Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE025442

[Submit comment/correction]

Sequence	AE025442
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE025442
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATAGGCTGTAGCATACTCTCTCGCGACCACACTGCCCGCCGCCGCCCTCG TGAAGTAGGTCACCGCCGCCTCCTCCTCCGCCCCCAGCCGCCTCCGGTCG GAACCAATCCCACCGACGCGCGAGAATCTCCCTCGCGCCATGGGGCGACC TAAGGGCGCCGCGGCGGCGGCGTCGAAGAAGCCCAAGGCCAACACGAAGC AGCGTGGTGGCGTCGACTTCAAGGTAATCACCCGGCCGTCTCTTGAAGCC GCCCCTGACCCCCACTCTCCGCCCGGAGCCACTTCCGATGCTAACCTCTT ATGATTTCGGTGGTTCGCAGAAGTACAAGCGCAAGGTTGGGCGCAAGCTG CCGCCGCCGAAGAACACCACCAACACGGAGATCAAGTCCAAAAGTGAGGC GAGCCTTTTTGCTTCGTTTGCTACTTGGTTCTGACGTGTCGCAGCGCTTA ACTAGTTTTTTTTTTACTTGCGTTGTCTGCTTGCAGTGATCGTGCTTCCG GAGCAGAGCATGGCGTCCGAAAGGATGGGCATGGCGGTGAACAAGCGCGG GCTCACGCTGCGGGAGCTCCTGCAGCAGACAGTGCACTACAATCCCAAAG TGCGGCGAGGTAAGCTGCCTCTTGCCTCTGCACGGCGCATTGGGACACCG GATGCACTGAGCATGCAGTCAATCCATCTCGATTATTCAGGCTAGGCAGC TAACGGGAATTATGCTGTATGTTTTTGTTGTTGAAGCTGCATTGAGTGGA ATAAAGGATCTTATCACTAAGCATCCAGCGGAGCTTAAACTGCACAAGGT TGCTATGATTGAGAAGCTGCAAGAACGTATATGCGACTCTGACAAGGTGG CTCGTGAATCGTTGTACACCACACTGCAGACTCTGATATTCCCATCTTTG AAAGAGGTACCCCCTCCCCCCTCTCACCAAATGCTGCAGAACCTGTTGTT TAATTGAAGAATAAAGATACCATGTTTAACCGCCTTTTGTATTGCACCCT ATGTTCATATAGACACACATGCTGCAAATTGAGTCTTTCTCATGTGATTA TGTTTTCTTTATGAACCACAATGTAATACCTACTTATTGATTGCGTGTGC AAATATATTATGGAAGTTCTGTTTCTACGCCTATAGATTCTATGTTCTTT GCTTCAGAAGTGATCTTATTCTCTATTTATTATTACAGGACAATGCAATA TCTACGCGGAGTACTCTATCTCTGTTGATGGCAAATGTTTTGAATGGAAT GACGCACCTTTCCATGGATATCCAGTTAATGGCTTTCAGGTTTCTGGAGC TAGTGGTTCTTAATTTCCCATCTTCCTTTCCCAGATATGCTGAACAGGTG AGTAGAATTCAGTCATGCATTGGTGTGTTGAAAAGTTGAATACCACTAGA ACTTGTTTTGTAGTCTTGCTTCTACAGTGGCTGTATGAAGTTATGGACCA AGGAACATATTGTTCAAACCGATTTCCTGGTGCTAGGTGTGTGAGTTGTG ATTGATCATATCCATTGTAAAGTAATAATTTCTTTTGCATATTGCTTCTG GCAGGCTTTCAACAACTTTGTTGCTGTACTGAGCAACGACAGGATCCATT TGCAGGATAAGAGTAAACTTAACAGTGTCCTTGCTGGGCTTGGGCACTGC CTTTCCTTGGTTGCCCGTGTGACGGAAAATGATCATGCATCAAATCGACT GGTTTGTGCCTGTTAGCAAGCTTGAACTTTTTTTCTTCAGTTTTTTGTCC TGACACAGCTGGATCTGTAATGAAGAACTTGATGAGATCGAAGTGCAAAT ATTCTGAATTTACAGCTGCATGAAACACTTCTATTGTTATGAACATAATA TTTCCTCTGATCTTACAGGTTCATAACCTTTCTACGAAAGAACTTTGGAA GCCCACCCTTGATGAAGATAACACTGGGAGTAGTAAGTCTTCTAGACGTT