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GrainGenes Sequence Report: AE047965

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Sequence
AE047965
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE047965
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTTAGCTCAACCGTCCAATCCCATGGAAATCTCCCCCAACTCCGGCCCCG
CCGCCACCGCCACCGCCACCGCCACCGCCGGCGGCGCGGCCACACCCACA
ACTCCCGCCTCCTCCTCGAACCCATCACCCCCGTCGATACGCCCCAGCAC
CACGCTTCGCCTACTCTGCCCCTTCAGCCGCGCCGCCGCCCTCCGCCCCG
CGCGCGACCTCTACGTTGAGCACCCCCCCGTGGGGGACGAAGCAGTGCTC
TTCGTATCCGGGCCGGATGCGCCAGCTGCGGCCGTGAGGGTGTGGGAGCG
GGTGGTGGGCGACGACTCGGGGGAGGGGGAGAAAGAGGTCGCCGGCGTGG
TGGGCTGCCGGATGCTGGCGGCCGGGGCGCAGGTGGGGTGCGTGCTGGGG
AAGGGAGGGAAGACGGTGGAGCGGATGCGGCAGGAGAGCGGCGCCCAGAT
CAGGGTGTTCCGGAACAGGGAGCAGGTGCCCCCCTGCGCCTTGCAGGGGG
ACGAGCTCATCCATGTACGCATCTCAACTCTCTCTGTTGACCTTTTCGGA
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AAAATAGTAATGAGATTTTAGGATTGTCATTTAAATGCTTGCTTAAATTG
CACAATTAAATTTAGTAAGAAAATAGTGAGATTAGGATTTGCAGAATTAT
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CACTTGTTACTGTGTTCCGTTGTCAACCCATTCTGACAATGCCGCAACTC
TACTATGTGCTCCCCCTACCCCCAACACACCAATCGCCTCTGTGCGCGCT
GATATTTTTATTCAACTTTAGCAAATCATTGCAGTGGTTTATATAGCACA
TGACTTCGAGTTGATATGAGATAACATAAATAAATATAGAAGCAAAATTA
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CAACATCCCAAGTCGTGAACCTTTTCTACGCGTATACTGTCGTGCTTATT
GACCTTATATAACAAAGGTAGTCCAGACATGTTATAATGACAACATTTGT
CCATCTATATCTGGCATCAGTGTCTTGGCCGCGTCGGGCAAACAATTACA
GCACTGGTTAGCTTCCTTCCTCACCAGAATCAAGATCCGCCTTAGTCCCT
TTGGCCCGTGCTAGTGTTTGCAGTCGTTGTTAGGTGGACCATTGACCTAT
TTGTAATTTTTAGTACTTTTAGAACTCTTTGTATTATTGTTGATGATTAT
TAATAGATCGGTGGAATTTTCGTAAAAAAAAAAGAAAGTCAGACTAATGA
GCCTAGAAAAAAATAACTAAAAAAGGTGGCTCAATGAAAATTGCGAGAAA
AAAAATCTTCTAATAATCTAAAGCACCACAGATTATGGCTCATTAGAAGA
CGTATTTAAACATACTGAAGATGCACGCGATGCAAAGACTATAATCGCTC
CTTCAACCTAAACAAAGGTATCCTTTTTTAGATGAACACAGGTATCGTTT
TAATAATGTTAGCATGAAACGTGGGTAGAAGCAAATGCAATGCATAGCCC
AGAAAATCAAACTAAAACAAGGACTTGTTATCTAAAATCTGAAGTAAAGA
