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GrainGenes Sequence Report: AE021545

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Sequence
AE021545
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE021545
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCTCACACCACCCCTCTCGTATCTCCTCTCTCGAGCAGAAGGAAGCGA
AGCTGTAGTAGTCTCGTCACCGCTCACAGACCGCCTGTGAGTCGAGAGAA
GGGGACGAGGCGGAGAAGCCACCAAACCAAACAGAAAAAAAAAATACTTT
GGAGAAGAACACTCGCGCATAGGGCAGAGAGGAGGGAAGGGGAACCCTAG
TCAAACAGAGACGGATCTGGCCTCCGCCGACAACGACGACGACAACGATC
GCCTGGTACGGAGATCCCCCGCCAACCCATGACTCCTCCTACGATTCGGC
GAACCCTAGGACCAAACGCCACGCGGCTTCTATGCGGTGTGGATGAATTG
ATCGGGGCGGTGGTCGAATGACGGAACCCTAGGATGGATGCGGGTGGGCG
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CTGCCGAATTCGGGCTTTAATTGTGGGGTGTGATTTTGCCGAATCTGGAG
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GGGTTACGTCATGGTGTAGCGGTAGTAATGGAAGGGGTACATGCAAATAA
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TTGATATGCCATTGTTTATTTTAAATGTTGACTTGTATGTCAAGATTTGT
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TTTGTACTCCTGTTATAGATAAGTTCTAATTCAACATAGGTTAGAATCGT
TCCTGCAATGCTAGGTGTCATTTGTCAGATATAGATACATATTAATTCTG
GGTTGAGTAGTTCACCTGTGTAGGTCGATACGAGAAGCATTTCACATGTC
ATACGTTATCTTCAATTGTAGACACAAATGCAAAGTTTTATATTCCTTTT
TCGTAGTTGTGGTCGTCAATCTTGGTTGTGTCAACTGTCAAGTACAAATT
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TATTTAGATTTGTTGGATGTGTCCAGCTGAAGTTACTCCGATTGGTGTAA
ATAGCTTTTTATTTTGTTGTTGTCTTTTTAAATAATTGCCAAGTGAAGGT
ATCATTTACATCTATAGATATTTGCCCATTTTATTTGATGTTTAATTCAG
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CAGTATTATTTGCTGATAGGTACATATTCTGCTTTAGTTAGTTCATTATT
CGGTGTAGCTATGAATCATTTATTTGTGTACATAATCCTATTTAGTATAT
TGCTAGTTATGTTTTGTCATAATCAGACACTAAGCAATCCTCAGATGGAT
CCTGTTTCATCATATTTACAATAGATTACTATCATCAGACACTAGTACAC
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AGCATGCTGAAGTACACTTATATTTCAATCACGGGCTTAAAAATTGGACT
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CCTCAGCACATTCGACTCTTCCTCCAAAAGTGCATACACAGTTAAATCTC
