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GrainGenes Sequence Report: AE027941

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Sequence
AE027941
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE027941
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCACCAAAGCCACTCGCCTTCTCCACCTCCCCACCCCCCCTCGCCGGAAA
ATATCTTCGCCACGTGCTGCTGCCTGCGCTGTGGCCGACGAGAGGATGGA
CACATCGTCGTCGGGCGCCGCCAAGGCGCGGCGGGAGAGCGGCAGCGGAA
GCTGGGGCACTGCCGGTGGCGGCGGCGCCGACCCGTTCGACATCCCCGCC
AAGGGCGCCCCCGTCGAGCGCCTCAAGAAGTGGAGGGTAAGCTCGCGCTC
CTTCCTCTACCCTGTCTGCCTCCCTACCTGATGCGGGCGACTTTTGGGTA
GTTTGGGGGGAAAGCGAGTTCGTGTTTTGGAAACCGAGGGTTTCTGCTGC
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GTCGACTTGGAGCTGCCGACTTGCACTCCTACTCTGTCGTCGTGGCGTCC
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TGCTGCAGTAGGGGGTTACACTTCATTGTCATCTTCAACCAGTGCGAAAA
TTTCGTTCCAACTAAGTCTATTTGACAATGTTCCCTTCATTCAGTTCAGC
ACTCCCAGATATTGCAAACGACAGTAATCTGTTGTTACCATGTGCGACTT
CTCCAGATCTGCTTTAGGATGGCCTTTCTGCAAAGTTTTATTGTATCCGG
GGCCAGTGACCACAGCTGTCGGACCTCATTCACAAATTTAATAAAAGTGG
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GGTTTTGATCCATTTTTTCTACCTGTGATCAATCTCCTCAAATTTTGGAG
TTCAATATCGTAGCTGGCTGCACAAAGTTTGCCCATCCCTTCAGTTAGGT
TTTTTTGTAGGTAATGGAAGGATCATCACCCCTGCCTCTGCATCATACCA
ACATAACCAAATTTTATTTAGGCATGCTAAAGGCATCAATACTGAACGTT
GCTTAGTTTCTCAAAATGATCGTAGTTGTGTCTGTAGACTTCTTGCTACT
GGTTTTTGGAGAGATCACCTTCGAACATTGTAATAGGGAGGCCAATGTGG
TTGCTCATGAGCTAGCTAGGCATAATTTCAGTGATCGTATTGATTGTATT
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AACTGTGTTTGAGAATCAACAAAGCTCGCCCAATGGCTTTCCCTGATAAA
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TGTTAGTGTACTACTAGTGCACTATGTTCCTGCTGGATGTTATCAGCAAC
TGGAGCATCTCATTGTAGGCGACTGGACAACGATATTTTTTCTGCTATTA
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TTCCGGTACACCCTTGACCTGAAAAAAGAAGAGCAAAAAGAGGAAGTCAA
AAGGAAAATTCGAGCACAAGCTCATGTCATAAGGGTATTTTATCGCCTTG
TTCTATTTGTATTTAATTTTTGTTTGCGTATGCTGATAGTTTTACTTTCC
TCTTCAGGCAGCATATCGTTTTAAAGAGGCAGCTCAAGTAAATGTTCAGC
CAAAGGAGACAACAGGTACTCTTTCTCTTGTTACGTACTCACCTGTTATT
AGTTTTGCTTGTGCTCCTCCATAGGATTGCCCTTAGGGTTTGAGTCACTT
CATGTATTCCATCCAAGCGGACCATTTGTGAATGCAATATTTGACACTGG
TCATGCTAATTCAGATTCAGTTCCACATGTCGATGGTGCACTCGGTTTCG
GAATTAAAGAAGAACAGCTTACTGCACTAACCAGAGATCACAACTTCTCT
GCTCTACAGCAGTATGGAGGGGTGAGCTAATTCTGCTTTTGCTGCGTGTC
