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GrainGenes Sequence Report: AE034125

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Sequence
AE034125
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE034125
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGCATAGGGAAGCACATTGTGAGCGAGGGATACCAGTGGGCGATCTA
CTTCTACCCCGACGAGAATAACCCCACCGACGATTGTGGTCTTCATCGCG
CTCGCCTCCAAGGGCACTGGTGTCCACGCCTTTTTCAAGTTAAAACTGCG
GTACCGGAGCAGCGAGGGCAATCTGAGCACAAGGTCCACTCTCACTTTGA
TTACTCAGCTTGAGGACGAGGCCGCAAAAAACAGCACGACGGCGCCTGCC
AGACTTGCGGGTGCCCACGTAGTCAAGGCCATGTGCCACCACGTGCTCGA
TGATTTCCTCCGCGACATCGCCAACGCAATCATGAAGCCTGCTACAACGG
GCGGGTGCTCAGTCCAGAGCTTTTCTCTTCATTTTTACCTTCATTGTGGT
TTGCGCACACAACCTATTTGTTGAAATGACCGGCTGCTAATCCTCTTATG
CACATTGCAGATACTTCTCTAGGTTGGATTGGAGGATTACTCATTTTATT
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TTGTCACCAGGTCCAGCTGCGCGGTCCCCGATCAGCTTCTTTCTCCTCGG
CCCTAGGTTTCTCTGCTCAGTCCCAAATGTCCTCCCAGCCGGCGTTCTCT
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TTTTGGTACACCTTGGTTGAGGTCAGCGTTAGTTGGTCTATACAGCCACT
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GTTCAGATGCTTCTAGGCATGCTTCTTGCAAGTACTTCATATTATGTTTT
TTGGAGGATACCATTATTGTTTTCAGTTGGGTTTGTAGTTCTCTTCGGGT
ACAAATTATATCAATTTGAGGTTTGTATGTTTTCTCTTATGCCAGGTTAT
CAGCATACCACCATCCATAATTCAGATAAAGTTAGCTCTAAGGGGTATCG
ATCAAAGGTAACAGTTTCACACATGCAGGTAAAAAGCTATCCTAACAATG
AGAGTAAAATGGTTGTCGGTGGATTCATGCTCTTTGGACAGCATGGAGTC
ACACTCACAGGTAAAACACCGTCTTGGTTGTGGCAAGCAACACAAGCCAA
ACTGATTTTCCTTTGACCTGACATAGATCGACATCAGAGAGAACAAGAAG
GAAATTTTAAGGTCATATGGTTCAGCATCTAAAAAAGGTACATTTTGATA
CCAGTTTTACAACTAAATACTGGCTAAATCACATTAATAATACCAGCTCA
CCGTCGTTTTGCTACCTGCTATGGAACCCATCAAGACAAAAAACCATAAA
AGGAACTATTCCGGCCCGAATAGACAATAGTGTGTTGCCAGGTCTAGACT
TTAAAATAGCCTTTTTTTCTTCCTATTTTTCCTCTTTACATTCACCTCTT
TCTCAGTTTATATCTATCTGGCCACTTAGGCGATGATTTAGATCGTTTGT
TCTTCTTATAGTCAATTTACACCTAATATCTGCATTCTTAAAAATACAAT
TTCCAACACTTCATATTTTCCGTAGGAGCTTAATTAACTTGCTGATCGCC
GTCTATAATCATTGTTTGCTGTGTTGCATATAATTATGAAGGTTAATCCA
ACTGAATATGTCAAAAAGAATCGGTTTGTTTTTCTTATGGCAATGATTCC
