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GrainGenes Sequence Report: AE002372

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Sequence
AE002372
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE002372
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGTGCCGCCTCTTGGACGGCTCCGAGTTCCGACCCTCCTCCCCTGGCGGC
TGGCCCCTCACACCCCGCGCTCCCGAACCAGTCAGGGCGGGGTTCCGCTC
GCCGCCGCCTGTTCTCCCCGCCGGCGGTTCGTCAGCCAGCCCCGCCATCA
TCTCCTTGCACCGCCCAATCCCGTCGCCCCACCCGTCCGCCCGAACAGAG
AGAAACGAGAGGATGGGCAGCTAGGATTCCTCCGCCGCCACCCGTCTCCA
CCTCGTCGGCGAGGAGCTGCTCCCCCGCCCCTCACCGCCTCGTCCGCGGC
AGACGACCACCGCCGCCACTCCCGACCGGGACCCTCTCCGCCGCCCCTCT
TCTCCGCCCGCGACCGGCAGATCGGAGCGGCGCCTCCACGAGCTCGTCCC
CGACCGCCTCCCGAGCTCGTTCCCGTCCAAGCCATTCCCCGACCGCCGCC
CGTCGTCTCGTCCCATACCTCCCCGACCGCCGTCCGCTCGTCCCGTCAGG
TGAGATGCCGTGCTGCTGGCTATTCGTGCGTTCTGCTGCTTGCTGTGCCG
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ATGTTCTACCCTGTGTAAACAAAGAGGCCTGCATTAAGTAAGATTCTCGA
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ATAGATACATTCGAACCTAGACAAAGCCAAGTCACTTATTTTCGGACAGA
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AGGTGGTGTGGTGAGGAGGTGGTAAGCTGTATCAGTTAGGGGATCACTGG
CTTTGGATGAGTTGAGCCTGATCCGATGGTCAGGTTTTGCTCACCGGATA
CATGTCTATATAAGCAGAAAAGAAGGCCTCGTTGCCTATTTTTTTTCTTG
GGAGATTTGAGATGGGACTGTTTCAAACATGGGATTGTTTCTTGTCCAAT
GCGTAACCACAATGGAATCACAGATTGACAGACAGTTCATTGTATCATTT
GCAATATTATGTTCTAACATCTCAATTTGTCACTTGGCAGACAGTTGATC
TTTGGAAGACACTCTTCCTGTTTCCCTGTCGTTTGATGCGGTTTAACGCC
GAGTAATATGCAGACTAGCGGGCCAGCTCAGGTAAGTACTGTCCTATAGC
TTGTAACGTGGTTATTCTCACGAAGGATTTTTGTTATCATGTGCTGTGCA
AGTATGGTAATCCCCTTAAATGTCTTCCAAGCAGCCTCCCAGGCCTCCTA
TGATGGGTTCTACCATTCTGCAACAAAATATGGGACCACCGATGCCCATG
CAGGTGAACTAGAACGTTTGTTGCTTCTTTCTGCAGTCCTCACTTTAGTA
ATCATATGTTAGATTCTTAATGTTGCTATTATGTGCTTCATTTTTCAGTT
TAGGCCAGCGGGCCCGCCACAACAGCCTCCTCAGTTCATGCAACCGTCGG
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GTGCCAGAGCAGATGCCACATTTTCTGCAACCTGGGCAGCCTATGCCTCA
CTCTGGTCATGTACTACCTGCATCACAAGCTGTCCCTATGGCGTATCAGG
CAGCTAGACCTATGTTATCAGCGCCTACGCAACTGCTGCCTCAAGGTGTA
TTCCCTGGTGGACATAGTTCCACCATGGGCACTCCTATGCCGCCTCCTTA
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CTTCTCTCTGTCAATAGTATATGTATATCTCAATGACAAGTTAATTAATG
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TGGACACCAGTCTATGCCAGCTTCATTGCCCCCAGTAAGTACTGCATGTC
