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GrainGenes Sequence Report: AE021675

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Sequence
AE021675
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE021675
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGGCCCCACCCCAAACTCCCACACGCCGGGCGGCTTGAAGCCCTAGTCC
ATCGCCGGGACCAAAGCGCACATATACAGCCACCGCGATCGGAAGCAGCA
GCCGCCGCCGCTATGCAGGGCTTCCCTGGCGGCACCCCGGATGCGCAGCA
GCTCCAGGCCACCATGCTCGCCATCGAGCAGGCCTGCTCCCTCATCCAGG
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TCAACTGCTTCTTCTATGGGCCTCCCTAAGGAGTTCCATGAACAATGCCA
ATGGTCACTTGAAGTGAAGTTTCTGAAGGTTGTGGCGTACTATTTTTCAG
AATATTATCGTCTATGCCATGTCATTTGAAACTGCTATTATCGTCGTTCT
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GTATTCAATACCGCAGACCAAATCTTGAATTCAAATGTAACTTTACCCGA
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GGAGCTTCAAGCCAACTCTGCAACATGAGAATTCAGATGCTAAGATAAAT
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CTGATATCAAGTGCGCATACTACTTGGATTTTGAACTTCTATACTACCCT
GCGCCAGAAGTACTTGTATGATACACTATGGGGCGATTCTCCTATTGCTG
TCTCTTGCAGGCAGCTTATAGTGCAGTTATGCTCCTTGGCAGGCGCTGTA
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CCATGATTTACAAATTTGATGTTTCATGAAAAGCTGCTTAATATTATCTC
AACAGCAAATGAGCGGAATCTGTTACTACCTCCGATCCATAATAAGTGTC
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CTGTGGATTGAACCTCCGAATGTCATAGCGGAATCAATTCGAAGTGGAGG
AAGCGAAAGGTCGTGCAACAACCATGATCACAATCTTCCTTGAATCTGAG
CACGTTAAGAAATACTGACGAGCATTATGGTTTACTCTTTGTGCAGTGAG
TTCATAGATGGTTGCCATGCCCTGCTTTCAGTAGCATCTTTGACTAGCAG
CTCACTTTTCGACAACCTCCTGAAATCAATAAGGTTAGTTATGTTATGAA
TAAGCAACTTGTATTACTAGGGGGCCAAAGGCCACAATATATAGGCCCTG
TTTGTTTGGGCTTCTGCTTCTGCTTTTGCTTTTGGGGCTTTTGGAATCCA
AAAGAAGTAGGCCAAAACAAACACCAAATATTTGCAAAGCGCTTGTGAAA
AGCTGGGGTGCAAAATGAACTGCGAGCCCGGAAGCGCCCGAAGCGGCGTC
AGAGCTGCTTCCCGAGCTTTTGCTAGCTTCCCGGTCTACAGGTGACCAAA
CTACCCTCTATGGTTTACAAAATTCACAAAATAATTGCCATCCCGAGGTC
AGCAGAGGAGACCCCGATTCCCCTAAATCCCCCCGATTCGGCAAGCTCGA
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CCGCCGTCCCTTGTCTCGATCTCGTCACCGACCGCCGCCGTCCCTGGGCT
CGAGCTCGTCTCCGACCGCCGCAGTCTCCAGGCTCGTCACCGACCACTGT
CCCTAGGCTCGATCTCGTCACCGACCGCCGTGGTCCCTTGGCTCGAGCTC
GTCCCTGGGCGGCGAATCCTAGGAAGGGGGCCGCCTCCAACGGCGACCAC
