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GrainGenes Sequence Report: AE042217

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Sequence
AE042217
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE042217
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCAAAGCAACTGCCTGAGCCGAGAGAGCACACGCACGCACTCGCCGTGG
ACCGTGGTGCCGCCGACCGCTCCGCCCCCTCCTCCGCCAGCCCACTACTA
CCTCGTAGCCGGCCTCGGCGAAGCTCCCCTGAAACCCCGGTCCAGGGGGG
GTTTCCCGTGCCTCGCTTTCCCTGCCTCCCATGGCGGCTCCCCTCCTCCT
CCGCATCCTCTTCCTCCTCGCGGTCGCCGCGTCCGCGTCGGCGGCGGCGC
GGCGGGAGGCGTTCCGTCGGGACCCCGGGCACGCGCAGTGGCACCACGGC
GCCTTCCACGACGTGGAGGACAGTATCCGCGCCGACGTTCGCCGCATGCT
CCACACCCGCGCAGAGGTACTCCACTCCCCCATCTCCCCGCCACTCCCCG
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ACAGAGCAGCTGAGCTCGACTAGATCCGAACTCGGTCGGAGCTTGCGGTG
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GGAATTCCCTCTCTTTGAGGTAGAAGCAACTGCGGTGGAGCATATATTCG
AGAGGCTATACTCATTTATTTTTGATATCGAGCCTGGTCGCTCTGAAACT
GAGATGGATAGGCCTGTACCTGTTGCAATATTTGTTGTTAATTTTGATAA
GGTATTGGAGACTTCTATCTAGCATTTATTATTTTCTGTAAGCATATGGT
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TCCCTTATTTGTTGTTTTTATCTTTCTATTACAGTTTGAAGGAAACACTA
GAGAAAAACCTGATGGAAATATATTTGAAAAATAACTTAAAAAGGTACAA
AGAAAAATGAAAGAAGTTAATTCAATCAGCGGGAGTTACATCCTGAACTG
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TCAAATAGTTCTCTCCTTCTAAATTCCATTGATGGTATACATATAAAATT
AAATTTCTTCGTTTGTAACTACTGACTACATATGCCAGCAGCCTACAGTT
AACACTTTAAACAACATATGAGAATTTAGATAGAGATAGTCATGCTCATA
TAACATCCTTAGCCTTCTGTAACAATTTGAAAGTATGCAGGTGTGAGCCC
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GTTGCAAGTAACTGTACAAAATGTGTTTAAGGGAAAAGAAAGGAAAATAA
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GAAAAACGTACTCTCACTTTTAAGTTTTTAATTTCAATAGATTCAAGTCA
AACAATTTCTCCATCTAAATTTGTTTGATGGTATATTATAAAAAGATATT
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ACAATTGGAAATATGCAGAGATGAGTTACAGAAGACATTCAGCCCAACAA
TGCTTAGTGAACTGGCGAGAGAGAACATTTGATTCAGTTTCATCCTCGTG
TCTTACAAATACAGTTATACGAATAGTAATTAACATATACAAAGCTCTTC
CTTGGCAGGTTAGAATGGATCCTCGGAACAAAGGAGTTGATCTTGATAGT
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AGAAGCAGATTACATCTACCGTTACCGGTACAATGGAGGTGGTGCAACTC
AGGTTTGGCTGAGTTCTGGAAGGTAATAAGTTATTCTCATAGACTGCAGA
TTACATCTACCGTTACCGGTACAATGGAGGTGGCGCAACTCGGATTTGAG
TCTTTGAGTCAAAATAACATTTTACTGAATCTGGTATCCTTATTTTCTTC
