Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE029079

[Submit comment/correction]

Sequence	AE029079
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE029079
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTAGCTGAAGCCAGCTGGCCTTGCAAAAACCTCCTTCACGCGAGTCATCG TCATTTCGAAACCCCACTAATTCCATCCGAAAAGAAATCGCCTCGCCGCC GCCGGGGAACCATGGCCGAGCGACGGTACACCGAGCAGGAGACGGCGCTC GAGATCAAGTCCCTCCGCCGTATCATCGCCGCCTACTTCAAGTACGCAAA TCGCGACCCCTTTCCTCTCCTTCCTCGTCCCCGAACGAATCCTCCTGTTC CCCGAACGAATCCCCCCCGTTCCGTCCTCACCGCGAGATTGATTGGTCGC GTAGAAGCGTAGCTCCGTTCCACCGGAAGTCCGGCGTGCTGCTCCGAGAT GTGGTCCGATTGGGTGGACTGGAGTTCGGAGCTCTGTCCGAGTTCAGGGT CCTTCCGATTTGTTGGGTTTAGGGATGGTTGCCCCAGTTCGATAGCACTG GCTGCGACCGGAGTTGATTTGGCGGTCGCTGGTGAATTAACCTCTGTCGA TGGCTGGGGGACTAGGTTTTGCTGTTTGCTACTCTTTGGGTGTTCGCAAA TAGCACCGCCCAATATGCTTCGGCATGGTCAGTGTGGATAGAGAGATTCA GCGTGTTCATCATTGACGTAATCCAGCAGATAGTGGTTTGGAGTTGCGAG CAACCATGTTAGTATGAAGGCTATGCATGGGAGCGGCCATTTTGTTTTTC ATGTTGTAGAGGGGGAAGATTACTGCAAATAATCTCGAGTTTCCTGTCAC ACTTGCATTTGATTGTTGCTGACTGAAGCTGTTACAGGGTCTGTAAGATG GTCTATTGGTGTTTTGAGTTCTCAAAATGAGGCCATATTAGTCTGAGCGT CGACATGGCAAATTGAGTAACTGATATGGATACTTAGAGATGTAGTTGGT CTGTTGGATGTACTTAAAACATCATTTATCTTGGCTTATTTTGTTGTTTC ATCATTGATGTTACACAGTTACGTTGTTCCCTGCTTTTCACTGATTAGTG ACTTGGCACAAAATGATATCTATACAAGATAAATACATGGAAACAGTCAT TCAAAATGTTGATATTTTGCTTCCCAGGTCTTAGGTCTTTTCTTTTCTCC TAGTATAAAAATATTGATATTTTTCTTTTGTAATAGCTATCAAGATGCAG CAGAGAAAGATGTCAAGAGATATGAACGGTCATTCAAAAAGCTTTCTCCT GCCCACAAGGTTTATTTTTCTGAGAGTCATCCCACATTTAACCTTTTAAT TAATCTAGGTTATCTATTGCTGTATGCTCCCTTATGTATTTCTCTGTGCA GAAACTTCTGTTTCACCTTGGTCTGAAGTACCAAAGATTGAGATGGTAAG TAATATTATGTGCTCAATGCTGGATCTATCTCTCATGCTCTACATCATCT GAAACAGTGATTTGTTAACTGTAATACATGGTTGATTCAGTTAGCTCATC TGGAATCACCAAATGTCACTTTTCCAATTATTTGATATGTACCAATGTTG CCTGGCCTAATCTGGGTATCTGAGATTTGCTGACGATGCTCTATCTTCAT GAGTTAGGAGTCTTCGTTGACTTACTATGAAGAAGCTACGTACACCACTT TGAAATTAGTTTTGGCCATATACTTGTTAAACATCCATCTTTTATTTTGG TATTTGTGCATTATAATATGTTCAAAACATGTGCTATAAATCAGTATCAG ACGTGGTAATGACATGTAGTAACAGGGATGGAGCTAGAAAATTTGTACTA