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GrainGenes Sequence Report: AE004863

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Sequence
AE004863
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE004863
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCTTTTTTCCTCCTGTCCTGAGTCCTTGCCTAAATCTTTCCCGTAGTCT
ACCACCGTGCCCTACAGCTACCGCCGTGTCGTACCTTAGCGTCACCGCCG
GCGCCTCAATCCCATCCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCGACGCCTC
AATCCCGCCCGCAGGCACCTCAATCCGGCCCTCCACGGTCTCCTCCCCAT
CCCCGACACCCTCGCCTGTCACGCGCGTCGCTGCCGTCGCCGTTCCCGTT
CTTCCTCGTCGGAATCGGAACGCCGCGTCTCCACCCCGCCCGCAGTCGTT
GCCCATTGAGTTTCGAGGTATGACGCAGTTTTCATGCAGCTATTAGTTAA
ATCCCACTGACCTTCCCAACTTCTGGGTGCGCAGGTGCACACACCCGGCA
CACCATCTAGATCCGTCCCTGACCCCAACTGTTTGTAGCTTATAGAAGAA
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AGACCAGGTAGTCATCTTTATTTACCATTAGTGTCCATTCCATAGAAGTT
GTTATAGAAAGTTCTGTTTATTTTGAATGCCTGAAATTCATTTTCTTAAA
GTCATGATGTATAGCATGTGCAATGTACAACTGCACAAAAAGAATTCAAA
GAGTGTTACAACCATTCTTTGTTCTTATTTTTGTTAGTGGTAAATAGTGT
ATATGATAAACAAACAATGTGTCAAAGTGCATCAATGATAGTGCAGATGT
TGCAGACAGTATTCTTCTTGCTATTGTCTCCATCTTTGCAATTCAAATTC
ATTTATTTGCTAGACCAGTGCTATACTAAACTACAAGTAATCAACTATTA
TTTTGACCATTGTGTAGTAGTGCTAGAACTAGTACATACAATAGACTAAG
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TATTGGATAAGGTAATTAATTTAAACCGTCTTCTTTTGTAACCATGATAG
CAAAATCTTATCCCAGTCAGTAAATATTGAGACTCTACAACTAACTAGAT
TGCACAAGAGAGCACAACGCAACAAACCGACTGCAAACTGCTTGTAAACC
TTTTAGCTGAGAATTTTGGCCATTAACATGTCCATTCATGTGCATGTAGA
GGGTGGGTGGAATGAGGTTGTTCAATACAACTTCGAAGGCATATGAGGGA
GGAGGAACTGAGTGAATTTATGTCCAATACAAACACAAGTATATATGTAT
ATTATAGGCGGTACATGAATAAAATTAAGAAAATATAACTGCATCTCAGG
GTGAACAGTGCCTATTTTGTTACCTCGCTACTTTCAGATGTACGTTGAAG
TTCCTGATATTTTTCATCCATGTTTATAAAGGAAGTTTCTTCCCCTAACC
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AAATAAGTTAGTACTCACTCATTTGCTCCATTTTTGCTAGTCATTTTTCT
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AAGTCATGCACATGTTTTTGTGGCATTGGTATGATCTGATATTATTCTCT
AATTTCAGATGTAAACTACCTGAGGACTCTTGACTCAAGCATTAAACGAA
ATACAACAGTTATAAAGAAGCTCAAAACAATAAATGATGAACAAAAGGAT
GGATTAATGGATGAGTTGAAAAGTGTGAACTTGAGCAAATTTGTCAGCGA
AGCAGTTTCTTATATTTGTGAAGCTAAACTCCGTTCTGCTGATATACAAG
CTGCAGTTCAGGTAATTGATGTTAGTAATTTGTACTCGCCTCAGTACAGA
AGCAAGAAATTGCTGTCATATAGCTGTCCCCTGTGCTTTATCAAGATATT
