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GrainGenes Sequence Report: AE013237

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Sequence
AE013237
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE013237
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCTGAGCCAGCGGTTGCCTGGCGGGGGCACGAATCAGAGGGAGCCTCTC
CCCCGCTGCCCTAGCGCACGCCTTCATCTTCCCCGCCGTCCTCTTCTTCC
GACTCCCTCTCCCGCGGCCGCTGCGCCGGAAACCAACAACTGAATAGGAG
AAGCTGAGCTTTGGAACAGGGCGGAGGAGTCAAACGTATCCGACAGGGAA
AGTGGAAGGCAATCCGAGTCTCCTGACAGGTGGGGCCCACGCCGCTCCTG
CCTTCCGGGAGAAGGTCACCTGCGCCGCCGCGTCGTCGCTCGGTGGTGGT
TTCCGTGACGAGCGAGAGGGAGTCGAGAGTGGCCCGGGGACAGGCGGACG
GGGAATTGGGCCTCCGTTTCCAGCCTGCAATTCAGATACTGTACAACCAA
ACGTTGGAATTGGGCCTCCGCAAGGGCCACTCTCGACTCCTTCCTCTCGC
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CTCTCGGCTGTGGGGGTAAATGACGGGCTCTCTCTGGCCTTCCCATGCGG
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GGGGCCCAATTTTTGCTCAAACTCAATAACTAGTAAAACAAAATCACGTG
TTTACATACTTCTATAACTTCACAATGTGCTATTCCGTATAATGTTCACA
AATATATCAAGTATTCATTCTAAAAGAGTAAATATAGCACTGAAGTAATA
AACGAATCTCATGTTCTACCAAAAAGCATTAGCCGTCTCGTATTTCTTGA
AATGAAATCTTCAATCATATCTTCATAATTAATCTTCTCCAGTATGTCAT
TCTCAAGTGCTATTGTGGCCAATCCACTGAGTCTTTCTTGTGTCATAGTA
GACCGCATGTACGATTTCAGCAATTTGAGTTTAGAAAAGCTCCTTTCCGC
AGATGCAACAGTAACAGGAACGGTTAACAAAATTCTGTATGCAATATTAG
CAAATGGATAAAAGGGACGTTTATCCAAAAACTTTAGAATGTCAAGAGGA
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TTCTTCTCCATCAACATCAATATGTTTTTCATCGGGTTCCTTTTCATGTG
TAAGTGCGGCCTCAAGTTTCACACAAGCATCCATCAAACCCTTCTCATCC
AAGGATCGCAGCCTATCTGAAGTAAACAAGAAACCAAAAGTTTTTTCATA
CTCCTGGTATTGTTCAAATCTGGTTGTAAGTGAAGCAATAGCTTGATCAA
CAATACGCAAAAAATAATTGACCCTAAATAACTCCTCTGTAGAATGTGAT
TCAGTAGGTGCATCAGCTGGACCCTCATCAAACTGTCTTTTTCTTGTAAT
TTTACGCTTGGTGCGAAATCCTGGATTAATATCCATCTCCACTGCAATTT
CTTTAGCAGCTTCCAAGGCTTTTGAAAAGCCAGTTTCTCTATACTTAGTG
AAAAAAGACATTAGCCCCCGTACAGACTCAATTGCAATATCAATAACCAT
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CATACCATATGATTATAGAAACTAAGAACTCAAAGTCACCAAGTTCATTT
TCTGCCAATGATTTTGCTACACTACTTGTCAATGGATCCTTATCACTTTC