ACATCTATCTGTAATAGATTCCACCTTTTAACTTTCCCTACAGATTTCAG
GGGTAGCAAATATGCTAAAGACAGATACAGAGAAGGGAACAAGTGGAGAC
GAACCAGATCTGAAGGCAAGGCAAAATGCATTTGGGTCCAATACATACCC
CCGTAAAAAGGGGAGAAGCTTCCTGGTATGCAGATGGTTTTCTTATTATT
TATATGGGAGTTCTTATCTCTGGGGGTGCTCACTCCTGGTGTTTTGTTGC
TGTTATTCAGGCTTTCGTGTGGGACGCTTGTAAAGATTTGACGCTCATCA
TCCTCATGGTTGCTGCTGTTGTTTCACTTTCTTTAGGCATAGCGACAGAG
GTGTGCATCACATCTTTAGTTCTCTTCCTTGTGTCTGAATTTCTTGTTAT
CTATGAGTACTTTGACTTCCTTCCTGGCTATTTATTTGCCATCATTACAC
ATTTCAAATCTGCCCTCATTTGTTCAATTTTTGTTCACTTGTAGTTTTGA
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AACCGTTAAATTGATCATTCGTTATCATTCTCTAAGCTTGTTATGGTTGT
ATAACTCCCATTATGACTTTTCCTGGTTTGTAGGGGATAAAAGAAGGGTG
GTATGATGGAGCGAGCATTGGCTTTGCTGTCCTCCTCGTTGTATTTGTTA
CAGGTATCGCCGGCGCTAATCACATTTCCTGTCTAAGGTTATAATTGTGA
GCAGTTGTAAACTTTGTAATACATATTGATTTCATTGCAGCTACTACTGA
TTACAAACAGTCACTGCAGTTTCAGAATTTGAATGAAGAGAAACAAAATA
TCCACTTAGAGGTAAATTTGTCGCACACCACACTATAAATAGTTTCTTCG
TTCCCAAATAACGGCCCAAATAATCTCATTCAGGTAGTTAGAGCTGGAAG
GCGAATCAAGGTATCGATATATGATTTGGTTGTTGGCGATGTCGTGCCTC
TTAAGATTGGTGACCAGGTACAAAGACAGTTGATCATCATTTCATACCAA
GTGGCTGCAAGCAGTTTAGAAATATGAGGGACAATTTCATTGTTCAGGTA
CCTGCTGATGGGATCCTTATCAGTGGTCACTCCTTCTCCATAGATGAATC
AAGTATGACAGGAGAAAGCAAGATAGTGAGTTACCCTAATACATACTTTA
AGAACTAACTTACTTGAAAAGTTCTAAGCTTATACTGCAAGGACATGGTT
CATTTTAGGTAAACAAAGACCAGAAGTCACCGTTCATGATGTCTGGTTGC
AAAGTTGCTGATGGATATGGTACAATGCTGGTGAGTTTGTCTCTGTTCCT
ACAAAATAGAGAATGAAACATGCAGCTACTGTTAAGGTCTGAAACTTCTT
ATACTCTGTGAAGTAGAAGTGCAGTGAATGTCAAATACAGTTAACTGATA
TGATTACAAGATGATCAATTATTGCCGCTTGAAACTATTTCTTTGTGGGA
TCAGAAGGTATCCTGATGCTATATTTGTTGGTAGTATGTGCTGATTTTGG
AAGTTTTATCGTAGTTAATAAAAGTTGCATCTATTAATTTTGTAAGTTAA
TCATGCGTACCTCATGTACTAAAATAACAAGTCTTACGAGTTACATCTGT
AAAGCCCAGCTTGGAATATAACAATAGTTTGACTGGTGAGTATAGTTGAC
TCACACCTGAGTGAGCTTGAGCTCATAGCGCAGTTATTTTGTGTTTCGTA
GTATGTATTTTGAACAAGCTCTTTAATCAATATATAATGCAAGGGCTGGC
GACACGCTAGTGAGGGCTCTTATGCGAACATTGATCATGATAATTTTACT
GTATAATATCTAGGTGACTGCTGTGGGTATTAATACTGAATGGGGATTGC
TAATGGCCAGCATATCAGAAGATTCTGGTGAAGAAACACCTTTGCAGGTT
TGATCTCATAATTCTTACTAACCTTGCATGAGCACATGCGTTGGCATGCT
TTTTTGAGCACATGTGTTGGCATTCTTGTATTGTTCTTGTGTAGGTCCGC
TTGAATGGTGTCGCTACCTTTATTGGAATAATTGGTCTTTCTGTTGCTGT
TCTTGTTCTTGTTGTCCTCGTGGCCAGGTATGATTGATGCATGTTTTAGT
TTTGCCAAGTACCTTTTTGGCTTATCTGTGTCACTATACTTTCTTCTAGG
