Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE001399

[Submit comment/correction]

Sequence	AE001399
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE001399
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ACCGCTCCCTCCCACCGCTCGCCCGCCGATCGCTGGCTTGGCTTCCAACG CACGCGGCATCTGAATCCGCACACGATCCCCGCGCCACTTGTCCCCGCGG GCATCCGTCTCGGTCCCCTCCCTCCCGCCCGTCCGCCCGCCCGCCGGCCA ATGCCCGCCCTCCGGTGAGATGGAGCCGCCGCGCGGCGGTGCTCCCCCCA CCATCTCGGGTTCGCCCCACTCCCGCATTTATTCCCTCACGCCAACAACG TCCCGTCGTCCTCATCCGCACTCCCGCCCGCGCCCCTCCTCCCTCTCCTC CTCGCCTATTTAAAGGAGGGGCGATATGCTCTCCAGGAGGCCGCTCGCCG CCGCGCTACGCCTCGCGCCCCTCTCGCCTCCCCTCCTCCTCTTCCTCGCC TCCTCCTCCTCATCGTCGTCGTGCTACCCCGCCGCTTCGGCTCCGGCTTC GAGCCCTAGAGGTGCGCGCTCACTGAACATTCGCAATTCGGGGCCGTTTT GTTCGCGGTGGAATGCTTAATTCTCCGGATTTCTAGCGACGTCTGCAATT CCGTAGTTATGAGAGTGGCGGTTTTGATCCTAGGGCAACATAGTTCGAGC TCCCGTTCACGGGCGAATGGTGAAGTTGATTGTGCATGTTTTTTTCTCTG TTCTGCTTAGAGTTGGTGCTTGCTATAACGAATTTCCTGGCTCGTATCCG TTTACTATGAGGTTCCTTTTGGCCTTTGTGCTGGGTTCCTATGGGTTGAT CGGAGCTTTTTTGCTGAATTGACGATGGCACGGGGAGACTGAATTTCGTT TGAATTTGGATGTGTCATTCAGTTCGCATCTCGTTCCTGATTATGGTAGT CCAAATGTGCATTTTTGTTTGAATTGTCCAAATGTGCATTTTCGATGAAC GTGTGGTCAGTATTCACCGTTTTTCGTCGATCACACTTGGATTTTCGCCG ACTTTGGTTAAATTCCTGACCGAGACACCAAGTTTTGCCACTTTTTATCA GTGTAACCTCCTAACTGTACTTTGCGACATGCTCTCACTGGTCTATTCAC CTCATACCAGGCTGCAGCGCTGTAAGGATGGATACTGGTGCTGTGGAACC AGCCTCAACGGGGAAAATCTGGTCAACGCCCTCAGCGGAGCCAGGAAGCA TTTCGATTGGGAAGCAGATATTCTGTAACAGGTCACTCAACATGAGGAAC ATCACAGCTGTAGGATTTGATATGGACTACACTCTGGCGCAGTACAAGCC CGAGACATTTGAGGCTCTTGCTTACCATGGCACCATCGAGAAGCTTGTGA AGGATCTCAACTACCCTGAGGAGGTTAGTTGCACTGGTACCTGCAAATCT GTTGATGTGTAAACACCAAGTGACCGGAGTTTGTGCTTTACTACTAGATT GACTGTTTTAGAGTTTAGGAGCAACTGTGCCAGGTCTTTCATTGTCAACT GCACACAACAACACAAGAGCCTTGATAGCAAATTGGCAATAGTTACTTCT CCTGTCTGATGTCATTTTAGATTCCGTGCAAAGACTTATGGTTTGCACCT GTATCCGTCCATGCTTTGGAGTTATGCGTAAAGCCATGATTTTTTTTCGA TGATATACAGCCCTGAATTTTTGTCTGCTCTTTACTAAAGCATGTTGTAG GAATTATTGCTGTTAATTTTAGGGGGTATACAAAGGCTGCTGCATTAACG TAGTAGCAGAAGGATCGTACTATCAAAATGAACGCCTGATTGTTTAGCAA GTGCCAACTGTTTGCTAGAAAGGATATTTTAGGTTGTCTTTGTAACTACA TTGTGATTGATTCATGAACCTAGTATTATTTTGCTTTGCTAGTTTCATTC TGAATGGATTTAACTTTGTTTCATCTTGCAGCTGTTAACATGGCAGTTTG