Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE011519

[Submit comment/correction]

Sequence	AE011519
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE011519
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTGACACTCTCGGTCTCTTTCTCTTCCCCGTCGCCATTACAGCGACTGAT GTTTCTCTGCTAGCATCTGTTGTATGTGGAAGTGTGGAGTGAATGCTAAA AGAAAAGGCATCCGCGGAGTGATTACTGGTCCAAAAACGAAGAATAAATC TGGTGCTGGTGGCGACCCGGCCATTGACCTCAGACGAAGTTGGTCTCGCT CCAGCAGGAGTTCTTGGTCTCCCGCCGGATTCATCTCATCCGGCCATCTG GGGCGCGATGCAGCAAGGTAACCGCAAATACCACAACGCCTCTTAGTTCC GAAGTTGCGATTTTTCGCTAGCTATCCCTTGCAATTTCTGCAGCTAATTT TGGTTACGAACTGCTGAACTCTTTTGGATGGGTATCCGCTGAGAGTAGTG ATTGTTTCAGTACTAATTGTTCTTTCCGAAGTTTGTTTCAACTAATTGTT CTTTCCGATTCAGGTCTCGATTTGAAGACCCGGTGGTTGATGCCTAGAGA GGTTTGGCATATATTACAGATTTTCGAGCTCTTCACGGTCGTACATAAGA TCCCCCCGAAACCACCGAGTAATAAAATAAGCCTTTGGTTTTTTGCGTGT GAGATATCCGATTCAAGCTCGCGCATATGGATTAACCTAGTTGCTTCTGA AATAACAGGTGGTTCTTGGTTTCTTATCAACCGTAGAGTATTTCGGTTCT TCCGGAATGATGGGTACGAATGGCGGAAAATGAAGATTGGGACGGCCATT GCTGAAGCCCACGAGTACCTCAAGGTCTGTTCAATGCTTATCTTCTCTAG TAATTAGAGTTGTTGCGTTAACTATAGTACTGTAATATGTTTGGTGCCAA ACATCTGGGGAAGCCAGTAGATAATTTTGAATTTGTGATGTTTCTTGTTA GGACTGAATCACATGACCTGGATAGTTGATATGCTTCTCGCTTTTGACAC TGAAAATTTCAGGTTGACAATGAAGAAAGACTGAGTTGCTACTATGCTCA GAGACAGGACAATCCTACATTCCAGAGACGGATATATTGGATTGTGGACC CGTAAGAACTCTGTTTACTCTGCTTTGAAATTCTTAAAGGTTCAGATTTT CTTTGTGCCCTCCCTGCAAAAAGGAAGATATTTTCTTTGTGCCCCAGTTG TTACCAATAACTATAAGTGTTTCTCTTGAGAACGCAATCCCATTACTACG AATCATGCTGTTGGTTGTGATTTGCTGAAATCTTTTTACATTTTATAATC AAATGGTTTATCTACGTCTAAAGTTCAGTTTGAATCATAATGAGAGCAAT CCATCTTTGCAGGGCCTATGAGCACATTGTTCTTGTCCACTATAGAGATG TTTCAGAGGTTTGCCGCTCGTTTAATTTTCCTTTTGTGAAAGCACACCTG CAATTTTGATACATAGCTAACTAAGATGAGTGAAAAAATAAAATTGGTTT ACTATCCACAATTATCTGTTCACTCCAACAGTGGTAAATCCTTGAACATA TCAGATTAGTAGTTCTCTGAGATAAAGCTTCTGTTAAACTAAGCTTGACA CTGTAGACTTTCCATTGGTTAATTCACCTATTATGATCTTTTATATATTG CGTTCCTTGTTTTCTTGACAGCCTTGCAACAATCGGAAATCCATCCTACC