CACTGCAGTTCATCGTGCTTGTGGATGCGTACACGAGGCCGGATCGAGCC
CCTCATGCCAGGCTCCACGCGCACGCCCACGACACCATGACCAGGCGCGG
CTCGGGACGAGACCAGCGCATGGCACCAACGACTGTCCGCTTCCGTGTAC
GAGGAGAAGGCGCCGGGGCACGAGCTCCACCAGCGAGCTCGCCAGCACAG
GGAGACGGGCACCGCTGCTGCTCATGCTTGGCTTCCCTCAAGATTAGTCA
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TGACGTGGGCCTTTCGGTCATATAACGGTTAGAGTGTCTAATTCTTTAAA
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GCTTTAAACATACCAGTTATGTTAAAAAGTCGGAATTAGCTAATTCGGTT
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CATTTCATCCTAAAACAGCAGCAGCAACCGTAAAAAAGCACTAGTGCCAA
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TAACAAGTTATTGCACCTCATTTTTTCGTTTTTACTTGCTTGTTCTTTTC
TACAAGGCAGTATAAGGTAAGTGGTTATCTTTTGAATTAATAAACACATA
CTAAATTGAAAAGTCACTACTGTTAGTACCTTTAGGATTCTGTTTATACC
ATTTGTTTACCAGCTAAGATTTGACTTGCTATTTTCTTGTAAAATGACAT
GCTTTCAGGCAGTATGGCACAATTAACCTGCTTTCTGCTTTGACATCCGA
AGCTGTCAAGTCTGTTCTGGATAACCACAATGAAGAAGAAACCTGGGGTT
CGGATGCTCTAGATATATTGTTAGAAACATGGAATGTTATTCTGGGGGTA
TTTTCATTGACCTGTGCTTAACATTATGTGTTTATGTTTTCTTGAACTTT
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TTGGCATTTTTTATTTTGACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTTATTA
GCTGTATATATTATTCCAATGAAGTAGTATATGTCACCGTCTTCTAGGTT
TATGCTAGATTTTTTATTACTGTCTCTTGGACATCATTTGGCCCAGTGCG
GACCTTAGAGCAGAGAATTTGACCTCTGCTATTGGTTATCAAGTGTTTTT
ATTTGGCAGCATTGCTTAATGAGTTGGTATATGCATGTTAACGTGATGAT
TACATCTGTATATTTATGGAACTGTAGCATCTCCTCCCTTAAAAAAGTTG
GTAATTCTATGTGCTTTACAATTTATTTGACTATTTAGAGCATATGTACC
TGATTATGTATAAGATACAAATCTCCCTTATCAATTCCATAGCGATATCC
CTTCTAATAGGGAAATAAAAGCTGTCTGATTGTTACTGGCAATCTCCTTC
GCAGCATTGAAGTGCTTGGCTTATCTTATTTGGTACATTGAAAACCCAAT
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TAGGGTACCTAGGTTAATATAGCTCATTGTACCATTTTATTGATTATAAA
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CTGATGCTGATAAAAGTCCTATGTCAGCTGATGGAGCACTTGCAGCTTCA
AGTTTGTTTAAGATCATCGTGGAGTCACATTTGAAGGGTACATTCCTTTT
TCCATATAAACTTACTGTTGAAGATATTGATACTATGCATACAGAGTTCT
TTGTCTGCTGTTCTCATGTCCTGCTGCTGTATATTGATTGCCCTTGGTTT
CTTTGACATAGCTGCCGCTGATTCTGCATTCGAGGATAGTGATGATGCTG
AATACTTTCATGTTTCTGTTTCAAGTATGTTGAAATTATTTTTTAAATAT
TTACTATTCTGAGCCCCTCCTCTTTGGCATACCTTTACACTAATGAAGTG