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AAATAGGTCGCAGACCTTATTCAGCATTACTTAAAATCGTCATATTCCCC
TTTTTCTTATCGCTTTGTTGTTAGTTGCTAGCCATCAGGGCTTCAAATCC
TGGCAGGAATTGGCCAGTTCCCATCATTTTAGTCAATCCCGACGTGACCT
GGTATTTGTAAACTAACCGGAATTTGGATGGACTGTCCATTACTTTGGGG
GTAAGCATATATCAGTGATTATGGGATGTAAAGGAACACGGACACTTAAG
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TTGGTCTCTGCTATACTAAACACTAGACATGATCAAGGATTGAACACAAA
CATAATTTTCTACCCTGGCTGCCATGACTCGTTGAATTACACATCATATT
TTCTATGCATGATCTATTTGTAAAGACTAAAGAGTGCTCCATATATAGCA
CAGTCATGTTCTACTGTTAATTGTTGCACGTTAGAGCAGATTTCTTTTAT
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CCATCAGTGATTACTTCTTGCAGATTTGTTGTAATAGATCTGTCAGCAGG
CCCTTGTACATATGGGAAAATAGAAACGGAAGAAGGCAGTGTTAGTTATA
GGTCAATGCCGCGGCTGTCAAATATAATCTTCCCACGAGGACTTGCTGCT
CCAAGTGCTAGTTCCACACAAAATATTTTTATGGGACAGCTTGGAGGATT
AATTTCAACTACCATTGAGCATGTGATAGCTCCTGACATCAGGTATTACC
AGAAATTTCTTTTGAGTGGAGTTAGTAGTACTTCATAATCCATAGATAAC
CGTAATGTAATATATTTTATGTAGATCGACAAAGTTAGTAGGAAATCACA
ATAACAAATTGTTGCACGAAGTATTCAATTTCTCTCTCAAAATATATTCT
GTGTCTCACGCACATTCCCTCTCTCTAAAATAAATCCGCCTTTTGGCACA
TACTTTGTAAAGCAAAAGTTAAGCTCAGCTATCAGGAATCAGGATCAGGT
TAAATCACCTCCCTAGCTTAGTGTGGTCTTTGAAACTTTTGTGTCTTCAT
TTCCTTGTATGCATCTTGCCTGCTTACTTGGAACCTGTAGCATGTACTAC
CTCCAATCCATAATAAGTGTCGGGGCTTTAGTTCAAATTTGGACTAAATT
GAACTAAACCCCAGATACTTATTATGGATCGGAGGGAGTACTAGGTTACT
GTTTTTCAATATATCTGCATACCCATCCTTACAAAAGAGATGTGCATTAG
TTTGTTTGGTCATCTCTGGGCATGGAAATGTGGGACAATTAATTGGAATT
TTTTCCAGCTTGATAGGATCAGATTAAATCACCTTCCTAGCTGAGTGTGG
TCTTTGACACTTTTGTGGGTTCAGTTCCCTGTACGCATCTTGCCCGCTTG
CTTGGAACCTGTAGCATGCACTAGATTACTGTGTTCTAATTATATCTGCA
TAGTCCATCCTTACAAATGAGATGTGCATTAGTTTGTTTGGTCATCTCTG
GGCATGGAAGTATGGGACAAATAATTGGAATTTAGTTTTTTTTTCCAGCT
TTACAGGCTCAGTTTACTTTTGGTGTGCTGTGCTTTGCATATTTATAGTG
TTGCCGTGATAAAAGAATTTGAAAAGTCTACTATCCCTTTGTCCTGAATT
AGATGTCGCAGATTTGTCATTTCGCATGTATCTATACACAAATGCGTCTT
GATACATGTGTATCTAAACAAATCTGTGACAAGTAATTAGGGACAGAGGG
AGTACTTTGTTTGGTAAATCACATCTAATAAATTATATAAAGTATGCTAT
TCATTGGTGGTCCTCTTAAATTTGATCTAGAAGAGTCTTTGGACATGATA
ATATTTGTCTGCAACTTTATATTACATAACTACAGTACAGCTAGCCAGAC
ACCCACGTGTTGTGAAGCGGTTCAATCAAATGAGATCATAATCCACCCAA
TGCCAAATGGGGCCTTAATTTGGCATACCATTAATAAACTTTCCTCTCTT
CGAAGTTGCTTATATTCAAAACACAAAATATGTCATACAATTAAAGAGTG
CCAAGGAAGTTGCATTAGGCAACCAGCTGTACATAAGTAAGCTGTCAATT
GAACATGTTATAGTATTTCACTGCCTTCATACTAGGTTTAAGCACTGAAT
GTTCTATTTTTCCTGTTTTTCTGATATGTCCTCTTAAAAAAAATCCAGGT
