Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE020418

[Submit comment/correction]

Sequence	AE020418
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE020418
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTTGTTCCGATTTTAGTCTCACCGCTGTCTTTTTCTTTAATCTCGTCAC TGCCCAGTCAACGACACGGTCCTCCCGATTCTGCTCCCACGCATCGCCAT CGCCTCGCCGCCACCGCCGCTCACTCCTTTCCCCTAGATTTGGGAGTCCA CACCCGGTCTCTGGCAGCAGGAGGCTACCGCGCGGGAGCTCAAGGCGCGG GTGCAGTGCAAGCGGTAGGAGGCCGGGAGCAAGGCGGCGGAGCTCGAAGA CAACGGCGAGGAGAATGTGAAAGCGCTGGCGGCGGAGGCTGCGTTGCTGC GGAAGGCGACCGCCAGGCTGGAGGAGGAGAACCAGATAGACGATCTTCTC CGCTGCTCTGTCCCCCACTCCATTCCTCTGGCGCTGGCCCTCTGCTCTCC GTTGGTCGAGCTCTTCTTCCATCATCAGCACAGCCCACTGCAGTCTGCAG GTACTCTTGCTTGGTCGAACCCTCTGCCCCTCCATATCTTTTTAATTGTG TCGACTGTGTACGTGAGAAAGCTGCAGCCTACGTTTCTTCTTGCTCGATT CACCTTGTTTATTTTTTGACTGTCACGGATCTGACCTCTCTCGATATATA TGCCATGCTTATTGTATAGTACAATTTCAACATGTTCTTAATTATTAGCT GCTGCTAGATGTGTCTTAATCGCTGAGGAATTACTTTTTTCTTCAGCTAT AGCGACACGTCAATTATTTGCTATATATCTTCCGACAGCACATTACACAG CATATCCATATACGTGCACTTACTGTTTTTATTACTAGGAGATGGAGAAT ACAACGTTGGACAGGTCATATCACACGAGTGGGGCGACATCACAGTTCAA GTTCGAGTTCTTAAAAAGGATTACTAATAATTTTTCCGAGGACCGTATAA TTGGCTCTGGTGCTTATGGAGTTGTTTACAAGGTATCCTTCTTACTTGCA TTCTTTACTTGGGCTTTCACTTTTCAAACTAGGCAAGACGAACCGCCAAT TATAAGAGCCCATGGACGCTACTAAAAAAGCATCTTTAAGCAGGGAGTCA TGGACAATGGGGAGGAGATTGCCGTGAAGAAGCTTGTATACATGCATCTA CACCATGACAGTGAGAAGCAATTTCACAATGAGTGTATTAACCTTATGAG GGTCCAACATCAAAATATTGTGCGGTTAGTTGGCTACTGCGATGAAACAC ATCGTCGATTGGTTGAATACAATGGAGAATTTGTTTTTGCCGACGAGAAT GAAAGAGCTCTGTGCTTCGAATACTTGCAGGGTGGAAGCCTTGACAAACA CGTCTCTGGTAAGATCATGCAATACATGGAGAATATTATTTGAAGAGAAA ATGTTATCTCTTTACTTATGATCTATTTTAATCAGTCCCTCAATTATCCT CTTTGTAATACATGCAGACGAGCCATGCAGACTTGATTGGGACACGTGTT ACAAAATAATTAAGGGAGTCTGTGAGGGCTTAAGTCACCTCCACAATGGA TACAAAGATTCTATTTTCCATTTGGACTTAAAACCTGCAAATATATTATT GGACAACAACATGATTCCAAAAATTGGAGATTTTGGTTTATCACGGCTCT TTTCTTCAACAAAAACATGTACCACAACAACGCCTATGGGAACAACGTGA GTTCATACCTGCCGTCAAGTAATCAACTATGTATATAATTTTGTTACAAA CTGTATTTGATACCATGCAGAGGATTCACACCACCGGAATACGTGGACAA ACAAGAAATCTCACCGAAATATGATGTGTTCAGTTTGGGTGTTGTAATAA TGCATATAATGGCTGGACGCAAGCACTACTATGACCATGTGGATACTCCA TCCAAAATCATTGAGCTTGTCAGTTAAATGTTTCTGAATCGTGAATACTT