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GrainGenes Sequence Report: AE005467

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Sequence
AE005467
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE005467
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCGCACGCCGCCCACCTCCGCATCTCTCCCTTCCCCCACGTCGCAAACCC
TGCGTCGCCACCACCGCCTCCTCCTCTCGCGGCGACTCCGCACCACCCCG
CTCCCCTCCGGTCGATATCTCCGTGGTTTCCTCTCCGCCGCGGACCCGTC
GAAGAACGCCCTCTCATCGCTTCCGCCGCGTCCTCCTGTCTCCGCCGTCG
CGGCTGGTGCTCCTGTCCTCGCAGTCCTGCCGCTTTCGCCGACACCGTCG
ATGCCACTTCGGTGGCTCGTGGAGACGGGTAATTGTCTCCCTTATACTCC
CTGCCTCTCAAGGATCGACTTTATCCCGCTTATTCTGGATTTGAATCGTT
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CGCCCATAACCCTGTTGATGTCAACAATTCTTCTAGAACAGGCGCAGAAG
AGAAATTAGATGGTTCCTCTGGAAAGTCTTCTGTCAGTTTGGATGGTTTA
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AGGACTTAGGGCATGCCAGTCAAATGGAGATGCCAAACAAAATGTGAATG
TTGATGCAGAAAGGAAGGATGTTGGGAATAAAATGGTAAGCAAGGAAGTC
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TTGCTTGTTCATAACAACAGTTGTAATGGTTATACTAATGATGCTGGTGG
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CTGTTATTTATTTGTCTTGGCATAATGTTGTTAATTAAAACCTTTACATA
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TAGCGAATTGTCAGCCCTGTAGAACCTAATCTGTACACAATGATAATAAT
GTTTATACATGGTTGTTTGCAGGTAGTAGTCACTAGTCACTAGGATTCCT
GTTCTTGAAATTCTGTGCCAAACTGTGAACATATAAAATGAGAAAATAGC
CCAGCAGAGATCATGGCTGTCAAATGTATACCCTAGAGGTCATATAGGCG
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AAAATCTTGTCGAACTATCGGAGTATGTGCTTTCATTCTCTTACTTAGAA
TGCAGTTCTTATTTTCTAGTAGACACCTCTATAAACTACAGTCATTTGTT
TCCTATCACAAATTTTATGGCCCTGTCTAAGTTTTGTGATACGCCTTGTG
TAAGTTTTGTGATACATAATTCACATTGAAGTTTCTAAATAGTTATCTTT
TTGCTCTGTTTACTCCAGTTCATAACTGCACCATTTGAGTCAACAATGTG
TTTTTCGTAATTGAGACTACTATGTTGTATGCATATGAACTTATCTATTG
CAACAAGGTGGTTCTGCCTTGTTTGCATGTTAGTTGCTTCTGGTATCTCT
AATGGCTTCGCCCTGCATTTACTTTATTGTTTGAAAACAGTGGAGAGGAA
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CTCAAGGCAAAACCAACAATTGACAGAAAGAGCTATATCGTTGTTTTCTT
CCCACGAACTAGAACTTATTCTTGGGTGGACATGCTACTTGTTCTTCCAA
TCGATGAATATCCTGTGCCACTTGTGAGTGGAACTCATCGCAATTGGCGA
AAACTGGTGAAGGATTTGAGTGTTCCTCGACGATTCATCATGCAGAAACT
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ATTTCCTGTTAAGTATTATTGTATTCATATAGTATCATTATTGCTCTTGA
CACTGTTTATATGTTTAATAGGCCATAATTGAGAATGCTCGGATGGCGAC
AGCTTGGAAAGAATTCGCTCAGGAAGCATCATGCTGTAGAGATTATACTG
ATCTTGGGAAGATGCTTGTCAAAATTCAAAACGTAATGACCCTATTCCAT
ATTATCTCATGGTGACTCTAATTTTCTCCTTGCAAGTTTGATGCTCTTAT
ATTGATGCAAATCCTTATGCATTGTTATCCTTGTGTAATGGAAATATATC
