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GrainGenes Sequence Report: AE031469

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Sequence
AE031469
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE031469
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAATTTTACTGCTGCACGCTTCGATTCCTCGGAGTCGTGTTTGCAGGA
TCTCAAAGTTGTAGTATCCTGGAACTCTGCACTGCAGTCCTCCTACCTCT
CCCGGGCTCCCGCACATCATCCCCTCCGTCCCTCGGGCCTGTCCCGAAAC
TCGAACTTGATGCACCAGATGAGGCCGAGGCGCCATGGCTGCCCCCTCCT
CTGCCTCTCCGCCGCCCTCCTCGCGGGCGCTCTGCTCGCCGGCCCCGCCG
TCGCCGATGGCGTCACGCCCTCCGAGGCGCGCCAGCTACGCGACGAGGTA
CCCCCGCCCCTCAGATCCGCCAGTCCTAGCGGAAGCCCCTCTAGCTCAAC
AGCTAGTTCCATGATTCTACTAGTGCTGAGTATTGTACAGTTCGGCTCGC
CGTTTGCCGTTCGATTGCGAGAGCAACGGTACCCTGCTTGCGAAGCGAGC
TGGTTCTGTAATCTGGTGCTAGGCTCCGCGGATCGATCACTTTGCTTGAT
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AGTGTTCCCGAAAGTGCTCATTTGTTTGATTCATGAATGTATAATTGCGG
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CGTTAGTTATAAGATCGTGTTAACAGAGGTACCAGTTGGGTTTTGAAGCA
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TGTGATGTTGTCTTTCTATTGGGCTGTTCGGAGGCATGCCTCGGTGCCTC
AAGCTACCTCAACTTTATGATGGTTTTGATGTTGCCTTATTTGGAAAAAA
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CTCTTAAATCTACCTTCTCATGAAGTATTTCTCAGGTAAGGCTCTGAACT
TTTTATGCCTTGCGTGAGGCACATTCTGATGTTGTTCTTGATGGTAGGAT
AAATAGGTTATAATTTGTATTATAGCTCATTTCTTTGAAGTGCAACTTAG
GCCAGTTCGGTTATCTGATTTCTGCAGGATTTCTCCTATTGTCTTACTCT
TGTACTTCGCCAAGATAGCATCATGTGTTAACTTATTAACCAATCATGTT
TGTAACATTAGCTTAGCTTGACTAGCAGCAGCGGCAATAACTCTGTTGTC
TATAAATGGCATACGAACAAGCTAATTGAGTTTTTATGCTCAGTATTGAC
CTAAAATCTTGTGTAAGTTCTAACATACAAGGTATGTCTTTTACGTAGGT
GAAGGATATGTTTTATCATGCATTTGATGGGTACATGCAACATGCTTTTC
CACTTGATGAACTGCGACCTTTGAGCTGTCAAGGTGAAGACTCCCTTGGT
GGTTATGCACTCACTCTTGTAAGAATTAATAGACTAGCTCCTCTTGTATT
TTTTCTTGACATTTGTTTCCTTGGTGGATTATCATCATTCATGAATAAGC
TTTTTTGAACAGATCGACTCTTTGGATACTTTGGCTTTACTAGGTGATAA
AGAGAGATTTAGTGCTGGTGTGGAGTGGGTTGGTAAGAACGTCCGTTTTG
ATATTGTAAGTAAACACGAGTGACATTTTGTGAATCTGGTTTCACTAATC
ACAAATCTAATTGAATCCACCATAACCATTAGCAATTGGTTTAGTTTTTG
CACGGTAATTTCTGAGTTAAAGAATATACATCTGATACATAGTAAACAAA
ACGTAGTACTCTTAAATCTTAATTTGTGCTTGGCAGCAAAATAATCTACT
ACTTGCTGGTTAAATTATGTTCTCTATTAATCTGTTAATCTACTTCACAA