ACTGGAAATATATGGTCAGAGGACTAGTTCTTGATAAGAAGAGAGGAAAT ATCTTGAAGGTCAGCTATAGTTGCTTGAACTCACTGCACTTTTTTGATGG AAAATTAAATCACATCCTTTACTTAGAAACAACACCACAGCAGCAGTTAA TTCAGGATGATCTGAATTGATCAAAGCAAGAATAGGATGAAGGAAACCCA TGGGGGACGACACGGAACCTTTTGTATTTAGTAGCAACAAGGGGTCATGC ACACAATTTTTTACAAAATCAGAATTCCTCGTGTTTATATTGATATCTGG AACCTTCTGTTTGTGCTTGAAATATTTTAACTTTAAAGTTAAAGACTTAA AGTATCTTGAAAGTTTGCTTGATAATAGGCAACGGCACAATTAGGCCTTG CACAAAATTTATTGTTCACTTTATTCACCACTACTTTGCCTCTTGCCTTT TCTTGATATCCTTTATGCTGGAAAATATTTACATGTATATTTGCTACTGC TTGTTCAATTTGTTTTAATATTCGTCAGATCAGGTTAGCTGCCATTTTAA GCATTTTCTTATGCAATATCAGATGGATCGGCACAAGTATGTAAAAGTTG CATACCATGGATTTAGGGAGATGTCGAAGGAAGAAAAAGTTGCTGCCTAC GGGAGTACATTGATAAGGGATTCCTTTGATGAACCTGATTATGCCCTTAT AGACACTCTATTCTCACTGGGTGAAGCCTATCTATTTGCTCAGCTTGTGG ACTTCATGGACAGCAATCCTGGAAAAGTACCTTCAGGCACTGAGTATGAT CATTCTGATCCATACATGTTTATGATACCAAATGCATTTGATTTTCTCAC ATCTGATTTGAATATTACTGGAGCAAGGCAAATGTGTTTGCATATTGGCA AACCTTTTTGCTATATGAATATATGTTTGTTCATGGTAGCAGTTAATACT TAATTCAGATCTGGAACCTGATAGACTTGCACTTATGTGAGATACGGTTT AAGGGAGCAGAGTTGGAAAGTGCCCTTATAATCATTGAAAATGCAGATTT GGAATGGATACTTAATAAACTTGGATGAAGTTAGTAGTTTTTACAAAGTT AAGTAAGATATGCTCTCAGAAACAAAATAACCAATATGCAGCCACTTTAC AGTATTCTCAGAACTAGTGGTGCATAGTGTTAGAGCACAGATTTGTGGTT CAAGACCTTGTTTTCCTTTGCCAAAATTCACACACAAATCCTCTTTGGTG CTAAGCCCTTGTCTACTAGTGAGTTCCCAATAAGGTTCTGGAATTGTTTG CAAACTGTTCCATGGGCAACTCTTTCCAAATCTAAGACCTATTTCATAAT ATGCTATGTTTCTGTAGGCTCTAAAGCTTATAATTGTATTTATGACTCGA GTTGCCTAACCTTTTCATTTTTGATATGAGGCCAAAAGTTAAAAATGTGT GTGCGCATGATCAATGTCTTCCACCATCACAGAACATCAGCATTAGCATG TGAACAAATGGATGATATTGAATTATTTTGTTGTTTAGTGTAACCAAACT GAAATCACCTTTTTCTCCAAGACTGATATATTTAAAATCTGTACACAAAA TTTTATCCCGTAAATATTATTTTGTATCATTCATTTGACTTGTACTGAGA TGCCAATATACTTATTAGCTTGTATTGTTTTATTGCTACAGTTATGCGCT TATGTACAGAGATGTGAGGTCTGCGGTTGACTTGTGCCATCGTGATGGAA CTTTAAAACGAATGGTTGCAAAGGAACCTAGCAGGTAATTCAGTTTTCCT TTAATCTTACACAACAATGTACTGGTTGTTCTGCCACATAGTGATTTGGT TTGGTCTTCTGCTTTTCATTTGTCCATGTGTCTATAGACACACATGCATT TCTTCCAATATTTAGGTTATAAGCAGCTATATGCTCTTATTCTTACTGGC ACTGCTAATTTGTGTATTCAAACTTGCAGGTATATTAATGAGGACTTGGC AATTGTGCCAATGCTTGAAATGCTAAGAAGATCAGGACGCTCAACATTCT TGGTAACAAATAGGTATGTTCTTTGTATCTTCGGGCTTCTTGAGATACTT