Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE028978

[Submit comment/correction]

Sequence	AE028978
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE028978
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGCCTTCTTCTTTTTAAGAGTTCCGCTCTCCTCGCCTCGCGTCCTCATCG GTCATCGCTCACGCCGTCCGTGGGAGGAGGAGAGAGCCGTCGAGCTTCGC GAGAGGAGGGCCCTCTCCTGACGGCGACGGCGGCTAGCGCGGTGAGTGCC CCGTCCCCTCGCCCTCCTCCTCCCATCGGACTCCGCGGAGCGTGTCTCCT AGTTCCCGCCTCTTCGCCCAAATCCAAAATGTTTGCGCGGTAGATTTCGC GACGGTTCGCGCGGCGCAGTGGCTCTCCGTGTGACCGGCGAGTTTGCGGT GGTCGGGACGCCGGTGGTGTGCTCTAATGGGGTTGAGCTACGGCTGTGTA GGGTTGGTGGGTTGTGCAGGTGCTATTTATTGTTTTGATTGATTTGGTTT GGAGGTTCGGTTTAGAAGGGGCATGGTTTCTAGGGTTTTGAACTTCCCTT GATCCGTTCATGCTAGAGGCCCGGAGCTGCGGATAGTTGGCGGTAGGAGC GTGTTGATTTGGCCGATTCTCGAACCACAAAAACCCCAATTACATGCCAT TTGCTCATAGCGGGTTTCAAGCATCTCCCCTTTTGGGCTTATAGGCAAGG AGAGGAATAGCTTTCGACTTCAAGTTGTGTGGAATGTGTTGCTGAAATTT TGAGATAACTCCGTGAATAGAGAAACTGTGAAGTTGGTCACTATTGGTAG CAAATTTCAGGATGGTATAGGGGCTAAATGGTAGTACATTGCTGATAGCG CTGGCCAGTTGTCTGCTGGTTTCAATAATGGCCATCCAGAACAAGTCCCC TGTCTTGGCAGCAGGGAAATTTTTAGCACACATCCATGTTCAACGCTGCT ATATAGACGTGCGCAAATAGCTACTAGGGTTCATGCTTTGTGTATGAAAA CTTAATATCAAGCGCAGCTTGTATCGGTGAACGAATGAATGTACTATTGC TCTGCTTCGCTGTCCGACTCCCTCGAGCCTGTCTCCTAGTTCCTGCCATG GGGCCCAAATCCAGAATGTTCTCGCGGTAGATTTAGCGTAGCGATGGTTC GCGCGACACAGTGGCTTCGTGAGAGTGGCGGGTTCATGGTGGTCTGGACG CTGTTTTTCTCTTTTGTTGGCTTTAAGCTACGACAGAGCAGGGTTGGTGG GTTCAGGTTGTACATGTGTAGTGGTTTTGATGGGCTGGTTCGGAGGTTCG GTTTAGAAGAGGCATGATTTCTAGGGTTTTGGACTTCCCTTGGTCCGGTC ATGCTACATACCCGTAGCTGAAGATAGTTGGCGGTAGGAGGGTGTTGATT TGGCCAATTCTCGAACAAAAAACCCCAATTACATGCCATTTGCTCATTGT GGTTTCAAGCATCTCCCCGTTTGGGCTTAGGCAAGGAGAGGAATTGCTTT CAACTTTAAGTTGTGGAATGTGTTGCTGAAATTTTGAGATAACCCCGTGG ATTGAGAAACTGTGAAGTTGGTCACTATTGGTAGCAAATTTCATGATGGT ATAGGGGCAAAAATGGTAGTACATTGCTGATAGCGCTGGCCTGTTGTCTG CTGGTTTCAATAATGGCCATCCAGAACAAGTCCCTGTTTTGGCAGCAGGG