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GrainGenes Sequence Report: AE046220

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Sequence
AE046220
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE046220
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAGATGGAAATGGAGGCGGGGGATCCTAGTTCGATGATGAGGCGATT
GGTGTCCCCCGGAGTGGGTCGAGGTGGAGGAGGCGCCGACGGCATCAGTA
ACCTCCCCGACGCCGTCCTCGGCGATATTATCTCCCTCCTCCCCACCAAG
GAAGGCGCCCGCACACAGATCCTCGCCTCCCGGTGGAGCCACCTCTGGCG
CTCTGCCCCTCTCAACCTTGACTGCCGTGGCTGTTATATGTTGATCCAAA
TTCTACAAAGTAGAGGCCAACTTCTGACGGAGCGGAACGAGGCCCGTCGC
CGGAGGCTTGGGCCGATGCGGAGCGGAGTCTGAAGTTGGCCCACTCCGTG
CCCAACAGGGACGCCTGTGGGGGGTGCGGGGGGCGACAGCCCCCCGCGGT
ACGGATCGTTGATGACCTAGGTTACCACCGCTATATATACTTCTTGTAAG
CCGCCGGCTGGGATAAGTCGCATCTGAGAAATCCCCGGCGTTGTGTAAAC
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TATCAGAGCCCCAGGTTCTAATCTAGGGTTTGCGACATGTCGTCATTGAA
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CCCTTGATGAAGTGCAAGATGCCCTCAAACAGAGGGAAAAGATGAAATCT
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AAGACGGCAGAAGTCGTTCGAAGTCCAAGGGAAAGGACAAGTTCTGCAGG
TATTGTAAGAAATCTAATCATGTTATTGATGATTGTTGGAAGCTGCAGAA
TAAGGAGAAAAGGAACGGTACTTACCAACCGAAAGATAAGGATCAAGGTA
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GCCGTTTTTGCTGCTTGTGCATCTCGTGATGATGAATGGATTCTTGATAC
TGCATGTTCGTTTCATATTTGCTGTAACAAAGATTGGTTCAGTTCATATG
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CATATTGTTGGAGTTGGATCTGTTAAGATCAAGACACATGATGGCGTGAC
GCGTACGTTGAATGAGGTGAAGCACATACCAAGCATGGCCAGAAATCTGA
TCTCCCTGAGTACCATGGACGTGGATGGATACAAGTACGCCGGTGGGCGT
AGGTTGTTAAAGGTATCGAAAGGCTCTCTTATTCACATGATAGGTGATAT
GAATTCTGCTAAGTTATATGTTCTTAGAGGTAGCACTTTGCCTGGTATTG
CTGCTGCTGTTACTGTTAATGATTCTGATGATTGTGGTAAAACAAATCTG
TGGCATATGCGTCTTGGGCATATGAGCGAACATGGCATGGCAGAATTGGT
TAAGAGAGAGCTGATTGATGGTTGCAACTTGGGTAAGTTTCAGTTCTGTG
AGCACTGTGTTTTTGGTAAGCATAAAAGAGTTAAATTCAATGCTTCCGTT
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GTTTTTGATGCTTTTAAGAAGTGGAAAGTTATGGTAGAAAAGCAAACTGA
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ATCCCTTACACTCCTCAGCAGAATGGCGTGGCTGAGCGCATGAACAGAAC
