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GrainGenes Sequence Report: AE016924

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Sequence
AE016924
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE016924
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AATAGAGCCCAAGTCAACGTCTAGGAATGTATGCGGACACAGACGGGCGC
ACCCCCACCACGGACACCGGAGCGCAAAACCTCCGCAGAGTCCACACCCC
TCGTACCCTCGCCGGAGTAATTAAACCCTAAACGATGGGCGCAACCGGTG
TAGCCCCCCTCGTCATCTTGGTGTTCTTCCTCCCCGTCCGCCTGCTCTCC
CTCACCTTCGGCATCTGCCTCCCCACCTTCCCATCCACCGCCCCGGCCCA
CCGCGCCCGCTCCGCCGCGGTGCTGTTGACCACAGCGGCCCTTCTCACCG
TCATATGTGCCATACCCGCCGCGGGATCCAGCCTCGCTTCCGAAGCCGAG
GTCCTCCGGTTGGAGATCAGCGAGCTCAGGCTCAAGCTCACGCGGTTGGG
TGAGGCACTTTCCTGCTGTCACTAATGCTATCGTTCTCCCTGCTCGGGGT
TCAGTTTCATTTCAGAGTAGCAGGACGTTTAAAATGGGTTGTCTCATATG
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ACTGTTGACATTTTTCAACTGAAACTTTTTAAAAATAGTTCTGACTTCGC
TAAATACAACTATATCTCACTTATAATTTCAATATACGTTTGGAAACAAC
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GTGAAGCACACAAAGACGATGCTTATGATTTACTGTAATATGTCAATGAG
AGTTGATTTTTTTAATTTTTTTTCACTTTATAGTTGTGATTATTAAGTGT
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GTCACCCTCTCAAATATATACAGTGGTTTACAAATTATGCATCTTTTGGC
CATTTATTTTCTACTTTCTACTTCAAGGGTACAATTCACAAGCTTCCAAG
CTGTACTAAAAAAGATAATTTATTTGTTTCTGAAGCTTTTTTACTAATTA
ATCCAATGGTCTTTGTGCATTTTCATTGATTAATGTATTATCCCTCAATC
TTTACAAAATTCATTCGCATCATAGAATCTATTTTGGAGGAAAATACAAA
AACTTTGAGGAGTAAACCTTTCATTTTGGAAGTGGACAACAAACTTACTG
AAGCAATGGAATATGGCGTCCAGCTTTTAATGAATGAAGAAGAGAGTTCC
GAGGTATGTGGTTTGATCAGTAAGTGTCGAGGTGTTGAATTAGTCTGCAA
TGGCAACCTCATACCACTTAAAATAAGTAAACATTACATGTGCAGTTATA
TCTTATGAAAAATCATTTTATTTGAGGTGGAGTTCGTTTAATTATACTTA
TAAATTAGATAACAGATACACCATGTTTCCTCTGTAGCAAATGTATGCAG
TAGAATTTTCATATTGCTTTCCAGAGGGAGTGTGAGTTTGTCACAGGAGC
TACATTAGCTTCAGCAAGATAGTACAAGCACACAAACATGTACTCGTCCG
AAAAAGGATATCGGAGATTTGTCTAGATTCGCATGGAACTAGACGCGTTT
TAGTGTATAGATACATGCAAATCTACACAAATCTCCGACAACATTTTTTG
GACGGAGGGAGTAGAAGATTTTTCTTCTTCTAAAAACAGTTTTATGGATG