ATCTTCTTCTCCTGCTTACCTATATGCCAGCAGCATGCGTAGTTATGTGT GCCAAAAATGCTAACTGTGAATTTGGTTGTAGTATAATCAGAAAAGCTCA ACACCAAGCCCGCTGGAGCCTTGTTATACTACAACCATTTGAACTCCCTT GGGAATAAATATGGAACTCACAGTTATTGAACTCCCTTGGGAATAAATAT GGAAATGATAAAATTTTGGGTGGTGACATAGCACAGCTATTGCATCCCCT CTAGCAATTTTTCGGTGATATTTTTTTCGTAGATGCACATCTTACCTGAT TATTTGTTAATTTTGGTTATGATCTTCTCTTAACTGAGCCTTGTTATTAG TGTCTCATTCACCTGTGCAATGCAGGCACATTTGCGACATCCGATGTACT AACGAAGCTTCAAAACCTCATCCAAATCCTTGTTAACTCCATAGAGGTTT CAGCTTCAGAAATATGTGCAAAGCCAGCAAATGATGCTCAGTCAAGTGAA GCATTGTTATCAGCCCTTCATTGTCTGGACCTAATATGTAGAACATTTGT TCATGAGGCAAAGAAACCTCAGATGGAATTTGGGATATCCAAAACGCAGT TTGGGTCTGATTGGTTGAATAGCTCTGTGTTGGTATATCTAAAGAAACTC TGGGGAGTGAAACGCTTGTTTCATGAAAAGGTATAAAGTTAATCCCTGCT CATTACTTACCTCTATTTTGCTGATTATACTGAAACCATTCTATGATCAG CCAATAGAGAAAATATCGTATGTTTTGATTAAGTAGTCTTGAAGTGATCA TAACAAATGGGTGAATAGATCCAGCATAATATGTTGACTAGGAGGGAAAG TAATCCTATAGGATTCCCCAAGGCTGCGTTCTTCGGATTCCTAAAGGATA TGAAAACTGGTTGTTTGGGTGTCAGACAGGAAAGCACAGGAAGTTGAGAT GTGTTTTCTCCTAGAATTTATCGAATGGGCTCCTTATGAGTCATTCCATT TTTCCGAACACCCTCAGTCATAGCGAATTTTTGAAGTTAATCCTCCAAAA TGCGTATGTTTTTCCTTTGTTCCAAAATACAGCAGAAAGTTGCTGCTCCC ATTTGTAACTTAGAGGATATAATGTTCACAATATTATATTAAGCTATATC AAAATACTTGGTGCTGTAAGGTGTTGGTAATGATATTTCTTTACTCAAGA GTTTACTCAGGCTGTTAATCATTCTTTCTTCAGAATGCTTTGGCTATAAC AAACAGTTTGCTAGGTTCTTAGTTCTTACGGAGTTGTCTTTCTAATTGCA GGGAGATGACAGATTTTTCGTCTTCAATCTAAAAATTGCTGAAATATTTT TGTGCTTGAGCACATCAGTGGATGATACAGCGTTTCCAGCCGAGGAGTTA TGCCAGTTTGTATCTTCTTTATTTGCAAAGGTTGTCCGTGGTTTCGTCAG TTTCAACAACTGATGTGTACTGTTGCCTTTGTTGCAGATAACTCTTAGGC AGTTTATGATATTTCTTCTGTGGTCATTTCATGGATATGTAACTGTGATA GGTGTTTTCTTTTATTTATCAGGCAAAAGTACTTCGTAACAAGGATCTCA TGGAAACACATTTCAGTCCGCTTATAAGTTGCATACCTGGTCTTATATCC AAAGCCACAGATGATTCAAAAGCATATTTGTTGGAGGTATGACTGATTTC CCTATACTGGCCGGTCAAATATGTTATTTTATAACTTTATCAAAATAAAA GAGTATATTGAACTGCAGGCATTTACAGATGCATTTAGGGACTCCAATGC GGATGGCAAGCTAATCTTGCCATATTTGGATGCCGTGGGAGAAATGCTGC TTCCTGTAGGTGCCTTTGTTGGTTACTGAAATTAAATTCCTTCTGCATAT GTTGACATGTTTAATCACCCTACAAAATAGCTGTACGAGATGCACATAAT CTAGATTATCAGATTGATGCATATATTTAAAAAAAGGTTAAGGTACTCTA TAAAACATGGAATCTCAATAAAGAAAATTTCAGAAAAATGGCCAATAAAA AATGATGGAAAAGTCAGCTTTCACAGCAAACTTCTCAGTTCCCTTCTAAC ACCAGTTAATCCTGTTGAGATTTGATTATTTGCAAAATTGACAATTTGCT