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GrainGenes Sequence Report: AE028006

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Sequence
AE028006
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE028006
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACTCTCGCTGCTCTCCCACACAGCACAGCCGCAGCAGCAGCCGCCGCCG
CCTTGAATCGAAGCGACTCCTCCTCCAACAGACGAAGAGCCCCTCTTCCT
CCTCTTCCTCCTCGCGAATGCCGCTTCCTTGCTCCGGTGTTCGCGCGTGA
GCGGCTAGGGCGCGGGACGAGGCGGCGATAGCCCCGGCGCGCGACATGGG
GGACGAGAAGGATTTGGGTGACATAGTGCTTTCCTGGTCGATCCAGCAGA
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CTGCGCCGCCAGTTCCGGAATGGTGGTTTTCTGCCGGCGCGGTCGCGGTT
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ACTATCTTGAATCGTATCGTGTGCCCCTGATTGAAGAAACAAGGTCAGAT
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GGCGATATCTTTATTTTGTCTAGCTCGAAACCTGGAGCTGTGGAGGACTT
GAACCGCTATGGCGTGACATATTGCCTCGCCATGGTTACCGAGGTTTCTT
TGGATGATGAATACCAGAAGGGTTTCAGAGTTAAAGTTGCAAAGGATATT
GGTTCAGAAGAAGACTTAAGTAAACTCAGACATGCAATATTTCTCAATAA
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ACATTATAAATTGGTGTCTAACTTTTTGAGCCCTCTTTGTTGGGTCTGTT
ACAGGGCGAGGATGTATGTGGCATCTGTGTTAAACAGGATGAGCGCTGTC
TTCCTTCTTTGACAGAGCAATTACTATCGAAACTTAATCAATCTCAAGTG
GATGCTGTTGAGTCTGTGATCTCAGCTGTACGATGTAGGCATAAGAACCT
CATGAAGCTTATATGGGGTCCACCAGGTACTGGGAAGACCAAGACCGTTA
GCGCTTTACTATGGGCTTTGGCGTGTGTGAAATGCAGAACTCTTACTTGT
GCTCCCACTAATGTTGCTGTCGTCGGAGTTTGCACCTGTTTCCTTCAAAT
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TTGGAGATGTCTTGCTGTTTGGAAACAAGTATAACATGGACATCACCGAG
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AATATGCTGGAAAAATTTGGCACCCTTCTGTGCGACGTCAACTTGACAGA
TGAGGGCTTGAAAAGGGGCCTTGGTTGTCTGTCAACTGAAAACTCTGTTT
TTCCACAGTCTTCTATTGAGAAGGAACTGGATGAAGCAAGGTCTGCATGC
CTTAAATTGCTTAAAGATCTGCAGCACTTGCTCAATTTACCCACTGGAGT
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TCTGTACTACCTCTAGCTCTTATCGCTTGCATCACATGGAGATTGCACCC
CTCGACGTCTTAATTGTTGACGAGGCTGCTCAAGTGCGAGAGTGTGAGTT
GGTGATCCCACTACGTCTGCATTGGTTGAAGCATGTTGTTTTGGTAGGAG
ATGACTGTCAGCTGAGTGCAATGGTTAAAAGTCAAGTAAGTTTCACCTAG
