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GrainGenes Sequence Report: AE038422

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Sequence
AE038422
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE038422
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGGCACCGCGAAATCCCAACGGGTGCTCGCCGGAGGAGGAACTCGG
CGGCGGCGACCTAAGCAGAGGTGGTGCTAGAGGCTTCCCCTCCCTCGTGG
ACGAGGGCGACTACTGCAGGAGCTCGAACCCCGCCGCCTCCCTGTTCCAT
TCGCCGGAGAAGAGGGCCACCGCAGCCGTGGCACAAGCCTGGAAGGAGAA
CCCTTCCTCCAGCAAGCGGTGCACAAGTGGATTCGGCGGCGGCATTGAGT
GAGTTTCTTTGCCCCCTCTCTGTATTATTTCTTTCATCTATTTTCTACAA
CAAATTAATGACAAATGCCTGTGCTTTCATATGTTGTAGACTAGATAAGA
GTGTGGTGTCCCTAGTCAAGACTATCCTAGTATTGTTGAGGATTGTTTGA
TGACACAACAAAGCAACATAATTCAGAAGGAGGAAGGCAAGCAGGTGCAA
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AGTAGTTGAACCAGAACCTGAGCCTGAGCTTGAACCTGTGAGGAAAAAGC
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TGGTGATCTAGGAGCAGATGATGATGATGACAGTGAGCAGATGAATTAGG
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TGGCACGATGAATCAAGAATTCATGCAGAACAGTATCTATGTTTGAAGAT
GTATTTCGTCGATGTTTACCAATTTAGAAGGGCTTTACATAGTTTGCATA
TAGCCCAGCTCATAAATTAATGTTATTGGAGAAATTGCAAGGATAGAGTC
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CAAAAGTGTGTGAGAGTAGTATCAGAATTGATCCCAGAACTACTGTTGAG
ACTGTGATGGAGACAACAAAGGAAAAGTTTGGGGTAGATGTACCAAAGAT
GATGGCCTATAGAGATAAGAGAAGTGCTCTACAAGTTGTCTTGGGTGATC
ATATATAAAGAAATATACAAGGCTCAGAAATTATCTACAGACAATGCTTG
AAACAAACCATGGTAGTAGATGCATCATCACTACAAAGGTTGTACCAGCG
CATCCTTCTCCCAACCCTAGATTTCATAGGATGTTTTATTGCTTGGGAGT
ATCTATTCAAGGTTTTCTCAATGGCTGTAGGTATTTCATAGGTAATTGTT
TGTATAATTGTTGCAAGGCTTGATATATGCATACAGGATTTTTTTGTTGC
CTTACTAGTTATTTGTACGAAAATTTTCAGGTTTGGATGGTTGTTTCGTC
AAGCTCAGCACTAAACAACAGATACTTGCCACCGTCAGCAGAGACGGGAA
CAACAACATATACACTATTGTTGTTGGCATAGTTTATAAGAAAGAGATAA
CTTCGTGGAGTTTGTTTCTCGCCTAGCTAAAGTATGCCCTTGGTGGAGAA
TCTGGCAAGTTTGGATACTATACCATCATTTCAGATAGAAAAAAGGTACA
TACTCTTGTGCACCGGCGGAGCGCCTTGGAGATGAAACTGGGCTATGACC
