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GrainGenes Sequence Report: AE007885

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Sequence
AE007885
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE007885
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTCACTCCTCACTCCTCTGGTCTGTCTTCTTCTTCCTCTGCTCCACTAG
GATCCCCTTCTTCTTCAGCTTCGGTTGCTACCACAATCAATCATTGTATT
CAGTTTGTATCGACCTCACGCCCCGATCTTCACCGGCGGCAACGGGTGTG
TGGCAGTGTCCACCTGCTTGCCCCGCGTCCTCCACGCCTCTGCCTCCCCG
CGCCGGAGTTCCCCTTCTGCGACCCAGCGCGAGATCGGCCGCTCGTGCTC
TGCCTCGTCTGCGTCCTCCACGCCTCTGCCTCCCCGCGCGAGCTCCGCCG
CCCGTTCTCTGCCTCTTCCGCGCGCTCGACAGCCGCCAGCAGCCGCCGCC
AAGGCCCCGCACTGCAACCCCGCCGCCGGTCACCGTCGCCTTGCCGTTCG
CGTCCGCCTACGCCTCAAGCAACAGCAAGGGCGAGGACGCACGGCAGCCA
GTCCCTTCTCGGTTGGAGGGAGGAAAGGGAGTTCAGGCCAGATCCGGACT
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CCAGTTAACTCTGACATTGAAGACGATGAGTGCGGTATTTCACCAGCTTA
CTCTGACACTGAAGACGATGAGTGCGGTATGTTGTTTATCTCATCTTGCA
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AATTATCTCTTTCCAATGTTACTGTTATGCCTGTGCAGTTTGTATCTGTT
TGATCATTACAGTGCTCTATAATAAAAATATCAACTGATTTGGTTGTCTT
GCTATGTACTACATCTAGGAATTTAATGAAATTTCACAACTTATTTTTAT
GCACTATAACTGAGCTTGAGCGGTGCCTTACATTGCCTATTCGGAACTTA
TTTGGACTTCACAGTTGTGCAATTCTGGATTGATTTTATCGTGCTTAGAA
TAAATATATGCAGTCTGTTGGTCTGTAGTCGCCACTTTCTGAGCAAATTA
AGCTACGTTATGGTTTCAATGGAAAATGTAATAATTTTGTGCAGTGATGA
ACTAGGAGTTTGGATGAGTCACAAATAGTTGCCTGTCTATTTAATTTTTT
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ATATGGGGCACCAAACTAGCATCATTAGATACGTTATCAAATATATGTTT
ACGTTGTATTTATTTGATGTTGCATATGTTGCTACTTTTTCTATTGATGA
AGTTTGATTTAGGACAAAACTAAATGAACTAACATTGTGAGACGGAGGGA
GTAGTTACCTTTGAATCTCTTGAAACATATGCTTGTTACATTCATTTAGC
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AGTGTTATACGACTAGTGCTGAACCGATCCTGGGTATCTGATATTGATTC
AGATGTATCTGCCTTTGCACTATGGTAACTGAAATCTGAAAAAATTGGCC
AATGTGTTTGCTTATGGGACATGCAGTAGCATTCGTAAATCGTAATTATA
GTTCACATCAAAATGCTAATTGGAATTTCATTCAAAGTACAAATGGTGGA
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ACGTATTTCGTGAAAAATTGCCGCTTAACTAGCATTGCTTTTAAAGCCTG
ACCTCACATGTCTGGTTCAACCAGAAAAAGGAGCCAGCAGATGTCCAAGC
