Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE023861

[Submit comment/correction]

Sequence	AE023861
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE023861
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCTGTTTGGTAGAGTGGACTCGGCTACTCTGGCTTCCCCGCAACAGCGGC ACAAGCCTCCCCTCTCTCTCCTCTCCCCTGTCCCCCCCATTCTCTTCCCC AAAATCCGCCGAGTCCCAACGCGAAATCACGACCTCTGCGCCTCGCGGAT TGCCGCGGGTTCCCCATCCGATCCCCTCACCAGGTTCGTCCCTCCCACTT TTCCCGCTTAGATTCCTGCGAGAAGTCCCGTGTTCTTTCTCCGGAACAAA AAAAAACCGGGCATCGTTTTCAGCTGTGCCGTCTGTTTGGTTTTCGGCAG GCGCTCGTTACATGGATTGGAGTTGCTGGGATCACGCTGCGCGCAAGCCC TCGTGCTGAGCTGGTTCGCTCCGGCGTGGCTGCTGTGCTCTGGTCCGGTT TTGGTGGACTGAGTGGCCGTGTGGTAGGTTGTTCCCGGAGGTGATTGCCT GATTGGGGAATCCTGGAAGAAGGTGGTGGAATTGGAGTCGCTAGACTGCC TTAACTCCGTGAAAGATCAGAAAAATAATACGGTATTATGGCTCATGGGA GGTGAGCAGTTGGGTTAGAGCATAAGGTGGGGGATCAGGAGAATTCTGTG TAGGAAGGGGATGGGAGGCCTCTGCTCAAAGGTCTCAGCGGTGGACAAGT CGCCGAGCGACACCGCACTTGGCCGGGACCAGATATTCGACCATGAGCCG GTCAGGTTGAAGGAGGAGAAATCGTCGTCGGTGTCCGAAGAGGCCGCGGC GAAGCGGGTGGAAGAGCAGCAGTCTTTCTCCTTCTTGGAGAGCGTCGTGC CTGGCCTTGCTGGTTACAACGGTGCAGATGCTGGACACACGGGGTCCAGG ACGCCACGGTTGGCTCGGACATTGTCGCAGAAAGCTGTTTTGGGCAAGAC AAAGGTTAGATGAATTGTTGTGCCGTTGGTTTTAATCTATGGTGAACTTA GCTTGTTAGATTGTAAAATTGTAGTGATATGGTGTTCCTCTTCTGTCATA TGCATAGACACTATGTATTTTCTTTTATCGCAGTAACATTCAGGAAAGCT AGTCAGGTTCTGTACTACGAAGAATAATTGGCTTCTTACTTATTAGCAAC CTCATGACATAATAAAGAATTAATTCACTCCAAATACCTTTCTGTCCTTG TTCTAGTTGGTGCATGTAGTTGATTCTAATGAACACATTATGCCAAATTC AACTGTAGTCGGTTAGGGCCGGTCCGTGGACTTCAGTTTGGTCGTATTTA TATAATTCTATACTGTACCGTGTAGCCTGGATATTTAGTGTTCTTTGGCA GTGCTGATATGCTAAAGCAGGGAATTATAAATGATAGCTTCTATGGCTAT ATAACACCCACCCCTGTTCTTAGAGATTTTAACAACTGGTAATTGATTAG CAATTGCCAGTGGTTTTCAGAGATAAATAGTGGTGAATTAAGTGTGATTA ACAGTTTTCTGTAGTTACTAATTTTAATTGGTCGAGGAGAAATAACTCAT ATAACCTTATAGAACAAACCGAACTGCCAGATGTATCACTTCGCACAGAA TGAGCTCGTCCTTCCTGGCTACTTATGCATGTTTAGTGCAAGCAACAAAA