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GrainGenes Sequence Report: AE025104

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Sequence
AE025104
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE025104
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGGCAAAGCTCCCCTGAGGAAGACGGCGACGACACACCAAAGCAAAGCCC
ACGAGCTCGTGCTCGTGCTCGTGCTCGTGCTCGCCTGCTGCCCACCAAAA
CCCTAACCCCCCGTAACCCAGGTTTCCCCGGTCAGAGCGGAGCTCTCCAG
CAATGTCGTCGTCGTCGAGATCGACGCGCTCCAGCATCTCCCCATTCCGA
TCCCGCCGCTCGCCCGCGGTGGCGCCGGCCGCGGCGCCTCCTCCACCGGC
GAGGACCTCGTCGGGCGGCCGCGGGTCCACCCCGTCCTCCTCCGCGCGGC
CCACCACCCCGTCGTCTTCCTCCGGCGGCCGCCCCACCACTCCCTCCGCC
GCCTTCGCGCGCCCCGCCACCCCTACCTCCGCGCGGCCCACCACGCCTTC
CTCTACCGCCTCCGCGCGGCCAACCACGCCCTCGTCGGTTTCCTCGCGAG
CAGCCGGGAGAGCGCCTTCCGCGGCAGCCGTGGACGCGTCCAATGCCAAG
GAGAACATCATGGTCACCGTTCGCTTCCGCCCCCTCAGGTGCGCTGCTGA
TTTGCTACCGAGGACGTGCGATTTCGTGTTTTATGCTTACATGTGTTTTT
TAGTAATTGTTTGTACTTGTTGGTGTGTAGTCCTAGAGAGATCAACAAGG
GGGACGAGGTGGCTTGGTATGCTGATGGTGACAACATGGTGCGCAATGAG
TACAACCCGAGTATTGCATATGCTTTTGGTGAGTGCTCTTCAGCTCATAG
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TGAGCACATGAAACGGAGGGGATTATCATATCTTCATTTGGAAACGAGGG
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AAGGGATATGCCTGTTTTGTTAGCGATTCTCGAATAAACTGTTGGAACCA
GTTACAGCTCTATAGGATGCATCACCTTGGTCAAGCCTGCTTTATATTAT
GCATGCTCAAGAGCATGATGAGAATGTCTGCTTGTTACTGAAGTAGCAAA
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ACCGCATAGCTAGCCATTTGAGCAAGGCTCCTTTCACAAAACGAAAGCTA
GTGATCATAGCCTCATACTTTACAACTTGTGATACCTGCCAGGTCTGTGT
AGTTTGCTGAAACCTACATTTTCTTTGTTGGCATTTGTTCAATTTTGCAG
ATAAAGTTTTTGGTCCAGCTACTACAACTCGCCGTGTGTATGATATTGCT
GCTCAGCATGTTGTAAGTGGTGCCATGGAAGGAATCAATGGTACTTTTCA
ACTCTCTTATTGTTTGTAATTTATAGAGTAAATCACATTCGACAGCGAAT
GTGAAGTTAGCGAACCTGGAACCTTCTGTTATATGCCTAATATCTTTATT
CTTTAGTGAGACCAATATTCTGTAGGAAGTTTTGGCAACAGACAATCAAA
AATATGTGATGTAGGTCGGATGGATCTGCATTTTTTTTCTTAAATCCTTT
CCGGGGAAGCTTCGCACCATGTTTATACTCCCTTTGTCCCTATTTAGGTG
GCGCACACGCATTGCAATGTCCATCTGTGACCATTGATTTAACTACCAAA
