Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE027740

[Submit comment/correction]

Sequence	AE027740
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE027740
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCGGGACCGGCTTCTCGTCGGACCCATGCTGCAGGGAGACGGCCGCAT ATACCCGCACACCTGGACGGAGACTCCCCAGTCCAGCTCCCCATGCCGCA TCGAGACGAAGCAAAATAAGCTCAGATTATTATTCTCCCCAAAGTCTCTC TCGCGATCGAACCCTCGCCCTCTTCCTCCCGTCTCGCCTCCTCCCCACCC ATCCTCTCCTCCTCCTCCTCCCACTCCTCATCTCGCGATTGCCGAATTCG ATCGAGGGTTTCGGGGGATTCGCTCCCCGCCCCAGGCGGCCCGGATCCAG CTCCTTCAAAAAGCTTCGGATCGCGTGAGCGCGCACTGCTGCTCACTCGC TCGCTGCTGTTCTCCCCTTTTTCGTCAGCCGCCACCACCGCCGCCACGAC GAGGGCGAGCTGGGCTGGACACCCGGTGAGAAACTATGCTCCTTCCTAGA GCTCCCGGCTACTCCTAGCTCTGCAGTCTGTACCCTCACCCACTTAGCGC CGCGGCGTGCCGTGTCTGGCCGCGGGCTCGATTCGATGCGTCGGAGACGG AGGCCGAGCTGGTCTGCGTAGCTGGAAGCTTGTTGGGGGGATGACGCCGG TTCGCGTTTGTGCGCCTGCTTTATTGCGTGTCCTGTCCGAGTGGGTGGGG GCGGCTGTGGTGTTGTTGTGTCAGTCAGTCCGTCATCGCTTTAGCTGCTT CGCTTTGCGGGGGTTGGTGCTTGTGGAGCTGGAAGCTCGTAGGATTGCTT TGCCTTTTCTAAGCGGTTTAGACTTTGGAGATGCGGGCTGGGAAGCGGGG AGCTCGCGGCGTATCTATCTCTCTGCCGAGTTGATGCGCTTCCGGATTTG ATGCGATCAGTTCCAGGTTCCGTGGTTAGCTGCCTTCGCTTTTATACTTT GAGTGGACTAGCCTCGTGATTCTGGGAGATCATTGGTGTGTTGGTCGTGG CTCTAGGTGCGGTTGTCTTGGAGGGTGGACATTTGGGGAGTGCATCTTGT AGTGCATATATGTTTAGGTGGGTGTTTGTGAGTAGATGGTGGTGAATACA ACATGTTTACTTTTTTTGGGGGACTTCCTTCTCTTCAGGGTTTCTAGTTT TGCTGGTATTTGGAGGTTGTGCGTACAGGGAATGTTTGACCCTCCTCTGT CCATGTTTTAATTTTGGGCTATTGCAGAGTTGCCGATTTGTTATCTGTTG TAGCACAAGTACTTTCAGGTCAAGTACCAAAATGCAATTAGATGGACACT CTTTTTTAGCAATACTGATAATATTTTCTGGAATTTCATGGGTTTATCGT TGTGGGTAAAGGATATGCATGATTAGAACCAAAGCTGACTCTTCTTGATG TGGTTGAACTTTTACTCTGTCTCATCTCACCATCAGCTATTTCAGGGTCT GTTCTGAATACTGGATATGAACCAGCCCACAAAGTGGAAACCCCAGCATT AAATCTGCTTTGTTTGCGTGACCGTGAGTGTGCTGGATACTGACGGAATT TTCTCATTCTTCAAGATGTTTTGGCATGTACCTGGACTTTCTGCTGCATC ACCAGTGAGTGCCTGCACTTTCGAATACATCTTGTTTATGGGACAGTTTT GAATAAATGGACATCTTACTAATTCTTTCAGGTGGATACTATATTGGACA AGGAAAACTTTAAGTTGGAAGACCTTCTTGACGAGGATGAAATAATCCAG GAGTGCAAAGCACTTAACACCCGACTAATTAATTTGTACTATTTCTCTTC