AGTTCCCCAACTTATTGATCTTCTCGGGCTTAGATAGCCATCACTATCAT GCTATGATAATTATTATGTAGTAGCTAGAAAGATGCAAATATTTGTGTGC TTTTCCTACTATAAGGATCACTTTGGTTTCTGTATTTGTACAAGATGTTC TCCTGTCTTTGCTCTTCTCCAGTGCCGGGAGTCTTGATTCTATGAGCGTT GTTATGCTGCTTACTGGTTGCTTTGCTATATTGACTATTGAAACAGGTTT CAGAAGTGAGCATGATTTTAGGTAGAGCTAGCACTGCTGGGCTTGGGAAA GCAGTGGAGGTTCTAGACACACTTGGTAGTAGCATGGCAAGTTTAAATAC TAGCAGTGGCTTTGTGTCAAGTGCTGGAGCAAAGGCAAACAAAATGTCTA TTTTGGCATTTGAGGTGGCAAATACCATCGTTAAGGGTTTTCAATTGTTG TGCCGTTGGTTTTAATCTGTGGTGAACTTAGCTTGTTAGATTGTAAAATT GTAGTGGTATAGTGTTCCTCTTCTGTTATATGCATACACACTATGTATTT TCCATCGCAGTAATATTCAGGTAAGTTAGTCAGATGCTTTACTATGAAGA ATAGTTTGCTTCTTACTTATTAGCAACCTCACGAAATAAAGAGTCCATTC ACTCTTCTGTTGGTCTGTGTAGTTGATCCTAATGAACACATTATGCCAAA TTCAACTGTAGTGGGTTGGGGCTGGTCCGTGGACTTCAGTTTGGTTGTAT TTATATAATTCTATACTGCACAGTGTAGCCTGGATATTTAGTGTTTTTTC GCGGTGCTGATATGATATAGCAGGGAACTATAAATCATAACTTCTAGGGC AACTGCTTGAATGAGTATATAACACCCACCCCTGTTCTTAGAGAGTTTAA CAACTGGTACTGATAAACAATTGCCAGTGGTTTTCAGAGATAAATAGTGG TGAATAAAGTGTGATTAATAGTTTTCTGTTATTACTAGAACAAACCGAAT AGCGAGATGTATCACTTTGCACAGAATGAGCTCGTCCTTCCTGGCTATCC TATGCAAAGGTTGTTTGGTGCAAGCAACAAAAAGTTCCCCAACTTATTGA TGTTCTAGGTCTTAGATAACCATCACTATCATGCTATGATAATTATTATG AAGTAGCTAGAAATATGCAAATATTGTGTGTGTTTTTTCTACTATAAGGA TCACTTTGGTTTCCGCATTTATATGAGATGTACTCCTGTCTTTGCTCTTC TCCGTGCCGGGAGTCTTGATTCTATGAGTGTTGTTATGCTGCTTACTGGT TGCTTTGCTATATTGACTATTGAAACAGGTTTCAGAAGTGAGCATGATTT TAGGTAGAGCTAGCACTGTTGGGCTTGGGAAAGCAGTGGAGGTTCTAGAC ACACTTGGTAGTAGCATGGCAAGTTTAAATACTAGCAGTGGCTTTGTGTC AAGTGCTGGAGCAAAGGGAAATAAAATATCTATTTTGGCATTTGAGGTGG CAAATACCATCGTTAAGGGTTCCAATCTAATGCGTTCTCTCTCAAAGGCC AACATAAAGCATATAAAAGAAGTAGTGCTTCATTCAGAAGGTGTCCAACA CCTTATATCCAAAGATATGGACGAACTACTTGAGATTGCAGCTGCTGACA AAAGGTTAGTGTTGAATCTACAGTGCTTCAGACTGCCTCCATGTCACTAG CCTCACGAGTGCCCTTTTCAAAATATCTGACCATTGAAGTGATCAACAGT GCAGTTAATGCAATTTTTCCACACTTTGCCCTTTAATGCTTTGGAAGAGG TTACTTCTTAGTAAGTGGTTGTAGTATGACATAGTGCTACCTTGGTCTGT