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GrainGenes Sequence Report: AE024062

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Sequence
AE024062
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE024062
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCACGGCGCCTGCCTCCCCGATCGAATCGATCCATCGATCGGAGCCGAAG
AAGCTCTCCCCCATCCCCTCCACTCTGACAAGCCCCCGCCAAAACAAAAA
CACATCATCCCCAGTAGTTAAGCCAGCACAGCTCCCGCACCGTTGCCGCG
CTCCGATTTGAACCGGGGAGGAGCCTCGACGCCCCGCCTCCGCCGTGTCG
CGCGGCCGGGAGGCGGAAACCCTAGCGATGGCGGCGTCCGTGGACTCGGC
CTCGGCCGCGCCCGCGCCTGCTCCCCCACCGCCCGTCGCCGTCGCGGCTG
AGGAGGTCGGCGGAGGCGACGCGGAGCAGGCCAGGACGCTCATCGGCGCG
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CGTCTCCTCCATCTACCAGGGGGGCGGCGAGGAGGACGAGGAGGAGGAGG
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TAGACGATCATATAACGTTTTGTAAGAAAATAAAAATAGATGATCCAGAT
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CCTTTTGGATTGTTGAAGAGAGAATAGAAACACAACGAATCTTTTGTTTT
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GCTTGAAGATGCTATATTTGGGAACCAAAGGATGCACATGTCGTGCTCAA
AATTGACTGCTGTAAAAGAAGAACGCTTCAATACTTCCATCCAGCATCGG
TTAGCTGAGCTCGAAGGTCTTATATCAAATCCTTCATTATCTTGTTTCCT
GATAGTTTCTCTTAGTTTCATTTGCTGCAGAAAGTCATACTATTGCAAGC
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TCCTTCCATCCCAGTAGGCCTATTCGTGCTCTAGCACACGCAAGGGAGCC
GTAGACAGGCAAGTGAAACCCAATCCAGGAAATAAGTTGATTGTGGTAAA
GGTCGTAATTCCAGAGGAATCATTACCACGTGGTGTTGGCCTATTCATGC
TCTAGCACACGCAAGGGAGCCGTAGACAGGCAAGTGAAATCCAATCCACG
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GTGGTCGGAAAAGAATCAATAGAATGAGGATCGGACGATATCTTTCTCGA
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TTATTGGATACTGACTATTGAGCATGTGACAAAACACAAGTTGCCTGCAC
TTGCATTTTTTTGATAGCTGCTTTCTTTACTGCTTGGATTTACTAAAACA
TGTGTAGTTGTTTAATCGGTTATGTCTACCAGTGACAATCTCGTTTCTTG
TTATCTGCCAGGGTTACCATCTACTCGGGGTGAAGATTTGCAAATGAAGT
GTTTGCTTGAACTGTACGGGCTAAAGGTAATGTGATGTCAACTGATTAGT
TTCAGGCATTGCTTTGTTCTGCTATATATGAATTTCCACTCCTTTGTTAC
AGTTTCCCTGTTTCGCTGACCATCTTAATTCTGCAGATGATGGTTGTACA
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TTTATCGACCGGTTTGCTTCCAATTACCAGGCCCATATGTTAATGCCAAA
AATATGATGGCTACAAATTTTTTATACTTAAACCAATTGGAAGCAAATTT
TGTTAGCATGCAAACATATCAGCAAGGCACTGACTGGCAGTGAACTGGGC
