Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE009634

[Submit comment/correction]

Sequence	AE009634
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE009634
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTGCGGCACGTCCAGGCTTTGATAATTTCCTGGGTCCGCCTCTGCCCAG CCCTATCGCTCGCCGGTGCATCCCAGCGACCTCTTCGCGACCAATTCCTC CACCGACGCAGGCTCCCCTCAACCCCAATCCAGCAGCCTCCCAAACCCTA GCTTCATCCCCTGCCGTTCTTGGCCGGAATCGATGCGGACAGCGGCAGGG AGGGCCTGGAATCGCGGAATCGATCTATAGCGGAGCCCTCTCGGGAGAGC AGGGTGCCCCTGCGGCGAGGACAGGGCGCATGGGAGCCGAACGCCTATGG GGACGGGTGCCTAGGGGGTCTGCCAGCGGCAGGGCTGAACTCTACTTTGC CCACGTATCTCTAGATCCCTTCTGGCTTTACTCCTGTGTTTAATTTCAGA CTTTGGTCTAGATTTTGGGTATCGTGAACGACATGACCATTCAAGAGGTC CATGTCTCTTATTTGATCTTCATTTTGGGTTTGGTCATCGTCTCAATAAA AGGATAGATTAATTCTGTTAAGATTTTAGTGTTGCTTAGCATGTTTATCA TGATTCTAGAAGCCAATAATTGTTGTAGATAATTGCATGCCCACCTGCTG TTGAATTGTGCTGTCAGCTTATCGATGTTGTCAGATATCCTTGCTAACTA GGTACCCTACAAGATTATGAATTGGATGCATACTCATGTCTTCTATCTGA GTTGTAACCATATTCATCAGTGTTACACACTTAATTGTGTTTGATTAGTG TACAGATTAGCCTGTTGTTCTTGATATGGTTTAATTTTTTCAATTTAATT AACCCCTGACACATATGTATCACAGGGCTAAAACTTATCTTTTTGGCTTC CAATAACAACTGCATCAGATTCCATTCACATTAATACTTTTCAACTTCCA GCAGACAAAAGGGGTGATTGTCCTTCAACTGTGCAGCGCAGGAGCTTCAC GAAGAAGGGGTCCTGTTTGAAAGCTATTCTTCTTAGTGCGCCTCTTTGTT TGTTTTGGTTGTTCTGCTCTTCCCGCTGCTGTTTAACCTAATATTATCAC GGTTTACACTTGATGATTGGATTATATATGTAAGAAGAAAAAGGATGTTG AGCTAGACAACAGAACAATCGATGGTTTCAAATGCACTTCCATTTTACCT GTTCGCATGGAACATATCATGGGGCTTTGGCGTGTATTTTTTCAGACTGA TAATGATATCTATCCATAAAATCCAAGTTATCATATATGATATTTTAAAT ATTTCTCGCACAACTAATGGTAGTGGAATTGTCTTGATGTAGCACTACTT TAGGATGCAATACTTGAGATATTTAGTTCCATATTTAAAGTGCAAGTGAA TAAAATTTTAATGGCATATGTTGAAAATTTGTTTTACGTATATTTGATGA AATTTCGTATAGGAGAACACAACTGATCGAATTTACATGGCTATTTATCA ATTACAATCTATATTATGGTGATGCACTAGATGAGAACCATAGCGCTTCT GCTACACACTTGCCAATTGCGGTATGCGGAGTTAACCAGACTCATGAACA AAAGCTATGAAGTTGCCCCAGTCAGAGATTTGATCCTTGGATTGTCCCCG TGCCCATATGATTATGTGCATGGACGTTGATACTGAACAATCAGACTGGT TATACCAATTAAAAAATGGTACGCATTCTTAGAACTTTGTTGTATGCATC CATCCAGGTAAGAATTCGTTTCCTCAAGCTCTCAGCAACGCATGCAATTC TGAAGAAGTTGCTCCAGTAGAAATCAACATGAGTAGGTCCTGAAATTTTG TCTCTTGTTGCAGCTATACGGTGCTGATTAGTATCACTATTACATTTAGA GTCTAAAACGCTCCATGGCCATATCTTGTCCCGATTTCCTTGGACATCAG TACTAGCTATTGCATTATAATTTTCAGTTATGACACGATCTGAGGTATTT