TTATATTGGACTTGTCTATTTCAAGCTTTTGGGTTACAGAATGAAGCATG
TTCCCTGCTTTGCTGTGATCCTTTACGTAGTGCTGCTACATATATTCTCA
GTTTTTTCACTTGGACTTACTGGTTTAGATCGTGCTGTTGCATTACATTT
TCATTTTTTTGCTTATTGGTCATCGTGCTATTACATGGCCTCATCACATC
ACTTTAGAGTTTGAGGTTTAGTTGATCATAAACATGTGAACTTCTAAATA
CATCACTTCTATGTGAATTTATGTAATGTAATAACCCTTGTAGCAATGTA
ATGTAGGTTTGCTCACTGCTTCATCAAAGATACAAGGACTTCTCACCTTG
TCTTGTACAAGGTCTACTGAAGGTCTTCTTTCCTGGTAAATCTGGCGAGG
ATTTGGACCTAGACAAAAACTCAAGAGCTATGAAGAAGAGAAGCACCCTG
AAGCTTCTGATTGAACTGTATTTTGTTGGAATTGTTGAAGATGCTAGTAT
CTTTGTAAACATTATAAAAGACCTTACATCACTGGAGCATTTGAAGGACC
GGGAAGCAACTCAGACAAATCTGTCTCTTCTCTCTTCCTTTGTTCGTCAA
GGGAGGTTATTTATAGGATTACGGTCTCATGGTCATGAATCAAATGATGA
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CGAACAAAATGATCATCACATTCGACTTCAACTGTAATAGGTAGAGTAAC
TTTTTTTGGCTAAGTTTGAGGCACATCATTGAGCCCCAAAATTACATTTT
TTGTAATAGGTAGAGTAGCTGTTTGCAGAATTTAGAAACGACCAGGGAAC
TTAAATTGATCAGTCCAACTCATGGCAAAGTTGGCAGGAATCAAGCTTAT
AAAAGCAAGATGGGTGCATTATGAAAAAAATAGCTGGGAACTTCAGGAAC
TGTAATTGACTCGTTGATGTACAATTTACACTTACACTAGCGCCTAAGCA
TGGGAGGGACCTGCATGCATGGAATTATGATTTTGATAATTGGGCCTCCT
CTCACCATTCTATGCTGTTTTATACATTATCCTCAAAGTCTACCAGTGCC
GAATGACTGCACTTATATGCCACCAATTGGTCAGAAGACTGATATGTTTC
AGTGTCCATACTGAGCTAACCTACCAACATTATTTTAAATCGATGCAGTT
CTTTAAGGACCTAAATGTTACTGCTGATCAGAAGAAGTTCTTCAAGAAAG
TCTTGAGCTCTTACTATGATGCTGTGTCTGAACTACTACAATCAGAAAAT
GCGGTAACTACACCCTTTCTGTTTATTAATTTGGACTCCTATTTGTCTTT
GACTGCCATCTAATATCTTACTGCATGTACCTAACTATCTACTATATCCA
GTCTCTTCGTCTGATGGAGGCAGAGAATGCAAAAGTTCTAAGTGCCAAAG
GGGAACTAAGTGATGAGAACACAGCTTCATATGAGAAACTCCGGAAGTCT
TTTGATCAGTTACTACGTGGTGTATCCTCGTGAGTATCTATTCGAGAATG
TTATTTCCAATATGTGTGTATTGACACATTTCAGCATAGTCTGCGGTTTG
TCCAGTTCTGTTATTCGTAGGCTTGTGACATATGATAACTAGTTTAGGGA
TCTATGTTTGTTGAATACAGCAGCACAGGCTTGTCCCTTATAATTTACTA
GCTGTATTTGTGGGTACCGCTCATGCCCTATCTCCTTGATAATGATGTAA
CTAAATAATTTGATCATATGGAAATATTGTATTTACACGGGAATTCATTC
ATACTCATTGCAATTAGGGGAATAAACTGTCTGCATATGATCAGCTTCTC
CATACCTGACAATTTCAGCAGATAATTTCTTTCAATTCTGTAGTCTATAG
TGTTGCTTTTTTTATTGAGATTCAAACACTATTTTCTTCTTTGTTCATAT
TTGACCTGAAAACATATATCAAAATGAGAACCCATCATCTCAATTAATTT
AAAAATAATTATGTTTTACGTTCAGCGTTACAAAAGACCATAGATGTTCA
GTTGTATCTTCTAAAATGTGTTAGAAAGGACAAAGCAGCTTTTCCCTTGA
CTTGAATAATTATTAATGATGTGCCTTCTAGCATTTCAACCATTTCATTC
AAATATATATTTTATATTTATGTATTATTAATGAGGATCTGCAACCTTTT
CATTTACAGGTTAGCTGAAGCTATTGACTTGCAACCTCCAGTGATGCCAG
