Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE043867

[Submit comment/correction]

Sequence
AE043867
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE043867
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCTATAGTCCAGCGTTGGGATAAACCGGACTATTTTATCATGATGAC
TTACAAACTGTACTGGGAGGAGATAACAGAAAAACTATTGCCTGGTCAGC
TACGACAAGATCGTCCAGACCTTGTGGCAAGAGTTTACAAAGCTAAGCAG
CGTGATATGATAGATTTATTGACCAAGGGGAAACATTTTGGAGAAGTCGT
TGCTTATGTGCATATCACCGAGTTTCAAAAAAGAGGTCTCCCACACGAGC
ATATCCTTCTAATCATGAAATCCGATAGCAAGTTAAAGACCCCAGATGAC
TATGATCGGGTAATATCTGATAAGATACCTGACAAAGAGAAGTATCCTAT
CCTACATGATCTGGTCGTCAAACACATGTGGCACGAACCTTGTGGTGAGT
TGAAAAAAATTGTCCTTGCATGGTTGATGGGCAGTGTCGTTTCCACTATC
CTCGATAGTTTTACAGCCACACATAGCAGGGGAAGGATTCATATCCTATC
TACAGAAGGAGGGTTGATGGGTGTGTAGTTAAGATTAGAGGAGCAAAACT
GGACAATAGATGGGTGGTCCCTTATAACCCATTTCTTCTCATGCGATACA
ACTGTCACATTAATGTGGAAGCTTGCTCGAGCATCAAGGTGGTCAAGTAT
TTGTTCAACTACATCTACAAAGGTCATGATAAAACATCATTTGCATTCGA
GAAAGATGTCATCAATTGTTGGAGATATGCCCAAGAGGCAATAATAAAGT
GGTTATTATTATATCTTTATGTTTATGATAAATGTTTACATCCCATGCTA
TAATTGTATTAACCGGAAACATTAATACTTGTGTGTTTTGTAAACATAAA
AGAGTCCCTAGTAAGCCTCTTGTTAAACTAGCTTGTTGATTAATGGTTGA
TCATGGTTTCCTGATCATGGACATTGGATGTCGTTAATAACAAGATCATA
TCATTAGGAGAATGATGTGATGGACACACACACCCATAGTAAGCGTAGCA
TAAGATCAAGTCATTAAGTTCGTATTGCTGTAAGCTTTCAAATACATAGT
AACCTAATCCTTCGACCATGAGGTTATGTTAATCACCATCACCGGATGGA
TACTTTGATGACATCAAACACCGCTTCGTAACTAGGTGGTCATAAAGGTG
TCATTGGGTATTCTGAAAGTATGTGTTGAAGCGCATGGACCAAGATTGGG
ATTTGTCCATCCATATGACAGATAGATATGCTCTGGGCCCTCTCGGTGGA
ATGTCATCTAGTTAGCTTGCAAGCATGTGACTGGGTCACAAGGGATGACA
TATCACGGAACGAGTAAAGATTACTTATCAGTAACGAGGTAGAACTAGGT
ATGGAGATGCTGACGATCAAACCTCGGATAAGTATAGTATCGCGTGACAA
AAGGAATTGGTTTCGTATGTAAATGGTTCAATCGATCACGAAGTCATCGT
TGAGTATGTGGGAGCCATTATGGATCTCCAGGTCCCGCTGATGGTTATTG
ATAGGAGATGTGTCTCTATCATGTCTACATATTCACGAACCGTAGGGTGA
CACACTTAAGGTTCGAAGTTGTTTTAAGTAGATATGGAATGTGCGTTGGA
GACCGAATGTTGTTCGGAGTCTCGGATTGGATTCGGGACATCACGAGGAG
ATCCGGAATGGTCCGGAGAATAAGATTCATATATAGGGGATCATTTTCTA
AGTTAGGAAATATTCCGGAGTGTTTGTATGAGGATTCTAGAAGGTTTCGG
AATGTTCCGGAAGGTTCTAGAAGATATCTTGGAGTTTGCTTGAAAATCAA
GATAGGGATCATGGAGTCTTGGTGGGTCAAGACACGGATTCGTGGGGGAG
GAGGACTCCTCCCCCCTCCCCAAATTCGTTGGCCATAGAGGAGGGGAGTC
