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GrainGenes Sequence Report: AE011216

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Sequence
AE011216
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE011216
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCTCACCGCGCAGCGGGAGCAGCTCACCCGTGTGAAGAAGGAGCCAGC
GTCGGCGCCAACGGAGGTCGTGGAGATCTCCTCCGACTCCAAGTGAGGTC
GCCGCCACTCCCTACGCTCCAGTGAGGTCTCCCGGAGCACTTTGGTCACA
GTAAGGGTAGGGTTTGCGGTGGTGCCGCCTTTGTTTTGATGTAAATATTA
TGTATTCCGTAATGATCTCGACGTGAGGATGACAAAGTGGCACGATGATC
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GCGACAATTTGGCGCCGCGATAATTTCGCGCGGATACGGTGTCCGGTAGA
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GCAGATCCAGGCCCATCTCCCGCGTGCCCGCCGCGGAGGGCGAAACTGAA
AAAGAGAGACGAGCGCGCCCTCCGGCCATCTTCATTCCCTCGCCAATTTC
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CCGCCCGCCAGCGAGCGATCCCTGCCGAGATCCCCGCCGCGATGCCGAGG
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CCCCAACCCCGACGCTCCGCCGCCGACCGCCATGGCCGCGCCTCTCCCTT
CGCCGCCGCGCGCCAAGGGGGCAGCCGCCGCCGCTTCGTCCGGGGACGGG
CCGCTCCATGGTACGGCACCCCGCTCTCTCATCCCCGCTTGGATTCGGTG
GTAGAAATGGTATTTAGTACTGACTGACCCCTCTCCTGCCTCCGCGTTTC
TCCGATGCGAAAACCTAGGCCGGGCCGCCGCCGACGGGTGCCGCGTTGAG
TCCATGGCCGACCTCCTCGTCCGAGGTACCGCCTCGTGCCTTCATCCCTT
ACCTGTCCGATCCGGTTAATCAGTGTGGGCACGCGTGTCAGCTTCTGCAT
CCCTGCGACGCTGCCCTGCGTACTGAAATGGCTGCGCGTGTATTCTTCGA
TGTGTACCGTCTCGGCGTTTGAATGAGCGCACATGATTCTGTTTAACTGG
TTGTCGGCCTGTTGTTACTGATGGAATCTGCAGCTCGGAGCAAGCTGCTC
GAAGGTGACGGGGTGGCTGGAGTAACTGAAGATGCAGGAAAGGGTGAGCT
CTTCTGCACTGGATCGGGGAGGTCAGTGTCTGTCAGCGAGAGTGCTATAA
GGAGAGCCAGGGCGTTGGTCAGGGATGAGGTCGAGGAGGCTAGTGTTAAG
AAGAGAAGTAAGAGCTGTTCAACTTTTGTTGGTGTGTTTGGTAGCATCAG
CTGGCTATCTTTCTGCATGTATTGTACTGGATTGACCAGTTTCTCTGTTT
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TCTGATGTTGGAACAAGAGCTAGAAAATGTACGAACTGTATTTTATTGAG
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CTTGCTGGGCAAGGACTCAATCCAGAAGGCAAGAGCTATTTTAGAAGGTA
GGAAGTTCAACTCCTGCTTACTTTCTATCGAATTGCTGCAAGTGCTTTCT
TATCACTTATTTGTGCACGATGACATACATATGCCTCAGAGTAATTTAGG
ATCTGTCCGTCCCCTGTACTGTTAGAAAACATGTCACAATTCACAAATAA