ATGATGGGAATACAACAAGGGTTACTACAGGAACTGATGTCACCCCCTCT
TCGGGAAAAGAACCATCTGTACTAGAACCTATTTGGGATGATGATGATAC
CAAGACTTTTTATGAATCTTTACCTGATCTAAGGTTTCTCTTCATACTAT
CAATAATTCTCTAGCTACATAAACTCTGTATTTACTAGATTCTTCTTCTG
ACTACATAACCTACTTCCTGAGCAGAGCATTTGTGCCCGCTGTGTTACTG
GGAGACGCTGAACAAAAGGCGAATGAGCAACATGCTAAGGGCCGTGAACT
ATCTAGTGTAAGAATCTGATACCTTCAAAGCAGTACATTCTGTCAGTTCA
CTTGGTACTGTCTGAGAACATTTTACAATACCTTTCTTTTGTAAAATGGA
TTGCTAGATGCCAATGTGTCATTATATTATTATTATGCTTGTTTGCATCA
TATCAGCAGTGTAGAACTGTTTTTTTTTGTGAACATCTTTTCTGACATCT
GGAGTCACCTCTTGCTTCTTCTTGCTCATTTCTTCTGGATAGCAAGGTGA
ACAACATATGGTTTGTTTTTAAGCGGTGTAAACGAAATTTCAGTTTTCTC
TTAATTAGCATTTCTCTTTTGTTTGGGTTCAGCATAAAATCATCTGTATG
GATTTTTGTTTTTGAAGGAGTCCAGCGCGGAACAAGAGACTGAAGTACAT
GACATTGCTCAAACTTCTTCCCCTGAAGATCAACTGGAGGGAAAGGCAGA
TGATGTAGCCAAGCATAGCGAGGACAAAGAAAAAGATAAGGGAAAAGATG
CAGAAAAACCCAAAGAGAAAGATTTAGACAGGAAAACTGAAAAAGATAAA
GAGAAAGTAAGAGCCTTGGATGGTGGAAGTTTGGATAACCTCCTACAGAG
GCTGCCAGGATGTGTTAGCCGTGATCTTATTGATCAATTGACGGTATATA
CTCCTATTCTGTTGTCTTCCCTTTCTGTATTTGTTAAGGTTCATTATCAT
TCTCAAGCTACTTTGGTTTCTCCAGGTTGAGTTTTGCTACCTGAATTCTA
AAGCAAGTCGGAAGAAACTTGTGCGGGCCTTATTCAGCGTTCCAAGGACT
TCTCTAGAGCTTTTACCTTACTATTCTCGGTTGGTTGCCACATTGTCATC
ATGTATGAAAGATGTCCCTAGTATGCTTCTTGCCATGCTCGAAGAGGAGT
TCAACTTCTTAATAAATAAGAAGGTATGATTATATTTGCTCGTAATTCCT
TCCTTGTGCTCATTGGTGAGTTCCTGTTTCTTACTCATATCAATTTGTCT
TATCTATCTCTAGCCATGATAATATTTATGATTTTGTGTTAATTCTATAA
TCTGAGCTAAGCAACTAATATCAAAATAAACAATGGATCGAACATCTCCA
GAACCTCCCCCACATCCTTTAAATTAGGAGGAACTTGGAGTTTAAATCCA
GGGGGGTAGGATATCCACATTAACTGATGTACTGTGACTAATTATTCTCT
ATGTTCTGTTCTGTTCATTTTCAGGATCAAATCAACATTGAAACAAAAAT
AAAAAACATAAGATTTATTGGGGAGCTGTGCAAATTCAAAATTGCACCTG
CAGCTCTTGTTTTTAGTTGTTTGAAGGTACTGTCTTATACTCTTATGCAT
GAAGTAGTAATTTATATGGTGTTTGCACTTCCACCTGTAGCTTATCTTAT
TGTTTAATTTTGTAGGCCTGTCTAGATGATTTCAGTCATCATAACATTGA
TGTGGCCTGCAACCTTCTTGAGACTTGCGGACGTTTTTTATATCGTTCAC
CTGAAACTACAATTCGCATGGCTAACATGTTGGAGATACTAATGCGATTG
AAAAATGTTAAGAATTTGGATCCACGCCACAGTACACTTGTAGAAAATGC
CTACTACCTTTGTAAACCGCCTGAAAGATCTGCCAGAGTTTCAAAAGTTC
GTCCACCTCTGTATCAAGTAAGATTTCCACTTCAGCTCTGGCCATTTATA
TTTCTCTGATCCTTCTCATTAGACTGCAATTGAAAAATATGCCCTATTTT
TTCTTCCTCTGCAGTACATAAGGAAGTTGCTTTTCTCAGATCTTGACAAA
TCAAGTGTTGAGCATGTCCTTCGCCAGTTACGCAAGCTACCTTGGGCAGA
GTGTCAGCAATACCTTGTAAAGTGCTTTCTAAAGGTTCACAAAGGAAAGT