AAAACGTCCAGATTAGCCGATAGTGATCACAGTGTCGGTACAACTGAAAA
CAGTAAAGAAACAAGGTTATATGTTTTTTTATTGGTTGTTTGGATGCTTA
TGATATGAAACCAAAGTATAAGTTACAGAATAATTTGATATGATAGGAGT
TGGTGAAATCAATTGTTTTTCATGTAAGACTGGATCCTGCTGAAAAATGG
TAAGATGCTATCGTGTCTGCAGCTAACGACTGACCTCTGCATTTGCTCGC
AACATTATAGGATCAGCAACGGAATCTTAATATGCTCATCATGTAGTCGG
CTTGCACGGACAACTTGTGTTACATAGGTTGCAAGACATGTTGAGAGAAA
GAGAACCTACCTAGAGATAAATACATGCTCCATGTCTGAAATTATTGAGC
CTTTCCAAGGTATTATTCTACATAATAATATATGCATTGGAAGTGGAATC
AAATACAAAGCTAGGTTCATGGAGCTGACCACCAATTGACTAGATATGGA
ATATTCTTTCTTCCAGGTTTAGTCCCGTAATCAAAAGACCAATACAACAG
AGCAAACCAATTGGAACAACACCTGTGACAAACACAACCAACATGGTCTC
AGCAATACAACAAAGCATCCAAGTGAAACTACAGGCACCAACATGCTCCT
TGACTCCACAAGACCAAGGGAAATATTTGTTCTTCTTTGGCATAGAGATA
TATCGGTTTTTCTCTGGCATGGAAAAGTTCTATAATATTTCCCATGGTGA
CCATACAAGGCTTTATCGACAAGTTTTATACTATTTTGGCCAAACCTGAG
ACAGGGTGATTCGCTCTTATAAATTGGTCTTCATGATTTTATCAATTAAT
GTTTCTGTATAGATTGAAAGGTTTGTTGTGCTCAGTTTTCAGGTGGGCTT
TTCATTCTGCTGCCAAATCATTAATGGAAAAGTTACTATACTTGCAGAGT
CATCGATTATATCGACCAATGAAGTTCATCCATTATCTAACTTTGTTCTT
ACTAATTACAACAATATTTACTTCCTGACGTAGCCATTTGGTAAGATAGT
AGTAGCATAAATCATCTGTATTTACTTTGCCCTCCTCTCTCTAAAAAATA
TTATGTTGTGTTTAGCAACCACTGCACAACTTAACGTGTGAAAACATGGA
TAGGCATTAGACCATTGTCTTGCTTAATTGAGGCAATTGGTCATTTTTTA
TTTAGTAATTTGAATATTTCATCTTGCTCTCTGAATTGCTTTAGTATGTT
AGTGTTTTCTTTCACATGTCTTCTAATTGTCGACAAGCGGTCGAGAACAT
TTGTTTGTTTCCTTGGTCCTGTTGTGTTGTGCTTGCTTAGGTGATCACAG
TTCAACGAAACTAGGCCAAATATAGTTCGCTTAAAGGCTCTTTGCACTTG
CACAATGTTTAGAGGATTTATCTTCGGGCCTTCCAATTTTTTTATTTAGT
GCTACATTGATAAGATTCATTCCGGTGGTGCATAATTTTCAAATAACGAT
GTTGAAGTGGTGGAGCAATACATATCAAGTTCAACCAGTATGTGAAACAA
AGAAGGTAATTCTTCTGCTCACTAAGAACTACTTATTTATTCCAAGCCTT
CTCACTAAGAACTACTTATTTATTACAAGCATGTAGCTAAAGGAATTGAT
TCTTTGATAAAAGAGGAAATTGATCATCTTTTTCTAACAAGTAGTAGGTG
AAATTATGGCTGAATAATATGTTGCACAAAAAACTTTAGGAGCATAAAGG
AATTGTTCTAAAATAAGTTTCTCAATCATACACATCACCATTCTTTTAGC
ATACTATAGCATTTGAAAGGGCAATCAATGTACATTGTTATGATGTTAAC
TTCATGGTAACATTCCAAGCAGGGATTCTATAATAAACCGGTAGGACAGG
AATCTGAAGTTGATTTGCTTAGATCATTGCCAAGGGTAGATACCTTTTGT
