACTTAATACTCTCTTCATTGCAGCAAA
TACTCCAACTTCATTGCACATTGAACAAATTGAGGCAATGATGTTTCATA
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AAGTTATATTTGGGAACAATTCGACTGCATTAATTGCAACTGCAATCGGA
GATCAGAAAATGAACCATGTATGTTAAAATCGTAGACGGGTTGTGAGTGA
ACCTGCTGCACACAATCCCATGTCATGCTGATCCCCAAACCAAGGAACTC
CAGAGTAGATCATCTTTTTGTTATCTGCTCAGAGACAGATATGTTCAGTA
GGATTTATTTAAGTGGCCTTTTACTATCAACATTGCTGTCATTGGGTAGT
GTAAAGTAGGCAACTCAATATAATCACTGCCAGTGGTCTTGTGTAAACAC
CAACAATGTCTGTCTGTGAATGTGTTCTTTGCCACTGGAGAAATATGTCT
CAAGTTTACGAGATGACTCAACTTGATGAGTCAGGTCACCTTCGGCCTCT
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ATAAATATCACCATTCTGAAAATTTATGAACTATCAGCTTATGCTATATA
ACATGCAGTTCAGTCAGGCATCTTGTAAGATAGGTAGTGCTTGGACTTCT
CAGTCATATGTCTGTGCATACAGAAAATTTGTTTTCCTGCAGTTCTAAGT
TTTCTAATCATGGTTACCTTGTTCGGGATTACTTCATTTTTTTGTGATCT
TCAGTGTAGCTAGACTTTTCATATCAATTGCCATTGTGCAGATCATCCTG
TTTCTGTTTTCTTCCATGATAAATATTCTAAAGAGATTCTTTCTCCTTTT
TTTGTTTGTAAAAACAGGTATGGTTGCATCAAAGGTTGGTAAGAGGTATG
CATTCACAGGCTTTGATGCATTGAGGGAATTGTTCGAAATGAGGTTAGCA
TCTTCTGGACTCTTGTCTTTTGTTACCTTTTAGCTATACTAGCCCCTCCT
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CTTCTTTTCATTGACCCTCACTGCCATTTCCTCAAAAAGAATGCATCCTT
TGCTCGAGTCACATGAATTGGCTGCACCATTGGTCCGTTATTAGTTTATA
AATTAATTATTGGTTGTCTTGTTTTTGCTAGATTGCTAGGCTTACGCAAG
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ACATTTGACTAGGCCCTCTCACGTACCTGCTTTTGTTTCCTTCTATTATA
GTTTTCTCTCGTTTTGTTCTGCCATGTTTAGTTGTTTACGCGTTATTCTC
ATTGTTTGTGTAGTAGCAAAATGACAACATTAAAATGATGCACCAGTCAT
CTGATGACACAGTAGTTATTTGGATATGGCAAGCTGGAAACAGGTTAATG
GTTCACCTGTGTTTACACCTCTAATACTAGTTCAGCATAGCTCATTTGAA
TTCGCCCACAATTAGTTTAGCTAGTTTACAAGGGTAGGTCTACATACATA
CTTAAAGAAAACAAGTTATGATGTGTACCTGTTCTTATTGGGGTGACAAT
GATTGAAAGTTCATTTGTAAAGGAACTATGCTGCATGGGTACAAGCGAAT
GGAGAGGGCTATGTCTGTCTTATGAGTGACATTATTTGGAACATTAACCA
GACTATTTAATTAGCACTGTCAGATTTTATTTTCTTGTCAAATAAGATCT
CTGTTTTCTTTTATTTTCTTGTCATATTGTTAATTGATTACCTTTTCTTT
CTAGGTTGTTGCCCGATCGTAAGTTGAAAAGTCTTATTCAGCGTCCATTA
GACATTTTACCTGAAACAAAAGATGGCTACTCACTTCTGCTATTCTGGCA
CTGGGAGGACTGCTTGAAACAGAGGTATTTCTCACTCAACTATGTATTTG
GCAACTTAGGTTTGAGTTATCCAGGACTCAAGTAGATGTGATATGTAGGT
CTGAACTCTGGAAGAAAGAAGCCTTTAATTTAGGAACACTTACTGACTTA
