Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE000119

[Submit comment/correction]

Sequence
AE000119
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE000119
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCTCTCTCTTAAACCCCCGAAACCAAAATCGAAAATAAAAATCCCCCTT
CCTTTCTCCCTCCCACCCATCCCGAACCCCTCGCCGCCGCCGCTCCTCCA
CCTCCTCCACCGCCGCCGCCTCTCCTAGGGTTCCGCCGCCGCGAGCCCCT
TCCAGACAGCCCCCGCTCCGGCGAACTCAGCCCTAACCCCCCCGCCTCTC
CTCTCGACACGCCCGCCGCCATGGCGGAGAAGCTGAGGGATCTGAGCCAG
CCCATCGACGTCCCGGTGCTCGACGCCACCGTCGCCGCCTTCTACGGCAC
CGGATCCAAGGAGGAGGTAACACATCCCGCGCCCCGCTCGCGGATTCACC
CTGCCCCCTCCCCCCTCCGCGCGCGCACGGCCTCGCTCTCCTGGTCGCCC
TACCACGCCCGCCCAGCGGTGCCTACGGGACTTAGGGTTTTCTAAGCTTC
CGAGCGGTCTTGTAGTTGCTAATGGTAGTTCACTTGCTTTTTTCCCCTAC
TGATGAAGGTTCGGGGGTGGACAGTGGTGATAAGGTTTATCCTTCTCCTA
GGAAAGTAGGGTTTGGCTTAGGCATACATGTCAACGATCATCATCTGTTG
TAGAGCCACTTGCTGTTGCTTCACGGGGACCTTCGGCACTGCATGTCTGT
TACGTCTTCTATGTCAAAAGTCATCTAACCTAAAGAATCCACTGCATGTT
TCGGAGTGCTACTGTGGTTGTTGTTTATAGCTTTGTCGATAGAACAAATG
TCACACATGTGTTCTAACAATCTGAGTGTACTTTGCTTGTTTCAGAGGAA
TGCCGCCGACCAGATATTGCGGGATCTGCAGAATAACCAGGACATGTGGC
TGCAAGTGGTCCACATCCTGCAGAACTCTCAGAACTTGAACACCAAGTTC
TTTGCCCTCCAAGTAAGTTTCTAAACATCGAGCGATGTTTTTTTTTCAAA
GCGTGAGGGTAGTTTTCTGTGAATATCTTATTTGTCATCTTAGGAAATAT
AGCTCTTGTCAAATGTGTAACCAGTTTTGACCTGTTCATTGGGTTTGAGG
GTTCAACATATTTAAACACAATATGCTGTTTTGAAAACCCCGAGGTTTAC
ATCTGATGAATGGATTCTGCTTTGCCATGTGAGCTCAAGCTTGATTACCT
TAACTGTAATTTGCATGAAAACATTTTTTTCTTATTCACCACCAGTTGTC
AGGAATCTCACTGCATGAATAGAAAACACTATAGAGGGGTTCAAATACGA
GTTAAAGATAATATATATACTTTGTTTCATAATTGTTCAGCTACAATCAT
CTAAAAAATAGCTGTTTTGTCTGCCACAATAGAAACACAATTTTAGGTTT
CTTTTGGGGTAAATGTGATTTTTGCTCTAGCTTTTCTTCTTCCCATTCTG
GTTCTATTTTAAACCTGGCCAAGGATAGTTGTTCTTTCAATTTTTTAACA
ACTGTTCCATCTATTTTTATCTCTGAAACCAAACTTATCCAAACGTGATG
ATGCCGTGATGGCACATGTAGAGGTGAAATGCAATGACTCACCATTTTAG
TTCACATTGTCATGTGCTGTTCTATTTCTGTACAAAATATGAGCAAAAGA