AGCCACTTGTAGCAATGCCTCCCTTATATCTGGCATTTGGAACCTTATAG
CCTTAACACTCTCAACACGACTCTCCCAACGAGTAGCTGACAATGACTTG
AGAGTCAATCCTGTTATATTGTCCTTAAGAATTTGCCATCTCTTAGTAGA
ATTAGCAAATGTTGTATAGATGCGCTGAATAATTCCAAAAAAATCAGTTG
CATTACGACAAGAATTTGCCATATCACAAAGTGTCAAATTCAGACTATGG
CAACCACAAGCAGAATAAAAAGCTCTTGGATTTATATTCAAAAGTTTCCT
TTGTACCCCTTGATGTTTTCCTTTCATATTGGACCCATTATCATATCCTT
GTCCTCTCACATTGTTTATATCAAGTTCAAGCCTCTCCAATACCTCTTGT
AAAACATCAAACAATCCCTGCCCCGTGGTATCATTCACATCCAAAAAACA
CAAGAAAGATTCCTCAATGCAAATAGAACCAGAAGATGCATCAACATACC
TTATTATCAAAGACATTTGTTCTTGGTGGCTTACATCAGGAGTACAATCA
AGAATAACCGAGAAGTACTTTGCTTTTTTGACCTTCGCAATGATTTCAGA
CCTGATTGCAGTAGCTAGCAAAGTTATCAACTCATTCTGGATAGTAGGAC
CAAGATAATGATCACGAGTTTTATCATTGGTAATTCGGTCAACATGCTCT
TGCATAACCGGATCAAATTTAACCAACATTTGAACCAATCCTAAGAAATT
GCCATTGTTGTCTTGGTACAACTTGCAATTAGTACCACGAAATGCTATGT
TATGTTCTCCAAAAAATTGTACAATCAAAAGAATCCTGTATAATACTTTT
CTCCAATGCTCCCTTTCCTTTTGAAGTTCCTGTTGAGCAACTTTATCAAT
TGTTTGATTGTTCTCAAACCTCATACGCAAGTCATACCATGAACTCATAT
TTGTGACATGTTCTCTACTAATTTCGTGTTCTTGAAGTCTATTGCTGAGA
TGTACCCAATCACTGAAACCCTCATTTGCTAATGATCCTCTCACAAGCCC
CCTTTTCAATAATTTGCAGCAAAAACAAAATATTTTGTCAAGCTCTTTGC
TGTATACAAGCCATTCTCTATCACACTTTTCTCCATTTGGGAGAAATCTA
TAGTATGCTGATGTAGAAAACCTTCTTGATAATTTGCCTCTAGGACCATG
CTCAACTGATAAGTTTCTCTTAGGACCCTTTTGCACCAAAATATCAATCA
TTTTACGATCAAGACCATCCCAACATCTTGGATCAAACATATCAGGATGA
AAAGAGCTATTGGTGTCACCAGCAATAGTAGCATCATTCACTTCAACACT
AGTATTAACATTATTACCTTCATCACCAGTATTAGCATCATCTCGCCCAT
CGCCGGTATTAGCATCACCACACTCATTGGCAGTATTAGCATCATCACGC
TCATCATCGGTATGAGCACCATCGCCTTCATCAAATTCTGCGGTATGAGA
CTCAACATCCACCACGTCATCACCATTACCATCATCAACATTAGCAACCG
GAGTCTGATTTTCAGAATTTACCTGAGTCTCTTTCACCACAAATCTATCT
AGAGCACCCTTTTGAGACTGAGCTGCCGCTTCTAGTCTTTGTCTTTTCTT
CTTCTTTTCAGCACCAGATTGACACTTTATTATTCTCATGATTTGTCCTG
TTTTTACAAATTAATAGATTAACAAAAATCCAAACAAGTCAAATTAATAA
GTTAACACGAATAGACCAGTTGTGGTGTTCATACCTTCACACACGTGAAC
AAAATCGCCGATCGGGAGGCTCGTGTCCGGCAAACGGAGAAGCTAGGTCT
GGCTGGTAGCAAGAACAAGGAAAACATTCGTTTAATAATCAATTTAGACC
ATCAGAATTGATCAATGATCAATCTGCTACTTCCCGTAAGTACTAGGATT