CCCTCTTTATACTGTATTGTGTCATACTGTCATTCTATAGTTATAGGTGC
ATTTTTCTACGACATCAACTTCTGATATCAGAAGGCCACACCAATATTTC
AGTTATTTATGCATTTGTCATCCACATCCAATGCATTATTGAAATATACG
GCCCACCCATCTCCATCAGTTCAGACTTTTGGGTGAACTGCCTGATAATT
CAATATGGTTTCAATCCACTTCCATGTGCACGTCTTGTCTAACATATGTT
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ACTTTATGAAGAAAACAATATAAGTAGCAAACAACACAATTATTCAAACT
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CCCATTCAACAGTTCAGATTGTTAAAAATGAAGTAAATACAAGAATAGAA
GCATACAACAGTCCAATACAAGAATAAGAATCATACAAGGGCGGGATGTT
TGTTCGGCATGGGGGAGTATTTGTTTTACAGGGAACTAAACGTCTTAAGT
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CCAAACTGGTGCATTTTCATATTAGTGGAGATGAAGTTCTGATTCTGACG
TGCCACAGGAATTTTGCATGAAAATTGTGAAGGCATTATCTTTTATTTGT
GTTTCGTTGTTACTGATCTATTCATGATAATCTTAGTTACCATTCATTTT
TTTATTTTCAGTTATGCAAAGAAGCTGGATTTGGTACAAGCCTTTTTGGG
AGATTGGTAGAGCTCAAATTCGAAAAACATCTGCTGAATATACAGTATCG
CATGAATCCTTCGATCAGCTTGTTTCCAAATGCTCAGTTTTATGAGAGGA
AGATCTTAGATGGCTCAAATGTGCTGTCTCCTAGCTATAATAAGGATTAC
ACATGCCTCCCATTTGGCAGCTACACTTTTATAAATGTCACGGATGGAAG
GGAAGAAAAAGAGGGCGCAGGAAACAGTCGGAGAAACATGGTTGAAGTTG
CTGTTGTTCTTCATCTGATCCAAACTATCTTTAGATGTATGTCTAAGCTG
AACCCTATCCTTTCTTGCAACCTTAGTACCCTGCCTTGATATCCTTGGTA
TTTATCAATTTGTTTCTATATGAAGCTACTTGGCTGATATAACATGGCAT
CTTTAGAAGCTTATAGGGTCTTGTTTTAGATGTTGTAACCTCCACTGATA
GGAAGGTATTTATCAATTTGTTTCTATATGAAGCTACTTGGCTGATATAA
CATGGCATCTTTAGAAGCTTATAGGGTCTTGTTTTAGATGTTGTAACCTC
CACTGATAGGAAGGTATATGAAGCTAATTGGGTGATATAACATGACATCT
TTAGAACCTTATTGGGTCTAAATTTCTTGTTTTGCGTGTTGCATAACCTT
CACTGATGGAGAAGTGTTCTCTGCAATAGTTTATGTCCAACAATACACCT
TCTTACTTGTATCTTGTGATGTGTTACCTCCATCAATCTGGGTTTATGAA
AATTCAATTGTCTGCCAGCTAGCCCTTTGTCATCTACTCTCCTGTTTAGC
AGATAACATTACATTCTTTATTTAGGAAACTGAGAACATTTAATTAGATG
CAAGAAAGACAACAGATCTTGCTCTATTAGAGTTGTTCATCACTACGTGG
AACCCATTTACTGTAGTTTTTTTCTTCGGAATAGATAAGTAATACTATGT
CAATTGCAAGCTGGTACAGAATCAACTTCGCTTTACTAGTTTTTTTCTCT
CGCTAGCCTTGTGCAAAAGTTGACCCCAAAAGATCAGTAAATTACCAGTT
TAGTGTATTCTGCAGGTTGGAGAAGTACAGGCCAAAGGCTCAGCGTGGGT
GTGGTCTCTCCATATAGTTCTCAAGTTGATACAATTAAAGGTAGACTTGG
CAAAAAATATGACACATGTGATGGCTTTCATGTGCGCGTCAAGAGCATTG