TACTTCACTGGGCATACGTACAATCCGGACGGGTCTCCGCAATATGTGAA
AGGAAAGATGGGTGTAGGTGCGACAATACGTGGAATAGTTAGAATCTTCA
CAGTGGCGGTAGGTATTAGCTTTACTATGCATGGCTGCCGGTTCAGTTTT
GACATTTTCTGTTATCTTACCATCTTGAGATGTAATTAGGTGACCATTGT
GGTTGTGGCTGTTCCTGAAGGACTTCCTTTGGCTGTCACATTGACGTAAG
CATGAATTTACTATAATTTACTAGTAGCACTACTAGCAATAATTTATGCT
GAATATTTCTTCCAGGCTTGCTTTTTCGATGCGTAAAATGATGCGGGACA
AAGCTCTGGTATGTTGTGATTCCTTGCATGCTTTTGGGGTACTTGTTGTG
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GTCAGGAGGCTTTCAGCATGCGAGACAATGGGGTCCGCAACAACAATCTG
CAGTGACAAGACTGGAACTTTAACTTTAAATCAGGTGAAAATTCTGTCAT
AACTTTCTCAGGACTGTTCTCAATACTTCAAAATTCAAGATAGGGAATTG
TGATTCTTGAAATATGCTTGGCCTTGACTTTCCTCTTTCTTCACTATCAA
TGTTAAGATGACTGTTGTCGAGGCATACTTTGGTGGAAAGAAGATGGTTC
CTACTGATAACACTGAGATGTTATCTGCTACTGTCTCAACCATGATTATT
GAAGGAATTGCTCAGAATACATCTGGAAGCATCTTTGAGCCTGAGGTCGG
TCAATACTTGTATTTTTCCCCTTTGATGTTCAGTTGATTGTTCCTGCTTG
TCATTTACGTGACCTTCACCTTTTCTTCCATGAAACCAAACATCAGTTTT
TTTCGCTCTCATGGTATGGATTAGCCTGGTGGCTACTGACTTTTGTTCAA
TGTTGCAGGGTGGTCAAGCTCCAGAGGTGACTGGATCGCCAACTGAAAAG
GCTATATTGTCTTGGGGGTTGCAGGTACATATACGACCTCTTAGTGGCCT
GAGCCTAGATTCTTTCTATCGCTTGTGCTTGCTAACGATGATCTGAATAT
TTCTACAGCTTGGTATGAAATTCAATGAAACAAGATCGAAGTCCTCTATT
CTTCAAGTCTTCCCATTTAATTCGGAAAAAAAGAGAGGCGGGGTTGCAGT
GCATGTGGTAATTTATTTTATCTGAAGCAATGTCAACTTCGCTTCTGGAT
AAGCAATAATGTTTGACTGCATCTTCCTCAATGTACCTTCCCATGATAGG
CTTATAGCATCCCTGTCTTGATAGTGTACTACCTCTGTTCGGGATTATTA
GCCCTAAGGGCCAAGTTGCTAATACCAAGACACTATAACTCTCTCTCATT
ATTCTTTGCATGCACTAATAGTCTTATATGCATGAGAGAAGTGAGAGAAA
AGGAGAACATGCATTGGACGAGAAAGCCTAATAAATGAGATAACCCTTAT
AATCTCAAACAATATAAAAAAGCTCTCTGGACCTAGACCTATGGCCTCAA
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ACATTTACAACTGACTACAGCTAACGATGTACATCCTTGCCTTCAAAGGC
TTTAACAAAAAATATGAAAATAGGGCTGTGCCGTGAACTGTTGTTTGCTA
ATCTGTGTTCTCATGCATCTGATTATTTTCTGTGTCTTTTCGCGAGTTGA
TTAATGCTCTTTCTTCTATTTCTGGAGGGTGACTCTGAGGTTCATGTTTA
CTGGAAAGGAGCTGCTGAACTTATTTTGGAGTCATGCACAGATTGGCTTG
ACGCAGATGGTTCAAAGCATTCAATGACCCCTGAGAAAGTAATTTATTTT
TCTTATATTAATGATTCACTCAAGTACACAATGGTTTTTTAACTAACTAA
TTAATCATTGTTACAGGCTGGTGAATTTAAGAAATTCATAGAAGACATGG
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AGTGATGTTCCAAATGAGGACCAGAGGGCTGAGTGGGTATTACCTGAAGA
TAACCTGATTATGCTTGGTATTGTAGGAATTAAGGTAAATTGCAAACATG
CATTTTATGCGTTTAATGACTGCTATTGATGGATTATTTTTATTTGATAG
CCGATCATTTCTTCTTGATGTCGTGATTAGAGGTTGACACTTGTGGTAGT