TATATGATAGATTGATATTCTGGTGTGCTATAGTCTTTTGAAACAATATG
ATCTCAACACTATTTTTTGTTTTCTATTGATGTTAAAAAATTCAAGTGCA
TTTCAAGACGCCGTGTTTATGTGAATTTGATACATCAATGAATGTGAATT
TGCTGTCTTGTGCTTGATACCATCAAGCATCACTCTTCAGCGCTTGCTGT
GATGGTTTTTATGCTCTCTCATAAAGAAATATTTGCGTGAGATGATAACT
ACTCTTGTTTCTGGATCTTTCTTGTCAAATGATGTCTATAGTTAATTTAC
ATCATTTTCTTGCATGCACTAATATCCACACTCTCCGTGTACAGAAATTT
CAAAGCAAATTCTACTCAGAAAGCAACATTTATATAATGGAAGATGAGGT
ACATCTCTCCCTCTCTCTTGTGAATCAGGTTTAAAATTGATATGAAATGG
GAGATGTGTATTTTCCCACATGGAGTAGCTTCTTACAGATAGAAGGGTAT
ACTACAGATAATAATGTATGCATCTGTTCCGTTGGCCATTTTGGAAAGCT
GGCTAAGATCATAATGTTTTTTATACTAATAAAATACATAAGCCAGTTGC
AGTGAACTATCTCGGAGAACTCTTCATTCAACTCATGGCATATATGCTGT
ACAGGTGGAAATCCTGCAGCAAGAGGTCAGAAAGATAAACACCATTGCTT
ACACCATAGAATCACTGGCAGTTGATGCCGAGAAAAGGGTAGAGTTCCTG
AGCTCAGAAATCAAAAAGGTATGCCCTAACTGATGTTCTTGTGTAGACAA
CTTAGTTTATATTTCTCCACTCATGCTTCCTGATATTTTCATGGGGGAAC
ATCACCTATAGCAATGGTATTAAAGAAATCTGAAGTGTCTATTTGTAGCT
GTAAGATGTTATATGCTATGATGAACAGATAGCTACTTCCATAACTACAA
AATTTGTTCTCACAGGACTCTCTTTCCTGTTTTTTTATATATTGTGAAAT
AGGAGATTTAAAACTATGCATGACATTAGAAGGAAAATACATATGCAAAC
AATTCAAAATAGGACTAGTATTGGCTGGAGAAATCGTAATTAGCCCCTTC
CACCTACATCACACCAGTCTGTTCTGTTGCCTCCACCTTGACATTTCAAT
AATCGCTGCTGTCAATTTGTATTTTTTTTCCAAAAAGTGCTTGCATTTCT
GGTCCTTCAATGTTCTTAGCAGTCTAAGATCACCACTGCCACAGCTCACA
TTGTCCCAGTTGTTGTGCTTGACAGGAGTGATAGGAAACTATGTCAGTTA
GAGGATCATGATTACTAGTTGAAGGGCAAAATTATATGTGTGGTGGGGTA
CCTTCTATAATAGGTTATCTACTGCACTAGATTAGAGCGTATTTAATAAA
CTGATATACATTTTCCTGCATGATTGATCACCTCAGTTTTTATGTATGTT
ACTACGCCTTTTTTAAACAAATGACAACATTTATTTTTGCTATTTTCAAA
CCAGATTGATAATATAATTGCAGAGCAATGGATCCAAATTCGGCAATTTG
AACAAGCATTTGTGTTAACTAAGGTATTCATGATTTGTTTTCTTGTGCTA
GACATGTTTTGAAAAACTGTTCATTTGTTGAGTGAAAATAACGCAGACGA
TGACTTCAGAAGTTTACGCAAGAAGGTTATCTGCGAATGCCTACAAGTGG
TCAGCAAAAGACATAGTTTTGAAGGTACTTTTGCAGTTTGTACAAATTAG
TGTTATTATAATGCATGATTGCAATCCATTTGTAGACAGTAGCTGCTACA
TCTTGGAGCTCAACTCTAATCTACATGATTTGCGGAAAATAACTCCAATC
ATATGTATAGTAGTAGTATAGTATGTTTTCTTTGCTGAATTTTGTGCTTT
