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GrainGenes Sequence Report: AE032208

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Sequence
AE032208
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE032208
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTCCGAGTCGTACCAGACCCTCTCTTTCCCTGTCCGCGACCTCATTTCT
CTCTCGCGATTTGGAGGGGACGGCGGCGCGGCCGGGGGGCGGACGGACGT
CGGTGGCGCAACTAGTCGAGCAGATCAAGGACGCGTGCTTTCTCCCTACC
TCCTCTCTCTCTCTCCAACCGGCGGCAGAGCGACCAACCGAGCGGCCAGA
GATCGACCCAGAGACCCACCTCCGTCTGAGCTCGGCGGTGACCGTGAGAC
GTCATCCCCGGCGCCCTCTCCATCTCCGGCTGCTTCGCACTGGTTGGAAA
CTACTCTTCTTCCTCCTCCTCCCACAGCTTATCGGGTTTGGCATGTTTGG
TAACGATTTCTAGGGTTCTTGGCATGTTCAGTAGTGGTAGATTCTTGGCA
TGGTTGCACATCGCAGACATTGATTGTCTTTTCTTGGTTTGTGTGCGAAA
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CCAGTAGATGATAGCTTTTCTGTTAGCATTCATGACATGCCATTTTTGTG
CGCAAGGAACTTGTGGAGAATCTTTTGCTGGCTATAATCATGTTTCATTT
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CTTCTTCTCAATTACTATGTGGGCAGTAGATATTGAAATTATTGATGCCT
CAGTGGCCTTATCCCTTGCACTTTCAGGCCAACTATTTATCTCAGGAAAT
TGGATACTCTTGTCTGAGGCGTGAACAGAAAACTTGTTGATATCTTCTCT
TGGCAGGTATGCTGAACTGCTACTGATGTGATGATTTTTTGTCTAAGTTG
TGTTCAAGCTTATTTCTTTAACCTTTCAGTTTGCCTTCAAGCACTTCAGC
CTTGTAGAACTTTGTTATTCAATTTAACCTTGTAAAATAATTTTAATTTG
ACTTCTTATGATCCTGTTTTGCCTCCCACAACAACAACCTATCATTTGCT
GCAGTATAAATCTTCTCTTCTTGCCTGTGTGGTTGCGGCTGTAGCTTTAG
TAGTACTAACATGTGGAAGTAGCAGTACTAGCAGTAGAATAAAGTGAACC
GTAGAATTTTTTGTTGCATTATAGCAGTAGAATAAAGTGACCTTCAGATT
TATGCTACTAGCTCGCTGCAGTAGATGATTACTTTTTAAGTTGATAACTT
TTCTTCTTTCTGATTGCAAGGTTCTCTCTTTTAGGAGCTCCCAAATGTCC
TCACTGTGTAGATGATAGATGTCACTTGTAGCATATCTAGTTGATTACTT
TTCGAAGTTGAGAGCAAAACTTGTCAGCATGTATGTATTTCCAAATGAGA
AATAAGATAAGTACTTGCAAGAAGAAATGATGCTGTGAACGGTAGCGTGC
TCACCTGTAACCGAATGCTGCATGTTAGTCACGAGCCCCACGCACGTGCG
GACACGTGGGCCTAACTACGAGGCCTAGGCCCAGTCACGATAGCTAAACG
GGCTGACCCGTTAAGGCCTTTTGGGCTGTTTTTTCTGGAAAAGAAAGAAA
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GTCGGACACACGGGCTTGAGGTAGAGGCCCAGGCACGGCCCCAGCTGTGT
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AAAGCAGAAATCTTGAGAGGAACCACCAGAATCCAGAGGAGGGGAGAAAT
CCAGAGATCCAGAGGAGGTGATCCGGAGGAAGAGAGAAGAGTAGATAGGC
TAGAGTGGACCTGCCACCATAGTTCATCCCTTGTCTAGTATCCCCAACGT
TAGAGGAAGACGGAGCCAGGAAGCCACCCACCAGCTAGACGAGGCCGTCT
AGCGGGGTCTCCACCTCCTCGCCGATGGCCTCCTTCGGGATCGCATGGTC
GAGGGAGTCTCCTTCCTCTTCGCCTTCACTGGAGGAGCGTACCTCGGAAG