AATTTTTTTAGCACACATTCATGGTCAAAGCTGCTATATAGACGTGCGCA AATAGCTACTAGGGTTCATGCTTTGTTGATGAAAACTTAATATGAAGCGC ACCTCGTATTGGTGAACGAATGAATTTACTATAGCTCCGCTTCTCTGGCT GACTCCCTCGAGCCTCTAGTTCCTGCCATGGGCCCCAAATCCAGAATATT TTTTCGCTATAGATTTTCCGTAGCGACGGTTCGCGTGACACAGTGGATCC GTGAGAGCCACGGGTTCATCATGGTCTGGACGCTGGTTTTCTCTTGTCTT GGGTTTGAGCTACCACAGTGCAGGGTTGGTGGGTTCAGGTTGTACATGTG TAGTGGTTTTGGTGGGCTGGTTCGGTGGTTTGGTTTAGAAGAGGCATGGT TTCTAGGGTTTTGACCTACCCTTGGTTCCGTCATGCTAGAGACCCAGAGC TGAAGATAGTCGGCGGTAGGAGCTTGTTGATTCGGATGATTATCCAACCA CAAAAATCCCAGTTACATGACATATGCTCGTTGCAGGTTTCAAGCAAATC TCCTTTAGGGCTTAGGCAAGGCAAGGAAACTCCCAAGTTGTATGGGGCGT GTTGTTGAAATTTTGAGATAACCTTGTGAACAGAGAAACTGTGAAAGTTT GCCACTACTGGTAGAAAATTCCAGGATGGTGTAGGGGCTAAAATGGTAGT ACATTGCTGATAGCGCAGGCCAGTTGTCTGCTCGTTTCAATAGTTGCCAT CTAGAAGAAGTCACCTGGCTTGGCAGAAGGGATTTTTTTTAGCACACATT CATGCTCAACGGTGCGCTATATAGATGTGCACAAACAGCTACTAGGGTTC ATTCTTTGTTGATGAAAACTTCATATGAAGCGCAACTCGTATTGGTGAAT GAATGAATGTACTATAGCTCCGCTTCCCCCTCCGACTCCCTCGTGTCTAG TTCTGGCTGCGGCATCCAATTCCAAAATGCTTTCGAGGCAGACATCACGG GTTTGCGATGCGGTGCTCTCCGTGAGAGCGTCGGGTTCCTGGCGGCCTGG ACACTGGTGTTCTGTTGTGCTGGGCTCTGAGCTGCGGCTGTGTAGGTTGG TGGGTTGTGCGGGTGCTGTGGTTTTGATGGGTTGGTTCGGAGGTTTCGTT TTGGAAGAGTCATGGCTTCTAGGGTTTTGAACTTCCCTTTGTCCGGTCAT GCTAGTGGTCTGGAGCTGAAGATAGTTGGCGGTAGGAACTTGTTGATTTG GTCGATTATCCGACCACAAAAACCCCCAATTACATGCTATTTGCTTTTCG GGTTTGAAGCATCTCCTCTTTAGGGCTTAGGCAAGGAAAGGAATAACTTT CAACTCCAAGTTGGAATAGGTTGAAATTTTGAGATGACCTCGTGAATAGA GAGACTGGAAGTTGGTCACTAAGTTGGTAGGAAATTCCAGTATGGTGTAG GGGCTAAAATGGCAGTACATTGCTGATAGCGCTGGTCAGTTGCCTGCTGG TGTCAATAATTGCCATACAGAAGAAGTCACCTATCCTGGCAGCAGGGAAA ATTAAAGCACAGATTCATGTTCAATGTTGCACTATATAGATGTGTGCAAA TAGCTACTAGGGTTCATACTTTCTTGATGATAACTTACTATGAAGCGCAA CTTGTATTGGTAAATGAATGAATGTACTATAGCTGCAACCTGCATTGAGC AAATAGCTACTTGAGTTCATACTTTCTTGATGATAACTTAATATGACCCG TGACTCGTATTGGTGATAACTTAATATGAAGCGCACGGGTCATAGGCAAG