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GrainGenes Sequence Report: AE005569

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Sequence
AE005569
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE005569
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CATTAGCATTCGCTAGTGCTGCCGCCGATTCCCATCCTTCCTTCCAGACT
TTTTCTGTGCTCCGATCCCCCACCCACCTCCACCTCCTACACCCCAAACC
GCATCGCATCTCGCTTCGTTGGCCGAGAGCACCGCGATGGTGGGGAACGA
CTGGATCAACAGCTACCTGGAGGCCATCCTCGACGCGGGCGGCACCGCGG
GGGACATCTCGGCCGCCTCTGTGGCCGGAGGCGAGGATGGGCCGAGCACT
GGTCGGGGCACCGCCGGGGAGAAGCGGGACAAGTCGTCGCTCATGCTCCG
AGAGCGCGGCCGGTTCAACCCCGCGCGCTACTTCGTCGAGGAGGTCATCT
CCGGCTTCGACGAGACGGATCTCTACAAGACCTGGGTCCGCGTAAGCGTC
GCCGCCGCTCCTCATCTTTTCGATAATTGCTCCAGTTATCGGTGGTGGCT
CTCATGACATTTTGAGGTTGTTTCTGGTGATTTATTCTGGACTTTTTTGT
TTTGTTTTGTTAAGACTTCGGCGATGAGGAGCCCGCAAGAGAGGAATACG
CGGCTGGAGAACATGTCCTGGAGGATCTGGAACCTCGCCAGGAAGAAGAA
GCAGGTATGTGATGCATGTACCGGTGAAGTAAAATTGTTGCCAATGCCTC
CATTTGCTTGGACTGTTGCATGCTCGCTGCTTAATTTTACCCTTCAATTT
CCGCGCTTAGTTCTTTTGGGCTAATTGTCAGTACTCAAGTTACACTTGAC
TGTTGGGGAGTTCACTGCTGTTGGCAAACTAGTGCGCGTCATGTTAGTAT
TTGTTGCATGCAGGGAATACTTAAATCCTACTTGCAAGGCGGAACTAGGA
AAAAATAACCTGTCCGCACAACTTTAACACACACTTAGGAAACATATGCA
ATTTTGAAGCGACAAAAAATACTAAATAGAAAATAGTATTGTTCTCGGCA
ACTCTTATATGGATAATCCGGCATAGCGATGGTGCTCTTATTTTAGCACT
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TCTAGGGATGCTCTTGGAGCCATTATTATTTTTGAATTGCTAAACCTTCT
CTTTCCTCTTCCTGTACCCAGTTTCAGCGATCCAAAATATACCAATGCTC
TTGGAGAGGCTCAAGTACATGAGAATTCAAAAAACAAAACCTAAATTAAA
ACCCTGCCATGGTACCTATATAATTTTGGTTGGGTTTTGCCAACAAAAAC
TACTCTGAACACTTCTCATTCCTCAAATATACATGAACATGAACACATGT
TTCCACCAACATTTCAGTTGCACGTCATGTTATCTGATCATTTCCCTTCT
TGATTTGTGTAAATACAGATTGAAGGTGAGGAAGCCTCCCGTTTATCGAA
GAAACGTCTTGAGCGTGAGAAGGCTCGTCGAGATGCTGCTGCTGATTTGT
CTGAGGACCTATCTGAGGGAGAAAAAGGAGAAACCATTAATGAATCATCT
GTTCACGATGAGAGCGCAAGGGGACGAATGCCAAGGATAGGTTCAACTGA
TGCTATTGAGGTGTGGGCAAATCAGCACAAAGATAAAAAACTCTACATAG
TGCTAATAAGGTATGAATCTATGCATGTTTTCTTTTAGACGGTTCAGTTA
TACCGGCTTCAAATAAAGAGACCTGCAATTTTTTGTGAAGTAGGTATAAC
