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GrainGenes Sequence Report: AE004560

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Sequence
AE004560
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE004560
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCACCTACCCATCCCAAATCGCGGATCCCAAGCTCCCACCCCCCTCG
GCCGGCCGGCGCCGGCGCCCCGGCCACCACCGTCCTCCTCACCTCCCCGC
CACGCCTGCGCCGTCCCACACCATCATCTCCCCGCTACCTCGCCCCCGCC
GTCCCATCCCCCAGCCGACGCCACCGCAGCCTGCACACGCCGGAAGATCC
ACAGGGGAGGAATAAAAATTCGATCTTCTCCTGCCACAGCTGGGTTTCCT
CCGCAACCACGTCAAGCCGCTCGAGATCTGGCAGTTCTAGACCGGCGAGG
CGCTGCTCCCCAACCACTTCAAGCCGGTCCGGACCTGGCAGTTCTACATC
GGCGAGGAGCTGTTCAGTCGACCTGTGGTGAGTTCTACCTTCTGTGCCAT
CCTTCTTCGGATATGGAAGCGGTAGGGTATGTAGTACCCGCAGATTTACA
GCAAGTGTTAGGAAATAGACTGTTTAGCATGTCTTTGTGGATGCTCAGTT
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TTGCCTTCATTATGTAACTCTTACTAAATATAAGCATTGCAGTGCAAGTA
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GGCGAGTCTGTGCTCGAAGATTCCGGTAAAGTTTCTTCAGATGTCTGGTC
CTAGCCACGAGCCCGCACCAACCACCCCATCTCACACGCGAGATGCGGTC
TCTCCCATCCCCCGCGGATCCCAAGCTTCCCCCTCTCCGCCGGCGCTGTC
GCCCTGGCAGCTCCTGCCTCCCTCGGCGAGGAGCTGTCCGGGAATCTCGA
GCGGCGCAACCGTGCTGGCCTGGTCAGCCATCGTCCGGCGGTGAGTTCCA
TACCATCCTTTTTACGATCTGCATGTCGTAGCGTATGTACTAGTCGCGGA
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ACGGTTTATCCAGTTATACTACCAGTTCTTGATGTATGCTATCTTCTAGC
ATGTGGATGCTCTTTGGTGCAGTTCCTAATTCATGGATATTTTATATGTC
ATTTGCAGCCAGGGAATCTGCTTGTTGACGAGTCTCTTCTTAATAGGAGG
ATTATGATGTAATGGAACAAACCTAACATTTCAGGTACATCCCATTGGAG
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GCCACATGAATGTGCACCTGTTACTCATTTATCAATTATCATTGTGTTGT
AGTCAATTCTGGGAGGGTAGGAGAAGATGAAGCAATAAGATGCTTCCACG
AACTTTTGGATGCAGTTGATCATCGTCATATTCGTGGAGTGTACCATAGA
GTCTGAAGGTTTATCCAGTTATCTGCCCAGTTCCTGATGTATTTTACCTT
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TGTGTATCTCTTGTTCCGTTCTTTACTTACTTACCTACTGTTGCTTTATG
ATGTGTGTCTCTACCTTTACAATCCAATTTTTGCTGTAAGTGTATGCATA
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AAGGCTACTGTCTTGCACTCCGGAAATGAGAAGTAGCGAATTTGCTGTTC
ACACCATTTCTTCTTACATTTCAAGAACTTATATGCAATAGCAAATGGAC
ATTAGTGAAAACATTTTTTTTACTACCAATTCATTTTTCATCACTTCTAT
GAAATGCAACATCATACACTTTTCACTGTAATCAAGCCTTAGAGTAAGAA
GCCTGCACGAGAGGAGCAGTTGATCAATATACCACAGTTATTAGTTCCAA