ATGTGCTAAATGCTGAGTCAAACACAATGGGCGTTTATTTTCCCTTAATC GTAGCAGTTCAGGAAAACTATCTAGTGGGGTTATTTTCTCATCTTGCTGC ATTCCACATTTTTGAGCTTTAAGTTTCTATCTCTTACTATTGGGATATAT GCTTGTGTATGCAGCTTGTGGGACTACACTGATGTTGTCATGAACTACCT ATGTGGGCCGTATATATCGGATTTGGGCTCAAGTCACAAACAGAAGTGGC TTGAGTATTTTGATGTTGTTATAACAGGCAGGTCGGCATCTTTTGTTGCC TTTTCATCATTAATCTATGATTAAGTATCTGCTTTCCCAACTCAAACATT TCCTTTCTTACTTTTCAGTTCAAAGCCAAGTTTTTTTCATGATGATAATC GAGCAGGACTGTTCGAAGTTGAACCTCATTCTGGAAAACTTCTAAATGCT GATCTTCAGGCCAGTGAAGTTGTTTTAATGTCTAATCCATCTCTATGATC CATATTTTACAATGTGTGTTGTGCTTTCTGAAGGTTGGAAGCCCAAGATC AAGCCAACCTCAGCCAAAACCAATTCGCAAAGTTTACCAGGTACTTATTA ATATGACAGGTGTATGTAGGAATGATGACCATAAACTGTCTTCCTTTTTT TTAGAAAGGTATATACTGTCTTCCTAGATGTGGGTAAAACTCTAGGAGTT AAACATACCATCTTCCTTCTTACTCTTTAATAGTGCAAATGACTATGCTT GCATTTCATGGATTTAGTTGTAATCATTGTGCGTATGCTCTATCTATCTC TAATAAGTGAATAAATTGTTTTACAGGGAGGCAATGTTGGTCATCTTCAT AGATTACTTTCTGTTGCTTCTAGTTCACAGGTATCTTTCTGTACTTATTA TACAACCCATTGCAGTATGCATGTTAACTTTCTCTATGTATTTGTGGCTG GTTGCAAGGAGTTTCCTGTTTAGTTGGAATGCCATCTTATAGGGCACATT AATCAAATCAAATAATGCAACATCTTACCATAATACAGATCCTATATGTT GGCGATCACATATATGGAGATATACTGCGAAGCAAGAAAGTCCTAGGTAT GTGTTCTTCATTCTCTAATGTTAAGTGATCTTGAAATCGACACCTGCTGT AAAATCGATTCAGTTTGGTACTTTTGACTGAGTGGATGATTTAGGGGTGT CTAGTCTTCTGCTAGCTAGCTGTACATGTAAATCTTAACTTACATGTTTG ATCTATTGAAGTAACTATATTGTATACTGTTCAATGAGTCCTATGTGCTT TATTTCTATTTGTTTTCATGCTTCGCCAATTCATGTTACCTATCTTATTC ATGTCCTCTAGGTTGCAATTGATGATTCAGTTCAGCATTTTATTTTCCAT TTCTCAAATGATTACGTGCTGTGATTATTTAAAAGGTTGGCGGACTATGC TGGTAATACCTGAGCTGGAGCAAGAGGTGAAGCTTCTTTCCGAATCAAAG TCTACTCGAAAGGTATACAGTTATTACACAGTTGCTGATCATTTTTTGAT GAAATTGTAAGGAGGCCTCCAAATTAAATACTCAGTTATTGATCCTGAAA ATGAATCTTAACAATGAAACTTATTAACTGCGCGCAAGCTGATGGCTCTT TTTATCATGCCACCCTATGCAGGAGCTTAGACGACTTAGGATGGAGCGTG ATTCGATTGAAGACAGAATCCATCGCCTTGAATGGTCTCTTCAGTAAGTA AATAAAGCCTCCCACTTGAGCTTCCTGAGTTTTTGTATTGTTCTGCCTTT TGAGTTGCCGACTTGTACTTTAGATTCTTTATTCAGCCTTTAAGGGTGAA CTTAAATACTTCATTATTGAAAAGAAGTTTCCATGAATGTTTTTGTATCC TTGTTACATCTTTATGTGTATGGATCAAACAATTAATGGATGCAACTCAT TATATAAGCATACAGAAAATAGCGCAACTAGAAGAACCAATTAAAAAAAG TACAACTGCATTTATTTTGACATTTGAGACTACTTTACCCTTTAATAGTC TTGCAAACGTGTTTACTAGGATGATGATTCTGTATTGAATGCAAACATGG