CGAGACAAAATATAATATGTATAGAACTAGCCAGATGTTTTGCAATTCCC
CGACTATTTGTTATACCTACAACTTAAAATATGTTCTGGATATGGTCAGC
CTGTTGAGCATTTTTACTCCATAGTAATATACAATGACCTCAGAGTAATT
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ATAACGAGACAAATATAATATGTATAGAACTAGCCAGATTTTTCGCAATT
GCCTGACTATTTGTTATACCTACAACTAAAAATATGTTTGGATATGGTCA
GCCTGTTGAGCATTTCTACTCCATAGAGTAATATACAATGACCTACCATA
GTTTTATACTGAGTAGGGTCGACCAAAAGTGTTGTTTGTATTGTTTTTCT
TTGTGAGAATTTCTAGTATAATCTCCTTTTCTCTTAGCATTTTTTTAAAT
CTGTCACTTTTATTGCACAATAGATGATGATAGTGCCCCTGGTGTCATAC
AACCGATGTTCCGTACTGGAAGGGGTAGGCCGGTTCCTGTGAGCAGGACC
TCCATTGATAAGGCAAAGGCTGTTTTGGAGGGACAAAAAATCGCAGAACA
AGGTCATTTTGATAAGAGTACGATAAACGTTTTGGATAGTCTGTACAAAC
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CAGGTGTGGATGGCATGGAACAGTTTCCATTGTTCCAAACTGGTTCAGGT
AAAGTTGTGTCAGTCAGTGTGGCATCTCTTCAGAAAGCTAAGTCTGTTTT
GAAGGATAATAATACAAGCGGTGGTGAGTTTTGATTGTTCTTCTATTTGA
ATTCAGAGCTGACGCTTTTGCCCAATTATTGTGGCACACACGCCTTTTTT
GGTGTACTGATGGGATTCCTCTCCTATTAGAAAATACGGAGAGTTTTGGT
AGGCCTGACCAGCCTATGATGTTCCAAACTGATTCCAGAAGACCATTCGT
GATCAGCGGAAGGTCCACTGAGAGATATAGAGGTGCGGCGAAGGAGGAAG
ATATGGAAAAGAGTGGTAATATTGGACTACCTGTGTTCCTTCAGAAAAAA
GCTTGGACCATCTTTCTTTTGATTTATCAGAATTCGGCTATAAATATTAT
TTCTAAGTGGTTACTTCTTTGTGTAGGGCATTGGGATACTGACTGCCAGA
TCCCAATGTTCCAAACAGGATTAGGAAAGCCTGTTGCCGTGAGCCGGAGC
TCAGTTCAGAAGGCAAGGGCAGTATTGGAGGGAGAGAAAAACAATACAAC
CGGTAAATAAACATATGTGCTTATTATTTGTTTAAAATTAGTTCAGAGGA
TCAGCATTTGCTTTGTTTTCTTTGAGATTCAGGACATGGAGATAATGGTG
TCACTACCCCAACTTTTCAAACTGAAACGCCGAGGTCTGTTTTGATGAGT
AGAAGTTCGATCATGAGTGATAGAACTGTTACACCGTACGGAGATAGTGC
AATGCAAGGTACTTGATTTTCTGATGTTGACTGAAATTGTTTTGTGCCTG
TGTATTACCATCTATTCATAATTTGAACAGCATGAAAATAATATTACCGA
TGCAACACATCTTTGATTTCCCTTATACCAAATAATCATTTTTGTTCACT
CAAGTAGAGAAAAATCAGGAGGATGGCAACCACTTGCCATTGTTTCAAAC
TGGGTTAGGGAGATCAATTGCTATAAGTAAGACCTCAGTTAAAAGGGCAA
GCGCAGTTCTGGAGCCAAGGAATATTGCAAAGGAATTGGAAGGTAAATTG
CTATCTAAATGCACACTGTGGTTTTGTAACTCCATTTGTGATAAATGAGC
ATTCATATTTACTGACAGTTAAATTTCCATTCTGTAAGATGAAGCTCATT
TAGATGGTGGCAATGATACTCCAGTGTTCAAAACTGGAATAGGAAGATCT
ATCTTAGCAAGTGAGAACTCTGGAAAGAAAGTACCGGTTATCTTAGAGGC