CATCAAATTCTAGAATCTAGAAGACCAAACAATGAACAAGATACACTAGA
GAAGGGACAGCCGGACAGGGTACGTACGTACTATACTGGTGAAAAAAGAA
ATAGGCGATCGTGGAATCGGGAGACGGGAGTTCGGCAGTTCGGCAATCCG
CGGTCAATCGATCTACTTCTATTGCTTCCCTGAATCCCAATTTGGCAGTT
CCCAAACCCGTTTTTGATCTGCTGGCCGGAAAGGAGCGAGTACCTTGGAC
AGTTGGAGACGGGAGCCGGCAGGAACTCGATGTCGATCGGTGATCGTGAT
CCAAGGAACGAGGGCAGGCGGCAAGGCGCGGACTCGCGGAGGAGTCCTGC
TTCGGGTCGGGACTGCTGGCGATCGACGGGAGAGGAAAAATAGTTCGCTA
AACATCAATCCGGGCCGTGTACATACTGGGCTGTAGCTAGAATCCGGGGC
CCCCTGGAATCGGGGGGCCCTGTTCGGTCGCTCCATCCGAACATGGCCAT
CAACGGGCCTGAAAATAATATATATGCATTCTAATATATACATGTTTTTC
ATACACGTACACAAGTTTATATTTCCCAAACTAAATAAAACATCCAATTC
CATGGTTTATACATCCAAACAACAATTGGAATTGGCTACTAACCGCTGAT
TCCAACAGAAAATTCCGAGCATATCCAAACAACAGAATTCGAATTGAGGC
CATTTCATTTCCATCTTGGTTTTGGTATTCTCATCCAATTCAATACCAAG
ATCCAATTCAGTGCATCCAAACACAGCGTAAAGTTTTGAGCTCGGAGGCG
CCGCCGGCGAGGTGAGATGGCTGATGCGGTCGTGAGGTGCCTTCGGGACG
GCCGCCTAGACGGCGAGCACGCGCCCGCGCTAGCCGTGCAGGGTTCCCTC
CAGTGCTGCCCTCTCGCTGCGCGCGTCATGCTCCACCTCGCCGCCACCGT
CGCCTCCAACACGGCTGCTGGGAAGGCGCAAGCCAGGTATTGTTGGTGTC
CTCTGTGGTATGCTTCTTTAGATTGGCCTCGTCTGGCTGATGACGCCAGT
TGTTGGCTTGGTTGGCAAATTGTGGTGGTGCAGGGGACTTGTGGTTGTGG
CGTTTGATCGGAGCCCGGAAGTTTACCTGGATTTCATGCGGCGGAGCGGA
CTTGATTCAAATGCTTTGAGTCAATGGTAAGATCTGTCAGCAATTTTCAT
TAGGAAAAATAGTCAGAGCTTTAGCATAACCTGACAACTTTTATAGTTGA
CATTTTAAAGTTTGAGCTAGATTGTGAAGTCTGAGATTGTTTTTGGTTAA
ATGTTCTGTTGTGAACCGTACATAGCATGTCCTTAATGCAGACCATAGTT
TGAATGTTCATGATTGTAGAATTTACACGAATGTCCAATGCTATGTTTTG
TAATTTTTGCATTGTTCCGACAGTGTTTGGATATTGGATTGCTATTCAGA
CCCACTTGGGTGGAAGCAGAATATTGAAAGCCAGTCGCACCAAGAGGAAA
GTGGAACACCTTACTCAACAAACAAAGACAACACCGCAATTTTCAGAAGT
GTGAAGGATGTTGATAAGTTGTTGTGCTCCATAATTGATCTTGGAAGAGG
TAAGTCCACCATATCACCTTTTAAACTTGTTAATTTACCTTATTTATGAT
AATGAAGCTAATGCTGCACTAAATGCTATGGATATATCAGGGTTTGAAGG
AGAGAGCAAGACCTATTTTTCGGTTGCTGTCGATTCAGTATGTACCTTGA
TGGAAACTTTTGCATTCTGTGGAAACCATAAAGCTTACTTGGGGCAGATT
TAATACAATGAAACTGGGTCTGTATTGTGTTAACTGCATCTAGGGCATAC
ATTGCATCACATATTACTATATGCGTTCTTCTGTTATAATTTATTATTGT
CGATGTTTATGGAACTGCCTGCATTAAATTAGGAATTCCAGATATTCGTG
TCAAAATTGAACAGTACAAACCTATAGCCTTGTAGTTAGCAGTTTGTGTA