TATGCTGGGACATTCCTTTGTAGGCCTACATATGATGCCTAGGTTATAGT AGGAGCTGACTAAAAGAATATGATTACCAGAACGTATTCTCATGCATGCT AACTGGCAGCGTCCATTAGCAAAAGAGACAGCAAAAATTCTTTAAAAATA ACTACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGACTTTACTTTGTCTAGATTCGTA TGTATCTAGTCTCAAAACAAGTCTACATACATATGAATCTAGACAAAGTG AAGTCACTTATTTTGGGCCTTTTGATAGTAGTTTACTTTGTCTAGACAAG TATAAAAAATAATGCATCTTAACAAAAATTCTTTGTGCCTTTTGATGCTA TCTTCATAGTAGTTTTCTTGGTAGTTCTCTATGTTTCTCTTTTGCTCTGT GAATCACTACGTCTAACCTCTTCATGTTGCCCAGATTTGAAAATCTTGCA GAAAATGAGAAGGAAAAGTTGTTATCTGAGCATGCCAATCTACTGGTATG TCCTTGTTTTGAGTTAGTCCTTAGTCATCTTGGTTGATGGGTATCTGAGA GAAATTACTACGTCCGTTGTTCTGAGTTATGTGTTGGTGTGTCGGAGAGA AAATATTCTCTCCATTTCTTTTTGCAGAGCGTGTTTTGATTTGTCAAGAT CGGGCTTTGGCCAACAAATATTCAGTTCTGCAATTTTGTATAACATAAAA TTGATATGTTAGATTCGTATTCAAAAGAGCTTATGGTTGTCATTATCACA TAAACAACATATTAGCAACACAATTCCTGGTCAAAGTCTTGCCTTGACCA ATCAAAATACACCTGACAACAAGAAACCTAGGAGCTAGTCTTCTTGCATG AAGAAAAATGGTACTGTAACATCTTTTTCCTCGAAAAATGGTACCGTAGC ATGTACTACTGTGCCATTTCATGGTTGACCAATAGAACAGTACCTCTGGA CTGGAAAAAGCGTAAGATTGACATACATTTTTTTAATGAGAAAACGCAAC TGTTTTGTGTTCATATGCATTGATAGAAGAAAAAACTATCACGAGAATGC AGTATCAACTCCTAGATGGCTTGTTTTCATCAGTAAGAGCAATTTTTTGG GGCTTTGTAACTCATGATTATTTTTTCTTCTGATTGCAGCAAAAGCTGAA GGGTATCCGCTGCGTTCTCCGAGATGCTCAGCTGCAACATCATCAGAAGG TAATTCATAACTACGAGGCGCCATTGATCATTTTGTATCATAGTTAAGGA AAAATCAGGGACGTATCATACTCAAGTCATCATAACTATCCCTTGAGAAA AATAATTATATCATAACTGTGTATATCTATAGCTTCCCCTTCTAATTGAG TACTATTTGTTTGCGACCAGTTTCACAAGGTGTGGGGGCAGCTTATGAAG ACTGGATACCAAAATTCTCGTTTTGCTCATCAGGTGCAATACTGTTTTAC CTGCAAAAAAAAGTTATGGACAGTTATGTTTTAGCAGTAAGTTGAAATGT TCTGCCTCTGCATGTCCACAGGTTGAGAGATTTGCGTGCTTATACTGCAG CCAAGTTACAAACTTCGGTTTATATTCTCCCAACAAGTATTACCGCCCAA GCGAAGATTACATGCCCCATGAGTTCGATGTGCTTGGCCTGTAGGAACTA ATTTATGCTCATGTTGAATCAAAGTTCTCCTTGGAAGTCTCGGCTGCAGC AAGATATGAGCATGATTTTAGCGTGACACTGAATAACAATCTAGTATCCT ATATTTCCACCTTATACAAAGGATGAGGTTACCTGGTGAAACTTCACCCA TTTTACTATAGTTGCTCATAGAAAGTTTACATGTTTCCCTTTTTGTACAT AACATGTCTTAACAGAGGGTGAATGAAAGTAATGTTGAATGTCGATCATA TCCTAGTTTTTAAGTGAACAATATATAGTGGTTACACCGGCTGGTAATGC TCAGCTGGATTGATGTGGAATCAATTGCATCGAGGTGGTGTGTAGCATTT GATAATATCCCGACAACAGTCCTGCCTGACAAAACA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.