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GrainGenes Sequence Report: AE020632

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Sequence
AE020632
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE020632
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TCTGTGGGTGATGAAAAACTCAACACCTCCGCCCTTTGTTTGCATCCTCC
CGATCTCGTTCTCCTTCTTTTATAAGCAGCACCCATCCCATTCCAAGATT
TCCCCGATTCATCACGAAACCGCAGAAAGGCAGAGAGGGACAGCAACCCA
GAAAGCGTAATAGTAGTGCTTGCTGCGCCGGTCCTCTCGCCCTGAGTTGA
TCTCGCCATGGCTGCCACCGTCGCCGTGGAGAACCTGAACCCCAAGGTGA
GGGGCGCCCTTCCTGTTCCCTCGTCCTGTCTGTTTTTTTTTTTGGAATTG
GGGGATTTCGATGAGGCGGGGGGCGGCTTGTTGAGGTGATTTGTGAGTTT
GGTGGGCTGGCGTGTATCTGATTTGGCGGCGCTCAGCTCGGGTTCTTTGA
TTGCTTCGAGGAGTCTTGGCTGCATTCGAGAAGGGGTTCTTCTTGCTGTC
TCGGATTCTCCTTCGTATCTGTTTTCAAGTACGCAGTATATTACTAGATT
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GATCCTGGGCCTGTGGTAGTTGCTATGCTTGATTGACTATTCAGCGCTAC
TGCTCTGGATCTAGTAATTCTAACTTGAACCGACGAGACGAACTGACAAA
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GCTGGGGACATGCAGTTTTTGTGTGACATCAGTGGCAATGCAATGTCAGC
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CTGTCATGCACTACAGAATTTAAACCCTTACAAGTTCATCAAATTTCCAG
TTTTCAGATGTACGTTTCATTCCATTAACCTGATCTGATCAACTATATTT
GTTTAGTAACTCACTAATTTTTTCCTTACAAGTTCTTCATATATTTGTTT
AGTAACTCACTAATTTTTTCCATCACCTGATCTGATCAACTATCTGCAAT
TTCTGATACTGAGGCACCTACTAATTCTCTTATCATATTGCTTCAGGTTT
TAAAATGTGAGTATGCAGTCCGTGGAGAGATTGTCATCCATGCTCAGGTA
TTTCAGTTTTCAAGTTATCACTAATCTTAGTATTTCAGTAATTTAGAATT
GGCTTTATTCAGATTTTAGTCTGACTCGTGTTCTTAGATAACCACCTAGC
CTGATAAAAAACATTAGTTGGATGCTCTTTTATCCTCAACTTTGTACAAT
CTACTATTTGTATTAGTATTTTTGTAGTCTTTAGGGGAAAAAAATCTGGG
ATGGGCCAGTCCCCTGGACCTCCACACCCTCTTATATATATGTAGCTGAA
CTTAGGTACATCTGAACTAGTACACTATAGAATACTCTAGAATTAGGTAG
GACACTAATTTAGACTACAGCATACTGGAATGTTCCAGGCACTCCTAGGA
CAGCACTAATATACTAACACTCCCTGGAATATTCTAGGCTCTCCTAGGAC
AGTCTCCAACACTCCCCCTCAAGATGGGTGATAGATATCTATCATTCCCA
TCTTGTTACAAGCTGAACTACACTCTTTATTTCCTAATCCTTTAGTTAAA
CAGTCTGCAATTTGCTTGCTAGAGGTTACATGATTTATCTTAATTATACC
GTCATCCAATTTCTCCTTTATGAAGAAGCGATCAATCTCCACATGCTTGG
TTCTATCATGTTGAACGGGGTTGTTTGCGATGTTGATCGCCGACTTGTTG