TGCTGCATCATTTAAATCCTGTAAGTATTTCAATAACTTAGATGCAAAGA
GGCTGAAGGAAGTTCTCTTTCCATCCCAACTAAACTAAGTGAAAAAAGGG
GTCTTGAATGCGTCTTCTTGCTCCAGCATTCAAGTTCCATTTCAAGGGAG
GACGTTGTACCATCATACTTTCTGTTTTGTCGGGTGTGAACCAGTCTTTT
GAGAGTAAAATATAAAGTAATATCTTGAATCATGTTTAACTGTTTCAAAA
AGCACGATGAGCATCACAGAAGGACACATCCCCAAACAAAACACTAGCGA
CCATAAGGGACACCAAGCCATGTGGCCAACAGAGCAAACAACAGGACACG
GCCAAGCACCACAATCAAGGACACCCTTGCCACGCTGAGACAGCTACACA
TGCTCGTCAAGTAGGCCAAATCTAGTGATACAATAGTCTCAACAAACATT
ACATTGTTGAGTTTTACACCAAGTTCTCCCACCTCCATAAAGGCACTGGA
AGCTCTGTTGGACTCTGGATTCTCCAACACCTACTACAAAAAGTTCTTCC
ACCACGAGGCACCAAAACCTCCATTGGACCTTCCAACACCTATTGCTCCC
TTGGCAAGGGGTCGAGCTAGAGCTTTACACCAAGAGGTTGATCTTTTCCC
TGAGGCCTGTGCATTTCACATAGAAAAGGATGGTGGGCTACCCAATGGAT
GGACACTTTCTTTGCTCAGGTGTGAAGGAACACACATGGGGAGAGTAAGA
AGAAGCAAGTCCTCCATCCGGTACTTCTGGACATACCTGGGAATTATCAA
ACTCGACTGTGAGCCCCTGCATCTCCAATCCTACTTCTGAATCTTCAGGC
CGCGCACCTGGAGCGAACGGAATGAACAGAGGCCCTCCACGACCACAAGC
CCCCTCGGAACCTCCGAGTCGCCTACACGGAACCACAAGACATTAGTGAG
CCTCCCCACCTCCCAGATCTTTTCAGAACGTCCGAACCACACACTTGCAA
TCACTAACCACATCTTGAAGAATCCCTATGTCAAGAACAACCGGACCACC
GCCCGGAACCTCCAGATCGAGCCCTTCCGCTTCTTCCCTTAGACACAGAT
ATGATGTTTAAACTCGTGAGAGCCAAGTACCTCGACCTCCAGGACTAAGA
CCTCTAAGGAGAATAACTCTTCCTCTTGTTCAACTTCCGCTCTTGGATTT
GATTGGATAAACGGATCGGTTGAGGGGATTTGTTTTCAGTTAAGAGCTTT
TCTTGACTTGACTTCATCTCCGAAAGGCTATCGAGTTGGAGTATGTTGTC
GGTCGGTCTTGATTTGCTAGTCTAGTTATCCTTCCAATTCGTGAAGATCA
AGAGCCCCTCCGTAGCATACAACGTGACCCGCACAACTGTTAAGGAGTAC
TAGTATTGTTCTAGGTCTCTAGGAGTCCGTATTTGTCTAGATTTACTTTC
TTCTACCTCAAGTCAGATGTACTATATATTGTAGCCTTTGCCCCCCTGGT
AATACAAGTTACTTATTTCTAACATGGTATCAGAGCCAGGTTAGGGTTTT
TACCGCACGTCGCAACTCCATGCTGAATCTCGACCAATTTTTTTCCATTC
CGTGCGTCATGGCTGCGCTGCTTATTGCACTGCTTCTCCTTGTCACTCCT
TGCGATTGCTCTGCTGGCCTACTGCCGGTTCTGGTTCCTTCTGCCCCATC
CAGATCGACTTGGTCGGTAGTTCCGCTCACCCAGATTTCTTGGTCAATTC
CTCATAAGCTACATACACGCAATCTTCTTTGGCTGCTGCAGATTCCACAT
GGCCGTCCTCCAGGTTGTGGTATGCTTGTCTCTTGCTGGACGTGGCCCGT
TGTTTATTCTCTCCGCTGCTTCTAGCTCATTGTTGTAGTGTATAAGTGGA
TTGTCTACCACTTTCCATCAGATCGGTCTTTTGGAATAGTTGGTTAGTGC