ACCCATGTCGAGCAATAAAACATGAAACATTCCAATATTGATCGAGCATA
TCAATGTTAGGCTAACTATGCTCACATAAATCTCAATTTCAGTGTCCTTA
TCCAAATGAATAAAAAATCTCGCAGATAGACAATTCAGTTTGTGATACCA
CCAGACCGAAACAAAGGAATAGAAGCTACAAAGCTGAAGTCAATTTGTTA
CTCCTGTAGTGCAAGAAACCTATAAATACTCTCGGCCGTGCAGTTTACAT
GAACAGGAAAGAATAGGATGGTTTAAACATACTTGCAACGTCTACCATAT
AACTTGCCAAACGTCCTGCATCACAAGAGCAGACACACACAATCATATTC
ACATTTCAGGGCAACGATTGCCACTCAGTGTCCATGGTGACCATTGCTAT
GTTGTCTGTTACTGTACATTGTTGTATTGTATCTTGCTTGCCTCCAGCGT
AGTTTGACAGAGGCCAGGATACCATTGCTTGAGGTGGAGCAGGACGTCAT
TGACCCTGCTCACCAGCATCAAGCTCATGTACGACACCATCAGGTCCTTG
GCAGCACTCCACGAGGACCTCCAGGGCCTAGTGCTCCGACAGTATTTCTA
GGCACCCCAGCAGGCACTCCAGCGAGAGAAGTTCCCAAGAAATGACATGT
GCCGGTACAATGTTTGACCCACGTTTGCCCGCCCATACTCCACATTCAGA
ATTCATAACCAATATCTTCTTCAGTGAAAGAACAAACCGGTAAGAAAAGA
ACTTACGGGGCAACAGATCTGAGGTTACCTTGGGAAGTGCCTGGACTGTA
CACAGTTTGCAGGGAGAGAACAAATGAATATCACAATATTTCAATGTTTC
TTTGTACATAATAGGACCAGTAATACCAAATCATTCTTCTACCATGCTAT
CATGGGATGTCAACACGCATTCAACAGGAGATTGTACGCAATTCTTGTTT
CTCGTAACAGAGCTTACTGAAATTGGAACCCTTGTAACGGAATAACAAAT
AAAATTTTATAGAAGCCAGAAGAAAGCAACCAAATTTCTTCCTCATTTTT
TCGAGTTCATTGAACAGATAGAGAAGTTTTACACCCTCCTAGGAGGTCGA
ATGCAAGCGGTGATACAGGTAAATCAGTGAACGTCCCAGGTGGTTGGGAG
CACGAGGCAAAGCCCGCGCACGCCGGCTCGAGCCCACATCCTGGCCTCCT
CTTTGATAGCTTCGGTGAGGGCGTGGACTGAAGGCCTTGCACCCTCGAAG
ACGCACGCGTTCCGGTGTTTCCAGATCATCCATGGGATGAGGAGAGAGGC
GGTGGCAAGCCCTTTGCGCATCGGTTTGGGGGTGTTGGGCTTGGCTTGCA
GCCACCAGTCCATGATCGACGGCTCCTGGTCGGGCGGTCTGGCTGTCATC
CGAAGCCAGTTAAGGATCTCGTGCTAGGCTTGGCGGGCAATGGGGCAGCC
GAGGAGGAGGTGCCGGATCGTTTTGGGGGCTTGGTCGCAGGGCAGGCACC
GGGGATGGTGCTGGAGCCCGTGGCGCGCTAGGCGCTCCGCCGTCCAATAT
CGATCAAGATGAGCAAGCCAGTGGAAGAATTTCACCTTCGGCGGCGCCCA
GCTCTTCCAGATCAGCTTTCAGGAGTAACAAGATGTTGATCCGTGGAAGG
TGGCGAGGTAGCAGGAGCGCGCCGACTAAGTTCCGTCCGAAGTCCACTTC
CACTGTAGCTGATCCTGGGCATCCGTGAGAATTGTGCCTTGCAGGATTCT
CCATAGCTGGATGTACTGTCCAATTTCTTGTATACCAATTGTGTCGTGAA
TGTCTTCTCCAATTTTTCGCCTCATAACTCTGCTCCTATGCAACAACAAC
AAAGCAAGTATATGTTCAGCAAGCACAAGACACTGACAATTAAATTAGGC
AATTGTAGTTTATTCAAGCACAAGCAAAATACACTTACCTAACTTTCATT