CTCCTTCATAAAGTTATGTTTTTTCTTACCCATGCTCTCTACCTATGCAA CATGTCAACATTTTGCTTCCATTGTGCAGGTATGTGAAAACTGGGAAAAA AGGCTACATGCAACTATGTGGTCACATGCATCAAGAGAAGTTAAGACATG CATTGAAATAGCGTTAACATGTGTGAAGTCTAACCGACAGGAAAGGCCTA CTATAAGAAAGATTGTTGATGATCTTAATTGGATTGATATTGCAAAGTCT CCGCTTACATACGAGGTATTGAAAGATGAGTGAGATTTTTCACTATCTAT GGCGACGTTTTGAAGGAATAATAGAGCTACGAACCAGTGCAAAATTGTTT ATGGTTATTTTTTTGCATATTGCTTTTACTGATAGGGTTTAGTTCTTTTA GCTATAATTAAAGTAAATTGTTGGATTTGTACTAGTAGTTCAGCATAACA GTTTCTCACATGACTAAATCGCCAATCATTATCATTGCCCACAAAATGTA TCAACTATTAAACCGTACTATGTATACTATAAATGCCAAAATAAATCCTA TGTTGTCCACTAAACATTTTGTAATTAGTTCCCTATAAATTGTTTCGCAA TAAGCCAATAACTTCTGATCAATAGTTTTTGTTTTGAGATCTGGTTTATG TATCTTTTAAAATGTTGTTGGTGTACAAGACTACATAATTTGCAGATACT ACCACATTAGAGGACTCTACGGATATGGGCTAAACCTCTTCAAATTTATT GTTTGTAGGCCACCAACTTAGAAAGTAGGGAGGCATTGGATTACAACCAA TACACAAACCCAGGTAACCATCTCGATTAGAACAAGATTTATGTGTTCCA AAAAATTGCAAATTTCAGTATGGGTCAATGATGAAGATTCGAAATAGTCT AATATTCTCATTAGTTACTAAGAATGTTTGACTCCTAAGGACACTTTCTC TTGTATATGAGACATCCAAGTTTGGACGGGGATTAGCATGCCATGAGGAA ATATTTTCTGTAAAGATATGACTCACTCCATATAAGTGTACATTCTAAAA TGGGAGTTGAGAAGGTTGTTGTACATGCTTTGGTACGCTTTAAATGCAGA CATGCATGCATTTTCCACATTAATAAAATATGTGGGTATAAAAGATCAGC AAATTTGTGTTACAACGTTAAAAAAATAACCCCAAATTTCAGTACATATA AATAATGGTTTCCATGTTCTGAATACTCCGCAATTGCATTTCCGATAATA AAAATTCCTAAATGAAAATCCTAAAGTGTGGTTAATTACATTTTAAGATT TTGCGCTTTTGAAATGCCTTAACAACCAAGTACTTTGTAATAATGATTTT TGGTTGATTGTACCTTTTGGTGCTAGATAGCGGGAATTATTATTTTTTAA CAATGTCTCCAATGTGTTGTAATAACATATAGCAATATTATTTTGGTTAA TCTAAACTGTCCTGATGTATCTGCTATCTCTCCAGTTTCGATGGGGGTGC ATGACAACACTACCGGGTTTGATTCAATGGAGGGTAAAGACTATATACGT GCAGTGTCGGACTTGGTGGGAGGCAATGATAGGTTGAGGTATGACCCCAT AGATTCTGTACAGGAGTCCAACGAGTCCATGAGGTTAACATATTATATGA TATCTTTCCTTTTCAGCAAGATGCACTTGTGTGCTTCTTACTTATTATAG ACTTGTCATTTGAATGTTATAGGGCCATGGTGGCCCGTGCCATTGGAGGG TGTAGGTTTTGGGGGGACATTTCTGGATGGGCATGGTCCCATGGACCTCC ACACCCTCTTATATATAGCATAACTTAGCCTTACATATTCACTCATACAC TGGAATGATCTAGACTCAGTAGGACACTACTACTATACTAACACTCCCTA GAATACTCTAGACTCTACCAGAGTAGTACTACTACACTAACTCAGACTCC AACACTCACTAGAATATTCCAGACTCTCCTAGGACACCACTGCTATGCTA GCCCAGTGTCCAACAGAGGGCATGCATCTAGAACTATTTCGGAGCCTCCA GATAAGATCCAGATATCTGAGGTCGACATCCTTGACGATGGCTATCGTAG