ATCTGCTACATTTCCATCCCTTTATCCTTTTCTGCTATATTAAATTTAAG
ACCTCTGTCCTATCGTTCCATTTCACATGCTACATAAAATTGAAATCTTT
GCCTGTGGAACAACTCAGTTATCAAATGTGCAGGTTAGCTCAACTGAACC
AAGCTCTTCGGATTGGCAAGAGCACAGTTCAGGGGATGGAAAGAAGTAAG
TTCATATATCTGTTACTTTCTGTTTTAAATAATAACTTCGTGATATACGT
GCTGATTCTGTAATTGCATCCGTTAGTCTTCTTTTGCTTATTTGCTTTGC
TTGGTATTGTTCTTTATCCAGGTACTATTACAATAAGAGGACAAAGCAAA
AAAGTTGGGAGAAACCTGCCGAGTTGATGACACCTTTGGAGGTTAGTTCC
GCTGTATGCTTATGCACGTCATATATATTTTCTTTGTTCCCCTGATGTTG
TATTTGTTCTGATAAAGTTTTAACTGTTATTCCAGTGTGCTATTTCAACA
TATCATTGTTCATTTTATCAAAATATTTACGGCCATGATTATCATTTGGT
ATTTAGCAGGTATAACTCAAACTTTGCTTGTATAGATTGATTATTTATCT
CCGTCAGTAACATGTAGGGATGTAAATGGCGCCTAAACGGCATCCGCAAG
TCCCGTTTATTCAACTGGTTAGTTCTTTTTTTTGGGAAAAGCAAACTTTA
TTGAACTAGAGTACTAATAAACGGTATTACGCGGGATTAAGTGGTGCGCT
GCTTACATCCCTAGTAACATGTGCAGCTTTTGCATTGCGGGCCAGCGTAT
TTTGAATTCTTTTTCATTTTTTAAATGACTAGTATCTAAATTTCAAAAAT
TTAGAATACAATGGAACAATAGTTGTACGAGTCTGCTTTATTTCGTCAGT
AGTACCGCACCCTAACTTATTTAATATGATATAAGTGCAACATGTTTTCT
TCCTGTATTGCTGTCGTATCATGTATTTTTTGCAATTATTGTTGAGTAGA
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CGAGGGCAATGCATATGGTAACTGAAGAAACATGTTAGTGTCTTGCCAGA
CCACTGCCTTTCATTGCTTTATTCTTTTTTGGTGAATATTAAATGGCCAT
TTATAGTTTTCATTCTAAGTTTTTGTAATGGTACAGCGGGCTGATGCCTC
AACTGAATGGAAAGAATTTACTACAGCAGAAGGACGAAAGTAAGTTCATA
TTGAAAATACCAGCCACATGTTCTATTATTTGGTCAATGTCATGGATTTT
CTTTATTCGGTAGCTTCACTATTGTGTTGTTCCAGGTACTATTACAACAA
AGTGACAAAGCAATCCAAATGGACTATTCCTGATGAGCTTAAGGTTTTTC
TTTTGACACGACGTCTATAATTATTGTCTAATATAAATTATAATATCTTA
CAATTACTCTCTGCTTTCTGTTCAGATTGCACGTGAAGTAGCAGAAATGA
CATCAAATCAACAGCCTGGCCGTGAGACCGAAACCACTACTGATGCCCCT
GGTGGATCCGCTTCTGTTTCTGCGGAGCCTTCCTCTTTACCTGCCAACCA
GTCTTCATCTTTAGTAGGAATAATTGCTTTAAGCACACAAGATGCGATGA
CAAACGTGCTTCCCGGTGCTTCTCCTGCTGCTGCCCTGTCATACAATGAG
GAATCTTCTTCCTTTGGTTCCATGCAAAATGGTGGAGCAAGTGCTGCTGT
TGTTACCCCAGTTACAACGAGCACGCCAATTTCATCAGTTGCTAGTGATG
TAGGGACAAGCAGGTATTTGCAGGTTTTCTCAATTCCCTCGATATCTTCC
TCACATTATTCAAATGCAGTTCACACATTGTGTTATGTGTTTTAACTTTG
AAGGAACAATTGTCGAAGTTCGTCTCTAACAGGCACTTCCTACACAAAAG
TTGGAGCATTTGCTGACGATTTGGAGGTATGTTTTGGTACCATTTCACAT
GTTCTTTATTTGGCAAAAACAGCTTGTCCCGTTAGCAAGTGTTGATCTAC
TTGCAATTATTTTAGAATAATCTATTTCCTCTATCTTGTGCACGGCCTGC
ATTGTTTCATTTTTTCTCACCCTTCCATTGACTTAAAGTCATAATACTTG
TGCCGTTGCTTAGATTCGTATGTGAATTGTTCTCCTTTAGAACATCGTTA