TGGTAGAGTGGATTAACTAAGAGAAAAGATGTATTCCTAGTTATTTTGAT
TAGCTCAAAGCGGTCGGTATCACCTTGTCCAATTGATTCACCTCATGCTT
CCTAAGCAGATGCACGGCCAACCTGCCTAGTGCTCCATCACACAGCCGTA
GTTGGCCACATGGTTCTGTATTACATTGTTTCTGTATGCTCCATCACATG
CCATAGTTAGCAAGAAGGTTATGCACTACCTTGTTTCTATCATTACTTGT
CATTTTTGACAATAGTGTTATTGAAATGAAACTTGTCTGGAATTTAATTT
CAAAAGGGACATAATTTACTATCTTAGCTATTTGAAGTTGATTTGGTTCC
TTATATTTACTTTCAGTCGTTGTAACTTAATAGTGATTTTAGCATTAAGT
TTTTTTAATTGTTTTTTACTACTTGTATTAGGTTCAAGGTCTTCAGAACT
GTATGGAAAATTTACATGGACGATTTATGATTTTTCCCTATTTAATAAGA
GGGAACTACGGAGCAATCCAATTTATATTGGTGGTCATGAATGGTATGAT
CTTCTCATGGATATTAATTGGAGTCACCATTGCATTTTTGAAAGTTTTGT
CTATGGTGCCACATCTTTAGCTTGAACGAGGTGCATCCAGATCAATGAAT
GGGGTCACAACAGAGGATGTGTGGGGCTAAATTTTCTTGGGTCGAAGCAT
GGTGGATTTTTCAGGATGGCTGTTGTTTGATGACCCTGTTATTGAATAAT
GTAGTGTGAATGTTAGATAACATCCCAAACATAAGTAAGCATTTGTTATC
CCAAACAACTTCAACTAGTTTAAACAAAAGCCATAGAAAATCCTTCATTC
ATGGAACACAGGATATGAGGGCTAAAATTTGGGACGAAGCACTGTAGGGG
TTTTTCAGGACGCTTGTTCAGAACATGGAACATGGGGTTGAAGACCGAGT
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AATTTTGAATTTAGAAGTTTTAAAAAATTCTGAAAAAAATACAATCAGGT
AGCCAACTATGCATTCTATTAGCGTGTAAAATTTCAGCTCAAAATACTTT
GCATTTTAGGCTCAGCAAAAATGACAGATTGAGCTTTTGTCATCGGTGAA
CAGTATTAAACATTACAAAGTGATGATTTTGTCATTTTGTGCGATTTTGT
CTTTTTTACTGACCCAAAATATCTCGTATTTCGAGCTGAAAATATACACA
CTGGTAGATTTCATGGTTGGCTACATGCAGGTATTTTTCAAGAATTTTTT
GAAAACCACTGAATTCAAATTTTCGGAGTTTGAAAAATAACAAACCAGCC
GGGCTACCTGGAGCCATCACGCTTATTCGGTTGAAAACCCCGTTATTAAA
TTATCGAGTGTGAAATTATTTTTTTGAGGGGAATTTAGCGTGGGATTCAG
GCAGCACTCCAAATATATGTAAGTATTTGTTACCCGAGAACTAACAAGAG
CATAGAAGACCCCTCATGCAAGCAAACACAATTTAACCACAGAAAATTTG
TTTTTTCTACCCTCATCGCCAACCCAAGAACACAGTTCCCACCACTTCTC
TTCATGGCATCCCCTCCCCTTCATCCACATATGTCCTCCCTCTCCATCCT
TCCTCCTCTCATCTCATGCCTTAGCTCTTTTCTCCTAATCCTCCCCTCCT
CTCATGTAACTGTAAGCTCTTTTCTCCTAATCCTCCCCCCCTCTCATGTA
AATGTGCCTACCTCCTCGGCACCCGCTCATCCTGCTTTGCCTTTTCACCA
TTTTTGGTTATCTAAATTCGCACCCTGTTGACCCTGATCGTCGCTGACCG
AGCAATCCTAGTAACTGTGACATGGGCTTGTTTCTTCCTGCTAGATGTGA
CTAAATTGTCTACTTCTGAAACTTTGCAACTAGAAGGTGACAACACAACC
AAGTTTTTATGCATTTATTGCGATAGCTCAGAGTGGATCCGCTATTTGCA