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AATTAGTTTAAATGATGCGGTGAACTGGCGACACACTTGATAATAACAAT
GCTGAGAAATATACCAAGTTCCGTTAGTGGAAACAAGTAGTAATATGTGT
AGAATAGTGACACGTGTAAATGTATAATTATGCTTCTGAATGACACGTTT
GATGGATATTTCATCATTGTGGCATGCTTGTAGCTATTTTTATTCTAAAT
TGCTAATATAATATGCTCCAATACAGAGGCACGTAACCATTGATGCAATC
TCTTATTGCCAATACCCTTGTTGATAGTCATACAAAGCAACCAATAATCG
ATTATATTATTGGTAAGAGAGCATCTATAACTTCTGATGCTTAACATGCC
TGCTAGGAACGACTAGTTTAAGATGGCAATTTGTGCACCATATCTTGTTT
GCCAAGAAGTAGGTTGGAACATACTCCATATCACGTATGAACTTTCAACT
GTGGATTATCTTTTCGTTATCTCCTTTTGTATTTCATAACACACCATTCC
GATTTGGAACATATCAAATATGAATTCAAGCTTAATGAGCGTTTGTCATT
TATAGATATATGTTTATAGAAGTATAACAGTGGCAGTGAGTTACCATATT
GAGGTTTGCTGACTAGTCGTGTACTTATGCAGTTACTAGACTTACAGAAG
AAAGTACGGTCTGATATCAATTCTGAATACTGGCTACACAAAAAGTGTGC
GTATCCTGACAAACAATTGTTTGACTGGGGGATGATGCGGATACGATATC
CTTTTGCCATGTATGGAACAGGGGATAGTTTTTCAATGGATACTGAGGAT
ATCCATCGCAAAAAGAGATTCACTGAGGTTTTGTACTACATATCTTTTGA
TAATTTGTTTTAATATTGTGTGTACATCTTAAAATTTGATTTGTCATTTG
TTATATTTGTGAACTTCAGAGGATCTCAAAACTGGAGGAGGAGGAAAAGA
ACCAGGCTGAGAACAGGAAGAGGAAATTTTTTACAGAAATTCTCAATGCT
GCTAGGGAATATCAGTTGCAATCATCGGCTACTTACAAACGAAGAAAGCA
ACGGAATGATGGAGTTGTGGTATGTTTTGATATGTTCTTTTTTCCAAATT
AGCAAACTAGATAGACACCACCTAATTTTGTGTCTCCTGTGAGAGTATTA
GCTCACCATATTTGGATTTGGTTCCAATACTATGTTTGACTGGATGCTTC
TCTTGTAAGAACTATGGAAAGGAGGCAGTAGCGTATAGTCTTTGCCTAGT
GATAGTCTTTTGATATTTTTTTTCCTGCTACATGTGTGCAAGGCATCAAC
TTTTTGGCATTCAGATCTTTTTTGTTATTTCCCTTGTTTTCTCAATACTT
GACGATATGTCTAAATCACCATGTGATGGGTGCTGAGCCTCCCATATGAC
TAATGTTTTTTTTAGCAAAGCTGTAAATTTGTGTACTATCTGTTGGTTTA
TCTGCAATGATTTCACTTCACTAAATTTCTCCATGTATCTCTTAATAATA
TTTTTATATGTTAAGTATGGATGATGAAATGTATTGTGCATGCTCCAATG
CTCAAGAGATCATATTTTTGTGTGGTGTGGTTAGCGAGTCTTAAGAAAGA
TGTTTGTCGTACCCTTTGCTTACTGCTTAAGCTGTTAGACCATCAACTTT
AAATGTACTACATTTCCTATGTTAGACTGCACTCTTTCCTATCTATATCT
ATATCTCTTTTCTTGTTTCTTCAGTTTTTAAGTGTACGTGAGCCTTTTTT
ACTTGCTAAATGTAGGCATGGCATCTCCGGGCACGCCAACGTATCACTCG
GCTTGAGAAAAGTAGATTGCAGGTTTTGAAAGCAGGTGATCAGGAAGCAT
ATTTGCGGATGGTTGAGGAGAGCAAGAATGAACGCCTGACAATGCTCCTT
GATAAGACAAATGAGCTGCTCGAAGGAATTGGAAAAGCTGTACAGCGACA
AAAAGATGCCGAGCATGTCAGTCGGCCTGAAGTGTCAAAAGATTCAGAAT
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TGTCCATTCCATTGAAGAGAAGGTAAAGCCTCACTTTTAGCTACATAGAT