TTCAGAGAGCAGCAACTCCTTATTACCTTTAGGTTAGTGCTATTCTAAAT ATTTTGATTCTCCCAATGCTAAATCTATGTATCATTAGACTATATGTGAG ATTCATAACACCAAATTATTGATGCAGAGACCATGAGTGATCCTCCTTTA TGTGAGAAGGTGAACTTTATTTCGATTTCAGCACTAAATTATCTTTTGCC CCATACGGAGACCAAGTCAGTACCAGCAAGTTGGCAAAAGATTCATTGTC TTGGGTGCATTTTGTCTCCGGTTTGTAAAATTTTGTATGCTGTGCAACGA TTTATATTTGGTGTTCATTGCTTTCTTGACAGTCTAACGATAATTCCAGC CTACCTTCAGAGAGCAGCAACACCTTATGGGCTTCTTTAGGTTAGTGCTA TTCATAAACATTTTGACTCATCAGATGCTTAATCTACGTATTATTAGCCT ATATGTGAGATTCATAATCCATATTCATCTTGAGGTGCAAAGGATTATCA CATTAATATAAAAACCCTAGATAGTAGCTTTGTCTATGGGAAGAAGATTT ACAGTTGGTCTTATTCGAGGATTTTTGTATTCCAGAAATGACTGGTCTAC CAACTGAACTTAAATCACTGGAGGCCATTATGATTGATGCAAATGCAGAG CCAGGTAGACTATCATATCTATTTCTCAGATCCATCACAAGAGATTTCTC TCAAGAGATTGGTCATGGTGGGTTCGGAGTTGTTTACCTGGTACGCTTCC TTGCTTGCGTTACACGTAGTAATTGTACATGTATTTGTCCAATAGAGCAA AATTCTCGTGACAGTGCTAAATGGTAATACGAATTAAACAGGGAGATCTT GGAAATGAGAAGGTTGCTGTGAAGAAACTTTCCATATCACATGGTTTTTC TGACACGGTCTTTGTGGACGAGATTAAGTGTTTAATGCAGGCAAAACACA ATAATGTAGTGAGATTTCTAGGTTATTGTGCCGATACACACGGGGAATTG GTGCCATCGAACGGAAGCTATGTGATAGCAGAGGTACCACAAAGGTTGCT ATGCTTGGAGTATGTCCCTAACGGAAACCTTCAGAAGTATCTGAAAGGTA AAGTTGCATTTTTTCTGACTTTTTTTCTGAAGTAAAACAAAAAGGGCTGT TCAAATAGGAACAAAAATTTGTGTCCACTAGGACGAAATTACAGGACTGT GAGCTACGTCGACTTCCTAAAGCTTCCAACTTTGTTTCTCCAATGTGTTG AGTTTCCTAAATTCATCTCAGTAAGTCAAACATGTTGTTAAATACTTAGA GATTAAGGCCTAGGTCTCTTAACTTGTTTAAATGGTTTACTTTTTCAGCA AAGTTTAAATATGTTATTTAGGCTCAACCATTACATGCGTGACCAGTTTC CAAACAGAACAAATTAATGGTTTCTTTTCCTTTTGATTATTGGTACTATT AATACAGATGATGCGTATTTCACTGCAATGGATCTTGTAATCCCGTCTGC CCAATAAGCTTTTGTCTATTTTAATGTTTATTTAACTGTATTTTTTCCAT TCTTAGTTACTATTTTTGCGCAGCACATTCTTACTGCACATGAACAACCA TAAACTGAACCTTTTTAGCGCTAACATCTAAATTAACCAAAGAATCGATT ACAAATGACACACCCAGTTCTAGGAAATTTGTCCCCATATTTTCAAAAAA TGAAGCCGAGGAAACTTAGAACATCCAAGTCCCCCAGCAAAACCTTCTAC AACTGAATCCACCACCGCACGTTTGGTCACCATTGCATATTTGACGGAGA GGACTAAGAATTGGAGAGCAGTAACTAAGTTGTCCAAACAGACCTTTAGT