ATGGTTTCCAAGGAGAAGAGGATGATATAATAATACTATCAACGGTTAGA
TCCAACGGCAGAGGAAATGTTGGATTTCTTGATGATGACCAAAGAACAAA
TGTTGCTCTTACCAGAGCAAAGTGAGCATCGATTTTTTTTTCTGCGGGCC
TTTGTTTTATTACTGTTCAAAGCATGCCAGACTGATAATATAAATCATCT
GATGGATGCTTTATTTGATGCAGACACTGTCTTTGGATTGTTGGGAATTC
TCATACTCTGTACAAAAGTCAGACTGTCTGGACAGACCTTGTTGCTGATG
CTCAAAGACGTAAATGTGTTTTCAATGCAACGGATGATGCGACCATATGT
AAGTTGGTTTTGCAAGTAAAGCAAGAGCTTGATCAACTTGACGATCTTCT
TAATGCTGATTCAGCGGTTTTCAGCAATACCAGGTGGAAGGTAAGTAACA
TAGTGATGTTAAATCAGCCGGACTTTGACCATACTTTCATGTGCTCCCTC
CAATTATGCCTTTCTTCTCCTCCTGTTCTTTTTGCTAGTACTCCCTCCAT
CTCAAAATAGATGTCGCAGATTTGTCAAAATTTGGATGAATCTAGACACT
ATTTAGTATATAGATACATCCATATTTTGATAAATTTCCGACATCTATTT
TGAGACGGAGGGAGTAGTTTAGTTTTGTAGCAATTTCCCCCGTTGGTTGG
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TTGGTTCGGTTATGTGCATTTAGTCTACTGGAATGCACCCTTTGTGCACA
CACTTGTGGGATGAGGGACTCATGTTTATTGTCAGGGAATACTTAGTTAT
TATTGAATATACAATTCCTTTAGCATGTGATTTTTTTCGTCTTTATAAAG
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TACCTGGTGTTATTTTGCACATGCTATGTCAATATATGGTTCTTTTTATA
GCATACAAACCATCTCGTGAATCTCCTAACCTTTAATAAAACATACCTGT
TCTTGTTACTCTTTTGAATTCTTTCTTTCTCAGGCTCTATTTTCTGTGTT
GGTAAATTCAACAGGTCATTGTGAGTGACGAGTTTAGGAAGTCCTTCACC
AAACTAAAATCATCACAGCTCAGGAGGGAAATACTCCAAAAGCTTATCAA
ACTTGGTGGTGGTTGGAGGACAACAGTTAGGAACTTAGATATACCTGGGG
TTTCCAATCTTGCAAAAGTATACAAGATTAGGGACCTTCATCTAATTTGG
AGTACTGACGTGGAGAAAAGTGAAAGCAGGTATTTCCAGATGATAAGAAT
TTGGGACCTACTGTCACAACAGCATGTTGAAAGAACTGTCCACCATCTCG
GGTACCTTTTTTCCATGTACACAGATGATTACCTGGATCACTGCAGAAGA
GTGCAGACACTCGGGTATGTGTTGTTCATTGTTACTGGTTATTCACAGGT
TCCTTGGATCCTTTCACCTTTGATGCTTGAAAATGAACTGTTTGTAAATA
CACATGCTTACTAATGGGCTGCGTGCAGACATTCTTCTTATTTTTGCCTC
CTTTTTTTGTTGCTTAACAGGAAGCTGGAGGTTCCTATGGTCTGGGATGT
CGATCATGAAATTATTCGCTATAAGAAGGATAACAAAGTTGATGCTCAGG
AAGAGCATGATCTCGTGGATACATCATATGCTATGGAAAATTCAAAAGTT
AGTGAAAGTTTCTTGCTGATGAAATTCTACTCATTATCTTCTGGAGTGGC
ACAGCATTTGCTGACAGCTTCTGATGGATCTGAAATTGATATCCCCTTTG
AACTGACTGATGAAGAGAAGGAGATAATCCAGTTCCCCCTCACTAGCTTT
ATACTTGGGAGGTCAGGCACCGGAAAAACCACTGTATTGACAATGAAACT
GATTCAAAAAGAGCAGCAGTCATTGATTGCCTCCCAAGGTCTACATTTGG