TCACACCACAAATTTAAAGGGCCTTTCCTCAATACTTTCAGTTCTAAAAG
AAGATTCCTCACCCATAACATCTCACTCAAACCTTGCGACATAGCTCTAT
ATTCAGCTTCAGCTGTTGACTTTGAAACCACCTGCTGCTTCTTACTTCGC
CATGACACCAAATTGCCCCCCACAAACACACAATAACCAGAAGTTGATCT
CCTATCATCCAAGCAACTTGCCCAGTCAGCATCACAATACCCATCCACAT
TTAGATGACCATTCCTTTTGAACCATAGTCCCTTTCCTGGACTACCCTTC
AAGTACCGGAGGATTTGATTGACCGCATCCAAGTGTCCGCTCCTAGGATC
ATGCATGTATCTACTCACTACACTCACTGCATATGAAATATCAGGTCTTG
TGTGACATAGATAGATGAGTCTTCCAACAAGCTTCTGGTACTTCTCCTTA
TCCACTGGATCACCAGATTCGGCACATAATTTGTGGTTCTGGTCGATAGG
TGTTGATGCAACCCGACACCCAAGCATGCCCGTGTCACTAAGCAAGTCCA
AAACATACTTCCGCTGGGAGAGCACAATCCCTTCGGGAGATCTAGCAATT
TCTATGCCAAGAAAGTACTTGAGTTGACCAAGATCCTTTACCTCAAATTC
CTTGCGTAGGTTGTCTTTCAGCCGTGATATCTCCATCGCATCATCTCCCG
TGATTATGATATCATCAACATATACAGCAAGGATTGTAATCTGGCTATTT
GAGTGCCGATAGAACATCGTATGATCCCCATTACACTGCTTATATCCCAT
ACCACATATCACTCGTCTAAATCTATCAAACCATGCCCGTGGAGATTGCT
TGAGGCCGTATAGAGATTTTCTCAACCTGCATACCTTTCCTGATGTTCTA
GGAGTGGAGAAACCAGGTGGGATCTCCATGTATACCTCCTCCTGTAAATC
TCCATGCAAGAATGCATTCTTGACATCCAACTGATGCAAAGGCCACCCAA
AGTTAGTTGCACAAGAGATTAGGATCCTCACTGTGTTCATCTTTGCCACC
GGCGCAAATGTCTCATCATAGTCAATCCCATATGTTTGACTATATCCTCT
GGCAACTAGTCTTGCCTTGTACCTTTCAATTTTCCCTTCTGGATTTTGTT
TCACAGTGTAAATCCATTTACACCCAACAGCTCTCTTTCCTACTGGAAGA
TGTACAAGTTCCCACGTTTTATTCTTTTCGAGAGCATTTAACTCCTCTAT
CATGGCCTCGCGCCACTTCGGGTCTTGCTTTGCTACTTTCCAGTTTCTTG
GGATCACCACGGGTTGCAATGATGCAATGAAGGCCAAGTAGTTTGTTGAT
AGAGATGTATATGATACATAATTAGCTATGTCATGCTCATCTTGGTACCA
ATTTGGAGGTTTTCTAGCTCCAACTCGGATTCCTTTTCTTAAGGCAATGG
GCAAGTCCATTGAATCTCTCGTATTAGATGGACCTGCGCCCTCAGTCAAT
TCAACAATTTCAACACTTGTTGGAGCATGTTGCTCCCTCGGCACCAGTGT
GTCACCTGCTGTAGGAGCTACGCCCTCAGTCGATTCAACAATTCCACCAC
TTGTTGGAGCATGTTGCTCCCCCTGCACCTGTGTGTCACCTGCTGTAGGA
GCTTGTTGCTGCTGCTCATGTTGTGGTTTTCTCCGTATATACACTTTTAA
GTTTTCTTCCTCATTTGGCTTTCTCCATCTATCTTCACTTGCAGGAGATG
GAATTGAACCAACAACAACTCTCGATTGTTCATCTTCCTTTGTCCTCAAC
AGTTCAGTCTCCCCCTCTCGACTAGCATCAATTGTGCTAGGAGAGTCAAA
GTCAAACAACGAGCTGAGGTCCGTCTTCTCTCCGTAGAACGGCTCAGACT
CTCTAAATGTCATATCCATGCTAACAAATGTTCTCCGCTCACTAGGGCTC
CAACACTTGTAGCCCTTTTGTCCAGATGGGTATCCAATGAAGATGCACTT
