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GrainGenes Sequence Report: AE000155

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Sequence
AE000155
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE000155
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGCCGCCTCGCTCCCCTGGCACCTCGTCCAAGCGCGGCGCCCGTCC
CCGCGCCCCTCCAAACCCTAGCCCCGCCCCTCCGGCCGCAGCTGCAGCCG
ACGGGCCGAATCCGCAGCACCAGCTCCTCCAGGCGGCGCAGGACGGCGAC
CTCCGCCTCCTCAAGAGTACGTCTTCGATTTCGGGTGGGTTTTGGTTGGT
TGGTTGGCGTTTGGGTACTGATTTTGTCGGGGTGGCCCGGCCAAGTTCCC
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GGGAGGTGGTGGAGGCGGCGGCCAGGGACGACGGCATCGGGGCGCTGCAC
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TCTTTTTTCTGTTTTTTATATAAAAAGGGAAGGGGGCCAAACGGCCCATA
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TCGCACGCACACGGGCACACCAGGAAGCAATGGAGAGCTGTGATAGCTTC
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GGCCAACACCCCACCATACAACTCAACCCAAGCAACCCAACCTAAGGGAG
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TCCACCACTCCGCGAAGACCCCTTCAACCACGGGAGGACCTGCGATAGAT
CGGATCCAGGAGAGGACCTCATGCCAGATTGTCCGCGAGAATGGGCAACC
TGTGAGGATGTGTGACATAGTCTCCTTAGATTGGTCACAGAACACGCAAC
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CTGGCTTGGCAAGCTAGTAAACGAAGAACTTCACCCTAGGTGGCTCCCTG
GATTTCCAAGGCAGTTTCCAAGATCCCGAGGCTAAAGACCCTTGAAAGAG
GGCATAGTAACAGGATTTGGAAGAGTACTGGCCATCAGTCATCCACTGCT
AGACAAGCTTGTTTGGTTCACCCACCAGGTGCACCCCTTGCATTCTGACC
CACAACTGAATGTATTGCCAAAGTGCAAGGGGGTTCACAACCCCAATCAT
GTCTATAATCCAGTTGCGCTCGGTTAGCGCCTGCTGGACTGTTCTCTGTT
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ATCGACATCCCGTCTAGCCATCTATCCTCCCAGAAGTGAGCGGAAGCTCC
GTCACCAAGTACCATCAAGGTAGAGGTGAAGAAGATTCCCCGCTCCATCC
TAGTGAAGTGAATATTGAGCCTGCGCCAAGGTCGCAATGGTTCCGTGTGC
ATCCTCCACAACCACTGGGTCTTGAGACTAATGGCCATGCGCTCGAGACC
TGGTACCCCAAGGCCTCTGTAGCACAGTGGCCTGATCACCTTAGCCTAGT
TGATGTGGCAGTGTCCACCCTCAACATCCTTCCTGCCCACCCATAGGAAG
CTGCGCAAAATCTTAATCACCTGCTTAAGGGTCTTCTTGTTAAGGGAAAG
CACCATAAGCTAGTGAAGAGGAATTGTAGTGAGCACTGAACAAATGAGAG
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CCGCGATCCGAGCGATCACTAGTTGGAATGCTTCTGCCGGGAGGCGACAA
ATGGCTAGGGTTATACCCAGATACTTGACAGGGAAGGGTGCCAATTGGCA
CTCCACCTTCTTCGAGCAAGAAACCGGGGACATCGAGCACTTTGCAAAGT
TGGTGTGCAATCCTGAGGCCTCGCCGAAGACCTCCAGGATGCCACGAACT
GCGCACAGGCCTGCCTCATCCGGGTTGCAAAAAATCACCACGTCGTCTGC
GTAGAGTGAGACTGAAGTCGTCAGCTCCTGGCGGGCCAACCATTGTAGCA
CACCCAACTCCTTGGCTTTCGTCAACACCCTCCTAATCGTGTTCATAATT
AATACAAACAACATTACTGACAAGGGATCCCCTTGTCTCAGCCCCCTCCT
GTGCCAAATGGGGGGGCCTGGCTCACCATTCAACATAACCCTAGTGCTGG
TCGTGGACAGCAAAATGGCCACCAGCTCACGGAACCTTGACCCGGAATCC
GAGCTTCTAGAGAACCTGGAAGAGAAGTCCCCAGGAGACGGAATCGAAGG
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GCGCTTCCTGATGGAAGTGCATTGCTTGCGATCCACCAGCGACTCCATCC