ACAGTCAAGTTCATCTGATTGCTCTTCTCACTGCTGGCCTTAGTCGTTAT
CACGACGACTTTGCTGTTGCAGTGGTAGATGAGGTTAGTTCCTTCAGTTG
AAGCCTTAAACGAGTCTTTGATTCCAAGAGAAGTTTCTTGATTGCAATAA
TTTATTTCCATGGCGGGCAAAGTTACCCCTTGAGTGATGAGAATGGCTGT
ATTTAGTTTATTCTGGAGCAGGTGCAACCAGCTTGCGTTCAATTGATTTA
ATTTATTTTCTAATTTAATTTAGGTCTTAGAAGAGATAAGGGTTGGGCTG
GAGTTGAATGACTATGCGATGCAACAAAGGCGACTTGCACACATGAGATT
TCTTGGCGAGCTATACAGCTACAAGCATATTGACTCATCAGTTGTATTTG
AGACATTATACCTCATCATTGTCTTTGGTCATGGAACTAATGAAGTAAGC
ACTTAAATCCTTTAGCACGACTAGGAACTTTGTTATCCTTAATTACTTTT
TCGGTGATATTCCTTATCATTGTTGAAATGCTAGCTTCTGTAATGTGATT
TGGATCCTGGCACGTAAAGGCTTATACAATTTCTCACAATAATAGTATTA
GATGTTAATAGAAGTGTTATTTTGAATCATTGGGTTTTGCTGTAAGTTGG
TAACACCCTATGCAGTCACTCTCCATGACATGGCTTTTAGTCCGAGCACC
AAATCAGCACAAAAGTTCCCCAAAACAATTCTGGATGTACTTCTCAAGTT
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CACATAATGAGAAAAAACTGACAAATGATAAAACTAAAGAAGCTAAATGC
TACTATTCACAGCAAACGTTCATCCTTCCCCCTTAACACATTTATATTTG
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TACTCCCTCCGATCCAAAATAAGTGTCGGAGACTTAGTACAAATTATGTA
CTAAACTAGTAGTACTAAATTGCCGATACTTATTATGGATCGGAGGGAGT
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TTTACTTTGTGTTCTTGACTTCTTGCGCATTTTATCTGTAAAAACTGTGC
TATCTTAAATTTACAACTATATAGAACTATCACATTATTTCTTATGCGGG
ATAAGTATCCGCCTCCCAAAAAAACGATGAAAATGAACCTTAATTTCCTC
ACTCTAATGTTTTATAGTACTTATTGCAATCGCATGTCTGAGAATGATTG
TTCATTGTTTCTTTTTTTACTTGCACAGCAAGATGTGTTGGATCCACCAG
AAGACTGCTTCAGGATCAGGTTGATCATAACACTTCTGCAGACTTGTGGC
CATTATTTCACTAGAGGCTCGTCCAAAAGAAAGCTTGACAAGTTCTTGCT
ACATTTTCAAAGATACATTATTATGAAAGGCCCCTTACCACTTGACATAG
AATTTGACATTCAGGTTAGTTTCTTTCTCACTTATCCAATTCCCAATATG
CATAAATACTTCTGTTAGTTCCTTTATCGTGTGAACAGTTTGCCAATGTA
CATAAATACTGATGTGAGTTTTCCATTATAAATGCTGGGCTATAAAGATT
AAGAAATAACTAATACAGATACCGTTAAATTTATTTATATTTCTGATGTT
GGTAGACAAGAATATTCATCTAGTAGGTTCTTTATTCTGATTATATTTGG
TAAAAAAACAGTTGCCTATGAGTCAAATGACTTCACTGTAGCAATAGTAG
CATCCACATTTGTACCCTCCGTTCCAATGAATAAGGCCTATATTTTTTTT
GAAAAATCAAGCTAAGTACGGTTTGACCAAACTTTTAGGAAAAACTATCA
ATAACTATGATATTATATCTAAAAAGTTGGTCAAACTTCATGTAGTTTGA
CTTATTAAAAAAAGAGAGCCTTATTCATTGGAATGGAGGTAGTAATAGTT
AACCAAGGAATTCTGGTGGGCTTCTGAAGATCAGTGGACTTACTAATAGC
CAAATACATTTTTATGGGCATCTGAAGATCCATGGACTTATTCAGGACTT
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CATGAGGTAATTACGCTTGCAGATTAAAACACTTAATAGAACAGAAAACA
