Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE040136

[Submit comment/correction]

Sequence	AE040136
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE040136
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AGATACTCAGAAGATGGAGGCACAGATGGAATAAATCGGCAAAAAAAATA CCAGTAGCATACCAAACACAAGTCATTAAATGTATTGAGATAGGGATAAA GTGCCAGTCCATTGACCCCTGTATACGGCCTTTTATACAAGATATAATGA AAGAAATTGGCGATATGGGAAGTACTAGTAATCACATCAGAAATGGTGAT GAACCTACAATTGACCAGGTAATGTCATATGCTCCTCCCACGAACCTCTA GAGCCTTATTTGCAAAATTTAGTATACTCCATTGTGTTTTCTTTAAATGT AATCATTTCATTTCCATGTTCTTTGATATGTGATTCTCACATGTGTAGAT AACTTCTGACTCTTTAGAGGATGACATGCTTGGGGTTGAGCCGCTGGAGC TACGATTTGCTGATTTTGATCACAACAACAAGCATGTACCAGTGTCGTGT TCCGTTGAGCTAAGCAACAACACAGATGGTTTTATTGCCTTCAATATTGA ACAGACCAGCCCTTTGACATACTACATATACCCAAACAATAAAATTGTGC CACCACAATCAAACCTCAGCGTGAACATAACATTACCGGAAGCTACACAA CATCATTATACGCAATACAAGGAGCAGTTCCTCGTGCGAAGCACTAAAGT TAATGAGAAATGTGCAGCTAAAGATAATTTATCAAGATATGTTTGTTAAG GGTAAATATGTTGATAAAGTTTATTTGACAGTTGTTCATGAGGTATGTTC ACACAATGAACCGGCTAGAGGGATGGTGCCACATGATTCAAAGAGGTTAG TTCTTCAATCTTCTACCACATCTCATAGTTTGATTTTAAGCACCTTCTTG GCAAATTCTATAACTTCTATTTTGCAAAGGTTTCTGTTTTTTCTGTGAGC CTTGTAAAAATTTCAAGCACATCTGTACATAGACGTCTTCAGAGGAGCAC ATCTCCCTTTTAGATCAATCCTTCATTTGAAGCACCTGTTTGGCAAATAC TCCCTCCGCCCGTGACCTGGATTTGTCTAATTTGTAAGTATCTACACATT AAAACATGTCAAGATGCATGCAAATTTAGCTAAATCCAATTCACTTCTTT TGAGACGGAAGGAGTACTACAACTTTTGTTTTGCAAATGTTCCTTTTTTT TCATCCTTGTAAGGTTCAAATACAAATGTATTTTATAGTTTCTTTATCAG TTGTTTTTCTAAATTTTCATGGGATTTCGTCCGCAACAGAACATACACGC GACAGGATGTATCAGAAACTACAATATATCTCTTGACCTATGACTTATAC GTGATGATATAATTGCACAAAGAACCTCAACTGCCAACTCAGCTGCAGAA AATCAGTAAACTATATGCTAGGTTAAATATTGTGATAGAGGGACTAGTTA CAACTGTGTATTCTTGGCATAACAGATTTTGTTGTTTTGGCTGATGCTGC TGTTGTTTCTACACGTATATCATTCAACTGAAGCATGGCTACACTTATTG ATTTACGTACGTTGAAAACAATTACAAAAGATTTTTCGGACGGCCAGAAA ATTGGAAGTGGTGGCTATGGAGATGTTTACAAGGTACTAGGCATGAACTA CTTTTTTTATTAAGTAGACTTGGTGTTTTTTTACGCATGATCGACTTGGT ATTTTGTTTTATGATGAACAACATCATCATTAATTATCAATCTGTCAAAC AGGCAGTCTACAACGGGGAAGAGATTGCAGTGAAGTTGCTTCATGCGACC AAAGGAATTGATGACCGACAATTTATGAACGAACTCCATCACCATACGAA GGTCCAACATCCAAACATTGTCTGTCTAGTTGGTTATTGCAATGAAGAAA CCATCAAATATGTTGAGCAAAACGACGGTGCGTCTGTTTCTGCTGAACTC GTGTACAGAGTGGTCTGCTTTGAATATATTCAAGGTGGAAGCCTAGACAA GAGTCTTTCTGGTAAAGATGCATGGCACTTCACTTCACTTCAATTTGATC