TGGGGGCAAGCCTGTTAGCCAACATCTTCGCCACCAGCTTGGCGAATGTG
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CCCGGTGCTTTCCCGTGGGGGAGCCCTTTCACCACCTCAGAGATCTCCTC
TTCAGTGAATGGCGCGTCCAACTCTGCTAAGTTTTCCGAGTGCAACCCTA
GGAAATCTAAGTCAAGCGAGAACTCGCAGTCAAGAGAAGTGCCCAGGAGG
TTCTGGAAGTGGTTGAAGGAGGCCCGAGCCATGGCTGCATGGTTTGAGAT
GACCGCGCCGTCAACCTGAATATTGCGAATGGCGTTCTTTTGCTTCCTAT
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CACGCGATCTTAGCCCGTTGCCATGTCCTCGTGCGTTCCAGGGAAGCCAG
ACCTAGGTAGGTACGCCTTAGGAGTGCCCGTAGGTGGCTCTCATCCTTAG
AGAGCTGCCTGGACTCCATGGTTGAATCAAGCCACAAGACAACCTCCCGT
GCTGTCATCAGCTGCAGTTTGATGCCCCCTACCTTTTTGTCGCTCCAACT
CATTAGCTGACGAGTGGTTCGTTTAAGCTTAGCGGTGAGCCTCCGGAAGG
GATCTGGGTCTCTGTCGATAGCACCCCAAGCAGATTGCACCACCTCGTTG
AAGCCATCGAACTTTAGCCAGTAGCGCTCGAACTGGAAGCGCTTTCTACC
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ATGATAGATTGTGCAGGGAGCAACTGTTGTGTAGCTCCTCCTAGCCAGCC
GTAACGAACACCCTATCTAGTCTCACGAGAGTGGGATGCTCCCTCTCGTT
TGACCAAGTGTACCGACATCCATGTAGGTAAACCTCTTTGAGTTCACACA
CATTCAGGAAACGTCTGAACCTGCCCATCATCCTCCTGTTGAGATTGTCG
TTGTCCTTATCCTCATCTCTGTAGATCAGGTTAAAGTCCCCGCAGAGCCC
ACTAAGGCTTGGTCTTGTGGAGCACAACGCGCGCAGCTCCGCAAGGAAGG
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CCCGGCGCTCCCCCCACGGGGTTCACCTTAGCCGTGACACTGTTAGTACA
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CAAAGAGCGATTTGTAAACAAGACAACTTGAACTCATGTTTTGGGTTGCA
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GTTTCAATTGTAGATGGACAAACATGGTTCTTTGACAGTCATTTTCATCA
ATTAGTTCTCATATTTTTTCTTTATATAAACCTTTTGCCTTGTTCCTTTC
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GTGCACGATTGGAGCATCGACGGAATAATGCGCTATGCAAAGTCAGTGTT
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AAATTTAGCATCAATATTGGATCCATGTTTCCCAGTTAGAATCACATACC
CAAAACTAGGCATGTTTTCTTGTTGCCTGTTTTGATTTGATGAACAAGAA
TAGTATACATGCCATCTATAATCTTCTAAAAAATTTGTTTGGGGCGATGG
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TGTATTGTTTATGTACTGCTTTGTACTTGCATTCCTGAGTCTTGATTCAT
TTGTTTTGCTTGATCATTTAGGGTGAGTTTCGAAATCCAAGAAGAATAAC
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TGTGGGTTTGGACTAATGTGACGTATCTACTTTCAAGGAAGAGTGAAAAA
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AAAAAGAGAAATATGAGCATTGAGTGTTAATCTCAACATGTAAGCAATAA
GCAGCAGCCAGAAGAGGAGCAATTTCAAAAGCAAAGCACCAAACATGTTA
ATATTTAAATTTACATGGCGTATCATGCTGTCTGACATTAAAACTCTCAT
TTTCCCCTTAAATAAATATTTACATGTAATCCTAAATAAAAAAATTCCTA
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AAGCAGCCAAACATTCAGCAAGTACATGAGGACACCTGCAGTACAAGGGC
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TCTCGAACAGGAGTCTTTGCTTCCTCCGCTTGGGTGATGGACAGAGTGCT
TTGCAGGATGCTCTTGCGTGCAGAGAAATGCGGCCTAGCTGGCCAAAGGG
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TGCGTTGAGGTTATGCTAGCTATGTTTCCTTTAATCATTCATGTTACAGG