ACTCGGGGGCAAGCGAATCTTTGTCAACGCTCCCGCTGTAGCCTACCGAG
CCTGACTCAGACTCGTCGCCTCCTGCGATCCCCTTCGCGTTGCAGAGATG
AAGGGCCACAAGGATGTCGGCTCGGCGCTCGTCCATGTGAAGCGGAATGG
GGAACTCTGGTATGTTCCCCGTCGCCTTCGGTGTGAGAAGCCTCCTCATC
AGGGCAAGGTAGGCTTCCCGGGAAAAATCATGTTTCTTCCCGGGCTGAAG
GCGCGTGCGGTCCTCGCTGCCGCTTTGCAGCGGCGCCAGGTGCCGCAGGT
TAAATCAGAAATTACGGCGGTGATGGTCAAGCCCTGGTCCACCAACTCAT
GGATCCTTGCCGTAATGGGGCGAAGGTCCGCATCCTGCGAGCTCAGTGAT
GGATAAGTCTCTGTCCTATGGTCTTTGTGGGACAACACACATGGTCCTTG
TGTCAAGGACTGGCAGTTAGAGATAGAGCATCAAGGACTGGTTGTTAGAG
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TATTCTTGGCTGGTTAGCAGCCTATAAATATGTATCCCCAACCCCTCAGG
TTGGCATGGCATTTGTGTGAGTTTGTGTGAGAAATAGAAACCAGAAAATT
GCCCCAACTCCTTGTGTCATCCTCTCCCTCGATGAGAGTTAGAATTCAGC
GACTAACACTCAGCCTCGACCAGGAACGGGCCGGTTGTGCTGCCTCCTTT
GGATTGCACATCCAGGGAAGGTGATCTCCAACCAGCACCATGCAGAATTC
AGCTTGCCATTCATCCCACTTGGACTTATATTGACTAGGGGGTACTGCCT
GGAGTGTTGGTTGCAAAGACAGAATGTAATACCCCTTGCGATCCGTGGTT
TCTTATCCACCCTGGGGGGTGAAGAAGTGGCGAAACAACGCCACTGATGG
CCTCACCCCCACGAACGCCTCACAAAGATGAGCGAAGGCGGCCAACGCCA
ACATGGTGTTGGGGTGGATCTGCACGAGGTGAAATCCATACACCTTCATC
ACCTCGAGGAAGAACTCTTAGAAAGGGGGAACCAACTCCATGCGGAGGAA
TCAGGCGTAGATTGGCAGCTCCCCATCCCCGACTCGGGTGCGGGACAGAG
AAGTTTGGTGGCCCTGTTCTCATGGCGTTCGTTTGCCACATGATCGAACA
GAGCCTAGAACTTCTCCTCATCTAGCGTCGGCTTGATGCGGGCTCGAGGA
CTCTCTTGGGGGCTTCACCGCCCCCGAGCGGGTCCTTGCCGATCCCGCTC
CTCTCCCAGCGTTCGGCGCCACGCGGTCCGCCATGGGCAAGTCGATCTGG
AGGAAGTATGCAAAGGGGAGGATGACGGGGGGTTGGTAGGGGGAGCGTAC
CTGGGGAGGAGCCTTTTTTATAAAGAGCCCCGCCCTTACACTCCCCCAAC
CCCATAGCCCCTCGAAACTCCTCGACTCGCACGCCCACCACTTCAAGGCA
CCTCGAGGTCGGGAGACGAGTCACCCAACCGTCAGTCAAGGAAAGCACAG
TTGGTGGCTTGGCGGGAATAGGGACTGGTTCCGCTGCGGCAGGAGGCCTT
AGCTAAACCAGTACCCGCGGGCTGCTGTCATATCCTTGGGACCCGGGGTC
CTCGGATCCCGCCTGGGTAAGCCACCACGAAGACTCCTGCCCAGGGGGGC
TACACGTTTCCGGCCCGCGAAGCAGCGAACGTCCCGGCTAGCTGCCCCCC
TGACAGGAGACAGGAGTGTCAGGCCAGAGCTCTGACGCCTGGGGAGCTAG
GCCTCAGAGCTGCCCTGCCACGCGAAGACCTCAAAGAAGAGTCCCCCCAT
GTTGCACCCGTACGCGCGACACCCTGCCGCGTGGCATAGCTGCACCGATG
TGTGTTCCTTCGACCCTTGTGGTGTCCCCTTGCCCTTATAAAAGGAGGCC
CAAGTCGAGTATAGGGGGAGAGGGATTTCTTAGCTAGAACCTTCCCTAGG
AAGGAGCCTGTGTAGATAGTTGCAGGACGTAGGGATACGCACATCGCGGA
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TCGCGGATCGAGCTCGCCGGACGTTGCGCCCCTGGCCGAACTAACAAAGG
GGATACCCATCCCCGGTGTCGAAAATCGAGACGCGACATATGGAATATGT
AGACATTTTACACGTTTGTGCATATTGCTGCTTGGACATTCCCGAATGCA