TGGACAAGATAACTAGGAACAATAAAGCTCTGTCACACTATTAAGGTTGA
AAAATGCATACTAATGTCACTAACTCCACCTTTTAAGAAGTCATGTTTTT
GGTTAGTGGCCTTCTCATGCATTGTGGATAGTCTATTACATATATTTACA
GGGATATATGTATTTGAACAGTGATATTGTTTGAACCTTTAGAGAAGCAC
ACAGAACTTCATTAGTATCACATATGTTGTTGATGTATTTGGTATTTTGA
ATTTATTGGATCCATGTGAAGAGATTGTGTAGGTCCGTGTGCGTGCATGC
TACATATGCACTATTGTGTCAAGTGTTGATATATTTTATAAATATATTTT
AGGTACTTGAAAGTGTTATCAAGTACAGGTGGAACGCGCTGCCGACTGAA
CAACGTGATGGCATGAAGAATTACATATCTGATGTGATTGTTCAGGTAAG
GATTAACTTCTTTGTTAACTATGACAAATCCTTCGTCATTTCTCTCATGA
AATAAATCTGATTCATGTACTTGTCTTGCTGTTAATTTTTTGGCACTCTA
CCAGCTCTCAAGTAATGAGGTTTCCTTTCGACAAGAGAGGCTTTATGTTA
ATAAACTCAACATTATATTGGTGCAAGTAAGTGTAAATCGAGCCATTTAA
CCCATTTGTTTCTGCTATCTGAATATACATGTATCTAATAATTCACTCGT
GCTTTTGAATTGTTGCAATGTAATAGGTTCTGAAGCATGAGTGGCCAGCC
CGGTGGACATCCTTCATTCCTGACCTTGTTGCAGCAGCTAAGAGTAGTGA
AACAATATGTGAAAATTGCATGGCTATATTAAAGGCAAGCTGTGTTTCTA
TTCTAATCTGCTTGATTGATGTACCAGAACACCTATTAACTATGCAACAA
TTTGCAGCTTTTAAGTGAAGAAATTTTTGATTTTTCAAGAGGTGAAATGA
CACAGCAAAAGATTAAAGAACTCAAGTCTTCACTTAACAGGTTGGATTTG
TTGCCATCTACTATTCCTGTCTGCCTAACAGCTTCTATTTGATAGAGTAG
AAGTTGACTCAGCAACTGAGTGTATTCGTTCTTTACTCTTTATATATAGT
TGGACTACTAATTAGTGCTGTCCTAATTTTCTTTGTTGTCAAACAGTGAA
TTTCGTCTCATCCACGAGCTATGTTTGTATGTCCTATCTGCAACACAAAG
CTCTGAGCTCATCCGTGCAACATTGGCTACGCTTCATGCCTTCCTATCGT
GGATTCCTGTTGGATTCATCTTCGAGTCACCGTTGGTAATTTTATCTACA
TTCCTCCTGAAAAATCTGATCTCTGTGGTTTCTTTGAAAACTGTGTCTTA
CTTTACCCCTGATGGCTATTAGCTGGAGACGCTGCTGAAGTTCTTTCCTA
TGGCTGCTTACCGGAATCTTACACTTCAGTGCCTAACAGAGGTAAAGAAA
ACATATTGTTAGATGTGTTTTATCCTGTGTTGTTCCTTACTATTCTGTTG
GAGTAATGCGAAGACAGTCTATCTAATTGTGGTTACTAGGGTGCTTTATG
TATTGCTTTACATATTTGTGGCAGTAAAGTGACAGTGGCATTGTTGTAAC
TTGTTTCATTGCTGACGCAACACCCTTTTGATTTTAACTTGCAGGTTGCT
GCTCTTCAGTTTGGCGATTTTTATAATATGCAGTATGTGAAGATGTACAC
AATTTTCATGATGCAGCTGCAGGTGAATGATGTGCTTCTTATTTCTTCTT
TCTGAAGTATTTTCGCTTAAACTTTACTTACTAATGGATTTTTCTCAAAT