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ACTAAACAACTAGTGTCGTGGAGCTTGGTAGCAAGGAGATTAAAGTTTGA
TGATATAACTCTGACTGAGCGACTGTTAACTTTGTAATTGCACTCGTGTT
ATGCTGGACCCATTATGATGGTAGATAGTTTTATTGTATGGAACACACTG
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TCCTGTAATGTGGAAATTTTGGTATAGAAGCCTTTCTTTTCCTGTTTGCA
TGAACTGATGGTGCCACTTTATCTATATTTTTTAATTTTACTTCTGACAA
ACTGCTCAAGGGTAAGAAATGAAATATTCTTGTATTATTTCCTTCACTAG
TTTGTTAATTTAATTTTATTATTTTGTTCTGACAACTTCTTGTTACGATA
TGTAATGCTCTGCACTTCTGGGCTAACTAATGTTTCTTTGTGCTTTATTC
AATATACAGGTAACAGAACAACCATCAGCTCTTGTAGGCGGGGAACTAAG
ACCATATCAGTTAGAGGGCCTCCAATGGATGCTTTCCTTGTTCAACAACA
ATTTGAATGGTATTCTGGCTGATGAAATGGGTTTGGGGAAAACAATTCAG
ACCATATCTCTGATCGCTTATTTATTGGAAAAGAAGGATGTCTCAGGACC
ACACTTAATAGTAGCTCCGAAAGCAGTACTACCAAATTGGTCTAATGAAT
TCAAAACATGGGCTCCCAGGTACGGTTTCCCTGGAATTTGCATGATCAGA
ATTTCTATGCTCATTTTCTGTCCCTACTATGAATCGAGGTAACCTAAATC
CAACATTTCTGTGGTTTGCAGCATTGATACAATTATGTATGATGGTCGTC
CAGATGAGAGGAAAGCTCTAAGGGAGGCACATTTTGGAGGTCAATTTAGT
GTCTTGCTTACACACTATGACTTGATACTGAAAGATAAGAAGTTTCTGAA
GAAGGTTTACTGGCATTATTTGATAGTTGATGAAGGGCATCGTTTGAAAA
ATCATGATTGTGCCCTTGCTCGCACGCTAGTTTCCGGGTATAAACTTTGC
TCATGAATTACTTCTTTATTTACTCTGGTGATGTTCCCGGTATATATTTG
CTGAGAACTTCTATTGGAGGGTGGCTCTGTGGGCCAATAATTCCTTAGTA
ATCGGGCATATAAGAATCTTGATTATAGCCGTATAGCTATGGCAGGAAGA
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TGTTCTCCTATTGTAGTGTATAAGAAAGATTAGATTAGTTTAGGAAAGTA
ATCGGTTAAAAGAGTCCCCAGATAGAGTTAACAGTAGACATGAACTTTTC
AGTCTGCCCTAAAAAAAGGCAGGGCCAGTTCCCTGCTAATCCTCTAGTCG
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GGTCAATCATCTATACAATCTATTCCACCTATCTGCTGTTCACATTAGTA
TCAACCATTGAACATCATGCTTGTTCAGCTCAAAAAACATCATGCTTGTA
CTTTATTATTTCATTTTAATAGAAAAATACCGTAGAGGAGGTTTTCCTGG
TAAAAAAAACAGCATGCTTGCAGCTTTGTCTATAGCACTTGGTCTCAGAA
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CATTCTTCATTAAAGAATAAATTGGAGGGCTTCTGTATGTTTCCCAACAT
TTATCCGTATATAATGACAACTGAAAATCTGAAGTTGCTGCAGTATTTTT
TTTATCTAACTCTTCATTCTACAAGCTGTTTTTTATTATCTCATGTTTAT
TCTGTACTTCAAATAAAATACCTAAGGATCTCTCACTTTATCAAGAAAGA
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TAACCTGTGTTTTGTTTTGCATAATAATCATATGTTAGAACTAAATCTTG
TAATTATCATGTATCTGAATGTTTCTTTACATATGCATGTAGTTAGGTGT
TTGTGCAAGACTTTAGTTTAGCGCTATGGAAGATGCCTGTGTACAAGGCG