CTCTTCTCTTGATTCCTTAACTTCACGTTTGAGTGATTGTCCTCTATTTG CAGAAAATTCTCTGGGAAATGAATGGCACACACATTACGAAATAATAAAA GGGACCTGTGAAGGTTTATGTTATCTTCACCATGGGTGCGAACTTCCGAT CCTCCACCTGGATCTAAAGCCAGCCAATATATTACTTGATAAACGCATGA AACCGAAACTTGTGGATTTTGGATTGTCAACAATCTACACTGCAAGTCGG AGCACAACGTTAGTGGAACATTTCATTAATTTTGGGATGCTTCTTTTTAT GTAGCCAAACAGACGGTGACACTGACCGTGTCCTTAATGTCATGCAGGAA GTACATGCCGCCCGAATTAATACATCGAGGAGAGATGTCAGAGATGACTG ATGTCTTCAGTTTAGGTGTTACAATCATAGATATAATTAAGGGATCTGGA AATTTTGGGCTTTCCTACGACGTCAGGGACACAAAATTTGTAGAAGATGT ACGAATAAATTATATTTAACCAACATGTTTAACACTAACAGGTCCGGTGT TATGGTTTATAATTATCCATCTTATGAAGTTGCTGATAATCTTTTTGTGT ATCGATTTTGCAGGTACTTACATATTGGAGGAAAAGGGACACGAGAGCAT ATTTAGATCAAGTGGAGACATGCACCAAAATTGCACTTCGTTGTCTGCAT CCCGATAGAAAGAAGAGGCCCACGATAAAGGAGATTGTGGCAAACTTAAA TAGTATGGAAACTCATATTTTCAGCAAGGTATGCTTGCTAACGACATCTA CCTATCTGTTTGTAACTTTTACTACCGGAATATTCATCGAACTAGAAAGA TAAGGGACGGAATCATCACATTGGTGGATTTTGTGCGTGAACTGCAATGC AGCATGCCCAGCCTCCTGGTGAAAAAATATCTTGCCTCTACACAAATATT AAGAATGAATATATGCTTTTTGTAAGATAAATAATAAATAAATAAATGAT TGTTAGTAGGAAAAGGATACTGTTATGCTCACTAGTAGAAAAGAGGCATT TGATCCAGCCTCCAAAGCCATTTATCCCGGTTCAAATAACAAATCGGGAT CAATGACAGGCATCGGTCTCGGTTCATGCCGCTAGAACATCCGTCCCGGT TCATCTCGGGGTATTGGTCCTGATTCATGGCATGAACCTGACCATTGGTC CCGGTTCATGCCACAAACCGGGACCCAAAGGGTCTCTCTTTAGTCTCGGT TCGGTATATAAATCGGGATAAAAAAACTTTGTAAGAAAACGTTATAAAAA TTTCAGATGTCCGCCATTTGTGCATACGATTGCGGAAAAAATCGTATAAT ATATGAAAATTATCGGCAGAAAATTACGATACCAATGCCAACCGCCTTCA GCCGTTTGCAATTTTTTTAGATTTTGGAAATTCCGAAAGAGTCAAAATTC TGATTTTTAATTTTATTTAAAATAATCAAAAAAATAAATAATGATATATT TGGATTCCTCACATTTTTCTGATAATAATGGACATATTATTTGTGGAATT TCGATTTATGGATTTAAAGATATGCATTATGCCATATTAAAAGAATTAAT GCAAAAATAATAATAATACATATTTTATTTATATATTTATTCAATATTAG TAGTACTTAGTTATTTTTGAACATTAAAATCATGTTTGTAACTCAAATTA TAAGAATGTGTGACTCACAAGATGCATGGGTTAATATCATTAATAACATA GTATAGACATAAGTTTATAAGTGGTACATAGGAAGGGGGATGGGAAGGAG CCAAGATGTTAAGTGTGCTAGGGGTGGATTAGTGTTAGGATGGGTGACCG ATCGGGAATTTTAACCAAAGATTCGAATTTGACTAAAAACTAAGTGTGAT TGAGAGCCTTCGGGTGAGAGATTAACTAGTCCAAATATTCATACATTCAA AAAAATTCAAAAAAAATTATTTTTTGAAAAATAAAATAGAAAAGTCCTTT GGTCCCGGTTCATACCACGAACCGGGACCAAAGGTCTTATTATAAGTGCC CGCGATGGCGCGCCACGTGGAGATCCATTGGTCCCGGTTCATGCCAGAAC TGGGACCAGCATTGATCCCGAGTGATTGGTCCTGATTCAAAATCCGGGAC TAATGGCCCTTATGAACCGGGACTAATGGCCCTTATGAACCGGGACAAAA