TCTGTAACCTGACATAAGCTTGTTTTTTCATTCAGTTGATAATAGGATGT
GCACTTGAGTAGGTCACCTGATATAAAACTATGTGAGAAAATTTATCTTA
ATTAGATTTTGTCTGTGGATCAAATTTGTTGCTTTACTACAGTATAGGTG
GGTTTGTAGCAGCTTCTAGACCATTAATGGTCCAAATAAGCTCTAAGCAA
ACCCGAAACTAGTTAGCTTAATCTCACTACACCCCTCATTCTCCATTGTT
AGTAGTAAACCTCGATTTTAAGGCGTCCGAGCTTATCCGCCTCCTCACCC
TTCTCGTGGCAATGTCCAGAAACATCATGATCCTAAATCCACCCAACCCG
AGTCGTCCCCTTGCGGCGTGATGGAGAGACGCAGGAGCTAGGGTTAGCAA
GTCGCCGCCCTCTCCCTTCGAGCCACCACACGCCCATTTTGCTATGTGCT
GCTTGCCACCCATTGTGCTCCACACCGCTCGCCTGCTCACACAACCATCT
TATTCCTTGTCGTCGTACAACTACTCGCCTGTCGCGGTCGCTGTCCAGTT
TGCCCGTAGGCCCTCTCGTGCTGTCTCTGAGTTGGAGCATTAATATTTTT
CCAAGAAATCATTGTTTCTTCTTTGACTTGTATTGTTTGTCTGTATACGT
CGTAGTATCACTGTAAAATTTAGAAACTGGCAAATATTTAGGAATAGGCT
AATCTGGGGCATTTATGACTTAAATCTTTGACTACAGACAATAAGTGCAA
CCTGCAGTTATAATTACCCTAGCTTATCCTGGGCTTACGTGGACAGTAGC
TTATGGACAAGCTGGAGTCGGTTCAAATCCAACCTAAACTTCACTAACTT
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ACCTAAACTTCACTAACTTGGGAAAACACCTTGAAAGAACAAATCAACCT
ATATGGTGGTCTTAAATTGCATTCAACAATTTTGATTCATGTCACTGTTG
AAGGGCGGCCTAGCGCAGTGGTAGAGTATCTCCACATCCACTTGTGTCTT
GGAGGTCCTAAGTTCGAATCAGCCTCTTTGCATAATAAAAAACAAGGGAA
ATGCTGCCTAGAAATACCCTTCCCCACGATGTGTTGGAGTTTTCAGCACT
GGGTATAACCCTTTGTCCACTACTAGTTTCATGCAGGATCTGTATTTTTA
AGACAAAAGGCATGATGGCCCTGCTTTATAGATTTTTTTTGTTATGGTGT
TTCACATCTGATGGGGATCGCTATTACAGAGGAAAGTACACACAGACAAA
ATTAACATCCAACAAACATAACAGCACTCTATCCTGCATATTGTTAACTC
ATTATCTTTGCAAATGTAGGTAACGCGTTCGTCTGTTGTAATTTAGAAAA
CCCTTCCGTTTGTCATATTGTCATCCATATGTGACGAATTTGTTGAATTA
CTGGGCTTCCATGAAGGACATGACATGCACATCATGGAAGCAATATGGAT
ATGCTGTTATTGTCTAGCATCCATACTTTGCATGTATTGGTATATAGTTT
GATGTCTTCTTTAGCTCCCCACAACTTACTCTTATGTTAAATTTAAAAGG
AATATGCATTTAGGTACGCGCATAGCAGCACCTTCTGTCCCATGTATGTA
TGCTTATGATGTTAAGTTTGCAATTGTGCCATTATGTATCTCTTTTTGTC
AGGTTTTATAGAGAAAAAGACAAAAATCATACATGGATATCATGCAGACA
AGTGACTCTTCACATCATGGAATAGTAGAGAACAACCCTTATGATAGACA
TGTGGAAGGTGGCCAACTTGGTGCTTCGTGGTACTTTAGTAGAAAAGAGA
TTGAGGAGAATTCCCTTTCAAGGAGAGATGGTATTGACTTGAAGAAGGAG
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GCTGAAAGTGTAAGAATGTACTGAACCATGAATATTTTAGTGGTACTTCT
TTTCCTGGGAAATATATCAGCTGTTTTAGCAGTATTATTTGATTATTGAC
TTTTTTCTAGTTTCTGTAGACAGCTGCAATTTATCTGATAGCTTAATTTC
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ATAATTTATGATTGATTTCATCCTCATTCTATTTTCCAAATCCTAGGAAA
GTCTGGTGCACACTTAAAGCATAAATGATTACATGCTGTTGATGACAGTT
