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GrainGenes Sequence Report: AE007520

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Sequence
AE007520
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE007520
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGACACAAGCAGACATATAGCCAGTGCCATCCCGCACACACCCACCCACC
CACGGAGCATTTCAACCAACGCTACCATGAATGAGAGAGTGAAAAGAATA
CATATCGTTTTATAAACAGATAGAGCTAGAGAGACGCGGCCATGGATCTG
GCCACGGGCGCCTTGAGCTCCCTCCTGCCCAAGCTGCTCAAGCTGGCTAC
AGATGAGTACAAGCTGCAGCAGGACGTGCAGGATCAGGTCAAGTCACTCG
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ACACATCTTGAAGCCTCCCTCAAATCAGTCCAGGTCCATATTCACATGGA
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GGAGAGGCCGACTAGGTTCACTGAAATCACCACAAGCCCTCCTTGGAAAA
CTGCGTCCACTTAGACCCTCTGTCGCGCCAACAGCCTCATCAACATGGGA
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ACGGGGACTCTTTTTCTCGCGGTCTCTTATTGCCATTTGCTTCGTGAAAC
ATTCACCTTCTGTCCGCTCATAATCATCGGCTAACTTGCTTATTTCATTT
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TGCCTGGGTTAAGAAACAGTGCAGCCCCATGTAGCTTGTGCTTCATCTGG
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CCCATATTTCTGGCATTGCTGGAATCTCATCACCATCGACAATCCTCAAA
GCTTGAAGAATTGGTTGTGATGCTCTCATGCTATTCTCCACCAATTGCCA
AAACGGCACAGAGAGCACGGTGTTTTCAGCTACCTTCCCTGGTTCAGTGA
TCTTCAACTTGCTTGTATACCATTCCGTGCTAACAAAGAGAGCTTTCAGA
TATTGGTGTTGCTGCCACATACTAGCCAACGTGAGGAATGATGTTGCAAA
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GCTTTAACAATGCAATCACTAAACTCTTTTATCTTCCCAATGTCCTCCAA
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GTTTTGCTACCAACTTGGCATCAACTGACTCGGAAGAAACATTGGCAGTC
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GCGTCCGCTCATGTCTGTCCAACCATCAGACATGAGAGTGCAACCATATT
CCTGCCATGCTTTTTGATGCTTCACCTTTAGTTCGTCAGTCTTGAGCTTT
GCCTTCTCAAGTAGTGGTATCCTCACATCATGGTAAGACGGTGATATATA
ATCAGGTCCATACTGTCCTATAGACTCCAAAAGAATCTCCCAACTTTTGG
AATTGATAATATTGAGGGGAAGACAATTTTCATAGAGGAAGTCAGCTACA
TGGCCATCAACAATTTCTTTTTGTTCCTTCGTCTTTGTGCCAAAATTCTT
GATTTTCAACTGAGTGCTCTTTGAGCTATGGCTCTCAGCTACAACCTCCT
CTGGTGTCTTCCTCATCTCAGCAGCTATTGTCTTGCCTTGCCTCTTTGCC
GGTGCCGGCACAGTAAAAAAATCTTCCTTTTCATAGACACAGAGGTGGTG
TTTGATGCCTTTGAATTTGCTTGAGTTGCTTCAGCCTCCTCTTCTTCTCC