GCGTGGCTGATGACAGATATAACAAAACAGAGGGAGTTAGGTTCGTAGGA TTTAACCCAAACTATTACCCAGTAGAACTGTACTCAGAGAACTGTACCAC TGCCTTTCTTTCCTCTTCTTGTCAAGTGTTTAATTGTTTCATTCCAACAG GGAAGAGTTAGAAGTATTCTCAAAAGAGGTTATTCGCTTTGGTAATCGTT GCAAAGATCCTCAGTGGCACAACTTGGACCGCTACTTTGAAAAGTACAGT TTAGTTAATGCCCTTATCTTAATTAAAGGCGATTATTTTAAGGTACTAAC TTGCATGTCTTTGTTGAATTCTTAGATTGGCGTCAGAAACAAGAACTTCC CAGCATTACCTGAAACGAGATGCAGAGGCAGTGATGCAACAATTGATAGT TTGTGTTCAGTATACAGCTGTAAGGATCACCAGAACAATTTAGCATGGTT TTTTAAGGCGATTTAGCATGGTTTTAGACCAAGTTATTTGCACTGTATGC TGTTTTGGTTGCCTCAGTTTTGCACCTAATTTTGCACTGAATGTTAGCTA CATGATGAATACACTGTAGTAACATCTGCCACTCCAGCTTTCAGTGCTTT GTTCAAGTGGTTTGTGACCAAATATCCTCGGTAGGCTAAATTTTGTACTT CCTCCATCCGGAAAAAGATGTCACAGATTTGTCTAGTACACATATATCTA GACGTGGTTTAGTGTATAGATACCAAGGCTTGATAGATACATGCAAATCT AGACAAATATACGACATCTAATTCGGGACAGAGGGTGTCGTAAGTTTTAT GTTCACTGCCATTTCAAAAAACCATGGACTGTACTTCTGGTTTGAAATGT AGCCATCCCAGATTGTGCACAGTCAAACATTTTTAGTTTTGACCATAAAT TGTCTAGAATTCTAATTGCCCACATGATTTCAGCACTAACAGATTCATCT TGAGAGTAACAATGTATTGTGATCGAAAGTAGTAACCAAAATCTTGGAGA CCATGTAAATGTCCAAAACGACCTATATTTGTTATGGCTTTAAATGTGCA CCTTTTCAACTTTTCATATTATTAGAGTTAGTTCTTTAATAACATGAATT ATTCTGCTTATTAAATTCATGTTATTGACTTTGCTTCAATTATTTACCTT TCCCCCCTCAGGAATTATATCATGAATTGCACGCATTGGATAGGTTTGAA CAAGACTATCGTCGTAAACATCAAGACCATGATGGCTTGGGTTCAACAGG TTAATTTTTTGTGATCTGTAGAACTGTATGATTTGGGTGGCCTGGCTGCA CACTTTTGCGTGTGTTTTAGTGGGGTTCCTCCGGTTTTGTAGCCACTTAG GAAGTAGAATATAATTATTCCTACTTTTGTGAATAATCAAACATCTATGT TTCACTTTGTAGTTGTTATGTTGTCATTTGTAGCTGTTCTAAAGTATGAT CCAATCTATCCGGACCATCCAAACAGGATTGATCCAATGGATGAAAAAAT ACGTTGGAACCTTGCACTCTTGATCAATCACACAATAATCACCCCCTCAA TTGCACAATACTCTCTTAATTTTCACTAAATAATTGCCCATTACATGTCC TCAATTTTCAAATTCTATCATATTCACCCTTTTCCGTTTGCACACTACTG TTGCGCAGGGTGCTCCCGTTGGCCCTTCTCTTTGTTGCATACGTCAGTAG ATAATTCATACGATATATACCTCCTTGCCTAGGTTGCATATATCAGTATG TGTTCATGCAAATATATACTGTGTAGAATGTGCATTGCCCCTAGACAGGT