CTACAAGGACTCCCCCTCCCCAGGCGCGCCTCCTCCCCTTAAATAGAAGG
GCAGGGGCGCCCCCTACAACCCTGCTCTTATAACACCCAATCTCTGCCGC
CTCTGTCCTCCACCATCTTCTGCATAGGCATAGGCGAAGCCCTGCAGAAT
TCTCTACTCCACCACCACCACCACGCCGTCGTGCTGCTGGGATTCCGTGG
AGAAGATCTACTACCTCCGCTGCTCGCTGGAACGGGGAGAGGAAGGTCTG
CTTCGACTCCGCACGTTTGACCGTCTGCGGAAGTGCTGCCGAATCGTGGC
GCCGGAAGGATCGTCTACTTGACCAAGGGCGGAAGCGCTGCTGGAATGCA
ACGCCGGAAGGATCGTCTACTTGACCGAGGGCGGAAGCGCTGCTGGAACG
CACGCCGGAAGGATCGTCCACACGATCTTGAGATCGGCAAGTGATCGAGT
ACATCAACCACGAGATCTAATCTCGTTAACGCTTTCGGATCTACGAGGGT
TAGTTCCCATCTATCTCGTTGCTCATGTCTAATAGATTAGATCTTGGCTT
TTATCAGATTAGATCTAAGTTTTGTTCGTTCTTGCGGTAGAAATTTTTTG
TTTTCCATGCTACGAACCCATCAGTGGTATCAGAGCCGTATCTATGCGTA
GATCTGTTGCACGAGTAGAACACAATGTTTTTGTGGGCGTTGATGCTTTT
GTTGTCGGTGTCTTAGCATGTACTTTGCATCTTGCGGCATGGTAGGATGA
AGCGGCTCGGGCTAACATTACATGTCATCGTACATGAGACTTGCTCCACG
CTTGGCGTGCAACTTGCTTTGCACAAGTGGCTTTGCGGGTGTCTGTCTCT
CCCACCATAGTTAAGATTCAATTTACAATGAGCATCTTGACAACACTTGT
ATCAACGTTGTGGTCCTTGTTCATAGGTAAGATCGGTCTTATGAAAGCCC
CAACCCACGTAAAACATGCAAAGAAAATTAGAGGCGTCTAACTTGTTTTT
GCAGGGGTTTTGTGATGTGATATGGCCATCATGTGATTATGATTATATTT
GATGTATGCAATGATCCTTGTTGTAATATGGCAACCGGCAGGAGCCTAAT
GGTTGTCTTTTAATTCTGTTAAGACCTGCGTGTCTATTCATCTTGTAATA
GCTTTATTCCAAGTAGTTGTAATAGTTGCTAGTGATGATGGACAATCATG
AAGCGGCGCCACGGACCTTGACGCCACGCCGGTGATGATGGAAATCTTGT
CCATGCTTTGGAGATGGAGATCAAAGGCACAAGAAGAAAGGCCATATCAT
ATCACATATTATGAATTGCCTGTGATGTTAATCCTTTATGCATCTTGTAT
TGCTTAGATCGCGACGGTAGCATTATAAGATGATCCCTCTCACTAAATAT
CAAGTAATAAAGTGTTCGTCCTTAGTTGGCACCGTTGCTAAGACTCGTCG
TTTCGAAGCATCTCGTGATGATCGGGTGTGATAGACTCTACGTGTGCATA
CAACGGGTGCAAGCCAGATTTGCACATGCAGAAACTAAGGTTAACCTTGA
CGAGCCTAGCATGTACAGACATGGTCTCGGAACACAGAATACCGAAAGGT
AAAACATGAGTCATATGGATGATATGATGAACATGTTGATTGTTCGCCTT
TAAAGCTACATCATCTCACGTGATGATCGGACTTGGTGTAGTGGATTTGG
TTCATGTAATCACTAAAACAACTTGAGGGATGTTGTTTTGAGTGGGAGTT
CATTTGTAATTTGGATTAGTCGAACTCAATTTATCATAAACACAATCAAA
GTGAATTTGCATAGTTTGTTGTAGTCATTGGCATCCGTTCACCACCTTAC
GCTTAGTTATAGTTGAGATAGTGGAACTATAGAAATTCTGGATATTTACT
TTACGAACTGGTATCATATTGTTTTTGAGTGTCAATCTAAAGTTTATAAG
TCCTATTGCAAACTTTCAGCAAACTCAATTTACTCCATGAAGTTTAATAA
ATAGTATTAAATCAAGAGTAACAATTCCAGTGTTAGTATCTAATGTATCA
TGTTAGCCTCCATGATTCTTGATACTCAAAAGATTGTTTTTAATATCAAG
TTTATCTAAGAGCTGAAAGCAATGTTTCAGAAACCATCATATGTGAAAGG