CTCATATCTTTATTGATGCACTGTTCTTTTATTGTCCTTGTCAAGAAGGC
ATTAGTTTTTATACTTGTGCGCAAAAAATAAAATAATGCTCTTACTAATC
CTGTAGTGTCACAAAGTTTATCCCTGACAGTATGTAACCTGCTTTCACAT
ATATGACTTCAGTACTGAAGAATAGAATCTAAAATATGCCAAGTGCATTA
GATAGTCTGTCAGTTGTTTTTCATGTTGCATTATGAACATAAATGGTAAT
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ACCTGGATATACTGCAGGGTCTATCTCGCTCGCTTGCTAATTCTGAAACA
GACCTTACATAGGTGGAGATAGTGCTGCTCCTGCTATTGCTAGAATGATA
ACGGTGCAACCTCAGTCAATTCCTCTCAACCAGGTTTGCACTATAGTGCA
CATAATATCCTTGAACAGCTTCAGGTTTCAGACTTTAAAGTGCCTATCTA
ATGCTTGGTTGCAATGATACATCTCTTTCTTAGGTTATTCCACTGTTTAT
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GTTGCTTTATGCAATTTGTTACTCTCATCGCATCCTCAGGTGACTTGATC
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CTCTAAGGCCAAACCTAATATTTTCTTGTTGTAGATCCTTGCTTTATGCA
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GGCGGGTCCGTGCTTGAAGATCCCGGTGAAGTTTCTTGAGACGTCTGGTC
CTTAAATCTCCCAAGGTATTTGACCGGTTCCATGGACTTTGCCTTCACTA
TGTAACTATTACTAAATATAAGCATTGGAGCGCAAGTAACCTTGTTCAAG
TCTAATGCCAAACCTAACATTTTGTTGTCGCAGATCCTTACCGTATGCAG
GCCCTGCTCATCGCTACATCTCCTGTGGTATACAATTAGGTGAGTCTGTG
CTTGAAGATCCCGGTAAAGTTTCTTCAGACGTCTGGTCCTTAATTTTATA
TATAATCACGAGTATTGGATTATTGTATGACCATATAATCTGCCCTTACT
TTAGCATTTTGCAATATTAGTCAACTGTTTTGGCTTTTTATAACGACAAT
GTCTTCATTCTGAGCCTTCATACAGTACACTGGTTTCTATTTCAGATTCT
ATGTTAGTACAAGGATACGATATTTAGCATGTACTTCCTCTGTTTCTAAA
TATAAGACGTTGTGACAGTTCAATTTGAGCTGCCAAAACTTCTTATATTT
AGAAACGGAGGGAGTACTTTGTGTAGATTTGTAATGCTGCCTTAAGTTTG
AATGTTAAGTCCCTCAGATGATTAAGGATGCACAACCAATTTTGTTTGTT
GCTGCAAACATACCTTGCTGTCATATAGACAATATCGAAAGGATATTCCT
GAAAGTACTTTTCATAATATCGTTAGATACATGTACTGATGTACAGTATC
TGGTTCTGTATTTCCTTATATTAAAGAATTTATGTGGTTTTAGGATATAT
TCATCGGCACACAAGATGACGCAACACATCGTTTTTTCAAACACCCATTT
CAAGTATTGCATCTTCGGGGGAAACGTCACCACTGGGTGAAATAGAAGGT
TATCCCTGTTTCAATGGTCTATAGCTTATCCATTATAATAGATAATTCTG
TTGGTCAGTGCTGCTTCTATTGAATGTGAATGGTTTTAATTTCTTTACCA
AGTTTTGAGCCAAGTTCCCTGTTTAAGGGCTGAAACAGATTAGGTTGCCC
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CTTGGCAAAAATGTTTGTATGATTTGGCTAAAATTTTAAAACGAGTGGAT
TACCTTGACTTTTTTAATCATACGTAATTCATTATCACTTACTGGTAGTG
CTCCTTGTACGAGTTGATCTAACATCAAGGATACAAGTAGTATTCTTGGC
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CACCATACTTTTTGTAAAATGTATTTTTGAATGCAGACAGCCATTATTTG
TTTGTTGCTATGAAGCATGGACATACCATGCTGCCATTTATAGACAGGAT