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TCCATGTTGCCCATACCTGTGTTGAACCAGGATGAGGAAAGAAGTAAAAG
TCAGGGATGGGGGTCCGGGGGCATGCATGTGTAGACGTTTCAGTTGTTGC
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TTTTTTTATATATAAACCGATCACTGAGATGGATCACGATTTGTTATTTT
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CGCCTCGATGCGGGACAACCTCCTCAACGCGGCGCACAGCGGCGACCTCC
GCCTCCTCAAGAGTACGTCCCGATTCTGGTGACTCCCCGTGGGGGTTCGG
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ATTGCAGGGCTGGTGTTGACGCTGGACGAGGGCGTCGGCCGCCCCAGGGA
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CCGCGGGCAACGGCCACATAGAGGTCTGCAGGTACCTCGTCCAGCAGCTG
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CCTAATAATTTAGGGAAGTCACCTTGTTCCATGTTCGGCTGTTTTGCGAT
GCTGAACCAGCCTTCATCTGTAGGTCTAGCTAAGCTAAGCTGCTGCTTGG
CTTCTTCATCTGTAGGTCTTAGGAGGCATCGGTTGTTTTCAGAGTCTGCT
CCTCCTCACAAAGCAAAGCACAACAATGATGAGCATGCTCCGTTGCCTTG
TTATGCTATCCCTCATTCATCATTCATATGCTTCATCGTGATAGGCCATG
TTCAGCACTGAAATAGTGCCTACGAGATAGAGACATGTAAAACTAATTTG
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ATCCCCAAAGGATTTATTGGGGCCTGCCACTAGTACTTGAATTTCATCTC
ACAGCGACTGAAATTAAAATTCTACAGTCTCGATTCTGCATATTTACTCT
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TTGCTTGGCAGGTAGAACACCACTGATTTTTGCGGTGCACAGTGAAAATG
CTTCTGTTGTCAAGTATCTTCTTGATCATGGTGCTGATCCAGACATAGCT
GCTGATATTGGGCTAACCCCGCTGCATTCTGCTGCCGGAATAGGTCCCAT
CTCTATTCATATGTATCTCTTTTGCATCTGTACACCACAGTTTTTTTCTT
TTAGTTTGTAATATATTCGGTGGCTGTATTTTGTTCTTAGTAGGGTTTAT
TTGACCTTGTTCTAGGGAAATTTATATTCTTCTTTCCCTTAGGTAAGCAT
GTAAGTGTATTATCTTCAAAGATGATAGTTAAATTCTGTTGACCTATCGT
TTACAATATCCTTATGTGTCAATCTGTATGGCAAGTGGTGTATTCTCTGA
AAGCTTTACCCATATGTTTGGTTTATCAACACAGAAAGTGTGTTTTCTGT
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AATGTACCCCTTTGCTTGATTTCAACAGTTATTGGTCCATTCAATTTTTT
TTGGCTAGGTGAGTAGGTGCAATTCTTGTTTCTATGGAACGTTAACCACT
TTAGCATGATCTTTGTAGCCTATATGCAGGGTAAACTGAGGTATGCCAGT
AGCATTATAAAAATAAAGAAAAAAAGTGGGTCAGAAAAAGCTTACCATCT
TATGTAATAAGTACCCTTCATGTTTCTTCTTTTATGCAGGTGACTGTGAA
ATGATAGAAATGTTGCTTGCAAAGGGAGCTCGTATTGACCTGATAGCTGA
TGAAATTGGGACACCGCTGCATCTTGCTACTAAGGAACAACACGTTGGTG
CTATGAAGATTTTGTTGGACCATAATGCAGATGTAAGCTTAAGTTCATGC
TACTTCTGCCTTAAGTTGCATGGTCAACTGTGTACATAAATAAAGTTTGA
ATTGTTTGCGTTCTCTCTGTTTCTTTGTTAACTGTATTTTTCTCATATTT
TATTCTAGTTATCGTTTGGTACTTTGGTCCCTTGAGGCTGTTTTTTTTTT
CTGCTATGCAAGTTATGATTCGATCGTGGCTCTTTGCAGCTCAATTAAAT
CTTCAAATGCATGTTACTCCTTTCTTCGCTGTTGCTTCTAGTTGTCTAAT
TTTCTACTTATGTGCTATTCTTGAAGATCTCCTTGGAACTACAAGAGTCA
GGAATATTTCATTACTTTTGTTTAAATCTATAACATGTTCTCATGCTATA
GTCTGGGTTATAGCTTATAGTGTCCATTCTTACGCAAGAGTAATGTTTAG
TGTTCGATTGGAACCATCACTATTTTTTTTTCTCCGGAAGTGTAGTACAC
ATGCTTTCATGTAGTTTTCAAAGTGCCAAATGCATGCTTTGGACAATTCC
TTCTTGGTGCACTTTCCATAACGATCAAATTTCCATCACGTCTGTCATTC
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GTCAAGTGTAAACCAATACTTACCGTTCTGTTTAATATTTTTCTCCATCC
