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GrainGenes Sequence Report: AE011014

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Sequence
AE011014
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE011014
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTAACCCCTGCTGCTTAAATCCCCCTCTCCAAACCATCGTCTGTTCTAAT
CTCCTCTCCTGGTCGCCTCGCCGTCTTTCGCCCCATCCCCAAAACCCTAG
ACCCGACCCGCCTCCGCCGTCGCCCGCCGCGGCCCGCGGCCATGGATCTC
CTCCGCGCGAACCTCCACAAGGTCCGCATCCCGGAGCCCACCAACCGCAT
CCACAAGGACGAGTGCTGCGTCTCCTTCGACACCCCCGTAAACCTTCTCC
TCCCTCTCCTGTACCTACTATCCGCTTCGATCGTGCTAGGGCTTGATCCG
AAAATTTTCCGTGCTCGTGTGTTCAGAGGTCGGAGGGTGGACTGTACGTG
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GAGCTATTTGTCAGACTAATTTTGAAGCAATCACCATCTTTACTAATGCT
TTTCCTCCCCTGATTGATAGGAGTGGAGGGAGGTTTTACTGAACAAGAAC
CTGAATACGATGTGACTTACGAAATTGTTGTCTTGCCTGAATTTATTTCT
CTCCCATTTCCATCTGTTGACTTACCAGAGAAGGTAATTTTTGGGCTGAG
TTTATAAGGGTGAAGCTGTTATGTTTAGTTATTTGTTATTTACTGTAGTA
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GCTGATAGAAAGCAACAACTGGCTTCTTGGGTGGCTGACAAGAAGAAAAT
CAGTGCACATGCTATGGATCTGCAACAACTAGACAATGGTGTAATTGTGC
CTCCTACTGGATGGAAATGTAGCAAGTGTGATAAAACTGAGAATCTCTGG
TTAAATTTAACCGATGGAATGATCCTCTGTGGGCGGAAGCTCTGGGACGG
AAGTGGTGGGAATAATCATGCTGTTGAACACTACCAGCAGACTAAATATC
CTCTAGCAGTAAAGCTTGGCACAATTACTGCTGATTTGGAAGGAGCAGGT
AATGCTAAACGTTAACTTTTGCAATTTAGGACTTGCTCATTTTTCTTATT
TATTACTCTATATACCTGATTTTGGAAGGAGCAGGACTGTGACATAAATG
TGTAATCAAACATTTTGATCTCTAAGCCAGTTGGGTGAAAATGATATCAG
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GTTGCAGCTTTATCAAAATTTGGATGAATCTATATACTAAATAGTGTCTA
GATTCATCCAATTTTTGACAAATCTGCGACATCTATTTTGAGACGGAGGG
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CATACTGAGATGAAATGTAGAAAGAGTGAGTATTTTCAAACTGGTATCAT
CGGTGCAGTTTTTTAACATGTGTCCAAAAGTTTCTTGTTCTTTTCAACCC
TCCAGATGTTATCTTCATATATAGTAGTAGGTTTGCTTGTAATTTTTTTC
CTTTTGGTATAAAGGTGTTGCCCGCATGCCCTAAGTAATACTGAAAGAGT
ATTCTTGATGCAACCTTATAAGATAGACCAGGCACCATTGTTTGCTTTCT
CCATTTCTTTTGCTATTTAGTAAAGTACCTATTCATACCAGATTTTCTGT
GACAACCCAGACGTTTACTCATACCCGGAAGATGATAGTGTTGAAGATCC
ACTGTTAGCTCACCACTTGTCACACTTCGGTATCGATTTTTCTTCACTCC
AAAAGGTGAGTTGCAACCTTATTTAGTGGCGCCCATCTGTGACAATTTTG
CTCTACAAGGCATGTTTTTTCACTCTTTTTCTTTTAAAAGATGGTCAAAT
CAAATTTATTTTTCACAGCAAACATACTATCTGACTTGATTGTAAATTTA