CAGGGGGTAGTTAAACAAAGAACCTCACATGTTTGGTATTGCAGAAATTG AGGTCATTTATATTATATCTAGGGGGCGTTACACATTTTTTACCATAGGT ACCCATGGCCCCTGTGCCATGTGTAGTACTATTTGTACATAAGCCTTTGT GCGTACAGCGTACTGTTCAGTGATGATTGAAACAATTTTTTTACTACTGT GTGTTTTGATGCATTATTACTTCACAGGTGTATATCCATGAATGCATCTT TTGTCATGAATATGCTTGAGGTATGGTCTATTTGAGACTATGTTTGTTGA AAACTGCAATGCACGTGGTGGTATTCTTAAAAAGGAAAGAACTGCAGGCA TTTGATCCTCCTTTCGACATGAGTCAGAATGAGGATGGTGATTGTCATGA TTGTGCTGAGCACGTGCATGGACATGATCACGCGGAGCACATGCATGGAC ATGATCATGCGGAGCACATGCATGGACATGATCATGCGAATTGCGCTCAT TCTAGTGAGAGGGCTGATTGCTCAAGAAGTGTTGTCACCATGAATAATTC CACAATACATGCCCAACATGATTGCCGTGGGGAAGATGTGAAGAGTAATG AATGTTGTGGAGAAACTGGGAATAAGAAGGTAAGTCCTCAGTCTCGATCC GTTTATTCTGTAAACATAACCTGTATGTATAGTGTATATAAAGTTTTCTT TGGAGCTTTTCAGAATAACATCATTTCTAGAAAAAACATAGGTTTTAATA CTTTGATGCGTTTGGGTCTAATAAATACCATAGTTTAACAAACTGTGTTA TTCCAGATACTGTGGTAATTCTTAGAGTATTAGAAAAATGTACCCCAAAC CTCCTTTTCCTAAACATGCTGAATTGCGGTCTCTCCCATACGTTGTGTCC TTGTGCTTAATTGCATGTAGAGTAGCAGGCAAGCACCCTCCATCTGTATA CGCACATGCAGCTTTAAAAGCACTCTCGTCTATCTCCATGGAATGCATCT ACCGCTAGCACCCTCCATACTGTGGTTTTAAAATACTTAGCATCCAAGCA TAAACATGGCAATGAATGTTTTCACGTATAATGATAGAAGGCTGTTACTA TATTTTAGATACAACATTGGATATGTTGCTGAACTATCCTTTGTGTTGCA TGTATAGTCTGACTGATTTGTATCGAACAGGACGGGAAAGTTCACATGGT GGGTTGCTCCCAGCATGCTGTCCCCAACTTGGGGGCGTCCCAGGATGTGG ATAATCCATGTAATGGTGGTGAAGACACAAATGCAGCTGCTAACTATCAA GATACAGATTGCTTTGCATCATCTACTGATGAAAATGTAAGCTCCCCTTG CAAGATGTAAGCTTTTGTTTTTATTCCAAATAATTCCCAAATGCATACTT TTAACAAAGCTTTGCTTTCACACATGAATTTTATTTTGACATGAACATGG CATGTTTGTTATGCTCTCATTGGAAACTCATAATATATTTCAGGAGATCA TTCAATATATTACCACTAAACATTACTTGGAAAATCCTGATAGTTCTGGA CTTCTGATCATGATATTTGATAAATTTAGGACTGGACTCAAATTCTTTTA TACTCTTTTGTAATTATAAAATTGGGCATGTGATGAAAAATTTATGCTCA AGCTAGGTCAGGAGGCTATACTGCAAAAGTATGCCTGGCAAAGAGTAAAC CAGGTATTGTAACTGGTACTCTTTCTTCCTGGTATCAATCCTCTAGGGAT TTGTTGCGTAGTCACTCTTTGAAAAGTGGAACGACTTCACATGTTAGAAA ATAAAAATGGGACATTCACCCGCGTTTTTGGATTTCCACAGAAAAGCGAT TTATATCGTGACTACTTATACCTCTAAGATACTTATTCAAAATTTCAAGG ATTCACTTGGTAAATGGTGACCATTTTAAGCCAAATTGGATTAGCCAGAG