TTCATCTTCACCCCCAGCAAGGTTGATGGTGTTGGACTTGAATGATTTGG
TTTTCATGTACTCATGCATCTCTTTATTGATTTCAGCGGTTGCTTTCGGA
CATTCCTCTACCTCTGTAAAACCACCAGCAAGGTGCTTCTTCATCCTTAG
GACTCCTGATGTGACCTTTTTATTGCATAAAGTACATTGGAGCAGCAACT
TGTTCTCAAGATCAGGCCAGAAAGCAAATGTCCACCCTGGATCTTTGCTC
CTGCGTGGCTTCCTCTTAGGATCCTTGGATGGATCGTAATGCTCATCAGC
TTCAGCTGCAGCTGCAGCTGAACACACAACTTGATCAATCTGTGGCGGCG
TCGACATTGCAGCTGGTAGCTCAGGCCTCGGGATCTTGAAATTGAAACAA
GGGGAACGAAAATCAGACAAGGATGAGGGGAGAAATCAAACCCAAAAAGC
AATTTCGAAGAAGGAAGGGAGAGAGAGGTTATTTGCTGGCTGCTACAGCC
GGCCGAAGAGGACAGCAAGGAGAGGAGACGAGGAGCACAGCTGCCACAAC
AGGAGAGGGCGGATCCAGGAGAGGGGCGAAACCGGTGGAGGGCGGCGTCG
CAGTCCTTCTGGTCGCCGGCGGCGGCGGCTTCTGGTTGGTGGCAGCGGGC
AACTTCTGGCTGGCGGCGGTGGCGGCCTCGTACTAGATGGGGAGGGCGGG
AGGAGCGAGCGTACCGAGCGGGAGTAAAATAGGGTTCCCAGGCGCCTCAG
ATATTTCCCTGAAATCGTCTCTCAAAAAAAAATTCCCTGAAATCTTGAGT
GGCTCGACTCAAAAAGTTTCGACTACTCGTAATAGTCTAGGACTAGTTGT
TCGACTCGTCGACTCAAAAAAAAGTTGCATCGACCAGCCGAGTCGACAGT
ACATTTACGACTTGTGGACTAGTCGGTCGACTAGTCGTTCGACTCGTAAT
TCTTGGAGAGGGAGTAATTAACTTGGGTAGCCTATGTGACCTCTTTCAAA
ATTCAAATCAATTTTATCCCTTTCTTTTGCGGTACCAACATTTTTCCAAG
AGGGATGAGAATTCCTGTGTTTGGGAGATACTGAAAATCTCGGACGACAA
AAAAAAAACTTGATGGTCCCTAGGTCACATTTGCAAAAATTCTATCATTA
CTGCAACGTAATATTTTCTCTTTGTAAGTACCATTTTCAAAAATGCAACA
TTTTTCTGTGTATCTATAAAAACTTGCGGTGTGTAACAAAAACTTTTACA
ATGTTTCGAGCATGCCCATGTAGCAAAAAAGTTATCATACTAACAAAACC
CATTTGTTAATAGAAAAATGTAAGAGTCGTGTCATAATAACATTAATACA
TTTTAGCTTTATTTTCCCAAATTTAATTGCAAAAGGATGTTTATATTGAA
TTTTTTTAATACTTTTTAGCTTTACTAAATTACTTAAACAATGTTGCACT
TTTTATTATATTACTTAAACAATGTTGCTTCCTGACAAACCTAGCCAATC
AATTTAATTATTTGTTTTAAAAATAAATTTTATCTTTCCTTCCACCCATC
GAAAACGGCCTTAGGGCATCTCGAAGGACGCCCAGATAGAATGTCCGAAC
ATCCCTAAATTATGTTCGTTTTGGGATGGACAACTTGTCCAGATCGATGG
GGGTGGGTGCGCCCAAGGTCACCCCCACCCCCAACCCAATACGGACCGGC
TCGTGTACATTATTTTAGCTCCATTTGCTTGTTTTTTATCTTATTTTTTC
TTGAAAAAGGGACAAAGCCCCCGCCTCTGCCTCTGTATCGACTGATACAT
GCGGCCTCTTATTTCTTTAGTAAACAGTTGTTACAAAAATTTATTACATC
ATGGGTTACACAAGGTGAGACGTGAATCAACCATCTAAAAAGTAAGGATA
ACATAATGTAACTCTGTATCAACATGTTATTTTTGTATCAAAACGTTAGT
TGTACTGGCTGTTTAAGTCATGTGCAACCATCTCCAAAAGGCTGCACCCA
GTATCCAAAACCTCGCGCTTGTCCGTGGGTTGTAGATAAGACAACGTACA