TATTGCGATATCTAAAAACAATGTGTTGGTTACGACATGATAGAGTATAC
GTCCTCATATTTGATGAGAATTTGTGAAGGTTGGAGACGCTAGTCGTCCT
AATCCTCCAGAAGGTTTTGAAAAAAGGAAACATTATACTCGCAATTCACC
TTTATAAGCTATAGCAGCTTGATCATGAAAGTTGTCATGATAAGGATGAA
TAGAAGATGTAAGTAAAATGTTTACTACACTAAAAGATTACTAAAGAATG
GATTTTTGAAAGAACACCAAACATTTGATGATGGTGATCCACCTCAAAGT
GCAAGTCCAAAGGTATTAGTAGTTAACTATATACGCTTTGTACCATGTGT
CATGTTGATGACACCAATGTTGATGTTGATAAATTCTTTTAAAAGAAAAG
GAATTGCTGAAAGAGAATCTATAAAATATTTGGCAGAAAATAAAAGGTTG
GAAATGTCCAACTTAGGCATATAGAAGATATACATGTTATGGTTGTATTC
CTTGCTTGTTAAACAATGTGGTTCTCCGGTATTGGATACCGAATTGGTTG
GTATGAAGTGTCATACAGGACAACACAATTCATGAACTGCAATGGCCTAA
GTAACTAGTAAGAGAATATGTGATGATGTTCATCGAAAACAAACAAAGGG
TTGTTGTGTTGCTCGTTAACATCAAAGGTTGCCTTCAAGATTTGTTTTAA
TAATTGTTATTTTGATCAGGTATTATGACGACAAAAGGTTGTTCAAATAA
TTACCGTATTCCATAATAGATGGATGATATACAAGTCTGGTTGGAGAAAT
AATGACCATAAAACTAATGCTAAAATGTCACAAGACAAAAGATTGAAAGA
TCACTTGCGAAGTGACATCGCCGTTTAAATTATATTGGAAAGAAAACATG
AAGAAACTCCATGTTGATTTTGATCAAATGACGCTTGTGAAACTTTCTAC
AGATAATTAAAACTTCGTTCATAGGCCAAAAGGAACGAATGACTGGCTTA
TTGGAACTTGTACATATAGATGTATGAAGCCCATTATGTAGTCAAGAGCG
ATGGATTTCAACTTCATATGCTTTCTCCGAGAATTTGAGTGAATATATGT
GTATTTACTTAATAAGGAGGAAGTATGAAACATTTGAAAATTGTTCAAAG
ACTTTCAAGATGAAGTTGAAAATCATTGTAACAAGAAAATAAAGAGTTTA
TGATTCGATCATAAAGGAAGATATTTGAGTTACATGTTTAGCAAAAACAC
CTAAGACTTGAGGAATTGTTCTGTGATTTGTGTTTCCCGATAAACCATAG
GATTATGGCATATTCGAGAGATAAAATCAAACCATGTTTGAGATGGTAAG
ATCAAGGGTGTCATTTATAAAACTGCCATTATGTTTTTAAAGATTAAAGC
TTTAGTGACTACCGCTTTTACACTGAAAAGAGCTCCATCGTGATCCGTTG
AAATGACACCATATAAGTCATGGTTTGGGATAAAACCCGAATTGTCTTTT
CTTAAAAATTTTGGTATGTTATGCATAAGTAAAATGTTTACAACCAAAGT
CGGATAAGCACGTCTTTGTAGGTTATCCCAAAGAATTTGTTGGGAATTTC
TCCATAACACTGAGGACAAAAGAGTTTGTTACTTGGAACGTCAAGTTTCT
TAAGAAGGAATTTTTCGTGAAAAGTTAAGTGGGAGGGCAATAGAACTTTG
ATAAGGTTGTGGAACCTTAGCTATATGTGCTAAGTAGCGCAGCGCCGGAA
AGTGTCCCGGTGGCGGCCACAAAGCTCATGGCTCTCGTGATTACAAAAGG
TGTGATCTCGGAGATTAGAGTTCCTATAGAACCGTGTGGGTCGGTAAGAA
TCAAATAGTAAGATTTGATAAGCAAGTCGTTATTGTTTTGACAATGATGA
ACCGACTACATGCAAAGAAGCGATGATGGGCCCTGACTCCATAAAATGAC
TAGAAGTCATGGAATCCGTGATAGTATCCATACACGAGAAATCAAGTTTC
TAAACTTAGAAGACCCTCCGGAAAGGCATGAAGCCTATCGGTCGTGTTTG
GATCTATAAAGAAATAGACATGGATGATTCAAATCTATGAAATAGTCGAC
ATGTACGACAATGTTCAAGGGATTGACTATGATAAGATTTGATCTTTCAT