GCGCTGGCCCCTTTCTTTCGTATTCCAGACAGACAAATACTGTGCACCCT
AAAAAATGCTGCCTAATTGGGTGTGCATGCCATGTCAGGATGCGAATGGC
CCTGGTTGGCCTGCTGAGCCACTAACCTGGCCCAAAAAATTGAGGCCGAT
GGGGCACGCGGCCTTGGACAAGATTTGGGTCACTAGAGCTGACACTGAGT
GACCCGTTGGGTTTGTAGGGCCGACTCAACTCATAGCCAAGCTTGTATCG
TCCACATGCCCCAAGATGTCCAGTTCGTCGTCTAACTGCTTGATGCATGT
GCATAGGATGACTCTGAGAAGCTAGCTTACATCGAGTAATTTAACTTTGT
AGCTAATGTTTGATTGATAGTCTAGTATCCGGCGCTGTGCACACGTACTG
GTTGACTCGCTTCCGAGCTGACGAACCTGCCGAGACGCACACGTAGTAGA
TAAGCAAGCAACTTAACGGATTACTAGCCAGCTAGCTTCATGTACACATC
AACACACCAGAAAATGATCGGTTACTTCTCAGCGATTTGCTGTTTCATTT
TAATCTTAGATCATTGTCTCATGTTGAAGATCAAAGATTGATTTTGGGTC
AACCCGTGGTACCCATCGGGCTGACGAGGCACGGACTTTTATTCAAATGG
GTCGACCCATGGCCTCTCAAATTGGCCTTGAGGCCATAGTGCCAGGTCCA
AGGCCAGGGCTGGGTCGGCCCATTCCCATCCTGAATGCCATGTACGCGGG
AGAGTCTTTATTGCTGTGCATGCGCGCGAGGCAGTTAGCAATAAACGAGG
AGACTGGCGCAATAAATCGAAGAGAGATTTAAGGGGAAGAAAAGGTTTTC
TGGGGGCAGTATTATAAAGTATTTTCGCTGCAAATCTCTCCTTAATCGGC
GTTGACCGGAACATATACGCCTTGTTGACCGGAACAGAGGGAGTAGAATT
CAATCGTTTTTTTTACATTGAAACTTGGGATTTTGACGGAGATTACCAGA
TTATACCTAGGACTGGGTGAAGTCAGTGAGAAGTTTAAGTTCTTTCATTG
AGATTACCAGATTATACCTAGGACTGGGAGATATAAACTTTCATCCACAA
CCCGTAGCCCCTGTTGGATAGGAAAACCTATTTTTGGGTTGGAAGAAATG
GAATCTAGTCTCGGCATACAAGCTTTTGGTTGTTGTAGTTTTCCTTTTTA
GCTGTTTGTCAAGATTGGAAACCTAATCACTGTACTTTTTGTTGAAATCC
AACTGGCATTTGCTTTTATCTTGTATATGCTATGTTCATATTTGGAACGT
AATTTGGGTTTATGACAATGCTATCTATTGCATGGCTGTATAACCTTACC
TTTGGAAAATGGCACCTACAGTAGCTTTGCTCTTTAGGTTGTGATGTTAA
CCGTTCCACCCAACACACCACCGTTATTTTTCTCCTTGTTATAGTCCACA
TATACTTATTTACTTTGTAAAGGGTCTGTCTGGATGATGATGTCATTTAT
CCCTGGAATCCAAATTCTTGACATAGGTAGGAAGTGGGTCGCAAGACGAA
GTGGGCTGGGTAAGGAATTCAGGGAAGCATGATATCCAGGTCACACCACC
TGACCGACATGTGTCTTCCTGCAGTACCATGCAATGGGATCTCTGCTTTA
ACTTTTCACTTGTTCAGCTCTCCTTCCTTGGCCTCTTGCTGGCGGCCTAT
CTCACTATTCTAGTAAAGCATCCACGCACCCCTTTTAATACCCTGTTCTG
TAGGGCCTACTGTTCAGTTTGTATAATACTAATATGTCATGCTGGTTATT
GCTGCAGATATCAGGTCAGTTATAGCTCTCCTTCATCAGGTCCTATTGCC
CTAGAAGATAGTTGCTGAGTCCACAAGTTGAATATTCAAGCTATATGCAT
TTACTCATGACATGGGTTCTCGAGGAAGGATGTTATTTGACCTCAATCAG