AAGAGCAACAGTAGCTAACAAGAGTTCTGGTATCACTCTACTATGGAATG
AAGGCACTAGACTTCCTTTCCGTGCTGTCTAGGTCTTAGTTCCCTTGCCA
TTATTATATGTGACACCTTTATTGTTGTTCTATTGGCCAGCATTTTAAAT
ACCAAACTGTTAGTTGAGATGTCCATTGAGTAAATTTCAGATGCGAACAC
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ACGTGACACTTGACATGTGTGTCCGTGTGGTCAGAAACAAGGATTAGCAG
GGAAACGGGCTAGCTAGGGTCTGTGCTACCAATTGTCCTAGTATCTATGG
TTATGTGAAAGTTTTTGAAACACTGTAGTTTTTTCTTGACACTTGCCAGT
GCTCCAAATATCCGAGTCATGTGAAACTTACCCATGATTCTTACACAACA
GATCATTTGAATTGATTGTTAACAGATGCTGAGACCTCTGGAGAAATGGA
GGATATACATGCATCAACAGACCATTTTATGTTGTTTGTTGATGCGTGAT
CATTCTATGTTTCAGTTCTAATTATCTGATTACTGTTACAGGTACGAGAA
GTTTGTTATTGCACTGGAGGATGCATTAAAAGATATGCTACCAAGTCTCA
AGGACAAAGCAATGAAGGTTAGCCCAAATTATGTATTCATATGAAACAAA
CCTTATCATTGCTCTGGTCCTGGGATAGGACATATCATTATTATCCTCAC
AGAATGAGTCAATTGAGAACTTGCAATGCGACATATCCTTTTATTTTCTA
CCAGTACATCATGTCAGATACTTGGAAATGTTGAACACAAGAAAAAAAGT
AGTTGTGAACAATCAAAACATAATAGCAAACATTTAACTAGATCTGGTGA
AGCTGCAATAGAAATTGCTGCACCCAGTAAGACTTTGAGACATCTAAGCA
TGGTTTGTCTAGACAGACTTGCATTACATCTAATCTAGCTGTGCCTGTCT
TGTGAGTTGAGATATGATGTACCCTATTACTAAATTGTGGGTATTGGTTA
TTGAATTGATATCGCATCATCTTTCAAACTGTGTTAACGTGGCATTATTA
AGCAAAGCAATTTTGTAGTCAGGCTCTTGTTCAGAGATGGAATTACATTT
TAATATTCTTGGTGGGAACTATTTCCTGGCAGGCACCAGAAAAATTGAAA
ACCAGCTTAGTATTGTAACTAAATATGACGATTTGAGTCAAAGTTTCTGG
CAGCAATTTTGTCGAACCAGCCAAAGTTTCCCAGGAACTGGTTGCGAAAG
CAAAATTACCTTATTAACTTTTGGCTTTGAAAGGAAACCACGAGATTTGG
AACTGGTTCTTGCCTGTAACTGGTCAGTTGCCAATCCTGGCTAAGGTGTA
GGGGTTTTGTCAAATCTGGAATCTTCAACTCTGCCACTGGTTCCTTATGA
GATCTGGCAAATGGCTGGCATTCTTTTTTCGAGGATTTAGTTATCCTAGC
TTCGTAAAATAGACTCTTTTGCTGATTTGTGCTATTACTAGGATCACTGA
CTATATTCTTGTGTTTCTTGTCATGAATGTGCGTTGTTTGTTGTTTTCCT
CTCTCTGCAGACGGTTTCCACCCTTTTAAAGAGTAAATCAGAACAAGAAC
GCCGGTTACTTACAGCTCTTGTTAATAAAGTAAGTTGTCATTTTTCTGCC
ATTCTCCACTTCCATTTATTATAATGTGCCAAAAGCAGGTATATTTATTT
TATAGTACAATACTAGATTACTTATGAGAAGCAATACCTTCAATTTTTAT
GGCAAGCGGCCTTATTCTTAGTCATCCTGATACAAATCTATTGTAGCTTG
GAGATCCTGAAAGAAGGGCAGCGTCAAGTGCTGCGTATCTGTTAACAGGT
CTCCTGTCCACTCATCCAAATATGAAGGTATATGCATTTGTTCCGTTATA
AAAAGATGTGACACTTGTGTTATTGTCATTATTATCTATTCGATCAAGAT
AGTTAACTATGTAATATTTTGCTGACAAAGCATTTTTGTCTTATTGGACA
