Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE020417

[Submit comment/correction]

Sequence
AE020417
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE020417
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCACAGTCCACGGTCCTTCCCATTCTCGCCGCAATCGCCGCCGGTACGCA
TTGCCTCGACTCCCATCGGCTTGCAGGATCGCCGCGCCGCCGCGCTTTAC
TTACCTCTGGATTTAATAGTTCACACGCAGTCTCAGGCAGTGGGAGACGT
CGGAGCCGCGCCGAGGAGAAGCTGCGGGCGCTCAAGGCGCGGGTGCAGAG
CGAGCGGGAAGAAACCCGGAGCGAGGCGGCGGCGCTCGAAGAAAACGGCG
ATGAGAATGTGAAAGAGCTGGCGGCAGAGGCGTAGGCGCTGCGGAAGGCG
ACCGCCGGGCTGGAGGAGGAGGAGGAGAGCTAGTTATATGTCTCCGATCC
CGTTCCTCTCTGTTGGTCGAACTCTACTTTCCACTCCAGGTATTCTTGCT
TGGCCGAACTCTCTGTCCTTCCATCCTTCTTATCTTATATGATGTGTACT
CTACATGAGAAAGCTGCCTGTTGTTTTGTTTGGACCTCATCAGGGCCGTA
CTCGAAAAAATGGAGGCCCCGTGTGAAACCAAAAATCTGGCCCTTGACAT
CGTCATTAGTAATTAGGAAAACAACGATGTTTGCAATATATTTATCATAC
TGTTGGTAGAAATTTTGAAATAATTGCATCTTATCAAGAAGTGATTATCT
GCAATTCAAAAGTACTACATTGTGTTTAGCAGAAACATGCCATCCTTCCG
GTAGCATTCCTTGAGAAAAATCTTCAATTAATTTTCCATAAGAAACCTTC
TGCAAAATGTCATGCATCAAATACATAACCTGGAAAAAATGGGATTTAAC
AACCTTTGACTGATTTTGAAAGCGAACTCTTAGATCGCGGTTGCTCCTCC
TCTGGATGAATCGGGCGTTTGGCATAAAAGCACTCGTGGCGGGGCCTCCA
ACTGAACTCAGATCCCAGGGACGGCATCAACAACTAAGGAGATCAAAAGC
AGAGCAAAGAGATGAGAAACTAAAAACAAAACGCGAAAGAAAAAGATATA
GGTTGAGGTTGCAACCTGCAGCGTACCCTGTACCTATTAATTGCAACAAC
TTATGTGTCGTGGAGAAATAGGAACTGAATTAATCTTGGTAGAAGCTGTC
ATTGGGAGATGAACAGAACAGTGCTTACGCTGCAAGAGAAATGAAAAGAA
AGAGAGACGAAGGAGTGCTCGTGTGTTGGGCCCTCTGAGTTAATTCGGTT
GCACACTCCTAGGAAATTGTATATATTATTCAATGCATCCATTAAACTCT
TTTTTTATAGGAAAAATCGATTAGTATCTGGAGGCTCTCCTAATACTAGC
AGTACTACTAAGTATAGTAGTTTAACATGTAAAACAGGAGGCCCTCCTAA
TTTGGGGGCCCTGTGCGTTGAACACTCTGCACATGTGTCCCGTACGGGCC
TGGACCTCATTATTTTCTTCTTGGTTGATTCTCCTTTTTTCGTGTTATTA
GGGAACTGACCTCTCTCAATATAAGTAGGATATATCATGCTTATTGTAGA
TTTCAACATGTTCTTACTTGTTAGCTGCTGCTAGATGTTCTTACGTCTCT
TAATTGCCGCCGAATTACTTAATTTTTAAAGCTATAGGGATAGGCCGATA
GGGACATGTCAATTATTTGTTAGATATTTTCTGACAATATATGCCTTTAT