CCTTTGCTGTTCATGGCTCTTAGTTTTTTGTTTTTCTCTAACTGGGTGTT
TAGACAAGGGGGGAAGCTTTGGGGATTCTTAACCAAGTCCTCCTTATTCA
AACTGACTACAGTAGTTTCTTATTTACCGATTTGTTGAGCTATTTGTGGA
TTGCTACATTCGAGCATGTCTTTTTGCCTGTGAAAAAAATCATTACCATG
ATCCTTAAACATTACTGTGAAGCACTCGCCATATTGATCGATTGATTTAG
AGTCTCTAAAATCAAAGTTTACTGTAATGATGGGGATATGGTTTACACTG
GACGCGTGGATGATATCTAGAGTTACTGGTTCCACTTGCGCATGCTTGGT
TCAGAACATTCTGATAGAAAGTTTGTGAGGATTCAAGGACTGCCGCGGTA
CAAAAATCTCATTTAGCGATCTAATTCATAGAGGGACTAAGAAGTTCTGT
TTCATTTCCTTGTTTTGTTATGGGTCTGTTAAAATCTACTGCTCAATATT
TAGTAGTTTGAACTCTTCTTTCTTAAAGGAAAATTTCCTTGTATAGTCTG
AGGTTCCTACTTGAGTTGAGACTAGTATGTCAACATCATTAGTGGCTGTC
CTACATAAACTGCTAATTTTGCACATCTCGGCATATTTGCATGTCCTGAT
TTGGATTTTTTTCCCAGCAAATGAATAGGACTACATAATGGGTGTAATTG
TATTTTCTGCTTACATTTTCTATGCTGCCCTGTGAGAAGCATATCTCTGT
TTTGGTCGCTGTGCATTAATATTATTTTTCTTACTGCCATCTAGGAGGCC
AAAAAGACAATGCCAACTGCAGGGAAGACCAATGTTACTCCACTGGAGAA
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GAATCGGCACATGTTGAGGCTGATTGGTCATGGGAGCATGTATGCAATTG
AATTTTAGTATTTATATTTAACTACTATTAAATTATTAATTAATCAAATT
CCTGACAGTGATGTAATCTTCCCAGGCCATGAGAGTTATTATCAATGACA
AAAGATATTGTGCTTTGAGAACTCTTGGAGAGAGAAAGCAAGCTTTCAAT
GAGGTTATCATTTATTACTTATCAGAGATAACATTGTTGTTGAATCCTTC
AGTGTAATATTGTCATTCCAATTGTGGTAAATGGCTCACTTAGGGCTACA
CCTGCTGTTCTGCAGTACTTAAACCAGCGTAGAAAGATTGAAGCTGAGGA
GAGGCGTGTCAAGCGGAGGAAAGCACGTGATGATTTTCTCAGAATGCTGG
AAGTAAGATTTCTCTAGTAAGATTTCTCTTCCCTTACTATACTTTTACCA
CATTAACCACTTTCATGCCCATTTCAGGAATCTAAGGACCTTACATCATC
GACAGGATGGAGGTATATTCTCCAACTCCTTTTTGTATATGACAACCATG
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TCTGTTAGTATGGCTTCTTTATGTTTCTGTTGCATACACGTAGCATGCCA
TTTTTTCACTGTGCAGAAAAGCAATAACTATGTTGGAGGGTGATGAAAGG
TTCAATGCTATTGAAAGCACAAGGGAGCGTCAAGATTTATTTGACGACTA
TCTTGTGGAGCTACAAAAGAAGGTTATAACTTACTCATCCACGAGATGGA
GTATATGAGATGAAAACACTAACTTAGAATTGTGGTAGTTGACATACGAT
TTAACCTGGAGATTATTTGAGATGCTGTTCATCTGTTGTGACTCTTCAGA
GTGGAGACTTCTGGTCAAGCCAGTGCTCTCATGCTTTCATGACTGCCTGT
CCTTGCCAGCAGGTTTCTACGGTTTTTAAAGTGCTGGTTGCTCTCCCATG
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TTATCTAGGAGTATTTTTTGACAGCAAACTATTCTGGGAAGCTTTCATGC
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GACACGTAGTGGAATATAGATCTTTTCTTGAATCATGTAACTTCATCAAG
GTTATTTCTTAGACCTTATCATCTAGTGAATTAGTATGTTCAGAGTGTCA
TCATATTTTTTATATGCTCAGGTAAACACCCAATGGAGAAAAGTTCAAGA