TTTTAAATTTGCAGATGGTTGTGATAGATGAGGTGGACTCATTTCTGTTC
AGACCACATGTTGGGCTTAGGGCCAAATACCAAGCTGTATGCCATTGTTT
TCCTTGTTAGCATCTGAATTTCATACAGTGACATTAGTTCTTTGCTTCTG
AATTTCCTAAACAGTGCACATTGGTAAATTGGTTCTCTTACTATTAACAT
TTTGTGTAAAGTTGTACTTTTTGAATATTAGAATATGCTCATCTATCCAA
ACTACTATGTATTTGAAGTATGCTAAATATGCTTTTTTTAACTAAAGGTA
CTATTGTACAGGTCAACTTTTTGAGCCATATTTTACTTGCTAAAAAAGGA
GATGGACCTAAAATCGCAAAGCGGTTGGTGGATGTCTACATTGCTCTTTT
CAAGGTTTGGATGTGATTCAGCAGTGTCTAATTTTTGTTGTGCTTAGGAA
TTGTTACTTAACCATTGGCCCTTTTCCTGCCAACTATTAGTTTAACTGTC
TTTTCATCACATCCTCAGTTCACCATCTTGTTGGCCCCATTTCTCTTTGC
ACTTCTGCAGTTTACATCATATGATTTTTCCCTATGGCTTTAAGTTCATC
TTCATAGTCTGCTGACTTATATGGTGTTGCTTTTAAATATTTAAAATTGT
CATTCCTGTTCTATGGCACTGTTGTCAGGTACTCATGTCTTGCCCTCGTG
ATACTAAAGGAGATAAACAAAGTAAACATGGCAAGAAAAAAGATGAAAAC
TGGAAAACGAAGGGAAGAAAGGACAGGGTCAACGACTCTAATTCGCATGG
CAACCATGAAGTGGATCCACCAGCAGGATCAGATTTAGAGATGGATTCTC
GCCTTCTCTCTGCACTTTTAACTGTATGTCTTACATTCTGCAGACTTGCG
TAGTACTGTCTTTGCTTCGTCGTGTTATCTGTTAACATTATGCTTACATG
CATGTGTTTCCCTTTATTGTGCTGAAACTGGTTATTGAAGTCTCTAATTC
TGTATAATTGTTTCATCTTATGCAGGGCGTAAATAGAGCATTACCATATG
TTGCAAGCTCTGAAGTTGATGATATTGTGGAAGTTCAGACACCAATTCTT
TTTAGACTGGTGAGGTTATTAGCTAATAAAAGTACATTGCCAAGTTGTTG
TCTGAAGGAACATATATCTGACATTTGTTTTGCATGTAGGTGCACTCTGA
GAACTTCAATGTTGGTGTTCAGGCATTAATGCTTCTGTACCAGATCTCAA
CCAAAAATCAGATTGCAAGTGACCGTTTTTACCGTGCATTATATGCAAAA
CTTTTGAGTCCTTCAGCTGTTACTTCATCAAAGGTTTCATGTGCCGGTCC
TTTTGTCGTCCTTTTTGTTTGCTCTTTATTTTAGCGTACTTTGATCTTCG
AACAGTAACATGGTTTTGTAATCTTCTTCATGGCATAACCTAACCATGAA
GAATGTAGCTATGCGTTTTGCACCCTTATATATATTGTTAGAAGTCTTTG
TTCTATAGTTTACCTGACTACTTATGTCTGCATATTTCAGCCGGAATTAT
TTCTAGGTCTACTGGTAAAAGCGATGAAGAATGATGTAATGTTGAAGAGA
GTAGCTGCATTTTCGAAGCGGTTACTGCAGGTCTGTTGGTTGATATTTTT
TAACGTGAAGCTGATTTTAATGTTGTGGACAATACTTAAATTTTCTATCT
AAGTTTGTGATTACAGACTTGTCATGGGCTCACGAGTCATAATGTATAAG
GCGATGATGCCTTAATTGATTTACTCGTTCCCCAGGACGAGCATAAAGGA
TTGTCATTAGTTACACTATAACTATACTGCACTAACACCACTATTCTACA
ACACTAAAATAAGTACTCCCCCCATCCCAAAATATAAGGTGCCCTTCTGG
TCAACAGCTTACAACTTTGACTACGATGTGTACTTAATATGTCCACAAAA
TCAGTATACAATATATGAAATGAAAGAATTTTGCAAGATGAATCCAACGA
TACCATTTATACATTCCCAATCCATATAATTTAGTACTCCCTCTATTGCA
ATATATAAGATGTTTTAGCAAGCTGTTTTAACTTGCTAAAACCTCTTATA