TTGAAACTGTTGACATGACATTGAGGTTGCTTGTACCTATCATTGTGCTA
CAGAACCACAATAGGTACAACATTCTTCAAGCTGGTCACAACAACAGTAT
AGATGTTCAAGCTATTGAAAGAGAGGTTAGTTGACTTTCATACGCAACCC
ATATATACATCTTTATGTTACTAAAGCCACGGTTTTCTGTAGTCAAGTTA
CTAGTTTGTTTTAGTTCATGCACTAGTTAACCTTTTCTAGTTCTCAGAAA
GAAATTATCTTTGTTAGGACCATTCCAATTAAAAAATCGTAGGGCAAAGA
CATGTTCTCCATTCCCATTGACATGAAATATCATCACAAATCACAAGAGT
GTCCAAAAACACTATGGAAATGCAATTCATCTGGAAGAATTACCATGCTA
AAATAAGAAATAAAGTTGTGGATACTCCATTGTATTTTGTTTCATTTGTT
GGGAGAAATTGTCACTTATACAAAATAGGAACAAAGCACATGTAAATTAA
ATATATACAATCACAATGAAGTCAAGGGTATATGGTTCTTCCTATTGGTC
TAGGGCCTCATTTGTTTCCTTGAGTCCTTAAATATATTTCCCCTTTGGCT
ATGCAATACATCAAGCCCTATTGGGGACAGGAAACCTATTTTTAAAACAG
TGCTTTGAGGCTGCGAGCAAAGCTTTCCCAATCAGTATTAGAGCATCTCC
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TGGGCCGTATGGGGGGGGGATGCGTTCACGATATGGGGCGCAGCGCTGCT
TCCCAGCTGTGCCCCTATACAAAATATTCAAACATTTGAAAATACGAAAA
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AGTGGTGGCCCCGGCCACGGCCGCCTAGTCCAAGGCGACGGTACATCGCC
GCCGCGTAGTCGTCGTCGTCGCTGGGCTCCTGCTTTGGCGGTGGCATGGT
GCTGCAGCCCTGGCCCGGATCGCCGCCCTAGCTCGAACAGCCGTCCTCGT
CGTCGTCGCCCTCAAGGTCGATGAACAAGACGAGGCGGCGCGCTCGCTCT
GCCTGCTCGCGCCGGTACTCCTCCGCGGACCACGCTTTCGCGAAGTTGTC
CGTCGCTGGCGGCACGGCCTCGTAGGAGGCGCGCTCGGCGACGCGCTAGC
CCGGAAACTCCTCCGGGTCCTCGTCGATCTTTAGCTGGAGGGTGGCCGCC
TTGTACTCCGGCAACAGTGTCCAATCCTTCACCTAGCGCTGGGTGCGGTG
AGGCGTAGGCGGCCACGGGGAGGTGATCGCTCGCGTCGGCCCCTAGCTGC
GGCGCCGTTGGGGCGCCGACACGACATAGGAGCCTCCTCGTACTCGTTCA
CCGGCGCGAGCATAGACGAGAAGCGCGGCGACGGCGTAGAGTACGGGGAG
TAGCGGGTCGAAGGCGAGGAAGACGTGGAGGAAGAGCGGGCGGCGTGGCG
CGGCGTGACGAGGAGGCATCGTCAACGGCGGGTGGTTGCCGGCAGCGATG
TACTCGAGGACCCAGGCCAGCGTCCGGCCTGGCGCGCTCCACCACCTGGT
CCGCCCTTCGATGTTGCTATCCAGCAGTGGGGGGCGTTGCCGTCGTAGGC
GCCGAGGCGGTCCTGGTGCTGGGCCTTGAAGAACACGGTCCATGCCTGCG
TGTTATCGGGATCCCAGGCGGGATCGTTCCGCTCCTTCGGCGAGAGGACC
TCCCAGTAGTGGCGGTAGATCTCCGCCTGCCCACGGGGGACCGGCGGGAC
GGGCCGACCATCGGCACTGAGGAACCAGCCGTGCGGGCAGTGCACGTCCG
GCGGCGGTGGGTACCCCGCCTCCCACAACGCGCGTGCCTCGTGGATGCGT
AGAGAACGGCGTCCAAACCCGTTCACGGCGGCTCCGTCTCCGGGGTATCT
CTCCATGGCCGGCGGTTTGGGTGGTTGGTCAAGACGGGAGAGGGGATGCG
AGGATGGAACTGGGCTGTGGAGGAGCTGCGAGGAAGGAGGGGGTTTTTAT
GCGCGGGGCGGTGGCGCGGCAGGCGAGGTGGGAGACGGACCGAACGCGTC
GGCCGCTGACGCTGACAGGGCTGGCCCGCGTGTGGGTTGGGTTTGGCCTG
GCGGCGCTGGATAACAAAACGGCCGCGCCGGTGCCAAAACTAATTTGGCC
GCTGGCGCCCCCGGTAGCCCTTTAGGGGGCTTTAGGGCCCCCGAGTGGAG
ATGCTCTTAGTTCTAGCATTGTTGTTTTGTGAACACATGCAAAAGTGTTG