GATCACCAGTGACGTTCCAATGCATTATGACTGTTTGAAACCTGATTACC
TTAACTGATTTGGTCCAACCATCGTTGAGCTCTGATACAGATGATTAATC
AAAATCAGGGTTAAAAATTTCTCTGATTGGACCCTATCGGTTGTCCGATT
CGGTAGCAGACAGTGAAAATATGGAGGAAGAACAAATGAGTATCAACGTA
TCATTTCCCTAAACACCTTGCTACCGCATCTCCATGGACGCCCTACTAAG
TTGAGGAATGACGCAAGCATCTCCGTCGCCATTGCTTGTTGCCATGGTGT
CACAAGCTGGAGCAGTCGAGGATGATAGGGTTGGGGGGGGGGGGGGGGGG
GAGCTATGTGAAGGTAGGGTTGATCCTGGAGATGCTTGTGCTGCTTTAGG
AATGCGTAAGTGGCTTTGCACGTGGGCTAGCTGCTAATTGAGCTGGGTCG
GCTTCACCTGTGCCATTCATTTAGTTTTCTTTTCTTCTATATTATTTCCG
TGCGTTGGGGATTTTCTATGTGTGTGCGTGGACCCAAACGACGTCAGTTT
ATCGTTGTAACTTTTTTTAACAAACCTTTTCTTTACATTTCATAGCTGAT
AGCTTGGTGCCAAAACTTACATTTCACTCCTTAATAATCCATGATACTGA
AGTACTGACCCCTCCCCTAATTGCTCCTATGCTCTATATATGCGATACCC
TAGGCTCAGTATCCACTTGGCGCCCTCTTCAGACATACGTTGGTTGTTGG
ATGCATATTCACTTAGGCTTTCTTCCTGGATTCACCCATCAGACTTAACA
TAGAGGTTTGACGTTCCAACAGGTAATGTATGTTAGTGCAACCTTCTTTA
AATTAAACTAACAGCGTTAGACCAGCCCACCACCAGTACACGTGTGGCAT
GTGCCCTATCACATCCATGCTGAGACCAGTTCTGCCCACCTACTCTGAAG
GGTAATGTCATCATCAACATATCGTGGACTTGGTAAATGCACAGAACCGC
TCTGCTGTACAGCCACCTTGTATTTGTTTAGGTAGGTATGTCCACCTAGG
GTGCCACTGATCAGGGTATGGGTAACCCAATTGATATCCACAAGACCATA
CACCAAAATTTCGCCCAGTTACCCATATCTGTGAAAGCGCAGGAAATATC
TCGTGGATAGTCCCATTCTGGTGACGTGCAATAAACTTCCCGTTTTTAAG
GGTGTTGATGCACGTCGCCCCTACAATCTTGTTGTGTCCATGCGCCAGGT
TCTGCCAATGCACACGGAGGGTGATATGAGGTTGATATTCTAAACAGTAA
TTATGGAACTTCTAAGAAATCTTCATGTTGAAGCTTGTTGAGGTTTACAC
ATATACATATGCCCACTGCACACATAAGTAGCTTCTCTTGAATCATCTAC
CACAATTTTAGTCAATTTTGTGAAAATTTTACAATGTGAACACTGGCTGA
AATTCCCAGTACTTCACTTCTTAGAGCAATGGAAAATTTGGAAATTTTCT
AACTTCATTTTTCATGGGATGTTTATGATAATTAAATATTACTCCCTCCG
TTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTATGAATGAAGTGTATCTAGACCC
CCTTTTAGTGTGTAGGTTCATCAAGGTTTGGAGTGAACCTACACACTAAA
AAGGTCTAGATACACTTCTTTCACAAAGTTAAAACATCTTATATTTTGAA
ACGGAAGGAGTAGCTTTACTCTTTCAAGTGACTAAGTGAGTATCCCAATC
ATACGTGGTCTGTATGGATTTGGCCTGTATCGTTCGTAGCCACAATTTGC
CAGGCCTAAGTTTGGCAAGTGTGGCTGCCATGAAAGTGTGTCTGCCATAA
GTGTGGCTGAAAAATTGGACGCCACAAAGTGTGGCAAAAGTTGGCAAAAA
ATTAACTCTATGGCAGGTGGACCATACGAACAATAAAGTGTGGCAAGAAC