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CGAGATTGCACAAACTAGTATCCAGTTAGCCGAGTGAGTCAGCTAGTTAG
CAAGTTAGTTGCTGCATGGTCATGACTCATGATTAGTTAATGGATTAGTG
CATGGGTTAGTGCGTGAGTGCATGGAGTTAGTGGTTAGTGGAGGAGTGGC
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TCTTGAGAGAAGACAGATAGTTTGTGTGAGAGAGATCATGAGAAGTAGAA
TAGAAGGAGCTGAGAGATTCAGCTCCAACAATATAATCATATTTTTTGCT
GCATGTACATAATCAACTTTTCAGTACTTGATTATTTTGAAGTGCACAAT
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AGTGTCTGGGCTACTTAGCACTTTAGCAACTTGTCCACGCACAGTGCTAA
AAAGATGTTTTATCAGTCTTGATTAGCTAACAGTAGAGGGAATTATGAGT
GAGTTTCCTAGGAATATAAACTTCAAAATTTGTACACGCGCATGTATTTT
TTCCCACAAGCTTTTTATCATTCTATTTTGGGCAAAAGAGAGTAAAGGCT
AAAAAACAACATCGAAAAGAGAGTAAGTGACACGGTTATAACTGCATAAA
GAAGCTTGATGGCTTCTGGCCATCCATTTGAAAAAATTTGTCTGTCAAAC
TGGCAGCTAGTTTTGTTCCCACTCCTTAACATTACTGATGCCATAATTTA
TATCAACTATCAAGATCAAAGGTTGCTAGCGATAATTGTTAAATCGGTCA
CCATGTTGTGATTTACATCATAAAATAATCATTCAGTTTGGTGCAATTCG
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AATTCACGTGATCAAGACACCTATCCTGTTATATTCACTATCTCTTTGAT
TCATCGCTACTTGCCTAGTTTCATTTTTTGATTTCTTGTACTCCCTCTGA
TCCATATTACTTGTCGCTGAAATAGATGTATCTAGACATATTTTAGTACT
AGATACATCTATTTTAGCGAAAAGTAATATGGATCGGAAGGAGTAGAAGT
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ACTGGCACTCCAATCCAAAATAGCCTACAAGAGCTGTGGTCGTTGCTTAA
CTTCATTCTGCCTAATATTTTCAATTCATCTGGAAATTTTGAAGAATGGT
TCAATGCACCGTTTGCATGTGATGTTAGCCTTAATGATGAGGAACAGCTA
CTAATCATACATCGTTTGCATCAAGTGAGTAATGGTGCTTCAATCCACCC
CGAGTAATTCAGTGAATTTAACAAGCTTACATGGTTATTTGCGTATTGTG
TCTGAATCAAACCAACTGTTTACAGCACACAAAGCACGTGTGAAACATGA
GTGCAGGCTGTTTTTGATATTTGAGAATATTAATCTTTTTTCATTGCACT
CTTGTTTTCCATCCAGGTTCTACGTCCATTTTTGCTCAGGAGGAAGAAAA
ATGAAGTTGAAAAGTATCTGCCTTCAAAAACACAAGTAATACTGAAGTGT
GACTTTTCTGCGTGGCAAAAGGCATACTACGAGCAGGTCACAAGCGACGG
AAGGGTTGTACTAGGATCTGGTAAGTTGTACTACCAATCCTCCGTAAAGT
ACTGGACTGAATAATTTTGTAATGTTTGACCGATCCTTGGAGAATGAAAT
ACTGCATCAATTACAAACTTCTCCTATAATGTGAAACCAAACCTGGTTCT
GTTTTGTCTTGGTTGCCTATCTAAGTACGTGGCCTTGTCCTTGTATGTGG
GCAGTGCATTTTCAAGAATAATACCAGTAAATCAACAGGGGAAGGACCCT
CCTCCCCTCCCCCCCAATATATTGAGACACCCATCGATAGTATTGCATTT
TCCTAATCCTTCTAGCATTTTTTTTTTGAAAAAAGCACACATTTAATGTT
TATATTGTTTATGTGCAGGGTTCAAATCAAAGGCTCTGCAAAACCTGTCA
ATGCAGCTCAGGAAGTGTTGCAATCATCCTTACTTATTCGTAGAGCAGTA
TAACATGTATCAGCGGGAGGAAATTGTTAGAGCGTCAGGGAAGTTTGAAT