GGAAGAAGCTTTCAGCTCCAAGTTGTGTGGAATGTGCTGTTGGAGTTTTG AGATAATCTCATGCATAGACAAACTGTGGAAGTTGGTACTACTGGTAGTA AGTTCCTGGATGGTCTAGGTGCTAAAATGGTACTTCCTCCGTCCAACATC TTATATTATGGGACGGAGGGAGTAGGTTGTAATATCATCTTATACTAGGT GCTAAAATGGTACTTCCTCCGTCCAACATCTTATATTATGGGATGGAGGG AGTAGGTTGTAATATCATCTTATATTATGGGACGGAGGGAGTAGTACATT GCTGATAGTGCTGGCCAGTTGTCTGCTGCTGTCAATAATTGCGATTCACC TATCTTGGCAGGAGTAGAATTTCAGCACACATCAATGTTCACTGCTGCGT TATATAGATGAGAACATATCTAGTGCTCCCACCTCTTTACATGCTACCAT GCTCCCACTTCCAAAATTCAATTTTTTATGTTTCAAAAAATTTTGAAAAA AATTTGTGGATGTTCACAAGATCCGTGTTTATGACCCTTAATATTTTCAT AACCAAATTCATGACACACATCATATGAAGCACAATTCGTATTGGTAATC AAATGAATGTACTGTACTGGATTTAAATCCAGAGTTTTAAGATGTAGAGT TATCAATGTAAAGTTATAACACGATCAGTCCTTACAATCACCCACGCTGA TTAGACTTTATTTACTTCGTGCAGGTGCTGGTTAATTTGGCGCAACTTCA TAGAGGCTCATATTTCAATGCGCTTGTGCTCCTCAAGAAGACAGATCTCT GAACCTGCGTTTTTTTGTTATTCACTAGAATAGAGTAACTTCTGGGTGCC ATCTGATGGACAGAAGCACTGTTCCTGGTCCTGCTGAGGACATTCTTGAG GCTGGGAATCATGCAAACTCTAGCCAGAATCCTGAGACCCTTAAGCATCA AAGTTTCCCGTACACATCACATTCAATGGGAAAAAACATGGGAGTAAGGA GAAATTACAAAAGGGCTGCTAACAGGGGGAAGAAAGGATCCCAAGTATTG GCAAGTAGAAATTATCCTTTGAGGTCATCTGATGGTACTGTCAGGATTCT TCGTTCTAGGTCAGTCGAAGAAAAGTCACCTAATGATTCTGTGCACACTC TAATAGAAAAGGCCACAAAGGAGCCACACAGTGACCCTGTGAACACTCTG GTAAAACGAGCTACAAAAAAAACAAAAAAGGGTAAACCCACAAAGAAAAG TTCGGACAATGAGTTCTCGAAAATTCGTCAGCGAGTTAGATACATTTTGA ATCGGATGAACTATGAGCAAAGTTTACTTGAAGCATATGCCAGTGAAGGA TGGAAAAGGCAAAGGTTTGTCACCTCTCTGTTCATATATTTCATTTGATT TGCTGGCATCTTCTCCTGAATTCACCTTGCATTTGTATTAGATTCACCTA TAGTTGAACAATTGTTTACTTGGTAGCGTATTTTCTAGACTCCTGGACGT ATCTGGCATTGGAGGTCTTTGAATCACCTTTATTTTACCTTTTCTATATA TTGTATATGTTAAGTAATATAGGGAACTTCTTTTTCTAGAGCTATATAAT ACACATGCTTCACTAGAATTGGTAAGATCCGCTGCAACCAACTCGGTCCC ATTGTATAGTATAGAGACTCTGAACTGTCCCAGAATTACTAAAAATTGCT ACAAGGTTACAGAGCTGGGTGTTAAGCTAAAATAAACCTCTTTGTGGGTC TTTCCTCTTTAATGTCATTTCATCAACCAGGAGAATGTTTAGGTAAGTAT