CAAACATATGCCAAATTGCCGAACTTTGGCTGGGAACCAAACACTAAATC
TTGCACTTGTGCACGTCCGTTTTCCACTACCTGGAACTCATCCCCCATGC
ACCTTGTTGAATTGTGCTTGCACTTGCTCAGTCATTTTCCTTCATGTATG
TCATAACTATCGCAGTCATACTTCCTTTTCATCTGTTCTCTTCTTTTAGA
TAAAGGGCGCTTTTATTAGACACAAACAGCTTACAACAAGATGATACAAA
CTATAAAGTCCACACCGGGCCTCTGCATGGCTAGGATGCACACAGCCGAA
AAGCAAAAAAAGAAGAAAAGGAAAAAACCAAAGACCCCGCCAAAGCAAGC
AGAGACTCGCAACAGCAACAGCACCACCAGTGTGGACGACACCTCGACTC
CGAGAAAGCTTCTCCAAAACGATGCCTTGTAGAAGGAAATGGCGCAGAAA
CACCGTCATCGTCTGGGCTGACTAGCATGGTCAGATCCTGGGTTTTCACC
CTGGAGGAGGTTCCAACTCCAGACAATGCCTTCAACAAGGGGATGACTCT
GGAGCCACCATTGCCAGATAGGCAGATACCACCATGAAGGTCATACCTAG
GGTTTTCACCCTGGATACTGAGACACAGAACTACAAGATCATTGACAACA
AGGAAGTCGGATAATCACCACCACCTGGCAGGGACCGTTGCTAAAGCTGC
AAAAATCTGTTTACTAGGCACACATACATCTTCACCCCATCTCTCTTGGT
CCATGTCACCATCAGAATGTTGCAGACCTCACTCAATGAGCATGTAGGTC
CTCTAATCCTCGATTCACCTTTACAAGTCCACCTCTGACCGTCCCATGGA
GGCCACGCCTCAGCGTGTAGGTCATACGAAGAACGGCGGTCGCAGGCCGA
GCCCAACCACTCTGGAGGCCACGCCTCAGCGTGTCGTCAAGCTGCGCCAC
CATGGAGGACTGGAGTAGCCCCATCACGTCAGGGCCGAGTCTCCCTCGCC
GCCGCCGAAAGCACCGCTGCGAGGCAAAGGGATCCCGCCATCTGCCATCT
TCCGGTGGCTGAGGGGCGGGGCGGCGGATCTAGATCTGGTGGGGGTCGGG
AGAGGGGGGATCTTGAACAGTTTTCTGTAGTGTTAGCATAAAGCAATAAC
CTAGATACCTAATTGATTGCTTGCAATTTTTACTTTAATTAACTATAAAC
TGTAGATTTGTTAATTAACTAAATACGTGATTATGCTTTTATAAGCCTAA
TGGACCAAGGTGTGTAATTTTTTGACCTACATGTAGATTGTATACACAAA
ATCGAGCATATCTTTTCACTTTTTGTGGTGGACATTGTTTACATGGATGC
TTTTATTTTGACATTTTCTGTTTTTATGCAGTATTCATGGTCTATTACGT
GGTGAGAATATGGAGCTTGGGCGTGATTCAGATACAGGCGGCCAGGTACT
TATGTGTCTCCCTAATTTTCATGTTTGCAGCCTCGACTTCATACCTGTGC
CTAATTATTACTTTCCTGGTAATATGCTTGTTCTTTATCTCTTTGCTAGT
TTGCTATATACTCCCTCTGTACCGAATTATAATACGTTCTGGCCTCCTGA
AATGGTCTTCACTGCCGATCTTATAATTCGGTGGAGGTAGGACTTACAGG
TTGGAATATATGGATGCTTGAGTTGAACTAACTGGTTCCATAACCTGCAG
GTCAAATATGTTGTAGAGCTTGCTAGGGCATTAGGTGAAACACCTGGAGT
ATATAGAGTTGATCTGCTGACAAGGCAGATTTCTGCACCTGATGTTGACT
GGAGTTACGGGGAACCTACAGAGATGCTGAGTCCAAGAAACTCTGAGAAC
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ATTTGGACCAAGAGAAAAGTATATACCTAAAGAGCAGCTCTGGCCCCACA