ATGAAGATGATTTGTCTGGGTTGGATGACAAAAGTATTATGCCACTGAAT
GATGTAAAAGAAAGTTTTATGAAACAAGTATTTATCACTGTAAGCCCAAA
GTTGTGTTCAGCCATAAAGAATCACATTTCTGGCCTTAAAAGGTAGAGCC
CCTTTAGAAGTTTAAACATGTTTAGAATTTTCGAAATTATTTTTTACATA
TATTTAAAATGGACAGTAATATGTGTGCAAGCTGGTTAAATTTTTTTTTC
CACTGTACTCACTCCATTCTACTGTATTTAAACTTCTTTTTGTTTGCGAG
GGTACTTTACGTTTAACTTCAAACTTTTCAGATTCCTTTGACATGTCCTT
TCAAATGGTTAATGGTTTTATCCATGTGAAGAACTTTTTTCTCCCTAATA
TACTTTATTATTGCAAATAACATTATCTAATGAGGACTAGCCCTTGTGGC
TTTGTAATGAAGCATACACTTTGTAGACGAGTCCTTAAACGTGGGTGGGC
TTGCTCTCTCGTGACTAGCTCCAAGCGAGTTTTATTTTTTGAAATTTACA
CTCTTGGAATGATATTTACTTTTGTTATTTAATGGGTTATATCGACCATG
TTCATCATATTACTTATAAGTTATTTCAACCCTTTGTAGGTTCGGCTCTG
GCGATGTCTCTGATCAGCCTAGCATTCTTCATATGCACGACATCATTGAT
GACCAAGATGAATTTACAGAAATACCTGACACTTTTAGTAATCTACCTCA
TGAGCACTATCCTCTTACTATAACATATCGGAAGTTCTTGATGATGCTTG
ATGGAACATGTCGGACATCATTTTTTGATGTGTTCTATGGTGAACTGAAC
TCTAGCACCGGGAGAGGGCATTCAAAATCTCGTGCACTGCAAACATTTAT
TGAATCAAAGGAAGTCACCTATGAGAAATTTGCTGCTTCCTATTGGCCTC
GGTTTAATGCAGACCTGACCAAGAATGTTGATGCATCCATTGTCTTCACT
GAAATAATTTCTCATATAAAGGGTAGATATCAAGCAAGCAGGCCTCATAC
CAGCAAGCTTGGAAGACAGGATTATGTGATGCTCTCAGAGAAAAGATTTT
CATCTCTGAACAGTGAGAAGAGAGATAAGATTTACAGTATTTTCGTTGCT
TATGAGAGTATGAAATCAACTGCCAGAGAGTTTGATTTGTCAGATTTGGT
CAATAGTCTTCACACCAGTCTTGTATCTGAGGGCTACAATGGAGATCTGG
TGGATTTTGTGTACATAGATGAGGTGCAGGATCTAACAATGACACAAATA
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ATATCCGTTCACTTTTCTATACTGCATTTCTCTCAGAAACTGAAGTTCCT
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TGAGCCTTTTGTACTTCTTTTACCCGTCAAGTGTTGACAAGCTTAATCCA
GAGACTGGACTTGTATACGGAGAAGCTCCCGTGCTGCTGGAGTCTGGTAA
CGATGAAAATGCAATCATGACTATATTTGGAGAAATCAAAAGTAAAAAGG
GTAACATGCATGGTTTTGGTGCTGAGCAAGTCATATTAGTTCGTGATGAT
GCTACCAAAAAACAAATTGTTGATCTTGTTGGTAAACAGGCTCTCATTTT
GACTATTGTTGAATGTAAGGGCCTCGAGTTCCAGGTACGAGCATATAAAT
TCACTTCATTTGCGTTCATTTGCAAAAATGGTCGTGTTTTAGGATTCTGA
GTATTCTTGCTTACTTTAAAGACATTGTGTAGGATGTACTGTTGTACAAC
TTTTTCGGCTCATCGCCTTTAAGAAACAAATGGAGAGTTCTTTACGGCTA
CATGGAAGATAAACAAATTATAGGACAATCTGAGGAGTTCTCTCATCCGG
GTTTCGACAGAAGCAAGCATCATCTTCTCTGCTCAGAGCTGAAGCAACTA
TATGTTGCAATCACACGCACTAGGCAAAGGTTGTGGATATGTGAAAATAC