ATATATGTTATGTACTCTAAAACTTATATGATTGAACGCATATTAAAAAA
AATGAGTGGTATAATTTATAACAATTACCTCATGTAAATAGTTAAATTTT
TGGTCAAAGAAAAACACGAAAAATGAGGGCGCCACCTAAATAGGGACGGA
TGGAGTATCTAACTTTGCAGTGCCAACTTTGTTTGATCAGACATATCTCA
TGCCAGTCTTGCATGATTATTTTGTTACAGCAAATAGCACACAGTTGTCC
GAATTTTGGATTTCCACTGCTATCTCTACTCCCTTTGCCCCTGAAAAAAC
CATTCCTCTACCTTTGATTAAGACATATATACTCGCTTAAATCATTGGTA
ATTGCTAGTGTTGCCTTCCGTCTCTTATATGTAGCTGTACTTTTCTCTTC
TGAGATTTACTCAATTCCCTAAAATTGCTTTGTTTCTTTCAGGCACTGTT
TTTGCATATGGTGTCACTAGTAGCGGGAAAACTCATACAATGCATGTAAG
TTTGTGCATGTTGTTATATATCTGCCATATGTTCCCTTAATTTCTCCAAC
ACATCTATCGGTGTGCTTCTATGTACATATTTTTTCAGGAGAGGATATAA
CTGTACTGTTTAGTATATAGCTGTTGTCCTCTTTTCTCTCTTATGTGTAT
TGCTTATCATCATGGTACACTTGAACTACACACACAAGCATGCACAAATT
GTTTTTAGCAACAACAATACTGAACTCTCTTTCACGGTACACTTGGATAA
CCTTTATTTCAGGGGGAGCAAAAATCGCCTGGAATTATCCCATTGGCAGT
GAAGGATGTGTTCAGCATTATTCAAGATGTAATTTCTTTATATGTTTTTT
TTCTATAAACATATAAAGAAATCAGGCTCGCATGACATCATTATTTCTTA
TCTTTACTTCAGACCCCTGGACGAGAGTTTCTTCTGCGGGTGTCATATCT
TGAAATTTACAACGAGGTGACTTATCTTTTCGAGCCATTCATTTGATTGC
TACTGATTTGCAATATGAAGACGAATTGCAGTTATCCATTTGGTATTGGA
ACTTTAGGTACATAAATATGCTATTGCTACCTCATAGGAACAAGTTTGTT
TTTATCATGATACAGTAGACTGTAGACATATAAGACCATAATTGCTATAT
GGTACTCCTGATTATGATACACATGATGCAATAAGGCTTACCTAGAAACA
AGTTTAAAATGGTGACAATGTGACATTGGAGTCAAGTCAACTTTTTCCGA
ACTTATTACTCATGAACGTGTCCATGCTTACTTTGCAGGTTATAAATGAT
TTACTTGATCCGACGGGACAGAATCTTAGAATTCGAGAAGATGCACAGGT
ACCTGGTTATTTGACCATGTCAATTAATCCTGTACAGCATAGCTATCTAT
ACTACATGAAACTTTATTTCTGTTTCTTAATTTATGAACTAATGCATACT
TCTTACTACTGAGTTCTTATTTCACATTGTGTGTTGATCTGTTTTATTCC
TTGTTCTCATTTCTTGCTGACAAGTCTCCTGTCAATAACTGTTGATCTGT
AGACCTTATCAGCTACTAATAATTTCATCACTCTTTCCATTCACTTAGGG
AACTTATGTGGAAGGGCTTAAAGAAGAGGTTGTTTTATCACCTGCACATG
CACTCTCTCTGATAGCATCTGGAGAAGGTATTTTTTTTATGTAGATAACA
TCCTCTCCTTTCCCCATATTATCACTAAATGCATCCAAGGAGTGTTTCCA
TATGTCCACGGGGATTGCTTCATCTCCATGTTTGTCCTTGTGAATTTGTT
GTGCCAAAACTTAAACCTACAGTGTATTTTTTGGTGAAGGTGTGTACCTA
TATGTGTATCTGCGTCTTTATATGCGGCCGTGTATGTGCTTGTGATGCTT
TGGCAATTCATTGATTGTTAGATCTTTGTACACCTTGAATCACATTAACC