GTTTAGGCTATTCTTCCTCCTGGATCAATTCCCAATGCTTATGCTAATGG
TTCCAATGATGAACAAGCATTCATACAAAATCTGGCACTGTTCTTCACTG
CCTTCTTTAAGGTAAGATCCTTGTCATTATGGATATTAGTTAATTGGTAT
ACTTCAACTTTGACATGTGAGATATTTTTTCGGTTCATAAAATATTCATA
GATGATGTAACTAACTTAACTGCATTATTGCCACAGTCCCAGCTATAACA
CTTCCGATTTTTATGACAATATTGTTCATTCGTTATTGCAACATTCCCAG
CTATAACACAAACGATTTTATGACAATATTGTTTATTGTCCTGCACTTAT
GGATTCTAAGATTTACAAATGGAGATATGCTAATGAGCAATATAATGATC
GGGAAATAGTAAGTCTCTGTTCTGATCCCTTTCGTTTTGTGATAATTTCT
TCCTTTTGTGATGTATGCAGAGTCATATACGTATACTGGAGACATCTCCA
GAAAATAGAGCTGCATTACTCCTTGGTCTTGAGTACCTCACTGGAATTTC
ATTTGTTGATGACACTGAGGTTTTCAAGGTAGTAAATTTAGAGCTTGATT
TAGCATGCATAAACAGTTCTTATGAAGTTGTATATCTCACGGTGATTAAT
CTACAGGTTTGTTTGGATTACTGGAATGTATTTGTCTTGGAGTTATTTGA
AGCACACAATCAGATTGAGCCGGCAACAGCAGCTGTAAGCATGATGGGAC
TTCAGGTGCTTTAAAAGTGCTGTCCACGTGATCTACTTAGATATATCCAA
CTTTCTAATTTATGCGTTTTGTCAATAAACAATCTTTACTGCTCTGCATT
TTGTTCTATATTTGTTTCTTGCTTTGTGAAATCCTTCTTCCTTCTCTCAC
TCAAAAGTTTTATGTCCTTCTGGTAACATCTATGCATGACTTGTACGCTC
AGATGATTCCTGGAGTTGTTGATGGTACTGGTACAGCTGTTCAGCATAGG
AGGCAGCTTTATTCAGGTCCACTGTCAAAATTACGAACGTTGATGATTTG
TCGGATGGCAAAGCCTGAGGAGGTACTGATTGTGGAAGATGAAAATGGCA
ATATTGTACGTGAAACATTGAAAGATAATGATGTCCTTGTCCAGTATAAG
GTTTGTAACTAAATGCCAAACTGCTGTGGTTCTTTACAAGATGTGCAATC
ATAGATCTGACGTGATACTTCTTCTCTTCAATTGTTATGCTAGATCATGA
GGGAAACACTCATCTACTTGTCTCATCTTGATCACGAGGATACAGAGCAG
CAGGTATGTTATTCATGATTTCAACGCCAATTCATTGTATATTTAGAAAT
CATGCACCAAGTATTGTACACTATAATTAGCTTGTTTGCGATCAGTGGTA
CCAAGTACACTCATTTATGGTGAGTTGACATAAGATATGGTTGAAACATG
AATGCTATTGATGATAGCTGGATTGTTCATTCAAGAACATTCAGTCTGTG
TGGCTGGGAAGGGTTGGAAATACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTT
TTAGCTTTGTGAAAAGAGTGTATCTAGACCCCTTTTAGTATCTAGGTTCA
CTCCAAACCTTGATGAACCTAGACACTAAAAGAGGTCTAGATACACTTTA
TTTACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTACCTATTT
TGTCTGTAAATTTATTCCCCTACTTTATTTTATTTTATTTTATTTACCAT