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TATAGTGCCAATGGAATTTCACATTTCATTCAAAATGTCTCTTTGCATAT
TTATAATAATTATTTAATGCCTGTGGCAAACCCGTGGTTTTCTAAACTTT
CTGCCTAGATCCTGGTAGGAGAACTAAAAATTACAAGTATGGGGTGATGA
TCTTTCTTGCAGCTACTACTGTCTTGTTGAGATCTGTCTTTTATGTATTA
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AGGAGAATTTCACTACTTAAAATACATTTTTTCTCAATGGATACAAAAAT
TATAGTCATCAATTATTGTTTCTTGCACCCGAAGTTCTTCTCCTTCGACA
TGTACCGACCTCATAGAGTAAGGGCGGTATCTACGTGCTCGCGTCACCAT
TCTCTTTTTGTTAGTTGAAGACTTTGATCCGGAAATCCAATTCGGCTCAC
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TGTAGCAGGGTGGGACTAAACGTGAGACGTACCGAATCTGATTCCACCTG
ACAGTCAAAATAACCAGGCATCTCGCGTAGAAGCCGGCCGGCCGAAACCA
ACATCAATTCAACAATACACTCTCTCAATCCAGATCTCCATAGTCTCGGT
CTCTTGTTATCTCTCTGTGGTATGCTCCCTGTCTCTCACGCACGAACTCC
TAGCAAAGCCTCAATGGCTCAATCTCTCACAGAACCATCACGGCCCTCCT
ATCAATATCTTAAGTCCATGGGGACACGCTGCTACATCTGCAGGTTCCTT
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TCGCGAAGTACGCCGTGCCGGTGGCGAATCATTTGCAGCAACATTGTCAG
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CAGTACAATCATGTCTTCACCTAAATATGAAGTATACATGGTTATCGATC
AGTGACATATGGGTCATGTATACTTCTGTTTATTTTAATCTTGTGACCTC
AACTGCTACAACCACCATGTGTACTCCTTGGTCTTTTTCAGGTAAAAAAG
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GCATGAGCATGAAAAGTTAGCGGTTGCAGTTTCCAAAGCAATGCGTAGCC
ACTCTCTTCATGAAACGAAGAGTGATGGTCGATTTCATGTCCGCACCAAA
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AGCTTTATTCAAATACATTTTTTGTATTGCAAGGGCATAATTTTCACTAT
GGTGGCTTCATAGCCATACTCACCTACATATCTTGGATGCATGATTTATT
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GTAGCAGGATTTGTTGTCCAATTTCTGTATAGGTGCTTGGGAGATTGTCA
TGTGGAGAACTATACACTAGACTTCATCTGGCCTGTTAACCATAACCTTG
AGAATAAACAAGCTCAACTCTTATAATTTGTAATCTACTTATGCTTGGAA
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ATGTTTATTTCTTGCATTTGAACTGCAATATTCCAATGTGGGTTATACCA
ACTGGTACAGGAAATGGAACGTTCTGCCGATGTGCTGTCGGCTGGTTTAT
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ATCACGATACCTGTTTTTTTTTAATACGGGTCTTATCACTTATGTACTTT
TTTTTGTCAACAACAGCATTGGATGGAGGAGCAAGATAACGTACAAGATT
CTATCAAGCACAAGCCCATTTGGGAATCTTTTATGCCCAGAAATAAGAAA
GAAAAAAGAGGAACTGGGAAAAAGAAACATGGATCTATGTACAGAACTTA
TGGAACCAGAGTAATTCCAGTGTAAGCTACCCCTCACAGAGAGAGCAAGT
GTAACATTTCAAACTCATACTGTGCTCCGGTAAATAAATAAAAAGGATAA
ATTGCAAGTGATAATTTAAGAACAATAAGAAGACAAGAGTCGATTTTCGC
ATGGATTTTTTCCTTTTGATTTTCTGTGAATTTAGGAAGTGAAGATATGG