GCGGCTAGAGGATGATGAAAGCTGTTTCCGACTTGAGAAGATTGATCGCT
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TTATGGTTTACCAAACCATTATTGTCCATTACAGGAGTATATACTGGATC
TGGAAAAAGAAGAAGAAGAGCAGAGGCGAATACAGAAGGTATTTCATTAT
CCTACTTTATTGCTAGTATCTAATTCCTTACTCACATTACTCTTTAAATG
CAGGAGCAAAAATGGAGACAAGAGCGGAAAAACCGCGATGAGTTCCGCAA
GATGTTGGAACAGCATGTTGCTGATGGCACACTTAATGCAAAAACTCATT
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AAGGAAGTTTTCTTCGTCCATTGACTCTAAAACCGGACAGAATTGGTCCC
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TTGACCCACGTACATCCATGTCTGCCACACCATATTAAATAAAACACCAT
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TGTAGACTTTGGCGATAGTTGAAGGACAAGCTTTGTCTGGTTTTAGAGTT
GGGTTGAAATGTAGATGTTGCCAATATTTATGGGATGAAAAGTACACTTT
TTTCCCAAATCAAATGTTTACCCTGATTCATTAAATTTGTCAATTTGCAG
GTAAATGATTCACATGCTTACCTAGCTGTAGCTTCAAACATGTCTGGTTC
CATGCCAAAAGAGCTCTTTGAAGATGTCATGGAGGAGCTGGATAAACAGG
TCTGATTTCTTAAAAATCTGAGTACTTATCTTTTAATCATTTATCAATGT
ATAAATTTCGTACTATAGTTTATCAGTTTTGGTACTTGGATGAGTAGTCT
GTGTATTGTATCGATGATTGACAAACTTTGAAAAATTCTGCAGTGAACTA
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GTGTCACACCTTTGCGTGTGTCGTGCTCCAGTTTTGTTAAAGACTTCTTA
GCTGTGGTTGGGTTAGTTCTTGGGAAGATTTATTGGGTTTCTGTTAGTTA
AGTTGTATGGTGCGATAGAGAGACCTATTTATGTGATAGTAAAGATTTAT
TGGGTTTCTGTTAGTTAAGTTGTATGGTGCGATAGAGAGCCCCATTCGCT
CTCAGCAGTTGTAAGCTTAGCATTAAATGTCCGATTGGATGTTGGGTCAT
ATTGTTCCAATTCGAGTTGAATATTCTCTGTAAGATCATGCTTGTTGATT
CATTCGATGTTCATGGTTTGAATAAAATCTGCTGGAAAAAAACAGTAGTT
CTATTCATCTTACAAGCCAAGCCTACTCAGATACCTGTCTTCCTTTTTTT
ATCCGTTTGAGCTGATGGTTTGTGACTATTTTTTTGTCAGTATCAAGATG
ACAAGACTTTAGTTAAAGATGAAGTGAAGTCTGGGAAGGTACCTTTGCAT
TTATTTATTTTTCACTCCTAGAAAAATGTGTAGTGCATAAGTGCTTTTTT
ATGATATAGTTTTTATCTAGAAACCCGTCACATGTATCGTTGACTACCTT
TCTATTCCTTCCTAGATTCATATTGAGGCCTCATGTACACTAGAGGAGTT
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CATGACTGATAATGTTGATTCACTTTTTGGTGGATCTGCTACAGCTTATT
TATGAGGACCAAATTGAAAGGCTCAGGGAGAAGGAACTAAAGGAGGCAAA
GAAGCGGCAGCAGCGGTTGGGTGATAATTTTCTGGATCTTCTGTACTCAA
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AACTTGCTTGAAACCCGTATTTGTAACCTTTACCTTTTTATTATAATTAT
AATTTTAGATTTAGACTTCAGTTGTTATGAACACACTGAATTATTGTCAA
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GATCACATTCATCAATATGTTTTGCTTCACTGAGCAACTTTATCCATAGT
TACTCCATTGTTTTAAATGAGATAAATTGAGAAATATTATCGTTTAGAAT