AACTGGTAAATCATAATTTCCCTCTTAAACCAGTCAAATCATGTTGAGTT GTTTATTTAAAAAAATGAAGATTGCTAACTGATGAGTCATTCGGTAAATA GCTTCCAATTTTTTTGTAGGGTAATTTTCTATTGATTTGGTCCTAAAATT TAGATACTTACCAACACTTAATCATCCTATATGTTTTGTTGAAAACAAAA CATCACCTTATAAAGATTATTTTTTCGGTTGTTTAAAAAGAAGTTACTGA TGTATGATATCCTTTGTCCTTGTGAAGGACAAATCAGGAATATCTTTTAC TGCAAATGATTCAGGCATATCGGAATATCATAGCACTTGGATAAATGAGC TACCTGGAATATTGCTACAATCAGTTGATAAATCTCCCTCAGTTACAAAG GTCTGTTGTAAGTTTGTTTATTCAGTACAGAGCTGTTAAACCATTCTTCA ATATAGACTTTGTGTCTGACCTTCTCGAGAAATTATGTAATTTATGTTGA TATGAATTACCATAGGTTGTTTTGGAGCTTCTTCTAAGAATTGGACAGTG TTTCCCCACTCTGGAGTGTGAAAACCTGCGATCCATTGCACAGCTATTTG GTACTAAATGTAAGTACTCCTCTACTCAAGAGATCTTATCCTCTGTTTTT ATACTGAACTAGTGTCATTTTGCTGACAGCTTCATCTGGAATGGTAGAGG TTGGTCCTTTTATATACGTTCCGCATGATTGCCAAGAACTTGCCGTTGCA TGCCTTTATTACTTCTCCAATCTGCTCCCTGACATTATTGAGCCATTGGC CTGTTGCTGCTTAAGTAAGTTTTTATGCTTCAACAGTATCAGTTTCTTGC ATAACTATACAGTTTTGTTCTTCCGTATAGAGGATCGTGGTATTCTATAA TATATGTAATGCAGGTGATAAGCTGGAGCCCCTCATATTATTTAGGATTG TTGAAGTTCTACAGTCAACATACAAGGCTGGGAATTTACAGATAACAGAG CAACTCAGTTTCTTGTCATTGCTAATGGCACGATTCGATGTTAATCGGGG TGAGTACTTTAACTTAACCAGAGTTTGCTCTTATTAAGTTTATTATGTTA TCTGAAGCTTTTTTATGTTTTACTTTTACGTAGTGATTATGGTACAATAG GCAGTGTAGGGGACAAGACTTCATAATACAAAGTGGAATAAATTCTCGAA AGACGCAACCATGAAAATAAGACATACATTAAACATATTTTTTTGTCACA TTGATCCTTGAAAAATACAGCTTCATCTTAAAATGCAACCTAGATTTGTT TTTGACCTCATGATAGAATATGACCCAGAAAAGTGCAACATTATTTTTTG AGATGGTGGCACTACTGTCTTCTTTGCTGTTGGCGGTTGTTTTCTCGTTG CATGGGGGTCATGAGAGGAACAATACCTGCAGAGTCGTCACTCGATTCCT CCATACTTTCCACACCCACTTGCATGCTGCCATCGATGCCTCAGAATGCC TGTGTGCTACCCCACCAGCCCACCACCTTGCTTTGAGAGGTGAAGGTGGC AGAGGAAGAGAGACTGAAAATTAGTTCGGAGGAGGCAGCCGGTAGGGGAG GATTTGGCAGGCTTGGGGATGTGGCGTGCTTGAAAAAACTGAGGGGAAGA GGAGAGAGTGGGGGTGGAGAGCAGAGAAAGTTTAGTTGATATTGATTTTT TATCTCAAGGGTGTATTTATGATATCATTGTCACCCAGTATGCTTTTGCG GCTGTTCCTCACTAGGTTTTACTTTTCAAATGGTTACTTGAGCAGAGTTT TTTGTTTGCTCTGGCTGACACTTGCCTTTGAATTTGTTAACCTAGGTATG TCCTGTACTCAGGAGGATGCCCGGAAGATCTCAAATTGGAATACTTTCAA GGCCTTGAATCACTTAATTTTGACTTCCTTATCTGAAATGGGTGATGGCT CCCTGGTCCTTGAGTTGATCTGGAATAATTTATCTAGTGAGATTGTGAGC TTTCGTAACTGTTTTTTTTGTATGTTTTTCTCATAAAAACCAAATTGAAC TCATGTTAGTTTGCTTTACAACAGGCGCGAAAACCATCACCGCATAACAT GAATGGTCTGTTTAGGATTATTGTTACACTCGATGCAGCAACAAATAAGC TCATGAATGAAGATGTCATTAAGCTTATAGCTGGCTACTTGGTCGATGCT