TTATTCTATATGTTTGACAACTGATGACTAGCTACGACTGTTTTGGTATT
TCTCACTGAACTATGGTTATGATAATTAATATTTTTATGTCTGAAAGCTT
TTTAGATAAATTATTTGGATATAATATAGTGAAATACCTATTTAGTCGTT
AACAAAGTTGTATTATTTTACTGTACACAGGTTCACGATGAGATAAATGA
TGCACCATCTTTGGTAGCTGTTAATGTTGGAATAGCTCTGCATACTCACT
CAAAAGAGAACACTCACTCTGATGTTGCTTCATTTATCCACTAGGGGATA
AACATTTTTAGGTTTTTCTTACATGATTATTTATAAGGATGATGATAACA
CCTCTTGACTCATGATAAATCCTCTTGCACATGTTGTAGAATGTGTTACA
CATGTGTAAAGCAAGTATGGCAAAAGTTCACCAGAATTTGGCAAAGGCGA
TGAGATATTAACTATGAGTGTTTAGCTTGCAAAAATTCAAAGTGCGAGTT
TTAGAGCTTTCATCCCCAACATAGGTGATGTAGCCCGTCCTGCGGACGCT
ACTACATCCACAACGCCCAAGTCCCCAAGATCGTCCCCAAGTCAACCAAG
AAGATGGACCAGGAGCAGCCAGCTCCAGAACGAGAGTCTTCGCCATCATC
GCCTCGGAGAGTTCGCCTGAATCCATCCGGAGTGTCCGGCCTGCCCCAGT
CCCAACCTGGCATGGACATTCAGAAGGCCAGTTCGGACACTACCTAGACA
CTACCCGGACTGTCCAGCCCAAGTGATGGGCCTGCGAGCCAACAGCTGGG
CCCTTGGCCCATGTACCCCTCTATTTCGCACCAAACCCTAGTTTTATGCC
CAAACTATCCCTGAACTTGTGGTTGGCCTATAAATAGAGCCCCCATCCCC
TCATGTATCCCTTAGGCATAGATGATAGACTAAAGACAACCCCCTTTGTG
GAATATCTAGTTTTGCCTCATCCCCTTCTACTAAAGGGATCGACTATCGT
CACCACCTCGTTGGAGTTTGTATCGCGCCTCCCTCGTTGTACAAGGCCTT
GGCATCGGTGTCCCTTTGCCAAGACGTCAAGACCCTCTCCAAGGTGTTCT
TCCCTCTTCGCGTGGGATCGAGGGAGCACGTTGACCGATCTTTCCTTGCG
AGGATTCTATTGGACCGGTGACCACCGTTGAGAGCAATCGGCCTTGTATC
GTGTGTGTTTTGCGTGTGTTCATCGTGTTCTTCGCGAGGTGTGCGTATGC
TTCCGCTACCTTCTCCCTTTCCCCTCGCTTTTCCATCGATTTGACCACGA
GATCCGTGAAGATCGGGCCACCCTAGAGGTTTGCCCTCATCATCTGGTAT
CAGAGCCCAAGTTGCCATGGATTTCACCCTCGTTCTTCCCCACCAATTTT
TTTCTTGAAAAACCACAAAAATAGCGACAAATTCGAGTGGATCTTGTGTC
AACCATCATCATCTGGTATCGGCAGCTTTTGGTTGCCACGGATTTCTCCT
CGATTTGGTCTTTTCTCTCATAAATTCGAAAATTCCACCAAAAATAGCCC
CAATTCGTGTTTTGGATCGATCTGTGATTTGAGTGCATTTTGGTAGGTTT
TGATCCGTGGATTACTTGCTAAACTTGTTGATCTACTTTCCCCTGCGTTC
CCATGGCTTAATTCCTTGTTTTCCCCCATCAATTTGAGGTTTTGGTTCGA
GTTTTTCCGCTAAAACTCGTCCCGTTCGTGTTCTGGAACTTCTGGATCGA
CCGGACCAGACTGTCCGGCCAAAACGGACCGGAATATCCGCCCCACCGGA
GTTTCCGGCCTAAACTGACCGGAATCTCCGCCCCGGCCGGACTGTCCGCT
CTCCTGCTCACAGAAAAATCTGTTTCACGGTTTTGAGCATAACTTTTGCA
TATGAACTCGGATTTTAGCGTTCTTTAGCTCGTTTTGAAGAGGAGAAAGA