CTATTCTTTGTACTTACTGTGTGTTTTTAGTACTAGTAGATGGAGAATAC
AACGTTGAACAGGTCACAACACACAAGTGGGGCGACGACGCAGTTCGAGT
TCGTGTTGTTAAAACAGATTACTAATAATTTTTCCGAGGACCGTATAATT
GGTTGCGGTGCATATGGAGTGGTTTACAAGGTATCGTTGTTATTTGCATT
CCTTTTACTCGGGCTCGTCTAAAAAAGATGCTAAGTACAAGAGCCTCTGG
ACGATATTAACAACAAATCTTTAACAGGGAGTCTTGGACAGTGGCGAAAA
GATTGCCGTGAAGAAGCTAATATACATGCCTCTGGATCATGACAGCGAGA
AACAATTTCATAATGAGTGTACTAACCTTATGAGGGTCCAACATCAGAAT
ATCGTCCTCTTGGTAGGCTACTGCTATGAAACCCGTCGTCAATGTGTTGA
ATACGATGGAAAATATGTTTTTGCAGAGGAGAATGAAAGAGCTCTATGTT
TCGAATACTTGGAGGGTGGAAGCCTTGAAAAATACGTTTCTGGTAAGATC
ATGTACTACATAGATAGTATTATTACACGTGGAAAAAATGTTATCCATGA
ACGTATGATCTATTTTAATTGATCGCTCAATTGTTGTCTTTGTGATACAC
GCCATGTTTACATCTGCCATGGTTATATCTACAGACGAGCCATGCATACT
TGATTGGGACATGTGTTACAAAATAATTAAAGGAGTATGTGAAGGTTTAA
ATCACCTCCACAATGGATACACAGATTCTATTTTTCATTTGGACTTAAAA
CCTGCAAATATATTGTTGGACAACAATATGATTCCAAAAATTGGAGATTT
TGGTTTATCAAGACTCTTTTCTACAGTCGGAACATGTACCACGACAACAC
CTTTGGGAACAGTGTGAGTTCATCATTACTGACACGAAGTAATCAACTTC
TTATATAATTTTGTTAAAATTAATTATATTTGATACCATGCAGGGGATTC
ACACCACCAGAATACATTGACAAGCAAGAAATCTCTCCTAAATATGATGT
ATTTAGTTTGGGTGTTGTAATAATACATATAATGGCAGGACGTAAGCATT
ATTATGACCATGTGGGCAATCCATCCAAGATCATTGAACTTGTAAGTAAA
AAGTTTGTGAATCATGAATACATATCCTTCATAAAGTTATGTTGTCTCAC
TCATGCTCTTTATGTATGCACCATGTCAACATTTTGCTTTCATTTTTATC
AGGTATGTGAAAACTGGGGGAAAAGGCTACACGCAACGATGTTGTCACAT
GGATCAGAAGAAGTTAAGACATGCATTGAACTAGCGTTAACATGTGTGGA
GTCTGACCGACAAAAAAGGCTTAGTATAAAACAGATTGTCGATGAACTTA
ATAGGATTGATATTGAAAAATTTCCACTTACACACGAGGTATTGAAAGAT
CAGTGATATTTTTTGGCAACTTTTTTTTAATAAATTATAGTGCTATAAGC
AAATGGAAAAATCATTTTCGATCATTTTTTGCATGTTGCATTTAATGATA
GGGTTTTAGGGTATTTGTAGCTATAATTGATTACATTGTTTGATTTGTAC
TAACAGTTAGCAGTTTCTCAGATGAGTAAATCGTCAATCGTTAGTTTTTC
CCATAGAAATGTATTGACTAGTAAACCCTACTATACATACTATGAAGGCC
AAATTTTGTTTTGTATGTTTGCCACTAAATATTTTGTAATTAGTTTGTTA
GAGGTTTTTTCATACGGTAACTCCCTATCAGTAATTGCTTGAGATCTGAT
