Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE003953

[Submit comment/correction]

Sequence	AE003953
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE003953
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATAACAAGCACACCATGGTTAACATTGCACGGCAACACGCACCTTGGGGG CGACGACGGTGGCGGCCCTGACGACGAGCCCGTGCGACGCCCGCCGGGCC GGGCGGATCCCGATGGCCGCCAAAGTGGGGACGCGGATGGCCTGGACGGA GGCCGCCGCTCCGACCGCGGCACCGCAGAGCTGCACCGACGCCATTGCTC GAGGGTGGATGGGATCCGAGCTGGAGCAGAGGATAAACCCTAGGGGCCAG AGCAGAGCAGTGAGAAGCGGCGAGGACGCAGAGCGCGAGCCACCAACCGC TTTATCTTCTCGAATCGTCAAGACTTTCTGTGGTGGACTCACCTAGGCCC ATTTGACCTTTGGGCTGAGAGTTCCAGTTGCTATGAAGCCCGTAACATTC TAGCCCAGTTGTACATGTGCTGTGCTGCCTGCTGCATCTTCCTGTTCGGC TCCGAGCAGTAGAGGGAGCAGCGGCGATCGCCAGCGCGGAAGCCATGGGC GCCGCCTCCCCTTCCTGCGCTGCGGTGGCGGGATGGACCGTAGCGGCGGT GCTTCTGCAGGTAGCTGGCCTCTCCCTCTTCCTCTACGGCTTCTTCCCCG TCAAGCCCACGCTCCCCGGCTTCAGGTTCGCGCCTCCGCCTCTGCTCAGC TCCGATTTCTCTGAGGAAACATGTTGTATCAGCTTTGGTTGACTTGTCTT TGGTCTGTGGTGATCCGTAGTGGAGCGGAGAGCTACAAGGCGCCGTCGTG TGGTCCCGTCGGTGGCGGGGAGGAGCCGGCGCTTCCTCCAGATCAGCTCA GATCGCTGTACAGGGTAGGGCATTGCTTCCATTTGAATTGCTCTCTGTAG AGTTTAGATCCGCCTCCTACTGTTCAAGAATGGTTCGATGTTCCTTCACC AAATCCTAAATTGTACTACTATTTAGTGTTCTACAACGTTATATTGGGGT TAAGGTTTTAAAGGAGAGCAAATTTTTGACCAAGATTCTTACAGTTTATG CTTGTTTCGAGCTTCCTAGAGATTCTTCTGTACTTAGCTTTACTAGAAGT TACATATTTATGATTTTATTGCTTTTGATTGCGTGCACGATTCATTCCAG GAACTTTCCGAGGTCCCCCATGTGTACGATCGCTTGGTATTGATGGTATG TCTTAAACCGATGTGCCTATTTCTGGCAGCATTAGCCATTTCTATGACTG CATGTCTTACCTTTTTAATGTTTGGCCTTTTGAGTTTATCAATGTCAATT TAGGTGGTAGATGGGCTACCTGCTGAATTTGTACTGGGAAGAGGTGGAAG ACATCCAAGCAAAGAAATGATGGAGGCAATGCCCTACACTCAATCTCTGT TAGCTGGTTGCAAAGCAGTGGGTTATCATGCAAAGGCTGCACCCCCAACC GTTACAATGCCCCGACTAAAAGTAGGACTTATTTTTACATTGAAACACCT ATTTGTGCACATGTCAAATATTGAGAAATCCGGACTGTATTTTTTTTTCT TTCAGACGATGGTATCAGGGGCAATTGGTGGTTTTCTAGATGTAGCGCTT AACTTCAATACTCAAGCCTTCTTGGATGACAATCTTCTTGGTTAGAACCT CTTGCTACCTCCCTATCAAGCTGTCATGCTAGTCCTACTTTTTTGTATGA TAAATAAGCAACAAGGAATTATTTATGAGTTATAATTTTAATTGATCACA GATCAGCTTCATACGATTGGTTATAAATTAGTGATGTTGGGAGATGAAAC ATGGATCAAATTGTTTCCAACTCTGTTCCACAGACGAGATGGAGTGAGCA GTTTCTATGTAAGCCCAGTCTCATGCATGACACGCTTTTCTTGCAATGAG ATGTGATTGAACATAAATTGTTGAAGGACAAGAGCATAGTTTGCATATAT AATTTGTGTTTCTGACTTTCTGTTACACTATCTTTTCAAGCGCTAACAAA CAGTTGCTTTACAACAAAGTATCTGTTTGTCCCTGTATTTTCTCTAAGAG