ACGATGACGTGTAGTAGCAATACTTTTTTCTGAATCAAATATTTTAGTAC
CAAGTGTGTCATATCTGTTGCATAGATACCTCATCACTTCATTTTATTTG
AGTCTTGTACTTCTACATACTGTACTTGTTTTCTAGCGTGTACAAATCAA
AATGCTTTTGGGTCAACATTTGTGAGTCTGTTTAGACTTAATTGTTGTTT
AGAGTTCACACCATTTTAGTAATCATGTTTCCTCTGTGCATGCAGAACAA
AACTGTCTCAGTTTTTGAAACCAATATACGTATCCTTGGAGGTCTGTTAT
CAGCTCACCTGATTGCCAGTGACTATGCCACTGTATGTCTGCTGAACCCT
ATCTTATCTTTGCTGTTTATTTCCTGATAACGCTATTTTTGGTATGGCAT
GAAAAGTATATGCGGATAGATATTGCTGCATACTATAATATACACCAGAA
CTGATATGCTGACATGTGACTTCTCTGTGCTCCGCCCAATTCCTAATAAA
TGGATGAAAAATCCTAAATGGGCAGCACAGAAAAGTATATACACGGCTTG
CAAGTGCTAGTATATTCTGATTCCAATATGATCTGCATTAGTCCAGAAAT
TGAAGTTTATTATTTTATATTTTTGTGACAAAACTGAACTTTAATGTGGT
TCAAGTGTTACTGTATTTGATTTAACTTTTCATTGATAGGGCATGAGAAT
TGACTCTTACGATGATCAGTTACTTCATTTGGCTGTTGACTTAGCCCAGA
GATTGCTGCCTGCATTTGACACTCCTACAGGTTCACAAATTTGTCCATTT
GCATCTATTTTTGGAATGGGATATGCTATGTATCACATTAGTACGGACAT
GTGATCCCTCTATTTGTAACAACTGTTATTGTGAAACAACTATTTTCACT
GCTTAGGGATGGTGGTACTATACCTGATTCATGGTTTTTAAGGCGTCCGC
TTTAGGACGCCTAGGCGACGCTTAGGCGTCAAGGCGCCCACCCTCCGCTT
TGAAAAAATGACCGCTTTAGGCGCCTAGGCGTCCAAAAGTGCCCGCCTAG
GCGTCGCCTAGGCATCAAAGCGCCCCCAGATCGCCTTAACGCCTTAAAAA
TCATGACCTGATTACATGGAAAATCATGTTCCATTTTAACATGCGAGCAT
GCACACACACTTTACAAATTTGTATCGCGGTGTGTTGGGATCTGCCATCT
GAGTTTTCCTGTTGTTGAACCTATCTCACTGCCTGTACTGTTTAATGTTA
TTTTGATGGCCAGTTGAACACTCATTTATGATTTTCTGGCTTCTCGCTAA
TGACCAACACGAAGGACATGCTCTTTAAGGAAAAACTTTTCACTCAATGA
CAACGACCTCTGCTGCCTCTACAACGATGGTTTGTTGGAAACCAGAGAGC
TTTTCTGGAACTGTAATTTCAGTAAACAATGTTGGGAATCCATCAACATC
ACACTAGAAGGCAATCTTGATCTTCCTCAGTGCTAGATGCAGCTTTGCAA
GGCCCTTTTTTCTTTGAAGTGTTTGCCGCTGCGTCTTGGAATATATGGAA
GCAAAGAAATGCTCTCATTTTTAAAAATATAGAACCTACTGCTAGAGCTT
GGCCCTCTTATTTTAAGAGAGACCTCATCCTTCTTTCTTACAGAAGGAAG
GATGATCTGAAATCTCCTCTTATAGCTTAGCGAGATGCTCTATATTTTTT
TTGGGTTATACCCTAGACTAGGGCCCTTCTGTACATTCCCTCCACCCCTT
CTTGTACATATTTTATCTCTTTAGTAAATTTTCACCCTCGGGGCCTCCCC
TGCAGTTTCAGCTAAAAAACACTCATTTATTGCACTTTCTGATAGCCTTA
CCAACTTGATTTTACCCAGGTTTGCAGTAGTGAAAATGACACTGATATTT
GCAGACTTTTCAGCTATATTCTGATTGGTGCTGTCTTGAATGAGTTCCAT
TATGCCACAAAATATTTATCTAGCAAAGGTGATTTGCAAAGTGCAAATTA
CAGAAAATCGTCCTTTCTGTTGGAACCGTTGGTCACTGCAACCATTTTGG
TACCCTTTTAATATAAAGCATATTTGTATGCTATATGGTGTTCGATACCA
TAGATGAAAGAACGTGCTAACATATGTCCCTTTATTAATTGCGTTGGAAA