CTTGTGTTCCACTGTGCATGACTATGCTTGGTACCTTTACGGACAGAATA
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CTCTTGGGCTGCGAATCAAACAAGCCTTTAGTGGAACTATTTAATGGGAG
GAAGAGCTAAAACAAACACTGGGGAACTTAAGAATTTAAGATGTTAGGGA
TGCAAAAGTTAGTCAAGAAGATTACAAACATCACCTCTGTGATCAAAGGA
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TGCTAATCATGCTGACTACTCGAGTGCCAGTTTAATCTTTTCCCCATCTT
GATCAACTTGTCCTTTTTTCCTGGCATTTACTTGATTACATGGACTAAGT
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TGATGGACCTATCCAGTTTTCCTTCTCCTTAAGCATTTGAGCAATTGTGA
GCATTATATGCTTTCAGTGTGTAGTTTATTCATTGTTGTTAATCATAGTC
CATATAATTTTTCAGTTTTGTATGTTAACTTTTGTTTTTTGTGGCAACAT
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CTCAATTATCAAGCCATGGGTTTTGTTGGAATCTGAGTTAGTGTAGTATT
GTTGTCCTAGGAGAACCTAGAGTATTCTAGTGGAGTGTTGGAGTCTATGT
TGGTGTCCCAGTTGAGTCTAGAGTATTCTAGGGAGTGTTAGTAGATTAGT
AGTATGTCCTACTAGATTCTAGACTATTCTAGTGTATGAGTGGAGATGTA
ATACTAAGCTGAGCTATATATAAGAGGGTGTGGAGGTACAAGAGACCAAG
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TTGGAAGTGGCTAGCTTGATGCAAAGTTTGTGTGCTTGAATTTTCAGTGT
CGAATGGGTGCTTGACCCCAGATGGTGAAAGACCGATGAGCAAGAGCTAG
AGTAATGCTCTTACGTATCTTTGTGTGCTTGCAAGCTAGATGTGTGGTGG
TTGTACTAAGTTTCATGGGGATGTAGCAAGATGGCCATGGTGATTAACCC
ATGCTCATCTTGAGGGGGAGTGTTGGAATCTGAGTTAGTGTAGTAGTGTT
GTCCTAGGAGAACCTAGAGTATTCTAGTGGAGTGTTGGAGTCTATGTTGG
TGTCCCAGTTGAGTCTAGAGTATTCTAGGGAGTGTTAGTAGATTAGTAGT
ATGCCCTACTAGATTCTAGACTATTCTAGTGTATGAGTGGAGATGTAATA
CTAAGCTGAGCTATATATAAGAGGGTGTGGAGGTACAAGGGACCAAGCCC
ATCCAGAAGTTTTCCCCCAAAACCTACAGGTTTTTCTGTTCAGCTGTGAA
CCCACTGGAATTCATGGTTTTTTGTCATGAGCACAGGGCATTTTCAGGAA
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TTACATTAGGGGCCACTCATTCTTGTCGGGCATGCAACAATTGCTGATGA
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AATGTAGGCCCCAAGTAACAATTGCTACAGCTATAGTATTCTGTCATCGC
TTTTTCCTTCGTCAATCTCATGCCAAGAATGATAGACAGGTAAGCCTTAC
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TGCGTGATATAACTTTGACCAGTAATTTAACCTTTAATACTTGTGTCATA
TATCATAAAACTTATACCATTAGAAACTTTATTCAAATACGAATTCAATG
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TTGTTAATGTAAATTCGTTATAATCTGCAGATAATAGCCACAGTTTGCAT
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TACTCATCTCTTATGAGATCATCCACAAAAAAGATCCTGCTGCAGTTGCT
CGAATTAAGCAGAAGGTGAGAGATTTTATTGTGAACACTCTCTTTGATAT
TCCCTACCTCGTAGCCTTAGCTATCTGTGTTCCCAGACACTTGTATTTCG
TAAAGCTGCTAAATTTTGTCTATAGCTGGTGAATTTTATTCCCTGAGTAT