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CCACATGTCTATTATTAGTTCTACAGGAACTCACTCGTATTACGGCCGCA
TACTTTTGATTAGTCGCTCTATTTCTATGTATTTTGTAACTTGTACCCAA
ATTGTTAATAATAAACTGAGTTGGATAATTACTACTCGCATCTCAAACAA
GTACATGCTCACGTGAAGTAAACACTAAAGAAAAATAACCAACTTGTGAA
TTTCGCCCATAGTACTACCACATCATCATGTGGTAGTAGAGAATTTTCAG
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TGCTTAGTGATTATTGTAACATTTGTGGACTGTGGCATGCACAGAATTTG
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GCTTTGTTATTACTGTAACATTCGCCGACATCACGCAGCAGCTTTAATGA
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TGCAAGAAATTTACTACTAGTTTACACTATAGGATCCCTGCCGCCCAGGA
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TGCATATTCTCATGAATAGTGAGGAGTCAATAAACGTAAAGAAGACATGT
CTTTTATTTTGACGAATTCTATACCTTAGCCTTCATCCAGGGACATGTTC
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TGTGTATGTTTATTCTCCTTGACTCGCTGGCATTGTGTTGATAACTGCTT
ATTTTCTGTCAATATGGACGTAGACACTAATGTTTTGGTATGTAATATGT
GCGTTACGTGTGAAACCATGAACTGTTGTACCAGTCCACAACTTTCAGGT
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TTACCTATGATGATACTTGGATCCAGAAGGTGAGACGCGTGAAACCAAAA
TGCCAAGGAAAATGATCAATTGCTTTCATGTTGTGCGGATGGTTCACATT
AATTAGAAAATAAGTGAAAGTTCTTGACATATTCCCTAATATATTGACAC
ACTTGTATCTCATTTGTATGTTCTGGGGTCTTTTTTTTAGCACCCTCTGT
TATGTGCTAAATTGTTAAGAAATATAGCATACAATGTTCTCCGCACACGT
AAACAAGGTCTGCTTTTCATGATTATTTTATCGTGCTGATTGTTGTCTTT
ATACAGCCTGGTTCATACAGATATCTGTATGTTTTGCATATAATTATTTG
TTTTAGCCTTACAATTAAGTGTACTCTATGTAACTTGCAACAGGTGATGG
GGAGGTCTTCACCAAATGATAAGCTTTTATTTGTTAAGGCACTGAGGAAC
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AAGTTGCCAAGGAGAGTTCTGATATTATTATCTTGGATGACAATTTTGCT
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GTCCCCCTGAATGCTGTCCAGGTTTGGTTCCTAAGTGCCTGGGAACTTCT
GAATTTCAGCAAAGTTCTTTTTTCACTATTTTTCAGTTCTAGTTGCTCTT
GTTTTTGGACGTTTAACTGTAGTTTTTTAAGTTTTCTGTTATGCTCAGAT
TCTTCAAGTATTTATTAGACAAATATAAGCTCCTTGCTCTAGTTTCTGTA
ATGCTGAGTTATATTTTCTGTTGATTTTGCTCCCTTTGTTTACAGTTGCT
CTGGGTTAATCTAATCATGGACACTTTGGGAGCGCTTGCGTTAGCGACCG
AGCCACCGAACAACCATCTTATGCAGAGACCACCGGTTGGACGGAGGTTT
GTTCTCTTGACTTCTGACATCGTTCTCCAGATATCTTTCTTGGTTTCTCG
AGATAATATTTGAATTGATTTACCAATTTGTTTCGGGACTTGATAAGAAG
AATCATGTTTTCTTGGCCTAACTGCCTTAAGTAGTGACTATTTACAAACA
TTTTTTTTGAAGAAATGGATATACAATATTCTTTTCCTTTTCCTTTTTTG
GATGTAGCTGTCAACCACTGCGGTAGTGACTGTATACAAACAATTTTGTG