ATGAAGCTTGACATGGTATCAGAGCCAAGGTCTCGAGTTCGAGTCCTGTG
TGGCGCAAATTTTCCTATAAATTGCTGGTGCCCCCTCTGTCCACATATTG
GCCTCTTGTGCCATACCTCTGAGTTTACACGTGTTGACTTTTCTTCCCTT
CACACATGAGGAGGGGTGTTGAAGTGTATAAGTGGATTGTCTACCACTTT
CCATCAGATCGGTCTTTTGGAATAGTTGGTTAGTGCATGAAGCTTGACAC
TCATGACATCCAGTTCGATCTTGTATGCACTGTGGCTGTTTTTGCTGCTT
TCATTTTTTGGGCCGCTTGCTGTTTCTTTCGGCAGTTCTGTCTCCAGATT
GATTCGGCAGTAAAAAATAGTGTCAGTTTGTGTCGTCCGGCACGTCTATT
TCTTCACTCTCCGGTGATTTTCGATGGTGTCCGTTCCAACTTATCTTTGC
ACGTTTGCTTCCATGCTCCGTGCTGTGTTTTCCGCTGTGTCCACCAAGTT
CGTTGTTATCTTGTGTTTCTCTTGTCATGCGAGTGCATCATACCTTTATC
GTCAGCCTGTTTTGCATTGCTGGTTGATCTACGCCCTTTGTCTTGTCGTC
GAACTTCTTTCGCTGCCGGTTTTCTTGGGTTATGATCTGGTGCGCAATGC
TTGATTCTCTTGATGTGCCATCTTTTAACAACCCATCTTCTCTTTATGTG
TGTGTCTTTCTTTTGATGTGCCGTCTGTCTCATTGTCTTCATTGATCTAC
GCACATTCTTTTGCCTGTTGAGTTTCTATTGCTGTTGGCATCTTGTGCTG
TGATCTTTTGTGACATGTTGTTCTTCTGACCGTCTTTCGGTCTGTGTGGT
CTCGTCTTCAATTGAGGTTTTGAAGACTCTTGATGCTACGCCAACACTCT
CAAGACGCGGATTCTGGATTATCATTTTTTAGTTTTACACCTTCAAATGT
ATGCTACTGCATACGCTTTGCATTGCATTTGAGGAGTATTAGTATTGTTC
TAGGTCTCTAGGAGTCCGTATTTGTCTAGATTTACCTTCTTGTACCTCAA
GTCAGATGTACTATATACTGTGGCCTTTGGCCCCCTGGTAATACAAGTTG
CTTATTCCTAACAACAACAACAGTTAGAGACACCGACAAGCTGGAGCCTG
GAGGAGGAGCACAAGGGACACAAATGCTGTGAAAGCACCTGTCAAGTACC
TCAAAACCCCTTTTATGCCCAAGAATCTGCACGACCAAAACAATCGCGGC
CGCCACCATAACAAGGAGAGAGAAGTTGTATACCATGGGATGGATGGATC
TCATCTCCTCTATTTCTGATGGCGTTGACAATACACCACTTCTGTTTTGC
CGTTAAAAATCCTCGATATTGTCGTTGATGCTGCTTCGGACCGCTTTTCT
GGTTCCCACATGACTCACCAAGCACATGTAGCCTGCTTTAACTTTTGGAG
CTTCAGCTCCAACTTCCACTACCTGCATGCTAGCGGCAACGCAGCATGGC
CAAGCCACCCACAACCATAGCTATACAATACAGCCATACACATCCCACGA
CTGCCAATCCCAATATCCATGCAAGTCAACCCTTCTTGTTCGCACAAGCG
AGTCAAAGGCCCTGCCATACCCTCGGTCCAGGACATCCGCAATACCAGGT
CGCTGGCCCGACATCTGAATCCGTTGTAGACACCGCCTTGCTAACCCTTC
AGGCTGCCGCCTCGTCCTTCAATGCTCGATGGATCCAATGCGTGCACCAT
TGTCAGCCTGCCCTGACGTTGCGAGAAGGCACAGTAGAAGCCTCCCTAGA
TCTGCATGTTATTGGCCTGGAATTAGTTTGTTTAGCCAGCGTTGTCGACC
TAGAATATTGATTTGCCCTTCGACGAGGTGCTGGCCTGTTTGGTTTGTCT