TGATTAGCATTGACTCCACGCCATAGCTTCCTGCCAGAATTTAAGGATTG AACATAGGCAACTCGTCCAGCTTTCCTAATTTCCAGGAAACTCTTCAATT CTCAATTTAACAGAAAACTTGTCATAAAGTTTAGGACATGGTATCGGCGT ATTGCACAACATTTCATGACCCACTTTAAGTATATCAAGCACTGATTCCT AGTACGGAATATAATCTCTTGGCACCTTCTACTTGTAGATAATAATGTGT TTAAATAACTGTGGATTATAACAACCCTGTTTTTGTTATTTCAGGTAACT CCAGGGCACTGCATGCCTCCATCTTTTCACTTGGATGTTCCTCCAGTTGA CGTTGACAAAGTAATGGTTCTTGTCATTTACATTCTCCTGATAGGCTGAT AGTGATAGCATAATGTTATAGCCTTATAGGGGGATGCTAGGCAAGGGTTT ATACTTGTTGACAACCCAAGAAGTTGCACCGAAGCTGGCATCTCTCCTGA GATATGATATTAGTGCTTTGCATTTATGTTCTTTCCTTGCCTTAAATTTT AATTCCTTAGTCATGCTATATTCTTGCTGAAGTCGTCTGCGTGCACGTGT TCAGGTGTTGGTCCCTTTGCCTGCATTTGCATTTTTTTCCTTGAATTTTT GTAGTTTCTCTCTCAGATTTTTTTTCTGTTTTATTTCTTCGATCATTCAG TTTCTTCCTATTTATGTAGGTAAGATGCATCATAAGAAATATTGTGAGAG ACTGGGCCCAGGAGGTAATATTCTGTAACTGTAGATTGTTTTATTATGTA CTTGAAGTAGAGCTTCTGTTTTCCTGCAGACATAATTTTCATTATTTTAC CTTTTTTTGTTCAGGGTCAGATTGAACGTGATGAGTGCTATAAACCAATT CTTGAGGAACTTAATCGTCTTTTTCCTGACCGGAGCAGGTAAATATGCAT TGTCCCTTGTTTCAGTAATTAAGAGCTACTGTACATTTGTTTATCATTTG CTGTATGCCTGTAACATTTTAGATTAAGAATTGATCTTGGTTTTAATAGT GACAAGCACTGTTCGTTGGTGTGCATCTTGTTTTGTGTTTGTGTTCACTA GCTTTGCTTGCATGGTGGTTGGGGATGGGGCTTCTAATGGAAACTGACTA GTCCTCTTAGATGGTGTTGTTTTCCCAGTAATGTTAGGAAATTGTTTTGA AGCTGCTCAGCCATCCCAGAACCCTGTGAGGTTGAGCCTTCCTTTCTTTT CTAGTTATTCAACCAATCATCTTTAAAGTACGAGTTGGGCGCAAGGAACA AATTGACAAAGTTCCTGCAGATTCGTGCTTTGTCTTCATACTCATGATTG TTTGATTATGGGCATACTGGTAATACTATTTATGGGCATATTTCCTTAAG GTTCAGCTATATTTGGCCTATCAGCCGCTATGGATGGTAGATCGAAGCAT TTCCGTTGACATCACAAATAAATAGAAGTTTCTTCCTGATTCATTCTAGT TTTCTTTTATTGATTGTATGTTTTGAAATTCACAGGCCTCCATCATGTTT AGTCCCTGGTGCTGGGCTTGGGAGATTGGCTTTGGAGATCTCTTCCCTCG GTACTGTATAGTGATGTTCGATAGAAGATTAGCTAATAAAATATATTTAT TGTAATTCTGTATTTTTTCCCTTGAACAGGTTTTGTAAGCCAGGGCAATG AGTTCTCATATTATATGATGATCTGTTCAAATTTCATTTTAAACCAGTAT GCCAATCTATTAACTCATTGCTGTAAATATTTATATGTGATCAAGCGCCT TTATTAAGTTGTGTTTTTAATGCTATTTTACCACATATTTCTATCAGCAC ACAAGAGGCCAACGAATGTACTATTTATCCTTGGATACACAGCAACTGCA ATTCTCTCTCAGACAATGATCAACTCCGGCCTGTTTCCTTTCCTGATATT CATCCCTCAAGGTACAGTTCACCGTGTTTTTAACATTTTATTACCATTGT