GCTCTACATCATCATATCCGTGGTTCATGCTATCTACTCCATCAAAATTC
CGTGAGCAAGGCAGAATCCACCAATAAAGGGTGAAGATCGGCGACGAAAG
GTATAAAAATTTCGCGACTTCTCCCCACTTGCATCCCTTTGTGAGCCACA
CTATCTTTGCGTTCAACAAACACCTATTGAGACTAGTTCCTCCTATGATT
GCTTGGGCTATGCACATTTGATACCTTGTAGAATTCCGAGCAAAAGTTGT
GAGCGCGCTATCTCATATTGTTATCTTGTATAGTTGTTGGCACAAGAAAA
AGGGAAGTGAAAAATAAAAGAAAAAGAGAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAA
AGAAGAAAAAGAAAGAAAGAAACAAGTGCCTCATAGAATAGGAATCGCAA
GCTCGATGAACATCAAATAGGTGGTACTTATTGTGCATATCTTGTAGCCC
ACCAATTATTGCAATCGAACTAGCGTCTCTCCTTGCACTTGTGTGACACG
AGCTTATAGTCTTCGCTAGGTAATCATTTGGTTCTTAGCTCACTTTCTCC
GTCGCGCAAGTCCCATTTATCCCACCGTGTGTGTTTCCTTGTACATATTT
CCTCTTGTGGATTGACTTGTTTTGCTTTGTGATTATTGTGGTTCTTTACT
TGCCATTACAATATCTTGATTTCTGATTGTTCTTGGACACGCCACCTTCC
ATACCTATCCACCATAAGCTTTGTGTGTGTGTGTTTTTTAGTGGTTAGTT
GGTTTTGGTGTTCCGCGTGAACTTCACTTTGCTTGGTTTTGATTGCTCTC
AAGTGTTGCCACTTGCACGATACTATCTTCCAAGGTAAAGTAAGGTTTGA
CGTTGCATCCCTAACCCCTACCACTTCCATATACACCACTTGGTCTTGTA
AAACATGTCTAGGGACTCTGGAACCAAGGATGATTTCTATGAAGAATCCA
CGATGAGCCACCATGCATATGCCTCCACAAGCATGGATGACATGATGGAG
CACTACACCGACAATGGCTCCACATGCTTGGGTGATATGGAGTTCTAGAA
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TCCTCAAGTCTCGTCGACCAAGACGGAGCCTCCACCTAGAGAACACCAAG
GTCCATCATCAAATGCAACTTCAAGTGCGACATGGACAACGACTTCGCCA
AAACCATGAGCATGATGGCCAAGACTAATGATGCTTTGCGCTCATTACAA
TGCCTCACCAAGAAGAGTGCCAAGGACAAGAAGCATCGTCGCGAGCGTTA
TGTGGATGACCAAGTGCGCCATCTACATCAACCTTTGGCAAGGCACGCCA
AACCTTCGTCGACACAATCAAAGGGCACCTTCAACTACTCGTGCCACCAC
CAAAATGGCACCAAGAGCAAGCTCTCCTCCACGCCATCAAGCTTCAATGC
CAAGACTTGACGTCCTAGATGACGCATGCACCTTCATGGATGAGGAGGAC
GAAGACCTCTACTTCGCCAAGTTTGATGAGTACGTCAAGAGGACTACACA
AACCAAGGTGCAAGACAGTGATGACAAGGTCAAGAATGGTGAGCATGGGA
TTTTCCCTTCACCAAAGGAGGCGCATGGAGTTGAGAGAACCAAGCCTACC
CCCATATGCTTGAGTGATGATGTGGTACCAATCCCATGTGAGTATGAGAG
CCACTTAGCCCACTTGAGTGGAAACAAGAGTGAGATGAGTGACTCCACCA
TATGTGAGATTGAGTGCTTCCACTTGGAGGGCATGAGTGATACACCGAGT
GAGTTGAGAGTGGTAGTTGATAGGTCATGTGAGACCACTTTGATTTCTAA
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TGGATCAAGAAGCGCCAAGCTTGGAGATGATGATGCCTCCTATCAAGAAG