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CATAGACTGAAACAGTAGATATAAAGAACTTTTTTAGCCTATACTATATT
GAATATTTGCCTCCTATGTGCAAACCAGTAAATAATGACAACGGAGAAGC
CTTTGTTGAAGACACGGCATTACAAGCTGGAATACAGATGTTTGTTCCCC
ATAGTAGAAGTTCAAGCCATAAGGCCAGTATTCTGTTGGAGCAACAAAAT
TTCCCAGAGAAAGGTAGCTTTTGCAGTCACTGGGTTACACAGTGGAGATT
TTTACATTTAAAAAAAATGGAAAGTAACTTAGACTCCTTTTCCCATGCCT
CTGACATATACAATATTATTATGAAGGATATGGAGAGTGTGGACGTCAAC
TTCCAATGTTTCAAACTGGATCTGGAAAGTCGGTTTTGATTAGAGAAAGT
TCAGTGCAGAAGGCAAAGGCTGTTCTGGAGGAAGAAAGCAATATAAACAA
AGGTATAACGGCTTACCAAACTTCTCTGGGACTATTTCGCTGATGCAGAA
ACTGCTACTTTATTTTCAAGAGAAGATTGTATAAACATTTAGCATGCATG
TGCAGTGTCTAATATCAGTCTGTAGTCCTGTAGTTCATTTATGGAGTACC
AAGTGTCATTGATGGTTAGCTAACTATCAAAGTACGCATTACTTGACTGG
TGTGCTAAACTGCTAATCCAAGGATTGCAATGCTTTTTAGTTGATAATTA
GACCAAGTTTACAAATTTAAAAAGCTAACAATGAACCACCAATGTGTAAC
CTGATTAGGTTGCAGCTTTCATTTGAATGATACAGTGATACACTTATTCA
TTGCTTTTGACTCTAGAATGTATCATTCTTTATAGTATACAGAATATATG
TTCTCCATATTACAAATTTTAAGCATACAATTTAAGGTCAGGGTGAGCAG
TCTAATCATTTAGTTAGGCAATGGAGTGACATGTTGATTCATGGACTTTA
ATATTGGCAAAAGTTATTTCAAAAGCATAAGTAATGTGTGTTTTGTGTGT
TTCAGTTTGTACACATTTTCTGTTTGAAGAGTTCTGATCTTGAGTATTTT
TTGTCAGATAATCATAAGCTCCTTAACATGGACCAAAAGTTTCCTGTCTT
TACTTCACCTCTCAAGACAAGCTGTGCAAGAACAGTAAATATATCTTCAG
TTGGCGTGTCTCGAGCTGCTACTTTGTTGGGCTTGGAGGAGAATACCCTT
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CAGAAAATCAAGTGCACAAGGAACCACATCAGCCATTTGAACTTTCTAAT
AACAGACTCTTTGATTCCAGTGAGCATCCAATCAGATTCAGTACCGCGGG
AGGCAGATCAATGGCTATTTCTAGTGATGCACTTCAACGTGCGAAAAACC
TTCTGGGTGAATCAGATGTGGTTTCAACAAATAAGTCAGCGGATTACTCT
TTGGCATCTGGTTGTAAAGATGAGATACCAAATTCAACTGTTGGCGCAAA
AGGAGGTGGATCTGATTTATCAAAAAAAAGTAGGGCCAGTGGAAAACCTG
AAATAGCAACATTTTCCCGCCAAGCAATGTCTGATAGGAAGCACAGTAGA
TCCTTTGGACATGCTGTACCTAATAGCCCTGCAACTATTGAAAATGCTGA
CGGGTTTCATGTGGGGAGTCATTCAATCGGTGAAATTCCAAAGATCCCGA
ACCCTTCGAGGTTTTTATCTGAAACTGACTATGCGGACGGCAGTAAAGAT
AAGACACGGCGACTCCATATGCCAGCTGCAGCGTTGGTGGACATTACTAA
CTTCATGGGTACACATTCTGGAAATATTGACCATATTGCTAATGAGAAGA
GAAGAATTGGGGGAAGAAACTCCCCATCTCCGTTTAAACGGCCCCGCTCA
TCCAGGTCCTTTGATCTGCATCCCTGTTAGCAAGTTGTAAACTGCTTGAT