CTCCCAACAGAAGCTGAAGAAGAAGCTGCGGTTGTTGTGTCCCAACCTCA
ACTTCCTGTTCCCAATATATACCCCTCAAATTTGCTTCTGCAACAGGGAG
TGCCTCAGACACAAGGGATTTTGAACAATTATGCCTTTAAGCATGCATCT
TCTGGTTCTGGTTTTCAACCTTTTGTGAGAAGCAAAGTTTCACAAAATGC
GAAGACAGAAGATAATTTGGATGCTACTGCTGCTTCTACGTCTATGGCAA
CACTTTCTCATCACGCTGAGCCCTCCAATCAGATTCCTCAAGCAGTTGAA
AGAGAAGAGGGAGAGTGGTCTGATGCAGATTGTGCTTCTGACACCGCAGG
AAGTAGTGTCAGCAACAAAGAAGAGTCAGCTGATCTGGCAAGCACTCAAG
TGAAAAGAGAATCCCTAGAGAGAGAATCTGCTGCTGTGAAATCTTTTTAT
GCGATTAAAGGTGACCCCGCTGCTGATCCCAGTGACACTGAAATGGTTGA
TGTGTCTAAGGATCCAGCTGTACATGCTCCAACAGCACCTGAGAGTACAC
AAAATTCTGAATGTAAAGGAAATCAACTTGGGGATGATTTAGAACAGTCC
AACAAGTCAAAGGATGTCAGAGGAGTAGAAGCCAGTTATGCATTGAAGTT
TACAAACAACCCTGCAAAGAGACCTAAGTTAGATGAACACAAAGTAGCAA
TGCTTGGTAAAAAGCGGGCCAGGCAGACTGTGTTCATTAATGTTGAGGAT
GCAAAACAAGCAGGCACAATGAAGACGATAACACCAAGGAGGCAATCATC
TTTTCCAGCACCAATTGTTACACGCACGGTGAAGGAAGGTTCTCGTGGTG
TTTGTGAAAGAGCTGCAGAAAAACAGAGCCAACCAGTCGTCAGAGACCAG
AAACAGTCTGAACCGATTGCTTCAGAAAGAAGTAATTCTGCAGATCCAAG
TGAGCAAAATGGTGAACCCAATGGTGATTTTGAATTGGGATCTCAGGGCA
GGTCAAAGAAAATGAATGCTGAAGAACCCCCCTCAGATTGCTATCAACAA
TCTGTGCCTCGGCAGGCTTCTTTAAAGCAGCCCATGGATTCCAAGCAGTT
CAAGGGCAGACCTGTATCTTCTCAGAAAGCAGTTCTAACAGGACAAAATA
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GCTTCAGCAAATAGCACACAGTACAATGACACATCTATCGAACGACTTAT
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GTATTATCCATGTTTCTTTTGTATATCTTTGGTTAACCAACAAAATTGGT
TAATCTGGAAAATTACATACTCCCTCCGATCCAAATTAATTGACTTAGAT
TCGTCTAGGTACGGATGTATCTAGACACATTTTAGTACTAAATACATCCA
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AAATGCTATTATTCTGTTTTAGTGACTTCCACTAACATAAGAGGCACTGC
TACATCCTTTAAGATGAGTGCAGCCCTGTAAACACTTATAATTTATTTAT
AAAGATGCTGCAATTTCTTTTGTTGATGTCAACTTGTGTTTCTGTATTTA
AGACTGTTCTGGTTTGCTCATAGTAGAGCTCTTTGTGTTCTCTCATTGTT
AATATATTGCACGGTGGATGCATGTGTAACATGTTGTATCTAATAGAATG
ATTGCTTTTAGTTTGACAAGGCAAGTTGTATATTTGTTATGTGAACAGAA
GAGGAAGAACTTCAGTGTGTTCCTGGAAGCTTTGATTCTGCTGAGGAGTA
CATTAAAGTTTTTGAGCCTTTGCTTTTTGAGGAATGCAGAGCTCAGCTAT