CAGAGCACGTGGGTCCAATTTTCCTACCGAAGGTCTATGGTCTCTGACAA
AGCATGTACACCCAAACACCTTTGGTGGAACAATGAACTCATTTTTACCA
AAGATCATTTCATATGGGGTCTTCATCCCAAGAATTCTTGATGGCATTCG
GTTGATGAGATAAGTAGCAGTCATAACTGCTTCACTCCATAAGAATTTTG
GCACATTCATAGTAAACATAAGCGATCGAGCTACCTCTAGTAGATGTCGA
TTCTTCCTCTCAGCTACTCCATTCTGTGGAGAAGTATCAGGGCATGAAGT
TTGATGAAGTATTCCTTTTTCTGAAAGAAAGTTGCCAAATTCATGGTTCA
TATACTCTGTCCCATTATCAGTCCTGATAATTTGAATACCAATGTTGAAA
CGATTTTGGATATATGCATAGAAGTCCCTAAAACAACTAAGCACCTCACT
TTTTTGTTTCATGAGATATATCCAAGTCATCCGCGAGTAACAGTCAATGA
AGGTGACAAAGTACTTCATTCCACTAATAGAGACCAAAGGAGAAGTCCAG
ACATCAGAGTGAATCAACGCGAAAGGCGATGTGCTTCGGAGTCCACGACT
CACATATGATGTCCTTGTGTGTTTTCCATATTCACAAGCATCACACACAA
GTTTTTCTTTATCCACCTTCTTCATTTCCTCGGGAAATATCTTACTCATA
GTATCAAAGGACATATGGCCCATTCGACAATGTAAGAGTATCACCTTTCC
TTCATTGTCACCAACAACAATTGTCAAAGCGGTGCATAATGCATCATCTG
TTTCATGTCTATCCAAGTACCATAGTCCCTTATGCCTGATGCCAACCCCA
AGTCTCCTTCCAGTTGTCCTCTCCTCAAATATACACTTGTATCGGTCAAC
AATAATTCGACAATCAATGTCGTCAACCAAGGCACTCATAGACACCAAAC
TCACTGGAAATGATGGAGCATACAAGACCGAAGACAATGTAATTGACGGA
GTGCATTTCACCGTGCCGACTCCTTTGACGGGCTGATAAGTTCCATCAGC
TGTTTGGATGGTCTCTTTATGCATGGGTGGATTTGGCGCATATGATGCGA
ACTCACTCCTCCTTCCCGTGACATGTGCAGATGCTCCCGAATCTAGTATC
CAATTTGAACAAGTTCCGTTTAATGTAGGAGCTTGATTTGACATACCTTC
TTCCGCTTGTGCGAGATTTACACAATTTCGTAGGGCTGTTGTTTTTTCAC
CTTGTTTTGGAACTTCCGCAATCTTCTTTGACTCTTTCAATTCTTCTATC
TCCTTCATCAATTGAGTCATTTTCTGAAGTAGCTTCTCAATTCTTTGATT
TTCCGCCATTGATCAGTGTTGTTGAGACTGAATCCACAACGTTGTTCAGC
TGTTCTACAAGTCCAGCCTGCACACACTCTTCTCCGTAGCTATAGCACAA
CCCAAACCGCTCCTCCGCTGCAGTACAGCCCACTCCTAGCTGCACTGTCT
GACCACTTCTCCTGGCTGCACTACACACACACCGCTGTCCGCCACCACAG
AAACCTCAAAGTGGAGCAGCACAACGTCCGGTCCCTGTTGCTTTTGCTAA
GAGACACGAGCTCACGAAGCTCTCTCTTCTGTCCTCTCCTAGCACACACC
GCAAACAACAATCACCTCTGCTTTGAGCAGCTGCAACTCTCTTGCTTCTC
CTTCTTCCCTGCGAGTCAACCTGGCCAACACTTTTCCACTTGAGCTAGCT
ACCCCTGTCTGCACTCACACCTGAACGCCTGGAGCTCCTCCACAAGCCGC
TGTTTCACCGCCGGCCACCACCAGGACCAAGCGCCTCCTTCCTCAGCTTA
TGCCATAGCAGAGCAACCCTGCTTCATCACCATTGCCACTTCTCAGGAGA
ACCTTGCTCTGAACAGTGGAACAGTGGTAGCTAGGGATAGGAGGAGCCTA
GCTCTGATACCATGTAGTCTTTAGGGGAAAAAAATCTGGGATGGGCCAGT
CCCCTGGACCTCCACGCCCTCTTATATATATATAGCTGAACTTAGGTACA