CATTTACTATGGACAACAATCAGTTAACAGTGAGTTAGTGAACGAAGGAC
CAAAGGACTTAGGCTAGGCCGACTACAGCATTCTTAGCATAGCTGAAGCC
TGAAGCCTGAAGTGGACCATGTGGATAGGCATCTTATTGGACATATGGGT
GTGAACAGCTATCACATTAACCTTGCTTCCTTTGGCACACAAGCACTCTT
TATCAACTTGCTGGTGGCAGCTCATTTAAGCAGTAGTTGTTCTCTTGCTA
TCTGAATTTTCTGTGAGCAGCCTATAGTTTTAGCATATAGTGCCATAGAG
ATGAAAGGCCAATTTATTATTAAATGTGTGTGGAGTGCCTGGTGGCCAGT
ATCACTTGGCTTGAACTGCCCTCTTGGGTTCGATCAACTCCTGGCTGGGC
AGGTTTTCACCGAATGGTGGGCTACCGCTGTCCGGAGCATTCCACGCGCT
CTTGGGAAGGGAACAGACTCTCTAATTCAACTCACTGCCTGGTAAATTTG
GAATAACCACAACGTTTGACGCCGTGTTGCTGGTTCACACTATGAAGGAT
GAGGTAGCCATCTGGGTCTCATCAGGCGCGACTAACCTCCAGCTTCTGCT
GGCGGGCAATTAAGCTGTTTTGCTTGCTCTGGAATGGAAGGGAAGTATTT
TTTTCCGCTCTTATCATGCATCGAGGCACAATCCATCATTTTTCTCGGAA
AAAAAAGTCTATTTAGCTTTTGATTCCAATTCATTTGATATGCTTATGCC
TATACTTCCATCTTCAATTAGCAGTAGTTTCATAGGCAAAACCAAGCTTA
TCTTTGCTGGAATTTGCAAAATGCTATTTGTGTCGTCCCTCATACCGAGG
AAGGGAAGCAGAATTCTTTTACTTCTCCCTCCGGTCCATATTAATGGCCT
CAACTTTGTCTAGATACAAATGCATCTAGTCTAAATACTTAACTAGATAC
ATACGAATCTAGATAAAGTTGAGGCCATTAATATGGACCGGGGGGAGTAA
TAGAATTAGGACGTGTTCTATTATTTATTTTATTTTTGCTATCGTGTTTT
TTGTTTTTCATGTATTTTGCAGTCTCAGCTAACTTTTAAATATAAATTAG
TATTCCCTCCGATCCAAATTAATGGACTTAGATTTCTCTAGATTCAGATT
TATCCAGTCATGTTTTAGAGCTAGATACACCCGAATCTAGACAAATCTGA
GTCCATTAATTTGGATCGGAGGAAGTATTAATGTTTGCCTTTAGACTTAT
AGGGCAAGTCTTCTGTGTCAAATTTTGACATCTACGAGTTGACTTTCAGG
TACATCTTGATTTATCCACAAGGATGTGATGTTTGCAATCACTTGTCACT
CTTTCTTTGTGTTGCCAACCATAATATGCTGCGCCCAGGTAGATGAAATG
CTCTATATATTGTCAACCATGGCAATCGTCTGACTGCCCAACTGTTATCT
TCAACGTCGTTCCTTTTTTCAGAATGGAGACACCTTGCACAGTTTACAAT
AGCTATAATTAATAAGGACCCTATGAAATCGAAGATTTCTGGTGAGTTTG
ATATACCACTATTTTGTTTGGCTACTAAAATTTGCTTGACATCTGCATGT
GAAGTTTAAACAATGTAGTGTTGCAGATTCACTGCACCTATTTTCGAAGG
CAGAACATGATTGGGGATGGAAAAGATTTATGGAGTTATCGAAGCTACAT
GATGGCTTTGTTGTTGAGGATGTTCTAACCATCGAAGCTCAAGTTCAAGT
TATCAGGTATCTGTTTCCTGCAGTTCTTTGAGTTAGATTTTTCATTTTCT
GGTGACAATGGCTGGACTAGTGCTGCCATCAGTTATTTTGAGTTGAGAGT
ATGCATTTACTTTACATAACCATGTCTTCTTCTGCATTGTAATATTTGAG
GGAGAAGGTAGACCGCCCATTTCGTTGCCTTGATGGTCAGTACCGAAGGG
AACTAGTTAGGGTGTATTTGTCAAATGTGGAACGAATTTGCCGGCGCTTT
ATCGAGAGAAGAACAATCAAGCTTCAGAGGTTAATTGAGGATAGAGTCAG
