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GrainGenes Sequence Report: AE008356

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Sequence
AE008356
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE008356
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TACTCGGAGGAGAGGTCAAGGAGACGGGAAACGAGAGATAGAGAGAGGCG
GCGCGTTTGTTCTCAATCCGAACGCCCCCTTCCTCCGACGCTGCCGGCCG
GCGAGGGCCCGTGGGAGGGCTGAATCGGGCGAGAGTTGCCAAGCGGGGAG
AGGAGGGAGAGATCGGGGAGCGGGCACGCCGTACGCCACGCAGCGCGCGG
CCTCGGTCCCATCTCCAGGCGGCGGAGAGAGCTATAACAGCGAGAGGTAC
CAATCCTCCCAGCTTTTACCCCCCAACGGGATTCCATAAACATACGGCGT
GGATAGAGCTGCTGGTTTGGCTCTCTGTACCTGCGCGCGTACTTGCTGGC
GCGCGCGCGGTTCCCCGTTTTTCCTTCTTTCTTTTTTATTATTCGATCTG
CTGCCGTTCCGATTCTGCGCCCCCGTGCGGTTTCCTGAATCTTCCAAGAG
GCGGCGCGCGGAGGAATCTGCGCCGCCGGCCGTGCGTGCGTGCGGTTCCC
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GCCCGCTGTTTCATCGCTGGTTGCCTGGTTTCTCCTTGCTTTCGGTGGTG
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GCCGCGCGCTGGTCGCAGGGCCCGCCGCGGCCACACTGCGTCGGCGCCGT
GCCGTTCCACCAGGCAGGCGCACGGAGGAGGCAGCGTATCTCTAGAAGGC
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TGCGGCGTTGGGTTCGTCGCCGAGCTATCTGGTGATGACAACAGGGAGAC
CGTGAGTTCTATTGACAGAGACGCCACCTGCAGTTTCTCTCTTCAATCCG
CCACCACGTCTGATAATTTTATATTAATTCTGCTTTTGTTTACTCGCCAG
GTCACCGATGCCATCCAGATGCTCGAGCGAATGGCTCACCGTGGTGCCTG
CGGCTGCGAAAAGAACACCGGTGATGGTGCCGGCATCCTCGTAGCTCTGC
CACATAAATTCTTCAGAGAGGTGAGCCTCCTTCTCTTCAAAAGTTTCAAG
CAAAGTCAGTAATCCTTGACACATTTATTCATCTCCGGTGTTTCTCTTGT
ATGTATTCCTTCAGGTGACAAAGGATGCCGGCTTTGAGTTACCGCCGCCA
GGTGAGTATGCTGTTGGAATGGTCTTCTTGCCAACTGACGAGAAGCGCCG
CGAGCGGAGCAAAGCTGAGTTTAAGAAGGTTGGTGGTTGTTGTATACAGT
AGAAAATTTAGAGAGTGCACACCTTGAGACTGTGATCATAACCTCATGAC
TTGTGTTGTTTTTTCTCATGCAGGTTGCAGAGTCGCTGGGGCATTCAATT
CTTGGGTGGCGCCAGGTTCCCACTGACAATTCAGACCTGGGTGAAGCTGC
ACTCGAGACTGAGCCCACGATTCAGCAGGTTTTCCTCACCAAGAGTTCTA
TCTCGAAGGCCGATTTCGAACAGCAGGTCATCCGCAAGTTCATTTTTTTT
TCTGAAACACATGTGATGAGCTTTGTTCTTAACTATTTTCCATGAATTAT
CACAGTTGTTTATACTGAGGAGGCTCTCAATTGTGTCTATTCGAGCTGTT
CTGGATCTTAAGCGTGGAGGAAAGAGAGATTTCTACATGTGCTCTTTATC
TTCAAGGTGCTTCCTTCTTCTGAATTCCAGTTTTTCTATGTTCACGTGAG
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AGGGACAGCTTATGCCGTCTCAGCTTAAGGGGTACTACTATGCAGATATA