TCTGAACTAGTACACTATAGAATACTCTAGAATTAGGTAGGACACTAATT
TAGACTACAACATACTGGAATGTTCCAGGCACTCCTAGGACAGCACTAAT
ATACTAACACTCCCTGGAATATTCTAGGCTCTCCTAGGACAGTCTCCAAC
AATTTTGATATGCTTTAACAACAAAACAAGCTACCTGCCATTTTCTGAGG
GACGGCAGCTCTTGTGCCATTATTTTTTGCTTACAATTGCTTAACCGTGG
TCATTTTGTTTTTGTTTCCAGCGCTTGCAGCAACAGCTGCTGACTCAACC
AGGATCTCTACCTTTTGATGAGGTAGGTTCCACAAACTGATGTAATATAT
AGATTTGTAATGTTTTACAATTTCCTTAGCTCATTCAACTTCTTACATGC
AGATCCTCTATTGCAACATTGGAAACCCACAGTCTCTTGGTCAGCAGCCA
GTTACATTCTTCAGGGAGGTATGCTAATCTTTTACCTGCAGAGTGTATTG
TTTGTTTTCCTAGATACTCACATGGTATAACACAGGTTCTTGCACTTTGT
GATCATCCATACTTGTTGCAAAGAGAGGAAATCAAGTCATTGTTCAGGTG
AATATCCACATCTTTATAGTTCGTCAGCATGAAACAAATGTACAGAAAAC
TTCAAAACAGGGGAGATATAAGCAGATATCCTTAACCAGGTGCTATCATG
CTGAATTTTTGTTGGACATTCAAATGAACTTGAATAATTCAAAAACACAA
TTGTGGCAATATTTCTTTGTGTGACCTGCCAATCTACAGAATTGCAAGTC
CATAGGTTTTAAAAATGCGAACCTTCCTGGGGTACAGTAATATGTGTTTT
TACATGATAGTGAAATATGACAGGCAGTTCACCTTTTCTCTTGCTAACTA
CTCCCTCCGTTCCAAATTATAAGATGTTTAGCCTTTTTCTGAACTCATTT
ATCTAGACACCATTTAGTGTGCAGGTTCGAACAACCCACACTAAAAGGCA
TCTAGATGCATGCGTTTCTGAAAAAAAGCTAAAACATCTTATACTTTCTA
ACGGAGGGAGTATTTGAGTTTGGACTTGAATATGTTTATTATAGTCGAAT
ATATCTAGGACCAATTCCAATATTTTCTTCCAGAGTTTTTTTAAAGTTAA
TTTGATGCCCATATCATGAGCATAATACATATAGCCAAGCGTCAGCAGTA
GATATACCCCCTCTGTTACTACTTTGTATTTTTTTAATCCAATTAACAAA
AATAACTTTATATTGTTTATCAGAAGATTCCTAGAACTAATCCATCTGTC
TTAACTGAACTGTGAGATTCTTGCATATGATACCTGATGCTTCATCTTTT
TACAGTGCCGATTCTATTTCTCGGGCAAAGCAGATTCTTGCCTTGATTCC
TGGAAAAGCAACAGGGGCATACAGTCATAGCCAGGTAATCGTCTACTGTT
GCACACTGTTACCTACCACCAGGAGAAAAAGGGGAATGTTGACTTGGTTT
GTTTTTTCTCATTTTCCTAGGGTATCAAAGGTCTTCGTGATGCAATTACT
GCTGGGATCACCTCACGAGATGGATTCCCTGCCAATGCAGATGACATCTT
TCTTACAGATGGAGCAAGTCCGGGGGTATGAACTGTATATGGTCTTTCAA
CTGCTAGACAATTTATGAACAAACATGAAGTAGTTAAGTCTTGTATCATA
TGATTGTTCCCTTGCCAGGTGCACTTGATGATGCAGTTACTGATAAGGAA
TGAGAACGATGGCATTCTTGTTCCGATTCCTCAGTATCCCTTGTACTCGG
CCTCCATAGCTCTTCATGGCGGAGCTCTTGTATGCACTCTATTTACCTGT
CAAAAGTAGTTAAGCATAGCTTTTCATGCCACACTAATCCTAAATTGAGA
GCATTATCTTTCAGGTCCCATACTATCTCAATGAATCGACAGGCTGGGGT
CTGGAAATCTCCGATGTTAAGAAGCAACTCGAAGATGCTCGGTCAAAAGG