CAGCACTTCTGCAATGTAATATGTTTCCATGCTTCATTCTGTGTACATTT GGTGCAAGTTGTATATATTTTTCCTGTTGGACACAGTTGGACTCTAGTAT TCTCATGGGCCAGTTATGTTGATTACATTTGTAGGCAATTTCTGTTATAG GGTTCTATATGTAAAACAGAATAGGATTATGGAATATTAGTGCATTATAG GTCCTTAAAATATTTCTTTGGTCTCCTGTCGGTCCTGGAACTTTGAAAAT TGCCATCCAGGTTGGATTGCACTTCCGGGACCCGTATGATGATTTTCATA GTTCGAGAACATATGTGAGACCAGGGAAACAATTTGAGGACCTATAATGC ACTTTACTCATTTCAGAATGTTGTGTACCCTGTTAAAAGTTTTTGCAAAG CCTACAGAACAATTTGGATGTACAAATTTTGCATTTGGCACTAAAATGTG TTGTCACATACTTAAATTTGACTCTCTATCCTAAGCTTCGTTTTATTTTA GAATCGAGTTTACTACTTGAGCTTGTTTCAGTCAGCTGGCATTATTTATA CTGTAGGTAAGAGCTAAATTTTATTTCTATTGAGTGTGGACTTTAATTAA ATGGGGGTATACAATTTCTTATCTTTTTGTATGGTTCATGGTGGCATATT TAGCTCACATGTCTCTCTTTTCTATTTATAGCGCTGGGATAACCGAAGGG TTTTCGATGTGTGCTGGAGATTTTGTAGAGGTCTATAGTGAGGAAAGCCA AGAATGTAAGATCACCCACTTCTCTTACAAATGGGATTTTATTAAACAAA GCAGGAATCAATATGATTTAAAATTTCTGGGGCCCTTTGACTTATGATGC ACTATTTGAACTGATTGCGGTGCACATATTTGTCACGTGCACTATTGGGT TGCTGTGCACATATTTGTCACGTGCACTATTGGGTTTCTGTGTTCTTGAA GGAATACTTAACCTTCTTGCATGGATCCAGAAAGCCTCTTGTTCTAGGTG CATTAATGACGAGAAATAGTATACTTACATGACTTTCTAAATTAAAGAGG TATGTGCTATTGCAGAATCAACTTAACCGCGCGTCTGCCTGCTACAATCC TAATGCGTGCCCATTGAATAGTTTATGGTTGGAAGTGGGCATGCAACTGC AGGAGGCTGAAATTAGGTGGTTAGATTGTTAAAAGTAGTGTGGTTAAGTA TTTATTGAAACATGGACACTCCTGCATTGGGATCAGTCCACCACTCCATC TTGTCTAAGCATATAAACATGTTAATAATTGCACAACAGCATCTTGCCAG AAGGAATTTGTTCTTGTGGTATGCTAAAACGAGACGAAAGTTTGTGCTGA TTTTGTTTGTCAGGCTGTCTGATTTTTAAATTATGGTTAACAAGAGCCTG TTGTGTTCTTGTTACTTCTACATGTGAAGTATGCTTTAGTGGGAAGCATT TTTGGTGTTGTTTTTATTCTGCACCTTGTTTGGTTTGATTTCATAGGCAC ATAATAAATAAATTGCATTACGAGTTGTGCATAAACTGGTTGGCCAATCT CAAAATAGTTTTTTACTAGGGAACAATGGTGATGAAATCATTAATCGTAA CTGCTCGGTCGGCTGGGAAGCAGAGAGTAATAAGCTGATCGGCCGATCAA CTGATTTAATCAATCGACAACTAACAACCAGTTAACTAGGACGAGACTAA CATATAGCAAGTTTTTAGTGTGTAAATCCCTGGCTCCATGGAGACGGGCT CGGGCTCCTGGAGCAGGGGATGGCATCGGAGAACAGCTCCAGCTGGCGGA GCCCGTGCTCAGGGAGGGCGGCCCATGAGGTGGAAGTGGAACAGGGGAAG GGACTGGGTGCCGGCGCCAAGAATTCTGCAGTGTCGACGGGAGCTCTCCC CTGGCCCAGGAGAGGAGGAGGAGGGGGGGCTGGGATGAGAACTGGACAAA