TTGCACTAAATTACTTATGACATTGCTTGTTGCAGAGCACAGACATGTTG
GATCCAACAACTTCAATCTTGTCAGTAGCCGGAGCCATACTATCTTCACA
TTGGTACTCTCTCACTCTCTCTCGTCCCTGCCACCTGTCCTCTCTCTTGT
ACAAATGTCTGTTGGCTGGCAGGTGTTTACATCCAACTGCCAAATAATTA
GTGCTTAATGAGTCTGCAAAGTAATGTAAATCGTTCCACGTAGTACTTTA
CTGAATCTAAAACTCTGTTGTTTCTTCGAAGTTGTTTGATGTAGCCAGTT
ACTATAAGTTTCAGCTCAGGTAGAATAATTTAAACTTACACCGTTACATG
CCTGCAGACCATCGAGAGCAGCCCCGCTGGTGAAACTGAAGAGGAAGAAG
TGAGATTGTGCCAATTGGTAATTCCTCTCATCCAGTGTGCTTATAATTTA
TACCATTTCAATCATCTTACTTATTGTCTTTATTTATTTAGCATCCAGCA
ACTTGGTGGAATTTATTTTTTGTACAGGCTCTGACAATTTCCATCCATAT
TGTTTTGTCAGAACTTGATTGATCTCGCTGGGTCTGAGAGTTCCAAGACT
GAAACAACTGGATTACGTCGCAAAGAAGGTTCATACATAAACAAAAGTCT
GCTCACTCTCGGAACTGTACGTTTTCCTGCAACCTGCGCTCCTGAGGATT
TCTCCTTTTGTGATATTATTGACAAATTAATACAGGATTAACTTTGTGAC
CCATTTCATCGATTTATTCCAAATTTGCTAGGATTAACTCGTTGTAGTGC
TAGCAGCACTAATAGAGGCAATGTTTGCATGCATGATTCCTTGGCTATTT
TCTACAACCTTGATCCACATGATGCTTAATCTCAAATATAAAAGACTAGT
AGGAAGGGTACTGGGGAAATGATCACATCTTTCATTTATTTATTTCTTCT
CATGGTAAATTGTCGATGAAATTTTCTCGCAGGTTATTGCTAAACTTACA
GATGGCAAGGCTGCTCATATTCCCTATAGAGACTCAAAGCTCACACGCTT
ACTTCAGTACTCTCTGAGCGGCCATGGACGCATTTCTGTGAGTGTCTCTG
CTCATATTACTTGTGCTTTCTATCTTGTTGAGATCCTTTATCTACTTATG
TACTCCCTCAGTCCAAAAAGAAGTGACTTGGTTTTGTCTAGATTCACATA
CATACGAATCTAGGTAAAACGAAGTCACTTATTTATGGACGGAGGGAGTA
TTATTTTTTGCCTCGGCTTTGGGAAGCTTTCACATTTACGTTTGGGCTCA
TAAGTGTAGGCATCTTATGTTGCTATAATCTCACCCTCATCTTTGTCGCA
GCTTATTTGCACAGTTACCCCTGCTTCCAGCAACACTGAAGAGACACATA
ATACATTAAAATTTGCCCATAGGAGCAAGCATGTCGAATTGAAAGCTTCT
CAAAATAAGGTAATAATCAATCAGTCTGAAATCCACATTCTAAGAATGAT
GCTTGGTACTGATGCTAATTGTCTTTCCAGATAATTGATGAGAAGTCCTT
GATAAAGAAGTATCAAAAGGAGATAACATGCTTGAAAGAAGAGCTGCAGC
AACTGAGACGCGGCATGATGGGAAACGGGTACATTCTTCCGACGGATCAG
GAGGATCTTGTTAACTTAAAACTTCAGGTTTGTTTTGCATGTTTTTCAGC
AACAGAGTACCTAACTTCTGGTCAATTATTATGTTTTCCTTATTAATTTC
GTGGCGAGTCATTCTCCACCTGTAAGAAATACTAAGTCACTGCAAGACTA
ACTTCTCTTCCACCTAAGCTTGCTCATACTCTATAGAGTATTGAGACACT
TTTCTTCTGGATGGCAATATGGCATGCTGGAGATTAAATTCAATCTATTC