TATCCAATATATTGCCTAAGGTATAACCTGCATAAAAGAATAAGTTTTAG
CATTGTTAAATATATAATCATTCTGGACATTCCAGATTTCCCAAAGTAAA
GCGCAAGCACCCACTCGGATTTGCACTTTCTTAATTTTGGAAACACCATT
TAGCCAATTACCAAACAGATTTGTCATACTAGTAGCGGGTGTGATAGTGA
AAGCCATATGCACTACACGCCAAACTAGTTTTGCAAAAGGACAATGTATG
AATACATATTGTATTGTCTTCTCATGATGTTGCGTTTGGCTAAATTTTCC
TTCGTGGGTAGCACCCTATGGTATAAGAACCATATAAAAATCTTTATTTT
AAGTGGAACTTTTATCTTTCATATATATATTTACAAAGGAATGGTGTATG
GTCATTTAAAAGATCTAAATATAATGACCTCACAGTGAAAGACCTTGATG
TAGTTAACTTTCAAACAGGCTGATCCGATATTTGAACATCCATTAAACGG
CGCACCAAATGAATCCATCTTGACCATTTGTTGCCCGTTAAAGACCTTTT
GAAAATTAATGTTGAGAGAGGATTATGAGACATAACATCCGCAACCAGAA
TCAGTTGTTCATAAATAAATATTTTAGGAGATAATTCAACTAATAAAAGC
ACAGAAATATTGTTTCAAATACTTCCTTCCCTTTGATCGAATCGTAGTTC
TCAAGCTTGTTTGTTGGATCATCCTCATTCATGGCTTCTTACCGCATGGG
TAAGTAATGTCCGAAGGTTTTTCCATGTATGTCATCCATGGATCCTTATC
CAACAATATGTCAAGGTGAAAGATCTATTTTCAGATCACTTCTTAAAGAG
ATCCAAAGCCATAGAGACCTAAACAAAACGATGGTACATGTCAATATATA
AGACACATTTGAACATAGTTAGGAAATCTTACTTGTTTTACGCACATGCC
ACTTTGCAGCCTACCAGCAATTTACATCACACCCACTAAATTTGTGCATT
GATCTTAGATAGTAGACCACATATGTGAAATTGAGCTCTCTCCACGATTA
CTTGAAATTTGAAAGGCTGGATAGCACTCCCGTTCATGGAATTGCTCTCA
AATCCTTCTCCCATGGGTAAACGATCTTTGCCCCGCACCGCAAATGTGAT
CTTGGCTCACTTCCATACACGAACCACAAAAACAGTAATCCTCCTTTTGT
GTGCATGTCGATCCTCTTTTGTTGTTGAATGGATGAATGAGGTGTGTGTG
TGTGGTCTCAATGTCAAGAACATCGAGAGAGAAACAACTAGGCCCCGATG
GTGTGCCTCCATCATGAGCGTACACGGGGAAGATGCCGAGAGCCCTGGCA
AGGTTCTCATTGGAAAGAGAGGTGTAGCAGTGGACGAGCTCCCTTGGCTC
CCATCAGCGGACGTTAGATCATCCTCGATAGATGACGAGCCGTTTGGTGA
TGACCTTTTTCGATGACGGGTGCCTCGACAATCTTCTACAATGAGCCGCT
GAGCCCACTCGGCGGTCTCTGGTTCGAGGTCCATGAGCGACGACGGAGAA
TTGGTCAAGACCGCATTCAAGAACGGGACAAGGCGTCAACGGACGGGAGA
AGGCAGTGTCGGCTTGATCGAGAGAGGATATGCATCTAGGGAGGTAGAGG
ATTGAGGAGGGATCCTAGTGAATATGGTTTTCCCCTATCTCATTATCAAG
AGGTGGCCGCGCTGTTGGGTGCCTTGCTAGCACTCATGTCGAGACGCGTC
CAGACACCCCGATTCGGCCACACAAATTGGGTGGGGGTCCTTGCAGGGGT
CTAGACACCTTTTGGACCAAAGTGTCCCTGGGAGATGCCCTTACTCCATC
TCTTCCTTTTCCTGTTGTATAACCTTCTCGTAAAGCCCACTCTTGTCCTT
TCTCCGGACATTCCAACTCACTCATTATAACTTGGACACGTCAGGTGATG
TTTTCTGTTTTCTTTGATTAACATATGGATTTTTAGAGAGTGTAATTAGT
ACAGGAATAGATAGATACAGAGAGAATTAATCCTGAAGTAAGGAAGACCT
TATTAGTTGGATGTTCCGTGAATACCAAAAGTTTCAATTATATAATGTGT