GAGCAACACACATCTAAGGTTTATTTTTCTTTGAACAAATATGTTGTTTG AGATTTCAAGAACTAGAGCATTCTCATTTAGCCATTTCTTTTCTCGGCTG CTCTGCATTGCTGGTGCTGAATATGTGTGTAGTTGCAGCGATACGAGTTT ATATTTTTAGAGCCTTATCTTTTTCTTGTATGGTGTGTGCATTCTTTCAC ACTAAAAAGTATTAATTCGTCTATTTTGAAATAGGTGACGCTAAAAAAAG CATGCAGAAATATAGAGGTCCTTACATAAATAGTATTATTGAGTTTTCCC ATGAAAATAAGTTCTAGAATGGTGGAGTGGCACATACATGGAGCGCGTTG GAATTCGCTAATGTGTACACGGTGGTGCAATTGCGCCCATCTACTACCGG TAAATGGTGCTAAGTGAGACCTAAGTTTCATCTTTTTGTTTAGCAAGATG GCATACTCAATACAGATATAGAAAATTGTGCTATCTTTTTTTAATCCAAG CCGTTATAACTCAGCCTCAAAAGATGGAGGGCAATTTTTTTGTTACTTCG TGGAACTTCTAGAGACTCACTCGCGTCATATATCATTCTAATTAATATCG TAACAAACGTGTTAAGTGTTATGAGTTGGTCTGACACTTATCATAAACTA GCATTGCACTATAAGTTTAAGGACTTATAATACTATATGAACCCTTTTAA AAAACTAGAATTGCACAATAAGTTTAAGGACCTATAATACTATATTTTGA GGTTAACTAAATTATAGAACGAGATCACATAAACTAGAATGATATATATT TGAATTTGAATGTATATTGTTGTTCCAAATTTGGAGAACACATGTTTGAG TGTTATGAGTTGGTCTGACAGTAACAATCACTCAGCTATAAGAAAAGAAT AATTTAGTGTGTTGAATGTTTGCATAATCCAGTTTTTAAGTTATTATTAT TTTGATCAAGTTTACATTACTTGTTGGTTATTGGAGACTTATTTAAGCAC ACCTTGAAATCCATAACTCTCTTTTCGAATTTGGAGTGGTTCAAATGGTA ATTACACTACTTTGTTTCTTTCTATATGAGAAACTATAGGTGAAGAATAT AATTACACCACAAGCAGCTTATCGGATCTATACATTTAATATTATCTGTC CAAACAATACGCTAAGCTCATTCTCTCCACCTTGTCAACAGGGCGGAAGG AAATATTCATACTCCTGTCATAATGGATAATATTGGCAATCTTTTTCAGT GGGCTAGATCTACTATTTCATCCCAGTGGAGAGGCACACGGGAAAAAGTG ATTCATGATGAATTATTTCACCTCGAGACTGGCCTACAACACCTTGTGGA TACTCTTCCTGCAATGTATGACCTCATTGATCGAGCAGAGTGGAGGAGCC ACAAACGTCGTGTGTCTGAGCTCCTTTCAAACCTCAAGGATGCGGTGTAT GATGCTGATGACCTTCTTGATGAGTTCAGATGGTACATGCTAAATGTGAA ACTGGAGGGGAATGCAAGCCAATCTCTTTCAATGGATTTCTTCAATGGTG TCATTCAAGGAAGCTTTATGAAGTCAGTGAATGGTGTCCGGGATAGGATG GATAATGTATCCACTCGCCTTTTAAATATGGGGTTAAATGAAGTATCAAC ACGGTTTGACAAATCAGTCAGGCCAGAGACTAGCTCTTTCCCCAATGAAC CAAAAATATTTGGTCGTGACATGGAGTTAAAGAAGATGATTGAATTTCTT TGCAAAACTAGAAATAGTAGCAGTGCCAATCCGAAACGCCAGAAAGGAAA TAGTGCAGTTGATGTATCAACAAGTAACCAAGTTAGCAGTGAGTCAAGAA TAACAGATCTTACTGTTTTACCAGTAGTTGGAATTGGGGGTGTCGGAAAG ACCACTTTGGCTCAACATATTTGTAATGATGCACAAGTGAAGTCTCATTT TGACCTGATAATTTGGGTTTGCGTCTCAGATGACTTTGATGTGAAGAGGT TAACTAAAGAGGCCATAGAGTCCTGTCCTGAAAGACAAGCAACAACTGAA AATTTGAATTCTCTTCAAAATATTCTTGCTGATATAGTGAGTAGTAAAAG GTTCCTGATTGTCCTTGATGATATGTGGGATGATGTTCTGAAGGAAAATG