TCCAGGAATTTGTTGATGGTGCACTTGTCCATATCATGCAGATGTCCAAG
GTTCTTGGTGACCAAGTTGGTAGTGGACAACCAATATGGCCTGTTGTTAT
CCATGGACACTATGCTGATGCAGGCGATTCTGCTGCTCTATTATCTGGGG
CACTCAATGTCCCAATGGTATTCACAGGTCATTCTCTTGGCAGAGACAAA
TTAGAGCAACTTTTGAAACAAGGACGTCAAACCAGGGACGAAGTAAATGC
AACATACAAGATAATGCGTCGGATTGAAGCTGAGGAACTTTGTCTTGACG
CATCTGAAATTGTAATTACAAGCACCAGGCAAGAAATAGAAAAACAATGG
GGATTATATAATGGATTTGATGTAACTATGGCGAGGAAACTTAGAGCAAG
AATAAAGCGTGGTGTCAGCTGCTATGGTCGTTACATGCCTCGTATGATTG
TGAGTCCTCCATCTACATGAATTCTTTCCTGTTCTAATGCATCTCATTAC
CTCACTATATTTTATGCTTAATGCTATACGTTATTAACAGGCGATTCCTC
CTGGCATGGAGTTCAGCCATATTGTGCCTCATGATGTTGACCTGGATGGT
GATGAAGCAAATGAAGTTGGCTCAGGCTCACCGGATCCACCTATCTGGGC
GGATGTGCGTTCTTCTTTTTTATCCCTCCTAAAGATATGCAGGAATAATT
GTTGATACGCCACTGAGATCACATGCTATATTTTACTTTACTGTTCTGTT
TGAAACAATTTCAGATAATGCGTTTCTTCTCGAACCCTCGTAAGCCCATG
ATTCTCGCTCTTGCGCGGCCAGATCCTAAGAAGAACATCACTACACTGGT
CAAGGCATTTGGTGAACACCCTGGATTGAGAAATTTAGCAAACCTTGTAT
GTGCCAGTCCTGTGTAGTTTCTCTTGTTATTTTTGTGCTGTTTATCTGGC
TGTTTAGTTTGTAATAATCTTCTCCTGTCACGAACTATCGCTGCCTGTTC
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TGATGTTATTGATGAAATGTCAAGCACAAATGGAGCTGTTTTGACATCAG
TACTCAAGTTAATTGACAAATATGATCTATATGGCCAAGTGGCATACCCC
AAGCACCATAAGCAATCCGAAGTTCCAGATATTTATCGTTTGGCAGCAAG
AACAAAGGTAACTAAGTATATCTTCATAGTTTGAAATATTTCGGTAGGAT
TTCTACCATAACTGTGCTAGTGGATTCTCTGACATGGATCATAATTAAGT
GATCATGCTACGGCTTTGCTGGTAGATTTGGTTTAACTACCTATCAGTAT
TAATTATCTCATGCATATATTGTGTCCTTTTTAATGGCTTTTGGCCCAGT
GGCGGAGCTAGGATTATGGGCAGGTGATGTCTAAATTCCAAAATAAGTGA
TAAATGAGACTAGTGATGTCATTATCTAGTACTCTTGGGGTCAAAACTAG
TGTTTTCGTAGCTATATCATGGTGTTTGTCAGATTATTATGATGTCAGTT
GACATCATTATACACCATGCAGCTCCGCCACTGTTTTGGCGTTTTGACTT
GTATTTTTGCTTGGCTGACCTACAGCAACAAACTGACTGTGCTGCTTGTT
TATGTCTTACTCCCATTATCATACATAAATACATGCTCATTTCGGTTCCT
GTTGTTTTCAGGGGGTGTTTATCAATTGTGCTTATATTGAACCATTTGGA
CTCACCTTGATCGAGGTAACTTCTTCGACATTTCACTTGGTTCTTACTTT
ATGTGTGGACTAATAATGTTTATGCAATCTTTACACTTTCTAACCTGTCA
GGCTGCTGCTTATGGTCTACCGATGGTTGCTACCCAAAATGGTGGGCCTG
TCGACATACACCGGGTACTGCCCCGCTATCTTGATTTACATCTGCACTGA