CTGAACACTTCTTTGTATCTTTTTTCTATTTCTCTGAGGTTTTTTTTGTT GGAACCTCTTCATTTATTGATATATTGTTTTAACTTTGGTTGTGGGTGAT TATCCATATATACGTACTTACTCTGACTCATGTGCATGTTCTCTGTGCCG AAATATATGTGTTAAACTTGTCTTGAAGTTCCTACCTGGGTTTGTCTTAA AGTGGATCGTCTCTAAATCTTGTTTATTCAAACATATGGAGTTTTGCCCT TTGAATTCACTATCCATTTTTTTGTTACCTGGACCTGGTCAATGTGTGTG CACCACAAGATGAAATGTCACATGGCCTTACGGAAAATCATATATGTATT TTAAGTATTAGAATTATTAGAGAATTGTAAGATTATTTTATAATAAACTA CCTGTTCATTCTGGATGTTGTAGTTTACGAGACAAAGTTCAGGTGGAGCT ACTGCTCCGCTACATTGTGGAAGAGACACCGGAAGATGCTGAAAAGAAAA GGATATTTAGGTATAGCAAGCCTAGTTAAAAATGAACCAATTTGTGCTGT GTGTCCTAACATGGACTTTGTTCACCACATTAGTGTCTGGTTTGCAGGTT TCCTTTTATAGCTTGTGAAATATTCATATGCGAAGTGGATGTCATCTTGA AGACATTAGTGGAGGATGAAGATGTATGTGTTTAATTTTAGCTTTCTATT TGTGTTGACGCAATAATATTCCCATAGTACAGTGTAATTTTTTTTACAAC TGATAAGTTGTGCTATCTGTGCAGCTTATGAATTTACTTTTCTCCTTCCT GAAACCTGACCATCCTCATGGGACTTTGTTGGCTGGCTACTTTGGCAAGG TACTTTTATGCAATCATTAACTCCTGGCAAATTTGGGTCTCTCTCTGGTC GATTAAATGGTAATGCCCTGATTTTTTAGCCTGACATTTTAAATGGCCAT CACTGTACTGCGTTCTGCAGGTGGTTATTTGCTTGATGCTGCGGAAGACA CTCCCACTTATGAATTATGTGCAGGTTTGTGACTTTGTGTAGCTTTCCTT TTATTTGTCATCTCTTCTTTGGTGTTCCATAATTTGCTTGATCCATAGAT CTCCCATGACAGCCATTCATGTACCTTATATATGCATTAGTATGTACCAT GTACAGTATTACGTGCCATATATTTTATCGAACAGTTCAAATATGTTGTA GTTTATGCTGATGCTGCAGCAGCTGTTCTAGAGTAGTCAGCTAATACCAG AATCATCAACTTAGCGTATACTTACAGAATTAAACATTAGTCCATTGCTG GAAACTGAAAGTATACTTTTAAACGACTTTATCATCCATCTCAGGTTTAA CAGTGCACAAGGCTTAAACATCTGTAAAGCCATTTCTGACAGTGTTTTTT ATTAAAAGTTGCACATGTAGAGTATCCATATAATTGGTTTTCTGTTTGTG TGAATTTCAATCTAATATGTTAATTTTCGTGTGCTGTTGCATTTCTCCTG CAGGGCCACCCTGAAATAGTTAGCCAACTTGTTGATCTTATCGGGATCAC TTCTATTATGGAGGTTAGTTTATTTTACTTGCTGGGCAGATTTAACACTG AAAAAGGAGCCCTGGTCCTACTTTTATTTGAATTTGTGACCTTTTGCAGT AAGATTAATTAAACGTAACTTGATAGTATGTCGGTTTGTAATGCAGGTGT TAATTCGCTTAATCGGCGCTGATGAAACTATGTATACAAGTTATGCGGAT TCAATGCAATGGTTAGATGATATACAAGTCCTTGAGATGATTGTTGACAA GTTCAGCTCATCCGTAAGAACCAAAGATTACTTTTAGCATCCAGCCATGT CAATCGCTCACTTGTCCCGTTTATTGGATTTTCAAACTATTGTAAAATCG TCTTGCTGATGTTTATCCACACCATGCACTCTGTTAGCAAAGGAGTGCCT TAGAAAACTAGTCTTTTGGATGTAAATTGGTTAGCCAAAATGCATTATTC