CATCATCTCGAGGGCTCGCTGTATGTTGTCCAATGCAGGTATGCATAGAC
GTTTCTGGGCTGAAGCAGCCAACACAGCGTGCTACCTCATCAACAGGTCA
CCTTCTATTCCACTTGAGAAGAAAACTCCCATTGAGGTATGGTCAGGTTC
GCCTGCTGATTATTCACAGTTGAGAGTTTTTGGTTGCACAGCTTATGCTC
ACGTTGATAATGGAAAGTTAGAGCCTAGAGCTGTTAAGTGCATATTCCTT
GGTTATGGTTCAGGAGTTAAGGCATATAAACTATGGAATCCTGAAACTAA
AAGGATTTTATTGAGTAGGAATGTTGTTTTCAATGAATCCGTTATGTATC
ATGACAGCTTGCCATCAGATCCCTCTCCTGTTGCTATTGGAGAGGAGGGA
GTTCGTGTGCAGGTGGAGCACCTGCAGAAAACTGTTGATAATAATGTTGT
TGTTGATGATACTCATGAGGAAAATATTGATGATGATGTTGTTCAGCACT
CACCTACTGTTTTGCAGCAGCCACAAGAATCTATTGCTGCTGATAGACCG
AGGCGTAACATAGTTCCACCTCGTCGTTTAATTGAAGAGTGTAATCTTGC
TCATTATGCTTTGAGTTGTGCTGAACAGGTGGAGCATGATACTGAACCTG
CTACATACAATGAGGCTATTGCATCCGTTGACCGCGAGAAGTGGTTTTCT
GCTATGCAAGAAGAGATGCAATCGCTTGATAAGAATGGCACATGGGAAGT
TGTGCGCTTGCCTAAACAGAAGAAGGTTGTCCGCTGTAAGTGGATATACA
AGAGAAAGGAAGGTTTGTCTCCTAATGAGCCTCCAAGGTTTAAGGCAAGG
TTAGTAGCAAAAGGTTTTAGCCAGATTCCAGGTATTGACTATAATGATGT
TTTCTCTCCGGTTGTGAAACATAGCTCTATTCGTACTTTCTTTGGTATTG
TTGCTATGCATGATCTTGAGCTTGAGCAGCTAGATGTAAAGACTGCTTTT
CTGCATGGTGAACTGGAGGAGGAGATTTACATGGACCAACCTGAAGGGTT
CATAGTTCCTGGAAAAGAGGATTTTGTGTGCAAATTGAAGAGATCGCTTT
ATGGTTTGAAGCAATCTCCAAGACAGTGGTATAAAAGGTTTGATTCATTT
ATGATCTCACAAGGTTTTAAGAGATCTCAGTTTGATAGCTGTGTTTATAT
AAAGTTTGCTAATGGGTCACCTATTTACTTGCTGTTATATGTTGATGATA
TGTTAATTGCTGCCAAGAGCATGAAAGAAATCACTACTTTGAAGGCACAC
CTAAGTAGTGAATTTGAGATGAAAGATCTTGGTGCTGCTAAGAAAATCCT
AGGTATGGAAATTAAACGGGACAGAAAATCTAGGTTGTTGTTTCTTAGTC
AGCAAAGTTACGTTGAGAAAGTTCTTCAACGTTTTAATATGCATGATGCA
AAGTCAGTTAGTACTCCTGTTGCTCCTCACTTTAGATTGTCAGCATTGCA
ATGTCCTAGTTCTGATGAAGATATTGAGTACATGTCTCGAGTTCCTTATT
CTAGTGCTGTTGGTTCCTTGATGTATGCCATGGTTTGTTCTCGCCCTGAT
TTATCATATGCTATGAGTTTGGTGAGTCGTTACATGGCTAATCCTGGTAA
AGAACATTGGAAAGTTGTTCAGTGGATTTTCAGGTACCTTCGTGGCACAT
CCAACGCTTGCTTGAAATTTGGCAAGACTGGTGAGGGACTCGCAGGCTAT
GTGGATTCAGATTTTGCTGCCGATTTGGATAAGAGGAGGTCCCTCACAGG
TTATGTGTTCATGGTAGGTGGATGTGCCGTGAGTTGGAAGGCAACGCTGC
AACCAGTTGTTGCTTTATCTACAACCGAAGCAGAATATATGGCTGTTGCT
GAAGCTTGCAAAGAGTCTGTTTGGTTGAAAGGTTTGTATGCTGAGCTTTG
TCAGGATGATTCTTGCATTAACCTGTTCTGTGACAGTCAAAGTGCTATTT