TTTCTGAAAAAAAAATACTGAAATCACTTCGACATTCACAGTTTTAGGTT TTTGGCATTTCCTAGCCATCTTTCAGGCTACATTTCTCTTATGAACATAT TGACACCCATTGAGGAGACTATTGGTTGGACTCCGTTTACAGATATTTGC ATATTAGACACGTGAGCTTATAATTGCTGCTTAATTTGTGCTAACAATAT TGCTTTCTTAGTTCTTCTCTGCCTGGTCTATTGTGACTAAATTTTGATTA ATGATATGAACTATATTGCAGGTGAAAGATACAGTTGAGGTTGATTTCAA TGTTTCTCGTCATCTGGAATTTGAGTTTGCTGCAAAAGACTGGGATGCAC TGGTACACTTCTACTCATGCCTCAGCGCATGTTCACTTGATTTATCACTT GTGACAGATAATGCTACTTTATGTCTGGATCTCAACCATGTACTCCAAGT GTTCAGCTATTGTTTTCTATAGTCAATGTCTATATCTCTTTACACGTCTT CCCTTTTTTGTGCTGCTTGATAAGGTTAACCTACAATCTTTTAGGTGAAT ACTGAGAAATTCTTTTGTATGACAATTTCAGATTCTTCACTATTTAGGTT TAGATCATGTTGGCCATATAGGTGGCCGTCAGAGGTAAATACCATACCAT TCTCACGTTGTTTTAGTGTTTGAGCAGTGTCTAGTTTGAGTTGAAGTTTC AACATGACAGTGTTTTGATGGCCCCAAAGCTGAAGGAGATGGATGATGTG ATTAGAAGGGTCCATGCTGCAGTTGCGAGCTTTCAGGAAAATTCAGACCG AACACTTTTGGTACGTGATGCTTCTGTTTGTACAAATTTTGTTCTGTTAC AAATATATTTTACTCTAAAACCAGCAGGAGACCGCTTCAGGTTCATCAGC AATAGTGAATTTGTAGTGATTACCCAGATGTGTGGTTGACATATTCTACC TCTGATGCCTTTTAACTTATGAAATTTAATGATTTCCACAACTGAAGGGT TGCAAGTCCAAATTGCGTTCATCAGTCTATTCTCCAAGTTGTATTAAAAA TGCTTGGATGCACTTTTTTCCATTACAGTTCTCATTGGGATTTTTCTTTG CCCTGCATTTCAGGTCGTAGTCAGTGATCATGGAATGACTGAAGTTGGTA ATCATGGAGGATCTTCTTACGAAGAAACTGACTCCCTTGCCCTTTTTATA GGACACAGCGTTGAGAACTCATATTGCTCCCCTTATGACCAGAACGAAGC ACTTCAAGTATGAATCTATACTTATCTCAGCCTTATCTCTGTATATTTGG AAGCTTGATTTCAATTTATAGATACTTTCGAGTTTGATAGATATTGTTGG GAGTATGTGATTATTTTTCTAGATTGGCCAGTTTTCTTGCTTTGTCACTT ACGCTGAAGAAATCGGTGTAAATATTCCATAAATAGTGTTTCAAGGTACT AACACACAACTCTGACATTTGACCTTTTTTGTTAGGTTGACCTTGCCCCG ACTCTAGCTCTTCTCTTTGGCATACCAATTCCGAAAAACAATATAGGTGT CGTGCTTCCGGAGGTTTTTAATTCTTTGACAGGTGAATATATAATACCTT CCATCTCAAGTGTGTTACGCTTCCATGCAAAAGAGTAGATTTGTTTTCCA AGAGTGTGCCAACAGTGCACCATATTTTTATAGAAGGTAGAAATAAATTA CAAGCAAGTCAGAGTCCTTGTGAACAAGAACTAGACTACAACTCCACACA TCCAGCACTAACGCCTACTCTCGCGCTATGTGATCACCTACACCAACACC TACCCTAACATGCATCCAAAGGTGAAACTCATCTAGAATGCTAGCTACCA ACTCCTGCACAGAGCGAACTTGACTTATGTTGTTGAAAGCCCTGGCGTTC CTCTGCTTCCAAAGCTTCCAGCAAGTAACGGTCACTAATGTGTCAAACTA CCTCCGTTCCTTGCCCTGGAATCTGCTCCTTTCCATCAGCCACCAATTTT CCAGATCGTCTGTCCGTTCAGGTACAATAACCGCCAGCTCTTCCCTTCTG ATACACTCATACCAAGTCTTCCTCGCATAAACACAACGCATTAGTACGTG TTCGATGGTATCTTCTTCCTGCAGGCAAGTATAGCAGCTGGAGGCTTGAT CCTGTAGTCCATGACGAGCCCTCTGATCCGACGTCCAAACTCTATGCTGC ATGGCCAACCACATAAAAATCTTGCATTTAAGTGGCGCCCAAGATCTCCA