CATCGCTCATGCATTAAAATAATACTCCCTCCGTCCTAAAATAATTGAGT
TGAGTTTGTCTAGATTCGCATGTATCTAGACTTGTTTTAGTGTAAGATAC
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GTTTGTAATGATATATCGTTCATAATATATATCTTGTATTACGTTGATCA
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GTACCATCTATTTCAAGGAATTGATTGGTGAATAGTTTAATAATCTGTTG
CTCTTGTGTCAAACTTTGTTGATAGGTACTTCGTTGTTATTGACGATATA
TGGGACACAGATACGTGGAAAAATATCAGCATTGCTTTGGCGAATAATAA
TCTCGGTAGTGCAATAATCACAACTACTCGTAACTCTGAAGTTGGCACGG
ATATCGGTCCCGTTTACACACCAGGTGAACTTTCCGATGATAACTCCAGG
AAATTATTCTATACAAGAGTATTTGGTACAGAAAAATGCCCTGATTATAA
ATCAGATGAGGAGCATAAAACAATTAGTGAGGTGACTGAACAAATTCTTG
AGAAATGCGGGGGTTTGCCATTAGCTATCACTACAGCAGCTAGTGTGTTG
GCTAATAAACCGCCCGTGATGTGGTCTGATCTGTACAACTCTATTGGTTT
TCGGCATGAAGATGATACACAAGTTAAAAAAACTATGAAGATATTGTCTT
TCAGCTATTATGATCTGCCTGTTCATATGCGGGCTTGCTTGTTATACCTA
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CCAGCACAGTTCTCTAAAGGCTCCATAACTAGCTGCCGTGTTCATGATAT
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TACTGGATAGTTTGCAACACATGCCTGTTGATAGCAGGCGGATATCCCTC
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TGCCCCCACTGTCTGATTTCTCCGTGTTACGTGTACTAGCCGTTCTAGAC
GGCAATGGTTCACCACAAGGTCATCCTTATTTTGAAGGACTTGGGAGATT
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GAGGGCACTGCCATAGAAGAATTGCCGGATGGTGTCGCCCATCTCAGGCA
ATTATTGTGCCTATGCGCTTCAAGGAAGACAAGAATGCCGGCCTGGATCG
GTGAGCTGACGTCCCTGCAGGAGCTGCGGATATGGCCTGCTGCCGAGGAA
TATGCATGCTTTGTGACAGAGCTGAGAAAGCTGACGGAACTGAGGGTCCT
CGTTACATGGAATTATACGCCTGATGATAACTTGGAGAGAGATCTTCTGG
AGTGTCTGGCAACCCTGAACAAGATCATGGTTATAGATTTTGAGTTATAT
ATCGGCGGCCTGCACAAGAGCTTTGAGGGTCGACGAACAAGAAGTGTCAT
CGAGATGGGCCAAGCTGGCTTTTTCCTCTCGCCACGTCTCCGTAGCTTAT
GTCTAGATGGCTTCCGGTTCTCAAGACTGCCGGCCTGGATTAATTCGTTC
CGTCTTCCTGATCTCTACTTCTTAGTAGTGGTAGTCGATAGGATGGAACA
GCAGGATTTTGACTTGCTTGGAGGTTTTACACAGCTCCGTAATCTATACA
TTGCAGCCTACGAAATCAAGGAAAATGTAATATTGACTTGGGCTGGTGGC
TCTGGTGCTTTCCAGAATCTGAGATACTTCAGTGTGACTAAGCCGCTCAA
GTTTCCGCCTGGATCTTTGCCAAGGCTTGAACACATTGATTTCTATATCA
GAGTCACGGAAGCAAAGCGTATTGACTTCGAATTTGGCTTGGTGAATCTC
CCTTCCCTTGAGAAAGTCTCTATCATAATCCTATATGTAGCTCCGGCGGA
CGCCGATGAACTGGAGGAAGCTGTAAGGCACGAAGTCCGCATCCATCCGA