TGATGATTACTGTCGACCAATGTTTGACTATTGGAAGAAGTTGTGTCTTG
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ATTTGGAGTCGGTATGTTTTTGGACCTTCTATTTTCATGAAAATTTTGTG
CCTTTTTTGTCTAAAAATTGGTCTACGCACATAAGTTCTTTTTAGATGGG
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GGCAAGAGCTGCTGGACTTGTAGCAACTGCTGAACGTGCTATGGCCACAA
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CTTCAAAAGAGCAGGTCTGTCGACTCTCCATAATTCTGAGATTTATCAAT
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GATGTTAAATTTGTTAAACATCTATGAAGAGTTACCGTATACTCCACGCA
GCTCTGTCTGACTAAACATTGTTTTCCCTGCATTGTCATAGGTATGGTCT
ATATGCAAAAATGTGGTGCTTCCAGGCTTGAGGATGCCGGTGACTGTTTT
GCCAGGGCTGAGTGCTGGTCAGAGGCAGCTGAAGTGTACTTCAGAGCTGA
ACGTTACACCGAGTGTTTCTCGATGTGCTCGAAAGAAAAGCAACTATTCA
ATCTTGGCTTGCAGTTCCTGCAACAGTTGGAGGAGGACCATTTGCTTGAG
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TGCTCAGCATTATTTTGAGCGGGGTGACATAAAGCATATGATGCCTTTTG
TTAAGGCTTTTAGTTCTATGGATCATGTACGAGCATTCTTAAACTCTAGG
AATCTTGTTGATGAACTGTTAAGTTTAGAGATGGAAAAGGGCAATTTCCT
TGAAGCTGCAGGAATAGCAAAGCATAAAGGAGATGTCTTACTGGAGGTAG
AAATGCTCGAGAAGGCAGGTTCATTTGAGGATGCAACGCAGCTTCTCCTC
CTCCATATCGTTGTAGATTCCTTGTGGTCTTCAAATAGTAGAGGCTGGCC
TCTGAAAAAATATTCAGAGAAGGAACGGTTGCTTGCAAAAGCCAAAGAAA
TGGCGACAAATGTTTCTGAGTGCTTCTGCTTCTTTGCTAGCCTGGAAGCT
GATGCACTGTCAGATGTGCCCAAGTCCCTTCCCAGATTAAACTGTGTATT
GTTTGACGGCAGAAAATGTGGAAACCTGTTCGTTGAATTTGTTGCTTCCC
GTTTGATTCTTGATGTTCATCTTCAGTGTCGAGCCTCTGAATACAGTTTG
GAATCACGGCCAGGATTTGAAGATGGAAGTAGCTGTAATGATATGGTGGC
TTGTAACCAGATATCACCTCATTCTCTTGCATATGCCTGGAATCACTGGA
AATCAATCATAGTCAACGTACTGTCTCATCTTCGACACACTGATGCTCCA
GAACTGAACGATTATGAAGTTATGTATGAAGATCTTTGTGCTAAGTACTT
TGGGTTGAGGAAGGATGGTGAAGATGATGGATATGTTGTGCTTAACATGA
ACTCAAGTTGGCTCTCTAACGCAGGCAGAAATTCTTTGCAGCAAGATGGC
AACAAATGTTGTCTGGATGTCAAACACTTCCGTTTGTGTGCTCAGTCTTT
CTTGATGAATGAGCTGTCTTCTGTTGGTCTGAGTGTACTTAAGAAGTTGG
AGTCCATTGTTCAAATTCCTCCAAAGTCGGCATCTTCATATACCCTCGTG
AGAACTATCCTCATTATAAATGAGATAGCCAAGTTCTTGGAAGAACCAGA
ATTCAGCCTGCAGAAAAGTACCATGAAGTTAAGAAGCTTCTGTGTGGGTC
GCTTCTTTGATCTAGCTTTTCTTCTCTGGAGAGATGGAACAACGAGGAGC