TGGGATCACCATATGTCAAACAGACTGGGATTTTCAGCACTACAAGTGAA TACTAATGTGTTTGGCCCTTTCAACTTGGCCACATCCCCCTTGAAACCTA ATGGCAAGAAAAAGCTATACCAAATATTTGCGAGCAGTTAACTTTTCTCT TTTTGTCGGGAAGTTCGTTTCGTACCCATGGTAAGTTCAGTTGTTCTGTT AGCAAATTTCTTTTTATCGGAGACTTCAACCATTTGTGTTTCAAATTCAT TTTTGGCCAGGAGTACAATTGTCCAAGTGGAAGATCAGTTTGAAAAATGC ACTTCTCAAAATTCGAATAGTTCAACTTTTATTTCTGAAAAATTCACTTT GTCCGCTAAATATATGTGAGACGTAGAAGTTTAATGAATGCAATTAGTTA ATCAAGTCTTCATTTTTAATTTGATTATATCATCTATAATAAACCATATG TGTTGTCTTTGTTATTGTTGAAGAATATACATGTAAACACAACTTTTAGT TATTTAATATTCCAACATCTCTCTACGTATGGGAAGGTCGTTTTTTTATT TGCTAAAGTTTAAGTAAGGTGATAACAGATGTTCAATCAATATGTTCACA TTTTTTATACTTAGCAACGCACGGGCATTCAACTAGTAGAGATAACCGAG GCACGCGGAAATGATGATGTTTTACCGAGTTTCTCCCAACAAGGGAGTAC GTCTCGTTTGGAGAGGGTGTGGTTTCAAACCACCAACGCCATAAAAGGCC TCCATTATTCTCCGGTGAACCTTTCCCCAAAGGGATTGATCCACTCTCGA CTATCGGTGCACTTGTCGGTGGCAATCCGTAACCTCGCACAAAGCTTAGG GTACTTCTCCACAACTCAATTGGAGGCTTCCAACAAACAAGCTTGGGAAA GCTCCACAACTTAATTGGAGGCCCCAAGAATCCACAAACCTGCAATACAA CTAAACTGTCTAGGGTTTCAAGAACCCAAGAGTAAGAAACTTCTCACCTT TCACCCAATCGAATAATCACCGAGAACTCAAACCGATGCACTAAATGAAA TGACAAGAACACAAGAAGTGCTCAAGTGCTTCATTCCAAAATTTCACCAA AGCTACAAAAGCTTATGAGGGAATAAGAGAGGAAAAACAATGGAGGGAAT CCACAAAAGACTTCAAGATCTAGATCCCAAGATGTTTCCCTTATTAGAGA AGAGATTGATTGGTAGGGTTGTAGATCTAAATCTCCTCTTTTAAATCCCT CAAGAATATGCAAAAATTATAGAAGGGATTGAGGGATAGCAAGCTTAAGA AGGTCAACAATGGAGGAGAAAAATTGCAAGAATGGGTAATTAACCGTTGA GGAAGAAGGGTCCCTTATATAGGTCTTCCAAAATCTAACCGTTACAGCTC TGGAGCACGCGAACCGGATATTCCGGCTAGTTTCCGAGTGGTATTAGATT TGAACATCTGAATGGCAACCACACGACTAAAATCTGAGATTTCTGCGCGA CACCGGAGTGTCCGGCCTTTTCACTCCGGACATTCCGGCAAAGGCAAAAC CAACAGAAACAACAATACAAAAACAACCATAACTTTTGCATCCGGACTCT GATCTTGATGATCTTGGGCTCGTTTTAAAGAGGACAAAAGGCTCTACAAG ATTATATAGGGAACAATCATAGTCCAGCAAGGGAGGATGAAACCAAATAA TGAAAGGTTTAACCTATCTATAAAAGACAATCGGTAAAATCTTCAATATT GAAAACGCAATAGAGAATGCATATGAAATCCGTTTTTGATGAACTTGAGC TTGTCATGAAGATTAATACAAGCTCTAAATCCTCTCATGAATAAGAACCA AGAAAGAAGATGCCAAGTATGTAAAGGTTTGAGCTCTCTCTGAATGATAT TATCAAGTTACTCACTCGAGAGCCCCTCTTGATAGTACGGATATCTATCC TATAAACTGGTCCTCCAACTAACACTACGAGACCAGTAAGAAAGAAACCC TATCAAGAACATACATTTGCCTTGCACATATTCCACTTCAGTTTGATGGC GACGATCTTGTCTACCTCAAGATGGAACACCTTTTTTGATTGCGCTAGCT TGGTGGAGACTTGCAAACTGCTCCCTCATATTTCACTATGGTAGAGCTTC