TTTTGCAACAGAGGGAGTATATAGTAGAGGTCAAAATCGTGTATCAAAGA
CCAGCAAAAAAACAGTGCACCTTATGTCAAAATCGTGTACACAGAACTAG
AACTAAACTACAGTTGCACATGGAAATACCAAGTGAAAGTTCCCCAGGAG
CTGCAAATTCCATGAAAGTGGGATAAAAATTTCCATTAGGCTCCTCTTGG
GAGCTTTGTAAAGTCTTCTTCCTGTAATTACTCGACATGCATATATTTCG
GGCACCAATGAAACCTCTGCAATTTACTCCTCCTGTAAAAGTGGTGTTTG
GGTCCAATGCCTCTCGAGCGAGAAGAAGATGCATAATTGTTTTAATGAGC
CGCCGGCTACTCCCAAGTGCTAGGAACACAGAGCACAGCTGCGTTAATGG
TGAACTCCATGAACACATCCTCGACCTTCAATCCTAGCCGCAGTGCCGAT
GCAAGCTTTGAGCTCGCCAACATGTCTGGTCACCTCCTCGCCCGCCTTGA
AGACAGATCCGCTGGGGAGAAGGGCGGTTGCCATGCCTGAGGATCCAAGG
AGTCTGAGTGTGACGGCGCCGGATTTGGAGAAGATGAGCTGGCATTACTG
CCGAGAAGACTGGATCCAGTGAGCTGGCATCAGCCTGCATGCTTCCCATC
TCTGGCTGCTACAGCCCAGAAGGACACCTGCTGCTGTGTTTCAATCACTG
GCCGCCATGCATTGCTCTCACCGGTGGTGGCTCACCGTTACCTCGTGGCC
GATGCCTGCTCTGGGTAGCGAGAGGAGCCAGTGTGCGTGACGTTTGTAGG
AAAAGAAACACAGGCTTCTCACCAGTTTATTTTTTCCGGGCATAAGTATA
AAAACAAGGCTTTTTGCCAGCCAAAATTGGTCATCCTAGCACCTATTGCA
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TCCCTCCGATCCATAATAATTGTCGCTAATTTAGTATGAAGTTGTACTAA
ATCAGCGACACTTATTATGGATCGGAGGGAGTACTATGGATTATGGAAGA
GCATGCTGTACATTGCAATCATGCAAAACTTCAGGACTAAAATCAACCTC
TTTTTCAAGACTTTAAAGCTAATCGATGTTTGGACCATAGTCATCTCCGA
ATCCCGGCAAGTATGTATATGAAAGCTGGCATGATAGCACACAATCAGCG
GACAACTATTTCAAGGTCACTGGAGCAGCATGATAATTACAAATTTGAAG
TGTTGAATGCTTTAGTTTACCAGTGTTATTAATGATTACAGAATCGTATG
GAATTAGGGAAGTTCTATAATTAAATCATGTTGTCTCTAAACAGGTGGCT
CTTCAACGCCCTCCACAGTATGCTTGTGGATGCCTTTTCATACTGTCTGA
GGTCCTTAAAGCAAAGCCACCATTATGGTATGTCGTTACTTGTCACAGTA
ACATGTCAGTGAATTTTATGGAGCGCATAATTTACATTAATTTTTTCAGG
ACGATTGTGCTCCAGAATGAATCTGTGGATGATGGTATTGAGCACTTTGA
GGACATTGTAGAGAATCCTGAGGACCCTGCTATTGCTTCAACAACTCTAA
ATAAAGAGGATGGTATGTCGGCTTCACTTGAGAAATACAATTCTGATGAT
GAGGATGGTTCTGATACTATGAAACAAGCAAAAGTGGCTGCTGATGATGA
GAAGGGTCAAACCAATGCATCAGCTGAGGGATCAACATCGCATGTATTGT
ATAATCCACGACACAGAGAGCCTTCTTACTGGTATTGTCTTTTTAAACCT
ATACTTTGCATGAATTTTCAGATTATTGTGTTTGATAATGCAAGGAAAAA
AATATGGGAATGCATCATGTATATTTGGATTAGAACTACTATCCCATCCC
AGTGTGTAGTTAACTATTCGTTGCGAAACCACTAGTTGCAATGTTATCGT
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GGTAGTTTTCACTATTTTCTCTCGTTTTTTGTACTTAGTTACAATACAAT