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ATACTCTTACACCAAAAGTCATGGGCATAGTCAGCGGATGGGAATCGATA
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TTGTGATGCCTTTAAGTGAAGTGCTAGAAATCTCTATTGGTTGATGTCCA
ATAACCATCTTGCAGAGTCCAGCTGCAGTTCTGGTATGGCTGACTGCTTG
CCGACTCTTCAGGATGTGACCGAAGAAATTGTGTTTGGTTTGAGGTAGCA
TAGGGCTCCCAACTGTTTTGCATGAAATTATATGCAACTGAAGCCTTTGT
ATTAGCATCCGTTCTTCATTTGGAATATAGTTGTTTTTAAATCGTAGACA
TGCAAAAGATGATTATGATATGATTTCTAAAAGTAATATTGGAACAGGTT
CATTCCCGGTTCTCCACCAACACCTTCCCCAGCTGGGACCGTGCACAGCC
AATGCGTGTCTTAGGCCACAATGGAGAGATCAATACACTCAAAGGGAACA
AAAATTGGTATGTGAAACCTTTTCCTCTGGTATATCCTAGATGCAGTCAT
CTCCTTATGCTTTTGCTGTCTGGATTGATGATCCCGTTTGCGTATACAGG
ATGAAAGCTCGTGAGGGTCTCTTGAAGTGTGAGAAGCTTGGCCTATCAGA
GGAAGAAATGTCAAAAATTCTTCCAATTGTAGATGCCACCTCTTCAGATT
CAGGTATGCAGTGCAATATGCAGTATGGATTTTCACTTGGCAAAGGAAAA
AATTTGCCTCAATCTTTTTGAGTTGTTAAGTAAAAACATTTGAATTTAGG
TGCATTCGATGGTGTTCTTGAGCTTCTTATCCGAGGTGGAAGAAGCCTGC
CAGAAGCGGTAATGATGATGATTCCTGAGGCATGGCAGAATGATGTAAAC
ATGGAGCCTGAGAAGAGAGCCCTCTACGAGTTTTTGTCAGCCCTTATGGA
GCCCTGGGATGGACCTGCTCTAATATCTTGTAATTTTCTTAACCCATATC
CTTTTCTGATCATACTCCTGATGGATTACTTAAGCTAACTTGGGTTTCAC
CTGTAGTTACTGATGGCCGTTACCTTGGAGCTACCCTCGACCGCAATGGC
CTGAGGCCTGGTCGATTTTACGTGACACACAGTGGACGTGTAGTCATGGG
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GTAGGCTTAACCCTGGAATGATGCTACTGGTTGACTTTGAGAATCATACA
GTAGTGGATGATGAAGCACTTAAGGCACAGTACTCGAGAGCTCACCCGTA
CGGTGAATGGCTCAAGAGACAAAAGCTGTACCTCAAAGACATTGTAGAAT
CTGTCCCAGAAACTGACAGAGTTGCTCCAAGCATTTCTGGTTCATTTACA
GTAAGTACTTTATATGCTTCAACTTATTGATTTCATTGTGCTATAATTTC
AACTGGATTGTTGGTGAGATCTTGCTCAAACGATAATTAACATAGAGATT
TTGCTTTCTGTTGCAATTTTGTGTAGCAAAAAGATGAGAACAAGGAATGC
GTAGGCATCAATGGAATTGTGACCCCGCTAAAGGCCTTTGGGTAAGCAAC
GGTTCAACATTGTTGATCAGCACTGCTGTTTCGTTTTATGCTGGCTAACT
ATCCAAACGGTTAACTCCAGATACACAGTGGAAGCCCTAGAAATGTTGCT
GCTTCCAATGGCAAAAGATGGAGTGGAAGCTCTTGGATCAATGGGAAATG
ATGCACCCCTAGCAGTGATGTCAAACCGAGAGAAGCTGACTTTTGAGTAC
TTCAAGCAGATGTTTGCACAAGTAACAAATCCGCCAATTGATCCAATCAG
GGAGAAGATTGTTACATCCATGGAATGCATGATTGGGCCAGAAGGAGATT
TGTTAGAAATAACCGAAAAGCAATGCAATCGCCTTGCACTTCAAGGTCCT
TTGGTGTCTATTGATGAAATGGAGTCCATTAAGAAGATGAATTACCGTGG
TTGGCGCAGCAAGGTTCTTGACATAACCTACCCTAAGAAGTCTGGAAGGA
AGGGGTTAGAAGAAACTTTGAATAGAATTTGTTCTGAAGCCCGGGAAGCG
ATAAGAGAGGGATACAAAATTTTGGTTCTGTCAGACAGAGGTCAGTGATA