GTCATGCTTCTGATATGCCCTTGCTGAAAATGGTTAGGTTCGTCGCACCT
ATAAGCACCAACAAACAATCCTCTGCTGGTAAGCTGATTGCTGATACACA
GATAAGCTCATTTGAAACTAAGTCCTACTTGATTGGTTGAACTATTGTTC
ACAGGAGTACCCAAGCTACTACCAACTCAGATCACTTCCTGTCAAAGAAA
GCTGTCTGCATCTTATCCTTTTCAACATAACAGGAAAACTTGGAAAGAGT
ATTTCGGTGGTCCTCCCTGCTTCAATTTTTTGGTACAACATGATGTATAT
CATTTCTGCAGGTAACCCATATTCCCACTTAAATGTTAACTTAAATTTTG
TGACCAGACCGAACATCCAACAGATGAAGTGAAGCTCATGGATGCTAAAG
GAGCTGAGAAGTACAAGTTTCATAATACAGATACTGGTGCAGAAGAATTT
CAGAAGATGCTGCTTGCCTGTGGTGCATCATTGACATACGCAACTAAAGA
GTAGGCATCATTCTTGAGCTGAATGACATATATTTCACTAGTCAATTGAC
CTTTTGTGGTCAGAAATAACACCCTTTTGCTTCTTTTTTTCTTAAGAAAT
GTCTGACCATTACCTTTATTGTTTCATGACTTGTGTTTTTTAAGTCCATA
ATATTTTTTGAAACTGCTTCTTATGGTCTCCTCTGTTCTCTTTCTGTTGC
TGCATCGCGTTAACATTAAACTATAATGTTACATGTTCCTTGGACATACC
GAGTTAGGCTGGAGATGCTCCAAATAATATGTATACATCCTAAACATCAA
ATCACTTGATCTTTCTGTTTTAGATGGGTGAACAATCACTATAAATGGAT
CGTGTGGAAACTTGCTTCACTTGAGAGATGCTATCCAACTAAAGCTGCAG
GCAAATTCTTGACAGTTGCTAATGTTTTTGATGAGCTGAAATATAGGTGA
GATGATGGGCATGCCTTTTCTGCCATTCCAATTGTGTCGATGCATATGAT
TTAATTCATGAAAACTCGTGCATTTTAGGTATGACCGAGAAGTGTACAAT
GGCCACCGATCAGCAATTAAGAAAATTTTAGAAGGAAATGCTTTGCCATC
TTTGATGATGGTGCTGTGCATTTCAGCTGTTTACTCCCATCCTGACGTAA
ATAACCCCAAGTTGGAGACTGGCATGAGAGATGAAAATGAGAACTGCATT
GACAATAAAAGCTTGTTAGCTGCTAAACAAAATATCCCTGCACACATTGA
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CTAGAAGCGTCATTGGATGTGCCGCTTTCAGAACAACTACAGAAAAGAAA
GCTTTTTATAGGACAAAAGCTTCGGGTACTATTCTGTTTTCACCTTGTTG
TCATGGAGACATGGGGAAATTATATCGCTCAATATGTGTTTTCATTTTGG
TAGATATGGGGTGCTTCCTTGTGTGGTTGGACTGGGCCTGTGTCATTTCA
TGAGGTTTGCCTGCTCCTTGACCTTTATAGGCCACAAAATGACAACCATA
TAGTCAATTTTCTCATGACTATTTTTTCCAGATATCTGGCACTGTCAAAT
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CTGCTTATCCCTTTTCAAACTAATAGCAAGATGGGATGATCCTTTGGGAT
TCTGTATGTACTTTACTACAAGACTGAATAATTATTTTGTATTGTTCTGC
TTATCCCTTTTCAAACTAATAGCAAGATGGGATGATCCTTTGGGATTCTG
TATGTACTTTACTACAAGACTGAATATTTATTTTGTATTGTTCTGCTTAT
CCCTTTTCAAACTAATAGATTCCAATTCTATTGATGACATCATACACATC
TCAGGCAAGCATGTTGGACCCCCACTGGCGTTCAATTGCATAAAACCTTC
TGGCGGCCGAGTCCCTAGGACACTGGTTGGAGTTGCAAGGATATATCCTA