GGCATTTTGGTTGCTCATTTTTAAGTGGTTGGGACAAGTATTCAACACGT
AGTGATTCATTTGCATTTTCACATGAGAGTCTCATGATGAGACAAACGAT
AATTCAGCAATAAAAATGTTTAAGTTTAAATCATTATTTCAGGCACAATA
CATGATAGGAATAAAAAATGATATATGTGAACAAAGAACCTATCTGATAT
ATTATTCCAGGCAAGACATATGTCTAGGAATAACAATTTTGACCGAGGGA
ATAAACTTCATGACACCTGAATGTGCTTGAATGCATCTAATAGGATGATA
ATTCTAGCAATCATAAGATAGTTGTTGTTCTAAATAGTCTACATGTATGG
TTTTTTAGGTATGCACTTCTGAAATAATCCTAGACGATGTCTTCTAAATG
TTTCACCTGGAGTACCATGTACTATCTGGTTTTGTTTTGTCCTTGCTTGT
GCCTCTGAAGTGCATACATTTTTATTATCCCAGCATAAAAAATTACAAAT
TTGCAGCGCGTTAGTTCTTTCATACCTTCCCTGAAACCATCCATCATGTT
TGGGTTAGAAATAAAAAGCATCTTCTTTCAGAAACCGATGAGGGGAGGAT
GAACAACTATTGTAACTTCGAAAGTAACGTAGATGTAATACAAAATAAAT
TCCAGTAATAGGCACCAACCGCAATAGGTACTACTATGAAAATTCTAGTC
GATTGGGACTGCCTAGTTTTTGTTAGTTGACAAAAATAGCCACTATAAAG
TTAAGATATCTCTCAAAGAACATCTGGCCATTGCCTTAATTTGATCGCAT
GGTTGTGTACTGATGTAGGACCATGAGCGCAACTACTTCGATTCCGCATA
CTGGGTCCTTGGCAAGGTCAGAAATCAAGACAGAACAAATCAGCGGTCAC
TCATTCAGACATAACATACCTTCAGTCATTCATTCAGCCAGAACATATCT
TCAGAACTGCCTCTAACCATGTCAGTAGAAAAAAAGGAAAGTTTCATGTC
GGCCAAATTATACTATCAAGTCTAGAAGAAAACTTTTACTGCTTGCTCGC
TTCGTTTCTTCAGAGAAACATGTGATATTTCCATGTGTATTGTCCCAACT
TTGAAAGTCTAGAAGAATACCTGATTTGTCCCAACTTTGAAAGTGGCCAG
GTTCCACTCCTGAACACCATTGTGCTTGGTTGGAGGTAGGGACGTCAGAT
GCCAATTGACGTAAGGTCGAGATGCAATGTTGCCGTCGGGTCGAGATGCC
CCATACGGCCCATACCCTGCTGCAACTCCCTCTCCTGCAGGGTACTCATC
GAGGACCATCCACCCTCTCCGGCTCCAACTCCCCAGCGTCCTCCCTGCTC
CCTCTCCTCGGGAAGAACAGGGTCGCCGCGTCCTCCGGCGTCGATTTGAT
AAGTCAAGGTCAGAGAACTCAATGAGTTCAGCCATGGCGCGAGGTGCGTC
GATGGATCTGGCAACCGTGCCCTTGGCTGCTCGTCCCCTGCCCTCAGTTG
CTCGTCGTGGCACGACCGGCCATAGGAGCGAGTGTGAGCACGGCGTCCAG
ACAACAAACGGGTGTGTCCCTGCGAGTCCCTCGTCTGTGGGGTGCTCCGC
CGTCACCAGGAGGAGGGAAAGCGGAGTGGGTGGCAGAGACAGCGGCGGCG
CGATTCGACCGATATGGGGGGAGAAGGGGATTAGGATGGAGGCACAAGAG
AGAGCGAGGGGTCAGGAGGGAGTTTCCACTGCGGGGGCTGATCACTGGAT
CGAACGGTTGTTTTTTGGCTGTGTTAAATCGGATGGTCCAGATTGCTCTA
ATGTTTGATGTTTGAGGCGACCTACGGTCACCAACTTCTTTTAATAGTAA
AGAAGTGTTGAAGAATGCTCTGGGATTTTGTGTCTCTCACACTGCAGAAT
CAATGTTTGTACGATCCCCGCTACATCGGGAAACAATCACCTGACTCAAT