TATTCCATATACAGTACTTTAAACTTTATACTTGGACCAATCAAGTTTTT
ATGGTACTAGTCACAACTTGCTAAAAACTGCTAGCAGATGGGTCAGGTGC
ACTCATCGCCGGATAGTAACTTGAATATGTCATAGTTTTAGTTAATTCAC
AGCCAGTATTTCCATTGCAAAGTGTTTTTTTTTTTGAGAGGCATTGCAAA
GTGTTGTATGATGGACATTCTTACTTTGTCAGCTTGATCATAGATAGAAT
GTACATTGATGATATGATTTATTTCAGTTTCAGTATATGAAATTTGTTGT
ATTTTCTTGATACAGGATTTTCTTCCAACCGTGTTGCTGTTAGCTCTCTC
TTGGCTGTTGGAGCAGTACATCAACACCTTGTTGCAAATCTTGAGAGGAC
ACGCGTAGGATTGTTGGTCGAGTCTGCTGAACCTCGTGAAGTGCACCATT
TCTGCACGCTTGTTGGATTTGGTGCAGATGCTATATGCCCTTACTTGGCC
ATCGAAGCAATTTGGTGCTTGCAGACTGATGGGAAGATTTCTCCCACTGA
CTCGAAGGAGGAACTTGTGATAAAATATTTTTATGCTTCCATCTATGGAA
TGATGAAAGTTCTTGCAAAGATGGGAATATCTACCCTTGCATCATACAAA
GGCGCACAGATTTTTGAAGCTCTTGGACTTTCTTCTGAAGTGATTCACAA
GTGTTTCGAAGGTACACCTAGCAGAATTGAGGGTGCAACATTTGAAATGC
TGGCACGTGATGCTCTCCGTCTTCATGATTTGGCATTCCCATCAAGAGCA
CCTCCACCTGGCAGTGCAGAAGCAAAGGCCCTTCCCAACCCAGGGGATTA
CCACTGGAGGAAAAATGGGGAAGTCCACCTAAATGATCCTCTTGCAATGG
CAAAATTGCAAGAAGCGGCTAAAGTAAACAGCCGGGAGGCATACAAAGAA
TATTCCAAGCGAATTCAGGAGCTCAACAAGGCGTGCAATCTACGTGGTAT
GCTGAAATTTAAAGATATTCCTAACAAGATTTCTTTGGATGAGGTTGAAC
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TTTTTCCTACTGTTGTGACATTAGTCTGATGCCTACGTTTGTACTATTTA
GGTAGTTTAGCTATTTAGACATGCCTTTTCTGTGTACATAATCACTCTAC
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GATTCAACATTTTTCTGCTTGCATACATCACATACCTACAAAGGGCCTGT
ATCCAGCATCCTTTTCCTATTTGTACCCCTTTAAATTTCTTTGTATTTCA
GATATTTGCTCCCTATACAGTTAAATCTACTGCTATTTGTATCTTGTACA
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ATAACTAACTTTACCCATCTTCTATATGTCATATGGATGTACTAATTCTA
ATACCTCTTTGAAGGTGAGGGAGGGGAACAGCCTTCTCGTATGGAACCTC
TTCCTGATGGTTCGATGAATCCAAAGCGAAGTGCAATCAAGCAAGTTGCC
AGTGGACGTTTTGGAGTTTCCAGCTATTATCTTACTAATGCAGATGAGCT
GCAGATAAAAATGGCTCAGGTACTTGCCAATATTGCGCACTACGCAATCA
CTAAAATGATCTCAGCATGTGGAAATCACCTGTATCCAATATGTTATGTG
GTAGACATTTACTCTTTTGTTATAACTATATATAGGGTGCCAAGCCTGGT
GAAGGTGGTGAGCTTCCTGGTCACAAGGTTATTGGTGACATTGCGGTTAC
AAGACATTCTACAGCTGGTGTAGGCCTCATTAGCCCACCTCCTCACCATG
ATATATATTCTATTGAGGATCTTGCACAACTTATCCACGATCTCAAGGTA
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TTGTTAATGATTACTTATAGATTAGGTTGGCTCAACACTGTAATTGGCCA
ACTCACCTGGGAAGTTTGAATCACTTGATATATGACCCATGATTTTACAA
TTAAACTTGCATGTATGCATATGTCTGCATTTTGCAAATATTGCCCGCTG