ATTTCCATTGCCTTAGGTAATCATTTTGAACAAAAAATGTTTTTCAACTT
TTTAGTTCACATTCTGTTCTATTTCCTATTGCTTGTCTAACTAATGCAAT
TTGTCTTGTAGGTATCCCATTTGGATCTGTTAATTTATTGTATGGTGTCG
ATGATGATGAAAGCAAGGCAAGCTTCTTTCTTCTTCCCTTTTTTGGGCTG
TAAAGTTTTGCAAACATAAACGTGCCAAAACACATGTTGATTATCAGTAG
TGTAGAGATTTGCTGAGAATTCCAAAATACTTGTGCAGTTTGCTTCAGTA
ATTTTGGAGTGGTTTCCTTGAATTATTCTATGATTTTGTTATCACTAAAA
ATAATACCTGAGTGGCATATAAACCTGTACATCACTTCTAAATTTCTTCT
GCTCATGCATTATTTTGAGGAGAAATAACACATATGTACTGTCGAATCTC
CCACATTCATCTTTGGTAACCAGCACAAGTAATTTTTGAAACTTGACAAT
TTGTACCTGGCTATTAAATGGACATGAACAATCATTATATTTGCTGTTGA
CGCTCTGGATGTTACCCCAGATAACATCGACAGCTGGTGGTGGCACTTTG
TCATTGGAATTCGGTGTCTTAAGTCGGTTGACTAATAACACTGGTCAGTA
TTGGCAATATGCATCAGTTTTGCACTTTACCTTTTGCAGTATTGCTTTCT
TATTATTGGTGTATTGTATCATTCTTTGTTAAATTTCCTCCTTCTCTCAT
GGCAGTTTTTGAGCAAGTTACAAAGAATTCAGTGCGTGGCATATGGGCAC
GCAGGTCAAAACTCAACCTTGTTGGTGCCCATATAAATGTCTTTACTGGT
GAATGGACACAGAAGGTATTAACCTTTGTCCTCTTGTGATAGGTTTTGGA
TCACCATATATATTATTTCGAGCATTCTCTTGCTGATGTTTAACTCTTTG
GTGTACAATAAACTACCTCATGGCATTTCTGCAAGCATTCGGCACTGTCT
GATATAAATACTACCTCCCCATAGCGACCCGATAGATCTATTTTTTATAA
AATTGATACTCCCTCTGTCCGAAAAAGGATGTTGCAAACGAAAATAGACA
AATATGCAACATCCTTTTCTGGACGGAGGGAGTATATGATTGGTCACATG
AGTGGAGTGGAAATATGTCTATTCTGCAATGTCTCATCACTTTACCAACA
TAATTACCATTACATGATACAGAAAGCTTCCGAAATGTGCTTTCAACTGT
TTTCTTTGCAGTCTTAAGTTTTGAAGATGATTCATCATGCAGGATGCAGG
AATTGGCACAAGTATTGACTCATTCTATGAATATCTTCTGAAGGTATCCA
AAACTGTAAACTTTTAGAGCTAGCTAGCTCTCGTCAGGACTTCCTCTCTC
TAAAGATGTGATGCACACACCGTTTTCTCTTTCTCTTTGTTTCTCAAGCA
CACATGCACACATGCACACTTGAACTAGTTTGAAGCATTGATTATTTATC
TCATACACTACAAGTTTAACATTACATCGATGGATACAGGTCCATTTATA
GGACATATAAAACTGACCTTCCTTTAGCTACCAACATAGTGAAACTATCT
AGCCTGGGAACATTACTATTACAGCTAAGGCAAATTTCGATTTTGCTTTT
ACTTGCTGTTACCGACTGCAGCTAGTCCAGCTTGGATCATTTTCTTTCCT
GGACTAGAAACTTTAGCCTACAAAAAACTCTTCACGGACATACATGCATA
GGTATTTTATCTTGCATACCAACATTCATGCACTTAAGTTGCATGTGCTT
AACCAGTAAGGTAATGATGATGAAAATATTAATGCTAACATAAATCATAT
ATAAGGGGGGTAGTAACATATTTTGGAAAAGAAGTTCTATACCATCAAAT
GCAACAAATGGGCACCGCAGAATAAATTTTTGGAATGATCCTTGATACAT
CATCTAGCTGGTCCTCTCTTCATCTTTTTGTTAACCCTTTTTCCTATTAT
GGATTTTAACAGTTATTTTTTGTATGAACAGGCATATTTATTGTTTGGAG
ATGAAGAATACCTGTATGTATTTCAGGAGGCTTACAAGGCTGTAATGCAC
TACCTCCATCATGATCCTTGGTAAAAATGCAATATGTTTGCTCCCTAGTA