TTGAAGTTAAGTAGGTTTGGGTACCATTTGGAAACACTTTACTCCAAACT
GAATAACATCAACCTGTCACTCACAGGTATTCTACTCTTTGTATTTTACG
ATTACAAGTATTATCTATGTATTGTTTAAAAGTAAAGAAATCTTTGCATT
CTTTCTAATCAATAGTTCATTACACTTTCACAATATTACTTAATTTCTTT
CAATGCTTAACAGCAAATCCTTAATGATATTTCAGATTAGCACTATGTTA
AGGCATGCTTCAGTGCGATCAATTTCAGGCCTTCTTAGTAATCTTCGAAG
CCATGGTATTATTTCTTATATTTTCCGTTTGTGTTAAGAGTCGTGCATTC
ATGGTACACTAGACAGAATAAAAATTTCCAGCACTAACATTGGATATATA
TCATATATTATATAACATGCATGTTGTATATGTCTTATCTTATAATGTTA
AGGCTACATGTTATCACCTGAAAGACCACCCTTGAACATACAGTCAGCAG
CATGCCAAATGCATTGTAATATCAGTAGGATGCATTCTTGTGGTCCAAAA
GGTTGATATACCATTCTTCATGTGTTGCTTACAGTAGTAATGTGGGTTAT
CCTCGTGTTGCAGATCAGATATCATCAATCCTCTGGCTAATGCATTCAGA
CCTCCATGAACCCAAGTTTTCACGAGCTTTTGAGTGTCTTTCTACCATGG
TTGCTTGTGTAGAGCCAGAAGTTGCAGATTCAGGATATGGGCAAGAACAT
AGAGGAAACATATCTTTCCTTGAGCATAACTATTCTAAAGCAAAGTTCCA
TGTGCGCCTGAAACGAAGGAATGGACGGGTAAAACATCTGGTAAGGTTCT
TGGTTATTTGGTGCTCAAAACTTCAATTTATTCTAAATACCACACGTTGA
AGAATCTGGATTGCAACTATACCTGCCTATGCAGTATGAGGAGTTACATG
TCGAGGGATATGATGTTAAATTTGTTTCTGCTTCTTCTTTAAGTATGGAA
GTGAACCAAAATCTAGTGCCTAAGGTTAGTTGATATATCCCAACATCCAT
AGCCCACACTTACCCTAGTACTTGTTTGGTTTCTGAAACAAATATTGGTT
ATGAATTGTGATATGTTGGCTCGACAGGTTCAGTTCAATCTTGAGCTGTC
AGAAAAGGAACGAAGTGACAGGGCAAATGTTGTTCTTCCTTTTGAACATC
AAGGTTCTCTCATAAACTAAAGTTATTTACCAAATTTAAGTATCAGTTAG
AAGTTTTATCTGACACATTTTGACTGCCTGAGATGCATTGATATGAATCA
GTAAATGATTGTCCCTTGTACTTACCTTAAATCTCAGGAAAAGGTGAGCC
AATTCGTATATATGATGGCCGGCGATCTCTCCTGGAGGCTCAGCAAGATC
CAAATTTAACTACAACAGCTCTCCTGGATGAAACAAAAGTTCCTAAATCT
GCAACTGCGAAGGGTGAAATTCATTACATTCGTGATTCTGATGATGAGCG
ACCTGACTCGGATGAAGACCCAGACGATGATTTGGATATTTAACCACAAT
ATGAGCTCAGTTTAGCTTACTGGGCTATCAAATCCAAGGTAACCCTTAGC
CCTATTGAGAAGAACTGCAATACTTTGTCGGTAGTCATTTCCATTTCAGT
ATTATTTATGTCGGTCATAGACCAATAGGGTTCACTGGACTAGAGTGAGG
GAGTGGTGTTGTTAACAAAGAATCCATTATATTTAATACTTGCTACTCTG
GAATTTCAAAACAATAGCACCCACTCCCACTGTTCTATATTGTGAGTAAA
ATACTAAAACATGTGCATCTAGTTCCCTCAAAGAGTAAAACACCGAAATG
TTGTTCAACCAATACAAGTTGACATCTGACTACTGACATGTTCAGTTTGG
ATGCACAGTGACTTGATTATATTCCACGGACAGTCTTGCGCACACCAAAC