CTCTTTGAATTTAAAGCACAACTCCGTGCCACTTCTTTTGGAATTGCAGA
TGTTGAAGAAATTGACTAAGCAATTGAATGGGGAAGACTGGAGCTGGAAT
AACCTCAATACTCTTTGCTGGGCTATCGGATCGATATCTGGTTCTATGGT
GGAGGAACAGGTTTGTACACTGTTATTATGCTAATTTGTTTGTTGTTGAT
AAATGCTTTGAAGGAGTCAGCATTCTATTAACTTCATTTTGATCCCCACT
CATCCAATGTACCAAAAATTCTAAATGGTTCCTTGGATCTGTTCTTACAG
GAAAATAGATTTTTGGTAATGGTAATTCGTGATTTGCTCAATCTGTGTGA
AATCACCAAGGGGAAAGACAATAAAGCTGTAATTGCGAGTAACATCATGT
ATGCATTTCTATCAATTCTCCCATGTTTGGAATTATGAAGGATTATCTTT
GCTCATTCGATGATTGCATTACTAGGTATGTGGTTGGTCAGTATCCAAGA
TTTCTCAGGGCTCACTGGAAGTTTCTGAAGACAGTGGTCAACAAGTTATT
TGAGTTCATGCATGAGATGCATCCTGGAGTTCAGGTTAGTGATGCATTTG
CATGTAGTTTGGAACAGTGAAATTGGTTATTGTTCGTTTAGTGCGGAATA
AGTATATTTTTTCCTGGCACGTCTAGTTCACAGCTTCTGTTTTGTTGCTT
TGCATAGTTGTGCTTCTATCAGCATCTGCAAAAAGGTTTTTATGCACTGC
TCTTTTGCAGGATATGGCGTGTGATACATTCCTGAAAATTGTTCAGAAAT
GCAAGCGCAAGTTTGTTACACAACAGGTAGATTCAATAACAATTCCCCTG
TGTCTATAATTTTGATTGATTTTACCGTTCGTTTCTAAATTCTAATTATG
TAATACCCAACACATGCAGTTAACTCAATTAGATATATAGTCACATCCAT
GCTATATGATGCTCACAAGTTACATGCCTGTTTTATTGTTTTCCCGTGAT
GTTTCCAGGTGGGTGAGAATGAACCATTTGTTTCTGAACTGCTGACCAAC
CTTGCCACGACAATCCTTGATCTGGAGCCACATCAGATTCATACTTTTTA
TGAATCGGTATGTTGAACAAATTTAACAAAATGTTGTTTATAAAAATAGT
CTATTATTATTGTTGCTATCATTTACGTGTTCTGTGCTGACTGTTCAGGT
TGGCCACATGATTCAAGCTGAATCTGATAATACTAAGAGGGACGAATACC
TCAAGAGATTGATGAGCCTTCCTAACCAGGTTCCATTTCTTGCATTCATT
TTGCTTCCTGTCATGCTTTCTCTCGAGTATATTCTTTACAACGTTATCTT
GTGTTTTGATTTGGCAGAAATGGGCGGAAATAATTGGGCAGGCAGGCCAG
AGCATTGATATCCTGAAGAACCAAGATGTTATCAGATCTGTTCTTAACAT
CTTGCAGGTAATAATGGAGGCTGAAGAGCTTCATTTTTACCGACATTGCT
TTATTATACTATTGTAAACTGCAATTATGTTGGTTATCTATTTATTTGTT
TAGAGTTTTTACTTCATTTCTAAATTTGCACAATGTTTTTGTTGTTCTAC
TTCAATAAATAATTTTTTACTTGACCAAACCCAGTTGCATGTCATCTCTT
TTTTTTTGGAGAGAGTTGCATGTCATCTCTTAGCAAGACAACTCTCCAAA
ACACTTGGTCAAGGCAAAATAAATATTTCCCAGGCTTCATTAGTGCCACT
TTCAGCTATTGGGCATGTGTTTTACTTGCTTTTGGTTGTCCATGCATTTT