ATTCCTGAAATTATTGTCCGTCAAGTTCGTTAGATACATGTATGAAATCT
GGTCCTTTGTTTCTTGATATTGAAGAATTTATGTACTTGTAGGATGGATT
CATGAGCACACGAAATGAGGAAATATGTCGATTTTTGGAACACACTTCAG
TTCAAGTATATGTTAGTCCAATATATGCTGGGAAACGTCACGGCTGTGAA
TCCGCAGGTCATCTCTCTCACTGATACACTTTATCCATTATAATTGTTGA
ATCTTTTCTAGTCGCTGAAAATATAATGGTTGCTGCATGTATTGAATTTA
AATTTCTTTAATTTCTCTACCAAGGATCATGATGTATTATGACTCTGGTG
TTATGTAGATCTAAATAGTCTCACCATTTGGCCAGTAACATAAAAATACA
TACATAACAGATTGCAATAATACTATGTTTTATCAAGTCACCTTATATTG
CAGTGTAGTAATTCAATAGTGCCACTTATTGAGCATATACAAATCTTGAA
AACCACGAAACATGAAGACATCTGTTCTCATCATCCAATTGTTTATAGCC
GGTCCTCAGGTTATATGTGCGTTGCATCATATCTAGTCATTATAATGTGC
ATATCACTTGTTCGTTGCCTTACTGGATCTACAGTTGTGCATGCAAAGAT
ATCTCATTTGCTTTGTTAAATCTTGCAGCCGTTGTTATTGCCTACTGATT
GAGCTTTTCTGTATTTACAGGTTGGGGCATCTAGGCATGCTCTATTCTGG
ACTTTTAAATGCACATGGAGGATTATCGCAATCTAAACTTTGCAGTATGG
AGGATTCTTGTTACTGCAAGCTAAATTTTGCTGTAAGTGTCTGCTTCCTG
CCATCATATTACAGCTGGAGTCTTTGCTTGAGAAGAGTGATCCTCCTGTG
ACCACTTTGCTTTTACTGCATCTGGGCGTTGTGTTTTTTAACATGTAGGA
TCTTGTAATTCCTGGGCGTTGGGTTAGATCGAACCGATCCTATTAAAAAA
ATTTGTTTAGAGAAATTGGTGGTGATGGATCGTTTCCTGGAATATCTGCA
GTTTGTTGCATTGGGTTGTTTGATGTAGAGAAGATTGTACATTTTAGTGG
CATTCCTTGGTTCTGCATTAGTAAATCCATGTATTGAATTTGGAATGTTT
GTAAGGCCAGTAAAATAACATGTGTAGCATTACAAAATTCCAACCTTTCA
TTCCAGTTAAGCAATCTTTTAGTACCGCTCTTTGACATATATATTGGAAT
CTTGAAAAAAACCCAGGAGCTATGTATGATTCATTCATCATAAAATTCTT
CATAGTTGGCACTCGTTTTATTATGCTCTGCATTATCTATCTATTATCTA
GTATGTCCTTGCTTTGCTGTTGCTGTGCAAGTAGTTGTAGATATCTGGAT
AATGCTCTAATCCTATATACTCTTGTCTAGTAGTAGTACATGCATACTGT
TGATTAAACTTGGTCCTCATTTTAAACTTGGTGTCTGGTAGTTACTTGAA
AAAAGAAAAAAGTATTGTCTAGTAGTTGTAGTACCTGGCAATGCATGTTT
AGTAGAGCATGGTGGAACCTGTAGCATGATGTCGACTAAACACAGTGGAT
GGTCATGCTCCGTGGTGTAGTAGGAGTAGGAGTAGGAGTACTGGAGTAGG
GTAAAATATTGCATACTCTTGTCAGAGCATGGTGCTGCTGCTGCTGCCAC
TGTTGGAGCAGTGTAGGTTTTTACTGCATTGGAGTAAAATGAGTGTGAAG
ATAATACTTGTATTTTAGTGGCATTGGATTCTCTCTGTGAGAAGTTTGAA
GATTCTGACTTGAGATTTTTTTACTGCATGCAGGTGGTGGGCGTTGGATT
CTTTGAAGTGGCAGGATAGGAGTACTAGTTCTTTACTGCTGCTACTAGTA
CTCCATCCACAGTAGTACTAGTAGCAGAGGCCTTGCTGGGCCCGTGGGAT
GAATGAATATTAAATGAAGCAAATGGAGACGCGTGCGCCGCGCATGCCGG
AGTCACGGGTTTGACTGACGCCTCCACCTTCTTCCTTCCCCTCACCCACC
ACCTAGCAGTCAGTTAGTTCTTCCCACTCCCCCACTCGGCCACCCAGAAT
CTTCTTCTTCTACACACCAGAAAGCTCGTCGGCGACCTCAAGGCCATTGA
AACATCAGGACGAGCTTGAAGCAGGTCCAAGGTTCCATTCCATGGCGACA