TGCTGGATCGGCTACTTCCAAAGCTGCATAGAGCTGGTCACAGGGTTCTG
CTTTTCTCTCAGATGACAAAATTGCTTAACATCTTAGAAGTATATATGCA
AATGTACAATTTCAATTACATGAGGCTTGATGGATCTACGAAAACTGAAG
AACGAGGCAAATTATTGGCTGATTTTAATAAGAAGGATTCAGAATATTTC
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TGCAGACACTGTTATTATTTTTGATAGTGATTGGAATCCTCAGATGGACC
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GTATTTGTTCTTGTTAGTGTTGGATCAATTGAAGAAGAGATCCTGGACCG
TGCAAAACAAAAGATGGGTATTGATGCAAAAGTTATCCAGGCTGGGCTGT
TCAACAATACCTCTACAGGTTTGTATGCCATTGCTGGCTGTGCTTTTCCT
GTTTGGTCATGTAGTTTTTCTTTACTTTTCTGTAGATGTATTTCGAGCTC
ACAGATATGCCTTGTTAACCTCGTGCAGCACAGGACAGGCGAGTGTTGCT
ACAGGAGATCTTGAAGAGAGGGACTAGTACACTTGGAACTGATATCCCTA
GTGAGCGCGAGATCAATCGTTTGGCCGCTCGAACAGAGGACGAGTTCTGG
TTGTTTGAGAAGATGGATGAAGAGAGGCGGCAACGTGAAAACTACAAATC
CAGGCTCATGCAGGGACCCGAGGTTCCGGACTGGGTGTTTGCTAATGCCG
AAACACCAGCTGAGAAGCGTCTTGCAGAAGAAGCCAAAAACCCTGTGATA
CACACGAAAAGACGCAGGAAGGAGGTTGTCTATTCAGACTCTTTTGTTGA
TCATCAATGGATGAAACCTGAGGATGGAAACGAAGACATTCCAAAGATGA
CTCCAAGAGCAAAACGGAGTGTTCACATGTCTGACTTCCAAGAAGTTGAT
TTACACGACAGGAGAAAAAGGCTCAAATTTGTGGAGGACAGTGCTGTGGG
TGCAAGCAACCCCACCTGGACACCGGAGAAAGGAAGACCTGGAGCTTCTT
CCTACAGCAAGGACGAGAATGAAGACGACGACGAAGACGAGGGCAACACC
AGCGGTTTCCAGCATGGAAGCAGCTTCACATGGAACACCCTCAGGAGGAA
AAGGTCAAGCCACAGTTCGTCGTCTGACCTGAGAGGGCGCCCGCCATTCT
AAAGCCCATCAACGGGAGTGCTGTGTAGATGCATATATCTGTTTGAAGCC
GTTCCTTCGTGGTAGAAGCTCTCGTTGAGAGAAACTAACAAGGCTTTCGA
TCTAGAAGTGCATTTTAAAGCTCATCAACTTTAGGATTAGTCGTGCATTG
TATGCTGGTGTTAAGCCGTGCTCCATTAGAACTCACAGTTAAGGTTCTGT
CATGTGTTCAATGTTTTTATGGAATGAAAACGTAAGATATTCGTTGTGTC
ACGGAGGTAGTTGTATGATTCTTGTGGTTTTAAGTTTGTGTTTATCAGGT
GATGACTAACATTTCTGTTGATCGAGATGTAATCTGTATTTACGTGGTTT
AAGTTTGTGCTGATGTAAAACACATCTTACCAAAGAGTGAACAACTTTGG
CAGCGAGGACTTGGACGTGTAGGTCTGAAAGATAAGATCAGCTGATCAGC
GAGGCAGCTAGAGGCTCGACGATGACGACAAGGGCCACGGCGTCGTCGTG
CCGCCAGGCTGCTGCAAGCTGGGGCGATCGATCTAGAAGGGTCATCTAGA
ACTCAGCGGCGTAGACGTTGGTATGGTCTACCTGCTCCTGAGCAAGCCGG
TGAGCTCGAGCTACTTCTGTGGCGGTGCAAGGTGGACTGCACTGCTGGTT
GTGAGGACAGTGTTTTTCCCATGCAGACGGGAGTTAAGCAGGGTCCCTCA
CTTTTAATCATAGGTAGTATGAAAAAAGATCTTGTCGTACCGACATGTGT
ACGTTTCATACTGTCCTTCTACCTTTTGCTTTGAGTTAAACTTTTTAATA
TTTAACCGATTTTGTAGACAAATGTAGCAATACACATATAATCAAATCGG
TTATTATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.