GGCAGTCCTGGAAGAGATTTTGTGCACCTTTAAAGAATGTGCTATGGGGA AGCATGATGCTGGTCACTACTAGATGTCAGAAGGTTGCCGACAAAGTGGG GACGAGGGATCCCATTACATTGGAAGGTTTAAATGATGAAGTCTTTTGGA GTTTCTTCAAGCTATGTGTGTTTGACTCTGGGAGTTCCAATAATAATGAT CCTGAGTTAGAGCGCATTGGCAGAAGCATAGTTCCTAAGTTGAAGGGTTC TCCTTTAGCCGCCAAAACTCTTGGACGAATATTAAGAATGAACCTTCAAG TAGAACATTGGAATGCTATACTAGAGAGTGAACTGTGGAAGTTGAGGCAA GAGGAGACTGAAATCTTACCAGCCCTTCGGTTGAGCTACATGCATTTACC ATTCCATTTGAAGAGATGCTTCTCACTTTGTGCTGTATACCCGAAAGATT ACAGATTTCAAAAAGGTTGTTTAGCTAAAATTTGGGTGGCAGCAGGCTTT GTGGAACCTCAGGGCGACATGCCACTTCAAGATATTGGTTGTGAGTACTT TAATGACCTTTTATATCGGTCCTTCTTTCAGGAATATTACGGTAGTTACG TAATCCATGACTTGCTGCATGATATGGCCCAGAAAGTTTCAGAGGATGAA TGCTTCATCGTAAAAAGAATGAGTGACTTCAAAAGTATTCCGCGCAATGT TCGCCATTTATCAGTACTCTCTAGCACAGAAATTGACTATTCCAATTTGT TGGGTCTACGCTGTTACACAAAGCTCCGTACCCTTCTTTGTGATGTGCCT TTGGCGGATAAGAAAACTCCACATAGTTTGATGGCAGATTGGTGTGGTGA ACTTCTGCGTTTGCGTGTGATTGTTTTTGCCTCTACCCATGAGTTACCAG CTAGTGTTGGTAACTTAAAACATCTTCGGTACCTTGAAATCTCTGGAGCT TGCCCTTTCACGAGTCTTCCCGCTGAGTTCTGTTGGCTCTATAATCTGCA GATTGTATGTGTCGAGAAATGCAGGCTTGAAAGCTTGCCTACTGACTACA GCAAGCTGATATTTTTACAGAGATTTAAATCACATGGTTTTCTTTGTGAT TCAATGTTTAGAAGATCTCAGAGAGAAGAATTTCATTATAAAGTATTCAT TGATGCAAGACTAGGTTTTAGTTTTATAAAGAATATTAACCAACTCGGTG AATTGGTAGTATATAATGTCAAGCCAATAAGCAAGGAGCATGCAGCAGAA GCCCAACTACACAATAAGAAGCATCTTGGAAAGCTTATCCTAAGATGGTC TTCGTTGAGGAATCCAGATGACAATGACATAGAAGTGCTTCGATTTCTAC AACCTCCCTCCTGCCTCAAGTCTCTGCTCCTCCAGGGTTATCCAGGTGTG TCACTTCCAAGCTTGTTTCAGGCACAGAATGGACTCAAGAGCTCATCAGT ACCCAGTATCACAAATCTGATCATTGATGGGTGTGAAAATTTATCAAGCC TCGAACATGTTATACATCCAGCTTACATAGCATCCCTCAAGAAAATGACA ATTAAAAATTGCAAGAATTTAGTATCAGTACCAGCTGAAAGATTTGTGGA TCTCCGTTGCCTTGAAGAATTGGAGGTGCAGGGATGTCCAAAGATATATT CCCGAAGTTTGGTTGTGCCCTCTCTCGAGAGGCTTGTACTCCATAGTTGT GGAAATCTCGCAGAAAATGTTGACTGCTGCTCCCTCACCTACTTTTGTTT GTCATGCAACTACCTCACATCCATCCAACTACAGAAGTGGAATCTTCCAG CACTAGAGGAGTTGCACATTTCAGAATGTCGACGTCTTACATCTATTATT GGAAAATCTGGACAGGTCATCAAAGGCACTTGTAACGTTAGAGCATTCTC ATCTCTTACTTCTCTAACCATTGACCGGTGTGATACATTGTCAACCATTG ATGATCTCCTAGCAGAAGAATATCTACCTGCCATCAGAAGAATTCGTGTT AAATCTTGTCACGAGTTAGTGTCCCTGCCCGGTGAAAGGTTTGGGAATTT TTCTTCTCTGAAAGAATTGGAGATCTCTGGTTGCTATATACTCAGCTGGA