ATGGTCCAGGTTAGAGAACTGTCTTTTGAGCACATTCACTGTCTTGTGGC
CAAGCTCATTTTAAACAAATTCAATGCAAAATTATGATTGTTTTGTGCCA
ATTGAATGTTTACTTGGCAAGTTGCAGAGTCAAAGCATTCTGGCTGGGAA
TGGATCCAATTGTGCGGCACCACATGACAAGAGGAAAGACTGGCACTATA
CTGAAAGCTCTAGTGAAACACTTTTTTATAGAAAACGAAATTACATCAAT
CTTAGTAATGGACGCACTATATAGCGGGCTCAAGGCTCTTGAATATAAGA
GCAAGAACAAAAATGGCTTGTTAAAATTAACAGGGACTGGCGCTCGAAGC
ACTTCTATGGTGCTGGTCGATCAGGATATGTTTGTCTTGGCCGATGATGT
GATACTCTCGCTTGAAAGAGCTACCCTAGACCCACTGCCGCAGCAACCAT
TGCCTACACATGATGATAAAAGTTCACAGAACCCCCTCAAGGTATAAATA
TTTCTCTTTTACCAGTTTGCACCGCTATTTCATCATATGAACTCTGAAAA
GTTTTACTTTTGCATTTCATGTTCGAGCCCTTAGAAATAGGATATGAACG
TTAATTACAAAATTAACTGAATCTTCAACCTTACCATCATGCCAGCAATC
TGGTTATTTAGTGTTACCAAAAGATATAAATCGAGGCTGTATTCATATTT
GCTACAAAAAAAAAACTTGCTCTTATCCTTCAAACAAACTAAACATTCCT
AAATAATAATATTCTGAAATAGAATTCTTTAACATGGGCTATGTTGGTTG
TTGAGAAAATCGAGGAAATTTTGTTTTAGGTTGTTGAGAAAATCTACATT
TGGAAGGAGTTACGTAAGATTCCTAATAAATGTTTGATTATAGGATGGCA
GCTCAGATGACGACTTCAATAAAGAATGTACTGAGCATAATAAACGACTT
ACAGAGCTCGGCTGGAAGACACTGGAATTTTTTGCCTTGGCTCATATATT
CAGGTGTGAAGTTTCTTCTAGTTCAGCATGTCCATCTTGTCTTGGTATTG
TTCTCCGTAACTTGAAATGTCAATTCGCAGCCCTTAATGCTACACTTGAC
ATGTCTGATCGTTCTGTTAATATGGTATACTTCGGTGCATGGCTCTGCTG
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TTGAATAATTCTGATGCCGTTTCTTTTCCTTGGTAAACTAGAAAGCCATG
ATGAAATTTTACATCATAAAATTCCTGTGTGGATTATGGCTTCCATGCGC
ATCTTACAGAAGTCTTGAATCAGTGAAATTAAAGTGAAATACCAAGAAGG
GGTGGCTTTGAAGCACCAAGAGGAGCTCATTCGTGAAGAGGAAGCCGCTT
GTCTTGCCAAAATTGAACTTATGGCCAAGCGCAGTGCTGCTGAGAAGGAA
AAACGCATCCGTGAGAACGAAAAACGCATCCGGAAGAATCAGGTTTGTCT
TTTCAGTTGTGCACCAGCACCATGTTATTCTGTCATAATAGATTTTCATT
TATCTTACTACATTCTGGTATAAACATCTGTAGTTCTGGATCTCTTGGAT
TCCATTTTTTGACATATTTTTCCCTTCAGCCTGTTTAAATGTTATTTCGA
ACGTGCAGTTGGATTATTGGAGATTGCAATGTTATCATCGCATTCATGTT
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AACATGGGCATCAAGGCCATAGTTCTAGAGAGCTGCCCATCAGGTGATAG
AATCCTGGATGATTTCTCAAGTCAAGCGGAAGAAGTGATCTTAAATGCCG
AGAACCTTGAAGAAGTATCTGATGTCTCGGATAACGGAGGTGATAATTCA
GCGGTTCTTCATGATCTTAATGAGCGTGTATCCAGTCCTGTTAATTGGGA
AAAAGATGCTTCAGTACCTAAAGGTGGTGATGTGCAAAATGAGCAAGCAG