TTTGATTATTGCTTTTTGCCAGTACGATGTGCTTGGAACATTTGAACACT
TCCTTCTGAATATTGAGTATGCACTTATGCCCAAACTTCATGTAAAGCAC
AGAATACTCGTCTGGACTTGCCAAACTTACCATAAACACACACTTGGTAC
CTGAACACAGGCTGTTTTTGGTACTTCCTCCGATCCTAATTAACGTTAGA
TTTTTCTAGATTCGGATGTATCTAGCACTAAAACATGACTAGATACATTC
GAATCTAGACAAATCTAAGAACATTAATTAGGATCGGAGGGAGTAGTATT
TTCCACCTAAGAAATTATGCTGATATCATTTGTCATTTTTACCAACCAGT
GAAAATTATGCTTTAATTATGTTGCTGAAAGCGAGTATATTGTTTGGCTT
TGGGTTTCCTTGTTATCAGCTGTGCAATTGCTCCTATTGTCATATTGATA
TAATGCTATTTGTGATTACTCTCTTGGTACTAACATGATGTTTGATTTGC
GATTGCAGACAAACACAAGCGTTGCGACTGCACTTGGACCGCACTTTTTC
CCACAAATTTCACTTATCTTCCTTGACATGCTAACCGTTTACAGGTATGT
TCTTTGGCCCACATGATGTTTTATAATACTAGATTGCCGTTAGCATGTTT
ATAAGTTTCGAGATAGTCCTGAAGAAGTGAAAATACCCTTTTCCATTGAA
CTGGTCCTACCTGGTGCCATCTTGCCTTGTAAACTTGGGTAGTCTGGTAC
TTCAGTACTCCCTCTAATCCATAATAAGTGTTGCTGAATCGGATGTATCT
AGACCATTAAAATGAACCGGAGGGAGTAAATGATAATTTTAAGCTGGGTA
TGTCACAATCTTTTGTTGCTCCCAACTAAATCAAGCCCAAAATGTTGTGC
TGGTTCAGTCTATAGTCAAAATTGGCTCACATACTAGTCCGGGATGCTTT
ACATCCTCATTGTACCTGCCTATTTTGGTTTTTTAGTGTGGTTTGCTTTG
TTATATTATATCTGCAAAGTAGAAAAAACGTGTCACAAGCTAATACATCT
TTCTCTTCGCATTTTACATTGTTTTCACATCAGAATGTACAGTGAGCTTG
TATCAAGCACTATTGCTGAAGGGGGGCCTTATGCCTCGAAGTCGTCATTT
GTAAAACTCTTAAGGTATGTTGCATCATTGATATCTACCTTTGTTTTCTT
CATTTTGTTGTCTTACTAAATAGTAATATTTGGAACAGATCTATCAAGAG
GGAAACATTGAAATTGATTGAGACTTTTGTGGACAAAGCTGAAGATCTAC
CACACCTTGGGAAGCAGTTTGTTCCTCCAATGATGGATCCTGTTCTTGGT
GATTATGCTAGAAATGTGCCTGATGCAAGGGAATCTGAAGTTCTGTCCCT
GTTTGCAACAATTATAAACAAGTACTGCCTTGAATCTGATACCCATTTTT
TCTCTAGCTGGGATATTTTTTTAAAATTATTGCACGGTAGCTTGTTCAGT
CAGTTAACTTCGATTCATGTTCAGTTATTTGTTGTTAATTCTATGTTGTA
TTTCACCTCATTTCTGATCATTGTATTATACTGCAGGTACAAAGCTGAAA
TGCTTGACGACGTGCCTCGTATATTCGAGGCTGTTTTCCAGTGTACCCTC
GAGGTAGGAATTCTTTCTTGCTTTCGTTACTGATCGTACCCATTTACATG
TCGAGAGTTGACTTTCATTTTATCTTGCCAGATGATTACCAAAAACTTTG
AAGACTATCCTGAGCACCGTCTTAAGTTTTTCTCTTTGCTTCGTGCTATT