GGGTTTTTTTTCTACTAGTGGCTGGGGGATCGTGTGACTTTCATCCTCCA GGTCACGTGGACATGCACGCACCAGGTCGTTGGTAGGGCCCGCTTGTCTT ATCTCGATTCCCCATCCTTCTTCTTTGTCTCTCTTGTTCCCAGCGTCAGC TCCGGCTGCCGCCTCCCTGGCGCTGCCGCTCCTCCTCGAGCTCCCTTCCC CTGCCACCGGGGGCTGCTCCTGCTGCCACTTCTCCCAGTTGAGTAGTCGG CGATGATGTCACCAATTTGCTTACATGGCAGTGCATGGACATGCATGTCA CTATGACTAGCCTACTAAGGCTGGTTATTGTGCAAGTAACTTCAAGAGTA ACTAAGTGTCCAGCTCAGCAAAATTGTTTATGTGGAAGTGAGTTAATAAA GAGAGAGGAGGATGGAGTAACATATTTGGTTACTATAACATCACACATAC CAATGTAAATGAGTCTATCACCAATAAATAGGACTTTGCATGAGACCACT TGTATGTTACTCTAGTAACATAGACAAGTAACTTGTGCATGTTACTAGTC TATGTTACTCTCCACTTTGACCAGCCTAAATGCTTATGGTAACAGCCCGA GTCCCAATGTTATTAAATGACGATGGACAATTGGACACGGTGGTTGGAAC CGAATACTAGTATTCAGTTGATGTTGATCCACTTTTACTTCGACACTATA AGCAGCAATTAATGCACACAAGTTTCAGTCTCTTGGATCTTCAGCAAGAA GGGCTTTCAGTTTACACTCGTAACCATGTCAATACACACGGCATCCTCTC GTAATGCTACCCTACCCCTACTTCGTGCACAGACTAAATCCCAGGAGACT CAAGAGGATCCATAATCTTCGGTACCCCCCCTCCCAAAAAAACAAAGAAA TTCAGCGGTAGCGGGTTTCGGGTTTGTGCTCTGGGTGGAGACCACACTAG CTACATAAACGACAGTGGCATACGTGAGCAGGCGGTGCTAGTGCTAGGCG TGGAGGTTGCGGAAGAGGAGTTGGGTGTGGTGTTTGTGCTTGGGCGTGGA GGACGATAGGCAACACCATGGTGGGTACGTAGGTCCGGGTGGATGTAGGT GTGGCTGACCGTCGTGGAGGAGGAGCGAGGGAAGGTGGAGGAACTGCGGG GGGCGGCAAGCTAGAGTGCAGCGATGATCTGCTCTCCGTCCAGCGATGGT TGCCGACGTGATCTACGCGATCACATACGCTCCACCCGGTCACGTACGCT CACAACCGATCCCGACCTCCTCGTATGCCCTCCTCGCTACCGATCAATTA CAATCCCGTCTGATCATGTATGCCGATGTCGTATACGTAGGCAGTATGGT CTCCATATCCACCCGGAGTAGGAACCCGAAACCGCTAGCGCTGAATTTCT TTGTCGGGGGGGGGGGGGAGGGGTACCGAAGCAAGAGTCTTTTTCTTTTA GTTATATATACTACTTGCTCCGTTTTACTAGTAAAATATAAGATGTTTTA GTCTTTTTCTAAAACACGTGTATCTAGGCATCCTTTAGTGTGTAGGTTCA CTCATTTTGCTCTGAAACTATGTAGTAAAAGACACATGCGTCATAGGAAA AGGCGGCTAAAACTTCCTATATTTTAGAACGGAAGGTGTGAAAATGTAAG TCTTTTTAGCGGTTTAAATTAAACTTCTACAAAATCTTAAATTATGGAAC CAATGTAGCACGTAGTTTTGTGGATGCTCTGTTCAAGCTTATATATATAT TCCTTGTGTATATGCCAGGGTCCCCATGCCCTCACCGTGAATTCGTCGAG CGAGAGGTTCAGCTTACTCGCCGCCGGTCCGAGTTCAGGTACAGGAGTGA TCATGAAGACCATGCATGCTGGTACCAAAAATCAGGTGTATGATTCTTGT TTTGGCGAACTATATGAACGGTCGATTTTTGTGTGCAGCGAGGGGGCCAC TGGACGCGGTGATTGTGTACGCATTCGACTGCTCCACCTGGACCCCGGCC CGGTACGCAGTGGATGATGAGATATTCTGGATGGTGCAAGGGAAGCTCAC CAAATTTACCGATAGTTCCATGGGTTACATCAAAGTCATGTTGAGCGGTA ACACATACATAAGTGACATGAAAACAGTTGATTCGGCTGAGACTAGGGCA ACTGGCTACACGGCCTTGGACGAGCGCAGGGTCACCTGCTACAAGAACAT