AGTGCATTCTGCTGTTCCTACTCGAGTGAAGCCCTGACAGAGCATGTCAT ATGCAGATTTAGCCATGTATACTCCGGAGCTAGTCCATGGCCAGGTGAAC ATGTCTGTGAATGTTGTGTCATGTTGCACGCCTGCGATTTGGAGCCACAG ATGCACCACCTGCAGTGTCTTGTCCTGATCCGGTAATTCGACATGTTCTC TATCCACTTGATGTTCAGTAGACCATCAGCTACAGTTCAGCTTCTTCCTT CTAATACTGATCGCTGCAAAAACCTTGGGCCCAATATCTTCAGCTGATCT CCCGTTGATCCATCTGTCACGCAACAACTTAACTCGCTTGCTGTCTCACA CACTTATTTTAACCAAGCTTTGGAACGCCTCATAAGCAGCCTTGTCTCAT AGTGCTGGCAGACCTTGCCAGGGCCTCGACAGATCTGTCCTCCGTAGCCA CTCCCATCGAATTCGCAAGGAAATGCCTTGTAGCTTCAAATCCTTTACGC CTAAACCTCCAAAGCAAGTTGGAGTGCAAATCTTGTCCCAGGCGACCAAG CATTGCCTGCTGTTCACCGATCGTTTTACGGCCCAAAAGAAAGATCTTGT CCACTTCTTGATTTCCTCCAAGAGCCACACAGGTGCTTTTGCCACCAACA ACTGATGAATTGGCTTTGCCGCAATCACCGTCTTCACAAGCATAAGTCTC CCAGCCCTAGCCACCAAACCTCTCCGCCAAGCTGGTATGAAGGCAATGGC CTTGTCGAGCACAGTCTGCCATTCATCTTTGGTCAAGGGCAACAAAGCCA GCTGTAGACCAAGATATTTGATTGGGAAATCCTGTGATCTGCACCTCAAC GTGTTCCTCACCAGTCTTTTCTCATGCTCTGATCCTCGTATTATTGGGGC AGTTGACTTGTTGTAATTGATGCGAGTCCAGATGCCTCCCCGGAGATCTG AAGGATTTCCCTGATCGCCTACAAGTCGTGGCGCAACCGTCTGACGAAAA GGACCACGTCATCTGAAGTAGATGTTTTTTAATGCTTCTGGAGTTCATTA CTAGGTTTAAGTTCTTGTTGGGTGTGTAATTGCACCCCTTTTGTTGATTT TTATATCTCATTTAGATCAAAACATTGGATTGTTTACAAATTTTATGATT AAGCACTCTCAGCCATCTGCTCTGAGATTGTGAATGTATCTTATTTCAGA TGACCAAAAACTGCGGACCCTAGAACTGAACTCATGGCAAATCTTAAGAT TGCTACAAGAACAGGGACCTGCTTTCTGCTTTGAAGATTGTGTTAATACG AAGGATGACTTTGGAGTCGGTATGCATCCTGAATCTATTGAGGAAAAGTT GTGCCATTTGCTTTCTAAGGCGTCTGCTTCTCATCGATCCTTGCTTCTTC ATCAAGATTCTGATTTCAGGTGAGATTATGGTCCTAATGTGATTAAAAAG ATGGATATCATCATCCATCAACTCTTCTTAAAAAAAGAACTCGCCGTTTC AGGTCTGTTGAAGCAACTGTGCACATTAGGACTGCTTTGGACGCCTACTC TGCCTTCTTAAGATATGCGAGTGAGTGGTTGTCTCACAGAGCGACCGATG TAATTTTTCTACCTTTGCACTGTTATACTTTTATACCGTACTGTTACATT TGGCTTTCTGCTGGATGACTTGTCTCCTTTTACTGTTGATATTTGCAGAA ACCACTCCATTTACTTGTCTCTGCTATCTCCTTGATGATTATTTCATGTT TTTCTCTTGTCGGCATCATCTTTTTCCTATTTGAGGAAAAGTCGCAAAGT CAAGTTGAACACCGTTCTGAGTGGGAACTGGATAAACATTGGCATCTTGA TGAGGTTTTCATTATAATGGGGATTTTTCTATACGTCGCAAGTCTTGGTT CAAGCTCTTTTGTTGAAGAAGAGCAGTACATATGGCATTTTCTCACGTCT ACTCTCTATTTAATATTTCTCATCAAGACGGTTCAGTCAATTCTGAAGGA ATCAAATTCAAGAATAGTCCATAGAACGGAAGCAGAGATCATTCACACAG ATAACTCCTCGTATCTTACCAGCTATAAACTAACCCCAGGCCAGCGTGTT GGTTGCAAGTTATGTACTGTCCTTGTTGTTCTTGTTGCTGGGAGAATTCT AAGAGCTTGGCATCAAGGTGGGATTAACTGGGTTCACTTCCCAGACATTT