ATAGTTCCTATGAGGAGAGTCTCGAGGCTGTATCAAGGGATGCACATGTA
ATGGTGCGTGTGAAAAGTGTGGATAGGCGTGAAAGAGGTACAATTGACAC
ATTTTTTTATTGACACCTTCTTTGTAGACCAATCATAAGAAAGATGTGTT
CTTGTATTCCATTGTTATCACCTGGCTTAAATATTATTGTGTATTCAGGA
TGGTATGATGTCATTGTTCTACCAACACATGAATATAAATGGACTTTCAA
AGAAGGTGAAGTTGCAATCTTGTCATTCCCTCGACCTAGTTCAGGTAGCT
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ATATTTCACAAATATGTTTGACAACTGTGCTTATTTCTGTTCTCTAGCAG
CCCAGTCTAGTAGATCTAATAGGAAGAGCTGTGCTTCAGTTGAAGAGGTT
GAAGCAGAAAGTGGACGGCTTGTAGGTACAGTTAGGCGACATATGCCTAT
TGATACACGTGAACCCATTGGAGCGATTATCCATTTTTATGTTGGGGATT
CATTTGATTCTAGCAGGTAATCTAGTGTTAATGTTATCATTGATCTTTAG
CTGAACTATGCAGGGTTGACCACATTTGTTTGCATTTAAGACGGTCTTTT
TGAACATAGGTAAACTATTAAAACGTATCTGCTAGTTCATTAAAATGCAC
TGTTACTGCTCATTTTGTAGAATGACAATATTTTGAAATCCTGATGTTCG
CTGAGTAAGACTTTGTCCACCAAGTGTGCCAACTTGGAGGATGGGCTGCA
TGGAGCCCTTTTTTGATTTTGTTGAAATCGAAATTTCGAAGTTTCAAAAA
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CAAAAAACCAATGCAAAATATTCTGTATTCTGAGCTGTGTAAAAAATGTT
TTTTTAGATCTGAGGCAGAACAGTGCTCATTCTGTAGAACGACAAATATT
TTGAATTCCTGATGTTTGCTGAGTAAGACTTTGTCCACCAAGTGTGCCAA
TTTGGAGGACGGGCTGCATGGAGCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTTGTTTAA
ATCGACATTTTGAAGTTCCAAAAAATTCTGAAGAACGTTCTTAGATGTAA
ATAATGATGGCTTCTACCTGTGAGCAAAAAACCAATGCAAAGCATTTTTG
GATCTGAGGTAGAACAGTGCGAAATTCAAGAACCTTGAGATTTTGTCATT
TTTTGTCCCAATAAACGAAGACTTTTTTCTGTAAATACTGCGTATTTAAT
TCCATTACCATATGATAATATTTGAATTTGATTTGTATTTCTTTATTGTA
TTATACCTTTATATATTCTAGATATATAGAATAGACTAATCTCGATTTGT
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TTTTCTAAAAAAGATTGAGCCGAGTTTAATTGCAATCAATTAGAGCCAAA
TCCGTGTTTTGAGAAAACAAGAGGGTTCTCGAACTAGAATACAAAGGAAA
AGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACGAATCGAGTTAAT
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ATCATTATCTAGGATTTTTTTTTTTTGAAATCCTAGATGTTTTCTTAGAA
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AAGTTGTATTTGATATTTTTTACAACCTGGATATAACCATTTTCATCGCA
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TGTCTAACTTATTACTCCAGTTTTGTTTAGCTCTAAGGTCAGGGTTACCA