AGCGATATTTAGTCTGGATGGATTAATGTAGCAACCACTACATATATTTT
GGTATATGGTAGTTGAACAAACAAAACAAGTTCTTCTAATAGAATGGTTA
CCTGGGACGTGTACATGACACGATCCATAGGGTTTTGTTGATTCAAAGGA
TGCTAAAAGAGTATGCAAAACTTCAATGGTTGAAGTAAGCATAGCGGAGT
TGGAATCTTCACCATGATGAAACTATTAAAAGAGTTTAAATTCATCGGAG
ATGATGAAGATGCTTGCATTTGCAAGAAATTAAGTGGGAGCGCTCAGACA
TATTTCTAATACATTATGTAGAGGACATATTGTTGATTGAAAATGATGTA
TCTTGTATTGACACAGGTTAAGAATTTCATTTCGATGAAAGACTTAGGCA
TAACCCAAGAATTAGGCATCAATGTCTATATGAATAGATTGAGGCGCTAA
TATGGTTTTGCCAAATGTACATAGATAAGATGTTGAATGATTTCAATATG
GAAACAACAAGAAAGGTTCTTGACGCACGGAAAGGACTGAATCAAGATTC
AAGTGTGTTGACACGAGATTCAAGTGTTTTGACACTTGGTGAAATCGCAA
GAGTATTTTGATCAATCATTCTTTAAGATGTACACATCGAGATATGTCCT
ATGCTCTAAATGTTATGAGCATATACCAGAATGATTCATAAGATGATCAT
TGGACAATAGTAAAGATATTCTTATGAGCTTTGGAAGAACTAAGAATATA
TCATGTATAAGTGACAAATAGTTGAAGGTAGTTCATTGTAAAGTGTTACA
TTGATACTAGTTTTGTCACAGGATACAAATTAAGTTTATCTCAATTTAAA
CTATGGGTGGCACAATGTAATGAAAGGAAGTTCCATAACGGATTTGGTTG
AGTACCAAAGTTAAAACATTGTGACAGACACTATAACAAAAGGCTAATTA
TATAAACTGCTATAGTAGCAGCAATGGAGGGCATTTGTGTTAAGTAGTTT
GTTATCAAACTAGGTGTGGTTCCTAGCGGGCTAATACTATGAAGATATAT
TGTGTGGCAATAACATCAACATATTTTGAGCCGAAGGAACTAAAGGTCTC
ACCAAAGGACCAAATTTATACAATGCCATCTCATTGGAGAATGAGTAATG
CGTAGAGACGCAAGGACATGCAAATACACACGGACCTGGAAGTGTCAGAT
CCGAAGATTATGTTTACCACTAGCAATAGTGTCTTACAACACCAGAAAGC
CATAGGTGTTGAATGCACAAGTTTTTAACTAGATTATTGACTCTAGTGCA
AGTGGGAGACTGTTGGAGATATGCCCAAGAGGCAATAATAAAGTGGTTAT
TATTATATCTTTATGTTTATGATAAATGTTTACATCCCATGCTATAATTG
TATTAACCGGAAACATTAATACTTGTGTATTTTGTAAACATAAAAGAGTC
CCTACTAAGCCTCTTGTTAAACTAGCTTGTTGATTAATGGATGATCATGG
TTTCCTGATCATGGACATTGGATGTCGTTAATAACAAGATCATATCATTA
GGAGAATGATGTGATGGACACACACACCCATAGTAAGTGTAGCATAAGAT
CAAGTCATTAAGTTCGTATTGATGTAAGCTTTCAAATACATAGTAACCTA
ATCCTTCGACCATGAGGTTATGTTAATCACCATCACCGGATGGATACTTT
GATGACATCAAACACCGCTTCGTAACTGGGTGGTCATAAAGGTGTCATTG
GGTATTCTGAAAGTATGTGTTGAAGCGCATGGACCAAGATTGGGATTTGT
CCATCCATATGACGGATAGATATGCTCTGGGCCCTCTAGGTGGAATGTCA
TCTAGTTAGCTTGCAAGCATGTGACTGGGTCACAAGGGATGACATATCAC
GGAACGAGTAAAGAGTACTTATCAGTAACGAGGTAGAACTAGGTATGGAG
ATGCTGAAGATCAAACCTCGGATAAGTATAGTATCGTGTGACAAAAGGAA
TTGGTTTCGTATGTAAATGGTTCAATCGATCACGAAGTCATCGTTGAGTA
TGTGGGAGCCATTATGGATCTCCAGGTCCCGCTGATGGTTATTGATAGGA