GGCAACTTCTATGTGTGTATTCCTTTATCGCCTTATGTGTGGCATCACTG
ACAGTGATTTGGCAGTATATTTCTCTAGGCAATTTTGTATGGTAAATAGC
TTTGTTTGCTGTTCCTGGATAAGAAACACCCATTGTTGTGCACCTTGATA
CCTTCTTTATTATATCTAGGAGTTTCATGAAATGTTGCTATCACGTAATT
GCCACAACTATGTCAGGTCCGTGAAATAGCTTTCTGTGCAGCAGCATTAG
GCTATTACTTTGCAATCTTCATACAAAATGTTAAATCTCCGTTATCAGAA
ATTGATTTGGAAATTTCTCAATGTGGAAGGACATGCTTGAGTATTGTAGG
AAAATACATATATATGTGGTACATTCATCAAGGTCCAAGTCCAGCTGATC
ATATAAAAAGGACATACAAAAATACAATTTTTTTTTGGCTGCATTAGGCC
AATACATCCTCCAGTTTATCAGTGTTGTAAAGAATTCTAAGAGCGAGCTA
TAAGATATGCATTATATCCATCTCTGCTTCATCCAACATTCAGTGCTGAT
GCCACAAACATAAGAAAAGTGTTTTGATTCTTGAGTAACATCAGAACAGC
CTCTTTCTGGCATTTCTTGGCATTGTTTCACCTTAGTTGTTTAATTTTAG
ATGATTCTTCCAGACTACACAAGCTCTCATTGGCTGCAAAATTCTTCCAA
CTTGTGGGTCCAGAAGTGTAATATTGCTCATGATGCTGGGACTGTTGAAA
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GTTTGTGACTTTTGCATGCTTATAAAATATGAAGTTACACATTTTCGTAT
GCCCATTTCTCTTTTCAGTATGAGCTTACATGTCTACACATATCAATATG
GATATGGTGCTAACCTCGTTCCTATGTTATGATTATTTTCTCGAGAACAT
GTTCTTGAGTTATCACTAAGCTCTTGAGCTCCTTGCACAAGCTGCACATA
TCTAGATTAGTGAAGCTCATAAATAATCCTGTCTAGGTATGCACTACCTA
GTCCTGTTTGTGCTGCTGTCCATGGGACTGTTTGGGCTTTCAATTTATGT
GAAAATAAGAGGTTCTGAAGATGCAAATCTAGTTGACTTGCCACTAGACG
AGTAGCTGTACAGTTAGTCTTGATCTGACATTGGCTAGTATTTGTTGCCT
ACCCCAACATAGCCTGACAACATGTACCTTGTTAGATTAAGTGGATGAAA
TGGTGTAAGATGGATACACCCAGCAGGAGCTGTTTTCTCGTGAACATATT
TTTGGAAGACTAATTAATTTTCCTTCAATTGGGTAGAGATTGGTACTTTT
GTTTGGTTTACTTGATACCTTCTGTTTGGCCTACGGGCGGACAATGAACA
CTGAATCTGAGAAATGACATGCATACCCCTAATAATATGCTATACAACAG
CTTGCCTGTTCCAAAACATTAAAATAAGGTTTGAGAGTGGATACATCGCA
TCAGTGGCACTCATTTGTAGTGGAACAGAGGGTGGTTTGTGTTGATTTGG
TTTGTGTCATGTGCATGGGTGAGTGTATCTCGACATGTAGAAATGCCCAC
TCCTAAAAATTAGTTGGTACCGTGGCCTGCAGTGGGGATTTTAATAAAAG
AACAGAAGCCTATCACTTTTCAACTTGTAACTTGAAATTTGTGCAGCATG
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TGTATATGTACTCTCTCCGTCCTGAAATAAGTGACTTGGATTTTTCTAGA
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CAATCCCGAGCCATTTTTATTTCAGGACAGAGGGAGTAAGATGTTTGTGC
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ATATTATACTATTTCCAAAGCGGGTTAAAACTTGGGCAACCTTGTTAATG
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GATGAATTGTGGAATGCACCAATGCAGCCTGAATTAGTGCCAGAGTGGAA
AACATGGAAACAAGAAGTCATGAAACAGTTCTTTTCATCACATGCTATAG
GTAACACGGGCAACTTTGAGCAAAGCAATAGCTATGATGATCCAGGTGTG
GATCAACAAACTCGCAGAAAGCGTCCCAAGCTTGAAGTACGCCGAGGAGA
AACACATTTTTCTCACATGGATGATGCTAACTGTAGCACTCTAAGCGAGG
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GAAGCATCAGCATCAACAGATCAGAATAACCCTGTTACCTTCCTCAGTAA