ATGTACATGGTGGATGAAGATGATGCCATCCCCATGGATGATGAAGAAGT
CGCCCACATGGAGGCTAATACTACCACAACACCCACTTCATATGAGAGGT
ATGAACAAGGTAAGAATACAGGTGTTGATGATGCCATGATCCCACGAGTG
GACATGATGATTTGTGATAACTTGCATGCTATGGATGATACTTATGACAT
GACATATGTTCCATTCTTATTCTCATGTGTTGATTTTGCTATGCATCATG
ATGACCATGTGGAATCCTTCTATTGTCATGATATTGCCATAGACATGACA
TGCTCTAAACGTTACATTGATGATATCATTGCTTGCACTTTGTTGAACAA
TTGCTCTTTCCAATGTTTTGCTTGGATGTTACCAATGGTACCCCTCGAAT
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TGAATAATTGCTCTTTCACTTGTTTTGCTTGCAACAATAATTCTCATATG
GTTTATATTGAGATGGCCCCCATAGCTTTCTCAAATGTTGGAGATTTTGA
TGATTGCCATGATAAGCATGTTCTCCACTTGCATACTCACCATGCCTATT
TTTCATACTTGATTGACACTAATGGTGATGTGCACAAGAAGAGATACGTC
ATGATGGATGATGTGTTTCTCTACCATGCACACACGTTCTTCCTTTTGTG
CTTGATGTGTGTAGGTACCCGCAAGAGAATGTCAACCTCGGTTGAGCACG
AGTTGACAAAAAGAGCTGTAGAGAGCATCCCCCAAGTGAGTTCAAGATCG
AACCCAACTCTGATACCTTTTGCATGCTTTGCATCTTTCATGTTGACAAA
TTGCTCTTTCCTATGGTTAGCTTGCAAGCATGTTAATGGTATTCTTTCAC
CTTGTGACAATCATGTTTCATTGCTTTTGGATATGGATGCTTTGTGTGTT
GCCACAAAAATGTTGAACAATTTCTCTTTCCGATGTTTGGGTGCAACCAT
AATGCCATTATGAGCATGTATTGTCACGAGAGCTTCCAAGTCTCTCGTAT
TGTTGTTGCAGCAAACATAAGGACCACTTGCTCTTTCATATGGTTTGTTT
GTAAACATGTTGTTTTTGTTTCCGCTTGCGATACTCATACCCCCATGATT
TTGGCTTTTGATGATATGTGTATGGCATCCAACATATTGAACAATTGTTC
TTTCCAATGGTTGGTTTGCACACATAATGTTGTTGCTTTGGATACTCTTC
CTCATGTGTTTTTACCGAATTCTCCTAGCTTTGCATCAAAGATGTTGATC
AAGATTTTAGTTACTTGCTTTGAGTGCCACACTAAGATGTTATATGGAGT
TTTTAAGTTCCCACATTTGGATGATGTTCAATTAACTTCCATGCACTTTG
ACCTTGCATACGCATTTCGTTTGCGATATTTGAGTTGTGCTAATAGTGTT
GTGAACAAGAATGGACATGCCACAAATGACATGCTCCTCTATCACACACA
AACATATGTTGCTTGGTCTTTGTTGTGTGAAGGTACAATTGCATACGTGT
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GGGCTATCCTTCAATGAGCCATCTCTATATCATAAGGTGACTTCCTTCTA
CTTGAGGACTTATGCTATAATCTTCATGAATTGGCTACTCTTTGAGTGTT
GCTTCGCTTTTGTTGTGAGCTTTGTAGGCTTCATGGAAGGTGAAGGAACA
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CAGGATCAAGAAGGTCTCTCGACATCATCTTCTTAGGATGAGCATGAAGA
GTCGAGGACGACTCTTTTTGAAGGGAGGAGCTGATGCAGCCCGATCTGCG