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AGCGATTTGCACGGCTAAGTCAGGTCTCCTCGTTAGCTCTATCTTGTGCT
TTATCCTGGATGCATATACGTCCCCGCCACAATAGCTTACCTTCCATGGT
ACGCTTCACACTATTCTTTTTTGACCGGAACTTCACACTATTCTGAGCAG
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GTTGCTGATTACCAGTCATGTCCTAACTGATTCAGGGGAAGGAGAAACAC
TGCTTGTAAATAACTCAAAGCTTCCTTTTTACCAATGTTTCCAAATTTTA
TAAGTAGCATGAATATTGTGTTTGCACTTTCCATCTGCTTTAGTGCAATC
TTCAATTCCAACCTGTTTAGAGGCTTAAATGCTGTACTGGTGTATTCTTG
CCATGGTTTTAAAGGCCTTAAGGTGTCTTAAGGCGATCTGGGGGCGCTCT
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CTATATCAACTAAGGTACATTATCTTTATTCTCATTTTTTCACTATTGGT
TATTTGTTTGACAGATTCCTGAAGCTTTACAGGCTGGGTTCCTCAATGTA
GTTGAAGTAGGACAACATCCTGTAGTTACATTGTCATGGTAATATAACTT
TTGCCTACACTTGACAGAGCTTGCTATTCTGTCGAATTTATTCGATTGCT
GATCTTATACCTCCTACTGTGTTTTGCATTAACATAAGAATTTTGGAAAC
CAGTTTTAATTTATGAAAACTTCTAATTCTGCCATAGTATAGAAATATTT
GACACTACGAGTTGCTGTCCATTTTTCCTGTTTTCACGAGTTATCACTGG
CTAAATGCTTTCCCTGTTATGCAAATATGTATACTATTAAATGAAATTCA
ATATTCAGAAATAAGTTAAAAAACCAGCATGCCCAAGTTGACCCAAGCCC
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GCCTTTGGTGTAACAGAACTTCGTATTATATGCTCGTAGGCTGAATTTTC
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TGTTGTTCTCATTTCAATGGTAGCACTTACTACATATCAGGGTGAAATTG
AGCTGCAGGTAACCTCCACCTTTACTAATAAATCTGCAAGACTGCACTAA
TTTTGCATTGATCTGCCTGTGCACGTACACTTGCATATCTATGTTTTTCC
ATGCTAATTATAACCAATGACCAGCCTGTGCAAAATTTAAAAGTACATGA
TGTTTTAGACTTGTCATGTTCTCCGAGATGCAACTTTGACCTTTAGTTTC
TATCACAATGTTGTTCATTAAAGAAACACATCTTTAATACTCCCTCTGTT
CCTAGATATAAGGTGTATTTGTTTTTGAGAAAAATCTAGAATATAGGGTG
TATTGAGTCGCACCACTCGTTTGGATTTTTTTTGGGATTTGATTACATTC
CCTTATCATGCAAACTCCTCTATTTTCATACGTCAATTAGCCAGGGTTAA
TCCCTCCCAAAACTGGTTTAATTTTCGCTCTACTTGTGTTCTTTAATTTC
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AAGTTCATAAGTATAGAAGGCTGTTCAATTTTTTCATGCAACCAATGCTA
AATACCAAATATTTTGAAATATATAAGTTGCCATTCGCCAAAAGGTTTAA
CTTTGAACATACTTCCAACAGTGATGGGAATTTGTGAGTAGAGGGAGTAT
TTTTATTGACAGTTCACATGACAAAATCATCCTTCTGGTTGCCCATTGTG
AAGGTTATCCCTAATCTTTTGCTTTGATTCATTTTATCAGACACTTACAT
GCCAAAAGCTACTTGCCTCTGTTGTTCGACGGAAACACACATGTGCATAT
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AAAAAATGTAGCACTCCTATCATCTAAGGTAATTCCTGTTTTAGTTGAAC