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TTCTTGTTCCTATTACTCGTAATCTCAGTACATGAATAGTTAGATTATCT
GATTATCTTGGAAACATTCAGTTTTAGTGTTTGCACACACTTATTTTAAC
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TAAACAGGTACGCCCGATCGCTCGATGATCGTGCTCTCCAGTTCTCCCTT
CGTCCTCAATACTTAGTTATAGTCTTTGCAGATACACATTTTACTCTTAA
CTTAGCTTCCTTCTCTGCCTCCTTACCACAGTTGCGGAAGTTGAGAAAAA
AGGTACATGCTCGATGATAGTAGCCTCCATTTGTCATCTCTCTCTCACAC
ACAGTTTGTCCTGCACATCTTCCCGCCAGTCTTTGCACCAAGTCATTTTC
CTACTAACATAGTATGATTCTCGGCCCTACTATAGCGGCCACAACTCGTC
GCTCAGATAAGCATCCAACTGCAACGTTATGCTGAAACTAATAAAGAGAT
TCATGAGATACGCAAGGTGGAATTTTCCTTGCCCGCTGACCATCCGATCC
TTCTAGAGGTATATCTCCCCTCTAGTCGCCAGTATGATTCACCATCGTGC
CTTTGGATGTCTTGTGTACGACTTACTGGTCTACCTACTCGTTTCATTTT
GCCGCAGGTGAATCCACTCATGGAGCAAATCCGCAACGATGTACGAGGTC
CCGATGTGCGCAAATATTTAACTGATGAAACGAACAGGCTCTTTCAGGGC
ATACGTGCTTCTGACATCCAACAACATGAACTGGTTTGTACTTGTACATT
CTTGCGTCCCATTGTCCATTCTTTCTTTCTCCCTGTCTGGACTAGTTACT
ACTTACTAGTGACTTCCATTCCATTCTTCTGGTTATAGATGGAAAACGTT
AAAGATTGTGAACGACTGCTTGATCGAATTACCATTGTAAATGAGCAGTC
GACCGCACTGCTGGACAAAATCAAGGCTGTGTTGGATATCGACATGGTAG
TCGTGGTCTTCATTTTTCCTCTATGATCTGAATATTCATATTAGAATCTC
TGATTCTCCTGGACACCTAGTTTCAGTTTTAATGCAGACTTATTTTGACT
TAGCATGCTTCTCTGCCTCCTTACTACAGGTTAGGAAGATAGAAGAAAAG
AAGGAGCAGGTACATTTGTACTATAGACACCTGCTGCCAGTCTTTGCAGT
ACTTTCCTTCTAACATGGTATGATTCTCTGCCTTACTATAGTGGAGAGAA
CTGTGCATTCAGAACAACCGTTTTATTGCAACTGGTTATGAGATTGAGAC
GATACGCGAGGTGGGGGGAAACTTGCCAGTCGACCATCCCAGCCTTCTAG
AGGTACATCCCACCACTGGTCTCTAATTCACCATCATGCCTGGAGTGTCA
TGTGTACGGTATACCAGTATAACTACTCAATTCATTTTGATGCAGATGAA
ACCGCTCTTGGAGCAACTCGACCATGACAATGTACGAGGTCCTAATACAG
TAAAATATCTTAATGATGAGTGCAAGAAGATCTTTAGCAGACCTACTATT
GACCTCCAACTCCATGAACTGGTTGGCACTCATGCACGCCTCACATTGTT
CCAACCTTCCATTCTCTCTATCTAAACTAATTACAAGTAACATACTGCTT
CCGGTTGCAGATGGAATACACTGCAGATTGGCAACGGCTGCATGAGCGAT
TCATCCTTGTAAATGAGCTATCAACCCCACTGGTGGAAAAAATCAGGGCT
GCATTGGATATCAAGACGGTAGTCGTGACCTCCATTGTTCCTCTATATCT
AAATATACATTACCGTGCTATACTATCTGATAGTCATGTCATGAACACTT
TGCTTTAGTTTTTGCATGGAATTATATCAACTTAGCATGCTCTCTGCCTC
CTTAATGCAGGGTAGCACGATGGAAGAAACAAACAAACAGGTACGTGCTC
AACCATCACCTCTCAATTCGACCTCTCTCATAAACAGGGTAGCACGATGG