CAGTGTTTTTCATCACCTGTGCCTTTTGCTGTGTTCTCAGTAATGCAGAT
CGTGCCAGTTGGTGGGAGCTGACGTTATTGGCCTCACATGTGCACCCATC
AGTATTTACAATGGCTAGGACATTGTTATCTGGGAACAATATTGTGTATA
ATGGTGATCCATTGACAGACCTGTCGCTTCCTGCCTTCCTTGATAAATTC
ATGGAGAAGAAACCTAAAGGAAACCGCATTGCCGAAGGAAAATGGCACGG
TGGATCACAGATTGCACCAGCTAAAAAGGTATGGATTTGTTATTTGCCTT
TATTTTTTGTTGTTGAATTCAAGTTGTTCATCTTGTCATGTTTTGTCTCT
GGATTTGTTTGACCTTTTCATGTTATTTTTTCATATGTTTGTCATGATTC
CCATAATCTCATGTAGCTTCACCAATAGGAAGCCTTGCATTAGTACCATT
GCTGTGCCTTTGTCATGTGGCATATAATATTCGTGCATGTCATGGAGAGT
ACACCAGTAACCACCCGTAGACTAGCATGTACCACAGTCGTTGCTAAATT
TTGGATTATGTTTATTAGTTCACATACTTGTTACGGAGTACTTCCTTTAA
GTTAGTGCTATCGTTTGTGGGTTTCCATCCTTTAGGTTATACCACCTTTC
CATAAGAATGTCCATTGTTGCGATTGGAAGTTGGCGAGCTATATATCGGT
TTTTCTCATTCTTAACTTTTCTCCCTGCATGTGTGCTGCTGTGCACATGC
GCCATTTAAGTCCAGTGACACCTCGATCAGGCCTAAGGGTCATCATTACA
TAAACACATTTATCTTCTTCATAATTAATTTGAATATGCTTACGTAAAAT
CAACCTCTCTATATATCTGCTGGCCACTATAAATAGCTGCCTATGTGTTA
CGTGGCCACATGTTCAATGATGATGTTTGACTGTGCTATCTGTTGTGGAT
TTTATCATCATGTGACAGCCTATGTGGTACTCTCCATACTCTAGATTTAA
TACTAGTTGTCAGTGCTGCAATTTATTGGCTGATCTATCTACATTGTGCC
CCTGCAGCTTGACCTGAACCATCATCTCATTGGGCAAGATCTGCTAGAAC
TCGAAGAAAATGAAGTTCCTCCTGAAGATGTTGTTTTCCACCGTTTCTAC
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TCTCGATGATGATACTGGAGAGCTCTTAGCTGATGTTGCTAGTGATGAAA
GTGATGACGAGATGCAGGAGCTGGAAGATGGGTCTGCGTCGGATGGGGAG
GAGTATGACTACGACAATCTGGACGCCAAGGCATTTGAGGAGGAAGGGGA
TTTGCTTAGAGATGACAGTGATGTTGATGAGTTGGTTGACATTTCAGATG
ATGATGAAGGAATGGAAAATGATGATGACGAAGATGATGATCTTAACATG
TCCTTCATGGACTCCGAAGCCGAGAGTGCTGACGATTCAGATGATAACAT
TACCAATGTAAAGGCTGCAGCCCATGGGCAAAAGCGGAAGCATGGTGCAA
AGAGCGGCTCAACTCCATTTGCAAGTCTAGAAGAGTATGAACATCTCATG
GATGGGAATGCTGACAAGTCTACGTTGAAGAAGAAGCAGAGGAAGCACAA
GGAAGCTGGTGACAGTGCGGGCCGTAAGGAGAGACCGAAACAGTCAGGAT
CACGGAAAAGAAAGTCGAAGAGATCTGAATGAGAACGAGCTTATACCATG
TTGGAAAATGTCCGTGGCCATGGTGCTCGCAAGTCGCACCCAAAGTTTTG
TAGTTCTGGGGGACGCAAGTGGATCTTTTGATGTGCGAGTGCTGCAACTT
GTTCGGTTATCTTTTGCTGTCAGTGCTCTTTACCTGGTGGAAGCGCTGGT
TTCCACGGGAAGAGAGAACGTCTGCAAGGTATCAATTGTTGCACCAGCCG
CCTCGTCCTAGTATCTGCACGGTGCAGCATGTATGCTCTATTTTTGACAA
TTATGTATGTTGCATTCAATTATGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.