TCCAAAGGTACCATTTGTGAGTTATCTGAAATTTGAATCATCCTTTTCTA GCAGAAACCCGCACAAAGTTCTACATAACACTAACATACATTATGTATAT CTGATACCTCAGGATTAACTAGCTACTGGCTTGGGTTTATCTACTCTTAT GTGAACCTATATGATTGTGAAGTCCTCTTTAGAAATACGTAATCACCTTC AGATGTTAGCCTGCTGTCCAGTTTCTGGTTTACCTCTACATGGTCAATGT GTTGGCTACATCTCTCCAGTCTGAACCTATATGACTGAAGTCCTCTTTAG AAATACGTTATAACCTTTAGATGTTTAGAGTCTGCTCTCGAGTTTCTGGT TCACATCCACCTTGTTGTCATGAGTTGGCGAGTTGCTCTTCACCCGTACC AATGTAAGATGTTGAACGACCGGGCTAATGTCCATGTATGGTGCAATGGT ATTCAGCTGCATCATTCTGTAGCTACATCCTCACAAATTATTATGTCACA TTTTTCCACAAATCATGTATGAATGGTGGTTATTTCTCTGCTGTTGAAAT TTTTCATTGTTCTTGGGATTTTGTGGTTCATGCTTTTATTACGTACATGA CTCCTTTTAATTTTCATTGCAGGATTCTGCTGAGGTTCATGCAAATGCTG CTGAAATCCTTTGTGCAGTGACTAGATATGCCCCTCCAGCACTTGCTACC AAAATTTCCAGTCCTAGGTGATTTCTTTTTGTGCAGTCTTACATTGTAGT ATTGAATATGTTGTCCCGGGCTTTTATAGTTTCAATTTGGTATTGAACAG AACTCTGTATTTTTCTCCTTTTCTCGAAATTTGCAGCTTTGTGGGGAGAT TGTTTCATCATGCTTTTGAAGATTCAAGACCTAAATCAGTGTTGGTCCAC TCATTGTCAGTGTGCATATCTTTGTTAGATCCTAAGAGACTTGTAACGGC GTCCTACCAAGCTTTCCGTAGTCAACTAAGTCATGGAACATTGGTCACCG CGAGTCCAGAAACAGTCAACGGCATGCTGGATTGCCTTGGTTAGTGGTCT ATACATCTTTTCATATGGAGAGATGCTATAGCTACAGTATTTAATTACTC ATGATTAACTGCCAGTTTTCCATTATGTATCTTCCATAATCCATACTTAA AAAGGAATAGCAAACGATACACATATCAAATGATTTATATATCTCTTTTA GAGAACGCGTTTTATATACATCTCTGGAATAGCACAAGTACCGTATTAGT TATATTTTAATTGTAAACCCTACACTATTATATCTGTCCATTCTTCCTAC ACTTCGTTCTGTCAAGTAATTATGAAGTTCAGACACTGCCTATATTTAGT TATTTACCAGTTGTTCGAAAAACCAATGCTCCAAGGATAATACTGCCTCC GTTCCAAAATAAGTGTCTCAACTTTGTCTAAAATGTGTCTAGATACATGC GAATCTAGACAAAATTAAGACACTTACTGAAACGGAGGTAGTATCAAAAT CCTAAATTTCTGTCTGTCATTTTCAGGAGATTTGTTGAAGCTGCTGGATG TTTCGTCTGCTGAAAATATTCTGCCGACAACGTATGGCAGCTTACAGCCT CCTCTAGGAAAACATCGCTTGAAGGTATGTGGTGATTAATTATGTTCAGA TTTACTAATTTGAACTAGTCATGAAATGAACATGAGTGCAGCGCAGGAAA CCTATTAGTGTTCCTTTGTCTAATAGCCTTCGTAGATATTTGAGCTACTG TTAGTTTGTATTCAGAGATATGTATACAAAGCAGTGATGTTCTTTGTTTC CTTGTTCTACAATTTGTATGGTTCAGGTAATTGATATTCTCCATGTTACT GTTGATGGTGGTTATTTTTCTTTTGCAGATTGTTGAGTTCATCTCTGTCC TACTTTCGATTGGTAGTGAAGTTGCTGAAATGCGTTTGATCCAACTAGGA GCAATCAAGCGTGTTATAGATCTATTTTTTGAGTAAGTTAGATATGACAA