TCATTACAACTCTATTGATGATTTGATTCTATACAGAGCACTTTCGCCGG
TGCCGTATCAATGGATCAATAATCACGTATGCCTGCAAAAGAAAGTTAGC
TGCCCACAAGCAACATGGGCAATACCAAGCCCCGACACTAAAACATCTTA
CTGGACATGGCCGATTTATTGCATGTACACAAAGCAGGTAACCTAAAAGC
AAAATGGTACCTATAGCTAGGCCAGTCAGTGAGTTACTCCTTAGCCTTGA
TGGTGGCCTCTGACTTTGAATCGAGATCCACCATGTGCACGAGGGGTTCC
TTGAGCGACTTGTGCTTAACGGTAACATTGTATTCACCTTTGAAGAGCTC
AGCCTTGAATATGCCCTTGTCATCGGTCTTGGTGTACTTGGGGACGGCCT
TCCATTCGGCGATGAGCTTGTCAACGACGTCCCCAACTGGAAGGTTCTTG
AAGTTTTTGTCGGTGAGGCACATGACATAACACTCCTTGGCATGCCAAGC
GCCCCACAGCACTATGCCCTTCACCCCTGGGTGCGAGAACCCCTCCCTCA
TCACCTCCTCTAGGTAGTCCACTTGCTTCGGCCCCTTTTTGACATCGATC
TCGGTGAGCCAGATGGGAACCTTGGCCTGCGCGAGAGTGTCGAGGGAGCC
CCTCACATAGGGAATGTTGGGGGTGTCAAAGTGGCTCTCCAAGCCGATGC
CGTACTTGAGCTTGTTATTGCCGGGGTATGATTGGATTTGCTTGAGCTTG
GCAAGGTACATTGTTGGCAGCGGCGCCGCATCATTGGGCTCCTCGATGGT
GTTGTACTCGTTCATGAAGAGGATGGGCTTGTCGTCGAGCTTGGCCACTT
CCTTGAAGACCTCGCCAGAGGCATCCTTGCCGAGCTTGTCCTCGAAGAAG
CTGTAGTGGAGGTTCTCGTTTAGCACATCCCAGTGGATGAGCTTACCAGC
ATAGCGAGACACTACATTCTTCATCCGTTTCTCCATAGCCTTCTTGAGCT
GTGGCACGCTCAACCTGCTCACCCAGTCCATCTGTTTGCTTTGGTCATCC
CAGAACACATTGTGCCCACGCACTGAGATGTTGTACTTCTCCGCCAGAGC
CAGCATCTTGTCCGGGATCTCGTACAACTCTTGGTTCTGGTCGTACTCTG
TGCTATACCACTTCATCTCGTTTTCCATCGTCGCCACCGTGAACCGTGAC
GTGAACCACTTCTCGTACTCTGGGATGTCCAAGATCTCCTTTGTCATTGC
GTTGCCCAGGGGGAAACCCTTGGCCACCCTCTCCAGGGACAGCTCTGCAT
CCGGCAGCACCTTGCCGCCGGAGCCATGGACGGTGATCTTTACTTTCTTC
TTGCGCTCCTGCATTCATTTTAGTTTCAGTTGTGGAGCCATGGAGTATTT
ATGTTTCTTTTGCATTAATTATTTTAGCTAGTGTCAGCGTTATGTAAATC
AAATGGGGATTAACACCTTGGCAATAGACTCATCGCGATGAGATTTCCAT
TCTTCGAAGCTGAAGGGCTGCAGCGCCATGCTATCCACCATCAACTCCGC
GGTTACATTGGTCTGCAGTTTTGCATGTTAATTACTCAGTACAGTGCTAC
ACATCCACATGCTGTGATGCCATCTCCTTGATGTATCATGCGTGGTTATC
GAACTAGCTACGTTACGCACCTCAAAGAAGAGCTCACCCTTGCCTGCAGC
CAAGGAGGTGGCGCCACCCTTGAGCATGGTCCAACAGCCGGACTATACCA
CAATCATGCCTGCGGTGTTGAAGTTGCCATCGGGGGTCACCAAGACGGCC
CTCACGACACCAGTGCTCTTGGAAAGCTGCAGCCAAGCTGAGGTCAAGCA
CAAACGTTTGGTTAGAAAGCAGCAACACCTAGTTTGTTGTCCTCAATCAG
TTGATTGACTTGATTCCTGCTGCGTGACCAGTCATGATGGAGGAATTAAT