GAAAGATGACTTCCTTTGTACAAAATGACTCGGTTACTTCAGTTATCTTT
AATGGATCACATGTGGGAGGTGCCTGGACGAATGTCAAATTCTCATCCAA
TAGGTATATTTTGATAATATTAATCTTCCCCATTCGTCGCTTGATATTTA
TCATCCTATATTTTATGATTCAGGGGAAATAACGGGGGACATAAGGATAC
TGATTCACGAACAGGACCGGCACAAGGTGGATCAAAATCAGTTCCCAGTG
GCTCTTTTGGATCTGACAACTCGAAGGACCTTAGTCATGAGGCTGAGGTA
CGTACAAAAGACGCCTGACACAAAGCTGCGTTCACACCCCACACACATCA
TTTACATATTCACACCCACCACCCACCTGCCCCCGCATACACTAATACTC
AAAACTACCAATCAGAGAAAGCTCAGAAAATCGAGGACGAAGAAAGTGAT
GCGGCCTGATATCATCTTGTCCGAGCTGAGAGACGCGATGGTCCTGCTGG
ACGAGGACAAGCTGAGGAAGAAGAACCAGGATGATCTCATTTCTATCCAA
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AATGTTTTCAATCAATGCTCTAAAGAAGACGAATAGCTTCAAGGGATTCA
TCAATAAGAGCATCGACTTGCTGAAGAGGGACAAACAGCATAAGATCCGG
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GTGTACGAGAAGCTCAAAGTGCATTTTGATTGTGGTGCTTTTGTTTCTGT
TTCTTTCAATCCTAACATTGCGAAGATTTTCAAGAATATTCTCCATCAAT
TTGGTAAGACGGATACTGACAGCAACAACGAAGATCAGCTAATCAACGAG
CTAAAAGAGTTTCTTCGAAATAAGAGGTATGTATGTGTCCTTATTTACAT
GTTTCAAGGAAAATGCAATCTAATAGGTTCTGAAAATTTTCATCCATAGC
AATTTGAGTTTAGGATGCCCCTGAAAATTTAATTCCATTTATGGGAATAG
ATGGGTACTGTACTACCTAAACAGAAATGTCAATTGGACAAAAGATAGGT
GAAAGTAGCATGGTAATATTGCGAGCTTCAACACACAAATATATTTGTTT
TCTAAAAGAAAACACTAATATATGAACTTTTGTTATTCACTTGTAGGTAC
TTCGTTGTTATCGATGACATATGGGATCTATCTGTGTGGGATAAAATCAA
ATGTGCACTGGCTGAGAATAACTGTGGAAGTAGATTAATTACAACAACTC
GTAATCGTAATGTTGCCCAGCATGTTGGTGGTGTGTATCAACTCAAACCT
CTTTCAGTTGATGACTCAGGAAAATTATTTTACCAAAGAATATTTGGTGC
CGAACAAAAACGTCCTCCCATTGAATTGGCTAAAATATCTGAAAGCATCT
TGAACAGATGTGGTAGAATACCATTGGCAATCATTACAATAGCTAGTGTG
TTGAAAAGTAAGTTGGGAGATGAGAACACATACAAGTATTGGTCCAAGTT
GAACCAATCCTTAGGCATTGAGCTAGAATGTTCTGCTATGAAGAACATGA
GAAAGATATTATCAGTCAGCTACAATGAGCTACCTTTGCATCTAAAGAAT
TGCTTATTATATCTAAGTATATTTCCAGAAGACCATGTGATTGAAAGAGA
ACAATTAGTATGGAGATGGATAGCTGAAGATCTCATTCCTGAAGTACATG
GCCGTACTTCGGAGCAAGTAGGAAATGAGGTATTCAATGAGCTTATTAAT
AGAAGTTTGATACAGCCTACGGATATTCAGTATGATGGTACAGCACTAGG
TTGTAGAGTTCATGACATGATACTTGAGCTTATTATATCAATATCTACGA
AGGATAATTTTGTTACCATAGTAGATCATAAGGAGAGAAAATTTAAACTT
AGGAAGATACACAGGTTGTCCTACAATGTTACCTATACTGAAAAAGCAGT