TCTGTTTCGCATAAACTTGTTAAAGAGCTGACAAAGAATTCATCGTCAGG TACCCTTTCAACAACTTTTTGCACCATCATGTGGAGAACATCATTGTTTC CTGTTTAGAGAGTAAACAGGATCCGCTGATTGCGCATGTTCTTGATGAAT GTAAACTTGTTACAAGAATTTTGGAAGCTGAGAAAAACTCTGCTCTCTCA GTAAATTTAACTAAGGTACAAAATAATGTCTCACCATTTGATATACTCCC TCTATTCCATTAAAACAAAGGCATACTATAATTTAGTCAAAAGTCAATGT TGTCGAACTCTGGCCCTGTTTCTAGACAAAAAGATGAACTTCTACAATAT TAAATCGATATCGATAGATCCTCCACAGAATATATTTTCACATTGTATTT ACCAAATATTGTGAATATTTATACTGTCTTATATATATTTTGTCAAACTT AACAAGTTTTGACTTTTGAGAAGATTTATAGGCCTTGTTTTCTGAAACGG AGGTATTACACCCAACCAGCTGATTGGTCTATTAATTTGCCCACTGATAT ATTCACTTGTTAGTTGTTACTCTCTTTGCAGCATACGCTATCTGCAGAGG GAAAAACTGCCCCAAGGGTTGGATTTATTGGTCATATTACACGGATAGCC AACAAGCTCATTCAACTGTCCAACAGCAACAGCACAATCCAATCACATTT GCAGGTTTATTTTTTTTATTATATACACCAAAATCTTCCATGTCTCACAT GTAATGGATGTGTTACTAGTCCCTTTCTGGTTATCTAACAGAACTCCTTG TGCAATGATAGTATGGTAGACATGCAATAATTTCTTGCAAAGTTTACTTG TTTCTTGGCCTTATTGCTATTATATGGCTGCTTTGAACTTCGGTTGAACC CTTTACATTGAACTTTGATGCTTTGGATTGCAGCAAAACTCTGGTTGGGC TGAGTGGCATGGTAGTATCCTAACAAAGCGTAATGCGGTAGAAAATGTTT ACCAGTGGGCTTGTGGGTAAGTTTCATTCGACTTCTGTTCATAAAATTAT CTTCTGTACTTTTTTCGTGTGTACTTTTGGTATTGATTGTATGTTCTTAG TTGAGTTATTTATTGTTCATATCACTTCCTTATGAATCATAATGCCGTGC TCTGTTGAATGAAAATGATTCAAGTCAGTATGATCGCTTTAAGGACATGA TTATGTATATGCGTTTAACTCCATCAGTGCTGCCCTGATCTCCAAAGATG CATTACACATATACATTGGCGTGTCAGTCATTAACTTCCTTTTGTCAGAG GAACTTTTGTCAATAATGTTGTGTTTTTTGACAATTAGGTTGCATTAATT GGTAGTGTTGGTTACAAACAACTGTCCTTTTTGCTCCATAGCTACTTACA GCCAGCCTTGTTCTGGCTTTTTTATTTAGATGGACAGCTGACTGTTGTTT ATGATCAATTTACATCGAATCTTATGAGAATGCAGCTGCTTTAAAAAAAA TCATTGTGACACCATTGCACCAATGGAAAAACAATACGATGTTTCACAAT TAACAATTCATTGAACTTGACGACCTTTTTCCCATTTAACCCATACCCCT GTGCTCATATGACAATCGCGCCATAGCTCTATCTACATCAATTCATAAAA ACTTGAAAAGGTCAGACATGCTATGGATAATGCATGTTCATATGAGTTTT TTGGTGTTATTCTAGAGTGAAGAGGTCATCCACTTCCTTAACTTATCTCT TTCCTATATGTCCTGCATTCCATGGAGAAAAGGCCATCTGCTGAAACGTT TCTTTGGTCATAGCCGACCGACATCACTGCAGGATCGAGGTAGGGACAGC GACGATGAAGACTTCCGAGACAGGGACTATGATGTGGCTGCACTTGCTAG CAATCTGAGCCAGGCATTTAAATACGGTATTAGTAATGAAGATGTTGATG AGGTCAGTATTTTCTTTTTCTTTTTTGTTGGGGTCAGTATTTTCTTCTTG