GGCATCCGGCCTCTCAGAGGCGCATAAGATGATCAACAACAACCGGGGAT ACGAGAACGGTATCATATTGCTCTTTTCGAATGGGTTGGAAAATAATAAG GGAGACTTCTTTGATGGAGCTGAGAACTTCGTGTCCAAAGTGCCCGTCCA CACATTTACAATTGGCCGGGACGCAGATAACCGTGTACGTATCATCCATC GAATCATATATATAGCTGATCCGCTGTTAACCATGCTCCTCTTACTAATA AATTTAATGTATTCTTATATGTTGAATATATGCTAGGTTCTCTACTCGAT TGCGGCAAATTCTCGGGGCGGGAAGTTTCACACCAACCCTGTTCCTGAAA GGCCGCTTCTCTCAACAGCCTTCTCGAAGCTACTAGATAACATCCTTGAT TGTCCCATTTCAGGTATATATACGTCCATCCAATCCAACCTGATTCCAAG AGTGATCATCAACAAGACAACAACATGCATAACAAGATGACCAACTGTCT ACACTGGTTTGCAGGAAGAGGGCCACTGGACGTGGTGTTGGTTTATGCCT TTGACTGCACTGAATCGACCCCGGCATGGCACACTATAAATAATGTGTTC TTTTGGTTACTAGAAGAGAAGCTCACCCACTTACCTGACAGTTGCATGGG CTACATATATGTCTTGTCGACCCCTAACACATATGCGTCCGACATGAAAT TAGTTGACCCTGCAGAGACAAACGTACCGGGAAAGAGATGGTCGTTGGTC TGCACTAAAAACATGGCATCTGGCCTCGCCGAAGCGCATAAAATGATCAG TTATCGCGGGCACCGCAATGGCATCATCTTTTTCGTCTCCGACGGATTTG TAAACAAGGGAGACTTCTTTGATGGAACCGAGAACTTCATCTCCAAAGTG CCAGTCCACACGTTCACTCTCGGCGGGGACGCATATAACCATGTATGTAT ATCAAGTAATAAGAACTACCTAGTACTGTACATCAAAATCACTGCTTATT AATTAATTCAACGTATCCTATGTCTATGGTAGGGTCTCCAAGCCATTGCG GCAAATTCTCCTGGTGGGACGTTCAACCCCCTTCCAGTTCCAGAGACACG GGAACTGTCGGCGCCCTTCTCCAAACTTCTGGATAGACTCCTCGTGAGCG CCATGAATTAACGACTGAAATTGTGATGAACAGATAGCATGGGCCAAGTG TGCACGCACTCCATTTCCAATGTCTTTGTTCATTTCATGTGTGCAATTAG TTGCCATATCGATCTAATTAAGGCACTGGTTTTAACCAGAATTGCGTGTG TGCGAGAAAGTTGAGGCTATCACAATATTCAGTTAAGCCAGGGTTGACAA TGACACAGTTTACACACTCACCACATGCAACAATGTTGCTACCCGAGGGG CGAGACACAGTCGCAACCCAATTATCAGTGTAGTGCATGGTGTCTGTACT CTAAGGCATGAAAACATGAGAGAGAAAAGAGGCCGAGACCTTGAACATGT CAAAGCAAGCCTGATCAGATGTACTTACGACGAGGCTGATGAAGCCGACT GCGCGTCCCGTGAAGGTTCAGATATCATAGACGATGTCGGTGTTTGTTGT AAACCGTCCTATTGGTGCAAGGTGACGACTTGCTGTCGGCCTTATTCTAG TCGTTCTGTCTGGTAATGTCGACAATGAAGCAACTAGAAGGGACCTCCAT GACGAGCTGAAGTGTGACAAGCAATACGCGCTGCAGGTCAGGCTCTCCTT TGGGATGTGCAGTGCATGAGCCGTAGACAGAGGCGCCTGAAGAACCCCAT ATGGATACGGCGGCCCTGGCATGATCCTCCGTGTTGGAAATAAGCGCTTC CTACACAGGCACGGCACCGTGCGCTTCTCCGTATACAAGAAGTATACGTA TGTGTGTTCCGACTAGTACACAATACGAGTGTTCCTGTCCGATTAGGAGT ATGTGTCCAGGTAGGACATATGGGTGTCTCCTAGTCGGTTTGGTATATGG AGTAGTAGTTGGACTCGGTGATTAGCAAGACTAGTATTTATATACATGTA ATAGCTAGACTTGTAACACAGCACACCGTGTAATCGTGAGTTGATCAATA TAAGGAACAGCAGGTGCGATATGCGCCTGTGGCAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.