Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE009499

[Submit comment/correction]

Sequence
AE009499
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE009499
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTTGCTCTATACAAAAGTGCAATTGTGCGAGCTGCTAGGTAAGCTCGT
CGTGGGATCATGGATAGGTTTGGAGTTGCACTTTGCTAGGTTTCTGGTGC
ATGAATTGTTTGTTGTGCTACTAATTTCCTTATAAACACTGAGTTGGCAG
CTGAAAGCACTACGTGAGAAAGCTAAAAAAATGGTGGAGGAAAGAACATC
CAGGTATGATGTCACACTTTCTAATTTTTTTAAAGTGAAACTCCACTTTC
TAAATTAATACCAGCCAATTTTCCAAATCATTGCATGTCTTTTTGCTAGC
TAAATCCAGTCGAACTTTTGTATTCTAATTACATTGATTTGTCGTTCTCA
AACTCTATCCACAATTAATCTTGTTAGTGGATTTTATGATTCGTGTGTTA
GTGGATTCTTTTTCTCCCGCCGCAATGCGCGGGCATGTTTCCTAGTATCT
ATACCTAATAATAAGGACGGATTGTTTCTTCCGGTCCAACACTTTTTTGG
ACCATTTTACCCTTCCTCAAAAACACAAATTAAGCACCAATACCACCGCA
ACCGTTCGTTCTATTTTTTATTTTCTTTCATCCTCCCCGTTTCCTGCAGG
CCAACGCACATGTACGGACATACATACGATACTATCAGTAGCACATGGGC
CAGAGCTAGCACAGCAGGCCCACATGCATGTACACACGGGAATGATCCAC
AGCCAGTTCGGTGTTTGACCCACGTCACTGTCTAGCTGCCCTTTGCTGAC
CCATGTAGGTATAGAATAGTACCACCTCGCTTCCTTGCACAAAATTTAAC
CGGTTGATATACTTTATCTGATTGACTGTCAACAAGCCAAGCAGACAGGA
GCCAGATCAAATGGAATGGAACAATGATAGAGCCTGAGATTGAACACTGT
TGATGGGCTTGTGGAGGTGTCGGGAGCTGAGCGGAAAATCAAGGAGTAAA
TAAAACAGCAGCGGTCCAGGCCTAGGAAGTAGCACCGGCCCGGTCGACAT
AGGGAGACGGCGGCGGTGCAGTGTCGAGGACGAGGCAGCATGCCTTCTTC
CCATGAAGCTCGGGTACAGCTTGAAGAAGTGGATGGGGAAGAGCTCGTGT
GACGAGGTTGCAGGGAGGCGGCGAGGTCCGCGGGTGGGGAGGCGGCGAGG
TCCGCGGGTCAAGGATGGAGGGAAGCACGGCCGGAGGTCGAGCGAGGCGA
CGCAGGCCACTGAAGGGACCCGCGGCGGCCGGTGTTGCAAGCGGATGCGA
GGACACAGGCTTCCTGGACGTTGTGTTGAGGGCGGCAGAGGACGACGCAT
GGGGTCGGCACGCCGGGGAGGAGCTGGAAGGGGAGTCGTCGAGCTTCAGG
CGCTCCCTCTGTTGGGGATCAAGCGGGAGGAGAGCGACGGGGCAGTTGGT
CGCCTGGATCTGGTTCGCTAGGTGGGGGGATGGGGTCGTGACTCGTGAGC
GTGTTGTGTGTTGGCCTATGTGCGGCCAGGTCGTGTCGCGTGGGTGTGCG
TGGGTGTGGTGCCACGAGGTCTGGGTGCATGGGTGGTTGGGGGGTGCGTG
TTGGACTGGGATTTGGTCCGATTGGGGTGGTGGTAGGTGGGCCTGGCCAC
ATGGTTGGGCTGCCTCCCCCAGAGAACGTTTTATCTTTCTTTATAAAATC
TTTTTGCAAATAGGTTTTGAGACAAACAAAAAATTAGATTTTAAATTAAA
AGAAATAGGAAAGTAATGTGAAAATAAAATTAGGGTTTTCGTGTAAATAG
TTTTAGAGGCAAAAATATGCATGATGTTATCATGATTCAAAAATAAAACA
ACAAGCAATTTTTTCATTGGGATTTCCTGGGATGCTATAATCCGACACCA
CTACTTTGGTCTTTAGCGCTAAAAGAATAAATGGAAAAGGCTGAATTTAA