ATTCCTTATAATCAAAACTAATGTGATTCACATCTGTCACTAGCCCAACA
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CAAGCTGTAAATCTTTCGTCAGTGGAATGCGTGAAGCTCCTGGTTGAGGT
ATTGTACCCATTTCTTAGGTTTGTCAAGTCCTAGCATTGCACTGGGCTTG
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GGTGCTGTTATCAGCTCAGATTGTGTCGAAACTGCTTCGCTTGATTCTAA
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GTGCCAACCGTGAAGTAAGATTTACCCATTTTACAGTACTCTTAAACACA
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GTGAAAGTCAAGTCATATGAAATTCCAGCGCTACTTGATGGCAATTTCTT
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TTTCGATTGGTATTGGAACCTTATACCGAATATTTTTTATTACATCACTG
TATGATTAGCCTGACTGCATGACCACTTGGAAGTCTAAACAATATGCTTA
TACAATCTGGATGTTGATAGTCAATATTTTTCCCAAACAAACCATGTTTT
CCAACAATCTGGATGTTGATAGTCAATATTTTTGCCAAACAAACCATGTT
TTCCAAAATAGTTACAGAACAGTCCTATGTAGTTCATGTACTATTAGAGC
ATTTCTCCATTCATTCATCATGTATTCATCATACATTTAGAGTATTATTT
ATGGGTCAGGATCAACATTCACATACAAGCAAAATCGCAAAGTTGAAGTC
ATTTGGGAATCAAGCTGTCGAGAGAAAAGATTACTTTTCTGCATCAGCGT
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TAGTAAAATTTTCTGTAAACTCACCAATTATTGGAACTAACGGTTGGATG
GATGGACAAATCAGTGAACCTACTGCTTGATTGGTTGGCTCAATGCTATG
GTCTTGGTAACTGTACCCCAAGGCCACTATCAACAACTTATGGCGTCGGA
CTGTCTTATTGTGTCTTGCAGTTGCAAAGGATGTTGTCCGGGATAAAATG
CGAATAATATCTATGTCTTTGGTTTGTTCCCTTGGTCATTTATTTACCTG
TTCTGTTGTGCCATCCTGTTTCAGTAGAATGATGATGAAAAAGAGAATTT
AGTACTCTAAAAATAACTTATCGCTCCTGTCAACTCGAAAGCTAGCAATT
AAACGATTATTACAAGTCAACTGGTCTGCCCTGGAAAAAGATATTTCATA
TGGGGGTTTGTTTTGCTTGATTTGTTCCTTATCGCTCTTCCATATTTTCA
AGGTGGGTTAGGAACTTATTTGGTCTGCTGTTGACTTTTACTTCAGTATT
GTGCTTCCAGACATTTAAAAGCTTCTTAGGTTGACTTTCTTTTCAAAAAA
GAGTAAAGGTATTCATGTGATCCATTAATATCTTGCACTAATACTAGTCC
ATGAGCGTGCATTTGCAGATTTCCCATTCAAATGCTCGCAGATTCGTACC
TGTATCTTTTGTTGCTCACCAAATCTTGCTCTAACTTGTTGGATGCAGGC
AATTGATCTTGACCCTAATGATGCGGCCTTGTTCTCAAACAGAAGCTTTT
GCTGGCTCTGCATGGGTGATGGACAAAAGGCATTGCTGGATGCTCTTGAA
TGCAGAAAACTTCGGCCTGACTGGCTGAAGGCTTACTACCGGCATGGCGC
TGCACTGAGTTTACTGGAGGTGGGATTGAAGATCCTGTGTGCTGCTTTAT
TGACTGGTGCAGATTGTTTTTTAACAATTGATTCACAAGGCTTTTGCTCA
TCAGGACTACGGGGGCGCGTGCCAAGCATTTCTTGATGGCCTCAAGTTGG
ACCCAGTTAATGCTGAGATGGAGGGCGCATTACGGTACCCATCCTACCCC
TTCTGTGTTGGAAACATGTTGTTTTGACTGCTCTGATGGGCTTGGCCGCT
TACTCTAGGATGGATATTTGCAGTTGCTTATACCTAACAAACTTCTGCTG
TGCAATTCTATATGCTTGATTTGTGCCATGTACTACTGTTTTTGCACACT
AAGTTTCCTCATGTGACCAGATTGTAGTTGTGTATCTGTGCCTACAACGT
TACCCAACACTTGCTGATCGTGTCTGTGATGTGCAGGGAAGCTATGGAGT
CTATGCAGACATCTAAAGGCACCAGGGCAAGACGAGGTTGCACCTGTGTT
CAAGGTAGATAGACAGATGCAGACACATCTCGTGAAAAACATCCTCTTTT
CAAGTCAAGTAATGGCCGCTGAAACATCGCAGGCCGTGTTTTTTTCATAT
ATTGCCAAGTGTTTGTATCGAGATGTTGGTGCCGTGGTGCCACTTGTACT
CCTTTGCTAAAACCTCTGCTCTGCTCGTATAGGTCGTCCACACTGCTAGG
CAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.