GCACTAGTGGAAAACGGGGCTATAGTCCCGAGACGTAATGGGCTTTAGTT CCGGATTCGCACCCAGGACTGTGAATTCGTTACTATAGGTCCCTATCTTG AACCGGGACTAGAGGCCACCACGTGGTAACGACAACGCGGCGGGGGTTGG AGGACCTCTAGTCCCGGGCCGTAACACCACCTGGGACTAAAGTTTTTTTT TCATTTTTTTTTCTTAAATTGTTTGACTCTCACTTGGTAACGCCAACTTG TTAATCTCTCACTTGGAGCATTTTTAACACTAAGTACACTTAATCTTAGG TCAAATTATACTCGTGGTCAAACTTCCCGGTCGGTCACCCATCCTAACAC TACTCCACCCCTAGCACGCTTAACTTTTCCATTCCATCATGATGACCTTG CGCGAGGGAAATTGTACCTTGTTGTCAACACTATCATATCAATCATATTA ACTCTTATCAATATGTCACACGTCTTTATTTTTTGAAATTACAGAAAAAC ATTTAAATAAATAACAATAAATAAGTAATAATAATATTTTATTCAAATGA AAACAAAATAGCTAAATAATATCTTTAATTCTGTAAATCGAAATTTGACA AATAATATATCCATTATTATCAGAAAATGTGAGGAATCCAAATATAATAT AAACAATTTACTAAAAAAGATTAATTTTTAAATTAGAATAATATTTTATT CATTTAATATGGATATCTTTAAATCTGTAAATCGAAATTCGCCAAATAAT ATATCCATTATTATCAGAAAAATGTGAGCAATCCTAATATGACATAAAAA AATTACTAATTTTTTAAAAACTTTTGAAATAACTTTTTTTCCTTTTCGAA TTATAAAAATCTAAAAGAATCCAAAATGGCCTAAGGCGGTTGAAATCAAA CTAGAAATATTTTTTGCACGTTTTGATAGGTTGTACTTTTTTATGCCCGT TTTCCTGCCGCGGTAGAACCCGCGATTTTTTCCCGTTTTCTTCTAAAGGT CTCTTTTTTAGTCCCTGTTTGTGACACCAACCGAGACCAAAGGGGTTGGC ACCGGCCGCAGCCTGCCGCAACCCCTTTAGTCCCGGTTGGTGTCTCCAAC CGGGACTAAAGGTCCCGTTTGACCCGGGACTAGAGCTGGTCGTGCCCCTG CGGGAGTACTAGCCGTTGGAACCGGGACTAGTGCTACATCTCCTAGGTCC AGACAGGACCGAGACTAGTGCTCCGGACGGAAGGCGCTTTTTCTACTAGT GGTGGAAAACTCCTTGTAGATATTGCAGCAGTAGCCACCTATTGTGTACG GCGGGTTCTGGGGGAAGAAGCCAAATTGGCATGGGACACTCCCTGTACGT GGTGAGGATTAGGCTTGTATCACCGATGGGAGGAGATGGCTCAGCCTGTG TACGCCCATGGGTTGGAACAACTGCACACAAGACGGAAATACCAGTGCCA TGGCCAACAGGCGGGCAACCAAACCAACACCAAACAAAGCCGGAGCACAT GCCCAACGACGACATAGACCCATTGACTCCTCGACGCAGTTGACCACGCT GTCGAGATAGTGATCCATTATTCAATGCAGCACCGTCACCTTATGAAGGG CATCACCATGTCACAAATGCCTAACCCTGACTACACAAAACATGCAAAAC CACGGTTCCCCCACCTCCCGCCGTCGGATCAGCAGATGGACATGGAGGGG AGGGAAACACCTACCTCGCCAGCGGGAGTGGGTGTAGATCTGGTCACCTG TCTAATAGTTTGGGGAGAGGAGAGGTTGGCGCCTAGAGTGTTTTTGAATA AAGTTGGTCAATTTTCCAAAAAAACCTTTGGAGATAAATGAAAAATATGA