CTTCTGTACATGAACTTGTTGGCCTTGCTCCCATCCAAAATGAATAACTT
TTGTAATTTATCTTTGTGTGATAGCTTGAAGCTGGCCAAGTCAAACTCCA
GTCAAGGTTAGAACAGGAAGAGGAAGCAAAAGCAGCATTGATGGGTAGAA
TTCAGAGGTTAACAAAACTGATATTGGTATCAACCAAAAGTTCAATATCC
TCAAATGTTTCAGGAAAGGCTAACCTCCGCCGACGACATTCATTTGGGGA
AGATGAGGTTTTTAAGCTCAAGCTCTCTTCTTCTTTGTTCAGTTGCAACA
TCTTAGTCTATTAATTCAACTCAGAATAAATTTTGAAGAGCCTTAAAACA
AAAGCTGGCATAGAAATTGAGAGTAATAGTGTAAGCGTGAAAGAGCAGGA
TTGGTGCTTTTTCTGTTCTTTTGTTTTTTTGGATCGAATTTGAGGATGTC
ACTCTATCTCACTTTTTTCTGACGTTGCAATTAAATTTCTACCCAGTTAC
AGCTTTGTTCACACTAATATGTAAAATGTGAGGTTAATTTGTGATGTTGC
ATGGTTACTACCTAATGCGCAGCTTTATTGTGCTATACTATGTTTCAGAA
TATTTTGGGGGTGCCTCAGATTACGAGTTCTCTAGAGTTCTCCACCAGCT
GGATGATGGTTTAGCAACCTGGATTAATTTGATTATGAAACGAAAAAAAA
ACATATTGTTCATCTCGAAATTTAGCCTATCATAACAAATTCTTATTTTG
TTGCAGCTTCTAGGTTTCAGTTCTGATAGGATGTGCAAACTTTTTGGCTG
TGCCTGGTTCTTGTGAAATCTTTACACATTTTTATGTTTTTATGTAGTAA
GCTATCTGTCAATATATTTCTGTAGGGCTCTCAACTACTGTTTCCTCAAT
AGAGAAAAATAGTAGTAATGAAAAAGCACCAACGCACTGTGACCTTGATG
AGTATTCGTTTGTATGGATGTGGGGCACGCCCTACTAATCCCATTTTGTA
TGAGAGCGTAGTTCATGGACCCTGGCCATGTGCAACGAAAACATACTCTT
TTGGACCGTACATTAACTAAATGATTGAGAGCTATGTATCTGAAATGCTC
AACTATGCTCATGTAACAAATCGAATGGAACAAAAAAAAGTTGCTCTACA
CTATGATTTTCAACTGCATATTATGGCTGTATTGGCGTTTTCATAGAAGG
AAACACTTCATTTTCGTAAAGAAGGCACTATTTCTCCTGATGATTTACCC
TGATCCTCACTGGACAGCACCTACTTTCTTGGAGAGTGCCTATTGTTCTT
ATTCGGTTTCATTTTGCAGCTTGCTTATTTACCCGATCGTAAGCGGGAGT
ACTGCACAGAGGACGATGATGTTAGCCTAGATTCAGAGTTTTCAATTGAA
GCAAAACTTGATTCTATTAATTCTGATGAGTCTGCTAGGTTTCATAGAAG
GAACCGCAAACGTGGAATGCTTGGTTGGTTCAAACTTAAGGTGATTTTCT
TGCTATGTATTACATAGTTTATCTCTCAACTTCTGTGTTAAGTTTGTATT
GCCATCAGCTATCTTCTGTTCTCTCCTGACAAAGGATTGTGTGCTTACAG
TAGGCAATATAGCTTTCCTGGTCGTTAAAAAAGGATGATTCTAGAAATAA
GCTAGGTGGCTTTATTGTAGTCTTGTTATTCATTTTATTCTAACTGTGTC
CGTTTCTTATGTGCTTCCCTGCACTTGCATTTGCTTATGTTTTAAATACC
TCTCCCACGATGGAAAAACAGTACACCTAGGAATTACTTGCTTGCAGGCT
TCCATACACTGAAAAATGTGAACGGCCGTGTTCTGTGGTAGAGAAGCACT
CAGTTTTGGTGGTTGAGATCACAATTATCAGCTCTATCCTCTACCTGTTT
TGAAGATTTGTAGTTCCACTTATGTGTCCCTCTTTTTTTATATATACAAG