GTTAGACTCTCTAAGCATGTCTGAGCTGACTAATTGCCGACTAGCTCAAT GCACATATGTATTCGACACTGTGCCCCTATGAGCACCGATTAACTGGTCG ACTAAAAGTTGAATCGGCTGGGTTTTTCCGGCATTGCTAGTGGAGTAGTG GTTGCAAAGCAGGCCTCAATTTGCTCTGCATTTAACGCTATTAACTTTGA GAGCACTGAAGCACATCCCTTAGGAAATCATATAGGTTAGTAATGCATGC TATTACTTTGTTCATGGATGAAAGCAAGCCGGAGTCTTTTTTGGAGTTCA ATATTCTTGCATTTCTCTGTTAACTGTTTCATTTATAGTATGTACTTGCG TAATGGATAAATGCTGTTTTGACAATCTTACAATCCTTATATTGTTCTTC CAGCTGCATGGGATGCTGTTGTAACTTGCTTCTTCCTGGATACGGCACAT AATATTGTTGAATACATTGAGATCATATCAAAAATTCTCAAGGATGGTGG GGTGAGGTCTCTTGTTCTAAGATTTTGATTACAATACTCCCTCCAATCCA TATTAATGTTCTCTGATTTGTTTAGATTCGAATGTATCTAGTCATGTTTT AGTGCTAGGTACATCTGAATCTAGACAAATCTGTGAACATTAATTTGGAA CGGAGGGAGTAGCTCTTCTTCATGAGAACCAGTACTACCTATGTTATTTT GTGAGCTAATTTTTAGGGAAGTTCATTATTTAGTAAAGTTGTTTCTCCGG TGCTATTATACCTGCTGTTTCTTTATCTACTGTAAGCACTAAGTCATTGT GTCAATTTGAATCAACAGGTCTGGGTAAACATGGGTCCACTTCTGTATCA CTTCGCTGATTCCTATGGACCAGATGATGTAATTACTCATTTGTTGACCC CCATTATTTATACTAATTGAAGGTGGCATTATCAATTCCTTGACATGATT TGTCTCCTTGAACTCAGGATATGTCTATCGAACTTAGTTTGGAAGACGTG AAAAGGGTAGCTTACCACTATGGATTTGTGATGGAGGTGAGGGTCTATGC ACTGTAAATAGACTATTGATGTTTCCACAGATTATTATTGATATGCAATT TGCAGGTGGAGAAAATGATAGATACCACTTACACAGCAAATATGGCATCA ATGATGCAGGTAAAACTTATTAATCCTCAGGACACTTAAATCAATCTGTT CTTTTACATTCCAAGTGCAGTATCTCAAATAGCCAGTAGGCGATTGAATT CATGATGTATAATTCTATACATTGAATTGAATGTGTAGCGTGATTAAATA CACTACTGGCCACCTCGGTTGGAATCTTGGCCATTTTTACCTGCCCCACT TTCCCTTGCGGCTTGGTGTTGATGTAACTATTGAGGATCCCCCGCTTAGA TTAGTTGAAATTACAGTCGTGCTAGAGTTTGTTAGTTGATACATTTTTGC TACCCAAAATCATATTATATGCACCTTTCTCCTACAGTATTTAAATTCAA TCTGTCTACGGTGACCAATCTTATTTCTTCTCTGTTGAGCTGCAGAACCG ATACCGTGCAGCATTTTGGACAATGAGGAAGGATGCATCCCGATCAAAAG CGAAGAAGCGCACGTGAGATGGAGATCCTCTGTTTGGTGTGGTTAGCACG CAAGCTGTTCAATGTTTAGAAGAACGGATTTCGGTCTGTCGATATCCAGG GGCTGGAAACATAGGACAAATAAGGATGATCAGTTCGTTCCACCATTTCT CATGATATTGAAGCCTCATAGCAAAATGTGTTGGTGAATCCTGCGATAGA ATTTGTGTGGCACTATGTTAGCATACGGTGATGCACCGTTCTTTGTACCT GGGTCCATCTGCATGCTATAAGATGAAAAAATTGACCGGACTATATAAGC TGGTTTTTGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.