GCAGTTTTGTTTTCACACCTACGGTTACATTACACAGTTAGGCATGCACT
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GTTAGGCATGCACACAAAACCATCTGTGCTGCAATTCTTTTCATCTTTCT
ACTTCTAATTTATCTAGTGCTGTCAACATTACCAGCTTAGTGGACGAGCC
TAAGCTATATTACCCGAGCTAAAATTCCATCACCCTAACAGACACTACTG
AGAGGTTCATGGTTGTACACATTTTTTGAGATGTTAGATGCTAGGTTGTT
TGGTCCAGTTTACTTGACTTTTTATCCATCGTTTGTGCATTTCTTAGATG
TGTAATACTTTTGCTTGTCTTTTTTGTGCTGTATTTGCAGTGAGACTAAT
GTTCTGAAGAAACTGCAACCTCGGAGTACCTGGTATCTAAGTGGTCTTGG
TTCTCTTGCGACAACACAGAGGGAATATGTAGCATTGCATGCTTTCCGAC
GCCTTAATGTGCAGGTAATATATATATATATTATACTCCCTCCGACCCAG
ATTAGTTGACTTGATTTGTCTAGATTTGAATGTATCTAGACTTGTTTTAG
TGCTAGATACCTCTAAATCTAGACAAAACCAAGTCAACTAATTTGGGTTG
GAGGGAGTACCTAATTGTTTTTTGGCTTTCTTGGTTAATATTTTTGGCTG
ATGCTGATAAAAATATTCACATCAGATGCAAAACGCAATTCTTCAGCCGA
GTCCAGAGCACTTCCCCAAGTATCAGGAGCAGCCACCTGCTATGCCTGAC
TGTTTTACGCCAAGTTTTTCTGATCATCTCAATCGTACATTCAATGGGCC
TCAGCTATCTGCGATTCACTGGGCTGCAATGCACACAGCTGCTGGCACAA
GCAATGGAGTGGTTAAGAAACAAGAGCCATGGCCTTTCACATTAGTACAA
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TATTCATCTTGTTCAGTATCAACATTACTATGCTGCTCTGCTAAAGAAAC
TTGCTCCTGAAAGTTACAAGCAGGTTGGTAGCACCACTAACAGCACTTCA
GAGGCTTTTGCTGCAGGGTCTATTGATGAAGTTTTGCAGAGCATGGATCA
GAACCTGTTTCGCACTCTTCCCAAGCTTTGCCCCAAACCAAGGATGCTTG
TTTGTGCCCCATCAAATGCTGCAACAGATGAGCTGCTTTCTCGTGTTCTA
GACCGAGGATTCATAGATGGTGAGATGAAGGTCTACCGCCCTGATGTTGC
TCGTGTTGGTGTTGATACACAGTCTCGTGCTGCCCAAGCTGTTTCAGTTG
AGCGACGGACGGAACAGCTTTTGATGAAGGGCCGTGATGAAGTAATTGGG
TGGTTACAGCAGCTAAAAGGCCGTGAGCAGCAGTTATCACAGGAGATAGG
GCTTCTACAGAGGGAACTTAATATGGTGGCAGTGTCTGGTAGATCCCAGG
GTTCAGTTGGGGTTGATCCTGAAGTGCTTGCTCACAGGGATCGTAACCGT
GATATTCTCCTTCAAAAACTTGCTGCCTCTGTAGAAAGCAGGGATAAAGT
ACTTGTAGAGATGTCACGGCTGCTGATATTAGAAAGCAGGTTCCGTGTTG
GCTGTAACTTCAATCTGGAAGATGCTAGGTCTAGTCTGGAAGCCAGTTTT
GCCAATGAAGCAGAAATTGTTTTTACAACAGTGTCCAGCAGTGGCCGCAG
GTTATTTTCTCGTCTTAGTCATGGTTTTGATATGGTTGTTATTGATGAGG
CTGCTCAGGCCAGTGAAGTAGGAATCCTCCCTCCACTTGCACTTGGTGCT
GCTAGATGTGTCTTGGTTGGCGATCCTCAGCAGCTCCCTGCCACTGTTAT
AAGCAAAGCGGCTGGAACTTTACTCTATAGCAGGAGCCTTTTTGAGAGGT