ATGCATTGTAGATTCTTTTCCTCCTCAACATAACATACTCGTATTCCTTG
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TTTTTGGCCCTGCAAACTTTTTTCTTCCCTTGACACTAAATTTTCAGTCA
GTTCCTTATTTGGCCCTAACCGTCAATTCTGTTACATACTCGCGTTAAAT
CAATTTTTACTGGACTAGTATACCCCTGGATGGATCGATAGATCCTTGAC
TGGAAAGAAAAAAAGGAACCGCTTCGTGGAACTCACGTGCCTCGGGACGC
GTTGCGGCAGTGGGAGAGGTGCTCGTGGAGCGCAAGTTCATCCGCGGCTG
CGGCACCATCGGGCACGTCGAGACGCCGCCGCGCCGCGCGGCCGTGGGCT
TAGGGAGCGTCGTGCGCCGGCTCGTGGAGCACGCGAAGGAGAGGGGTGCT
ACAAGGTCATACTGACTGCACCCCGGAGCTGATGGGATTCTACGCCAGGT
GCATATTCGTGGAGAGGAACGTCTAGATGGGGCTCTACTTCTGATTTAGG
TTCTGCCTATTTTCAGATCTCTCCCTGACGATATTTTCTAATTGTTGCCT
GTATGCATGAAACGTGGGATATATTTGTGCTTTTACGGTTTGTTTCCATC
AATTTTCCATTTAAGTATTTGTTTTCTGTCAATCCTTGCTGCTTATTAAC
TACTGGTCTTATCTCCGTGGTTATGCATTCTATATGTATGAATGAACTGT
GTGCAGGGGAGATGGCATCCAGTTACAAGGAAGGTTCTCCCAGAATTTTG
AATATTTTGCATTAAAATCTGAGCCTAATTTTTCAATTCAAATCGGTTAT
ATGACAAAATGTTCTGTTTTCTAATTTAGTCCAATAACTTTGACCAAATA
TATCACGACACTGCTACTATTTTGTTCACATATTGCACCAAGGGCAAACA
CGTCATCTTACGTACCTTCTTAACACCGTTAGTGCTCAAATTGCACTAGA
GGGCCAAATAAGGAACCAATTAAAAATTTAGTGTCAAGAAGGGAAGATTT
TTTTTTGCAGGGCCAAGAAAGGAAGCCAAACTTTAACCAGGGCCAAATAA
GGAATTCTCTCAAAAACTACTGGTACACTTTTTGTGGCTTGTAATTCATA
TTTTGTTTGTGAAATCCATGGTCAAAGGTTAGACTCGAAAATCGAGCCTG
TCTGACAAACCTGGATGGAGGGAGTATCTTTTGTTTTTTCTGTCCGGTTC
ACAACGGATCAAATTTTATACGTACAAGTCTTTCCTGGTGCACATGGACT
AAAATGTACAATTCTTTCAAAAATATATTGTATGCACAAACAGACCCTTT
CATAGTTTTTGCACCAGCACTACGAGCACATCAGGTTTACCCATAGTACT
GATGGCCAAGAATATACTAATGTTCAGTAATGAGGTAGACCAGAAATTTC
TCATGCACTAGAAGTGCCATATATGATAACTTTGTTCATGCTTATTCCTT
AACCAATTGTTCATTTGTACTTGCTTTGAAATATTAGGTGTCCTTTGAAT
GCAGGCAGCACTCTGACCCGCACTGAGCTGAATTTGTTATGTTATAGTGA
ACTTGAAAATAACAGGAAAGGCGCCTGAAGTTACCTTGATCTCATTGGTT
TTGCTCAATCCGTCATAGCTCTAGCATTGTAGCACAAACTGCAAAACTTG
CCAACAGAAATTATGTATGTCGAGAAATAGCTGATGAGAGAAGTTATTGT
CGAGAATAGGAAAGTGGAGTGGCGTTTCACCCTAACCACAACTCATCCGC
TGATTCTTCAGCATCAGTCAGTTTGGACCTATGCTTTCATCCAAGCTTCA
TCCTGGTCATGGATAGATCACCCAATTGCTCTTCTAAAAGGAACATCCGT
TCTCACAATTCCCTCTTCATCTTATGTTTCAAAGAAATTATTTACAATAA
ACACTATAGAATAAGCAATGAAACACCATATGATTTTCCTTTTGTGTTTC
GTCACCATCCTTGATTCCCCCCCTGTTTTTTCCCACTTTATGTTTCATAA
CATTGTCTACCTTCTTAGGACTCATGGCGTGATCTTACTAGAGCTTTTGC