TTCTGAGCCCCGTGAGATTGTAGAATCAGGCAGCATCAGCCCAGCTTCAC
AGAATGCCGGACATGAGTTTGATTCCTTAAAGAATTCTAGGCAGTGTTCT
GCATACATGGAAACGAAGGGAAGACAGTGTGGCAGGTGGGCAAATGATGG
TGACATTTACTGTTGTGTGCATCAAAGTATGCATTTTGTTGACCATTCTT
CTAGGGAGGACAAGGCACTTACTAGTGACACTGTAGTGTGCAGTGGTATG
ACTAATCTGGGTAGACAATGCAAGCATCGAGCTCAGCATGGTTCAATTTT
CTGCAAAAAACACCGTACCCAGACAAACCTGGATACAATAAGCTCAGATA
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ATAGGGATGGAGAAGAATCGCAACTTGAATGCAATATATGCCGTGGGCTC
CAAAAGGGCCAGTGGCTCCCAAGTTTCTGTTCAAGTTAAATTGACCCCCA
CCATTTCCGAGGAGATTTCAGGTGATAAAGCTCCTGGATTTGAGAGCACT
GATTTGCTCTACCCCATGTCAACTTCCATGGCAACAGCTAATTTAGATAC
CCACCTTTGCATTGGAATTCTTTCTAATGACAACATTGTCGAATGCCAGG
ATTATGCTAAGCGGCACACACTTTACTGTGAGAAGCACCTTCCAAAGTTC
CTTAAACGTGCCAGGGATGGAAAAAGTCGACTCATCTCTAAAGATGTCTT
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ATCGAGCCTGCGAGTTTCTTTATTGGTTCTTGAGAAACAACATTTCTCGT
CAACACTCTGGTCCTGATAGCAACTATATGCCTCAGATACTAGCTGAAGT
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AAAGAGAAAAACTCACAAATCTTTGGGGCTTTGGTGCAAATGAATCTAAG
CAAATATCACTTGATAATCGGGAGGGGCCTACGATGGTTTTACAAGGAAC
TAATCCTTCAGCTGGTCTGAAGTGCAAGATATGTGTTCAAGATTTCTCTG
ATGATCAATCTCTTGGGTTACATTGGACAAAAGTTCACAGAAAGGAGACT
CGATGGCTATTTAGAGGGTATTCCTGTGCTGCTTGCATGGACCCTTTTAC
AAACAGAAAAGTTCTTGAAAAACATGTGCAGGAAAGACACGGTGCTCAAT
TTCTCCAGTATTCAATTTTCTTCCGGTGTATGTCGTGTAACAGCAACTTC
TTGAACATGGATCTTTTATGGCAACATATTGTTTCAGATCATGTTCGTGA
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CGTGGTCGACACTACTATTCTGCCTTCAAGCAATCCTTGCGACCGTCAAG
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CAAGCTCTGATCTCTCTATGATAACATCACAAATTGTGGAATCTGGAACA
GCAAACATCGGTAAGTTGTTGGATTTTCAATGCTCAGATCTGGCACAAAC
TTTATTTTCAAAGATACAAAAGACAAGACCCCATCCAAGCAATCTTGATA
TTTTATCTATGGCCCGTTCTGTATGCTGTAAGACAAGTCTTCTTGCTGCA
TTGGAAGTTAAATACGGTGTCATGCCTGAAAACATATCTGTGAAAGCTGC
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ATCATCTATAAATAAAATCTTATAGGTTCCACAAAAGAGTCTTGGTCTTG
GTTCATGTCTACCTAAATTTGGTTTATCTTAATCAAAGTTTTCTAACAAA
TTATGTATCTGCAGAACTGTGTGGCCGGCTGTACATGTTCTCATGCCCAT
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ATGAAAATAGCAAAATCATTTTGCAGGTACTAACTGTTGGCATTTACACG
TCTTTCATTCTAGATGTTTTTGCATACGTGGAATTTGGAACAATGAAAGA
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ATAGTTCTACATACTTCAACTGCTTTTAATTGTCAAATCGACCTCCTCTG
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GGATGTGCCTGGCCAGGCAGGGCATGAACCCTGAATAATGTGGAGCTGCT
CTGCATGCCTGTAAATTGTGTCTCTGCATGCCTGTAAATTGTGTCTGACG
GAGTTCTCCTTTTACTTTAATTATTTTTTGTTAAATTTGCAGGAAGGATA