AAATCCTATCAGCATAGTTGAATTACAGTCCGCATGTCATTGTTTGAGGG
TGTTTGGCTACTTTTGCAAGGTTGTGTTGTTTAAAAGTTGAAATTTGGAA
TCTGATCTTGCATGAATAAACTAAGGATCAAAGTCATGTCTTTTCTCTAT
AATATGAAACTGTAAGGTACAACTACATATGTTCAATCATGTTTTTATTT
GTAAGCATTGATGGTCAGATATTTATGTCTGCATACCGTTTTAAGTTCAA
CTGCTTCCTGTTGAATGGGCAAGTTTGAAATGAACTGTCAAAAATGCCAT
GCTAGGTATATTGAGGTAAATATGAATTCTGGCGCGACGGTTTGGCCACT
ATTCAACAGTCTGCAGGCATTCTGGCCAGGACTTCAGGTTTGGGATCTTC
ATATATCAGAACATATACAGCGTGTATTCGGACGGTTACTTATGCTATTT
AGATTTAAGGTTTTAGCTGGAGATGTCGATCCTGCCATTCGAACACATGC
TGCCTTCTTTAGCGTCTGGAAGAAATATGGGTTCACTCCAGAAGGGTTTA
ACCTCGCTACATCCACTGTTCAGGTATTGGAACAACAGAACAATTTTTAT
ACCTTTATGGGTTAATGCATTTTTTGTCCTTGAACCTTCGGGCACCTGCA
AGCCTTGAACTTCAAATGGAATTATCAATTCTAAAAGACACGTATACTAA
TGTTAATCTCACCATTTCCTATGTTTCATAGAATGGACAAAGGAGCTACC
CTCTGCGGCCTGAGTTGATTGAAAGCACATATTGGCTATTCAAGGCTACC
AGAGATTATAGGTGTGTCTTTCTTTGCAAGGTGAAGATATAATTTGTTCT
TGGTTAACACATCAATCTTTTAGATTCAGTTTCTCTCACCACTAAAAGGG
ATAGGAAACTCGAGTGAAGCTTTTTGCATGTATGGTTTTCTTATTGGATG
CTTATGCGGACAAAAGGTGTTTAGCTTTTGTCTTTGCTAATTTGATGGTT
GAATAAGTGATTTCAGTTATAACTGTAAAACTATAACTTCATTAACATGA
AAAGATTGCATGACTGAGTACCTCTATCTGATACTAGCAAGCTCTAAACC
ATTTTTAGTTAAATTTATTCTGTTTATGTGACCAGTTTTCCTCCTAATAC
ATTTTGGCATATATATTAACCGCAGGTACCTTGATGTTGGAAGAGATATA
CTAGCAAGCCTTCAGTATGGTGCTAAATGTCCTTGTGGCTACTGTCACAT
ATCAGATGTGGAAACCCACAAGCAGGATGACCACATGGAGAGTTTTTTCC
TTGCAGAAACGGCAAGTATTTATATATCAAAATATGCGACATAATCTCTG
CTGTTAAAAAGCTGGCATGCCCATGATGTTTTTCGTGGACCGGTGTCACA
CACACACATCACCAAGATCAGTTGATTACATATGACATTAGCTTGTGTTG
GCATAACTATTTATTGTACCACTACTAAACATTTAGTCATTTACCTTGTA
GGGTGTCTAGTCTACTAACACGAGAGTGAACCATAACCTTTAAAACAATC
TCTTCTCCTAAATCCTGACATTTATGAATAGATTTAAGTTCTGATATGAA
TTAAGAAACATAATCATTTATTTCGTGTCTGTTAGATTTTATGTGAATGT
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ATGCTATATTTCCTCCCAAGTTATTATCTGCCAATTAAATCTAACTACTA
ACACATTGCAGGTAAAATATCTGTGGCTTCTCTTTGATTTAGCTGTAGGC
CCTGATAACATTGTTGAAAATGGGCCATATAAGTAAGTACAACTCCAGAG
TTATTAAGTTCAGTTGCTTATTCATAGGTAAAATATTCCAACTTACCGTG
TATCGTTGACTCTGCAGATACATATTTAGTACAGAAGGTCATTTGTTACC
TGCTACTCCCGAAATAGCCTTGGTAGATGAGCATTGCCTTTATTTGGGAG
CATTCTGTAATGACAGTACAACCCGTGGCTACGGTAACGATGATAGTTCC
AGTAAGCAGCGAAGTTCTAACTACACTCAGTTTGATGAAAGACAAACCGC
TTCCAGTCAATATTCAATGTCAAACGTTTTGTTTAGAACAAGAGGTTATA