GTTAACCTGTTGACTAATTTATCTTTTTCCTTGAAAAATTGTAGGAAATA
ACAGCTACTTCAACATGGTATGATTCAAAATCACAGTTTGGTGATACCAT
GGAGTACAGGTAATGACAACCCTCTTTACGCATTGCGTTAAGTTGCTAAC
AATGTGCCATTCCGCCTTGTTACAAATACTTTCACCGATCCTCTTTCACG
GTGCAATTCAGCTGATTTGGCAGTTGTGGTATGTGGTAACTGGCTAGTTA
CTTCTGTTTGCACTTATAATTTGTACAGTTTGGCTAGCAAAAAAGAAGCC
GAGTTGGTAGATCTGAAAAAAAATGTTTGTGAAGGTCCTGAGATTTAGAT
TTGTAATCAAGCTGTGTAATTTACATTTTAAATCTTTTTAAGCCAGCTTG
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TGTAAATAAGTTCCAAGTGTCCTGAGGACCTATTCAAAATTGGCGCGTTG
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AGAAAATGCTGGTTTGGGCGTTGGATGTTTACAGAAGTTCCTCTCTGAAA
TTGGAGTTAGCCAATATCTATTTAATATTTGATACTTTTGCCTATTGGGA
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TTTTGCGGACAACTAATGGAAAATGATTTTTATCTACTGTGCATGTTTTC
TGAGCTTCCTCCACCTTGTATTATTCCGCACTCCTCACTCCCACTTGTTT
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CGCAATACTCGTTTCATTGAGAAGTGAAGAGAGTATTTACAAGCCTAGAA
AACCTGGTTACAACATATGCAAAACACAGAATTAATGGACATCCCATGTC
TCAGGCAAGTAAATACCGTAGGCCTAAGGCCCCTGCATGTGCCAAAGGCT
GGATTCAGCTTTGGTTCTGTTCAATGTGTTGGTGCAGCTTGGGCTGTTTC
CAGATCAGCCTACCAGTCCCCTAAAACTTGACCCCTTGTAACGGTGGTGG
ATAGGTGACACGCAACATCAATGCAACTTATGTACTACTCCCTCCGTTCG
GAAATATAAGACATTCTAGCTTTGTGAAACGAATGTATCTAGACATCTTT
TAGTGTATAGGTTCATTCCGAACCTCTATGAACCTATACACTAAAAGATG
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AGGGAGTAGTATTGTTTACACATGAATGCAACTTAACTACCTGTACAGTT
TACCTACATATGCGTTCATGTAAGTTTTCTTCTATGTAGACAAAGAAAGA
AAACGACCATGAAGAGAGAGAAAAGAAGAAAGATGAAGAAAAAGAAAGGA
GGGAGAAAGACCGCAAAGAAAAAGGAAGAGACCGAGAGAAGGAAAGAGAA
AAGGAAAAAGTAAAGGATCGGTTAAAGAGAGATGAAATGGAGATTGATGA
CGATGATGTGGAGATTCATGGCTCACAGGATAAGAAACGGGAGAAGGGTA
AAGAAAAGAAGCATAAAAGACGCCACTATGACACCACAAATGATCTAAGC
TCTGAAAGCGATGAGAAGGATGACTCGAAGAAGTCTCGAAGGCAGAAATC
TAGGAAGGTATAACATTTGTTATCTTTTTGTGCAATCCATGCTTCAGACT
CGGATACATATGGATATATATGATATTGAGATTCTTTGTTATTCATGCAG
CATACCCATGCTTCAGACTCGGATAGTGAGAACTGGCACAGAAGACAGAG
AAGGGATCTAGATATTTTCTGCAAAAACGTTTTAAATGAGGAGCTTGAAG
ACGGCGAGCTTGGAGAAGATGGGGAGATTCATTAGGCTTTGCTTTTACCT
CCAAGACTTACTGTCCCTTGTCATGTTGTCAATTGTTGCTATTTTGATTG
CTTAGTAACAATGCTTCGGAACTTAACAGTGCTACAATTATTGAAACTAG
TGTTGGGCTTCCCCTCCGTTTAAGCGTAACCATGTGTAGTCCTGGGGTTT
TGCGCCATTAGCCAATCTGCCTTCTTTGTTGGCGTGTATGCAGAATCGTA
GTGCACAAGGTATATTTTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.