ATGTAGTTATTTTCATGTCTGTCTCTTCTTTGTAGAATTCAAACCCTCAA
GCTAGAATCAGCGTCAAGCTTGTCTCTGAGGCTGGTGTAGGAGTTGTCGC
TAGCGGTGTGGTAAAAGGTCATGCAGACCATGTTCTTATTTCTGGCCATG
ATGGTGGCACTGGAGCATCAAGATGGACAGGCATTAAGAATGCTGGACTG
CCATGGGAACTTGGATTGGCTGAGACGCATCAAACTTTAGTGGCAAATGG
ACTTCGTGGCAGAGCTGTTCTACAAACAGATGGTCAGTTAAAAACTGGTA
GAGATGTTGCTGTTGCATGCTTACTTGGTGCAGAGGAATTTGGTTTCAGC
ACTGCTCCATTGATCACACTGGGCTGCATTATGATGCGAAAATGCCATAC
CAACACTTGTCCTGTCGGTATAGCTACCCAAGATCCAGTGCTTCGTGAAA
AGTTTGCTGGAGAACCAGAGCATGTCATTAACTTTTTCTTCATGCTTGCT
GAGGAACTAAGAGAAATCATGGCTCATCTTGGTCTCCGCAGCATTAATGA
AATGGTTGGACGCTCTGATATGCTTGAAGTTGATCCAGAAGTAGTGAAGA
GCAATGAGAAATTGGAGAACATTGATCTCTCACTGATCTTAAAACCAGCT
TCAGAGATTCGTCCTGGTGCTGCTCAGTACTGTGTTGAAAAACAAGATCA
TGGCCTTGACATGGCTTTGGATAATAAACTTATAGCATTATCAAGGGCCG
CACTTGAAAAGGAAGTTAAGGTTTTCATTGAGACTCCGATTAAGAACACT
AATCGGGCGGTAGGCACTACACTTAGCCATGAAGTCACAAAACGTTATCA
CATGAAGGGATTAAAATCTGGAACCATCCATGTGAAACTTACTGGAAGTG
CTGGACAGAGTTTCGGTGCCTTTCTTTGTCCTGGAATTACCCTTGAGCTT
GAGGGAGACAGTAATGATTATGTTGGCAAGGGATTATCTGGTGGAAAAAT
TATTGTGTACCCACCCAGGAACAGTACATTTAGTGCAGAAGACAATATTG
TCATTGGTAATGTGGCTTTGTATGGTGCTACCAAGGGAGAAGCATATTTC
AATGGAATGGCAGCAGAAAGGTTTTGTGTTCGCAATTCAGGTGCTCGAAC
AGTGGTTGAAGGAATTGGTGATCATGGATGTGAGTACATGACAGGAGGTA
CTGTAGTTATCCTTGGTAAAACAGGAAGAAATTTTGCTGCTGGCATGAGT
GGTGGCATCGCTTATGTTTATGATGTTGATGGGACATTTAGTGCCCGCTG
TAACCATGAGTTAGTTGATCTATATCATGTGGAGGAAGAGGAGGATATTA
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AAAAGGCTGCATCTAGGCACACAAAGGAACCTAAAATGCCAAATGGTGTT
TCTGTGACAACTAAGGTAATACTATGATTGAAATCTTTATTCTACTTCAT
AATTGCAATTTTCTTTTAATGTATACATGGATAAAATGTTCTCCATCTGT
ACAAGTTTATCCATGAGAAATCACAATGATATACTACTGTAAATTGTTTT
TGCCCTAATTAGATAAACTTTGTTCAGAAAATACAAACAGAGCAGTCAAC
TAGCCGACCAACAAGTTCTGCCAACGCCAAAAAGTACCGAGGTTTTATAT
CATACGAGCGAGAGGGTGTTTCGTACCGTGATCCCAGTGAACGTGTTAAA
GATTGGGATGAGGTTGCCATCGAATCAGTTCCAGGGCCGCTACTAAACAC
GCAGTCTGCTCGTTGTATGGACTGTGGCACTCCTTTCTGTCATCAGGTGA
CACACACTTTTTATCTTATTTATTTAATATCAAACACTTTGATTGGATTT
TTGTAAGGTTAAGGGTTGATATGTTTAGCTATTCAGCTTTCAAGCTCAAG
GATAATAACTAATACATTTTTATATCTTATTGAGGAAAAGAGGCTCCTTG
CTGTCCTTGATCACAACTTGTTCAAATCACTACTAGCTTGTTGCATATGT
TTTTATTCAAGACTAGATAAATAGCTAGCCATATCGTTTAGTCATATATG
CCTTTTGTGGTGATACCTCTGTGGTGACTACATATGAAATTTGACCAGTG