GGTACCCATTGCTTCAAAGCATTGATTCAGCTTTCAAGTCAGGTTTGTAT
CAGCTCTTTTCTCACTATTTCTTCATTAGCCCAGTCATTCAAAGCATTAA
TTCAGCTTTCAAGTCAGGTTTGTATCAACTCTTTTCCCACTATTTATTCA
TTAGCCTGTCAATGTTATTTGTGTCAGTATAGCATCCGGTATTTCTTCTC
TTTAATTTGATTATTTGACTGTTTGTTTCAGCAATTGAAGCTTGTGATTG
ATTCGATCAATTGGGCCTTCAGACATACGGAGAGAAACATTGCTGAGACT
GGCCTTAGTCTATTGTTGGAAATTCTGAAGAATTTTCAGGTGGAACATAT
GGTCATCTTTTATTCTTTCGCTGTATGTAATTATTTGGAAGCTTAACTCT
TTGATTTGATTGTCCTGTGCAGGCTTCAGCATTCCAGAACCAGTTCTACA
AAACATACTTTTTGAATATTGAGCAAGAGATTTTTGCAGTTCTCACAGAT
TCTTTTCATAAGCCCGGTTTCAAGCTTCATGTTTTGGTGCTTCAACATTT
GTTTTGCGTGGTATGTTTGTTGTGCATTGTAACTGTTATTATATTTCCTT
GGACTCATAGTGTTTGTATGTGTGCATCTAATTATTACATTTCATAATAT
GTAGGTTGATGGTCTAACTGAGCCTCTATGGGATGCTTCCTCAGCACCAT
ATCAATCTAACGCTATGTATGTTCGGGAGTACACTATAAATCTTCTTGGA
GCATCATTTCCTAACATTGCGGCTGCTGAGGTATGATATTATCCTAATGC
AGCTATCCTGTGCTCGACTTGGCCATCATGATGCTGACAATTTTTTTTTG
CGCAGGTGACAAAGTTTGTTGATGGGCTCCTTAGCTCGAGACATGACCTT
ACAACCTTCAAAAACCATATTAGAGACTTCCTGGTGCAATCGAAGGAGTT
TTCGGTGCAGGTAACTTGCCCCCCTTTTCATTACACCACCTGCAATTGAT
TGGTTATCGTAAGATTGAAGAAAACTATAATTTCAAGAAAAAAGCTTCAT
AAATAATCAACAAAATATTCGTACATGATAAAATGTAGCTCACTGGAGAA
CTATCTTCGGAAATATGATGAGTTACTGCAGCTTAACTTCACAAGTCACT
TTGTGCAAGATTTTTTTTGACAAGTTGTTATCTTTGTGCTTCAGGATAAC
AAGGATCTGTATGCGGAAGAGGCTGCTGTACAAAGAGAAAAGGAACGGCA
ACGGATGATGTCCATTCCTGGGCTCATTGCCCCGAGTGAATTGCAAGACG
AGATGGTAGATTCATAGTGTGCCTGCTGATTCTGCCTTTCTAATCCAGTG
GCCTCTCGAGGCCTCGACATCATCCCCCCAAGCCTTAGTGATCTTCCATG
GTGGTGAAAGGTGCCTGCTGTAATTTTATTCTCGGTTGCCTCCACTTGAC
TCTTGATAGGGACTCAATTTTGTCGCAAGAGCTGCTTTGGAGAGTGGTAT
TGGTTTGCGGCATTTTGCGCTGTGTGGGTTAGATTTGGTTTAGCAAGCAG
CTCTTGTGCTCCTCGCGGGTTGTAAGTTGACATTTGGTTGGGTGCTGTGT
GATGAGCCATGATTGATGATCACGGTGCAACATTTGTATGGTGCTGCTTA
TTGCTAGTTTAGCCTATAGTTTGACTGTATGATGTACCAAGACTGATGAT
CCAGACTGATAGGAACTTTATAATCCTGCTATTGTACTGTTATATGTGAA
ATATGTTTTTTACCTTCTTTTGTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.