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TGAGCAACAGAAGGAACTTCTGTTGATTGGGGAGCGCCTTGTGCTTGTAA
CACTTGGTTTTGACATGAATGTGCACCACCCTTACAAGCCCTTGGTTGAA
GCAATTAAAAAATTCAAGGTTGCTCAAAATGCACTTGCTCAAGTTGCCTG
GAATTTTGTTAACGATGGGTATGCTAAAATTACACTTATCCTTATAAAAA
TAGTAAACCCCCCATTATGCCTATTTACTATACCTTAAAAGGGGTGTACA
GGCTACGCACTTCGCTTTGCCTGCAATTTAAGCCCCATCATATTGCGGCT
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TTATCCATTGTCGTAAGGATCGCAGTATACACACTTCCACAAGTACCAGA
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TCAAAGACAGGGTGTTGCATGATGTGCACAAGGTAATCTTATCTGTATTG
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GTATTTTTCAGCTCGGTGATTTTCCAATGCTACTGAGCAGTATTGTCTGT
TATTATATCTGTTTGCTTAGAACTGTTGCTAATTTTACTCCCATTTTCTG
CCACGGTTACTTTGAAGTTTTGATGCTCTCTGTTGTGAAATAACATATGC
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TTTCTTTTTGTGATAAATCTTTTCAGAGGTTAGCAACCAAATGTTGGAGC
TCTATGAGCAGAACCGTGTTGGGCCACCACCATCACAAGGGAATGATACC
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CCATGAAACTCATCAAGCACCTAGACAGTCGAGTGTACCAGGCCGCCATG
GATATGACCACCCTCACCCTGAAAAGCAAAATTCAAACCAGCGGATACCC
AAGACCGAAGCAAGGGATGGTACTGCCAATAGCAATGAAGGCACCAATAT
GTCATCGTCAATGATGGATGCGATGAAAAAGATAGACAAGGACAAGGTGA
AAGCTGCGCTGGAGAAACGGAGGAAATCAAAAGTTGATGCTGGTAGAAAG
GTTGATGTCATGGATGATGATGACCTAATTGAAAGGGAGCTGGAACATGG
TATAGAATTGGCTGCCGAGGACGACAAAAAACATGACAGAAGGCAGAGCT
GGCCACATCCAGCGCAGCGGGAGGATCACCAGAACACAGTTCACAAGGTG
GGGAACACCGAAGAGGGCGAGCTGTCCATGGACAGCCAGGAATACCACAC
TCCTGACCCCGACAGCCGGAAGAGGAAGGATGCTCGTGGCGGCGACAGAG
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AACCTAGTTTTTTCCATCGCTGGAGCACTCAGATGCTTGTTTGCCTATGT
TGAGATTTGAACCTTGATGTACTGTAATCTGAAAAGATGGTTTCCCCAAG
AGAGGAGTGTATACATGTTCAGGCGATAATGTTATGAAACATCCGGAAGC
AGTTTCGTGCTGAGAAACCATATGAATGAGGCAAACAAGTCTTTCCATGG
TTCCACTTCCACCAGGACAACGTGATTTGGAAGTACATGGGCTTGAAGCA
CATTTGGATGGGGGATATTCATATGCAAGTGTTGTGGTTTGATGCTCCGT
TGTTTGTACTAGTATTTTGTTTGGATGTATGCAGGGGGCATATAGCATGC
ACTAGGTGCTTGAGGTGTACTAATGCACTAAGGGCTAAGAGCCACCAGAT
TAAATATCCACGGTCCAGATAGAAGAGGGTGTATAGGCCAGGTACATCTT
ATAATTGACTCCCTGTAAACTCCCTGTAAGTTTCCAATCTGGAACAACTT
GTCCCTGTTCCTTAGTTCGGTCCGTCTCCCAGTCCTACCGCCCAGTGAAG
AGATTAATCACAAATTTCAGAGACTGTTTAGAAGATGTCCCAATCAAATT
TCAACAAATATACAAGATCATTTGCTTTCCTGGATAAAATTTCATAGAAA
TTTCATCCATCTTAGGGAAAAAAATATGTTTCATCAATTCTAGAAATTTC
ATTCATTTTAGCGAAAAAAATTATGTTTCAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.