TGTCATTTGTGTATATGCCTTTTAATTAGATATTATCATTTAAGTGTTTG
TTAAAATAATAATATGTTTCTACATTAATTTTAGAATTTTCTAAGGAAAT
CGGCCGTAGCAACACACGGGCACATGTGCTAGTCTATACCTAATAATAAA
GGACGGATTGTTTCTTCCGGTCCAACACTTTTTGGACCGTTTTGTCCTCT
AACCAAAAACAAAATTACCCACTATGTCACCGGTAAGTGCAAATAAACTT
AAAAAAAAAGGCTTCCAATCGCTGGCGCGTATAAAAAAACTCCTCGATCC
AATCGCGCAACAGAAGCTAGCCTTCTTCTCTAGGATTTGCGGCTGCCGGC
TCGGTTTGATATATGAGGGATCCGTCGAAGGTGGAGCTCGTGCCGCCAGG
GATTAGCTTTTTCCTGAGCTCCTCAACCGGCCTTAAAACTACACGATCTA
GCTATAAGACCTTGAGGTGGCACGTGGTGGACGCCTAGACGGATCCATGA
TATGCTGCACAAGCCCAAGAGGAGGTCCAAGACACACTGTACGATCAGAT
TGTCACCAATCCAATTAGCAACCATCTCATTTCCCAAAATCCCTTGCCCA
GATCAATATCCGATCGAGAAGATTTGTAGAGCGGTCATACAAACAAGGTC
AATGAGATTGGCTACTGCATGGAACCAGGTCAGATTGGCGTGCTATGCGT
ACCTCGTGTATTCTCCTTTTTTTAACAAGCGCTGGATTTGTACTCATACG
TTTGAGTTTGACAGTCTAAGGGTGGCCTTTCGGAAGAGATGCATCGGATT
ATTGAACAGTACTATGGTGAAGATGACTGGGAACTAAAAACTCTTATGCT
CGGTTTGTGATTTTTGGGATCCGCTTATTTCCTGAACTGCTGTGTAAGAA
ATTCAAGAAATTCTATTATCTGTTTGAGTTAATCTAATTAAACGTGGATG
CCGTCCTGTTATCCAGTGGTTTTCCTATTGATACATGATACACGCCTACA
TACACACGAAGGTATATCCGCTAGCGACTTCATTACAGCCTGAAGCTGCA
TGCAAAAAGTGCAAATGAGGCATCCATGTTTTGGATTAGTAGTTATGCAA
CGAAGCATCTTATTTATCAGCAATTTTTTAATTCATGCTAGAATGCTACT
CTTGATTGAGTAGCGGTGCATTTTTTATTACAGTATACAATTCATGTTCA
AACTTGCATTTGGTCATATCCAACAGGTTGCATGTGAACCTATTCCTAAT
AATGTCCCTACATATATATTTGGAGCCAGGACAACAACATGGGAAATATG
TGATTAACCGACTTTTCTGTAACTTTACACTTTGTAGAATATGATCCAAA
TAGTTAGAATATTAGTTGTTAGTGAGATATGAAAAATATCTCTTGCATGG
TCCATTGATGGAGATAATCTCTCAGATCGTGTTTCCATGCCTGGGTTATA
CGTGTTATGGTAGCACTTGGCCAAGGTTCTTTTTTTAACGATAAAAGGGT
CTCAGCGATCCTAGAAGTTGCAATTATACAACGTGGCAGGTACAAGATGT
GGGAGGCCTCTTAGCACAAAACACCCTAGCAAGGCTAGAGAATAAAAAAA
AGGGCCTCCACTTTACACAAAGCACCAGAAACCTAAAAAGAAGATTACAA
TTCCTAGATAACGGTGATTTGTATTAATCAAGCAGGTTTAAAGAGGGCGG
ATTGCAAGGACGCGCATAGAGGGGTCGGGGATGAGCATGATGGCCATGGA
CGTGGAGATGCAGGTCTCTCGAGGTCGAGGAGCAAGGGCCCCAGAGGTGT
GGAGGTCGGAACTGCGCCACTGAGGCGGGGACCGAGCAGGTCGGGCAGGA
GACGACCTTTCATGAGGGAGGTCGAGCCGGTGCCGTGCCGGTGTAGTAAG
TATTTTTTAGCTTATCATTTATTTTCCCTGTGCAACGCACAGACACTTTC
TTTGGAACACTATTTTGTTAATTCGTAGTTTTTACTAAGAGCATCCATTG
CTACAAAGCTTACTATATTCTTAGTTCGAAAACACATGTGCTCCTTACTA