GCAACACTGAACTAGCGATGGCATGATGCCAGGTTCTCGCAGTATCATCC
TTCTGAAGATGAAGACCTGACGACACCCACTGCTTCTCCATGTTAAGGAC
AAGATGTTTGAGCTTGCTGACCACCAACTTTTATTCTGAAGTGCTACCTC
CAAGTTACCTTGTAGAAAACTATAACAATGCAAGCATGTATCAAACAACC
TCCAGAATTAACATGTGATGTTTCTTTTTAAACAATATCCTATTTCATGC
TACATATGATCTTTTTTGCACCCAGGAAGCAAATATCCGAACCAGGGTAC
CAGGTCGGTTTCCTGACCTAATGCTCCACAATTTTTTTACTGCTAGATGC
TATTAGAACTTAAGTGCAATAGGTAAAAGGGGAGAGAAGTATATGGTGTC
GAGCCTCAACTTTTGTAGTGGCAGCAAGGAATCTCCCAAAGTAAACACTA
TACAAATGAGCAATCCAATATCTTAGATCAACATATTTTTGTTGTTGTCT
GCTAATAATGTTGTTGCGATGAACCCTGTTTTATTGCTGTTATTTTATCT
TACGGAGGCCAAAGACAAGTCAACATGATAGTTCTGTAGTTTTGATTCCA
TAGCTTTGCTTGCACATTTTCTTCAGCGTGCTCATCCATATGTTCTTTCA
GGATTTGTTTGCTGATCTACGACCAAACATGACCAGATATTCATCAATGG
ATGAAGTTAACTCTGCATTAGCTGAGCTCGAAGAACACGAACTTGCAGCC
TCAGTAGAGAAGCCTGAAAGCGAAAGGCACTCAGACAACGAATCTCAGAA
AAAGCAGCCACATGATGGTGCTTCTAATGGCAAGGGTTCAGCGAATGGAG
CTGAGGGAAATGGAAAGGATCACGGAGAAGGCGCAGATAGTGAGAGTTAT
TCAGATAGTGGCAGCATTGATGGCCGTGAAGATGAGGAAGATCTTCTGTC
TGATGAGAAATCAAATGATGCATCAGAGAACGAAGGTGACGATGAGGACG
ATGGGATGGCTGTTGGTTCTGATGAAGATGAGGGTGTTGAGGTTAGACAA
AAGGTCGTTCAGATTGATCTTAAGGAGCAAGAAGACTTTGACCGTGAGCT
GAAAGCCCTTCTACATGAGAGCCTGGAGTCACGTAAGTCAGAGGTGCGTT
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TCGAAGGACCCAAGAGCTACAGAGTCGGAGAGTGGAGAGGAAACTGTGGA
TGAAGAGGGTGGTAATGCTGGTGGTGGCAGCAAGGTACGTGTTAAGGTCC
TAATGAAGAAAGGGCACAAACAACAGACAAGGCAGATGTTTATCCCCAGC
GACTCTGCCCTTGTACAGAGCACAAAGCAGCAAGAGGCTGCCGAGCTTGA
GGAGAAGCAGAACATCAAGCGGAGGATCCTCGAATACAATGAGAGGGAGG
AAGAGGAAATGAACGGCGGGTCGTCACAAATGGGGAACTGGGGCCAAGGA
GGGAGCAATACTGGCAGCAGTATTAGATCAGGTGGGCGGGGCAACTGGGA
TGGCTGGATCAGGGGAGGTGCTCGACGCCACCACGCTGCCGGTGGTTTCT
ATCAAGGATATGGTAGGAGAAGATGAATAGCGACGTGAATGCTAGTTTGC
CCTGAGGTTTTTGACAGGGGCAATGCTATCCAACTCCTAATGGAGAAAAG
GATGCCTTGAAGGTGTTTGACAGGAGGACAGGAGGTAAACATGGACGATA
GAAACACTTTCCACCTCTGAATACAAGTGTTGCGTCAGTTATAGTGCCGA
CCCCACATGACAATAAGAGAACACCAGCATCAACGATGGGATAAGACCTT
CTCTGAAGTGGGCTATTTTTGTGCTGAAGTTCTTCAGGAGCACATTGGTC
TGGTTGTGAATGTGTACATAAGCTTTTCTTTCATTCCTCGAGTGCTTCGG
CTGTAAACTTAGCTAGCGTGCATTTTTACCTTACCTGAATGTTGATATGA
TGCTGCTATTTACAAATCTTCCGTGTGCCACTAAATGTTGCTTGGATGCC
ATGCAACTCTGTAAACAACAGATGTAAAAATAAACACGTCTGTAACCGGT
GCCCATGCTCATTTTCAGTCTTGATACGGAGAATAACTGCTATCCTAGGA
TTGTTCTGAAACAGTGAATA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.