TATCAATTTTGAATCACTTTTTCCTTGTTGCAGATAAGTCTCGCAGAGAT GAATGGCAAGTACGGTATAAAATGATTAGGGGAATTTGTCATGGTTTGAA CTATCTTCACAGCCAACGCATTAATCATTTGGATTTAAAACCAGAAAATA TTCTCTTGGATGCTTGTATGGAGCCAAAAATTACTGATTTTGGGCTATCA AAATGTTTTGATGAAGGGATATCAAGAGTTTACACTAAAAACATCCGCGG AACACTGTAAGCTAAGCACACCATGACTTGTTTCTCTTGTTGTCGATTAT GATATATTTGTTTATGCACGGATATTAAAATTAATTGTCATATTGTCATG CAGGGGATGTATTGCACCCGAGACAATAAACTATGGAGAAATAACATTCA AGTCAGACATCTATGGTTTGGGTATTATAATCATAAAACTATTAACAGGG CATCACAACTATGATTTTGAAAATGTAAGAAATAATTAGTTAACCATTTT GATTCATGTTTCTTTTACAAATTAAAACTGTGTAGTACATACTATATGGG ATACCAACTACAAGTCGCAATTCAGTGCAAGAAACAACACCATGGGTTTT ATGTATTAAATTATACTAATAGCTCTTGCATTCCGTAAACACGTCATGCA TGACAAACTCAGTTTTTGTTGTAATCACTTACAATTTGTAGTGATGATTT TTTTAGTTTCATACACCAAGGATATTCGGAAAATTTACAACATTCACACT CTTCATTTGAAATGTAATACAGAAATTATGTAGTCATGTTTTTTTTTAGT TTCGTTTGAAATGTTCTTGTATTTTTCTTTTTACACCTCCAGGGTGGTAG CAGGATTTTTCTTTGATTATCAAAAGTGAAAATTTAAGAATACTGTTACC ACAAGTTATAAAAGCAGTCATGTTTTCTAGGGGGTATATTTCTAAGTCAA TGAAACAAATCCATCATATTTTATGAACATATGTTCAGAAGTGGTATCAC TCGTGTTACTGCAGAACTGCATGCTCTAGACGATAGTTAGTTAGACTATC ATATCAGTTAACTAACATATTGTAAAAAACAATGTGTGGAATGCCACATG TAGTGTATTAATTTATGTTTTTACATATGGAAGCTTTTCAATAAGTGTCA TATGTAATCGTTATGCTGTATGTTTGAACTTTGCAGTGGCACACAACTTT AGACGTGGAAAGTCCACAAGTAAAGAGCTGCATTGAAATAGCTCAAACAT GTGTGGCTCTTGACCAACATGAGAGACCTTCAATAGTTGAGATCATGCAA AAGCTGAATGATATAGAGAGGCTGTGATTCAAAAAACCCAATACCTTTAC TATGACAGGTATATACGATCATTCAAGGCATAGAGATGAAACATGTTTAC TTTGAGATTTATATGGTGTATACTCCTTTCCTTTTGTGCATCCCTGGGGC ACTGTGCAGTTATCATATTACATAAATACTAGCACAAAACATGTGAGTTG CTACGGACTAAAAAAATCATGCTATATGTTTACCAAGTAATTAATCGAGG ACAAAACTATCGCGATATCTTGTATTGCACGATTGTCTATATCAATATGT ACAGATTGTCAGCATGTTTCTCCAGGCTTCTAGAAGTTTCTTTTTTGCCA CTTGTGTTAGCCACCTACAAAAGTGTAGGCATTGATAGCACTCCAATACC GAATAACTGAAATCTACATAGATTTGCTATAATCTAAAATACAAAATATT TTATCCTTTAAACCATTTGTCTGTTTGATGTTTCCTTTTGACTCGTGGGT TCATCACAACGAGGAATTCAAAAATTGATTTCATGTTGATAATTTTTTAT