GCTAGATTATAACTGTTGCTGGAACTTGCTGATCATATCATGCCACTATA
AAAAACATGTATTCTATTTTATTTGTATCCTTTCAAAAGGTTTAACTATT
TTTGGCCCTTTTTAAAGCCTCTAGGGGCAGCTAAAGAAGTTGTTGTGACA
CTTTAAGGTCTCATCCAATAAGAAAGTCGAAAAAATATAATTATGTGCTT
TTTGTAATTGTGGATTTTGATCTCCCGTTATGATGCGCGGGCATTTTTTC
TATCCTATAATAATAAATGACGGATTATTTCTTCTGGTCCAACACTTTTT
TAGAACTTTTTGCCCCCTCCCCCCACCCCCACCACCAAATACTAAATTAC
CCACCATTGCCTCTGATAAGTGGAAAAAGACGTTTCGATTTTTTTTATCA
GACTCCCACGCCCCCGAGACACTGTATAAAGGAACATGGAAAAATAACGG
GTGCAGAGCCTTTGCGTCGCCATGGGCACGCACGCCGAGTTAAGCTATTC
TGATGCGCCACATGCTACCTGACCGAGACACAACGTCGTGCTCCATGCAT
CTTTCTTGGCAGGAGAGAAGTCGTTGCGCGCGTACACTTTTCAATCGTTC
TTCGTTCTTCGGTGCACTACTATACCAATACCAAAAGATCAAACTTCTTG
ATAGTTGGAACTGCTCTTTATATCCCTGCCCAGAGCCGATGCTTACTTAA
CCTATGAAGTTCACTCTGGCACAAGAGAATCAGAGGTATGCAACCAGTTA
TCACGACGCTCCCTAGGAACATGCTCACACATGCATAGTTTTCTTTATCT
TCATCGGTTGTCGAAGGGGATGGTCTCACGGAGTTAATCTCCCGACGCAA
ATTAGTTGACTCAAATTTTTCTAGATACGAACGTACCTAATATAAAATTA
TGTCTAGATACATCGACGGTCGGTGCAACGCGAGCATCTGGCAGCGGCCG
ATGCAGCGCGAGCCTCCGGCAGCGGCCGGAGGCGGAGCTAGCAGTGGCGG
TGGCAGCGACAGGGAACGCCACACACAGGGAACCGCACACACATGGTGGC
TGGGTTGCGTGTGCGTGTGTGGTGAGAGGGATATGGTCGGTCGGGAGGGT
GCCTCGACATTAGTTTTCTTCGCTAAGATGTTGTATGCACATGCATGTTT
CCTATGCAAGTTGTCTGGTCAAACACTATACTCTACAACCGTGGAAAAGA
ACTAGAAGGTCAACAACCTTGCTCTTTCGCAGCAAAGCGTGGGCATGTTG
CTAGTATCTTTACTATTAAATGGGAGTTGATGATCGTAGGTCGTCCTCAA
ACATCAAACATTGGAAACATCTAGACTGTACAATCTATATCCGATGGCAC
ATTAGACGTCCGTTAGTTAATTACGCAGCTTTGCTACCGATAAGTGCAAA
AAAAATTAGTGTTCCGTATTCTGCCGATCCCTCCACTCGACCACTCTGTC
GGGTTTTTTTGGTCGACGCCTCTCCACGAGATCTCCCTCTACAACCACCG
ATTTTCTCAGGTTTTTTCTTTTTTCATTCAAGTGCAAAGCCCCAAAACAG
CTATGACCTTCGCTCGCCTCTCCATCCCCGTCTTCTCTCTACCGCCGCCG
CCGCCGCTCTGTACCGGCCACCTCTACCGCTGATTGGCGCCATCACGGCG
CTGCCGCACTCATCTGATTCCCCTGTCTCCTCCCTCTCTCGCCATGGCCG
CCGCCCACTACTGTCGCTACGTTATTCCGCACCTGCACGTAGATAACCCT
AGCCGCCTCAATCTCAGACGAGGAGTCTGACGCCAGCACCTCTCCACTCC
CCCTCATAGTCCCGCCCCTCTCCCCAATGCGCTCCCATTATGGTTCCTCC
AACTCTCACCTCCCCATCGACCATATGTACAGTACTGCATATGTTTGGAG
TAATTGTATAAGCGGACCACTTGATGGGAATCGATCCTGATTATTACACC
AGAAAGTATCATTGGATTCTCATTTGGTTGATGCAAGGTTCACTAGATAG
GTACTCCTCCAGTAATCCCCTTATGTTCTTTCTCATGGCCACAATTTAGA
TTCTCATTTTATTAATTGATGGTTGTTCTTTTCGTTCTCCTAGGAAGATT