TTGCATTAAATATCAAGCAGGAAACCAGAATAGAATTAGTTATTAAACTT
CTAGGGTATTATATCAATTACCAAAAAGCATTGCACGATTGAACCTATAA
AAAAATCTTATGATATTGGCTGGTATGATAATCGTATGCTAAGTTGCTCT
AAGAATTATTGACCAGGTAAAATATCCGAGTCTATGCTAATTTTAAAGGC
AAACAGAATTTTGCTACAACTGGCAGTGCATTGATGCAGAATTTATTTAT
TGCCCTTCATTTATATGAGGTTCTGTTTTATTTGTTGCTGCAGACTGAGA
TGACTACTGCTGAAAGAGAACTTGACCACAACACAAATTATGATTGGAAT
AGACTACAAGAAAGTGGCAAAGATGCTGAACCTTTATATGGACCAGGCTA
TACTGGCCTTGTAAACCTTGGAAACAGGTATCACGGCTTGAATACGCAAG
ATTATTTTCTCTTCTCATAACGTGTCTTAACTCTTAAGCAATGCATATAT
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CAACCCACCCGTTTATATCACGGTTAGTTCTACTTCCTCATATGATACCG
TGTGTCTTATTTATCTACTGTTGCACCCAATCCTCTTCACCCTAAGTAGC
ATTCTCTCTTCCATTTATTTACCCATTGAATGTTTCAGGTACTTTGAAAA
GCAGAGCTTGAAAGCTGCATTCGCAATTTCCCAAGCTGATCCAACATTGG
ACCTAAACATGCAAATGTAAGTTATCACGGATGACCTATCTGTTTGGGTG
TGTTCATGGAATGTGCTACTATCTTCAGGTAGTAGTTTTCTGATGCAGTT
TGTTTAGTTTTTTGTGCGGAATGCAATCTTAAAATAAAGGAGATGTTAGG
TTGTGTAATCCTTATGTTGAAACCATCATTTTCTTACAGTTAGATTGCTA
ACGTCACAGATAAACACTCCTTGATCTTGGTTCTGGTCAGCCATTTTCTG
ATCTCGGCTTGCACTTATTGGCCACTTGGAAAACACTTATTGGCCACCTT
ATTGGGGTGTTAGTTAGTCGGTACAAAGTATTGCAGGTCTATAGCAATAG
CAATGTTAAATCAATCATGCATCATGCTTTACAAAGAGAACTGTACACTA
CAAGAATTTATCATTAGCGTGATGTCTATTTGTTGTTAACTTAGAATGGC
AGGGATCCACGTTGTCCTGCAGGAGTTTAATCTAGGTATTGATGTCACTG
TTTACTCTCTTTTCAGGACAAAGTTGGCGCATGGTATGCTCTCTGGTAAA
TATTCTGCTCCCACTCAGGAGGTAATAATTTGTTATATACTTACATGCTG
ATCTTTTGTTGTTTGTATATGCCCTTCAGTTCTTGTGTTCATTTGGGTTA
TAGGCTGATGATTCAGTCTGGAATGAACTGCTTTTCTTGCTTCATTTTAG
CTTTTGTGCGATGCATGGGTGATGCTCTTGTTGATTTCTCACGTAATTAA
ATGCAAGTTGGGATCTTTTGAATTGCATGATAACGTTCATGTGTTAAATT
GGTGGGTCCGGTAAATTTTTCTGGAATTGCATGATAATTTAAAATCCGTT
AATTTTCTTTAATAGAAATTGCATATTTGATGAAAGGAAGGGAGCTTTGG
TGTTTCTTTAACTGTGCTACTCCGAGCTTCCTGATGAGCACAGCACCAAG
TTGATTCAGTTTCAGTTTTAATAGACTGCTTTTCTTGCTTCATTTTAGCT
TTTGTGCGATGCATGGGTGATGCTCTTGTTGCTTCCTCATGAATTAGGGT
TAAATGCGGTGGATTTTCTTTGAATTGCATGATAATGTTCATGTGTTAAA
TTTACGGGTCCGGTAAGAAATTCTGGAGTTGCATGATAGTTTAAAATCCG
TCAATTTCCTTGGATAGCAATTGCATATTTAATGAAAGGAAGGGAGCTTT
GGGGTTTCTTTAACTGTGCTACTCCGAGCATCCTGATGGGCACAACACCA
ATGGTACTTCCATGCTCTCTAGTTTGAGTAATCAATGGCGAGTTTCTTTC
AGAATGGTGTAGCATGCAATGTTCATGCTTTACAAGCTTTGTTATTGCTT
TGTTCCATATTGGGTGTTGGGGGGAAACAAGTGGTTCCGAGGGACAAATA