GCAGGGGATTTGTGTTACCATATTCCCTCCAGATTCTCTCCTTGCGTTAC TGTGGGGATATCTCTGCATGGGTTCCCAGCTGCCTACAGAACCTTGCATC CCTTGTTAGATTAGAGATTCGTCAATGTCGGGGTATAACATCCATTCTAG GCAACTTTTGGAGCACTAATCTCACATCACTTGAGTATTTAGTGATTTAT AGATGTGCAGATATTGTATCAATTGGTGGAGAGAACACAATTTCAGAAAT AAAAAATGTCTACATTCACGGCTGTCCAAAGTTGGAGGAACTAAAGCAGC CCGTAAGAAGAGGCAGTTACTTATAGTATCATTGTAATGGAGCCAGTCTT CCTTACGGTATGTGTTTTTACACAAACTTCGTTCCAGATTGTACTGATAT TTCTTGCACTCGTGTGATCATTGTATGACTAAACACAAGTACACGTGGCG ATCCTTTGCTCATAACTATATATATGTGCACCCGTATTTCCAAAAGTTTA ACCACCCTTGACTTCACTAACCAATTTGTTTTTGTGTAGCTTTATATTAG ATCTACAACCAATTGGGGAGGAAACTCTGTGCTCCTGGCTGAATCAACGT GAGACCATGGCAGACCTTGTTACTCGAGCTCCTGGCTTAATCTATCCATC GGTCAGTCTGCGACTCATATTTCCGCTCATAAGTTGTGCTCTTTAGAATA CTCAGCTGCAGCTTGAGTTGCAAGGTACAGATAACGCCGGGGCATCGTTA AAAAGGAGCTTTCAGTCTCCCCAGATTTTTCATGCTCCATTTTGCAATTT CTATACCGTGCGAAATATGTGAGGACAAAGCATGCACGTTGTTGTACCTT CTGGAAGCGTGTATGTGTGCCATTGATTTGTCTCTTGCTCAGCCAGTGTA CTAAGTACAGTTTTAATCAGGATGTTCTCCTCCTGTGGGAAGCTAATATG TAGCCGTTCTCCTGTTAAGGCTGTAGCAGTTTAACATCTGAAGAGCTTCC TGATGCATGATGTTTTTTTCTGGATTGAACTAATCTGGTTTATTATTTGA CAATTGTACTCATAGATGCTTGGTCTTGTGATATCTGAATCCTCTTTTAC ATAGTATTTCCTGATAGTTTTCAAATATGCAGTATTCTGATATGTTTGAG AGTGCTGATCTGGTTTTTGCCAAGGCGCAACTGATTTCAAGGTCTGTAAC TAGAAGACCAGAATGCCTTGCTCAATGGAGATCTAATTTTGATGTGTACA AGTGTTTGAGAGTCCTGATCTGATTTTTTTATTTTTTTTGAAATTGAACT TGATGGTAGTATGGTGCCATAGTGTCATCTGAAACGTGTCATAGATAGTA TGGTGCCATATGTGCCCATTGAACCTGTAGGAGAGAAGGAGAAGACTGCA TCTGCCGACGGATTAGAATTTGCTTACAAATGATGAAAAATTACAGCTAT TTTGCTACATGGCTTGGCATGCCAACTAGTACTATTAGTTATCTTTGGTT TGCCCAAACGGTTGGAACTGGAGTATCTGCGAATGTTACCTCTGAATGCC ACTCCAGGATTACACACACAATAAAGAAAGAAAAGTGGAGAGACACATTT GGTCGTTCCTGCGTGCGATGCTTGTGTCCGCAAACTACCACAGCATTTTA TTGTCCTTGAGCCATTCCTTGTCCATTTTCCTAAACCAAATTGGCCGTGG AACTTGAGATGAGCACTCAGATCATGTGGAACAAAATCGTCATGACCAAA CAGAAATGAATGTAAGGACAAGCATTTTTTATGCAGTTGCGGGCTTTATC ATAATCACTTTAGTCTGTCCATCACATCACTTGATACTAGTCAGTCAGTG ACTCGGCGCAAATATGTGACTGTCGGTAGTTGGTTTTCAACTTAGAGATC GCTTCGATGCCACTGACACTCGTCATCATCATCCCCCATCTGAAACACCT GGGGGTGTATAAGGTGTGATGGAGAAAAGGAGAAGAGCTGCTCCGCGTGG GCCATGTCGCGGACATCGGTGGCGCGCGCGGAGGACGAGGATGGAAGACA AGCCGTGGAGGGCGGAGGCCGTGGATCTGGCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.