ATGTATCTTTTGAAACGTTGGGGTGCATGATTACAAAATTTAGAGATACT
ACCACCGGAGTGCCCTCTACAAATAATATGGACTAAACCTCTACAAATTT
GTTGTTTGTAGGTCACCAACTTACAAAACAGGGAGGCAGACTATAACCAA
TACACCAACTCAGGTAATTATCTCAATCAAACAAGATTTGTGTGTTTTGA
AAAGTTTGCAAACTTCAATATGGGTCATGTGGATCAATGATGAGGATGCG
AAATAGTCATATTGTTGATAATTGTTAAGAATTGGCTCCCAAGGACGTCT
ACTCTTGAATATGAGGCAACTAAGTTTGCACAGGAATTAACATGCCAGAA
GAATGAAAATGTTTTCCATAAGGATAGAATATAATCCATGTATGTGTACC
TTCTAAGAAGGGAGGGGAGAGGGTTGTTTTACATAAACCCGTATGATTTA
AATGCATACATGCATCCATTTCTCCAAATTAAGAAAATGTGCATGATTAA
AAGAGTCAGCAGGTTGTGTTACAATATTAGAAAAAGACCACAAATTTCAA
AAGATATAAACATTTGTTTATGTATTCTGAATATTAAAATTGCATTTCTG
CTAATACAGATTCCTAAATGAAAATCCTGAAGGGTGAATAGACATGTAAT
TTGTAATAATCATTTTTGGTTGAGTGTACCTTCTGGTGCCAGATAGTGGG
AATATTTATTTTACACAATTTCTCCAGTGTGTTGCAATAATGTAGAGCAC
TACTTTTTTGGTTTATCTAAATGCTGTGATTTATTTGTTATGCCGGCAGT
TTCGATGGGGGTGCATGACAACGCCAACCAGTTTGATTCACTGGTGGCTA
TCGCCTATATACCAGTAGTGTCGGACGAGGTGGGAGGTGATGATAGGTCG
ATGCATGGCAGTATGTACCAGGATGCTGCCAACCCCATGGATTATGTGCA
CGAGTCCATCATTAGGTTAACATTTATATTTACCCTTCTTCCTTTTCAAT
GCTTTGTTGTTCAAAATTTTGACACATGTGTTAGTGTTATGAGTTGGTCT
GGTAGTAAACAACTAAAGAACACTCAGCTATAAGAAAAGAGTAATTTAGT
GGTGAATGTGTGCATTATTATGTTTTTACATTATCATAATTAGGGAATGA
GTTTATATTATTGTTACTTTGCGTTGCTTTTTTACAAATTCAAATCTTCT
ATTATAAAATGTGTGTTGATTATCAAGGACTTATTTAAAACATACTTTGA
TATTTCATCACTGTTTCTGAACTTGGCAATGAATTATACATGGAAACTGG
TTCAAAGAGCAATTGCACAACTATGATTTTTAATAGGAAACAATGTGTGG
AGAATATAATTACATCACATCTGGGTTATTGTAATCTTTAATACTATCTG
ACCAGACAATATACTATGCTCATTCTCTCCACTTTGTTAACAGAGCGGAA
GGAAATATTCATACTCCAATCACTATGGGCATAACAAATACTATTGTGGT
CACAAGTGGCTCCAAATTGTGTGACGATCTTTTTCAGTGGGCTAGATGTA
CTATTTCATCACGATGGAACGGCCTGGAGGGGCAAAGGCTTCATCATGAA
TTATTTTGCCTAGAAAGTGGCCTACAATATCTTATGGATACTCTTCCCGC
AATGTATGACCTCATTGATCGAGTAGAGTGGAGGAGCCACAAACATCGTG
TGGCTGAGCTCCTTCCAAACCTCAAGGACGCGGTGTATGATGCCGATGAC
CTTCTTGATGAGTTTAGATGGTATACACTAAATTTGAAAGTGGAGGGGAA
TAGAAGCCAATCTCTTTCAGTAGACTTCTTCAATAGTTTCATTCAAGGAA