TTCAGCAGGCTGGCTGCCCAACCATTTTGTTGTCCGTGCAATATCGGATG
CATCCCCAGATCCGTGAGTTTCCATCAAGATACTTCTATCAAGGGCGTCT
TACAGACAGTGAAACTGTTGTCAAATTGCCTGATGAGTCGTATTACAGAG
ATGCATTAATGTCACCTTACATTTTCTATGACATCTCGCATGGCCGCGAG
TCTCATAGAGGTGGATCATCTTCATACCAGAATGTTCATGAAGCGCAGTT
TGCATTGCGTTTGTATGAGCATCTTCAGAAGCTTGTGAAAGCTAATGGTG
GCAAGAAAGCATCTGTTGGTATAATCACTCCATATAAGTTGCAGTTGAAG
TGTCTCCAACGGGAATTCGAAGAGGTTATGAATACCGAGGAAGGGAAAGA
TATCTATATTAACACGGTTGATGCTTTCCAAGGTCAGGAGCGTGATGTGA
TTATTATGTCATGTGTCCGTGCTTCAAACCATGGTGTGGGTTTTGTTGCA
GATATACGACGTATGAATGTCGCTCTTACTCGAGCTAGGAGAGCTCTATG
GGTACACGTCTAACCTCTTTCAGAAAATACATCAAGAGCATTTACTAAAT
GTTACTCCCTTCGTCTCAAAATAGATGTCTTGAATTTTTTCTAAATTTGG
ATGTATCTAGTACTAAATAGTGTCTAGATACATCTAAATTTTCGACATCT
ATTTTTAGACAGAGGGAGTATTTTATTTGCTCTGGATGTATGCTATAGTT
CTAATATTACTTGGTTTTTTTCTAGGTTGTTGGTAATGCCAATGCTCTTG
TGCAGTCAGAGGACTGGGCGGCACTTGTAGCAGACGCAAAGGCCAGGAAA
TGTTTCATTGACTTGGATAGCATCCCCAAGGACTTCCTAGCCATGAAGAT
TTCTTCCAACACTCCAGGAAGGAACTCTTCAAACAACATAAGGAACATGA
GGGCTGGTGGACCAAGACCGAGGCATCTGGACATGCTTCTGGACTCAAGG
ATTGGCATGAGGTCTGATGATGATGAGCGTCTCAACTCTGTTTCAAGAAA
TGCTAGTAACCGGAATTTGGATGAATTGGGACGCCCTGGTGATAGATCTA
GGGAAAATTTGCAGTTTGGAATGCCAAGGAGACCGAATTCATCCAATGGT
TCGAGGAGAGAAGTCTGAGGAAACTTCATTGGTATCTTCAGCTTTGCTTG
TGTGGAACAATGATGAGGTTTGCGATGAAGCCTGGTTGGAGCAAAGTGTT
ACCTATCCGGAAGATGCACCCTGAGTGGTGTTGAGGAGCTGGCGTTGCTA
ATGGCAGGGCAAGAAATGAGTAGGCATCTGGACGGCGGGTGCACCATTGC
ATTGACGACAAGCTAATCAGATAACGCTGTGTTGGGTGGGTTATGGCTCT
CTCATCCTGTGAGAACAAGGAAAGGCTCCTCAGTGTTCTGCAACTGTGCA
GGACAGATGAAGTACTTTTATGTCGACCAGACTCAAGACTTGAACAAGGC
TGCAGCCGGATGGTTCCTGTTTGGTATTGCAGTACTTGCTTTAGGGTCCT
TTAAAGAATCCATCTTTCTCATAGATATGAATACATGTGTGGGATTTTCC
ATTTTGAAACATGCCAGGAGAGAAAAATCTCACTGGCCCTAGAGCAGGTT
AGTTCTCAAGCTTCGCTGTGCCATTGCTGCTAGCGGCAAACATATGTGCT
TGATATACCCCTGTAGGATCAGTTGCTAACATAGGCAGGACTTCTGTAAC
ATATGACATAAGCTCCCTCTGTGTACAAAGTCCACATCTAGAAAAGAAGT
TCATTATTTGATTCAGCTACCGTATTGTCTGTCACCTGTGGTTCTGTTTG
CCATGGTGGTCGGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.