TAGGAAAATGAGGAGGGATGAGTTATCTCAAGTTCAATCTTTTAGCGTCT
TTGGGCATGTCAGAGAAATACCCCGTCTCAGAGATTTTCGAGCATTGAGG
TTGAGGGTTTTGGACTTGGGATCTTGTAGATTTATTGAAAACCACCATAT
TGAGAACTTAGGAAGGTTGACTGAACTTAGATATTTGGATCTCAGTCAAA
CAAGCATCACCGAGCTTCCAAGCCAGATAGGAAATCTCGAATACCTGGAA
ACGTTGGATCTTCGGTGTAGAATAGAGAAGTTGCCCTCTACTATTGCTAC
ATTGAAGAACTTGCAACGCCTATTTGTAGGCAGCAGTGTAAGATTTCCGG
ACGAGATTGGATGCATGCAAGGTTTACAGATGCTGTTGTGTGCCTCAATG
TCCTGTAACTCCATCAGATTTATGGAAGAGCTTGGCAAATTGAATCTAAT
GGGGGCACTTCAGATAACTTTTGGAAAACCTGCTGACATGGTCGATGAAG
TGAGCGCGTACACAACTTGTTTTGTGTCATCCCTCAACAAGTTGGGAAAC
CTTCACTGTCTAAAGATAGATAGTGAAGAAGGTTCTCTCCTTGATTCCTT
GATTGAAGTACACCTCGATTTTCCATGTCTCAGAATGCTTAGAATTGCCC
ACATTTCACGGCTTCCAAAATGGATCGGACGGGTTCAGAGTCTTGTCAAG
TTGGAAGTGAAAGTTGTTACCGTGCAAGCTGAAGATCTTGATATGCTTGA
AGGCATAGTCGATCTTCTCTATCTGGAGCTAGAGGTGGAGGATGCTTCCA
ATAAAATCATCAATATTGGTAACCGAAGATTTCAAAACCTAAAAGAGTTC
CATTTCATATGCTGGAATGATGGAATGGGGATGGTGTTTGCAGAAGGTGC
TATGCCGGAGCTTGACACGTTACATCTTTGCTTCCAAACATGCAAAACAA
TGTGCATGTATGGTGGCATTGATGACAGCGGCATCCACCATCTTACAAGC
CTGAAAAATCTCTTCGTTGACATCAGCTGTAGTGGTTCAAATAATGTGGA
GGTTGAAGCTGTGGAAGCTTCTATCAGCAGAGCAGCTGACAAACATCGTA
CCCAGCTCATACTTGAAATCCAAAGGTGTTCTGAACCAGATACGATGGAT
GAAAAGGTTCATAAAGATAATAAGGGGATTACAAAGAACTCCGTGAGAAG
GAGAAGAATCACGCGAGCGACTGTCGGGATTGCTTTCAGGTATGTATTTT
TCCTTGCAAGAGAACAATCTATTTTCATTGAATTTGTTTTATTTCTGAGC
AATTCCTACTTCTGATATGCGCTTTCCATTGTAAATATATTCCAACCAGG
GTGAGAGCTGCTCAGAGCGAATGGAGTAGGACTTTGAAAAAGAGAACACC
ATCGGCGAAAACTCCCGAGTAAATTACTGTTACCTAATGATCATATGTAC
TGATTGTTCCTAAAGGAATTTTGCTTTGACTAAGTTGCTTTTCTTGTATG
TTACCAGATTTTCTTAAAGGGTAGTGAAAGTTGCCTTTTGGGTCTCTTCA
GCTTTACTTCACTTATACATTCTTGTGCAATCATATTGGTTCCGTTATAT
GTTTTCACCCGTTACAGACTCATAGTCCTTGTTACGTCCAAAATGTACTC
CCTCCGTCCGGAAATAAGTGATTTTGATTTGTCTAAATTTGAATGTATCT
ATACACATTGAATCAGCATGAGTTGCTATAGTTGCTAGGATGATGGTTGC
TGTATTGTTCCAGGGCTCATATTATCCTGCTACGATTTGGCATCAAATTG
CCATTGATCTTTGCTGAACATACCATTGGATCTTATTTTTCTTAATGAAA
TCCCATGTTACTTTTGCTACAAATAGTGTGTACAATTGGGAAAATTAGGT
AGGTTAGCCCCTTGGAACTCCACACCCTCGGATATACTTAATACTGTCTT
GCTGAATGGACTTAACCTGGCCTCAATGGGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.