TCCGATATATGAGTGCAATTCGTCATGCACCTGTAATGCATCCTGTCCAA
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GAGAATAAGGTGAAATATTTATGACCAAAGTTTGGTTTCCCTCAACCCTG
CTTGCAGACCTTCGCTATTACGATAGAACGTGTTATACAGATCATATTGT
AATGGTTTCTAGTGCTGCAGGGTTGGGCTGTTAGAGCGGCAGAACCTATT
CCGCGGGGCACTTTTGTGTGCGAGTATGTAGGGGAGGTTGTGAAGGATGA
TGATGCCATGAGAAGTGCTGAAAGGTTTGCTAATTCTTTTTCCTGCCTTT
TTGTTTAAGGTTAAACTCAGTGGCGTTTCAGAAGTACAAAACATGGGCAT
CATTGGAAAATTTCATGTTTAAATTTGATGGCCATATTCCCAAATTAGAA
ACTGTAGGGAGGCCCTGACATGACATGCACATTTTTTTTGGGGGTGGGGG
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGGGTGGGAAG
GATTACCGTACACATGGTGGCTAAGCAAGCTGGTCAAGCCAGTCTTTGGA
GGAGATACAAGCTTTTCCTTCATCCTAGAAAGAAATAAGAAATAGATCCC
TTTTCTTTATTATGTATAAAGAGAAAAGACCAAGATGCTAGACCAGGTTT
CACATTGTCATTGTGTTTCTTTGTTTCCAGCATAATGCCACCACAAAGGC
CTCCATAAAGAAGGGCTTGCTGAAGTGATGCCCATTGTCTGGTGCTTAAC
GTTACAACTTACATGCCTAACCTTAGTCGAATCTTGCATCTTGGTATTTC
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GGTTTGGTTGTGGTGTGTCATGTGTGAGATTTTCATGGTTGGGATTCTGT
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GGGAATGTGTCCCGCTTTATTAACCATAGGTAATAGGACTATTTAATTTA
TTTTAGGAGCATCTATTCTGCTGGAGCAAATTGATTTTGAGACTTTTTTT
GTGTGTTTCTTCCTGACAGTTGTTCGCCTAACCTCAATACCCGTTTAGTT
CTGGTGGAGAGCAGTGATTGCCAGCTAGCTCACATTGGCTTGTTTGCTAA
TAAAGATGTAAGCATATTTTAGCTGTACTATTTCAACATAATGTTGAATT
GCAATACAAACTTTTTTTCTTTATAATTGCTGCTATGCTATTCTCCAGAT
TGCTGCTGGAGAGGAATTGTCGTACGACTATCGACAAAAGCTGCTACCTG
GTGATGGCTGCCCTTGCCATTGTGGAGCTCAGAATTGCCGAGGCCGTGTT
TATTGAATTTGCAGTGAGAGAAAATAAGGGGAAGGATGGATCCATTGCTT
AGTAGCGTATCTTGAGACGCTTGTAGAATGGTGATAAGTTAGCAACAGAT
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AATAGTGTTTGTGATATAGACAGTGGCTAGGTACACCATAACATTACTTC
TAGTCATGGCACTTAACTGACGGTTTGTTAGAAGCAGCCTATAATCAGAG
CAACTGAGGCTGCATTCCTTTGTAGGCGACAGGTCGGTCTTTGTAAAATA
GTATGGTCATTCAGTTTTTACTGCTCATAAGCTCCGCCATCGAAGTTGAA
GCAAAAATCTGTACCTGTCAGTCGGCTGATGACCCTGGCGTTTTGCTGGC
GTTACAGCACCTGTTTCTGCAGTTGTGTAGGTAATTGTGCATGCAGCGAA
AGTCTGAATTTACGGTCAAGCAAAAAATAAGTACTTCTCTTTAATTAGAT
GTGTTTAGATTCGTATGCATCTAGACTACGAGCGCAAGTATTTGATGAAC
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CCATTGGCTCTGCCGACTTGGAGATCCGGGGACCTGTGTGGTCTGCTGTG
TGGCGACGGGCTGCCGTGCCGTCAACCTACATGCCGCGTGTACAGTCAGG
GTGGAAAACAATGCACTGTTGGCAGTGGCGGAGCCAGAAATTTCATATTG
GGTATTTGAAGTAAAAAAATTCAATACACCAATATAATATATGTATATAT
GTAGGTTCACAATAACAAGATAGAGCTACAAAATTTTGAAAGTAATGAAA
ATGTCTACAATAATTAAATTATATTGCAAGAACAACAAAAAATATTACTT
AACTCTACGATATCCCTTTTGAAAGCGGTGATTACCTCCAATGTCTCTTA
TTGGAAAATCATGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.