CAAAGATATTGACCCAATGTGACTCTTCTATCGTGAAGTCTCTTCAAATT ATCTCAGTTCTCGCGGTCGTGGTATTGTATGCAGTTTCACTCATTTTACT GAGAACAAGGAGAATGCTTGTTGTAGGGCTATGGTTGAGCCACCTTTCAT GTGGACTTTTAGTTATGCTGCATATCTGGAAGAGTCAGGTTAATACTTCA GTACCGATGAACCGTAGTACAACATCAATAGCTCAGATATTCTATGTCAT CGCAAGTACTTCAATAATTTGCACTGTTCTTTTGTCACCTTGGATATTTC CAGTACATTCTAAAGAAGCAGAACCAACATCCTCCTCTGAGTCCAGTCCT CAAAAAGCTATACCTTTGCACGGAATCAATCATTCTGTGTTCCTGACTGG AGTAACATACATAATGTTCTGGTGCCTTCTTCAATTGCTTCTGCAGCAAC CCATAAATGCAATTCCTGTTTTACTCATTCTCTTGCAAATTATCTCGAGT GTTATTCATTTTTCTCTGGACAAATCATTGTATAGGCAATGGGTGCAGGT TAGTTAGTTGTAAAATTTCTTCTTATCTTTGCTTGATCAACAGGGTTTTT CTTATTTGTTTCCCAAATCCACGGCATCATGGGTGATGACTATTTCTATT GGCTAACTGCGTAGGTTGTTGCAATGCAATTCTTGGGGATGACCGGTCAT TTTGGTCTTGGGAATACCAATAGCCTCGCCAGCATAGATGTTGCTGGAGC TTTCATTGTAAGCTGGGCATGAACTTTTTGAAGCGTCTTTTCGCACCATT TTCCCTTCAGATTTGACTATTGAATTTTAACAGGGTATTTCAAGCTACTC TACGGTTCTTTCTGGGATGCTGATGTTCATTATTACATACGGATCGCCTC TGTTGTTATACATTGGGATAGTGGTTTATATGTCGGTGAAAGATGGTGAT GATATGTCTACTCCACAGCAATTAAGATGGAGCAGCATTCTGGGCAAAAT GATCGCATTGCCCTGTTTGCTTCCTTTGCTGATTAATTCTGTTGCCCTGA CTTCATACACTGTTGTTCTGTTGCTCATGAGGAACCATTTGTTCGTCTGG AGCGTGTTTTCACCAAAGTAAGTGATCGACAAAAGTTGCATGTCAATGTC TAGTCAGTTCTCCATTTGGGTGTATAACATGGGCCTGGGTAGGAATCATT AGCTCGTGTTTGACGCTTATCTTCTGTATTTGGCTTCCGTTTGTTTCTAG TTTAGAGATCAGAACAACTGTCTGCAGCTACACTGGAAGTTGTACCCCAG TGCTTTTCGTGCAAACCAGTATTCCCTCAGTCCAGAATTAACTGACTCAC ATTTGTCTAGATCCAACATGCGGATCTAGACAAATGTGAGTCAGTTAATT CCGCACATAGGCAGTACTCGAAGTGCACCCCTCAAATTGCCGAATAGAAC TTGTGAGGGCAATGACATGAAGAAAATGATGCTTTTAAGAATTGAATTCT AGCTTAGACAGTTTGTTCTGACAAGGATGATTTCACGGATTGCAACTTAT CATGCGTAGGCTTTTACTTGGTGCAAGAGATTTAACCTAGTTTGCTACAT TTGGTTCTTACTGTTTTTTTGACCACCTCCATGTCTTAATGGCAACAGGT ACCTGTACGTCTGCGCAGCAACAGTGTGCACATACGCTGGAGTGTTCATC ATAGCCATGACCGCTGCCTACACCTGCGCTGTATTTTCATTCAGGACGAG AAACCACAGTGACAGATCCATATGATTTACACTAACAGCTACTACCTCTG TTCCACAATATAAGCCTTTTTAGCAAGCTAAAACAGTTTTCTAAAAAGGC TTATATTATGGAACGGAGCAGCTTGTTAAAAAGGCTTATATTATGGAATG GAGGTAGTAGGTGTTTCTGACTTCAGCACTGATTTGCTAGGAAAGAATAG TGCTAGCATTGACTTAAGTCACAGAACTCTCTCTTGGACGGTGTAGCCCA GTTTTAGGCCATGCCATGCCTGGAAGAATGTAGACACATTTTCTGTGCTA CTTTGTTGCACATGATTTGATCTGGAAGGATGTATGTTCTCAGTTTCATA AACTGTATACTTTTCTGGTTTGCCACTGAACTACTGAAGGATGCATTCAA TATATTGAACTGGTTTCATAAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.