AATTTCTGGCGCTCTGGTGAATACCTGTACCCTTGTTTTGGTTTCTTTAT
TCAGGTTCTCGACAATGGTATTCTTGTTGATCCCCACAACCAAAACGATA
TAGCTGAGGCGCTTTATAAGCTTGTTTCTGATAAGCACTTGTGGGCACAA
TGCCGTCAGAATGGTCTGGATAATATCCATCGATTTTCTTGGCCTGAACA
TTGCAAGAACTATTTGTCACGGGTTGGCACACTGAAGCCTAGACATCCAC
GATGGCAAAGGAGCTGTGATGCTAATGAAGTTTCTGAAATAGATTCACCT
GGCGACTCTTTGAGGGATGTTCATGATATCTCTCTTAACTTGAAGCTTTC
CTTGGACAGTGAAAAATCAGGCACCAAGATAAATATTGAAGGGAATTCCA
CCAATGCTAGAAGAAACCTTGAGGATGCTGTACAGAAATTTTCAAATGCT
GTTAATGCTGGCACAAAGGACGAGTCTGGTGAGAATGCTGAGGCCACCAT
AGGCTCCAATAAATGGCCATCTTTGCGGTGGAGAAAACACATTGTTGTTA
TTGCTGTAGATTCTGTGCAAAATGCTGACTTGGTTCAGATTATCAAAAAC
CTTTTTGAGGCTTCAAGCAAAGAGAAGTCATCTGGTGCTGTTGGTTTTGT
ATTGTCAACATCTCAAGCAGTATCAGAGATACTTCCTTTGTTAACATCTG
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GATCTCTGTTATCCATCTTCAAGTTCGGAAGACATGCTTAGCCCTACCGA
GCTTCCATTCATGATTGATCTCGATTATCACTCTCAGATTGAATATCGTT
GGGGAGGGGAAGGTTTAAGGAAGACACTAATTCGTTGGGCAGCAGAAAAG
AACAGTGAGAGTGGACAAGAAGTAGTTGTTGAAGATGAAGAATGTTCATC
CACTTACTGCATTTCATTTAAAGTGAAGAATACCGAGGCTGTATGTTTCA
TCCTCTTTCTTTATTCCCTCTTCATCTACTTTTTCACTGATTTTTTCGAC
CTTCTCTACAATTCTTGGTGGTCTTATTTTGTTTCAACTTTCAACTGTTG
TAGGTCCCTCCTGTGAAGGATCTTAGAAAAACAATGAGAATTCAAGCACT
GCGCTGTCATGTATTGTACAGCCATGATGGTAGCAAGTTGAATCTTATAC
CTGTTCTAGCATCACGATCCCAAGCACTAAGGTTTGACTATTCTTATATC
TGTTCTTTTGTTTCATGAGCATAGCCTTCAATCTTCAGTTGAGTAAATGT
TATACTGTTATACTCTATCTGCCACTAGAAGCTGTTATAGGATGCTTGCA
GTTCTGATCATCAGCTTGTACAAAGTATACTATTTTGTGAGCTTACAAAC
TACTATAGATTGATCACATGAATTTAATTTGGTACCACAGTACAAAACTT
ATCTTTGAAGTTTTCTATGGCAACAGCGTAAATCAATGATCAAAACAGCG
GTCCAAGTAGAGAATTTGTACATTGATATCTTAAGTGACTTATATTACTC
TTATATACTGGAATCCAGCTTGGGGATGTTGAAATGCTGTTATTTTGACC
GTCACCTAATAAATGCAGTTATGTGTAAGTTAGTAATGTACCATACAAAA
TATTTTTTTTCTTCATTGTAAGAGGTATGGATTGTTAGAAAAATTTAACA
CCTGAGGTCCCAGTACAAATATAAGAGAAGTAAGATGTATGTAGAAATTC
TACTAGCTTTCCATTTCACTTCAAATCATCTCAGCAGCTTTGATGGTTCT
TCCATCAGATATTCAGAATTTCAAATCAAAGCTTACCTAACAAAGTTATC
TGCCCAAGGCGAGAATACTTTCGGTAGCTGTGAGATTTAGGCCTTTTGTC
CCAGTACAAATATAAGAAAAGTAAGATGTATGTAGAAATTCTACTAGCTT
TCCATTTCACTTCAAATCATCTCAGCAGCTTTGATGGTTCTTCCGTCAGA