TGATGAACTAAAGGAAAACTTTTGATTCATTTGCAGGTGAAAGTCTGCAC ATACTAAAGCAGGAAGTGAAGAGCCAAAATAAGCATGTTAAAAGTTTGAA AAAAAGGTCACTTTGGTCCAAGAACTTGGAAGAGGTCAGTAGTATGTGGT TTTGTTATAAATCTACTATATTGTATTTAGAATTGTTGGTTCAGTGAAGG CATTGGTTATGTTATATTACTGCTAGATGTTTCCACTTTCCAGATTTGAT GAATACTATTGCTCTCTTTGCAGGTGATTGAAAAGCTTGTAGACATTGTC CACTTCTTAGATCTGGAGATCTATGATGCCTTTGGTTATGCCGGTATTAG TCCTTATGTCTGCTCTCTTACAAGAGTTCATGTTGTTGCTAGTGCAGTTT GATTATGGTTATTTGACGAGTCATATATGCTTTGCCATGATAGACTTGAC CCACATATGTTCTATGAATGCATTCGATGTCTTTGGTTACATCCATCATG TCAGCAAATTTTCTTTTCTCACATTAGTCCACTAAAAATTCTTAAAGGGA TTGCTTCTGTTACCTGGATAGATGGCACTCAGTTTCCTTGTGCTTATCAC AGGAATTGAACATTACACAGCCGTGACTCATTTTTAAATTATTATTATCA GCCACCAACACTGCATAGAACAGAAAGTCCATATCAAGTAAAGTTTTGAT TGAATTTAGCTAGTTTGGCACCCTTAGACAACCAAAGTTTATATATGTTT ATTCAAGTTATGATCTGAACTTATTCACACTTAGCAGGAGGGACAATGTA CATATGTTCCTTGTTATAGTATAACTGTGATCTGCACACCTATCCAATGC CCAATTTCATTGCTAATACTTGCTATTGAGTGTGCAATTTTAATCTTTCA ATCTGTAGTCTAAATTGTGTACCTCTATAGGCACTGTAAAGTCAGTAAGT GTAGGCTGATCCTTCTCAAAAGACTGATCTAGTACAAATCATCATTTATT GTGACAATGATTTAGAGGTTCCTGCTCCTGTTAACTGTAGAGAGTGAAGA ACCACAAGAACCTGTGAGACGCCATAAGAGATTGGGACCAGCAGGCCTTG CGCTGCACTATGCAAATATCATCAATCAGATTGATACACTTGTAAGTTAA CACTCTACTGGAGATATTACGTAACTATTCTATGATCACAGTAATAATCA CAGATTCCGACCTATTGCCAATACAAAGATTTCTGTTTTAAGTCCCCTTG CATAGTCCAAGTTTCATACAAAACGTGCACTATTTTCACAGGCTAGATAT GTTACTTACCCTTTGTTGTCAACTCATGCATTGTCTTCGATTTTAGGGAC CAAATTATCTTTCCGTACATTTTGACTCTGAAGTTAAAATACTAAAGGGT ACTAGGACATTCTACATAGCGTGTCATCATCTTTTTGAGAATTTTTCATA TGTTGGCTTCTTGACCATGTGTCCACCTCAAAGGGTGATTGCCTGGCATA TTTTGCCATATTTTAAAAATCATACACAATTGCACTATCAGATATTAGGT ATTAGCAAAGCACCCAAGTAAAGTAGCTCATATTCGTGTGGTGATACATC CTTCTACTTCAATTTCTTTTGAAAAAGATTTATCACTTGGCAGGTTTCTC GATCAAGTTCTATCTCTTCAAACACGAGGGATAATTTATACCAAGGTTTG CCACCTACCATCAAATCTGCTCTCCGGTCTAGGCTACAATCTTTTGAAAT CAAAGAAGAGGTATGGCAGACTGGCGGCTCATATTTGTTGCTACTATGAG TAGACAGTTATGAACCTCGATGCCATGCTGTGGAATCGTGACTCATAATT