AACACTTTGCTTTAGTTTGTCCTGGAATCCCGCTGCCTGCCTTTGCACCA
ATTCATTTTACTCCTAACATAGTATGATTCTCTGCCTTACTATAGAGGAG
ACACATAATTGATCAGATACGCAACCAAGGGGAGCGTGAGCATGCAATTA
GTGTTGAGATTGAGGAGATACGTAAGGTGGAAGAAGCCTTGAACGCTGAC
CATCCCAGTCTTCTAGAGGTACATTTCCTTTCCCCCCGAGTGACCAATTC
GCCACCATGGTTGGGATGTCATATGTAAGATACACCTACTACCTACTCAT
ATTGTGCTGCAGATAAAACCACTCCTGAATCAACTCGACAATGTTCGATG
TCCTGATACCATCAGAAACATAGAGGATGAATGCAAGAGGCTCTATTCCA
TAAGTATTTCTGTAGACCTCCAACTCCATGAACTGGTTGGTACTTGGTAC
TCATGCATGCTTCCCATTGGTGCAAGCATCCATTCTTACTATAGTATATA
AATTAGTTAGTACCAATAGTTCCCATTCATTGCTTCTGGCTGCAGATGGA
AAACGTTGAAGATTTTCAACGAATGCTTGGGCGACTCACCCTTTTAAATG
AGCAGTCGGTCGTACTGCTGGACAAAATCAAGGCTGTGTTGGGTATCGAG
ACGGTAGTCGTGCCCTCCATTCTGAATAGTGAATATACATACTCTGTTAG
GCTATGTGATCGCCCCAGACACCTAGTTTTAATTTTTTTTCTTTGACTTA
GCATGCTTCTCTGCCTCTTACTGCAGGTTAGAAAGATTGAAGAAAAACAG
AAACAGGTACTTGCTCAACCATTGCCTGTCGTCCTCTCTCGCACACAGTT
TTTCCTAAAAACCTGGTTTTAGTCTCTGCACAGACTTATTTTGCTACTGA
CTTAGCATGCTTCTCTGCCCTCTTACTGCAGTTTCTGAAGATGGAAGAAA
AAATGGAAAAGGTACGTGCTCGATGGAAGTGTTCTCCATTCGTCCCCTCT
CTCACCAACACGCAGTTTGTCCTGGCCTCCTGGCCACCAGTCTTTGCACC
AATTCACTTTTCTAACATAGTATGATTCTCCACCTTACTGTAGAGAACAC
AAATCCTCGAACAGATACGCACCCAAGCGGACTATGACAATGCAATCAGT
GTTGAGATTGAGGAGATACGCAAGGTGGAAGAAGTCTTCCCCGTGGACCA
TCCCGGTCTTCTAGAGGTACATTACCCTGGTAGTGGCCAACTCGCCATCA
TGGCTGGGATTTACAGGTGCTTGCCTACATACTCATTTCATATTGTGGCA
GGCAAAACCACTCTTGAATCAACTCGGCGACCATATTCGAGGTCCTGATA
CACGTAAATATCTAGAGGATGAAGGCAACCGGCTCGTTGTCACAAAAACT
TCTGCTGTCCTCCAACTCCATGAGCTGGTTGGTACTTGATAGTAGTGCTC
GTTGGCATCCATTATTCCTATCTAAACTAGTTACTAATATATAACAATCT
ATCCTTCTCGTTGCAGAAGGAAAACATCAAAGATTTAAAACGAATGCTTA
AGCAACTCACCCTTGCAAATTACCAGTCGATCGCACTGCTGGACAGAATC
AAGGATGTGTTGCACATCCATCCCAACATTCAAAGGGTATGCACGGATTC
TAGTATTTAGTTCCCATCTATTTGTCCATTTCCAAAAAAGTAGTATCTTA
TTCCCCTTCCTTGTTTTCCCGCTTTCCATTTGCAGGAGGAAGGAGAAGCG
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TTAAGGTGCGTAGTAGATACTACTCCCTCCCCAAATTAAGATGCCTATTA
GTTTTGGTCAAAGTCAACCTTTTTAAAATTTGACCAACTATATAGAAAAA
TATAGTAACTTTTGGAATACAAAATGCATATAATACGAAAATATACTTCA
TTATGGTTCTAATAACATTGAGTTTATGTTTTATTTCATATATACTTTGT
CAAGGTTTATAAACTTTGACTTTGATAAAATCTAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.