TGGCTGCCTTCCCATCCCCAAAGGGAACGTGCGGGGTGAAGCCATGAACT
GATGCTTCTGTTTGAACACCTCCACCCTCTGGCCATGGATGGCGCACTGC
TGATTACCCACATTTCTCGGACCCAAGTAACATGCTCTATTGTGGCTTTC
TTGCTAACCCCGACATCCTCGAGGAGATCCAGACCAAGAACGCCATCCTC
TCCTCCATGAACAGACATGCATGTCATGGTCTTCCACTTTGAACCCACCT
GATCCATACAGTTTTGCGATCTTGTTGTTCAAGTCACCGGCGCTGGGCTT
CACCGTTAGCTTCAGCCTGCTCCAGGAGGGTTGCTGCCTCGCTGCACTTT
GCCCTTGTCAGCAATCCTCAACCTCCTTGTTGCTATGTTCGGAGGTCACA
GCCTGTTTGCATTTCTTCTTCTCCTCCAACGTGCTCTTCAACTGCATCTA
GTCACATTTCTACGACTCACTCCATCGTCATCCTGACGGATAATTCTATC
ATGCTGTGGCGTTTGTTCAGCCCCAAGGCGTGGATGAAGCACTTGACAGG
GGACATGTAGGACGGTGCTAGTGTAAGTTAGTTCTGTGTTGTGCATCACA
TGTGTTTAGAAAAGGTTGGCTGTTGAGGAATTTCAGCAGGATGGCACATT
CCTGTACGTGTTCACACCCCATCATGCAAGGTACTTGTTTTGCTTCAGTT
GGAATATGTTGGTTATTAGATTTATAGTGACGTAAGGTTGTAGTTTTGGA
TATGATGTGGAACGATGAGGATGTTCCATTAGAAGTCAATTTTAGAATAG
TGAGATTTTCTTTGGGTGAGGAGCTGAAAACATAGAATAAGCATAATAAT
GATGTGCTCGTGTGCCTGAGTGGGTTTCTCAAATACAAATGTGTGCATGT
GAATGAACTTGACACTGTGAATTGAAATATGACAGAATGCAAAGAAGGCA
CTGTGCTAGCATGATGATTTTGACAATACATTTGGGATCATCTTCATAAG
CTATGGCTGGTTATGTTACTGGTCATGGTTTTCTTGTACAGTTGTACCTC
ACATACATGTGCCCATACGAGAAAATGAGTTCAACATGAGCTAATTGTGC
CTGGTTTGTACCTAGCTCTGATTAAATTCATTAGTTGGGCACATATCGTG
AGCTTGTTCATATGATTTATGAACAACGCCATCTTATTATGATGCATTGT
TGACACACAGAAACAATATTAAATGTTGATTTTTCTTGTTGCAGAAATAC
TAAGTTTATGATTGAGTCCCACCCCTCTAATCCACAAACCATCACATGAG
TAGAGTCTATTGTTTCATCGAACAATTAGGCAAGTATGATCTTGCAATTA
CAAAAATGTTTTTGTGAACGTAATATTGCTTGGATATTTACCAGCTCTAC
CTGTATTTCATTGGTGATGGCTTTTGTTCTGCCCTGCTCAGGAAATGCTG
TTATATTGGCATGTTTAATCTTTAATTTGGATATTTTATCTTTTAAACTA
ACTGCATTCTAACATGATAATATTTTCCTGTTAGATAAGTGGGAGCTTTT
CTGCAGCAAGGAAAGCACTTTTATTAGTTTCGATCTGCCTCCAAGATAAT
CCCAGGCCAGACACAAGCAGTTTTCCGGCTGGAAGATCATTTGGGCCTCC
AGGCAGTGGATGTCCACCTGGTGTTGATCCTCATTCTCAAAGAGGCTATT
TACCACCACATATACCTGATTATAATGCAAGGAACTTTCCAAGCAATGTT
GCTATCCCTGGTCCTAGATTCTTTGTTGAACAAGAGATAATGTTCAGAAT
GATATGTTTAAATGAAATGGTGGGTGGTATTATTGGAAAAGGTGGTGCCA
CTATCCGCGCATTACAGAGTGAAAGTGGTGCTTCAGTCAAGGTTATAGAC
CCTGTTCCTGATTCGGACGAACGTGTAATTGTGATATCTGCACGTGAGGT