TCTCCATTCGCCCAGCAGATGAAACCTTCAAGGCCTGGCCGGCGACGTCG
TCCTGCAAGCGGTACGTATTTCTTCTATCCCTCCTTCCAAAATACGTACA
TCTGGCTGTCTATAATTCTTCCCCTAACGGCTTTTCCCCCCTTCCCCACT
TTCTGTCTTTCTACACAGATGAACTAAGATGCACGCTGACAGGTGCTAAA
ATACTACTACTCATATTGTCCTTGGATCTTTCTGTATCTGACATGGTGCT
GGATATCACTGATATTGTGCTGTATTTCTATAGATATGGCAGTTTGATAA
CAAACAAATCTAGCAAAGCCTGACAGTTTGATTTATATCCAGATTGATTA
CTTCCACGTGTATGCGTTCAACAGTTTAGGATCTTTTGTTCTTGATATCT
TGTACTATTTCTGTCAGTTTGGCTGACTGCAAAGCCATCTAGCCTCAACA
ACTTGTGACGATTCCATGATAGTACTGTTTCTTGCACCAGTTTAACTTTA
AAGTTAACCTGCCCTACTAATCTGTAACTGTCAAAGCATCTAACCAATGT
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AGTCGGCGAATTGGCAGGGCAACCATGCCGGACCTGTGAAGAAAACGCCT
AGGGAAAGGGATGAGGAGCTCAAAGAAAAACTACGTAAAAGTGGCCGAGT
CAATCCAAACGTAAGATTTTCCTTTACTGGAATATTGTCATCTTGTGCTA
CTCTTACTTTCTCTGCACTGACCTGGCGGTGTTAAGTAGTATTGTTACTT
ATTATCGCTACTTACTAGAATCTAAATGAATAGGATCTGTAGCATCCTTA
TTGACGTGTACCTTCTGATAACATTATAGGAGCTACTCTCGTATATTTAC
CCTGACGGCATGTTAGGGCAGCGACCGGAAGTTGACTCCTTCAATGCAAT
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TCTAGTCATCATATGCCTAATTTGGAACCATATATTTCATTCTTTATTGA
TATTTTGTTCTTGTGTTATGCTCTTATGAAGGATGCTTGACCTGAAACTG
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GTGATGGAGCCCACCGCTACGTAAGGATTCCTGAAGTGCTGGTGCAGGAT
GTGCAATTGATTGCATAGGTGTGTTTTAGTTTTCTTCAAATCTTCACTCT
ACAATTTAATTTTGTAGAGGTTTTGATGAACCTGCAGACACATTTTTTTC
TATTCCCTAAAATGAATCGGTGCTAAGTATTATTTTCTGCAGCCACCACT
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GCTTTACCTTAGTCATGTTGAATCCTTAACCACCATTTTTTGTAGCTTGA
ACTGAACCAATGTTTAAGTACTACCTCTGATCCATATTAGTTAAGTATCT
AGACAAAGTTGAGTCAATTAATTTTGATCGGAGGGAGTATTATTTTGTTC
TGCGATTACTTTTAAAGTTTTTTGTAAGAATTCCCCGAGTTTCAAACAGA
ATAGCAAAGCCGAGTTGAATGGTTTTCATGTTATAAATTGATTGTTCTTT
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TGTACACTGCCTTCTTCGTTATGCTGAGTTTTACCATTTTTAATTGCAGG
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TTTTCTTCATATGCTTGTTGATTGCTTACTTCCTGGGATCTCGTCTCTTC
CTGGTCTGGGCATGCGAATCTGATCTTTCCAGGCTTGTATATAAAAAGTT
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TTGATTCGTGATATTAACAGTGGTAGTCTTTATCTCTTGTTGCAGTGTTC
ATCTTGCTGTAATGTACATTCTTGTGAACGATGGCTCTGGAATAGAGATG
CACGTTGTTGGTTTTTTTGGCCTGTTTGTGGCGTAGAATTCATTTCTAAA
TGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.