ACCTTACTAAGGATCAGATGTTCCATGAGAGAACAAAGCACATTGATATC
AAGTACCATTATGTTCGTGATGTTGTTGCACAAGGTACACTGAAGGTATG
CAAGATAAGCACTCATGATAATCCTGCTGTGACAAAGCCTGTTCCTGTTG
CTAAGTTTGAGCTATGCTCAAGCTTAGTTGGTATAACTGCTTAGCCCAAG
TGGCTATTGGCGCCGAAAGTGTTTTTCTTTGTTTGTTCAGGGAGATGATT
ACCGTTGATGCTACAAGAAGGAATTTGTCTCAAGGTGGAGTTTGTTATAT
GTTGATCCAAATTCTACAAAGTAGAGGCCAACTTCTGACGGAGCGGAACG
AGGCCCGTCGCCGGAGGCTTGGGCCGATGCGGAGCGGAGTCTGAAGTTGG
CCCACTCCGTGCCCAACAGGGACGCCTGTGGGGGGTGCGGGGGGCGACAG
CCCCCCGCGGTACGGATCGTTGATGACCTAGGTTACCACCGCTATATATA
CTTCTTGTAAGCCGCCGGCTGGGATAAGTCGCATCTGAGAAATCCCCGGC
GTTGTGTAAACACTCTCCGTTATAGTGAAGTTTCGCTGGCTGGCGCCCGT
GGTTTTTCCCTTCTCTTTGTTGGAGAGGGTTTTCCACGTTAAATCTGTGT
CCCCTTGCTGTGATTTTGTTTTCGTTCTTCGTTATTTACTTGTCGCAAAT
CTAACAAGTGGTATCAGAGCCCCAGGTTCTAATCTAGGGTTTGCGACATG
TCGTCATTGAAATTCGATCTACCGCAGCTGGACTACTCCACAAGATTCTG
CTTGTGGCAGGTGAAGATGCGGGCGATTCTCGCCCAAACTTCAGATCTGG
ATGATGCGCTGGATGGATTCGGGGAAAAGGATGCTAAGAGCTGGTCTGAC
GAAGAGAAGCGGAAGGACCGTAAGGCTTTGTCTATGATTCAACTTCATCT
ATCCAATAATATTTTGCAGGAAGTCTTGAAAGAGAAATCTGCTGCTGCCC
TTTGGGGGAAACTGGAATCGATCTGCATGTCAAAGGATCTAACCAGTAAG
ATGCATGTGAAGATGAAGTTGTTCTCGCATAGATTGCAAGAAGGTGGATC
GGTAATGAATCACTTATCTCTTTTCAGAGAGATTATTTCTGATTTGCAAT
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TCGTTGCCTAGTTCTTATACTCACTTTCGTGATACAATGTTGTTGAGCCG
TGATAAGATAACCCTTGATGAAGTGCAAGATGCCCTCAAACAGAGGGAAA
AGATGAAATCTATGGTGCAGGCAGATGGGGCGTCTTCCAAGGCTGAAGCT
CTGCAGATTCGTGGCAGGACCGATCAGAGATTTAACAACTATGGCAACCG
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AGTTCTGCAGGTATTGTAAGAAATCTAATCATGTTATTGATGATTGTTGG
AAGCTGCAGAATAAGGAGAAAAGGAACGGTACTTACCAACCGAAAGATAA
GGATCAAGGTAATGGTAAGGCTGCTGTTGTTTCTGGTGATAGTTCTGACG
GTGAATGTTTAGCCGTTTTTGCTGCTTGTGCATCTCGTGATGATGAATGG
ATTCTTGATACTGCATGTTCGTTTCATATTTGCTGTAACAAAGATTGGTT
CAGTTCATATGAGTCTGTGCAGACTGGAGATTTTGTACGTGTGGGGAATG
ACAACCCATGCCATATTGTTGGAGTTGGATCTGTTAAGATCAAGACACAT
GATGGCGTGACGCGTACGTTGAATGAGGTGAAGCACATACCAAGCATGGC
CAGAAATCTGATCTCCCTGAGTACCATGGACGTGGATGGATACAAGTACG
CCGGTGGGCGTAGGTTGTTAAAGGTATCGAAAGGCTCTCTTATTCACATG
ATAGGTGATATGAATTCTGCTAAGTTATATGTTCTTAGAGGTAGCACTTT