CATTGATGTTAGGGCTTTGGTGGTTATCAATCCAGGAAATCCAACTGGAC
AGGTTTGTGCTCATTGTTTCTCCTTTCGGATTTAGTAAATATCTCTGCTT
GCTGCACCTTTGGTATACACACCATGTTTCTATCATGTGCCTTTACTTGC
TCTTCAATGTGCATGTAACATTCTGTAGTTGAGTTAGATAACTAAAAATG
ACAAAAGACCAATATTTAGATGGTTCATTTATGTATAGGTTCTTGCCGAG
GAAAACCAATATGACATAGCGAAGTTCTGCAAAAACGAGGGTCTTGTTCT
TCTGGCTGATGAGGTGAGTGATGATGGCTGAGAAAACATCCCAACAAACT
TTGAGCTGCTTAATTCTATTTCTTTTGTCGCATGTAACATTAACACCATT
ATCGCTTGGTAGGTATACCAAGAGAATATCTATGTTGACAATAAGAAATT
TCATTCTTTCAAGAAGATAGTGAGATCCTTGGGGTACGGCGAGGAGGATC
TTCCTCTAGTTTCATATCAATCTGTTTCTAAGGGTAGGTATGATTTACTT
GCTTATTCTTCGTATACACATTGGTGCTGACGCGTCAAAAATATTTGTTG
CTGCCACCAGGATATTATGGAGAGTGTGGTAAAAGAGGAGGTTACATGGA
GATTACTGGCTTCAGTGCTCCAGTAAGAGAGCAGATATACAAAATAGCAT
CAGTGAACTTATGTTCCAATATCACTGGTCAGATCCTTGCTAGTCTCATC
ATGAACCCACCAAAGGTCAGCGATGCGACATTTTTTAAATCTCTAGCCCT
GACAAATAATGCAAAGTTCTCCACCTAAATGTCATTGTTGGCTTCTGCAG
GCCGGGGATGAATCTTACGCTTCATACAAGGCAGAAAAAGATGGAATCAT
AGCGTCCTTAACTCGTCGTGCAAAGGTGCGCCAGAGTCCCGCATCTCTTG
ATAGCTCTAAACGACTTCTTAATCTTAAAAAGAAGACTTGAATTTGTTGA
TGTGGAATTCTCGAGCGCAGGCACTGGAGGATGCATTCAACAAACTTGAG
GGAATTACATGCAACGAAGCTGAAGGAGCAATGTACCTGTTCCCTCAGAT
TGTTCTGCCACAGAAGGCAATTGAAGCTGCGAATGCTGCTAACAAAGCAC
CTGATGCGTTCTATGCTCTCCGTCTCCTTGAGTCAACTGGAATTGTTGTT
GTCCCTGGATCTGGATTTGGCCAGGTGAGTGAACTTAGTCTTAATACAAA
GATTATTGTGTAGTTTTGTGCCTGTAGCCACCGATAGTATTGGCTTGTGA
CATATATAAAGCTAAAGCCAACAGCACTTTCTATGTCACCAACCAACAGT
CCTATGATCAAAAATTATAACCTAAACGAAATTAGGAAACCAAAATTTCT
TTTTGTTGGCTAGTGCGACATTTATCTGAAGATAAAAGTAAACATGCCTG
AACTCATATGTTTAGGCTATTAGAGTTATATACTCTCTCCGTCCGGATCT
AGACAAATCCAAGTCACTTACTTCTAGACGGAAAGAGTATTTATGATGCC
TGAACTCATATGTTTAGGCTATTTACGTAGTTGGGGTTAGGAATAATGTA
CATTACATCTACTTCCTCCAGCTGCCTGACATTGCTCATTGGTGTTCTGT
TCTTCTATTTGACAGGTTCCTGGCACATGGCACTTCAGATGCACAATCCT
TCCGCAGGAGGAGAAGATCCCGGCGATCATCTCTCGCTTCAAGGTGTTTC
ATGAGGCATTCATGGCGGAGTACCGCGACTAAACTGCTCTAGTGCTGTAC
CATACAAGACCTCATGGATTTTATAGCCATTCCCTTCTTGACAGCAGCGT
CCTGTAGTGTAGAAGAAACAAAATAAAGCAAAGCCATGGCGTCCTTTTTC
TGCGTGATAAATGTATCAGATAAATTAAACAGAGGCCAGTGTGATGCCTT
TGATGGCTAAATTGGTAACTGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.