TTCTGTTGACCTATCTTATACAAACATGCTTTTGCACGTTTGTGTACTTC
CTCGTAATTCTATGTATGTTAGTATCTACTGTAGTGAAACTATGTGCTGT
ACTACTCCATTTGTACCCTTTCCTTATTTAAGCAGTACAAAGTGTTGCAG
TACCCAACTGCCCAATACCCACCGTACTTTTTCGTTATTCTCATGATCCG
GCCTGCTGGTCCGCAAATCTGGTTCTGGATAGCTGACTAGACTGGTCTTG
TTATTTTTGGTTCCAGAGCTTTGCAAATACTCCCTCCATCCAAAAATAAG
AGACTTGGATTTGTCTACATTCGCATGTATCTAGACACATTTTAGTGTAT
ATATACATGCGGAAATCTAGACAAATGGAAGTCACGTATTTCTGGACGGA
GGGAGTACCATTGAACCTACTTCTGTGTTAATCCACCCGTTGCTCTATTG
TTGTTTTACAGGGACAAGAAGGAATACGTCCCCGTATGTTTAAGTCAGTT
ATTGCAGCAAGCCATCCTGAATTTTCAAGTATGAGGCAACAGGTACCTTT
ATGCCTATTGGCAAAACCAACCCTTCTTATAACCTTCCCTAATTTCTTGA
TTTCCACTCAAGTTTCTATACACTGATTTTCTCTAAATTTTCTTAGTTTT
TGTGATATTTTCTTTTAATTTTCTTATTCTATATGTTATTTGTTGACTAT
GCTGCCACATACGAAAACCACTTGCCATGCCATACAAAACTGCTTTGGAC
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GAGCGGGATTTCTTTGATTACAGTTGAGGGTTTAAGTTTAGAGTCTGCCA
AGAGTTTATGGGTAGAGAGAATTGAGTTCTTTCTTTCTGTCTTGTAGCGA
GGCGCTACTCATATGGGTTCTGTTTTAATTTATTGATCCACAGTTTTAAG
TACGAGTTTCTTGACTTCCATTATCTTATTTATACTTGTCCAGGATGCCC
TTGACTTCTACCTTCATATTATCGACAAAGTTGATCAGGCAAATCCTGGA
GACCACCAGTTAAATCCTTTTACAGGTTTCAAGTTCATCATTGAGGAGAG
GGTTCAATGCCCTTCTGGCAAAGTTTCTTACAACAAAAGTTCTGACTACA
TGCTTTCTTTGAGCATACCGTTGCATGAAGCAACTAACAAAGGTGGTTTT
TAGAAGTTCTTGTTCTTTTTGGGTTTATAATTCAATGTATTAGAACCTTG
ACATTTGTGGGGCATGCAGAGCAGCTAGAAGCGTTTCATGAGAAGAAAGC
TGCAATGGACTTGGATGGAAAGGAAGTGTAAGTCATTCATGTTTCATGCT
GTGCCTACTTCCTAGTGGGTGTATGTCCCATGACATCTGTATCATCGTGT
TTCCATGACAGGTCTAATGAGGAGATTGTGAGGCCAAGAGTCCCACTGGA
GGCATGCTTAGCAAGTTTTTCAGGCGAAGAAGAAGTTCCTGATTTTTATA
GCACTGCATTAAATTCAAAGACGACAGCAATTAAGTATGTATATCTTGAA
TCTTTATTCAGTATTTGCTAAAAGATGCCATCAAAATTCTCTTGCATACA
CAAACTGCAGTACTTTATTCCAGGGTTGTTTTTCTAATCCCATTGTCTGT
TTTCATGCAATAAGTTATTTTAGTGATAATCTGATGTAAAATGCTAAGCT
TTCCTTGGAACTGTAGCATATCCAGCTGGAACAATATGAAAGAGAGGCAT
TCTTCGATTTGTCTTATGGATTATTGGCTACATCAACCTCAGAAAAGCAG
AAAAGCTAACATATCTGCATTGAAGTTCAGCAATAACCAATTTTAGAATT
GACATGCAATGTTGCCTCTTACTAGTTCAGCATAAACCTGTACGATAGAA
GCGTAATGCTCGAGCAAATAAACATTTTAACTGTAACACCTTATACTTAA
TATTCTACTATAGTTTAGTTATATGTCTGCACTTTGTTATGAAATTCAGC
CAATTAGTTTGAATTTGCGGTCCTCTGGTACTCTTAATGTGAGGATTTGA
GAGATCCGTACTTACCTAGGATTTGCATACAACCATTCGACTTCTGTTCA
TTTTCTCTGCTAATTGACTTTTCTAGATCAGAAAGAATGTCTTATCTTTT
TACACGTATGTACTGAACAGTAAAGTTCTTTGTTAAATGATATAGTTATT