TTCCGAGCCATTAAAATGCTAATACTCCATGATTGTTTGTACAGGAAAGC
TCAGGTGCTGGCTGTCCTCTTGGAAACAAGATCCCAGAGTTCAATGAGCT
AGTTCACCAAAATAGATGGCGAGAAGCACTGGATCGTTTACTGGAGACAA
ACAACTTCCCTGAATTTACTGGACGAGTGTGCCCTGCTCCCTGTGAAGGG
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TGTTTTCCATATTTTAATATACTTTGCATTTAGTAGGTAATATTTGAGTT
GCACTTGCTGAAAGTACGCTGTTCCTTTTGCAGAAAGAAAATCGCCATAG
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GGCCATTTCGTAACTGTGTTTGAACGTTCAGATCGTATAGGAGGTCTGAT
GATGTATGGTGTACCAAACATGAAGACAGACAAGATTGGTGTTGTTCAGC
GCCGTGTAAATTTAATGGCCGAAGAGGGTATTACGTTTGTGGTTAATGCC
AGTGTAGGCAGTGATCCTTTATACTCAATTGAACGTCTCCGCTCTGAGAA
CAATGCAGTTATCCTGGCTTGTGGAGCTACAAAACCAAGGTATCTACATG
GAGATGTTAAAATTAGGATTTTTTTTATCTTATGTTACAGAAGTTCACTG
GCAGTTTTTTTTATCTTACGTTACAGAAGTTCACTGGCAGTTTTTTTTAT
CTTACGTTACAGAAGTTCACTGGCAGTTGTGCTTTCTTATCTTTCCAAAA
AAGGAGGGGATGTGCTTTCTCATAGATGCAAAATAACGTTTACTTTCTTA
TATATGCCTTTTTTATGCTAACATTATGCGGGATATCCTTGAACAGGGAT
CTCACTATTCCAGGCCGTGAGCTATCAGGAGTTCATTTTGCTATGGAATT
TCTCCACGCAAACACCAAAAGCTTGCTTGACAGCAACTTGGAGGATGGTA
GATACATCTCTGCCAAGGGGAAAAAGGTGGTGGTTATTGGTGGTGGAGAC
ACAGGCACAGATTGTATCGGTACATCTGTTAGGCATGGTTGCAGTAGCGT
TGTAAATCTGGAGCTGCTTACCAAACCACCAAGCAAGAGAGCTGCTGACA
ATCCCTGGCCGCAGGTAAATATGTCAGTACGTGTAATGATTTAGTCAGTA
CTTCTTGCAAAATAAAACCCATTTGCAAGAAAACAATGGAATATTGCCTT
GCATATGTGAATTGCCATATCATTTCCTGCTCCAGTTAAGTTCTTACGCT
AGCATTTCCTATTGTTGCCTGCAGTGGCCACGTGTCTTCCGCGTGGACTA
CGGGCATCAGGAAGCATCTACCAAGTTTGGAAAGGACCCAAGAACTTATG
AAGTCTTGACCAAGCGTTTCATTGGTGATGACAATGGAAAACTGAAGGCT
CTTGAGGTGGTGCGTGTGAAGTGGGAAAAGGTAGATGGAAGATTCCAACT
GAAGGAGATCCAAGGATCAGAAGAGATCATTGAGGCAGACCTTGTCCTCC
TTGCCATGGGATTCCTGGGCCCTGAAGCGGTTAGTTATGCGGCCCCAGAT
GCCTCTGTTTACCTTCATGATAAACTGTTTGACAAGAACCAACTCACTGT
TTATTTCTCTGTAGACTATCGCTGAGAAACTGGGTTTAGAGAAAGACAAC
CGGTCCAACTTCAAGGCCCAATTCGGACACTTTGCAACCAGCGTGGACGG
TGTCTTTGCCGCTGGGGACTGCAGACGTGGACAATCACTGGTCGTTTGGG
CCATCACCGAGGGACGGGAAGCTGCTGCTGCTGTCGATAAGTACTTGTCA
AGGGATGAACCAAATGCTGCCGAAGACATCACTGCCTCTGGTGCAGGTCT
TGTTCAACCAATTACTGCATAAACAACACAGCCCTTATATAGATTTTTGG
GTGCTGATACCAACTTAATTAGGGTCGGTGGTTTTATCTTTTGATCATAG
CCCTTTCATACTTTGGTAGACAAACAATTGGAAATTTTGGTTGGCTATTG
TTTCTTGGCTCATTGTTTAGCTATAATGTTTTGCGTGCCGAAATGCGGTT
TTGTAGCCTGAATAATGTACAGTATTTTTGGTTAATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.