GATGTGTCTCTATCATGTCTACATATTCACGAACCGTAGGGTGACACACT
TAAGGTTTGAAGTTGTTTTAAGTACATATGGAATGTGCGTTGGAGACCGA
ATGTTGTTCGGAGTCTCGGATTGGATTCGGGACATCACGAGGAGATCCGA
AATGGTTCGGAGAATAAGATTCATATATAGGGGATCATTTTCTAAGTTAG
GAAATATTCCGGAGTGTTTGTATGAGGATTCTAGAAGGTTTCGGAATGTT
CCGGAAGGTTCTAGAAGATATCTTGGAGTTTGCTTGAAAATCAAGATAGG
GATCAAGGAGTCTTGGTGGGTCAAGACACGGATTCGTGGGGGAGGAGGAC
TCCTCCCCCCTCCCCAAATTCGTTGGCCATAGAGGAGGGGAGTCCTACAA
GGACTCCCCCTCCCCAGGCGCGCCTCCTCCCCTTAAATAGAAGGGCAGGG
GCACCCCCTCCAACCCTGCTCTTATAATACCCAATCTCTGCCGCCTCTCT
CCTCCACCATCTTCTGCACAGGCATAGGCGAAGCCCTGCAGAATTCTCTA
CTCCACCACCACCACCACGCCGTCGTGCTGCTGGGATTCCATGGAGAAGA
TCTACTACCTCCGCTGCTCGCTGGAACGAGGAGAGGAAGGTCTGCTTCGA
CTCCGCACGTGTGACCGTCTGCGGAAGCGCTGCCGAATCGTGGCGCCGGA
AGGATCGTCTACTTGACCAAGGGCGGAAGCGTTGCTGGAACGCAACGCCA
GAAGGATCGTCTACTTGACCGAGGGCGGAAGCGCTGCTGGAACGCGACGC
CGGAAGGATCGTCCACACGATCTTGAGATCGGCAAGTGATCGACTACATC
AACCACGAGATCTAATCTCGTTAACGCTTTCGGATCTACGAGGGTTAGTT
CCCATCTATCTCGTCTCATGTCTAATAGATTAGATCTTGGCTTTTATCTA
GATTAGATCTAAGTTTTGTTCGTTCTTGCGGTAGAAATTTTTTGTTTTCC
ATGCTACGAACCCATCATCAATGACGGGGGAACCATCAATGAAATTAGTC
AATACAGGGATGCATGCTATATTTCTCCTCCAGAGGCTATTTATAGGATT
TTTGGATTCCGCATGTTTGGTGGCAGTCCGTCTATTCTATAGCTACAACT
TCATTTGCCCAACATGCATACTGTTGCGTTTAAAGCCGATGATAATGTAG
AAGATGTTGTCGCTGGTCCATCTTCATCTAAATCCATGCTTACCGAGTAC
TTTGAGATGAACCGGAAGTATTTGGAGGCACGAAAATGGTTGTATAGAGA
GTTTCCAGAACAATATAGGTGGATCGCCAGAGATAAGAAGTGGCAGAAGA
GACAAAATAAGAGATCACAGATTGGATCACTTGAGTATGCACACCCTACT
GAAGGAGAGAGGTACTACTTGCGGGTGCTCCTAAGTCTTGTTCGAGGTGC
TACTTTGTTTGATGACATAAAAACAGTTAATGGCAATCTATGCAGTTCCT
TTAGAGAGGCGTGTGAGCACTTAGGCCTTATTGAACATGACAGGTCCCTT
GATGATTGCATGGCGGAGGCAGCCACATTTCAGATGCCTTGTGCTCTTAG
ACGGTTGTTCGCAACTATACTGGTATTCTGCGAGGCAACAGAAATCCTAC
AGTTGTGGGATAAACATCTAGCATCGATGTCTGAGGATTACCGCCTCAAT
CAATACAATGAGGCGGCACTTGAGCAGATGGTCCTAAGAGATATCAAAGA
TCTTGTACAATTCATGGGGAAGGATATTAAAAGCTATGGACTTCCAGATT
TGGTTGAGACGGATGGTTTTTCTGACACCGAGTACAGAGAGGTAACAGAG
GAGAGACAAGTCACTGTGGACCAACAACATCTAGATCAAATTGATTGTTT
GAACAATGAACAACTGGCTGGTTATAATGAAATAATGGATCATGTGATGA
ACAAAAGGAGCCAGACATTTTTTGTTGATGGTCCAGGAGGCACCGGGAAT
ACATACTTGTACAAGGCATTGCTTGCAAAGGTTCATGACATGGGCCTTAT
AGCAATCGCAACAGCTACATCGGGCATAGCAGCGTCAATTATGCCTGGAG
GCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.