AATATCACTCTTATGTTAAGGTATAGCTAACCACTTCTACCTGGATTTGT CTTGTATCTTTTGTTTGGATGTTTCAAACTCACATGATCTGTATATGAAT CAGTTCTTTCTTTTTATATGTATTTTATTCAATAGTAGAACAGGACTCTC CCATGGTATCTGCCTTGTTAAATGTCAAACTTGCGCAGTAAAGCTCTAGA GCATAATACTCTTCTATCGCGATAATGGGCTTAACCAGTGGATACAATAT TCAGATTTACTTGATAAATAACTCTTTTGTGGGTTATATATGCAGGCTCA AGCATCACAAGAGCGAGATGATGAGGTATGCTAGCTTTGTTTGCTAAAGT TCATGCACCGTTATATATGCCTAGCAACATTATGATATTTGTATTTGCTG GTACATGTAATATGATTTTCTGTGTTCTGATTGTTACTATCCCTCTGTAG GATGTGTATTTTGATGATGAAGCTGCTGAAGTAGTTATCTCCAATATTCG TTTTGGTGATGATCATGACAGGTATTTTCTTTATCCATACAATTTGGCCA TATCTTTCCCATAAGTACTCCCTCCGTTCCAAACTAAAACAGTTTGCCGA AACATCTTATATTTTGCAACGGAGGGAGTACATTTTATTTGATGTCTGCA ACAACTGGCTGATGAAGAGTATGCTTTGCAGGGGCTCCCTTTTTACGAAC TCCAATTGGTTTGCATTTGATGAGGACAAAGCACTGAACGATGACCCAGA AGCTTCCCTTTCCGCAAAATTGGAGTTGCCTTCATCAAATGTGGATGACG ATATGGATGAGGTCATTCTTGGTGAACCTGTAGATGGCACAAAAGGTTCG GATTCACTTTTAGCAACCTCTGACATAGACTTGAGTGAAGAGTCTGGTCA CACAGTATTGACAAATGGCCCTATTGATAAATTGGAAGATGACATCAGAC CGCCAACTCCAGATGTAAAAGAGAGTCTGCCTGAGTGTGTTGAGTGGACG GAGGAAGATGCTGAACCTGCTGAGGTATCAGTGAATACTGCTGTTCTGAA TTCTGAGGTTGGAAATGAGAATGCAATGGATGCCACTGGTGGACTTGTTT CCGGTACTACACAATCAGGAGAAGAACAAGGTGGTGCGAATTTGGTTGAA TCCCCGGTTCTTGAGACCACAGTAGAAAAGACATTACCAGATTTACCGGA TGCTAATTCAACGGGTCATTCTGAACCAGGTGATGGAAGCTCTAATTTGG ATTCTCCAATGGGTGAACAGAAGCACGGAAACAATGATAGTTAGGGGATA TAAAGTGGATCCGAGGGTACCAGTATAGCACAGTTTTGTTCACATGGTGC TGGATGTCTGGATGGCATATGATCATGGATGTGCAGTGTAGGTGCTGGGG TAACATGTTAAACCATTGTCTGAATAGCTCAGGGGCCGATGTTTTGATAT TTCTGTACAATTTGCATTGGATGGCCCTGCCATGCACCTCAGAATTTGGG TCTCATGAATCCAACAAGGTGTTGTCGATCTGCTCAAGCTTGTCTTACCT CAGAATTTGGTGGAGCTCTGTTGTTACTGTGTCAATGTAATTGATCTGTT GTCTACACATGGTGCAGAATATCTAACAGTAGATATCTCTTAAGTCCCTG CAGCCACGAAGTTGGTTTCTGCCCTGGTCTGTCTGGTAAATAACTGATTA TTTGGTGATATTTGGTTCCGATACTTCATTTCTCTAGGTGGTGATGTTAG TAGTAAAATTTTGACTCGAATTTCTGGAGATATACTCTCATATGTGTAAT ACTATGAATACCTTTTTTTTGGTTTCCCCAAGTACCTTTTATTTTATGAC TCTGTTCAAAATGTTGATTGTGATAATTATTACGGAATAAAATAGGCACC TGAATGGAACTTGCATAGCCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.