CCCTTCCAAAAGTGTAACTATGTTTCTAGGCATACTTTGCGTCGGCCATC
TTATGTTTCCTAGTGGTTTTAATCCAGCGCAAGCGAGGTGAAAAAGGCCT
CAAGGCATTGGCTTGGCTGGCTGGTGGTAGATAGTTCACTGGCTGTGTGA
TAAGCCTGTTGGCCTGTGTAGAAATAGATTAGTGTTTTTACCTTGGGCCA
TCAACCGGATGTTTTCTCCTTGCTGGACATCGGTGGATAAAATAGAAACA
TAAGTTGCATAGTATGACAATTCGATTGTAAATAAAAAAATCTCCACCGG
TACACTAAAAAAACTCCACGGGTCATGGGTGGTAAAAATTCCTCTCTCGC
TACGTCAATTTATATGTAAATAAAGAAATTAAGTGCATGTTCATGCTTAA
AAATCATCTGATACTGTTACGGCGAAACTTGAAATTGGAGCATAATTAGC
GGCGAGGAGTTGAATTTTGCCCCTGCTATGCTTTTGCTTACGCTCCGCAC
TGCTCTTGTGTATTCTTAATCCCATGCATATTGTTACATCTGCCATGTGT
ATGCACATTATTATAGCTCCCATATGTATGCTTATTCTCAATTGTTGCAG
GGCTTGCTAAATGCAATAAATTCAGTCTTTCCCAATTGCCCACAAAGGTA
TTGCTTGAGACATATCTATGTAAATTTCTAAACTGCTGGTTTCAGAGGGG
AAGAGATGAAGAAAGTCATGGATTCTGCAAGCTACTGATACGTCCATTTT
GCATCACTATTCTATGTCATAATTCACTATTATTCATTGATATATTTCAT
ATTGAGAGGTGATACTTATGTTATTTCATCTGTTTTTGCATGGTTGATGA
CTTTTGGAGCATGGACCGCTGTAGTCAGGATTCTGATGGAAAAGGTGCTG
TTTGGAGGCAAAATTCGCGAAGATCGGAAAATCCGAGAAAATACATGGAA
AATCCTATTTTACCAGAAGACGAAGGAAGACAGAAGGGGGGCTGGAGATG
GGCCACAGGGGGCCCACACCACCTCCTGGCGCGGGCCACCCTGGGGCGCG
CCACCAGGTGGTGTGGGCGCCCTGGTCCACCCCTGGCACTCCCCTCTGGC
GTATATATTCCTCCCGAAACCCTAAGACTCGGGGAGCGACCACCAAAAAA
TTCCGCTGCCTCTGTGGGGCGGAAAACACTGAGAGAGAAAGATCTCTCCA
GCAGACAGATTTCTGCTGGGGGAATTCGTTCCCAGAAAGGGGAGATCATC
GCCATCAACACCACCATCAAGCTGGACTTCATCGGGATCATCATCATCAC
CACCACCATCAGCACCCTCATCCCATGTCCATATTGTTGTAACAATTGGG
TTGAATCTTGCATAGTTCATAGGGGAAACTTTTTCCGGTGTTGATTACTC
TTTGTAGTTGATGCTATTGAGTGAACCATTGAATTATTGTTTATGTTCAG
ATTGTTATACATCATTATTCCATCTCTGATCATGATCCATATGATGTCTT
GTGAGTAGTTCGTTTTGTTCTTGAGGACATGGGAGAAGTCATGTTGTTAG
TAGTGGAGTTGTGTTGAGAAAGATTCAATAGTTTGATATTTAAGTTGTGG
TGTACTTATTCTAGTGGTGTCATGTGAATGTAGACTACATGACACTTCGC
CTATATGGGCCTAGGGGAATGCATTGTGTATTTGGCTACTAATCGTAGGG
GTTGCCGGAGTGACAAAAACCTGAACCCCCGTTAGAAAACCATTGCACAA
GGGACGTAAGGGTCTTAGAGTTTAAAGCTGTCATTCGGTTTCTACCTTAA
TTATTTTCTTGTACTTACAGATGTTTGCAAGGGGTATAATCATAAGTATG
TATTAGTCCTAGGAAGGTCGGTACATTAGCACAGGTTCACCCACACAACA