GTACTCTGTCTCAAAATAGATGCGGCATCTATTTTGAGACGGAGGGAGTA
TATAGTTTTATTGAGTGATGTTTATGGACTGGGAGTCGCCTTCATATTTG
CAAATTAATTATCAGTCTTAATCATCATGATCACTTGTAATAATTAGTAA
AATTTCATTGCAGGACTGCTGGCTTTAAAACTTTTCCTGATTACCTGGTG
CTACAGATGCGGAAGTTTGTAATGGAAGCAGGATGGGTGCCAAAGAAACT
TGGTAATACTCCTGACCCTTACAATAATTTCTTATCAGTTGCAATCTTAT
GTGTCTGAAATTTAGGAGCAACTGATGGTTTTGGTGGTTCTCACATCCCA
CTTACTTTTGTTCAGGCTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTA
GCTTTGTGAAGTGAATGTACCTAGACCACTTTTAGTGTGTATGTTATGTA
TTTGCTAGAGGGAGGGCGCAAGAGGGCCCGCCGGGGGTCTTGCCCACGGC
CGGTGGCAAGAGGGAAGGGATTTCCTTCTTAATTCTTGCTTGATTAGATT
GATACATCTCCTCTCCTTATATAGAGAGGTTTACTTGACTCCCAAGCAAG
GCTTACTTGACCCCTAAGCAAGTGACCCTTATCTCTAATTAACCCTAAGA
CTAATGGGCTATACTGCCAGCCCAGGCCCATGACGTACTCTAACACTACA
CCCCACCTGGACATGCAGCTCGTCCTCGAGCTGCAACCTAACCAACTTAT
AACGATGACTCGACGCGACACAAACCTCACACTTAAAAACAAGCCTTTTA
CATCTTGGCTTGGTTTATTACTCTCAATCTGAAATGGGCTGGGACGCTCT
ATTTTGGACCCCTTAACAAAAAGTGGACACCATCCGCATGAAGTACGTGT
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GAGGGGTGCGCCCTCCCAACCGCTGATGTCGCAGACTTTGAGGTCGTTGC
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AGAGCCCTGACGCAGCGGACGAGATCGAGGTCCTTGGCGCAGCAAAGGGC
AACTTGGAGGAGCGGCAGCTGCAGACCACGCATCTCCCGCACACGCCGGC
GCGCTAGGAGGCCGCGCGCAGCAGCCTGCAGCCTCACCGCCGCCGACACG
TGGTGGGTAGCGATCCAAGACGGAAGCGGTGACGGCGAGGGCGGGAACCG
GACTTGGATCGGAACTCCCGCCGGCGCGGTCGTAGCTGGCCCAGGGCTGA
GTGGTAGCGGCGGCTGCTGCAGCAGGGCCATGGCCGCGACGGGGCCCGCG
AGGGGCTGGGACGGCCACGGCAACCAGGGCGGGGTGGTGGCGGAGACCGC
CAGATCCGGCGGCTGCCACGGCAGGAGCAGCGGCCTGGTGGTGGCGGCCC
GTAGGGCACTTGGATCGGAACTCCTGTCGGCGCGGTCGTAGCTGGCCCGG
GGCTGAGTGGCAGCGGCGGCTGCTGTAGCAGGGCCATGGCCGCGACGGGG
CCCGCGAGGGGCTGGGACAGCCACGACAACCAGGGCGGGGTGGTGGCGGT
GGCGACCGCGGCGGAGACCGCTATCTGCGGCGGCTGCCACGGCAGGAGCA
GCGGCCTGGTGGTGGTGGCCGGCGGCGGCCCGTAGGGCCCGGCCAAGTAG
AGGTGGATCTCCTGGACCGCGGTGGCGAGATCGCGGAGGGCTGCGGTCAT
CTCCGCCGGGGAGAGAACAGCGGGGGCGTCGGAGTGCGGCGGCGGCGGGT
GGGAAGAACTCGGTGGAGGGCTGGACATAATCGAAACCCGGGAAAGCTGA
TACCAAATGTTAATGTTATGTATTTGCTAGAGGGAGGGTGCAAGAGGGCC
GGCCGGGGGTCTTGCCCACGGCCGGTGGCAAGAGGGAGGGATTTCCTTCT
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TTTACTTGACTCCCAAGCAAGGCTTACTTGACCCCTAAGCAAGTGACCCT
TATCTCTAATTAACCCTAAGACTAATGGGCTATACTGCCAGTCCAGGCCC
ATGACGTACTCTAACAGTGTAGGTTCACTCCAAACCTCTCTGAACCTACA