TGCCTCCTCAAATAATGCACTAGACAATTAAGATTATCATTTGTGCATGG
AAGTAGAATTATTGACATGGTACTTTGAGAACTGGGATCCTAAAGAATGC
TTTGCTGAGGCAGAATGTACACTGCTACTTTTGCTGATCTTTTTTAAAAT
CACAGTTTTGTATTATCATTGGCTGAAGTTGATGCTGAGCTTATGATGGA
AGAGGAAAGTCTTGTTTGGACAAGTAAAGATGTTGTAATTGTGCTGGAGC
ATAACAATAAAATGATTCCTCTAAGGTATGTTAAAGTTTTATGTACAGGC
AAATTTATTTTATGGATTTCTGCACTGTGTGAGTCTAGTTGCTTCTGTTT
TTAAGTGTCCCTTTGATGTTGCAGCTACGTGTCAGAAACAACTAGGCAGT
TTGCTTATCCATCTCTAGCACAGCGCCACATCTTGGCTGGTTTGGCTTCG
GCGGTTGGAGGTCTGAGTGCACCGTACGAACGGGCATCACGTATTCATGA
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AATAGGGGAGGCAGAGCATTGCTCACATGTAATATCGAGATGTTGTTTGT
TGGTCATGCTTTCATGGTATGTACATAGAGGCACAGACTGAAACTTTGAG
TTCAGACCCGCTATACAGTCCATTTCTTGTTTTTTTCCATGTGTGTTAGG
AGCATCATAGGTTGGGTATCTATTTTTCTCTACCATCTCATTGCCATTTA
TGCATAAACTAACATCATGTTTCCTTTTTAACTAATTTAAACGCTGGTTT
AAATATGGGACCCCTAGCCCGTGTCAGCATGTATTCCTACCATAGACATC
AAAATGCATGGGCAATGCAGTTATTGATTATAAAACGCGTTTCTACTGCC
TTTTGAAACTCATTTGAAGCTGCTTTGTACAGCCCTTCCTTCAGCTGTTA
CCATATCTTTTTGTGTTAATTTATGTTTTTTTAATGTGTAGAGAACTACA
ATTTATGCACGGGTGGATGCAGCTCTTCGCAAAATAAGGGACACATCAGA
GGTCATATGACATTCAGTTGAACTTGTCATCATTTTTTTTACGTACACGG
CGAACTAAAACTGTGGTTGGTTGGTGCAGTCCGTTCAATCTTTTGCGTCA
GATCATCTTAAGACGCCATTAGGTGAACCTGTTAAAGGTAGTAAAAACAA
GTCCAGCACTGATTTATGGGTAGAGAAATTCTACAAGAAGGTAACCACGA
TGCCGGAGCCTTTCCCCCATGATCTTGTTGAGCGTTTAGAAGAGTACCTG
GATGTAAGTATACGTTTCATAATTCATTAGTCTACTTTTAGTGCGGAACT
TCTGTCTGGACCTGAAATCCTTTTTTTTTTGCACTCCATTTCAGAGGCTT
GAGGAACAACTAGTGGATCTATCTTCTTTGCTCTATGACCATCGTCTGGT
TGATGCTTCTCAAAACAGTTCTGATATCCTGCAGAGCACTATATTTACAG
AACAGTATGTTACTTTATCTAGAGTCACAAATCTCTGACTAGCTATTCTA
CATTTTCTTCGTTTACTAAAAAGCCAAGTGTATTGAAAAAAAAATACATT
TTTCTCTTCTTTTTCTGATTATTAGTTCCCTGTTTACCCTTTCTTTGGAA
TTTTTTCTTATGAACTTTGGTTGAACAGGTATGTAGAACGTGTTTTATCT
TCGGAGAGAGACAAAATGAAGTGTTGCCGCATCGAATACAGTCACCCAAA
ACAGTCATCCCAGGCTTTTGTCTATGGAGGGATCCTTCTGGCTGGGTTTC
TTGTGTACTCACTGGTTATTTTCTTCTCTTCACCAGTTCGATAACTTGCA
GAATAACTGGGTAAAGGCACTCGTGAGGATTATCTCTAGGTCTACAAGAT
GGGTACTTCAAGGATGCCGTCTGCATGAAGCCATGAACTAACATCGTGTT
GTATTAGTTAGTGGTTGTTTCTCCAAAAAGAAATGTGTTAGGGGCTATCT
CAGCTTATAGCTTTCAGCAGAAAAAAAACTTGGATTATAACACAGTTTTT
GTCTATGAGATTATTATTTGTCAGTACTTGTTCCGTAGGAATCCCCATGT
AGCTGATAGTCAGTTCATGATCGGTGGGCGACGTTATGGTTTTCCCTGTT
CTGCAATTCATAAGTATACAGTATATAGAGAGATGCCAACACAATAATCC
CAAATAAAACATGGCCAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.