TCAAGGTATACCCTACTGCATTTCTGATTCACAGTTTCCTTAGGCACGTC
TCTACAGAAAGAAAAGGGGACGATAATGGATTATGTCATTTGAAGAGATT
TCTCTTTAACAATATATTCACTGTTTGCATGAACATATTTAATGGTGTGA
TTAACATCCTACTCATTGTCATTGTTACTGGTCCTTCATTGAAGGTCGGA
AGAGATGAGATTGAACTTTATCTGAGTATAGTTAGGAGTGCCATGCATGC
TTTCTATGTTAATCTGATGTAAAGATGAATGATTCTGTTTTATGTTTTAT
AGTACTTCTGCCATTCTACATGAATACCACATTTACCAAGAGGATCCTCT
ATGATCTTGTGCCACTTCAGTTATCTTATGCGCACACACTGGTCTGAAGT
GCCTCCTTTTTAATTACTTTTTTTTTCTAACTGCAATGTATCTTTTTGCT
AGGGAGTTTGTCCAGGATTGAGTCAGGCGCAGAGACTTGGCATATCGTAC
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CTGTTGTATTGATTTCTCATCCAGTTACAAGGCAACCCGATGAGTCCTTG
ATGACCAGGTCAGGAACTCAACATCATGAAAACATTGTGGTAGTTGCCGA
CTCCGAGTCCTTGAGGGAGCCCACGAGGACTGATACTACTGGCGGCTCGT
CCGAAGAACTTGCCGTGGACACTGATGAAGAAATTGTGTCTCTAGACCAA
AATGAAGATAGTACCAGCGGACCCTTAGAGTAGGCACCAATTTTTGTACA
TGACTTGGAGCACCTCCATGGTCAGAGCTGGCCGTGTTACACTCGAAAAC
TGTCAGCGTGGGAAACAAGCAAAAGCAGTGTTGGGTCAGTGGTTAATGAG
CTGGAATCAGTGGTTGAAATGGGGCCATTCTTTGAGTCGTGCAATGAGCT
GGGATCAGTGGTTGAAATGGTGCCATTCTTTGAGTCGTGCAATGAGCTGG
GCCCAAGCAGCATTTACCACCAGAAAAAATCTAGTAAATGAATTTCCTAT
GGAAAATGGACTTGGGAATCGACATTTGTTAATTTATTCTGTTGTACCGA
TTAGATTTTTTTTGGGTACTATATATACTTCTGATCAAATAGCAGATGTA
AAGTCGTATACACTAGAGGCAAACAATGAACTATATGGCCAAATAGGTGC
AGTGGATATTACAGATTATCAACAGCCCTACTGAAATCTCTGAAGATCTG
TGTCTGAAATGTTCCTCAATTTTTTTTATTCAAGTTGCTAGACGCACAAT
ATCAAGGGAGGCAAAGCATTTCTTCTGACCGCTAAACATCTCTCAGAATG
GAAACACTTAGATACAAATATCCATGTCTGGAATTACATTACACCGACCA
GAGACCATCGCCATGCTTACACGGAGATCATACGAGATCAAAGAGAAGAC
TTAGAGCGAGAGGCCGCCTGACTCCTCGTCCTCGTCGAGGCCGGAGGTGT
AGACGGTGTAGAGTGACCAGATGAGTCCGAACACGCCCAGGAGGATCCAC
CCCAGCAGGTTGTTGCTCAGGCCGAGGCTCAGCCCGGTGCCCTCCGTCGA
CATCCGCTCGTCGACGAGCGCCAAGGCCGGGGCCGCGGACACGGTCACTG
CAGTCGCTGCGGCGAGCAGGGAAGCGCCTGCGCCACGGACGGCGGCCGCC
GGAGTCTCCTCCTTGGCGTCCTTGGAGTAGCTGCACCTCACCCTCTGGCT
CCTCGTCGTCAGCTGGGGCAGACCTGCACAGTTAATCGACAGGTCCTTCA
TGCTCAGCTCATAGTGAACTGCCAACGTGCAAATGGAACAGAGTTTTGTG
CATAGAAGACATGTATAGCACTGCGTACCTAGAGCCTGCGGCCTAGTGAC
CACGGCACGGGCAACGACGGTGGTCGCCGCGGCGGCGCTGATGGTGGCCA
TCGTTGCTGTGCTGTGCTGTTTCTGGCCTGCTGGTGCTGCTAGCTGGAGA
GTGTGTCTTGCTCAGGTCTTGGCTAGCGTGTGCTGCGCCGCTGGCGTTTC
CTTTTTAAGGCGACATTGGAAAGTATCTCGAATCGAGAACGGTGCGAATC
GTCTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.