GCTTTATCAAGTCAGTGAATGGTATCCGGGGTAGGCTGGATAACATATCC
ACTCGCCTTCTAAATATGGGGTTACATGAAGTATCAACACGGTTTGGCAA
ATCACTTAGGCCAGAGACTAGCTCCTTCCCGAATGAAACAAAAATATTTG
GTCGTGACATGGAGCTAAAGAAGATAATTAGATTTCTCTGTGAACCTAGA
AATAATAACATCGCTAATCACAAACGCCAGAAAGGAAACAACGCAGTCGA
TGTATCAATAAGCACATCATCAAGTAACCAAGTTAGCAGTGAGTCAAGCA
TAAAAGATCTTACTGTTTTACCAATAGTTGGAATTGGGGGTGTTGGAAAG
ACTAGTTTGGCTCAACATATTTGTAGTGATGCACGAGTGAAGTCTCATTT
TGATCTGATAATTTGGGTTTTCGTCTCAGATGACTTTGATGTGAAGAGGT
TAACTAAAGAGGCTATAGAGTCCTGTCCTGGACAACAAGCATCAACTAAC
AATTTGAATACTCTTCAAATTCTTCTTTCTAATATTGTGAGTAAAAAAAG
GTTCTTGATTGTCCTTGATGATATGTGGGATGATGTTTTGAAGGAAAATG
GGCAGAGCTGGAATAGGTTTCGTGCACCTTTCAACAATGTGCTACAGGGA
AGCGTGATATTGGTCACTACAAGAAGTCGTCAAGTTGCTGACGGAGTGGG
CACAACGGATCCCATCATACTGGATGGTCTAAAGGATGATATCTTTTGGA
ATTTCTTTAAACTATGTGTGTTTGAATCTGGGAGTTCTAATAATAATGAT
CCTGAGTTGGAGCGAATTGGTAGAAGCATAGTTCCTAAGTTGAAGGGTTC
ACCTTTAGCTGCGAAAACTCTTGGACGGATATTAAGAATGAATCTTCAAG
CAGCTCATTGGAATGCTATACTAGAGAGTGAATTGTGGAAGTTGAGGCAA
GAGGAGACTGAAATTTTGCCAGCCCTTCGGTTGAGCTACATGTATTTACC
ATTCCATTTGAAGAGATGCTTCTCACTTTGTGCCCTTTACCCGAAAGATT
ACAAATTTCAAAAGGGTCATTTAGCTGAATTTTGGGTGGCAGAAGGCTTT
GTGGAACCTCAAGGAGACATTCCAGTTCAAGATATTGGCTGTGAATATTT
TAATGACCTTTTGGACCGGTCCTTCTTTCAAGAAGTTCAAAGTGAATATG
TAATCCATGACTTGCTGCATGATATGGCACAGAAAGTTTCAGAGTTTGAC
TGCTTCATCATAAAAGGAAGGAGTGACTTCAAAAGTATTCCGCTGAATGT
TCGCCATTTGTCAATACTCTCTAGCGCAGACATTGACTATTCCAATTTGT
TGGGTCTATGTCGTTTCAAAAAGCTCCGTACTCTTCTTTGCAACAAGCCT
TTAGCAAATAACAAAACTCCACCCAGTTTGATGGCAGCTTGGTGCAGTGA
ATTTCTGCGTCTGCGTGTGATTGTTTTTGCCTCTACCGATGACTTGCCAG
CTAGTATTGGCAACTTGAAACATCTTCGGTACCTTCAAATCTCCAGAGTT
TGCCCTCTCAAGAGTCTTCCCCCAGAGTTATGCTGGCTGTATAATCTGCA
GATTTTAAGTATGCAGCAATGCAAGCTTGAAAGCTTGCCTAGTGACTTCA
GGAAGCTGATATGCTTACAGAGATTTGAATCACATGGATTTCGCTGTGAT
TCAGTGTTTAGAAGATTTCAGAAAGAAGAAATTTATTTCAAAGTATGGGT
TGATGCAGAAGATGATGAGCAGGGACTAGGAATTAGGTTGATAAAGAATA
TTAACCAACTCAGTGAATTGGTGATATATAATATTGGCAAGTCAATTATT