TATTCAGAATTTCAAATCAAAGCTTACCTAACAAAGTTATCTGCCCAAGG
CGAGAATACTTTAGGTAGCTCTGAGATTTAGGCCTTTTCTAGTTTGTTTT
TTCGTTTCCTTTCCTCTAGGGTCGTCTGACACGCTGTTGTCTTCTTTTGC
TTGCCTAATGTGCTTTCCTGCTTAATGAGAAAATATGATGGGCTCTTCCA
CGTAGACTAAAAAATATTTAAGGTTCACTGCATTTTCAGACAAATCTACC
AAATTGGCAGTGACAGAAGTCATGAGTTATTTTTCTTATAGTATGTTTGT
TCATTTATGTGCAGGTACTTATATATAAGATGGGGGGTAGAGCTGTCAAA
CATGACGGTGGTGGTTGGTGAAAGTGGTGATACAGATTATGAAGGGCTAC
TAGGAGGCGTGCACAAGACCATCATACTCAAAGGCTCATTTAATGCTTCT
CCAAACCAGCTTCATGCTGCCAGAAGCTATTCACTGGAGGATGTTGTATC
GTTTGACAAACCAGGAATTGCTTCAGTCGAGGGATATCTCCCAGATAGCT
TAAAATCTGCTCTACAGCAATTCGGTGTGCTGAAGGACTAAAATGACGAA
CTTGTCATCAGCAGAGCAGTTAAGTAGGTATGTTGAGGCACTCTTTGTGA
ATATTGAATGTTACATCCAGTGAACTTAACAGCCAACTGAATATTCAAAT
TGCATGGTTGGAGATCTGCATATCAAGAGTAAGGTTGTCTTTCAGTTTGG
CCTTTTAGTTTATCTTATCATTATTTTGAAATTGAAACTAAACAATAACA
ATACAGCAACAGTATATCGTTGATCCAACTAACTTGCCCTTTTGCTGTGG
TTTCCTTGTTTCTTATGCCACAGATTTCATCGAATGCTTAATTCCTTGCA
TAAAACTACAATGATTTATTTAACTGATATGTGCATAAAAGAAAACTAGT
AATAAACGCAACAAATTATATTTAGGCAAGATAACTCTCTTGAAATTTGA
AATTTCACATGAAATGCGTAGTCCCTATTCGTGACACATGATTTTTTTTA
AATGTTAGATTTCATGAATAACATGCCTTCATGTATCCAAATTTCACAAG
AAAATTACATATTGCACACTTTTCCAATGTAAGATTGTGCCCCAAACAGT
TACAATCTCTTGACATGAGCCATTTTAAAAATATTTTTAGAAAAGTAATT
TAGACCATGAGGATATGGAAAGAAAGTGATAGACAACTTACCTTTACAAT
GATTGTGTATTAGCCAAAGCTAGTTCTCTACCTGAATCGTCAAACTAACC
ACTACTCCCACACCTTCATTCATATCATAGAACATTTGTTTATATCCTGT
CCTCGTATTGTTAACTATTATAATCTTCCTCCACCAATATGTTTGAGAAT
TGGTTGAATGGAGTTGACACTATCTAAGGCTAGAATTTGCATTGGTATTT
CTGTCTTATGTTGGTCTATTTGGAGATGCAGGAATGATGTAATATTTAAC
AGGTCAAGATCTTTTTTTTTTGCAGGTTATCCATATGGTTGCTCATTGGG
TGCAGCTATGGGCTTTTCTTCTACCGGAGGACCAACGCGATGCTATGGCT
ACTGGATGCAGCCGTCTCCTAATGGTCGCTCAGGCTATCTTCAGCCAGAG
TGGCTGGCAACATACAAGATGCCTAGTGATCATATGCTTTTTTATTTTTC
GCTGATTCTTGTTTCAATTTTAAGCGATCCTTGATTTGTAATAACCTTTG
AATGATGAACTTTTAATAAAGGTTGTATGCATCAACCGATGCCAAAGGCC
AGGGTTTTATTCCCCTTTCCGAAAAGGACACCTCTACGGTGAAATGAATC
CATTGGAAGATTTAGTTGCATATGAAAATGGAGTGCCATATTAATTAGTA
ATCAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.