CTATAAAAGAGGTCTAGATACATTAGCTTCACAAAGGTAAAACATCTTAT
ATTTTGAAACGGAGGGAGTAGATGATTAACAAATTCATCACATTTTTATA
TCTTTGAGTCTTGACATTTTGTTTCCATCTCAGATGTTTATATTGATGTG
CCCGATATAATCGATATATCGCACATGCGCAGCAAAGGTGTACAGCCTGG
GGAGGAGCTACTACCTGAAGGTTTGGTTGTCTCCTATTAGTTTTCTTTTT
CCTGCTGAACATTCTCTATTTATTCCCTTCAAAGACCCCCGTCATCTTTG
ATGACTTGGCAATATCATCTTTCAGCTGCTTGTGGCAACAAAGCTGAACC
TGCTCGTCCTGTTGCCAGTGAAGACATTGTGTCCCAGCTTGCAAGCATGG
GATTCAATTACTTTCATTGTCAGAAAGCTGCCATTAATACATCGAATACA
GGTGTTGAGGAGGCGATGAATTGGCTCCTCTCACACATGGATGATCCAGG
TTGGTATGCAGATGCCAAAGTTCCATTATCTTATTGCTTTTTCATCATGA
AATCATGAGTGCATTAGTTGTAACTGTTACAGATGAAACTGCAATGAACT
TGTGCAGATATTGATGATCCGATATCTCAAGATCCAACGTCTGCTGAAGA
TACTGTTGATGAAGCAAGTGTTCAAACTCTCGTTTCTTTTGGATTTCAAG
AAGATGTTGCCCGAATGGCCTTGAAAGCTTCCGTAAGATTATTTCTATGA
TTACATCCACAAATGAATTGTGATGTTTTTTAATAATCATTTATAAAAAT
AATACACAGAAATGTTGGCCTTCCTTTGGAAAGTTGGTGTTTGCCTATTT
CCCTCGTCAGCATTGCATTTTCTGCTTCTGTCCTTGATACTCTTGCTGTG
TCATGTATCAGGGTGGAAATATTGAGAGAGCCACGGACTGGGTATTCAAC
CACCCTGAAGCATCTAGCTCCGCATCTGCTGATTCTTCAACAAGCAACGT
AAAAGATGATGACCAACACATACCAGATGGCAGTGGCAGTAAGTTTATCC
AGCACTTGTTTGCTCATTGCTGCAATTAACTTACTATTGTCTGCATGTGT
CTATCAAATTACTACTCCCTCACTTATTATGGATTGGAGGGAGTACTAAT
GTGCAATAGTTTTAAGTACTTGCTTTCAAGGTGGAATTAGTTTACTGTTC
AGAGTAATGGTCATTGTAGGTGCAATTCCTCCCTCCCCTCTGAGAAATAC
ACCTTTGTATGGTGCCAACTGGACGAGTTAATTCCCAATAGTTGTCCTTT
GGAAGTTTCACATCTGTACATGCTTGACGCATATCCTTGTAGTTAATATA
GATAGTTATCATATACTACTATATGTTTATCCCACGTTAAGCGGATGCAA
AATTAGGACAAGATAATCTGCCCAAAATAGTTTTTTTTGGCAATATTGGA
TTGCTCTCAGTTACTGTTCCATCACCAAAATTGGTCTGGCCTATATCTAA
GCCTGTCAAAACATTGGTTTACTACTGTACTATTGTTTGTAGTTCTGCTG
ATCACATTATTGCTAAAACTCATTAGCAGTAAGCTAACAACTATATTTAT
GCTGCCTAGGATACAAGCTGATGGCGTTTGTGAGCCATATGGGCACCTCT
ACCCACTGTGGGCACTATGTGGCGCATGTCCTTAAAGACGGGAGGTGGGT
AATCTTCAACGACAGTAAGGTTGCTGCCTCTGTTGACCTGCCCAAGGATA
TGGGCTACCTCTATTTCTTTCAGAGGATAAGCAGTTGAAGCAGACATCAC
AGGCAAATCATGAAGTCATAGTTCTCACACTTATCATCAGAAGCACGGCC
GGTGGTTTCAGCACTTTTCTGCAAATCGACTAAACACCGCCACATCCTTG
CATGCTAGTTTTAGACTGATCACCTTGGATACAGCTTTGTTGGTTCAGAC
ATTATGCATTGGAAACTTGAATTACATTTATCCTTAGTAACATGTGACAG
TTAATGCTATGGAATGATATAAATTGTGGATCCGTTCAACCCGTTATTGT
TCTGATGATGGTTTTCTTGAGTATGAATTTTATTAGCGCATTTCTTTTTC
T

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.