TTCTGTATAAGGAGAGGTATACAATTGGATGCAAACTAAAAACAATCAAA
CCTTACCGATTTGTTCCACTGGTCCATATTTAATTGCATAATTCAGGTTG
CCTGACGGTCGTTCTGTTGTGAGATCTGAAAGGATGGAAAGGAAAGCCCT
ACAACTGTACCACCAGAGGTACTTATTTATGTTACTGAAACTGTAGGCAA
TATTATTCAACTGAATACTCTGTATGTTGATTGCACCTTAAATTGACATA
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ATAGAAAGAGGGCAATCATTTTTTTCTAACTTGTGAAAGCTGAGACTTTA
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TGCATTATATTTTCATTGATAATAAATGCCAAGGTATTGAAGAAATATCA
ATATGTCAGAATATTGAAGAAGCCACGCACAGAAGTATTCTGAAATACAT
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GTTGGATTATCATCCTGGTTATGGTGTGTATCGTTTCCCCTTGTTAAGGT
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TTTCCTGTTAAGAAATATCGTATATATACATACCCATGTTACATACGATC
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ATTAGTTTTATGGTTCCTTTTGTTTTTATAAGCTGACATTGCCCCTTTTT
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GTCAGGAAGGGGCAAAAATTTGCAAAATGCTAGAGCGGGCAGCTGAGCCT
GAAGTTATGATGGCAGGCATGACGTCAGAGCAGAGGATATCTTTTTCATC
TTATCAAGCAAAGCAAAAAGTACGCATAAATACCCCCCTCATCTATCAAA
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CAAAATGAAGTAGCTAAGAAGGTTGAAAACGCTCTGGAAGTTGCTGGCCT
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CTTTTTAGTATTCCCCAATGATGTACTCCCTGCGTCTCAAAACAGATGTC
ACAGATTTTTCAAAATTTGGATGAATCTAGACATCCAAATCTAGACACTA
TACAGTATATAGATTCATCCAAATTTTAACAAACCTACGACATCTATTTT
GAGACGGAGGGAGTACATATGATCTACTCCCTCCTTCCTGAAATAAGTGA
CTTAGATTTGTATAGATTCGCATGTATCTATACAGTAAAACACGTCTAGA
TACATGTGAATCTAGACAAATCCAAATCACTTGTTTCTGTACGGAGGGAG
TACAAGAAGTTAGCTTAAATGCTATTAATTTAATTATTTCTATTGACAGA
AAGCCGACCTGGTGGAGGGACAAATTTACTACGTCACAGGACTGGTGCCT
TCTACCTACTGTACTGACAGTCTTTACTTGCATGCTAGAGGATCATCTAC
CATGTGGAAGCCATTAGCATCAGCACGGGCTGCAGATTTTGAGTAAGTGT
CCACTGCTAGTATGCTCAGACTGTAATGTTCAAAGTTAACCATGCTTCTT
TTTGCAGACCATTTTTCACTCCACGTAAGGCGGTTGAACTGTCATTGTTT
GGTGAGGTACCGCTGGCAAGGTTAGTCTAGTTATCCTGTGGAAAGTTGAT
ATGTTAAACCTGTCAATCCGGTGTCCTGTATTAAAACCTCCTAATTAACC
TTTGTTTGTTGCAGTGAATTTGACATTGCAGGTGTCGTTTTGCATGTTGG
CGATGTTTATTTGTGTAGCAGCCAGAAAAGACAGTGGCTCTTTTTGACAG
ATGGATCTAAATTTACCTTAGCACAGCAGTCCACAGAGCAAGATGATTGT