AAGGAACATGCAGCAGAAGCCCAACTACAGAATAAGAAATATCTTGAGAA
GCTGAACCTGAAATGGTCTTTGTTGTGGAATCCACAGGATATTGACATAG
AAGTGCTTCAATTTCTGCAACCTCCCCCCTGCCTCAAGTCTCTGCTCCTC
CATGGTTATCGAGGTCTTTCACTTCCAAGCTGGTTTCGGCCACATAATGT
GCCAAGCTTAATGTCACCTTCATTTATAAGCTCTAGTGGACTTGAGAGCT
CATCAGTACGCGGTATCACAGATCTAATTATTGATGGGTGCGAAAATTTA
TCAAGCCTCGAACATGTTATACATCCAGCTTACATACCAGCCCTCAAGAA
AATTAAAATTAAAGATTGCAAGGAGTTAGTATCAGTACCAGCTGAAAGAT
TTTGGGAACTCCGTTGCCTTGAAGAATTGGAGGTGCAGGGATGCCCAAAT
ATATGTTCCCAAATTTTGGTTGCACCCTCTCTCAAGAGGCTTGTGTTGGG
CTCTAAGGATTGGAGTGGCGACTACACTTGTGGGAATCTTGCAGAAAATG
TCGACTGCTGCTCCCTCACCTACTTTTTTTTGTCATGCAACTACCTCACT
TCCATTCAACTGCAGAAATGGAATCTTCCAGCATTAGAGGAGTTGCACAT
TTCAGAATGTCGACGTCTTATATCTATTGTCGGACAATCTGGACATGTCA
TCAAAGACAGCAGCAGTGTTAGAGCATTTCCATGTCTTGTTTCCCTAACC
ATTGAGTGGTGTGAGAAACTGTCAACCATTGCTGATCTCCTAGCAAAAGA
ATATCTACCTGCCATTGAGAGAATTCATGTTAGATTTTGTTTCGAGTTAG
TGTCCCTGCCCGGTGAAAGCTTTGGGATTTTTTCTTCTCTGAAGCATTTG
GAGATCTGTTATTGCCTTAAAATTGCTGGGAGGAGGGGATTTGTGTTACC
ATCTTCCCTCCAGATTCTGTCCTTCTATGATTGTGGGGATATCTCTGCAT
GGGTTCCCAGCTGCCTACAGAACCTTGCTTCCCTTATTACATTAAGGATT
GATGAATGTCAGCATATAACATCCATTCCAGGAAACCTTTGGAGCACTAA
TCTCACATCACTTGAGAGTTTACTGATTCGTGATTGTGATGACATTGTAT
CAATTGGTGGAGAAAATGCAATTTCAGAAATAAAAAATGTCTGGATTCTC
GGCTGTCCAAAGCTGGAGGAACTCAAACAGCCCATGGTAAGAGGCAGCTA
CTTAGTATCATGAGAATGGAGCCAGTCTTCCCCTATGGTACGCTTGTTTA
TACAAACTTTCCAGATTGTACTCATATGTTTCTTGCACTCCTCTGACGTA
GGATTGGACATATATATGAGACCACTTTTTGCTCATAACTATATGTGTAC
TTGTATTTCCAAAAGTTTAACCATCCTTGACTTCACTGATCAATGTTTTT
TGTTTTGGTATATAGCTTCTTATTGAGTCAACAACCAATTGGGGTGAAAA
ACCTGAGCTACTGGATGAATCAACTTTAACCTGAGCTGGTGTACTAAGTA
CAGTTTTGATCATGATATTCTCCTCCTGTGATAAGTGTATAGGTGTTCTT
TTGGTAAGGCTGTAGCAGCTTAACATCTGAAGAGCCTGCAGATGCATGAT
GTGTTTTTTTCTTAATTAAACCAGTTTATTATTTGACAACTGTAGTCATA
GATACTTGGTCTTGTTATATCTGAATCATCTTCTTCTACATAGTATTTCA
TAATAGTTTTCGAATAGGCATGATATGTTGGAAAGAGTCCTGATCCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.