GTCTCTGGATGCATCATTATGTTACATGCTGCTGCAGGGATACTACTTCG
ACTTCCTTGTGAGAGTGATTAATGGTGAATTCAAACTATGAGCAGTTTAA
TTTATGTTTGTTTCGTATTGCATGTTTCATTCGGTAACAGTGTGCCTCCT
AATAGTTTTCCCTTTCCAAACATCCTTTTCCAAGGAATAACATATTTTGT
CCTTTTCGTGTTGTGATTACTAAGCACTGAAATTTTTACTGCGAGTGCCA
AGTGCCAACATAAGAGTATGATATTAAGTACTGTTTTCCCTAAATTATGA
TCCAAGTTCTAATTTTGCCTTTTGAATTTGGGAAAACTACAAGATGGGAA
AACAATATGAGGGTCTCTGCATTCTGCTAACCATTTTCCAGAACACGATG
AAACACCAGGAGTCTGTTGTAGACGAATCTCCACCTTCTCCTTGTAACCA
AGGTATCTTTTTAGGTTCCTATCAGAATTAAAACTGGCATTGGTACTGGC
CGAGACCTGATGTGCTGAGTGGTTCTGTAGAACAGTCCCAATGGGAGGGA
GCTCGTCGAGCAGATCTACCAATTCCTCGAGGCTGAGGCTGAAGCTACTG
GCACCGCATCTTCCTTCGTCTGACCTGGTCTGGTTCGTGCCTTCTCTCTT
AGCCATTAAGAGAGAAAATAATGTTTCTATATCACACAGAGAAAATAAGG
TTTTACTTGATTTGTAATAGTGTGCACAGAGAATATAAGATAGCATCATC
TATATTGCAACGACCATGCCACTCAATTAGTCATTTGTTAATCCTTTTCA
TAAATGTTGTGCAAAGAATCAGCCATCGATGATAAGCTCAAAATTTAGAA
ATTAATTCTATGCCCACTAGACATAAGTTTGTGAGTTTATTCACTTAATC
TGCATATAGGATATATGTCAAATCTCGAGCTATTCAAATCAGCCATACAG
TATTTTGTATGACAACAAGAACTTCCTATTATCCTTAGGGAACAAAGTAA
ATAGTGTGTGATTATCTTGCATCGAAACTAATGAAGTACCTCTTAATGTG
TACAAACTGTGCTGCTTGTGGAGAACCATGCATCACATAACATGGAGGAT
TCTTTTTGTTGTCACTTTGCTTTGTGTATGAGTGGAATCCTGAATGGAAT
ATTGCTTGTGGGCATTGACTTAATTGTTGCATTATCCGTGCAGTAATTTT
AGCCCTTATTTTCTTTCCTTTATTTTAAATCTAGGTATCTGATCAACCAG
AGGAGAAGGGTCATATGTCAACACCAAGAACAACCTTAGTACCAGGCTCA
ACATCCTTGACCTCAAGCAAAGGTACCTACCAGCAACATTCATTTCTTTC
TAAATCTAACTCATTATTTCATTTTTATTTATGGAACTTATTTTTCTAAG
ATTTCCTTGTATTTTTATTCTTCGAAACACATCATGTTTGTAGAGATTGT
GTTCTAAGAATTTTTCCATTGCCACATACGAGGATGCACTGCCACCCAAT
TGGCTCAACATGCGGGCGGTCAAGAGGATCATGGCACGTATGCCAAGCCA
GATTTATGTTCCTCTGCCCTTTCTCTGAAGATTTAAGTAGCCAGTGGAAT
GCAAAATGAGGATTTCTATCAATTGGAAATGGCAGAACAAGGCGGTTGCG
CTGGCCTGGGCCACCAAGATCTCAACGAGAGACTCCAGGCACTTCCCTTC
TCTCCCAACCCCACCACGTATTGTGATCTCAGGTCTGGTAGGTATCTCTT
CAAGTTTTCTAATTGGATTGCAGTTGTGCATTTGTTGTGGTACATGGATG
GAATATAAATAAAATTATTGAAGTAGTGCACTGATGTCTCGGATGTTGGG
ATTTGGCAACATGTTAAATAGTATGTCTGGTGGGTTATATTTCCATGTAT
GTGCACATGTTAAATTGAAGTAGTGTTTCTCCATGTAGATGATAATTTCT
TCTCATTTATGTAGGTGATCATTTGTCAACCAATCTGCTTGTGCTGGGAC
CGTAGAAGATATAAAGCATTCAGTGTCCTTTTTTTCAAGTTGTGTTAGTT
CTAAAATTAACAAAGAAGTGAACTGTGTGGTTCGTGTTTTGGCAAGGTCC