CTTAGCAAGCTAAAGAAGATTAATCAACTATATGAAACGAAAGCACTTGA
CGGTCTTCCCATGTGTCCTCGAGAACGTTTGGTCATCTTAAGTAATACAC
CCGGCTTGTCCTTTGCTGCATAAAGGATTGGGCCACTTGCTGCATGTATT
CCTACTGTCTTTTATTTACTCGTACTTTGTTTACTTGCCTTATTAAAAAC
CCCTAAAAATCCATTTGCTAAGTATTTGCAAAGAATTCCTGATCCATACC
ACTAGCCAGCACCTTCTGCTCCTCATTGGGTTCGACACTCTTACTTATCG
AAAATACTGCGATACACCCCCTATACTTGTGGGTCATCAAGACTATTTTC
TGGCGCCGTTGCCGAGGAGTGAAGCGCTATTGGAGAGTGGAACTGGTAAA
GGAAACTTCTACTGTGAGTATTGTTTACTTATGCTAGTTGCTTTATTTTC
GTTATGGATAATTCGCTGAGTTTCTTATTTGGTAATGCTACTACCACTGC
TAAGGCAGTAGATAAACCACCACCTGCTGAGAATGATGTTTTTAAAATAC
CTACAAGAATTATTGATCGTGTTATGGATAACTACTATGTTGGGGATAGA
ACAGTCCATCCCGGTGATCATTTAATCTTTATACACAAATTATGCGGGTT
GTTCAAGTGTGCAGGTATTACTACAGATCAAGTTAAGAAGAATTTATATT
CATTATCACTGAAAGGAAGAGCTGAGGAATGGTATAAGCTGTTGAAGAAT
GGTCAAGCTCTGGAATGGGAGGAAATAGTGCCTCTCTTTTATTCAAAGTT
TTATCCTCCTAGTGAGATTCATAAAGATCGGAATCAAATATACAACTTTT
GGCCTCTTGATGGAGAGAGTACCGCTCAAGCTTGGAGGAGATTGAAGTTA
CTAATGCTCAAATGTCCCATTCATGAGCTCCCCAACAATATTATTATCAA
CAACTTTTATGCAAGGCTTTCTCTTCATGATAAAGATTTATTGGATGCTT
CTTGTGCTGGATCATTCACTCGCATGGAAGAAGAAGCTAAATAGGATCTT
CTGGACCGTATTCAAGACAATGCTGAAGCTTGGGAGAATGACAAAGGTAG
AAAGTCAGGTATAAATTATGATTATGAGTGCATTGAATCTTTTATGGGAA
CTGATGACTTTCAAAATATTAAAAATGCTTATGGTCTAGACTCTCAAGAT
ACTGATTCTTATTTTAAGGCTTTTGCTTCCTACATTGAAGTGCCTAAAAA
GAAGTGGAATAAGTATCATGAACCTTATAAAGATATTGCTAAGAGTGTTC
CTGCAAGAAATACTGAAGTTTATACTGCTAATCATGTCTTACCTGAACCT
TATATTGAGAAAATTCCTTTCCCAGTTAAGATAAAGGAACATTCTATGAT
AGCTAGTATGGTTAATGAAAGTATAATCAAAGCTGTTGAACCTGATAAAC
AAATGGTTGATGAACCTATAATAGCAAATGTGAAAGACTTTGTTACTAGA
TATGAAGAAGAGGGACACACTATCCTTTGCAAGGATACCTCTAATATTGT
TTCACAAAGTAGTGTTATGAGAGCTAGTATTCCTGTGTTTTCTGTTAGAA
TAAGCGATCATTGCTATGATGGCCCTTGTGATAGTTATATTGTTAAGTTT
ATGCATGATACTGAAAGTTATTATGAGAGAGGGAAAAGTGTTCTTATGTA
TCTCAATAATATCAAGTTTCCTCGTTTTATGCTGGAAGTTTTTATGTTGC
ACTTCGTTTGCCTTCTTATGCTTGTAGCCTCTGGTTTCTACAACTTGTTT
GTTTACAAAATTCTCTTGCATAGGAAGTGGGTTATACTTAAATGTGTGTA
TTTTTGCTTCTTAATGCTCTCCTTCACCTCAATTCATATTCTTATGTGAG