TCTTTTGGGCACATCTTTACATATCCATGAGCACCATAGAATGGAGAGCT TCAAGCAAATGAATCTTCCAGATGGCTCATCTTGAACTTGTACTTTATTT TTTTCTTTCTTCATCATGTTGGTGTCTTGAAGGTACACAAGAGATATCAC ATCATATTATTTTTCAATACACACTTGCCATAGGCTCAACTCTCACATGA CCAATCTTTGGATTACTCCTTGAATATCTTGGTCATCACTTGATCTTCTT CACTTTCTTGTTCTCCCAATCTTGAACCTAACATATGATTTAATCATTGC CTATGGACGAATCCTATAAGTAAAACTCAATGCAAACATAAATCCATAAA GATTGTCATTAATTACCAATACCACACATGGGGGCACACATGCACTTTCA TCTAACATTCTATAGTTTTAATAGACAGGGCACAACAACGCGCGCCAATA TAATCTAGTAGTGTACGACAACACCCGACAGACGGCCCACGATCAGCACA CGCAAGGTGGAGATTTGGTGCACATGGGCATCCAGCTTTAAAAAAAATAT TTTTTTAGTTCCAAACAATTCTAAAAACAAATTAGGATGTAGCCTATAAT TTATACCACAAGCATGCAAAATCTAAATTCAAAATAATGTGTAAAATAAC AAAATTGTAAATCTATAGTAATAGTGATTTCAAATCACAAAAAAAATCAC ACTTTGTCATTTCTATGTTACTTTTGTGTAGCTCGAATACAAAACATTTC AAATTAAGATTTTGCATGTTTGTGGATCATTAGTAACTTTTATTATTCTA TTTCAATATTTTTTTAAACTTATAAGTGCAAGTTTTAATTTTTTAAATAC ACAAAGAGCAATGGAGCTCAGGAGTCAAAAGGACTTTCGCATCACAAAAA AATTCACGCGATAGTGTAATCTTGTAGGTCTCTCCCAGATAGTGTTCTAT CAAACAACAATGAGTCTGGAGGACCTATTAGTGCGGTTTAGAACACTAGG GCCACTTTTTTCGCGAAAACACATAAACTTAGCGTTTCGATTCGTTGGGA AAAAGGGAGTTTTGTATCAAATATACACCAGCTACGATGAGCGACACTCC ATACAACTCAACCCGCTAGAACTACGGGACCATCGGGAGCAAAGCGCTAA GGCCACGTGCTCCCGCTACGGCCCAGGAGCGAGCCACAGATCAAATCGTA CTGAGAAGGTTACTCATGTTAGGCGACGCGTTGTCAAAAACTACTGCGAT CCGCTGCTTCCAAATCTCCCGGGCCGTCGACATGACGAGTGAAGACGTCC CCCTACGCAAGGCGCGAGGGTGGAAGACAAAGTCTCCAGCCACTAGTCCA CGAAGTCTCCCTCTCCATCCGATGGCATAACCGTAGATAAAATCCAAGAG AGCACCTCATGCTAAATTGCCTTGGAGAAGAGGCAACCCACCATCAAATG AGTCATGGTCACAGCAGATTGGTCACACAGTGGGCAGCGCGGGGGGTGGA CTAAGCCCCGCCTCGCTAGCCTCTCTGTCGTCCAGCAACGGTCCTAGCAA GCTAGCCAGACAAAAAATTTCACTCTGGGTGGTGCCCAAGCCCTCCAGAC AAGCTGCCATGAGCTCAAAGCCATGCCGAGTAGCAGGCATCCGGCGTCCA TCGCCAGAGAAGGGTATCCGGCTCGTCCGACAGCCCAAAGTCCCACACCC AAAACCAGAGTTGTACATATTGCCAAAGGGCCAACGGACTCGGCGCGTCC TGAATATTAGCAATCCAGCAGTGCTCCAACATCGCCTCTCATCGTCCGGC GCTTCCTAGGGATTGACGCGAAAAGTTCTTACCCTAACTCCTGCATGGTC CTCCAGTCGAGCTTGCATGCGTCCAAAAGTATAGAATTGACCGATATTTT TTTCCAAAGAGGGTTATGGTTTCCTGTAAAATAGTGCAAATAAGCTCAGA AAAATTCAGACACAGGTCACGGAAGCCTACAGATTAACAACCCACATCAA AAAAAATCCTAAGAATTAAATTCCTACGAATTAGAAAATTAAAACAGAGA TAACAAATATTCAAAATTCTTATAAACGTTGAATCTCATAGTCCCAATCT TAGCCCAAAAAAAGGCCTGAAAGCCTTGAAACATGTATTTACGAATGAAG CATTGAAGCAAATGGATGGCCTCGACAAATGCATCCTCCGAGCTGATCAG