GAACGCTCTTGCCATTCGCTGGATGCTGTCTAATTGTTCAACTATCTTTG
TTGATGTTTCATATAGCTTTGAGTGCTATCTTGTCTTTGTAACTTGTAGT
GGCTATGCTCTATAAGCTATCTGAATCAGTCCTTAATATGTTTTACTTAT
GCAGAAGTCAGAGCAATTATCTGGACTATCGGCTAGTGTCGATAGTGACA
GCACCGCTAGCGGCTCGCCTTCCTTCTCCAGGTCATCACAACAAAAACAC
CTATTGCTTGACCTGAAGGATGGTCGGAGGAAATCTGTGACTAGGAAAGC
GGGTGATCCAGCACTTAGCGATTCTTTTCTAGAGAGGACCCAAGCTGGTG
ATTTATTTAGTGCTGCACCCATAGCTCGGCACCCACTGCCGGTGAGTTGG
TTTTCTAATTTTTTACATTTTTGCCGCTCATCTCATTCTATTTCGCTGCA
AAATTACAAATCCGATGCATTCCCTTCTCTTGACTAGTAACTTGGCTAGC
AGTAGGCAGTAGCAATGCCGTGGAATATAGTGGAAACCTTCCATGTTAAA
TTGTAATGTAGCCTTCTAGTTCTTGTTTGCTGCTTTCTGAAGGACAGTGG
CTCCTGGGGAGACTTCACACAGAGCTGGCTGTTGCCCATTTAGGGTAATG
TAATTCCAGATTAAAGTAAGTTGTTGATAAGTGGATTCAGGTCTGAAGGA
ACTATGAGATTGTCCTTGTACTCTTTTCCTTTGCCTGGCTACCATATGTG
GCTAGAAGCAGCATGTGGCCCATGACTTACTTGCCAATATGAGATTGAGT
CATATTGTTTTCGTTTTAGCTGTGTTCTTCTATATTCATTAATTTTGACA
CTAACTGACATGTTACATGTATAGGGTGGAACAACTATCGTGGATCAAAT
AGATCTTCTTCAAGAGCAGGTCAAAATGCTGGGTGGGGAAGTTGCACTTT
CGACAAGCTCACTCAAAAGGCTGTTAGAGCAAGCAGCCAACAACCCTGAT
GATTCACAAATTCAGGTAAATATATTTCTAATACTTTCTGTGCTAGTTGG
GCATATTTGTGTGATATCTACCTTAGAACCTCAGCCATTTATTTTATAAA
TATACTTACCTGAGTAGTCCCATTTCTCTTCTACAGGACCAAATCGAGAG
GTTAAAAAATGAAATCAGTGAAAAGAGATCACATATACATGCATTAGAAC
AGCGTATAATGCAATCGCTGGAAACTACTGATGACCCAGCTATTTGGACT
GAAATGTCCCAGGTAATAGTTGCCAAGTGATGCTAAAGTTGAAATTTGAA
TTCACCTTATGTTGGCTTACATGGAAATTTCTACAGATTTTCATTTGAGC
ACAATGTACTTATGTTTCGCGTTAATTAGCTCTACCTTAAATTGCTTCAT
CACTGAATTATCTGTGACCAATGAATCATATTCTACAATGTTTTGGATTT
AGAGTGTTAATGATTGTAGTGTTTTGTGTGGTAATCTTTTTCAGACCTTA
TCAAAGTTGAGCATGCAATTGAGTGAGAAGACATTTGAACTGGAGGTATG
TTCAGTGTCACTTTGTCAGCTAATGTTTTGTTTCTCTGATTGATATCTAT
CCTAGACTAATTACTTTTTCGGACGTCTCTAGATCATGTCTGCAGATAAT
AAAATTCTCCAAGATCAGCTACAAGCAAAGGTAAGAAAGGGTGGGAGAAC
AATTATTTTTCCTGTTCAAGATACCAGTCTGATGTTCTTTTTCTTGTTCA
TGTAGGTATCAGAAAATGCAGAACTCCAAGACGCAGTTGCACAATTGAGG
CGAGAAATCAGTAATTTGTTGAAGGCTTCTAGGAGTGAGTATAGTGTGGC
TGCTACTCAGTTTAGTGAACCATCAACGGCAAGAAGCGATCTTAGGGATC
AGGCAGATGAGTTCTCAAGTCATGCTGACATTCCCTCTAGAACAGCTGAA