TACCAGAGAGGGCGTAATGAGTATCCTTTTCCAGCTCGACCTTGAGCGTG
GAGCCCTTCGCTGGGGTGCTCTTTCTCTTTGCCATTAGGAGCTTCTTGCC
ACCAGCCGACACAGTGGCTGGTGCCTCAACGCAGTTCAGGATGCCGCCAC
CGTACAAAGGTTTTGATGGCTCCTTCTCACACTGCATGCACTGTGCCAGC
CTGAACCTGTTAGTCCTTGCTCTCAAGGAAAATGTATGTATATACGCATA
TGAAACAAGAATGCATGATCTACCGATGATGCATATTGCATGGAGTGTTT
GAACCTAAAACTGTGCAATTTTGCACGGACTTGAGAGATCGACTTGCCAT
TATATGATGCTGACATAAGTGGTATCATGACCAAATGACTAAACACGGTT
GTTTGATTTCCTATCTCAAATCAAATAGAAGAGTGCGTGCGTTTTCCTAA
AAAAAAAAGCATAAGCAATATGTATGCATGGTTGATGCATGCAGACACAA
AAGGACATGGTGCTTGCCTCAATGTTTGCTGAATAGTCATATACAGCGGA
TTTGGCTGATTTATCTGAGTTCTCTGACTTCTCTGATTTTTCCGACTTAT
CTGATTTATAAGATTTAGCCAAGTATCCTGCGTTGAGAGGAGAGACAGTT
ATGTGTTAGCATCCTGATTGGTATGTTCACAAACACCCGTCAATTATAGT
ACAAGACAACTGAATATTTATTTTTCTCAAATCTAATACCCACAAAATTC
CATCTGTTCTTAAGTTTCCCAATCTAAATTGAACTTCAGCACAGAAACTG
AAATTTCATAGCTACAGCCATGAATATATGGCATACGTAAATTAGCGTAT
GGTAGTTCACATATTGTGATTTTAAATTATACACCTTGCCACTTTGTTTA
CTACAAAATTCAGACAATATTTATCAATGTATGTTGTCTTATGGATACAT
AACAATAATTTACACATTCAGATATCCAAATTGGAACTAACCGGGAACAA
CTAACCTTCAAAGAGGACAACCAACAAGAGCAGGACCAACTTCCCTGTGA
AAACCTTCATATTTCCTATGCCACTGGCTGCAATTGATGCGGGTGTTAGA
ACTTGAGACTTTGAATAATATATAAATGTGGGAGGAGAGAACATCGGAGA
GCAACAAGGTACTATGTTCAGTTTCGCCAACAAGAAAGAGCTGTCATTAA
AGGAGAAAAAATAGTAGGAAGTCAGTTTCACATGTATGGAGGTAATTAAC
CCATAGCATCTAGTCATTCACGAGCTCGTTAGATGCATGGTCGGTGGTTC
TCAGTTGTCCGTTGACACATCAACGAGGCCTACAGTTTCTTATTCTGTTT
CTGTTCTATTAGCATGTACAACACATATGCTTAGATGAGTGATTATGTAA
AAGTAATCCTTTTTTTTTTGCCTTGTCAGGTATATTAGGTGCTTGCAAAA
AATACTAGGAGGTGATTCACTTTGCCTTGGTGCCTGAAGGAGTGCAAACT
TGATGGTTGTATAATTTGAGCATATGTGCACCTTTGTCAGCATTGGAGGA
GAACCTTTGTAAAAGGGTTGAAATTATTTGAATGCTCAAGACTAGATCTT
TTATTAGTAGCCTGTTGACTTGAAACTTGTCACTTAGTGGGTATATGCCG
AAACCCTGATCTCTGTAGCGCGACTCCAACTGTTGAGGGGTTGTCGCGCA
ATAGAGGCAGAGGAAGAGGTACGTGGGGATAATAGATTGATTTATTTATG
CTTGCCCTTCACGAGGGAGAGATTGGCATTATAAGCCAATGTACATGACT
AAACATGGAGATGACTAAACAAACTTAGAAACTATCTCTAGAGATAAGAT
CATACTCTCTCTGTTCCTGGATGTAAGGTGTATAGTTTTTGGTATGAAAA
TTAAAGAACACACATGGAGTGAAAATTAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.