CACTGTGTGGTCAGTTCCCAAGGAAGTCATCACTTCACCAGATGGCACAT CAAACAGCAGAAAGCCCTTTGTACTCCCTTCGTCCATTTGTCTAGATTCG AATGTATCTACACACAAAAATGCGTCTAAATATATTCGAATCTAGAAAAA CTCAAGTCAGTTATTTCTGGACGAAGGGAGTACAATAAAACCTTCCGTCA AAGAATCATCAAAGTCATTATTGACCAAATCAGCCTTTTGAGGAGTATTA GTCACATCATTTCAGTTCTGAACTTCTGATTACCGCCATAGACCGAGATA CTGGAGGGAAAATGAGATCACCACATGGGCACATCATATAAAGGTTGATG AGGATGTTGATGCCTCGGCTATCAGCCAGAGAGGTTGGCGGGCTTGAAGG CAAGCACCGATGTCGAAGGGATGCAATTCAACCCCGTCAAATATAAGGTT TACTCCCGGTAAGAGTACATATGTGATGTCTGCATCTTCTGGATCTGGTT TTCCCTCATGGGTAGATGATTCAGAGATCGGTATGGTGGTAGCTCCATCA TGCTCCGGGGAAAGGGCATATGACCTTTTAAGATTGAGAACATTAGCCAC AAATGAATTAATATGAAGAAACATGTGAAATATGTGACAAAATAATAAAA TCCAAACAATGAGCAAATTCAAAAAACCTGACAGTGCTCCCATCAAAGCC CACAACTTCTGTGCGGCATCTCTGTCGCCCAGCTAGTTTTAGCCCCTCGT GTTGACTTGGGGCTCCTCTGTTGGTTTGTGTTGAAGGATCATTAGTTGGA TTCCATCTGCTACTGATACTATTGATTAAAGTGCGAGGTAAATCCCTTGA GCTTCCCCGCTTGTTAAATAACCTTGCTACCGGACCAGTTGCTTGATATT CACTACAAAGTTCTCTTAGCCGCCTTCTAACATTTTGCATCACATCATAA TGTTCAGTGAGATCATCTTTCTGAAGTATATGGGAAGCAACAACCCTTTC ACAAATCCTCTCACATAAGTTCGGATTGAACAAAGGCATTCCAAACTCCA AACTCAAGGGCACCCACTGGTAACTTGCATATTTGGGATGAAAGCTATCC GATTCAACAAGCCTGTTAAGTCTTAGTAAACGAAGGTACCCAAGTGTGCT CAGCTCAAATTTACTGGATAGGTCTTTCAGTACTGAGGTCAAATTAAAGA CCTGTTCCTTTGGCAAATTAGCTTGAGCTACCACAGATTCAATTGAATGA TCATCATTCTTCAGGGGTAAAGGAATATCCACAGTGACAAGATTCCCTGA CGTGCTAAGATCATTTATTCCAAGCGGTTGCACCAACACAGCAGATTGTT TCAACATTGAGTTCAAGCAGTGTAAGAGTAGATTGCCCTTGACCAAATTT CCTTCAAACTTCCCTCCTAGTCCACCAACTACAGAGCCATCCCAAGACCA TATCAGTGCCTTTTCACAACCAGCTAACGGTTCCGGCAACAATCTGAAGT GTTGTCCTTTCATGAAAACAGCAGATAATGGTCCACAATGGCCTGCAGTA TACAATACTAGTTTCATCCAAGGTGTCATTGAAGAATAAGAGGGTGGACC AAAATGAACTGGGGCTGAAGGACCGGGAAGAACTGATGAAGAAGGAAGAG GAACCATTGACACAATAATGTCATAGTCACGGAGAAATAGCCGTTCCAGT GTTGCTGGAGCAAGTGAAGCTAAGCTCTCACATCGCAGGACATCAACAGT GTACTTCCTTTTAATCATTAAAGCATTGGCATCGGTTGAGCCATTCTCAG CCTCAATTCTAAACATGTTTTCCCCACTTTCCGGTAACTCCATTGACATA GATGATGTATTTTGATCTTTACCATCTAAAATACCAGTATAACGGTTATC CTGGGGCACTTCATCAGTTGCGTCCTCAATGTTCACCTTGGCCAGGTGAG CGGTAACATTGTCATGCAAGGAGCTTGCTGGAGTCTTTGCTTCACCAGCA TCATCAGTATTCTCGTTGGTAGAAACTCCACCAGACTTTAAACACTCCAA GGACCACCGCAGACTGAATGCATGATTAGCAAACTCCTCTAACACGCCCT CAAATTTCTTTCCTTCTAAACTAGCCAGATCACTACATAGTTCCGCAATG