AAGAACGGATATACAATATTGTTTTTCATTTTTCTTTCTTGGATGTAGCT
GTGAACGGACCGAGGTTGAGTGAGCCTGGAGCTGGGCTGAAACTTGGCTG
TTCTATGCTTTTGTTAGCAGAACGTGTTGCACCCCATTGAACCAGCCGCA
AAAGGAAAAAAATAGCCTCTGGACCAGGGCTCGTTTCCGCTTGGTAACAA
AATCACGCGTGATTCATATGAGTACTAGAAATTGTGGGGATTCATCTCTG
ACCACTACAGAACACCAAGGCCAAAAAAATCAGCAAGACTAGGAGGTCAC
GGTGATCCTTCCTTGACATCTTTTGGGAGCAGCCAGGGCCAGGCCACTGT
GGAAATCACACTGCTAATTCATCCAGATGATAATGATCTTTATCTGCTTA
CTGTTAATCTGTCAAGACCAAGAGTTGGGACGTGTGTGGTACGTTGGGCC
TCGGTTCTGTGCGCTGTGCTGCCATAGTGTAGTGTAGGTGTGATGGTTTG
TGCGGGGTTACTCGTCTTGCTGGGCTTGCTGAACTTCTTGTCGGGCTTGA
GCTCGGTTTGAATCTAGCTCAAGTAGTTTGTGTTAGTACTAGTGCCATCA
AACTGCTTGATTACTTGCAGTTGTACTAAACATCTTCCAATACATTTGTG
TTGACACTAGTGGTAGCTTAATGATATTGCTTAACACATGCATTTGTATC
ACGCGCTGTGCTGGCGGCTTCTATTCTGCAAGTGTCAAAATTGCTTTTTG
CCTGCTGATGGTGTCTCAACCTGCTTGTTTTCAGGGAGCCTTTGATAACA
AATATCATGTGGAGAAACTTGCTCATAATGGTATGCTACTTACGCAATGC
ACTCTTTTCATATTGGAATCTGAATATCTGATATCTTTCTAATGACGACT
TCTTCCTTCAGGCTTTCTATCAAGTTGCTGTTCTTCTCACTCTTAACTTC
ATGGGTCAGAGCCTTCTGCAGTTGAAACATGATAACGCAGCGCATGCTGA
AACAGTGAAAAATACCTTCATATTCAACACCTTTGTTCTGTGCCAAGTGA
GTTCCTTCCTTTGCTCTAATCTGACTAGGAGATGCATACAGTTGATGCAG
TGGGGTTAAACTTGGTCACTCAATCTTGTCTTCCTCAGGTGTTCAATGAG
TTCAACGCTAGGAAACCAGATGAGCTAAATGTTTTCAAGGGTATTACAGG
GAACCACCTCTTCATGGCCATTATAGCGATAACGGTTGTACTTCAGGTAA
AGGCTCTAAAATAGTGTTTTGTTTATGGCAACTGCGGCTATCTTGGTTTT
GCTGTTGTCATGGGCTTATTCCTGTATTCTATCCAGGTACTCATCATCGA
GTTCCTTGGCAAGTTCACGTCAACAGTCAGGCTGAGCTGGCAGCTGTGGT
TGGTGTCAATAGGTCTTGGTTTTGTCAGGTAAGATTCTTCAGTTAGTAAA
GAACAGAAGGTTTATGATTCTGATGTGTCTTTTTGTGGAACGATTTTTTT
GGTATTATACAGTCAATTTTGCTGAAGATTTTGTAGATACTTTCATTTAG
AAAAGTAGCTAATGAATTTCTTGTATTTTATGCAGCTGGCCATTGGCACT
CCTGGGAAAGCTTATCCCTGTTCCAGACCGTCCGTTCTCAGAACTATTTG
CGTGCTGCTTCCCGGGGAAGAAACAGGGTATGTTTGAATTGCATCCAACA
GTGTACTTGTTTGCCGGTCTCTAGGGAGTGGAGTTCATACTTATACCATG
GGCCAACCATCTTGTGCAAATCTTCCCCTAATGACAATTTTTTTGTGCAG
CTGATGATGTAAAGGAGGAGGGCAGTGCTAAGCATAGTGAAGTATGAATG
AAGGATAGGCGTTGAGGACCTGATGCTGTTTTTTGGTCAAGGTTTAACAT
GATTGTTCTGTAGTTATGTGGTGATTTGCCCTGTAGATACTCTAGGCTTC
ATGTGGATAGGTCTCACTTTTGCAAACATTTGACGCTATCTTAACCACGC
GCACCACACCCGGAGGCTGACTTTGAAACTGGAATTGATCTTGTTTGTGT
AGACGAAGCTGGAATTTCGCTTAAATGGATGTTTGAGAGGAGTACTTATG
ATTCTCCTTTGTGTTTGTTCAACAAGTCCATCTATCTGGTTTTGTCATCT
CTGGCTGCATTGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.