AAGTGGGCGTTCTTTATTTTCATTAAGTGGACGTTTACAGGTAGGTGTTA
TAGCATGCACTCATTATGCTTTCTTTTACCTCCATGTTGTGAAGACCTTA
TGGTTTTGTTACCACTTACCACACCTTCACAGAGATCTCTAGCAGAAACA
CTTGCATGTGCAGCTTCCTGCATCAAGGATCCCGAAGCATCTGTGCAGTA
AGCCCATTTTCAACTGCTTTCTTTTATCTTAACAGGTACGGAAATTTATA
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GTCGCTGGATGCCTACTGGAAAATGCTAGCAGGAGTGATCTCAAATCTGT
TGCACATCAACCAGACGTTATCTACATGGTGAGTCTGCATGTTCTTTGCT
TTAAGCTCTTTGAAGCCAATATAATGGGAAATACCTGTAGGTCTGTTGCC
TATTGGAAAGGCTAAGAGGAGCTGCTAGAGCTACTCAGCCTCGCACTCAA
AAGGTTCTGTTTGAGATGGGTCATACCGCGATGAAGTCACTCTTAACTCT
TCTGGAGGTGTACAAAAATCAGGTATTGTAACTCATCTGCCGGTCATGCA
TCCTCTCACACTTATTTTTTTTACATAGAATCGTGTCATGCTTATACATG
TGAACCCTGAAGATCATACAGTAACATTTTTTTGTTCTTTAGTCTGAAGT
CGTATATATGATACTCAAGTTTGTGGTTGACTTCATTGATGGTCAAGCTG
TATTCCTGGATGGTAAGGAGACATCAGTTTTGATGAGCTTTTGCTTACGA
CTGCTCCAGATATACTCCTCCCATAATATTGGAAAGGTAAGAACAGGAAT
CCTTATTACTGTGTTATTCTGTGTCAGATTTTTTCTCCAAATGCTGCTGC
TAATGATTCTTGTTCTGAAACACATGTGTTCACATGCCTGCTCCATACAT
TTTGCCTTGTTTGCATGGTACATGAGGCATGAGCCCATTTTTATGTTGGG
TTGTATGTGCTAGGGGATTTTGCTTCTGAAAAGCAGTATACAAAGCTCCA
TTCGAGCTAACCTATACAAAAGGATTTGCTCTAATCCCTATCAATCTAAA
CAAGCCCTTGGGGACTGATTGGAAGAGGGGAGAGTTGCTTTGGGCTTTTG
GGATGTAGTTATACTGTTAAGGGGAACAGTGTGTCACCGACTATTGTGCT
ATTGGAAATAATAAATTAGGACAGTGAATATGACATCTCATCAAATTTAT
ATTGCTTAATGCGAACTGACAAAAAAAAATTGGCGGTGACAGATGTGACA
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GTACATGACCTGACCCTTATTGTCTATCTGTTCTGCGTAGGTAATGCTCT
CGCTTTCTTCTACTCTGCGCTGTGAATCACAATCTGAAAAATACAAGGAT
CTGCGTGCTTTGCTTCGGCTTTTAACAAATATATGCTCAAAGGATTTGGT
AACTTTCGCCCTTACACCCTGTTGTGCGTAGTGTCTTCCAAAGATTCCCA
GATGACTGAGTAGCGCTGTTGGCAAATGCAGGTGGGTTTCTTATCTCATA
GCAACATTGAAGGTTCCCCAGATATTGCAGAGGTATGCAGCTTGCTGTTT
TTCCAGTATTTTTGTTTCTTAAGTAAATTGAACTGCCTATATCCAAGGAT
TACGTGTCGCTCGACAAGTCGTGACTTGTCAGACGACTTGTCTACAGGTC
GCAACTTGACTGTCGACACGTTGGAGCGACACGACAAGTTCAACTTGTTG
ATCGACTAGTTGACTAGTCGACGACTAACCACGACTAGTCTCTGTCAACA
AGTCGAGCGACAACCTGAGGGCCGGAACATAAGGCCTGCCCGTGAAACCC
TACGCTTCCAGAATCATATCGTGCCCTCCCTCCCACACAGCCACCTCTCC
CCTGGCGCCCCTCCCGTGGCGTTGCCTCTCACCTGGCCGCCGGCGGCTCG
CCCTCAGCCTCTCCCCTGCTCTCCGCTGCCAATACCTGGCTCGTGAGCTC
CTCCGAAGGCTGCCTCCAGTACCTGGTTTAGGGTTTAGGTTCCTCTTCAC