CTTCTAGCAGTTAGCTTCTCTTGCCGAATTGCTGGCGATGACTCTGCTTT
TTTCAGTCATGCCCTTTCTGGAAATACCGTATGTCATCTCAGATTATGTT
GTCTCTATTTCAAGTTGATGGTTCTTTAAAGTTTTGACTTCCATTGATCC
CTAATGTCACCATCATAATATTGAAACTTTTGCGCTAAGCAATATCTTAT
AAATCCACTGTGTAGACATTTGAGGACTGTACTCCCTCTATCCAGAAATA
AGTGACTTGTATTATGTCTAGATTCACATGTATATATACACTAAAACATG
TCAAGATACATGCGAATCTAGACAAATTCAATTCACTTATTTCTAGACAG
AGGGTGTACTTGCCAGCAAAAATGTTTGCAGTGATCTATACTTCATTGTT
CAACTTTATACATTTCTAAAGCAAGTGCAGCTTTACCTTACTGTATCTCT
GTTTCTCAGGTTGGTTTCAGTAATTTGGTCAAGCGGCAGAAAGACCAGAC
TAGGCGCATATGGGTAGCCGAGGCAACAGAGAGCTCTACCTTTACTCTTT
CTCATGAGATCTCTAAAAAATCACATCTTAAGGAAGCTGCCATTTGTGCC
GAGAAATGGGCTTCAAGTTCTTATCCTGTAAGTTTCTTTACATTACTACG
TTAGATTAGAGGAGATAATCCCTCCGATCCGAATTAATTGATGCAGATTT
ATGCAAAATTTTGGCTAAATCTGTTTAGGTTTAATGAATCTGCGCAATTA
CAATGGATTGGAGGAAGTAACATTTTACCGTGACAAGTTCTGATGGTCCT
GTTGTAACTGACTGTTGTGTTGCAATATGAACGAACCCTTTCAGAAAATT
CAGCAGCTAAAGGAGAGGGTTGTCTGCATAATTGGTGATAGTGGTGGCTG
AAGTACTATGAAATAATGGACGCTGTTCTACGGATTTACTCTCCAAACTG
GAGGTGGTGTGTTCTGGGCTTCCAGGATGTACTTTGTGGCAATGGGGTGC
CCATTGGTAAAAATGGTGTCCATGAAGTGTTAATGATGATGGATGCAAAG
TTACAAGATCCGCTCCCTCTGTTTTATAACATAAGATGTTTTAGCTCTGT
GAAAGTAATGTATCTAGATGTTTTTTTAGCGTGTAGGTTCGGAGAGGTTC
ACACCGAATTTACACGCTAAAAGACGTCTAGATACAGTGATACACTACCT
TAACAAAACTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTATATATTAT
GGCGCAGGTACAGTGGTTTAGGCCATTATTCTTAGCTGGGGATTTTTAAA
CTCCCCACAACTAGTTATTCATTCCCCAAGTTATTCCACAAATTAATACT
TCTGTATGTGCAGGGGTTGCGCTGCGGAGAGCCATTGATCCGGTGCTTGC
AGAAGAAAACGATTTCCCTCGACTGACATGCACTTGTTGGATACTCAAGA
TGACGGCATCCTTCTGGAGTTTAAGCGCAACCCATCTGATGTCTTTCCTA
CAACGAGCACTTGCTGCTACTCCATTTCAACACAACTGCTAACAAATGGC
TCACGTGGCATCTGGGGAATGGCATGTCTTGTGCTTCCCAAGCTAGACTG
GGAGCTTCTCTCTTGTTTGCTTGTGCCATGATCATCGGTGCTACATAGGC
AATGTTGTGAGGCAGGGTTGGCAACCCAGGATTGCTAGTAATTATCTGGT
GTCTATGATTGCCGAATCATTATCATTTTGTACTGGATTTTCAAATGAAG
AAAGGCGCTGATGTATGGACTGCGCATATCTATGCAACAGGATTGTTACC
TCGTCAGCTCCAAATTGCAAGCTAATCTTTAAAAAATTATTGTGTGTAGT
AAAAATTTAAAGTTAACCCCGTGTTGTATGGTGCTAACTAAAGTTCCTTT
ATTTAATCCGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.