GCCTGGTATTGCTGCTGCTGTTACTGTTAATGATTCTGATGATTGTGGTA
AAACAAATCTGTGGCATATGCGTCTTGGGCATATGAGCGAACATGGCATG
GCAGAATTGGTTAAGAGAGAGCTGATTGATGGTTGCAACTTGGGTAAGTT
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ATGCTTCCGTTCATACCACCAAAGGCATATTAGATTATGTGCATGCTGAT
GTATGGGGACCTTCCCGTAAGACTTCTATTGGTGGTGCTAATTACATGCT
TACTATTATTGATGACTACTCAAGAAAAGTGTGGCCATATTTTCTGAAAC
ACAAATCTGATGTTTTTGATGCTTTTAAGAAGTGGAAAGTTATGGTAGAA
AAGCAAACTGAAAAGAAGGTAAAGGTACTACGTACTGATAATGGTATGGA
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ATGAACAGAACCATCATCTCGAGGGCTCGCTGTATGTTGTCCAATGCAGG
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GCATATTCCTTGGTTATGGTTCAGGAGTTAAGGCATATAAACTATGGAAT
CCTGAAACTAAAAGGATTTTATTGAGTAGGAATGTTGTTTTCAATGAATC
CGTTATGTATCATGACAGCTTGCCATCAGATCCCTCTCCTGTTGCTATTG
GAGAGGAGGGAGTTCGTGTGCAGGTGGAGCACCTGCAGAAAACTGTTGAT
AATAATGTTGTTGTTGATGATACTCATGAGGAAAATATTGATGATGATGT
TGTTCAGCACTCACCTACTGTTTTGCAGCAGCCACAAGAATCTATTGCTG
CTGATAGACCGAGGCGTAACATAGTTCCACCTCGTCGTTTAATTGAAGAG
TGTAATCTTGCTCATTATGCTTTGAGTTGTGCTGAACAGGTGGAGCATGA
TACTGAACCTGCTACATACAATGAGGCTATTGCATCCGTTGACCGCGAGA
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GTGGATATACAAGAGAAAGGAAGGTTTGTCTCCTAATGAGCCTCCAAGGT
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TATAATGATGTTTTCTCTCCGGTTGTGAAACATAGCTCTATTCGTACTTT
CTTTGGTATTGTTGCTATGCATGATCTTGAGCTTGAGCAGCTAGATGTAA
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GAGATCGCTTTATGGTTTGAAGCAATCTCCAAGACAGTGGTATAAAAGGT
TTGATTCATTTATGATCTCACAAGGTTTTAAGAGATCTCAGTTTGATAGC
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AAGAAAATCCTAGGTATGGAAATTAAACGGGACAGAAAATCTAGGTTGTT
GTTTCTTAGTCAGCAAAGTTACGTTGAGAAAGTTCTTCAACGTTTTAATA
TGCATGATGCAAAGTCAGTTAGTACTCCTGTTGCTCCTCACTTTAGATTG
TCAGCATTGCAATGTCCTAGTTCTGATGAAGATATTGAGTACATGTCTCG
AGTTCCTTATTCTAGTGCTGTTGGTTCCTTGATGTATGCCATGGTTTGTT
CTCGCCCTGATTTATCATATGCTATGAGTTTGGTGAGTCGTTACATGGCT
AATCCTGGTAAAGAACATTGGAAAGTTGTTCAGTGGATTTTCAGGTACCT
TCGTGGCACATCCAACGCTTGCTTGAAATTTGGCAAGACTGGTGAGGGAC
TCGCAGGCTATGTGGATTCAGATTTTGCTGCCGATTTGGATAAGAGGAGG
TCCCTCACAGGTTATGTGTTCATGGTAGGTGGATGTGCCGTGAGTTGGAA