CAAGAATCACCTAACTTTCCAGCTTCATACAGCGTGACAGCATGAGATTT TAGACCTGCAGTAGGTTACTTAAGGTGCTCAATACAGTATTTATTTAGGC AGTCCACTAGGTAGTGCCAACAGTCATTTAAATCAGCAATGTACAAGAGA AGAAGTCACTACATTTCTATATTATCCTTAAAATATAGAGAAGTGAAATC TTAGGCAATTGTTTACGATGGTGAAACAAGTAATTGATGTTGAACAGACT TCAGCTACAAATCTGACATATTTAGTATTACAAATAAAGAGAGTATCTAA CCTGGGGACAATGAATCCATTATCAGGTAAATCCGACATATTCAGTATTA CAAATAAAGAGAGTATCTAACCTGGGGACAATGAACCCATCATCAGGTAT GAAGTAACATTGGCATCGACAACAAAGCCTACATGAGCAGTCCCAGAGAT TTTCATGGGTCCATTAGTGTCGATACTAAGCGACTGTGAACCAGACATTT CTGAGTTGATACTTGCATTTGAACCTTCTTCGTCATCACTGAGAATGTTA CTGGGAAATGCATGTCCACCTTCATCTTTAAGTACAGAGTCAGCATCCAC AATTTTTACAGCCCAGCCCAGTCGACATGCAAATGATGCCGCTGCCTGCA GCTGATACAGGTCAGCTTGTAAGGTTGCAGCCAATTCAGCTACAGTAGCA TTAGCACTTGACACAACAAATACAGCATAAAGTAGCCTGCAATCAAGAAA ATCAGGTAACAAATTTGATGGTAATACAGCATTAGTACCGAAATATATTT CCATAGGAAATGAAGGTCATCATGTCACAGAAGGATTGGCAGAACTTACT CTTCAATCGGGTCTTCATAGGATTGATCCTTGTTAGAAACAAAGCCTTCA AGCCTAGAAACTAAACAAAAAGAAGCAATAGGGTAACCTGAATACAAGTT TTCTTAGCACAAATCACGAGACATGCTTATTACTTTAATAAAAGGAACAA GCTCAGGCGTTTACCATTCCTACAAAGGAAGCGCATGATTAGGGATATAT TACCATAGCCAAGTTTAGTAAAGTTCCATTGACACCATTACGTAAATTGT ACTCCCTCCGTTCCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTTGTGAAACGAATG TATCTAGATGTCTTTTAGTGCGTAAGTTCACTCCGAACCTACACACTAAA AGATGTCTAGATATATTCGTTTCACAAAAGCTAAAACATCTTATATTATG GAAGGGAGGGAGTATCTGTTTTCTAACAATAATAACATGGTGATCCATCC ATACAATGAAAGCCAATAAAGGACTGTTTTCTAGAAAAAGCCTCATCCGC CATCCTTACATGCAAATTTAACTATCATGTTTCATTTTGCTACCAAATAT ATACAAGATTTAAAATGTTAAAACCTTTTGTCTAACTCTATTGTAGCTTC TTTGTATAAACACAGACTAGGTCATATAGCAGAGAAACAACTTTGTGTCA GTGTATGTGCTATGTTGCGGGACAGATTAGTATCTTCTAAAGCAGAAAAT ACCAGTACTTCTCTAAAATGTACTACCTTGGCTGGGTTAAATGCTGAACT TGTTAACATAGCAAATTTATGCTCTTTGATCTATGTAGAGAGAATTCCTT ATTTGACACTATGTCCCAATATGATTCCTTATTTGACACCGACTTTTTTT ACTTCCCTATTTGACAACTAGTGTAAATATTTTGCCTTATATGACACTCT AGTGTATTTTGAGAGCTAACGGTGTTAGTTTGGGACCTACAAAGACATTT TTGCCCCTGGTGAATACTGTGACAAACAAATGGCAATCTGCTCATGGTGA AATTAAAAATTCATATCCAAAACATTTTAGTAATGGAGTACGGTTTACAT GTGCACTTGAGACTTGACCATGCGTGCGTTTGAGCTTATGGAAATTTGGG CCTTTTGAAAAACTCTATTTCATCACCATGTATTACCGGAAGTCAACCCA CCGATTTCACCTGCACGTATACTCCTAATCCCACTAGCATAAAGATTTTT GTTGTGACTATTTAGGTCCCGTTCGGTTTGGAGGAATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.