TCCATATGCCATCAATATTTATTGCAGTATACCAAAATTAGTAGACTAGT
TACTCAGCTCGACTACACATCGACAAGTCTAGCACTAGTCGAGGACTAGT
CTCTGTGCCGGTACCCTAGCGACAAGTTGCGACACATCGGCACACAATTC
TTGCCTATATCTATTGAGAATAAATTGTTAACATGATTCCATAAACATAA
CTTTCCACCTCTGGCATCAGTAGCCAACTCTTGTACTGGTCCCTCATGAC
CACAAAACCACAAGAAACATTTACAATATGCCAATTAACCTTGATTTATA
GTTTTGCAATTGGAGCTTTGCCAAGTTTGAAGTGCTGCACATACTGACCT
TTGTGCGAGCATTGTGAGCGCCTCTGTTGTGTAGATTGTAGGGATGGTTC
ACCGGCGGGCGAGAGCGTCACCTGCGAGTTGGTGCCGTGGCTGGCGAGTT
GATAGGATAAACGGGGGTATATCAGAGAAAGTAGAGAGTTAGAGATTTAG
CAATTGGAAGATTGGGGGTTTATTACTGCTTGACCCAAAACACACAGGGT
ACGCATCCTCTTATAGGAGAACCAACACCAGGAGGCCTGATGCAAACCTA
CAAGGACTAGTAGTAGTATTTAACTAGGACTCTGCTCTGACACAAAATAA
CTCATATTACCCTGTTCAATCCGCCTACGCTGCTGAAGTAATTGACTTGG
TCTCTAACTATGGAAGCTACTGCTAACTGCTACCATCTATACTATTGACG
CCACAACAGTACTCCCCCCACAGCCGGTCCTCGAGCTTTAATTCATGATG
GATCTTCCTCCTCCGCTTCTTCAATCTACAAGGTAGAAAGGCGCTGACAA
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TTCCCTTCTTTCTGCCATCTTTGCGACTGTCAGTCAGCGGAGCGTTCGTT
CTTCCCCAAGTGGAACTGTGTGATTCAAGGACTTCCCTTGCAGCTGTCCA
ACTGTCGTGGATGACTTCTCGCTAGAGGCTGCTGCTATGATAGTTGAACA
CTGCTCGTAAGCGCGTTCCATACTCATGGCGATTTGAAGGTCAAATGGTT
TTTGCATCTCAACATCCACACGGAGCAGGTTGGTGAGGCCTGATGTAAAT
AGTTGAACCTTGCTGCTTTGTTGAAAGGGGGTCATTGTGAGCAAGCAGGG
ACAGAAATTTCTCCACATATTCTGTCACTGTACGGATTTGGTGGCCCAAA
GCGCAGGTTGCAACATTCTTTAAACCTGGGCCATGATGGCATACCCTCAT
CTCGCTCCAGCTGCATATACCACTCTTGAGCGAAGCCCACCATGTGATAT
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GAGGGGCGGGCCAGATATTTGGAAAGCTCGGTTGGTGCTGTTGTGGTGCG
AACGATGTAAACCCCGCATTGCTCGGTTGGTGCTGTTGTGGTGTGAACGA
CGGAAACCCCGCCTGATGCGGCTGTGGTGCATAGGGCCTTGCCGAGGTTG
ATGCGGCGCAAGCGGCAGCTGTTGTGACAGTTAAGGAAACTGTTGCGAGT
ACTGCGGCAGATTCATTGGAGGCAGCCCCACCGAGGTGGTGAGTATGTCT
GCAAGCTGCATGGCCGGTTGAGTCGCCGCAACACCAGATGAAGTGAGCAG
CTGGAGTTTTGCTAGTTTTATCACGAGGCGTCGCCGATCGCCTTCTCCTC
CAAGGCTTTGATGCGTATGAGAAGGGCTGCGAAGCCCTTCTCCATCTGTT
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ATGCTGTGAGCGCCTCTGCTGCGTAGATTGTAGGGATGTTTCACCGGCAG
ACGAAGCGTCGCCTGCAAGCTGGTGCCGTAACTGGCGAGTTGAGAGGATA
AACAGGGTTAGATCAGAGAAAGTAGAGAGGTGGAGATTAGCAATTGGAAG
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CAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.