GCTCTGGTGCGTGCTTTCCTAATTCCAAAGCTTTGATACTCATAGTTGGA TGATTGTTGCACCTACTATTTTTCTCCGGCTAATATTCAGCAGAGCCTAA CAGAGGGGCTTATATTCAGCGGATCGTAACAGAGATGTACTGCATTATAT GTTAATAAATGCAGACCGTTTGTTAGATTGAGCACCTGGTGTTTAGAAGA CCTCTGTCATTATAGGATTCAGCAGAGTACCATTTTTCAGTAGGACGCAG GACCTTACCGATAGACCGTGTTTTTTTCCAGGGATGATAGACCGCGTTTC TAGTGGTAGCTCAGGGATATAATAACATGGAACTAGTTATAGCTCCCAAT CCTTGCATTACCAGGCAACTCCGGCAGTTGCCATTTTTCAATCACTTATG GAACTTTCCTTGCATACAGGCTCGTTAATTTGTCGTATTATTTGAGAAAA GAAATCAGAAACAAGGAGTTGATAAATTGGCATTGTGTATACAGTTTGCC TACAACGAAGTTGATAAATTGGTGTTGTGTACTTGTGTATACAGTTTGTC TACAGAGAAGTTGAATTAACACTTTTGGATACTTCCTCAACTTTATCATT TCACCTGGTTGATGCTAAGATTAGATAATAGCTGTCTTTTATTTGATTAG CATGCTATGTAATCATTTACACGCCTCTCCTTTTGACCACCATTTCTTGA TCTACTCCAGTGTTCTCTTGTTACTACACTTCTGGTTATGGCTGATAATT GATCTCAACCCTGTTATCATGCATCTGCAGGATCTGTCAAAAAGCATTGA AGTGGGCTTTCAGTCTGACAAGACAAGATTATTCCAATACTTCATAAAGC CCTGCAGAATCATGTTTGAGCAGAATGACGAGGTTCTCTGCTGCACATTG GAGATGCTTAAATCTTTTGCATCAGGAGATTATCATATGTTTTCATCTGT CTCCAATTTAGATTACCCAAGGGAGCTTTCACAACGAGTTTGTATTGTCA CAACCATACTGGTCTTCTTATTCAATGATCAGAGTCTCCATCGAAATCTT TCTTTGAGCAAAACGGTTATTAAAGGCATCCTGCATTATATAAGGCATCA GGTGGTGAGCAGTGACGAGACAAATCCCTTTCCTTGGTAGTCACATAGAT AAACTTTGACCTTCAAAATCATGATGTGTCAATTTGAGGAGTGGAAGCAT AAAATGATACTGTAGCTTACCTACTCACTTGCTTTATAATACCCGAATGT AGTTCAGACTTCAGAACTTCCTTACAATTGTTTGAATTTATGCCAATTCT TGCTGCAGGGTTCTAATGTGCCTGATGTAACATATGGAGAAAAGCAGAAA TTAAAATTTGCTTTTGAGCAACTCAAGACCAAAGCATTGCAGTTGAACTG CTGGGATGGAAGTGAGCTGGAAGGGCTTTCAAGCACCACATGATGTAATG TGAGTAACTTCATCATGATTCACTAGTGATGCCACTTTCATTTTTTTGGT ATGAAACGAAACTCTTATCTATCTCTGACAGGCACATCTATCTGATGGCT TCATATGGACATATGGCAATGGAAGGAAAAGGAGAGTGCCCCATTTTCCA ACTTGTGTCACATTGCAGCGGGTGCAGCATGTCTGTGAGGCGTTGCTTTT ACCAACAGAGTGCTGAAGGTTGGTGCTTCCAGATAAATGCAAGAGATGCC TCTCGGGATATCATATATAACTATGTTACATGCCTACCAGATCTCAAATC CGTAGATTTGTCATGAATTCACGTGCCAGTCCTTTGCTCACAATGTCTCT GTTCTCTCAATGGCAGTGGCATCCGGTCAGAACAGATGCACCGTTAACGT TTCTTATGCCCTGGAAACTAACAGTCGAAGGCTAACAGTTTCTTTTGCCA GAAAATTCTTTTGAGCTAGTTATTTTTTGTTAGTTAGAAAAATAGAAGTG TTTTTTTCTATGTATCCGTAAAATTTTGTTCAACCATCCACTTTGTGAAT CGCCACCCAAGCTGATAGCGCCAAAACACATGTGATCTCTAAGATGGAGG TGAACTCATGTAAATGCAGAGATTTTGATCTCAGTTAATCCCGAGCCAGT GATTTCATTTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.