GAAACCGATGGATTTGTTTCACTAGGTGTACATTTAGTTCGAGGAATAGA CTTATGATTCACGAGGTCTAACTTTCTATAGTTCTCAGTCAATTGTGTCA TGAATCTCTTTGGGCATGTCGTCCATTTGATCTTTTCTTCTTTTTGAGAA AAGAAAGAAATAAAAGAACTTTGACTGGTCTATCCTAATGCACCCTTTAT CATGGTTTTATCGTTTTATTTCTTGCCTTTCTGTCTTCAGAGGATATATT TTATTCGTATACAGTTATATTTTCCAACTATTCTCAGTGCCAGCTGTAAT GATTGATCTTGGGTTTAGTAAAATTTACGTTCTTTTTTGTCTCCTATTTC ATCAGAGTTGCAAGTTTTTTTTTTTTTTTGCCTAGTGTTAAGGACACAGT TCTTGGATATTTTTAGTTGTGAATTCCTTGTACTGCAAAAGAAATGTTAC TCACCCATATACCAATATACAGCTTGGAAAAGATAAGGCCCGAGAAGGAG CTTGAGCGAGCCAAGGCAGAAATTGTGCGGTGTAAATTGAGAATACGAGA AGCTTTCCAGAGTCTTGATGATCTTCTATCTGTGGGGAAGCTTCAGGAAT CTTTGTTTGATTCTGAAGGAGAGATATCTTGTGAAGATGTATGCCAACAC ATTATCTTTTCTGATGTTGTGCTCTGTTATGCTTAGCATTTTAGTTTGTG ACCATGCTTCCCATCTTGCAGATTGTTTGTGCCACCTGTAGTACGCAAGA TGTTACATCGAATAATGACATCATTCTCTGTGACGGAGTCTGCGACAGAG GGTTCCACCAGAAATGTTTAAACCCTCCTTTACTGACTAAAGATAGTAAT AATTATTCTCCCTATTTGTTATGGTATCTAAGGTTATGCTTTTTCTGCTG TTAATTCATTCATGAGATTCCATTCCCTTGTAGTCCCTGTGGGTGATGAA GGATGGCTTTGCCCTGCATGTGATTGCAAGATAGATTGTATAGATATCAT AAATGAACTCCAAGGGACCGATCTTTCCATTAATGACTCTTGGGAGGTAA CAGTTTCACTGTTAAGAATACATAAATTTGGTTTTGTTTCAAGGGCAATG AGTCTAAACTATATTCCACCATGATATTACTACGAAATGTTTGCAGAAAG TTTTTCCTGAGGCAGTTGCTGTGGCACGCGGACCGATGCAAAATGATGCA TTTGATCTTCCATCGGACGATTCAGAAGATGATGACTTCGACCCTGATGC TGCTGAAGAACATGTGGCTGGTCATGTAGAAGTATCATCAGAAGTGGGTG GGGATGAAGATTCAGACTCTGATGACTCAGATTTCATCACCTCCTCTGAC AATTCAGAACATGTTAAGGAGAAAGAGAAAGTTGATGACCTTGGATTACC TTCTGAGGACTCGGAGGATGATGACTATGATCCAGCTGGTCCTGATTCTG ATAAAGATATCGAAGAGAAGCAAGATGAGTCAGACTTCACATCGGACTCT GATGATTTCTGTGCTGAGATTGCTAAATCTTGTGGTCAGGATGAAGTTTC GTCAGGTCCTAAGGTTGGAGATTGTAGCGATGACATGGTTGGAGCCACTG TTCAGCCTAACACAGCAATGCCACATCTCACTTCCAAGGATCTTGAAATC GACCAAGATTTGATTTTACCTTCAGGGAGACGACGGCAGGTTCAACGGTT GGACTACAAAAAACTGTATGATGTAAGCCCTCAACTTGCATGCATGCATG CCTATTTTGAAAGTAATTTTGCTGATGTTTCTTGCCTTGCCAAAACCTTT