CCTTTTCTTCCTAGGCATGAGGTCCATTCATTGATTGGAGGTATATATAC
TCATAGCGGCGTGAGCCATCACGTCGACCACTGCTCCCTGAAGTGTGCTA
GGAGAAAGACCCTTGGCTTACGAGAGCTGGTAATAACTTGTCTGCGATCA
CCTTCTTTTTTTGGTGGCGGATCTGCTGGTTTAATGTGCCACTTGATTGG
TGGATTGATTGGCATGTTGTGCCCAAAGCATAGATCTTCTTTGTTCTTGC
CGCCAAACTGTGGGCATGTTTGTTTCAGTCTAAAAGAGGGATGTTTGTTT
CTAGCTCTAGCTCCAAACTTTGGCCAATGGATGAAGTATCTTGGTCTCTG
GCCCAGGGCCATGATGTCATCTCTAGGCGGGAGGGCAATAACATGCTCTC
CCAGCCCTGCGGCAGTAAAGCTAGCACATGCACAGTTAATCCCTCGTCAA
TTGGATGGGCTCAGCCATGTACAACCACTTGCTTGATGCCGGGTATCAAA
ACGTAAGCTTGCATTTAGTGGGCACCTATAATAGAAATATTGTGATCCTA
CTTAGAGTCTGCAAAATGTAACTAAGCAGGATTTGTACGAAGTATTTCAT
CAAAGTGGTGAAGTTGTACATCTTTGCCGCTAAGTGGGTTTTAGTGTTAA
TGACAAGTTATTAGAGACTAATTCTACTCATGAGCAAGTTTTAGTCCGAT
GAATTGTAGAAGAGGAAAATAAGACGATGCTCTAAATATATGCATCTTTT
CATCAAGATTGGGTCATAAAGAAGCTATACTAATGATAGGGTTTTCGATG
AAGTACAAGGAATGGGGATCTATGCCTAAACACAATCCTGGATACACTCA
AAATAAATGTGAGAAACCACCAAAAAGGTAATCTATGTGCTGTTGTTATA
CAAATTCCGTGGCCTGGAGTTCGGCACAGAGCCTCCAGGTGACTCTAGAG
CCAAATTAGAATCCTCCGCCAAGTTCTGCATCGTGCTTGTTGCTCTTGGA
GTTGTGACCATTCCTAGACTATACACCGAGAACATGATTTCCACCTCAAA
TGTTGCTGTTCTTTTCGAATGTTGGGCATTTGACAATGTTCATAGACCGT
CATACTTATGCTTAAATGGAGTTCAGTGGCTAGTTTGGAGAGTGTGTATA
TAGACTGGCTCCACAAACCAACAGAAGTCCTTCCAACGCAGTTTGTATTC
ACTCGTGTGCACCATGTGAAACTTCTCAGGAGGTTTTTCCAGAGCAGTTT
GAATTCACTTATGCTCACCATGGGAAATATCCCAATATTGCTCCCAGCAA
AGCACGATTAACTGAGAGGTTCTTAGAGATGAGCTTCCGGAAAAAAAGAT
ACATCTTGTTATTATGATAGTACTATTAACCCTTTCGAGCCTTGGGCCAG
GATGTCACAGATTGTGGAGACAAGGAGATTGATAGATTATGAAAAATAGA
TTAAGGCATTGTGTGTGATATTGAGCTTTGGGCAGTTAATATAGAGTTCA
AGACTTGGAGGACACGAAGCCTCTCTTAGAGAAGGTAGGAGATGGATTAG
GAATCATATACTACCAAATACACATATCTCAAATATGAACAGAGATCACA
TGGGGAGTAAGCATGTGGGGATTTAATACTTATTTTATCTTGAAGCAAGC
ATGGTTCTGTTGAAGACTAACTTAGTGTGTACTTTTCTAGCTTTACAAAA
CTTTGTTTTTATTGAAAATGACGCCTTTCAACAAGTTAATTATGCGCTGT
AATATGTTAGTTACATTATTTTGAATTTGGTCAAATAGTTCATGATATAA
ACAACATTGAATAGGTCAACAGAGTCTGTGTCAAAAAAAGAAAAGAATAG
GTCAACAGAGAAAATATCCGCCTATAATCAGAATCCTACGTGGTTATGTA
CTTATATAGCATATCGAGAAGTCATTTGTTCCTATTCTAATATTTCTATC