ATGGCTCTAAACTTGCAAAGAATTGCTCATTTTCCTTCCAGTTCTAATTG
ATTAATGTTCCTAATTGTCCCGTGATGAACTTCTTTTCTGTCCATTTTAT
GTTATGGATCTGCATGTCGGTGATACTTGCATATCATGTCAATTTGTATC
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TATATTGTTATTTTATTGTTGTCAGGAAAGTTGTTTGATGGATGCTATGT
TTTTTGTGCAGAATTCTGAGATGATGCATTCTCCATCTCAGGACGCATTG
CTTCGGGTGTATTCCAGAATCTCGGAGGCGTCTATCGATAAAAGTTCTGC
TGTACCTGCCAGGCTTCTTGTTCCATCACAGCATATTGGTTGCCTGCTTG
GCAAAGGTGGATCTATAATTGCAGAGATGAGGATGGTAACAGGAGCCAGC
ATTCGAATTTTTGGGAATGAACAAATTCCAAGATGTGCACAAAGAAATGA
TGAGCTGGTTCAGGTATGTTCCAGCTCTACTAATCAATCAACTTCAGATT
TTGACTTTATGTACTTATGTATGATTAAATTTTATGTTGTATACGCCACA
GTTATCTCTAGGTCCGCATGACCTTTTTGTAGTTCCCCCAGTATGCATGG
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ATGCTGTAACTCTTTCATGTTAATTTCGTAACTACTTCCGATTTCGTGCC
CAAGTGCTCCATTTGGCACTTATTTCTACTTGTTTTCCTGGAACCTTGCT
TCGAAAAAAATGTACTCCGACCCATATTAGTTGACTCAACTTTGTCTAGA
TACGGATGCATCTAGACTAGATACTTAACTAGATACATATGAATCTAGAC
AAAGTTGAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTACTTGATTATGCATAA
TTATGCTATCACCTATTTTGGTATTATACTAAACATTATATGATCATCCT
GAAAAGAGAAAAGTAGGGGATCCCTGAAGGGAGATTACTGAGTAGATCCA
GGTCAGACTAACTTCTAGAGCTCTTGTTGCAGGTCACCGGTAGCTTCCAA
TCCATTCAGGATGCATTGCTTCAAATCACTGGAAGGATTAGAGATCTCAT
CATTCCCCCGAAGCCACATCCTAGTGGAGGCATGCCTCCATATCCACCTG
TAGGGAACACACCTCATCACCAACCAGTTCCACCACATCACAGTGGAGGC
ATGCCTCCCTATCCTATGCATCCTTTCAGACCTAATCCTCCTATGGGTCC
TTTCGACGTGTCAGATCATCAACCACCTGGACCACCTCCCTCGCATCCGA
TGGAACATATGGGTGCTGGGCCATACCCATATGGTTGTGAACGCGGTCCT
TATCCTTTTGTTGAGCAGCCATCACAGAGAATCTGGGGTCCTGAGGTTAG
TACATGGAAAATGGTGTTTGCCACTAAGCATAAATTCTGTAGGTTGTTGG
TAGCATATAATGCACAAATGGCTCTATTAAGAACTTCCACTGTCAGATAG
GCCCCACTAAAGGGTGCAGGATGATCTGCCATCGGTTTTTTGTTGAAAAA
AAACATCATTTGTATGCATATCACATTGCTCATGCACTGGTTGAATGACT
AAGAATCAAGTCCCTTGTCATGTGCAGGCACCAACAACTGATGCTCCAAG
AAGCATGCCTAACATGGTACCAGCTGTAGATTTCAGAAAGGCGCCAGTGG
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TTTAAATAATTACACTAGCTGTCAAATTAGGATTTGCCATTCAGAAGTTA
TTTTTTGTCTGAAACAGTGAAATAATTAACTGCTGTGATCTATGTGGGAA