CTCTTGCCTGCTATACTTGACTCACCAGCTGCATATGGTCTGCTTGCTGA
TTCCCTTAGTGCAAATCATCGCCCAAAATATAAAAATTTGACGTATGGGC
ATCTTGGGAAAACAACCATGCTACTGCTCCATGCAGGGCGATTAGATGAT
GCATTACTTTCAAGGCTACTACAGTTCCTGGACAATGATTCTGGGTGGAC
AGATTTTTTTAGATCTTTGAATAGATTTCTTGACAGTGGTCTTGATAGAT
CCTCCTTGATCCTGAACTTTAAGGTTGCTCTGGACTTTACCTTCTACGGT
GTGAGGTGGAGGGACGAACTGGACTACATATCCCCAATGTGCTATGTGGG
TCTTATGGAGTGCCTTGGTTTCTTGGGTTCGTCATACCTTCTACAGAAAG
GTCGTATATACTGCACGGAGTCTCTGTTGGTCAATATGCTGGAGTGCCGT
ACCAGCAAGCTTTACCTTGACACCTGTTTGGTATCTAACTCAAGCTCTGA
CTCCGATCTTGATGATATGGCATTCCTATCTGGGCGTTTCATATTTCAGA
CAATTATGAATATCTTGACAGACAAGAATATGCTGTGGGAGTGGGCACGG
AAGACTTCAACTCCTAGTAGTTCACCCAGTGCAGTCCTCCTGAGACTAGT
GGTCACACTTTATTCACTGATCCTAACTCATGATTTGGGGTGTTGCTATG
AGGTCACAAGTACTCTTCTGAAGTGTGGAGTCTTTAAGGATCTACCTAAG
GAGTTCTCTCAGAAGATTGTACCTACTTTGCAATTGAGGTATCACACGCT
GAACAACTTCATAAAGGCGCTTGCTGATGCACTTGCCGCAATTGGAGATC
CTATGGTAATTATGGGTTCTTCACAGAAAGGCCCGGCAATCTGTCGAAGC
ATAGTTCATATGATTAGCACAGAGGATTTGTGTGATGTTCCAAAGGTAAT
GGCTCTTCTTTGTCCTGAAGAGCCAAGTCCTGTAAAGCAGAAGACTCCAC
TGCCAGAAAAATCTGATGGTAACAAAGTCGGCAATGTTACTGGAGACATT
GCTAAGGTGGTTCAAGATAATAAGATGGAGAGTACAAGTGAAATAGATTT
AAGTGATCGGAGTAGATCCTTCTGGGTAAATAAGCTTGAGGCTTTTCACG
CCAGCCACCGAGTCCGGGTGAGTCTCATACATTCTGATGCTTGTTCAGTT
ATCTTCCTGTTTGTCCCAATGCTCTGCCATCACCAAATGGTTCTAAAAGC
TTATCTTTGCAGAAAGATGGAACTGCCATCATTCAGTTGATGAGAGATGC
CGTTTTATGGCTGGAGCAAAGAGGCCCTCCAGAAAAGATTAGTGCGCAAT
TAGCGGAAGAGGTCAGGCACGTCTGCAGTGAGTTGGAAGAACGGTCTGGA
AGGTAAGCTAATGTTAATTTCCAAAGACTCTTGAGTTTTAATGGCTTTAT
AAATCCAGTATTGCAATCTGTTGACAAGTACCAGTTTAATGTTAATTTCC
ATGTGAAAATGATTTGTGATCACAGGTTGGAGAAGGGAGCTTTTCTGACT
GTAGAGGATCTATACTCTGTGTGGCAAGATGGTGAGAGCAAAGTGCAGAC
TATCTTCGACTATCTGTGTTCCGAAATGGCATCCATGGTAGAAGGCGGTG
GCAGAAGGAATAAAGCCACAGCCGCTGTCCAGTCACAGACTGACGGAGCA
GACGATCAGACTGGATGTTCAAACAACGAGCCTGGCGAACCAGTCACGGA
AGAAGCAGACGACGCTGCCACCTCGGCCTCAACAAAGGCGGCGCCCAAGC
AGAAGAACAACAAGAAGAAATCCAAGAAATCTAAGGGCCGCGGCAGGAAG
TGAGGTGCTGTGGCTGTAAGCTGTAGCCCGTGGTCGCCTTCATCGGAGGA
AACTAACTGATAGCGCAGGCTGGTTTTGCTCGTACCTCATGTCGTTGCCT
TAACGCTTCTACCTGATCGTACTCGCAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.