TTGTTTCTTGACGTTTCCATCTGCAGTATATGAGAAATATTGATCTACAT
GATATGTTTCTTGCCGGGGCGTCACACTCAAGGACCTGTGTTTCTTATAC
TTATAAACAATGCAAGAATTTCAATGAACCAGTGAACAGATGCTACCATA
AGGTACCTAACCGACTAGTTTGCCATCTTTGTGCGACTATATATGCGTTC
GCTGCATATTTATTACCCATGTGCTTTGCTAATATTAATAAGCATGAAGT
ACAAAATGCATGTGCTCAGTTGTGCATCAAAGATAGACAACATACCGTTA
AGATAGAACCTGTCAAGATTGTTGGATAACCTTGAACATCCTTCTCTGCA
CTCATGAAGTTTGTTTTCCATAACTCAAACAGTTACAGAACACTTACTGT
TGCTGTTCTAGCAGTAGTGGAGGGTTAGCAGTAACTATTGATCTCTTGCA
AAATAGTTTTGTGCCACACTTTTTTGGGGATTGTGCCATGCTTTCTGAAA
TATCTTTACTCCTTATAGGCTTCCCAGTTCAACAAAGCGATACGGCGCCA
GTGCTCTGCTGATGTTGATGATAGGCCTAATGCCTTCTTCTTGGGTGGAT
CCATCTCAAGATCATGCATTTCTCTTCCTTACAAGCAATTCAAGATTTCC
ATTTCATCAGCACAAAAATTCCACCATAAGGTGCCAGTTTCTTCTCTTTA
TTTAAACAATTACCGTATGTGTTGTGGCATTAGTAGCACAGAAGTTGCCA
TAGCTATAGTTACAGTCCAGTTCAATTATTACTGCAGGATTAAACAATTA
GGGAAAATAGGGTAACGTGAGTTAGTTTAAATAGGGTCCTAGTAGTTGTG
TACTACAGGTCTTGGAGTCGGTAATGTGCACCATGCCCCCTGGCGGCTGG
TCCTCCTGTAATAGGATGTGTATCTCGTCATCTCAGTGTGTTTCCATTGG
ACTGGAGATTTTATCCCTCGACAGAAGGTTCAGTTATGCTCACAGAAACT
CTGTCACAGTTTGTACAGTCTGGTTTCCAAATTTAAGTCATCCTAGAATG
CATTTCTTCAAACAATATGGAAGCCGCGTCATTGTGTAGGAATTGGTAAG
CTACAATTTCTGTATACTATTGGCGTTGGGTAGGATTACACCTGGAATAC
GTTTGTATTCAGAAAATCAGTTGTAGCTATAGAATTCGACCTGGATATTT
GTGTGATGTATACTTGACTAATTACACAACATACAACTCAGTCATCTGTT
AAGTCATTCGTCATATTTATATTTGCAGGTCCAAGTGTGTCTTGAAGGTG
CAATGAGATCCAACAGATATAGTAGACTTTTAGCAAGCGAGGTGATCACA
TCCTTGTTGGTGAGTATTTTGCATATCCACTCTGGTTTGGCGTATTCTGT
TGAACCATACTAATAGGAGTCCTTGATCAAACTGCAGGCTTATCTCGTCG
TAATATCTCCAATCTGGATTGCATGGTTCCTTTTTTCATGGCGATTTGGC
TCAAAAATGTGAACATCTTGCTGGAGTTGCGCAGTTTTGTCTCTCTACTT
TCGCCTTGGATAGGTATAGAAGAGTTAAAAAACCATGTAAACATGAACTA
TAGGCTGGCTTGGTCTTGCAATTTTTTCCCCTAAATCCTCGAAGAAAAGA
GAATTATTCAAAGTAAACTGTGGCAAAAAATCAAGGTGAATGCAATAGAG
GGCAAATCATTGAGTACCCCACTTAATCCCCTCTAACCCAGCCCAGCCGT
CCGTCGTCGAGGGCCTCGACGTCGAGTGCACCGCCCTTCAGGTGCTGGGC
AAGGCTGCCCTTGGTGGGGACCAGCACCGTGATGCCGTCTCGAACGCGCT
GTTCCCCGTGGCCTCATCATCCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.