GTTCTAGTCTTGAAGTCATCGATAACTAAATTTGTAGCAGTGCCATCCTT
TTGTAAAGAAAGGTGACAAAATTCTTTTGTAAAGAAAGTTATACCATTGT
TCTGACATGTGTTCATCAGCAGTGAAAATCAAGTGGCTACACCAAGAAGT
ACAACATCTGAAGTTGTTGTTCCTTGCAAGTACATAGGTTTTATTTGTGG
AACCAATGGCAGTGACCTTGCCGAGATAAAAAAGGTACTTGCACTGTTCT
TTATTGTTTACCGAACGTCAGATTAACTAGTACTTGTCCCTTGTTACATT
GTGCTAACCAAGGGCACACGGATGTCTTGTTCTAACCTATTCCCGTCAAG
TGATAAGGACTTGTTGGCTCATCGTTTTACCCTCGTGGCACAACACAGTC
TGCCCATATCGCTTGTCATTATTTCAGTCTTTCTCACTCATGTAAAGTCA
CTTCAAATAGTCTTCACTCTTGATAGCCTCTGGCTGTGTAGTCCTAGATA
AATCTATCAAGATTTGATACTGTAACCCTTTACGGAGTATCTGGTCATAA
AGCTCACAGTATTGCTGCTGTTTCAGATGTCTGGCGCTGTAATTACAGTT
CATGATCCGAAGCCCGGAGATACAAACACAACAGTTATCATATGTGGGGA
TGCTGAACAGACTAAGAAGGCACAGAGCCTGATTCATGCTTTCATCTTTT
GTGGTCTGTACCAAACATGCAAACATGATCCATGACAGCCGATGATCATG
AATTGTGTATCCCCCAGAGGTTTCCATCCGGAGCGTTTTTTCCCTGATAG
GATGTATGTACATTGTACAATAGCGATTGGGTTGAATGTAGATAGAAATT
GAATTGATTGCTGGACGCACATCACTAGTGTAAGTTCTTTGAGTCACATG
GCGGCATTGTAAGTTTTTTGAATTGACAGCTGGAGACGCAGCCCCGATGT
AAGTTTTGTTTTTGTTTAGTTCAGGGAGTACCATGGAAGGCGCGTGCCCA
GTGTATCTTGTTTCTCATCTGGAAATGGGCAATGATAAACTTGTAACTGA
GTTCTGCATGATCATCTCTGGGAAGTTGGACCTGCGGCCTGATGGACTCC
AGTTTTCTGTGGGATGATGGTAGGGAATTCCCAGGAAACTCCATGGCCGC
ATGAGTACAAGTTACAGCTGATGCTGGCATGACATGACATGACCTGGCCT
CCCATGATCATCAGAGACGACCTGAGTGTCAACCCTTAGTTGATGCACAT
GGGCCCTACCATGCCACTTGTGTCCGAGGGAGGCTTCAGAGGAAATCCAG
ATAATTCGGCACCAAGGACAAGGCCTCGTCTGGAGCACAGGAATTTCACG
GAAACAACAAGCTAACTTCACTGGAATTCCAGCGGGTCCTTGAAGCATTT
TTGGGAAACAACGGCGTTTTGGAATATGCATAGTACAGATCAAACCAACT
GGATGCAGACCTTGCCCAGCCAGAAGGAAAAAGCAACGAGCAGGACGCTG
GACTTTGGTTAAAGAGGTCAATCATGAGGCTTGGGATCTTCTTCCCCAAG
GAACTTCCAGGCAATTGCAAGCTTGACATCTGTGGCATCTCCTTGATATG
CTTTCGGATGTACTCCATTAATCCAGTAACGTCTTGTGCCGTGGAGCATA
GAAGTTGGGTAACTGTCATACATGGCTATATATATATCCAGACAAGTACA
AAATAGCCATCTACTCCCTCGGCCCCGAATTAGATGTCACAGTCTGTGTT
ACTCCATATAACTTGCTTATTCGGGATAGAGTGACTAGTATTTTGCACCC
TTGTTGCATGTTACTCCATATAACTTGCTTATGTTGTATTTTCCCCTCTG
GATGGAAATGGAGCCAAGTTGTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.