GGCAACGCTGCAACCAGTTGTTGCTTTATCTACAACCGAAGCAGAATATA
TGGCTGTTGCTGAAGCTTGCAAAGAGTCTGTTTGGTTGAAAGGTTTGTAT
GCTGAGCTTTGTCAGGATGATTCTTGCATTAACCTGTTCTGTGACAGTCA
AAGTGCTATTTACCTTACTAAGGATCAGATGTTCCATGAGAGAACAAAGC
ACATTGATATCAAGTACCATTATGTTCGTGATGTTGTTGCACAAGGTACA
CTGAAGGTATGCAAGATAAGCACTCATGATAATCCTGCTGTGACAAAGCC
TGTTCCTGTTGCTAAGTTTGAGCTATGCTCAAGCTTAGTTGGTATAACTG
CTTAGCCCAAGTGGCTATTGGCGCCGAAAGTGTTTTTCTTTGTTTGTTCA
GGGAGATGATTACCGTTGATGCTACAAGAAGGAATTTGTCTCAAGGTGGA
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GGGGGCGACAGCCCCCCGCGGTACGGATCGTTGATGACCTAGGTTACCAC
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CTGGCGCCCGTGGTTTTTCCCTTCTCTTTGTTGGAGAGGGTTTTCCACGT
TAAATCTGTGTCCCCTTGCTGTGATTTTGTTTTCGTTCTTCGTTATTTAC
TTGTCGCAAATCTAACAGTGGCCTCGTCAAGCGTGGTGCTGAACTCCCAG
GTGTCGTGTCGCGCATCCTTTCCTCTCACAGGGGCCCTGGCCGCCGCTTC
TTCGTCGACACATACAGCCTCAGCGCCCTCGGCGCCCTAAACGCCGACCC
GCCGCCCTCGAAAATCTCCAAGAGCTTGATTTATGCTACACTAAAGACTA
TCGGATGCCGCTGTCAGCGTTCATCTTCCGCTTCTCGGCCACCCAAGTGC
TTCGCGTTGTCACCATTGGAAAATGTAACTTCCCTGACGGCATTGTCCAA
GTGCTTCACTTTCCCCTGCTCAAGCAGCTCAGACTTGAATCTGTCTCCAT
CTCGGAGACCTCTCTACATAGCCTGATTGTTGGGTGTCCTATCCTGGAGA
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CACGCTACAGTTTGAGGAACTCATCATCGAGAACGCCCCTTCTCTTGAAA
GGTTGCTCAATCTTGATTGGAACATTGATCTGCATATATCAGTACTCTCT
GCGCCTAAATTGATGACCTTTGGCTATCTTTATGAAACCTCCTCCAGGCT
TGTGCTTGGTTCCATAATTATTCACGTAACTGCAGCCTTCAGGCTTCTTT
CCACCGGGAGGATTCGAACCTCCATTTCTGTATACATTGAGATTACATAT
CATTTACACCGGCATAGTATGGTATAATGTGGCCTTTCTTTCTTAATAAA
GGGATTGCACATTGATAACCTGGCAAAAGTGGTGTCCACAGTTAAGAGTT
TGGCTGTTTATATGTCTACACCTAGTTTCGATATGATTATTGAGTTGATG
AGATGCTTTCCGTGCTTGGAGAAGTTGTACATTCGGGTGATGATTCTTTA
TTCATGGTTCATACTCCAGTATTCATCTGTTCTTTTTTCATCTACTTGCT
GTTCTGAAATTGTTGATTCTTTTCTCTATGTTCTTTTCAGGGTTATTCAC
CAGCAGAAACAAATGTGTGGCGTCGTAAACATCAGGATCTTATCGCCTTT
CTTGATATCCGTCTGAAGTTAGTAGTGGTGGAATATTATCAGGGATATAA
GTCAGACATTGATTTCGTCACATTCTTTGTATTGAACGCTAGAGTGCTAG
AGTTGATGACACTTGTGGTTAGAACCAGGGTTTATGGTGAGGAGTTCTTG
GCAAAACAGCGTCAGAAGCTTCAGCTCGAGAAAAGGGCTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.