CCTTGTTATGTTGATTTATCTTTTAACACTGGAACATGGTTGTGCTAAAT GGATGCAGCTTATGGTTTCTCAAATCAAAGCCGAAATGGAGAAAACTTTG CGATGGCTTGTCCCCATTGCAAATAACACGACTAAGTACTCTATTTATTA CCTATGACTTGTTTTTTGTAATTGCAAGAACTGTCCACGTCTGACTGAGA ATGTGATTATCTGCTCATATCAGGGCACACCACGGCTTTGGTTGGGTTGG AGAGTGGGCAAATACAGGGTTAGCTTGCGCTACAATATAATTTTGAACAA AACTGACGAAATAGAATTTCTCAAGAATTCAACTTTTTTGTCCTATGTAG ATCTGAACTGAACTGCAAGCTATCAGGACAGATGGACTTGACCCGAATTG AGACACTGTATCATGCTGAGAAGGACAAGACTGAAGCATATATCCTTGAG CTTGTTGTGTGGCTTCATCATCTCATCAGTAGATCCAGAGCTGCTAATGG AGATGTAAGGTCTCCTATCAAATCTCCTGTCCGTTCACCAACACAGAAGG GTCGCACAATCAGGTTGCAGCAGCCAGACCAAGCGAATGGTTCATCGCCG ATTCTCACACCAGAGGATCAGGATATGCTAAGCTGTGTCAAGTACAGGAA ATTTGTCCCTGGGATAAGCAAAAGTCAAGAATTTGACACAAAGTCAAGGC ACAACAAGCAGGATAGATTGTGCAAGAGCAATAGCCATTCTCCAACCAGT GGCAACAGGAAAAATTTGCTCCCAGTTAGGAGGTTCTCCCTACTTCCTGT TATAGACTTCGAGATTGATAGGACAAAAGCTTTGGATTTAATCGACAGGC TTTGATGATCTCAAAACACAGTGAGGAATCAACTGAAAAGAATGGCGTGT TCACCTATAGTGAAAAAGCAGTATGTCGATGTGATAGTATGGAGAGTATT GGTATTTGGTGGTAGCGAACATTGTATCATACATCATGTTCTGAACATAA AAGGGAAATTATTGTAAAAATATGTCTGATGTTTTAGTTGCTTGTATAAG AATACAAGTTTTGACGAAAATTAGGGGGAGATAGGATCTCTATGTTGTAA ATATTCATGAATTGAGAATACCAGTATCAGATGAATGTTTAGCATACCAG TGTAACAATTTGAATGTAGATGTAAGACTGATCAAATTGCACTTCAGTAG CTGGTCATTTAGATAATTTCGGGGAGTATCTAATTGTGCAAAATCAGAAC CATTATTCATTTCTCCATATTTATTACTCCCTCCGTATAGAAATAACGAA ATAACTGACTTGGCTTTGTCTAGATTCAAATGTCTAGACAAATCCAAGTC ACTTATTTCTGGACGGAGGGAGTATGTAACATCTTACAAAGATAAACCAA CCTTCACATGCTTATACGGATCAGCTCAGACCTCTAGACAGCCAAGCAAC TACATGGCAAACTCTGATGTGTTTGTCAACTTTTCCTCTGGGATATTGGC TATCCTATCCTCGATTCTTCGCTCCTCGCACTGGCTATGGTACAGAGAAA TTGTCCTATCATGGTGCTACAAAGGACATTGTTATCGCCGTGTGAGTCTG TATCTCTTATGTACTGTTACATGCATTGCTCATGTTGGAGGTCTCTCCAG GGCCACCCAGCCAAATCTGCCTTTCCGGAAGTCAGACAAGATGCGGAAAG CTGCTTGGGTGGTATCTCCATTGAACAAGTGAACTGAGAGCTTCGTGACA AACCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.