CATCTTCAAAATTCTCATGCCCATCTTAATGGCTATACAGAAAGAGCTTT
TTGGGAGACAACCCAATTTATTTGTGTTTTCAGGTTGTTTTTGTTTTTAT
TTGAGTCTTGGAAGTTATTACTTCGGTAATAACCTCTCCTTATCCTTTTT
GTTTGGTTTTTGTGTCAAGATCAACCTCTAATGAGAGAGAAGTAAGATTT
GGGGAAGTTGTTGTCCCGGAACAGATTTTTGTGCTTCACCGTAAAAATTC
GTGAGAGATCTCTGTCTGTCGGATTGAGCTGTAATTTTTTTTGCTTCTGA
CCCAGGTTGTTATTTAACTTTTGTTAGTTTTGCACTTTTTTATTTGAGCA
ACATAAGATTTTCAAAAAAATTGATCTTTACCTGCTGGTCTGTTTTGACA
GATTTTGCCACTCTTGCATTTGCTTCTTTAATCGATTTCCTTTTTGAATT
CTCTTTAGGTTTTCGGAAGGAGTTGTTACAGTAGCTTATGTTTTGATGGT
TTTCAGTTGAAGTTAAACTCAAAAGGTTTTATCACTTCACTTATACTAAT
ATTGCTAATGAGAACTGTGTGAAGTTTTGTGTGAAAGAAATTTCTAGGAA
GTGGATATAATGGTGCAATAAGGAAGAGAAGGGTTTTATGACTCAAGTAA
TAAGTGTATGAAGATGAAGATATTGATGTTATTCAAGTGGTGACTCCGGA
AGAATCTACTAGATACTAAATTCAGAAACCTGCAGAGTCCGTTTTCAAAC
AGGTAACAGTTATGGTAAGAAAAGTTCCGCGAAAATACTATCCAACTATA
TTTTGCAGTTTTTAGTCAATATGGAAAGCTACAAAGCGAAAGAGGGACGG
AAACGGAGTTAGGGTGGCTCACACCACCCTGTGGCGCGGGCCCTCCCCTG
GCCGCGTCACTAGGTGGTGAGTCCACCCCAGACTCCGCCTCCGACTCATT
TTCTCCCAGCACCTTCCTTTCATCATGAAACTTCGTAATATATAATCCCC
TGGATCTCCCGAGGTTCGTATATTGTGTTTTCCTCGTGTTTTCGTTTCGA
TCTGTTTCTGACAGGTAGAGTCCCAGATTTGGAGCTACAATGTCTTCCTC
TGGACCAGCCAAGGAAGATTCTTTAGAGGATATCATCAACCCATATATGA
GAGAGCTAAAGATTCATCCCAAGGAGTTGTTGCTTGAAGATGGGGAACTC
CGGATAAAAGAGGTTCGAGGCCCTAAAGGTAAAGGAAGTCTGGAGGACAA
GATGGAAGCTCTGGAGCAAGAAGTCTTTAGGTACAAGAAGATGGTGGAGC
GCGAAGTGGATATCACCCATAAGATTTGTTCCAAACTCATCGCCGAGCAC
CAAAAGGAGACTGCTGAACTCAAGGATGAAGTTCTCTCACTCTGCCAAAC
AACCAACGAACCGCAAGCACAGTTCTATGGCGTTCAAAATCAAAACTATG
AGTATGAAGTTAGGTTTAAACGCATAAGTGTTGCTGCAAGTTTCAGGATG
CTGGAAACCACGATGTCCTTTGTTGATGGGAAGCCCTTACCCTGGAAGTC
GTACGAAGATGAGATATTACCACCACCACCGAAGGAGTAATTCGTCATCA
GGTTTGGCATCCCCTTGGTTTGTTCCAAGCTTGGGGGAGTGTCACGGTAT
CACATCACTATTTTCTATCTTTTTACTTTATTAGTAGAGTCATATCATGA
ATAGAGAAGTTATTATGTAGGATGGTTTGCATTATGGAAGTGTTCCATCT
CTCGTTAGATATGTATCCCTTGGTGTGAGTTGCCGTTATGGAATATTAAT
GAGAAGTTCTATCATTTACTCTTTTGCATAGCTTATATTAGTTTTCAATT
CGTGGTTATATGATTGATCTTGTTGTTAGTATTGGTAGCACTTTGGGATC