TTGCCTCGCCTCCCTATCACCTCCCTCGATTCTGGCGGCACAAGAAACTA
ATGGTTTGGATTTGCAATTAATTTCCTTTCATTTCAAAATTGTATTGGTC
TAAACTGTGGAACAAAGGTGGGAGTAAGACTGGACATCAGGTTGCAAGGA
ATGCATAATTTTGGACCCCAACTAGAGCACTCTTGGGCTTGAACCCATGA
AAAATTTGTGTGCACTGTTTTGTTCTAAGTGCTTGAAATAATCAGAAAGA
ACACTTAATCTAACTAATCTAGCTGCACATGTTTGTTGTGATTACCTTTT
ATGAGACGTCAGGTTTCCGATGTATTTGTAGAGTTTATTCTGCGGGAAGT
TTCTAACTTTTCGCACTAGCGTGTTTTTTATAGGCATTCCTTTTCTGAGA
TGTTCTAAATCAGAATTGATCTACATCCATCTCATCTTAGCTGGCACTCA
AGGTATGGTGATGATGTGAGATCGTCCCACGGGTTTAATTATTTGATAGG
ATGTACTTTAATTTGTTCAGGGCTACATATGTATGTTTAGCACAGAGCTA
CTTGAAGCAAGTGCGCTTATGTCTAGAAATATACATATGTTTTTTCTGTC
TTTTTATGCCATTTGAATAGGATTATCTAGCTTGAAATCTACGTTGGCAA
TTGTGAAGCAAGAGAAATCTACGACAAATTTTATTGCTAATGAAGATTGT
TAGTAGTATAGTCAATAGGTCAATAAGAGGTATCAGTCTGATGGTGATTC
AGTTCATCTTGATTAGCCTCTTCTTAAATGATATGTGCATATTGACCCTC
GTGGGTTGTAGAGGAGTGCCAAACATATGACTCACTTTTGAATTAAAAAT
TGCACTAAGGTAGATAGTTTAGGCACACTGGTTAGCTTTAGTAGCTCTAT
TTGGTTCTTGTTGTAGCAAACTATATTACCATATGTTTGTTTAATTTTAT
TTTTATTGTAATTTCTTCGGCAACATACAAGAAAGTTAAATAGTTTTGAT
CTAGAAGGTCTCATCCTTCCGAGAGGGTTTACTTCTTTTTTTGCGAAAAG
TTGTAAATTTCCTCATAAGTTAAGAGATATGTGGTTATCTATTTGTGCCA
ATATATACCACCCGAGATCTCCCTAACCAAGATACAATCTAGAGATATAT
CATTACAGTTGCATCATGCAATAATCAGTCATACATCTCTTGTCTCTTAT
GCCTTGCTAATCAGTTCTCACTTTATTAGGCTTCAGAACAAACTGCAATA
TATTTTAAATTCTTAGTGTTATTGGTAAAAAAAAACTTTCATTAGATCTT
GACCTTTAACTATCTAGATATATAAAACTTGCTTGCAATCATTTTTTATG
CAGTATTACTTCTTTTTTATGCAATTTCAACAATTGTAACCTATTTCTCA
CTAGCGCACTACGACACTAAGTAACTTGATCATAAGAGAGGCAACTGACT
TCTGAAACTGACCTATACAGTTAATATGTTTTTGAAAATTGTACATCCTG
ACTTACTTGAGTACTTGATAGCGAGAACATATATAACCGGTAATAGTAAT
TTTTATTCTTCATATTGTAAAGGGAACAAGGAGTAGCACTTGGAGAAGAG
AGCCAAAATGCCAAAAAGGTACCTGCATCTTTGTGATAGCGAGCACCAGC
CAATGAAGGGTGCGACACAAACAACAAATTGTTGCCTTATTGGTCTGTAC
AAAATCATTTTTATTGAATTAACGCTAGAGATGTCTCTGACATGTGACCC
TATGTTTATGTTTTTTTGTTTAATTTGTATATCTTTTATCTATATACTTC
CTCGGTCTAGAAATAACTGACCTGGGTATGTCTAGATTCGAATGTATCTA
TACACTAAAATGCGTCTAGATACATTCGAATCTAGATAAATTCAAGTCAG
TTATTTCTGGACAGAGAGAGTATAAGAAAAGTTGTATTCAGATAGTCCCT
TTCTTCTCTCGATAGCATCTTTGGAAAACTGTGATTGTTGTTTCTGGTTA
ATATATTTTTTAGTGTGAAATATTTTGTCGTTACATGCGTCGAGAAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.