GAGAGTAAGGAGTCACCATTAAAATCTCAAGTGCTCATGCAGGTAAACAT
CATATGCCCCTAAATTCATCCCCTTCCAGTTTAGTCTGTCACTTGAAGCC
TTAAAGAAACGATGCTGCAGGTTGCAGAAATTGAGAATTTGAAGCAAGAC
AAGCTGAGGCTGACGGAAGAGAAGGATGGGCTGGAAATACACAGTCAAAA
GCTGGCTGAAGAATCATACTATGCTAAAGAATTGGCAGCTGCCGCTGCAG
TTGAACTAAAAAATTTGGCTGAAGAAGTCACCAGGCTTTCTTATGAAAAT
GCAAAGCTGGTTGCAGACTTAACTGCAGCAAAAGAGCATACTGCATCGGT
TGCAAGGGGCACCATCCACAATGACACAAAACAGCGTGATCACGAAAATG
GAATTTTAGTTGAAGAGATGCAGAAAGAGTTGGTTGCTAGTTGTGAGAGG
GAGGCTGCGTTAGAGGACACATTATCCCAAAAGTCCCGGCGAGAAAATGA
GCTTTTGAAGATAATTGATGATGGGAAGTGCCATGAGCATGATTTGGAAA
ATGAGCTGGCAAACATGTGGACCCTCGTTTCGAAGATGAAGAAAGAAAAC
TCTCAGGATGATTTGTTTGAATTCAAATCAAAGCAAAATGGCTTTCATTC
AGCAAAGAATGATACTGGCAGAACCCAAAGCGAGATGGAAGCTTCAGATA
ATTGGAAATATGATGGCGTCAGTACTCTAGAAGAAGCAAAAGCTGCGTAC
AATTTTGAAAGAAGGCGCTGCAAAGAGTTGGAAAACGCAATGTCTAGATT
GAAGGTAACCATATATTACTTCCCTAGCAAGTTTACCTTTAAACCACATA
TGTGGGGATGACTTGGCTGCTTCCTTTCTTCTGATGCATCCGTATTTTGG
GACCTTTTTAGGGTGAAAACATCAGAGGATTAGAGGTTAAGGTCCTTGAA
GAGCTACAAAATTTTCATGTGGAAGCACTGTCAAGGATTTGCCAAGAAAA
GGTACAGTATTCTTTTCCATCATCCATATCTCGTTTCTACGTACTCCCTC
CGACCCATATTAGTTGACTCAACTTTGTCTAGATACGGATGCATCTAGAC
TAGATACTTAACTAGATACATATGAATCTGGACTAACTTGAGTCAACTAA
TATGGATCGGAGGGAGTACTAATTTTTCTAAACTTCCTGCCGTATGTGTC
TGCATGCTGCATCTTATTTTGCGAGTGCTGCAGCTTTAACTTAAGTACAT
GTTGAGACAGAGGCGGCTTCCTTTCACCCTACTTACTAAATTTCTCTTGC
GCTTTACAGATGGCAAAACAGATGCTATAGCAGGCCCTTTTCAAGTTGAG
AGGCTGCTTCCATGTCTCGTCATGTTTGTCTGCTGCTGTTTATTCACACC
ATATACTGTTGCTACAGCCGAAGCAATGCTGATCCTAATGCGGTATGACT
TACAACAACCGGAGTAGATAACCTGGAATGGCCAGCTTTCGCCTGTGTCA
ACAGAAAAAAAGAAGGGGGAAGCAAAATATAGTTCTGACTTCTTGCCCCG
ATGCTAATCTGCCGGATACTTACTCTCCTGTACAGTTAACTGGATTAGAA
ATACTATCCACTTGTAGATTGAATTAACTTGCGGTACGGGCTAGCAAAGA
AAATGCCCAAGGTGTAGCTAAAGGGCCGGCTTTGGCCTTGAGAGTCGGAT
GAGACTGTTGTTTACCGTACTTGTACCCTGTGTAGTTGTAGATGGACATG
TGATGCCCCGAGTTGAACGGGTGGAACTGTAGGTCCTGCTGTTGTACTCG
TTGCCTGAAGCAAAGCTGCAGTTTTCGCACAATTATTCGTTTCATGTGTG
GGTCGCCGTATAATCGGTGCTCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.