ATTGAGTTAATTTAGTTGGTTTTGGCAAACCTAGCTCGGTCAGTTTCAAC
ACTATTTTTGAGAGTTGAAAGAAAAGATAAAAGTACTCTAAAGAAAAATT
ATTTCATCATCTTTCTTTATTGATTTGCTCATAAGTCTAGTATTCTCTAG
TTAAGATCTTTTGTGCTTCCAAGGAAAATTGCATGTTTATTTTTATCACT
TGTATGTTTGTTTGTTTCCTTCAACTCTTGTACTTGCTAGCCAAAGACCT
GTACTGAGAGGGATTTCTTCTCGTGCATCCACTCCTTAAAACCAAAACCT
TTGCCATTTGTGTCCACCATACCTACCTATTAGCATTATTGCTATTCCAA
GTAAATTCTTGTTTTATCTACAATGACAAGAGCTTACTCGTGACTGAAGT
TGAGTAGCATGAGGTTCGGTACTCATAAGTAAGGGGCATGAGATTTCAAC
TTATAACTTGTCAAGCATATCCTCTTAGTTGTGTCACTTTAACCTTAATA
ATCACCAAAAGATGCCTATGATAGGGGCAATGAGAGCTGAAAGCTAGTAA
GTATCATAATTTTTGGGAGCTCTTTATGAGACTTGCAATCTCTGCTTCCC
TCTGTGAAGGGCCTTTCTTTTTACTTAGTAGATGAGTCGGTAAACCTATT
CCCTTCTATCTCACCAAGTATTTTGAGTTGTTGTGTTTCATTCATTCATA
TGATGATTTATCCAATCATGTTTCTTATGTTCCTTGTTTTGCACATTGCT
CTTACCTTGATGATTACTACTTTGAAAGCTATCATTGAAAACCAGCTATT
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CCATTACCAATTATGATTTACTTTATGTATCTTTATTGTGTTTCCTTTAC
TCATTGCAAGTTAAGTTATATAATAGTGAGTTGTCTTCTATAATGATCTA
TGTATTGATGAATGTGATGCTTCTTGTCCGTATTATTTTATCGACTCTTC
ACTCCATAAACCTGAGGTCATGTTTATTGAGCTCAGTTTCGCTTGGGGAC
AAGCGAAGTCTAAGTTTGGGGGGAGTTGATACGTCCATTTTGCATCACTA
TTCTATGTCATAATTCACTGTTATTCATTGATATATTTCGTATTGAGAGG
TGATACTTATGTTATTTCATCTGTTTTTGCATGGTTGATGACTTTTGGAG
CATGGACCGTAGTAGTCAGGATTCTGATGAAAAAGGTGTTGTTTGGAGGC
AAAATTCGCGAAGATCAGAAAATCCGAAAAAATACATGGAAAATCCTATT
TTCCCAGAAGACGGAGGAAACCAGAAGGGGGCTGGAGATGGGCCATAGGG
GCCCCACACCACCCCTGGCGCGGGCCACCCTAGGCCGCGCCACCAGGTGG
TGTGGCCGCCCTGGTCCACCCTGGCACTCCCCTCTGGCGTATATATTCCT
CCCAAAACCCTAAGACTCGGGGAGCAACCACAGAAAGATTCCGCCGCCTT
TGTGGGGCGGAAAACACCGAGAGAGAAAGATCTCTCCGGCAGACAGATTT
CTACCGGGGGAATTCCTTTCCGGAGAGGGGAGATCGTCGCCATCAACACC
ACCATCAAGCTGGAATTCATCGGGATCATCATCATCATCATCACCAGCAT
CATCACCATCAGCACCCTCATCACCATCTCCATATTGCTATAACAATTGG
GTTGAATCTTGCATAGTTCATAGGGGAAACTTTCCCGGTGTTGATTACTC
TTTGTAGTTGATGCTATTGAGTGAACCATTGAATTATTGTTTATGTTCAG
ATTGTTATACATCATTATTCCATCTCTGATCATGATCCATATGATGTCCT