GGGTGTAATTTTTGTATCAACTACCAGCGGAGTTCTTACACTTTATTCAG GAAATATAGGGGAATCCAGCAGTTCCACTGAAGATTGAAAAAATTATGGT GATGATCGACATGATTATAATGCGATAACCTTAACTAGGAATGCATGCAT ATACCCTGATAATTTGGCAGTAGATACGTAGCTGATCTGCTCTTTCTTGA ATTTTATTATTGTTTCAAGGCTTTACGGAACAGATAAGAGCTTCTGAACT GAGGCTGCTATTTGAGTAGAATTGTTGTGTGTGCATGCATGAACATGTTT TACTGGGTTATGAACTTGACATGTTTCCTCTTCATGCTGAAACCAAAAGG ATGCTTATGGGGAAGCACCATCTGATTCAAGTGATAGTGAAGACTGGTCT GGGAAGAGCACATTCAAAGAAGACGATGAAGAAAGAAATGAAGTGGAATC ATTTGCACGCTCCAGAGAAGCACGGGTTGTGCAGCAGAATAGTGAGTGCT CTCCACGAAGTGCTCGACAAAGCTTACATCCTGATGGATTTCATGGTTTA GTAAATGGTCAACATGCAGGGGAGCTTACCTCTGATGGCAGCAATAGTAA AACTAAGAAAAGGCAATTTGGTCCAATAATTAATGAGGTACAATGACACA TTCTCAGCTCTTCCTGGTTATGTACTTGTCAGAACAGTCGGGACAAGCTT TGATAACCAAAGTTGGGTTGTAGTTGCTAACACCTCATTTTTCTTGCAGA GGCTAAACAAACAATTCACAACAGACCAATATCCTAGCCGTGCTGTTAAA GAAAGCTTGGCCAAAGAACTAGGGCTGACATTCCGTCAGGTTTGTACATC TTTGTCATGAATTTCAATTGCATGTGACAGTTAACTTGGCATTGAGCAAA ACCCCCACAATGGCTTCTGCTAACAGGTTAACAAATGGTTTGAAAGTACC CGTAGTGCCGCGAGAGTAGCTGCTACCAAAAATGGCACTCACCTAGAAAA CCATGGCAACAAGAGGAAGAGGGGCTCAGTGGTAACTCGCACAGAAGTTG CAGAACCCAAAGAGATGATGTTTGAAAAATCTAATGCATGTAAAAACGAA GGTATCAAACAAGACGGCTCTTCTGGAAATTCAGAACCTTTGGAGAACAT AGAGAAAGTTACTGACCTTGGATTACCTTCTGATGACTCTGAGGATGATG CCTATGATCCAACAAGTCCTGATTCTGATAAAGATATTGAGGAGAAGCAA TCAGTTTCAGATGAGTCAGACTCTGATGACTCAAATTTTATCACCTCTTC TGATAATTCGGAACACGTGAAGGAGAAAGAGAAAGTTGATGACCTTGGAT TACCTTCCGAGGACTCGGAAGATGATGACTATGATCCAGCAGGTCCTGAT TCAGATAAAGATATCAAGGAGAAGCAAGGTGAATCAGACTTCACATCTGA CTCTGATGACCGTGACAAATATGTGGTTTTACCAGCTTCAGGGAGACGCC AGGTTCAGTCTTTGGACAGCAAAGAACTGTATGATGTAAGCCCTCAACTT GCATGTGTGCATATCTTAGCGCCTATTATTCTAATAATGTTTTTGTCCTT GATGAAAGCTTTTGATATGTTTGTTTGCCTTACTGTAAACTGGGAGAGTG ATATCCTTATTCAGAAAAATGAAAGCCAGCATGGGAATACTCAACATAAA TTAGAATGTGAGCATTGACATACATGGATAGCCTGATAATATATTACTCC GTACTAGATATGTAGCTGGTCTGCTCTATCTTGAATTTAGTTAGTGTAAT TTTTTTAGCTGATACTGAACTGTTGGCTTCAATTTTTCTGTTGAGCGGAG