GACGCTACTACATCCACAACGCCAAGTCCCCAAGATCGTCCCAAAGTCAA
CCAAGAAGATGGACCAGGAGCAGCCAGCTCCAGAACGAGAGTCTCCGCCG
TCATCGCCCCGGAGAGTCCGCCCGAGTCCAGCCGGAGTGTCCGGCGTAGC
CAGAGTGTCCGGCGCAACTCGGCCGGAGTGTCCGGCTTGCCCCAGACCCA
ACCTGGCGTGGACATTCAGAAGGCCAGTTTGGACACTACCTGGACACTAC
CCGGAGTGTTCGGCCACCCCGGACTGTCCGGTCACTCCGATCTGGACTGT
CCGGCCCAAGTGATGGGTCTGCGAGCCAACAGCTGGGCCCTTGGCCCATG
TACCCCTCTATTTCGCACCAAACCCTAGTTTTATGCCCAAACTACCCCTG
AACTTGTGGTTGGCCTATAAATAGAGCCCCCACCCCCTCATGTATCCCTT
AGGCATAGATGATAGACTAAAGACAACCCCCTTTGTGGAATCTCTAGTTT
TGCCTCATCCCCTTCTACCAAAGGGGATCGACTATCGTCACCACCTTGTT
GGAGTTTGCATCGCGCCTCCCTCGTTGTACAAGGCCTTGGCATCGGTGTC
CCTTTGCCAAGATGTCAAGACTCTCTCCAAGGTGTTCTTCCCTCTCCACA
TGGGATCAAGGGAGCATGTTGACCGATCTTTCCTTGCGAGGATTCTATCG
GACCAGTGGCCACCGATGAGAGCAATCGGCCTTGTATCGTGTGTGTTTTG
CGTGTGTTCATCGTGTTTTTCGCGAGGTGTGCGTCCTCTTCCGCTACCTT
CTTCATTTCTCCTCGCTTTCCCATCGATTTGACCACGAGATCCGTGAAGA
TCGGGCCACCCTAGAGGTTTGCCCTCATCAATAGGTATTGGGATATATAT
GATGTTTCAAGATAAGCGTGATTCCGGTTGGCAATAGTCCACCAGACTTT
GGCCTAGGCGATGACATATTACATAGTAGGAGTTAACTATGAGTGTTCGT
CTTGTAAAAAACTAGAAAAACCAGTGTGCAAGTTTTAGAGCTTTCATCCC
CAACATATGTATTAGGATATATATGATGTTTCAAGATAAGCGTGGTTTTG
GTTCTATTTAAGAAAAGTCGAGTTCACTCATGTATAAGTTTAGAGTTCAC
TCATGCGTAAGTTTGGAAGTTCCTGTGAATATGTGCCCTGTTTAATTCTG
TGAGCAAGGTTATCGAGTAGTAGTCGCAGCCTATAGATGCATAGTCTAGC
TAAAATGTGGTGTGTGATGATGTTTGCTGCTCAAATGGAATGGTAGAACT
GCCATTGCGACGTGAGCTATTTCTTTCATCATGATCAATGATGCATATAT
AGGCATAATTGGAATGATGTAGAGCAGTTTGTCTCCTCTTCTTTTTCTAA
ACTTTTTTGTGCTCCTCTTATTTTTCCAAACTTTCTTTCTACACAACTGT
TCTGACCCGGTGCTCTCTTTTTCATTGAATTCAATTGTGGATATATTTGG
TAGACCGATGAAGCTCCATATCTGGCCATGTGTAGTCGGCAACATGATTT
GTGACATTTTGTATTTCAGGAGCTGTAGAAGCACATCAATTATGTGGTCT
TAAGTCAGACGATGCCTTTGGCGTGAGCTATACTTTCCTATTTTTGTTTG
GAAGGGGAAGCTTGGTTCAAGGAAATACTCTTCATAGTGATAAAGATATC
TTCTTTTGGTTGGCGGATGTTAGATGAGTAGTTTCATTGTTGAGTAAACC
ATTGTCGTGCTTTTGCATGTTTGATATATGTCCATGCTTCTGTCTATTCT
AGAAAAAACATTAGGGCAATTGTAATGAATATAAGTTTTAGAATTTTTTT
CATGGTGCGCGTGGTTAATGATTTTTATTTTTTTATATACGTGATTAAAC
AGGTGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.