GTGAGTAGTTTGTTTTGTTCTTGAGGACATGGGAAAAGTCATGTTGTTAG
TAGTGGAGTTGTGTTGAGAAAGATTCAATAGTTTGATATTTAAGTTATGG
TGTACTTCTTCTAGTGGTGTCATGTGAACGTCGACTACATGACACTTCAC
CTATATGGGCCTAGGGGAATGCATTGTGTATTTGGCTACTAATCGTAGGG
GTTGCCGGAGTGACAAAAACCTGAACCCCCGTTAGGAAACCATTGCACAA
GGGACGTAAGGGTCTTAGAGTTTAAAGCTGTCGTTCGGTTTCTACCTTAA
TTACTTTCTTGTACTTACAGATGTTTGCAAGGGGTATAATCATAAGTATG
TATTAGTCCTAGGAAGGTCGGTACATTAGCACAGGTTCACCCACACAACA
CTTAGCAAGCTAAAGAAGATTAATCAACTATATGAAGCGAAAGCACTTGA
CGGTCTTCCCATGTGTCCTCGAGAACGTTTGGTTATCTTAATTAATACAC
CCAGCTTGTCCTTTGCTGCATAAAGGATTGGGCCACTTGCTGCATTTATT
CCTACTGTCTTTTATTTACTCGTACTTTGTTTACTTGCCTTATTAAAAAC
CCCTAAAAATCCATTTGCTAAGTATTTGCAAAGAATTCCTGATCCATACC
ACTAGCCAGCACCTTCTGCTCCTCATTGGGTTCGACACTCTTACTTATCG
AAAATATTGCGATACACCCCCTATACTTGTGGGTCATCAGCTACTCATAC
ACAAAACATTGTTTCGATGTTGCCATGGAAGGTATGAAAAATGAGTGCAT
CGAAGCTTGGGAGTGGCTTTGCAAGATTCCTGTTGAGTGTTGGGCTAGAC
ATGCAATGGATCACAACTGGAAAACAGATCTTGTGGTCAACAATCTGAGT
GAATGCTTCAATAGGATGATACTAGATGTTAGATCAAAATCTATCAAAAT
AATGATGGAAGGATTAAGAAGCAAGATGATGGCTAGATACAATGGAAAGA
GAGTTGGTGCAAGGAATGCCATGTGGAATGTCACACCCACGCCTATGGAG
AGAAGCTGGCTGAGAACAAGAAGTGGTCAAGGCCATGTAGATCAGTACCA
TCTAAAGATGGCCTATGGTAGGTAACAAGTGGCCTGGAAAATATTTATGC
TGTGAATTTGACTATAAGGACATGTGGGTGTAGGAAATGGGATATTACTG
GAATTCCCTGCGACCCTGCAATATCAACCATTTATAAGTCATATCAGCAT
CTAGAGGATTTTGTTCACGACTACTTCAAGAAGCCTATGTACCTAGAAGC
ATATGATCTTGTCATATATCCAGTGCCTGGTCAAGATTGTTTTGAGTAAA
ATAGACACATCTGATATTGATCCACCAGTGTTCAAAATGTTAGTTGGAAG
GGCTCAAACCAAGAGGAGAAAATGGTAGTCTGAGGTGCCACAACCCAAGT
CCACCTCTAGGATGGGGTCAATTACTTGTAGCAGTTGTGGTAGATTGGGC
CATAAATATACCAGTTGTGATCAACCACTCAAACCTGCATTGCACCCGAG
GAAAAACAAACATATGGTAATCATTTGTGACAATTCATGTGAAAAGTAAT
TGCCTGCAATTTTTTACTAACCATAACTACATCTACAGGAGCAAAGAACC
GAGGGACAGGACTCTACGACACCAGCTACTACCCAGCCACCATCCATGGA
TACTGCTGCTCCCAGGCCATCATCTACGGCCGCTCCTCGTACAAGGCCAT
CTTCATCGGCTGCTGCTGCCAGGACTTCTTCGGCAGCATCTGGCGGTTCA
TCTTCGGCAGCAGCCCAACCACCATCTTCGGCACCACGGCCAGCTACAGC
TGCAGTGCATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.