TTTAGCAACCATTATCAAGTACATCTTTGCCATGTGCACATACATGTACG TGTTTCACTGGCTTATGAACTTACATATTTCCTCCTCATGCTGAATCGAA AGGAGGCTAACCAGGAAGCACCATTTGATTCGAAACATGGTGAAGATTTA CCTGAAAAAAGCACACCTGAAAAGCACAATGGGAAACCAAGTGAAGCAGG TCCTTTTGTTCCCAAGAACTCTAGAAGCACAGGGACTGTGAGCCAAAGTA ATGAATTCACTCCGCAAAGTGCTCCACAGAACTTGCATGATTCGGTGAAT GAGGAACATTCAGAAGAGCTCCTTACCCCTAATGGAAGCAATAGTGCAGT CCAGAAAGGAAAATTTGGGCCAATAGTTAATCAGGTACGGTGGCATCCTT TCTTCCTAATCAGTTATTTTAGAGTTTATCAAGAATGAGCTGAACAAGCT TATCTTTACTACTCCCTCCGTCTCAAAATAGATGTCGCAAGTTTGTCTAA ATTTGGATGAATGTAGATACTATAGTGTCTAGATACATCCAAATTTAGAT AAATTTGCGACATCTATTTTGAGAATTAGGGAGTATTAAATTAACCAGTA ATATTGCTATCATAAGTTTGATTCAGATGTAATCATATCATTTTTTTTGC AGAGGCTACTTGAGCTTTTTGAAACAGATCGATATCCTAGCCGTGCTGTT AAAGAAAGCTTGACACAAGAACTAGGTCTGACATTCCGTCAGGTTTGTTC CTCTTTTTCCTGAATTTCTGATTGCAAGTGATAATTGTCTTTCCATTGAG CAAACCCTCATTATGGCTTTCTGCTTACAGGTTAGCAAATGGTTTGAAAG TAAGCGGCGTAACAGAAGAGTACCATCCAACAGAAGTGGCACTCAAGTAG ACAACCATAGCACCAAGGAAAATGGGAGCTCAGTTGCAGCTCACATTGAA GTTACAGACTCCATGGAGACGATGGTGGAAAAACCTAATGTAAGCAATAG TGATGCTGCAAATGAGGATATGCCATCTGGAGTTCTGAACAAAGGTATGA AGCAAGATAGTCCACTGAAACGAGACATTGGTGGTGCACTGAAGACAAAT GTCAGCCCTCCAAATAGCAGTCACAGATGTACTCCCACCAAGGGTGAGTC CAGAGAAAAACATGGAGAGAATGCCTCCTCAAGCTCCGTTGGAAAGCGAA AAGATGGCGATGCGGAGGATGTGGTTCTGGCGCTAGAAGCTGTAGATGAG AGAACAAAGAACTCTGTACTGCGGGAGCTGAAGAAGAGGAAAATCGGCTG AGGACATTTCTAGCTAGAGACCCTTTGAAATTGCAAGTTGGGCCATGATT CTGGCTACCGCTAGTCAGCTGACTCTTTCACTGGATCATGCCAGTTAACT TACCTAGTGGAGAAGCAGTTACATTATTTACCTGCATGGTGGACGTTACC CCGACAGGAAGCTTGGGTCTATTTGGGGCTCCCCTCTTAAGATGGTTATA CTCGTTCAGATCGTAAGTGGTAAGAACTGAAATAGTGCCAAAAGACGATG GTGCGCTGTGGTTGTAGAGAATGTAAACGATGGGATGTCTTGTTGTGCAT TCAACTCTGTTGTCTCTTTTTACAATGTTGTGAAATTATGGTCCTTGACA GTCATGGGTTGTATTTGTTGTTTCCCTAGACAAGAAACTAGATTGCCATT CATGTTGTACTGTTCGTAATGAGTATGTTCATCACATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.