ATATTTTTTGCATTAGTGATTGGAATGAACGAGCTATAACTTTGATAATG GTCACTAATCATTGTGCCTGATTTGTGTATAAAAATAGGCTCCATTCCAA GAAGCAACTCCACTAGTACAACACCATAACTGTATAATTTGGATCTAAGT ACCCAAATGTACCTTGGACATTTCGTAACAGTGTGTTTTTGTATTTTGAT CAACCGAAACCAAACGCTCAAGTCTGAAACATTAGCTGTGTAGTTCCCAT TGAAAAGTATATTCGGCATCTTCACTGTCAAGATGATAGATTGATGCTAA GCTGAAGAGTGGAAATAAAGATAGAGCCAGGGCAATCTTGTGTAATCACC CCAGGACAAAGAAAACCCAATTACTTGAATCAACATGAAGAACTTGCGAT AGTGAGCTATTGGATATGTAATCATATACCAGCAGTGGAACCTCAGTTTG AGAAAACATCTGAAGAGCTTTACAATATATCTCTGATTTATTTCTGTGAG GACTATGACCTCAAAGATGAATTTGTTTATCTCATACTGCTTAGTGACGT TTTTTTAGGGAAGACCTTTGGTTTTTATTATTGCAATGACATATGCCTTT GTATCATATTTGTTTGATTCCGTCTCTAGCTCTTCTGAGTTCTTCATAAA AAATTATTTGTATTCTCAAATCTCATTCACAGATTCATGATATGATGTTG ACGTTTCTAGACGAAGACCATGGTTCCTCTAGAAATAGCTCTTTCGTTGT TTCTCAGAAGTAGAATGCTGGGACCACATGACAGTCCTATATATCCTATA TAATTATATATAGTTGCAGACAATAAAATTTTGGCTCCCAGGCTCCAGGT AGCCCGTTTTTGAAAAATTCGAAAAAAATTGAAGCTTCAAACAATTTCAA AATTTTGTAGGACCAGTAACCTTATCCTGTCTCGCATATATTCTATATCT TCAGTTTCGATAATCTTTTAGGGTCATCTGATTATAGTGCTTTCATTGAC CTTGCACCAAAATTTATTACAATCTGATAATAGATATGCAATACATGAAT CTAGATCTCTGAAAAGAAAAATAAGATGTTGCCTGTTGAAACTATGCTGT GCTCGGAGGGAGTACATTTTGGCAGTCATATTATGTTACATAATTGTTCA AAAAACATTATGTTACATAACAAATATATGAGTGAGAGTTTGGAAAAAAA ATTGTGAAGAGTTTAATACATCATCTTTAAGAAATGACATTCTATAAAAC GAAACTTTACAAAAATATTTATATATAAAATAATGGCCACATTCACCAGT TGAGATTAAACGGATTTCTTCTAATTATTATTTGCCTAATCGAGATTCTT TGAAGCTATACATGGTGAAGAATAATCAGGAACAACCTAGGAGGATGCGG AGGGCATCTGGCCTACTTTGATATTGTCAACTATCCCAGGCATTGACTAC TAGGACAGCTTCGATGGTGCAACTATGCAAGTACGTCAAAGCTCATGTTG AGCGCGAGGATGATTCGTGAGGATCATGAAAAAAACTCCCCAGTGGCAGA CATACATAGATTGTATGGTCTCCGGCAACCTCATCAACCTGCTCAGAGTA CCCTAGCTTCTGTATGTTCTCATAGTAACATATATTTGTCGCAAATAGTG CAGTTATGGATTATCGAGTTATAATGTATCTTTTATTGCCTCAATGCATA TTTTGCAACTTCCTGGCATTCCATCTGTTTGCATTCCTTACAGAGGGGCA CATATTGTTTCAATACAAAAATTTACAGTATATTGATTATACTTTGCAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.